NEXUS
[File created by TreeBASE:  1/16/09  15:32:55]
[Matrix accession#: M3624]

BEGIN TAXA;
	TITLE M3624;
	DIMENSIONS  NTAX=4;
	TAXLABELS
		Mus_musculus_b1genew2	Mus_musculus_b1genew1	Mus_musculus_b1genep	Mus_musculus_b1gened
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M3624;
	DIMENSIONS NCHAR=1427;
	FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = -  ;
	MATRIX
		Mus_musculus_b1genew2       ATGGTGCACCTGACTGATGCTGAGAAGGCTGCTGTCTCTGGCCTGTGGGGAAAGGTGAACTCCGATGAAGTTGGTGGTGAGGCCCTGGGCAGGCTGCTGGTTGTCTACCCTTGGACCCAGAGGTACTTTGATAGCTTTGGAGACCTATCCTCTGCCTCTGCTATCATGGGTAATGCCAAAGTGAAGGCCCATGGCAAGAAAGTGATAACTGCCTTTAACGAGGGCCTGAATCACTTGGACAGCCTCAAGGGCACCTTTGCCAGCCTCAGTGAGCTCCACTGTGACAAGCTCCATGTGGATCCTGAGAACTTCAGGCTCCTGGGCAATATGATCGTGATTGTGCTGGGCCACCACCTGGGCAAGGATTTCACCCCCGCTGCACAGGCTGCCTTCCAGAAGGTGATGGCTGGAGTGGCCACTGCCCTGGCTCACAAGTACCACTAATTGGTATCCAGGTTACAAGGCAGCTCACAAGAAG---TTGGGTGCTTGGAGACAGAGGTCTGCTTTCCAGCAGGCACTAACTTTCAGTGTCCCCTGTCTATGTTTCCCTTTTTAGGGTGAGTCTGATGGGCACCTCCTGGGTTTCCTTCCCCTGGCTATTCTGCTCAACCTTTCTATCAGAAGGAAAGGGGAAGCGATTCTAGGGAGCAGTCTCCATGACTGTGTGTGGAGTGTTGACAAGAGTTTGGATATTTTATTCTCTACTCAGAATCGCTGCTCCCTCTCACTCTGTTCTGTGTTGTCATTTCCTCTTTCTTTGGTAAGCTTTTAATTTCCAGTTGCATTTTACTAAATTAATTAAGCTGGTTATTTACTTCCCATCCTGATATCAGCTTCCCCTCCTCCTTTCATCCCAGTCCTTCTCTCTCTCTTCTCTCTTTCTCTAATCCTTTCCTTTCCCTCACTCCATTTCTTCTTCTTTGATCTACTTTTGTTTGTCTTTTTAAATATTGCCTTGTAACTTGCTCAGAGGACAAGGAAGATATGTCCCTGTTTCTTCTCATAGCTCTCAAGAATAGTAGCATAATTGGCTTTTATGCCAGGGTGACAGGGGAAGAATATATTTTACATATAAATTCTGTGTGACATAGGAT-CTTATAATAATTTGTCAGTAGTTTAAGGTTGCAAACAAATGTCTTTGTAAATAAGCCTGCAGTATCTGGTATTTTTGCTCTACAGTTATGTTGATGGTTCTTCCATCTTCCCACATATAAGGTGAGGTAGGATCAGTTGCTCCTCACATTTGCTTCTGACATAGTTGTGTTGACTCACAACCCCAGAAACAGACATCACCCCCTTTCCTGCTCTTGCCTGTGAACAATGGTTAATTGTTCCCAAGAGAGCATCTGTCAGTTGTTGGCAAAATGATAAAGACATTTGAAAATCTGTCTTCTGACAAATAAAAAGCATTTATGTTCACTGC
		Mus_musculus_b1genew1       ATGGTGCACCTGACTGATGCTGAGAAGGCTGCTGTCTCTGGCCTGTGGGGAAAGGTGAACTCCGATGAAGTTGGTGGTGAGGCCCTGGGCAGGCTGCTGGTTGTCTACCCTTGGACCCAGAGGTACTTTGATAGCTTTGGAGACCTATCCTCTGCCTCTGCTATCATGGGTAATGCCAAAGTGAAGGCCCATGGCAAGAAAGTGATAACTGCCTTTAACGAGGGCCTGAATCACTTGGACAGCCTCAAGGGCACCTTTGCCAGCCTCAGTGAGCTCCACTGTGACAAGCTCCATGTGGATCCTGAGAACTTCAGGCTCCTGGGCAATATGATCGTGATTGTGCTGGGCCACCACCTGGGCAAGGATTTCACCCCCGCTGCACAGGCTGCCTTCCAGAAGGTGATGGCTGGAGTGGCCACTGCCCTGGCTCACAAGTACCACTAATTGGTATCCAGGTTACAAGGCAGCTCACAAGAAG---TTGGGTGCTTGGAGACAGAGGTCTGCTTTCCAGCAGGCACTAACTTTCAGTGTCCCCTGTCTATGTTTCCCTTTTTAGGGTGAGTCTGATGGGCACCTCCTGGGTTTCCTTCCCCTGGCTATTCTGCTCAACCTTTCTATCAGAAGGAAAGGGGAAGCGATTCTAGGGAGCAGTCTCCATGACTGTGTGTGGAGTGTTGACAAGAGTTTGGATATTTTATTCTCTACTCAGAATCGCTGCTCCCTCTCACTCTGTTCTGTGTTGTCATTTCCTCTTTCTTTGGTAAGCTTTTAATTTCCAGTTGCATTTTACTAAATTAATTAAGCTGGTTATTTACTTCCCATCCTGATATCAGCTTCCCCTCCTCCTTTCATCCCAGTCCTTCTCTCTCTCTTCTCTCTTTCTCTAATCCTTTCCTTTCCCTCAGTCCATTTCTTCTTCTTTGATCTACTTTTGTTTGTCTTTTTAAATATTGCCTTGTAACTTGCTCAGAGGACAAGGAAGATATGTCCCTGTTTCTTCTCATAGCTCTCAAGAATAGTAGCATAATTGGCTTTTATGCCAGGGTGACAGGGGAAGAATATATTTTACATATAAATTCTGTGTGACATAGGAT-CTTATAATAATTTGTCAGTAGTTTAAGGTTGCAAACAAATGTCTTTGTAAATAAGCCTGCAGTATCTGGTATTTTTGCTCTACAGTTATGTTGATGGTTCTTCCATCTTCCCACATATAAGGTGAGGTAGGATCAGTTGCTCCTCACATTTGCTTCTGACATAGTTGTGTTGACTCACAACCCCAGAAACAGACATCACCCCCTTTCCTGCTCTTGCCTGTGAACAATGGTTAATTGTTCCCAAGAGAGCATCTGTCAGTTGTTGCCAAAATGATAAAGACATTTGAAAATCTGTCTTCTGACAAATAAAAAGCATTTATGTTCACTGC
		Mus_musculus_b1genep        ATGGTGCACCTGACTGATGCTGAGAAGGCTGCTGTCTCTTGCCTGTGGGGAAAGGTGAACTCCGATGAAGTTGGTGGTGAGGCCCTGGGCAGGCTGCTGGTTGTCTACCCTTGGACCCAGCGGTACTTTGATAGCTTTGGAGACCTATCCTCTGCCTCTGCTATCATGGGTAATGCCAAAGTGAAGGCCCATGGCAAGAAGGTGATAACTGCCTTTAACGATGGCCTGAATCACTTGGACAGCCTCAAGGGCACCTTTGCCAGCCTCAGTGAGCTCCACTGTGACAAGCTGCATGTGGATCCTGAGAACTTCAGGCTCCTGGGCAATATGATCGTGATTGTGCTGGGCCACCACCTGGGCAAGGATTTCACCCCCGCTGCACAGGCTGCCTTCCAGAAGGTGGTGGCTGGAGTGGCCACTGCCCTGGCTCACAAGTACCACTAATTGGTATCCAGGTTACAAGGCAGCTCACAAGAAGAAGTTGGGTGCTTGGAGACAGAGGTCTGCTTTCCAGCAGGCACTAACTTTCAGTGTCCCCTGTCTATGTTTCCCTTTTTAGGGTGAGTCTGATGGACACCTCCTGAGTTTCCTTCCCCTGGCTATTCTGCTCAACCTTCCTATCAGAAAAAAAGGGGAAGCGATTCTAGGGAGCAGTCTCCATGACTGTGTGTGGAGTGTTGACAAGAGTTCGGATATTTTATTCTCTACTCAGAATCGCTGCTCCCCCTCACTCTGTTCTGTGTTGTCATTTCCTCTTTCTTTGGTAAGCTTTTAATTTCCAGTTGCATTTTACTAAATTAATTAAGCTGGTTATTTACTTCCCATCCTGATATCAGCTTCCCCTCCTCCTTTCCTCCCAGTCCTTCTCTCTCTCCTCTCTCTTTCTCTAATCCTTTCCTTTCCCTCAGTTCATTTCTTCTTCTTTGATCTACGTTTGTTTGTCTTTTTAAATATTGCCTTGTAACTTGCTCAGAGGACAAGGAAGATATGTCCCTGTTTCTTCTCATAGCTCTCAAGAATAGTAGCATAATTGGCTTTTATGCCAGGGTGACAGGGGAAGAATATATTTTACATATAAATTCTGTTTGACATAGGATTCTTATAATAATTTGTCAGTAGTTTAAGGTTGCAAACAAATGTCTTTGTAAATAAGCCTGCAGTATCTGGTATTTTTGCTCTACAGTTATGTTGATGGTTCTTCCATATTCCCACATATAAGGTGAGGTAGGATCAGTTGCTCCTCACATTTGCTTCTGACATAGTTGTGTTGACTCACAACCCCAGAAACAGACATCACCCCCTTTCCTGCTCTTGCCTGTGAACAATGGTTAATTGTTCCCAAGAGAGCATCTGTCAGTTGTTGGCAAAATGATA--GACATTTGAAAATCTGTCTTCTGACAAATAAAAAGCATTTATGTTCACTGC
		Mus_musculus_b1gened        ATGGTGCACCTGACTGATGCTGAGAAGGCTGCTGTCTCTTGCCTGTGGGGAAAGGTGAACTCCGATGAAGTTGGTGGTGAGGCCCTGGGCAGGCTGCTGGTTGTCTACCCTTGGACCCAGCGGTACTTTGATAGCTTTGGAGACCTATCCTCTGCCTCTGCTATCATGGGTAATGCCAAAGTGAAGGCCCATGGCAAGAAGGTGATAACTGCCTTTAACGATGGCCTGAATCACTTGGACAGCCTCAAGGGCACCTTTGCCAGCCTCAGTGAGCTCCACTGTGACAAGCTGCATGTGGATCCTGAGAACTTCAGGCTCCTGGGCAATATGATCGTGATTGTGCTGGGCCACCACCTGGGCAAGGATTTCACCCCCGCTGCACAGGCTGCCTTCCAGAAGGTGGTGGCTGGAGTGGCCACTGCCCTGGCTCACAAGTACCACTAATTGGTATCCAGGTTACAAGGCAGCTCACAAGAAGAAGTTGGGTGCTTGGAGACAGAGGTCTGCTTTCCAGCAGACACTAACTTTCAGTGTCCCCTGTCTATGTTTCCCTTTTTAGGGTGAGTCTGATGGGCACCTCCTGGGTTTCCTTCCCCTGGCTATTCTGCTCAACCTTCCTATCAGAAAAAAAGGGGAAGCGATTCTAGGGAGCAGTCTCCATGACTGTGTGTGGAGTGTTGACAAGAGTTCGGATATTTTATTCTCTACTCAGAATTGCTGCTCCCCCTCACTCTGTTCTGTGTTGTCATTTCCTCTTTCTTTGGTAAGCTTTTAATTTCCAGTTGCATTTTACTAAATTAATTAAGCTGGTTATTTACTTCCCATCCTGATATCAGCTTCCCCTCCTCCTTTCCTCCCAGTCCTTCTCTCTCTCCTCTCTCTTTCTCTAATCCTTTCCTTTCCCTCAGTTCATTTCTTCTTCTTTGATCTACGTTTGTTTGTCTTTTTAAATATTGCCTTGTAACTTGCTCAGAGGACAAGGAAGATATGTCCCTGTTTCTTCTCATAGCTCTCAAGAATAGTAGCATAATTGGCTTTTATGCCAGGGTGACAGGGGAAGAATATATTTTACATATAAATTCTGTTTGACATAGGATTCTTATAATAATTTGTCAGTAGTTTAAGGTTGCAAACAAATGTCTTTGTAAATAAGCCTGCAGTATCTGGTATTTTTGCTCTACAGTTATGTTGATGGTTCTTCCATATTCCCACATATAAGGTGAGGTAGGATCAGTTGCTCCTCACATTTGCTTCTGACATAGTTGTGTTGACTCACAACCCCAGAAACAGACATCACCCCCTTTCCTGCTCTTGCCTGTGAACAATGGTTAATTGTTCCCAAGAGAGCATCTGTCAGTTGTTGGCAAAATGATA--GACATTTGAAAATCTGTCTTCTGACAAATAAAAAGCATTTATGTTCACTGC
	;
END;

BEGIN CODONS;
CODONPOSSET * CodonPositions = 
 N: 1 - 1427 ; 
 CODESET * UNTITLED = Universal: all ; 
 END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
 END;