NEXUS [File created by TreeBASE: 1/16/09 15:34:25] [Matrix accession#: M3795] BEGIN TAXA; TITLE M3795; DIMENSIONS NTAX=13; TAXLABELS Pediculus_schaeffi Pediculus_humanus_capitis_AY316875_KittlerUK Pediculus_humanus_capitis_AY316864_KittlerEthiopia Pediculus_humanus_capitis_AY316863_KittlerEthiopia Pediculus_humanus_capitis_AY316872_KittlerEthiopia Pediculus_humanus_capitis_AY316871_KittlerEthiopia Pediculus_humanus_capitis_AY316870_KittlerEthiopia Pediculus_humanus_capitis_AY316869_KittlerNepal Pediculus_humanus_capitis_AY316859_KittlerGermany Pediculus_humanus_capitis_AY316854_KittlerPNG Pediculus_humanus_capitis_AY316851_KittlerTaiwan Pediculus_humanus_humanus_AY316847_KittlerGermany Pediculus_humanus_humanus_AY316840_KittlerEthiopia ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE M3795; DIMENSIONS NCHAR=579; FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = - ; MATRIX Pediculus_schaeffi ATTATTATATTTACGTGTGTAAGTTTTATTTATTTAATTGTAAAATTATTTTATAATAAAGTTAACTTTGCTGTATCTTTTATTCCTTCTTTTCTTTTACTAAGGTTACATCCTTCCCCCTTAGGAGGTTGGGTAAGTTGTGCTAGTTCGTTTTTTAGTTTTATACAGAGATTTTCTAGTTTTAGCTCGAGAACTTCATTAATATTTCAAATTAGCATTTTATTGGTCATAATTTTATCTTTTAAGGATTTTTCACAAAGTTATCTTTTTATT------CTTATGGGTAGATTAGTTTTTTATATGACTGACAGTTGGTTGCTTTTTTTTATCTCTTTTGAGTTTACTCTTATTCCTGTGTTTTATATAGTCTATGTGTGGAGATCCGCTCCGGAACGTCTTCGAGCAAGCTGGTTTTTATTTATTTATACTCTCATAGGGTCTCTACCTTTATTCTTTGTTATTTTCACAATTGGAAAGAGTTCATTTTGAATATTTCCTAACTGTGTTAGTTTGAGTTTGTTTAGGCCTTTTCTTATCTCAATGGCATTTCTGGTCAAAATACCGCTTTATCTTACT Pediculus_humanus_capitis_AY316875_KittlerUK ATTGTTGTACTTTTGACTTCTTGTCTTATGTCTCTTGTTATAAGGTTTATATTTAGAAATTTCCTTATGTGTTTAGCTTTTTCTCCTTCTATCTTTCTTTTAGCTCTTCATTCATCTCCTTTTGGTGGATGGCCTGGCTGTGCGGGTTCTTATTTCGGTTTAATTCAAAGATTTTCTAGTTGAAATATAAGAGTTTCTTTAATACTTCAAATCAGGGTATTACTTATAGAAATTTTATTAATAAAATTAAATCTCTCAATTAGAAGTTGTATTTTGATTTTGGCAGGGAGCTCGATTTTTTATTTGACTGATAGATGATTAATATTTTTTATTTCTTTTGAGTTTACACTTCTTCCAATTTTTTATATAGTTTATGCTTACAGAACAACGCCTGAACGTCTTCGTGCTAGATGATTTTTGTTTATTTATACTCTTATTGGCTCTTTGCCTCTTTTTGTAGTTATTTTTTGTGTTGGAAAACTATCGTTTTGAATATTTCCTTCTTGTGTTGGATTAGAAATATTTAACCCTATTTTTATCTCCATGGCATTTTTAATTAAATTGCCTTTATATTTTACG Pediculus_humanus_capitis_AY316864_KittlerEthiopia ATTGTTGTGCTTTTGACTTCTTGTTTTATGTCTCTTATTGTAAGGTTTATATTTAAGAATTTCCTTACGTGTTTAGCTTTTTCTCCTTCTATTTTTCTCTTAGCTCTTCATTCATCCCCTTTTGGAGGATGGTCTGGTTGTATAGGTTCTTATCTCGGCTTAATTCAAAGATTTTCTAGTTGAAATATAAGAGTTTCTTTAATACTTCAAGTCAGGGTGTTACTTATAGAGATTTTGTTAATAAAATTAAATCTCTCGATCAGAAGTTGTATTTTGATTTTGGCAGGAAGCTCGGTTTTTTATTTGACTGACAGATGGCTAATATTTTTTATTTCTTTTGAGTTTACACTTCTTCCAATTTTTTATATAGTCTATGCTTACAGAACAACGCCTGAACGTCTTCGTGCTAGATGGTTTTTGTTTATTTATACTCTTATTGGCTCTTTGCCTCTTTTTGTAATTATTTTTTGTGTTGGGAAACTGTCGTTTTGAATGTTTCCTTCTTGTGTTGGATTAGAAATATTTAACCCTGTTTTTATTTCCATGGCATTTTTAATTAAATTACCTTTATATTTTTCA Pediculus_humanus_capitis_AY316863_KittlerEthiopia ATTGTTGTGCTTTTGACTTCTTGTTTTATGTCTCTTATTATAAGGTTTATATTTAAGAATTTCCTTACGTGTTTAGCTTTTTCTCCTTCTATCTTTCTCTTAGCTCTTCATTCATCCCCTTTTGGAGGATGGTCTGGTTGTATAGGTTCTTATCTCGGCTTAATTCAAAGATTTTCTAGTTGAAATATAAGAGTTTCTTTAATACTTCAAGTCAGGGTGTTACTTATAGAGATTTTGTTAATAAAATTAAATCTCTCGATCAGAAGTTGTATTTTGATTTTGGCAGGAAGCTCGGTTTTTTATTTGACTGACAGATGGTTAATATTTTTTATTTCTTTTGAGTTTACACTTCTTCCAATTTTTTATATAGTCTATGCTTACAGAACAACGCCTGAACGTCTTCGTGCTAGATGGTTTTTGTTTATTTATACTCTTATTGGCTCTTTGCCTCTTTTTGTAATTATTTTTTGTGTTGGGAAACTGTCGTTTTGAATGTTTCCTTCTTGTGTTGGATTAGAAATATTTAACCCTGTTTTTATTTCCATGGCATTTTTAATTAAATTACCTTTATATTTTTCA Pediculus_humanus_capitis_AY316872_KittlerEthiopia ATTGTTGTGCTTTTGACTTCTTGTTTTATGTCTCTTGTTATAAGGTTTTTATTTAAGAATTTCCTTATTTGTTTAGCTTTTTCTCCTTCTATCTTTCTTTTAGCTCTTCATTCGTCTCCTTTTGGCGGGTGACCTGGATGTACGGGCTCTTATTTCGGTTTAATTCAAAGATTTTCTAGTTGAAATATAAGAGTTTCTTTAATACTTCAAATCAGGGTATTACTTATAGAGATTTTATTAATAAAATTAAATCTTTCAATTAAAAGTTGTATTTTGATTTTGGCAGGAAGCTCGATTTTTTATTTGACTGATAGGTGATTAATATTTTTTATTTCTTTTGAATTTACACTTCTTCCAATTTTTTATATAGTTTATGCTTACAGAACAACGCCTGAACGTCTTCGTGCTAGATGGTTTTTGTTTATTTATACTCTTATTGGTTCTTTGCCTCTTTTTGTGGTTATTTTTTGTGTTGGAAAACTGTCGTTTTGAATGTTTCCTTCTTGTGTTGGATTAGAAATATTTAACCCTGTTTTTATCTCCATGGCATTTTTAATTAAATTACCTTTATATTTTATA Pediculus_humanus_capitis_AY316871_KittlerEthiopia ATTGTTGTGCTTTTGATTTCTTGTTTTATGTCCCTTGCTATAAGGTTTTTATTTAAGAATTTCCTTATGTGTTTAGCTTTTTCTCCTTCTATCTTTCTTTTAGCTCTTCATTCGTCTCCTTTTGGCGGTTGGCCTGGTTGTGCGGGCTCTTATTTCGGTTTAATTCAAAGATTTTCTAGTTGAAATATAAGAGTTTCTTTAATGCTTCAAATCAGGGTACTACTTATAGAGATCTTATTAATAAAATTAAATCTCTCAATTAGAAGTTGTATTTTGATTTTGGCAGGAAGCTCAATTTTTTATTTGACTGATAGGTGATTAATATTTTTTATTTCTTTTGAATTTACACTTCTTCCAATTTTTTACATAGTTTATGTTTACAGAACAACGCCTGAGCGTCTTCGTGCTAGATGGTTTTTGTTTATTTATACTCTTATTGGTTCTTTGCCTCTTTTTGTAGTTATTTTTTGTGTTGGAAAACTGTCATTTTGAATGTTTCCTTCTTGTGTTGGGTTAGAAATATTTAGCCCTGTTTTTATTTCCATGGCATTTTTAATTAAATTACCTTTATATTATATA Pediculus_humanus_capitis_AY316870_KittlerEthiopia ATTGTTGTGCTTTTGACTTCTTGTTTTATGTCTCTTGTTATAAGGTTTTTATTTAAGAATTTCCTTATTTGTTTAGCTTTTTCTCCTTCTATCTTTCTTTTAGCTCTTCATTCGTCTCCTTTTGGCGGGTGACCTGGATGTACGGGCTCTTATTTCGGTTTAATTCAAAGATTTTCTAGTTGAAATATAAGAGTTTCTTTAATACTTCAAATCAGGGTATTACTTATAGTGATTTTATTAATAAAATTAAATCTTTCAATTAAAAGTTGTATTTTGATTTTGGCAGGAAGCTCGATTTTTTATTTGACTGATAGGTGATTAATATTTTTTATTTCTTTTGAATTTACACTTCTTCCAATTTTTTATATAGTTTATGCTTACAGAACAACGCCTGAACGTCTTCGTGCTAGATGGTTTTTGTTTATTTATACTCTTATTGGTTCTTTGCCTCTTTTTGTGGTTATTTTTTGTGTTGGAAAACTGGCGTTTTGAATGTTTCCTTCTTGTGTTGGATTAGAAATATTTAACCCTGTTTTTATCTCCATGGCATTTTTAATTAAATTACCTTTATATTTTATA Pediculus_humanus_capitis_AY316869_KittlerNepal ATTGTTGTGCTTTTGACTTCTTGTTTTATGTCTCTTGTTATAAGGTTTTTATTTAAGAATTTCCTTATTTGTTTAGCTTTTTCTCCTTCTATCTTTCTTTTAGCTCTTCATTCGTCTCCTTTTGGCGGGTGACCTGGATGTGCGGGCTCTTATTTCGGTTTAATTCAAAGATTTTCTAGTTGAAATATAAGAGTTTCTTTAATACTTCAAATCAGGGTATTACTTATAGAGATTTTATTAATAAAATTAAATCTTTCAATTAAAAGTTGTATTTTGATTTTGGCAGGAAGCTCGATTTTTTATTTGACTGATAGGTGATTAATATTTTTTATTTCTTTTGAATTTACACTTCTTCCAATTTTTTATATAGTTTATGTTTACAGAACAACGCCTGAACGTCTTCGTGCTAGATGGTTTTTGTTTATTTATACTCTTATTGGTTCTTTGCCTCTTTTTGTGGTTATTTTTTGTGTTGGAAAACTGTCGTTTTGAATGTTTCCTTCTTGTGTTGGATTAGAAATATTTAACCCTGTTTTTATCTCCATGGCATTTTTAATTAAATTACCTTTATATTTTATA Pediculus_humanus_capitis_AY316859_KittlerGermany ATTGTTGTGCTTTTGACTTCTTGTTTTATGTCTCTTGTTATAAGGTTTTTATTTAAGAATTTCCTTATTTGTTTAGCTTTTTCTCCTTCTATCTTTCTTTTAGCTCTTCATTCGTCTCCTTTTGGCGGGTGACCTGGATGTACGGGCTCTTATTTCGGTTTAATTCAAAGATTTTCTAGTTGAAATATAAGAGTTTCTTTAATACTTCAAATCAGGGTATTACTTATAGAGATTTTATTAATAAAATCAAATCTTTCAATTAAAAGTTGTATTTTGATTTTGGCAGGAAGCTCGATTTTTTATTTGACTGATAGGTGATTAATATTTTTTATTTCTTTTGAATTTACACTTCTTCCAATTTTTTATATAGTTTATGCTTACAGAACAACGCCTGAACGTCTTCGTGCTAGATGGTTTTTGTTTATTTATACTCTTATTGGTTCTTTGCCTCTTTTTGTGGTTATTTTTTGTGTTGGAAAACTGTCGTTTTGAATGTTTCCTTCTTGTGTTGGATTAGAAATATTTAACCCTGTTTTTATCTCCATGGCATTTTTAATTAAATTACCTTTATATTTTATA Pediculus_humanus_capitis_AY316854_KittlerPNG ATTGTTGTGCTTTTGATTTCTTGTTTTATGTCTCTTGTTATAAGGTTTTTATTTAAGAATTTCCTTATTTGTTTAGCTTTTTCTCCTTCTATCTTTCTTTTAGCTCTTCATTCGTCTCCTTTTGGCGGGTGACCTGGATGTACGGGCTCTTATTTCGGTTTAATTCAAAGATTTTCTAGTTGAAATATAAGAGTTTCTTTAATACTTCAAATCAGGGTATTACTTATAGAGATTTTATTAATAAAATTAAATCTTTCAATTAAAAGTTGTATTTTGATTTTGGCAGGAAGCTCGATTTTTTATTTGACTGATAGGTGATTAATATTTTTTATTTCTTTTGAATTTACACTTCTTCCAATTTTTTATATAGTTTATGCTTACAGAACAACGCCTGAACGTCTTCGTGCTAGATGGTTTTTGTTTATTTATACTCTTATTGGTTCTTTGCCTCTTTTTGTGGTTATTTTTTGTGTTGGAAAACTGTCGTTTTGAATGTTTCCTTCTTGTGTTGGATTAGAAATATTTAACCCTGTTTTTATCTCCATGGCATTTTTAATTAAATTACCTTTATATTTTATA Pediculus_humanus_capitis_AY316851_KittlerTaiwan ATTGTTGTGCTTTTGACTTCTTGTTTTATGTCTCTTGTTATAAGGTTTTTATTTAAGAATTTCCTTATTTGTTTAGCTTTTTCTCCTTCTATCTTTCTTTTAGCTCTTCATTCGTCTCCTTTTGGCGGGTGACCTGGATGTATGGGCTCTTATTTCGGTTTAATTCAAAGATTTTCTAGTTGAAATATAAGAGTTTCTTTAATACTTCAAATCAGGGTATTACTTATAGAGATTTTATTAATAAAATTAAATCTTTCAATTAAAAGTTGTATTTTGATTTTGGCAGGAAGCTCGATTTTTTATTTGACTGATAGGTGATTAATATTTTTTATTTCTTTTGAATTTACACTTCTTCCAATTTTTTATATAGTTTATGCTTACAGAACAACGCCTGAACGTCTTCGTGCTAGATGGTTTTTGTTTATTTATACTCTTATTGGTTCTTTGCCTCTTTTTGTGGTTATTTTTTGTGTTGGAAAACTGTCGTTTTGAATGTTTCCTTCTTGTGTTGGATTAGAAATATTTAACCCTGTTTTTATCTCCATGGCATTTTTAATTAAATTACCTTTATATTTTATA Pediculus_humanus_humanus_AY316847_KittlerGermany ATTGTTGTGCTTTTGACTTCTTGTTTTATGTCTCTTGTTATAAGGTTTTTATTTAAGAATTTCCTTATTTGTTTAGCTTTTTCTCCTTCTATCTTTCTTTTAGCTCTTCATTCGTCTCCTTTTGGCGGGTGACTTGGATGTACGGGCTCTTATTTCGGTTTAATTCAAAGATTTTCTAGTTGAAATATAAGAGTTTCTTTAATACTTCAAATCAGGGTATTACTTATAGAGATTTTATTAATAAAATTAAATCTTTCAATTAAAAGTTGTATTTTGATTTTGGCAGGAAGCTCGATTTTTTATTTGACTGATAGGTGATTAATATTTTTTATTTCTTTTGAATTTACACTTCTTCCAATTTTTTATATAGTTTATGCTTACAGAACAACGCCTGAACGTCTTCGTGCTAGATGGTTTTTGTTTATTTATACTCTTATTGGTTCTTTGCCTCTATTTGTGGTTATTTTTTGTGTTGGAAAACTGTCGTTTTGAATGTTTCCTTCTTGTGTTGGATTAGAAATATTTAACCCTGTTTTTATCTCCATGGCATTTTTAATTAAATTACCTTTATATTTTATA Pediculus_humanus_humanus_AY316840_KittlerEthiopia ATTGTTGTGCTTTTGACTTCTTGTTTTATGTCTCTTGTTATAAGGTTTTTATTTAAGAATTTCCTTATTTGTTTAGCTTTTTCTCCTTCTATCTTTCTTTTAGCTCTTCATTCGTCTCCTTTTGGCGGGTGACCTGGATGTACGGGCTCTTATTTCGGTTTAATTCAAAGATTTTCTAGTTGAAATATAAGAGTTTCTTTAATACTTCAAATCAGGGTATTACTTATAGTGATTTTATTAATAAAATTAAATCTTTCAATTAAAAGTTGTATTTTGATTTTGGCAGGAAGCTCGATTTTTTATTTGACTGATAGGTGATTAATATTTTTTATTTCTTTTGAATTTACACTTCTTCCAATTTTTTATATAGTTTATGCTTACAGAACAACGCCTGAACGTCTTCGTGCTAGATGGTTTTTGTTTATTTATACTCTTATTGGTTCTTTGCCTCTTTTTGTGGTTATTTTTTGTGTTGGAAAACTGTCGTTTTGAATGTTTCCTTCTTGTGTTGGATTAGAAATATTTAACCCTGTTTTTATCTCCATGGCATTTTTAATTAAATTACCTTTATATTTTATA ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions = N: 1 - 579 ; CODESET * UNTITLED = Universal: all ; END; BEGIN ASSUMPTIONS; OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; END;