NEXUS
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[Matrix accession#: M3796]

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		Pediculus_humanus_capitis_AY316766_KittlerEthiopia       ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CAAATGTCCTTTTGAGGGGCGACTGTTATTACTAACCTTTTAAGTGCTATTCCTATTATTGGGAGAGATTTGGTTATTTGAGTGTGAGGAGGGTTTTCAGTTAGGCACCCTACTTTAGAGCGCTTATTTACCCTTCACTTTCTCTTGCCGTTTATTTTGTTGGGGTTTGTGATAGCTCATATTATTCTCCTTCATCAGCACGGCTCTAGAAATCCTTTAGGGTTGGAATTGGATAGTGATAAAATTTACTTTTATCCTTATTTTTATCTCAAAGACATTTTAGGAGGTTTTGTGTGTTTATTCTTATTTGTTTTGATTTGCATTTATTCACCGGACTTCTTTATGGACCCGGATAATTTTGTTGAATCAAATCCTATAATTACACCTCCACACATTCAGCCAGAATGGTACTTTCTATTTGCGTATGCAATTTTACGGAG
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		Pediculus_schaeffi                                       -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTATGTTTTTCCCATGAGGTCAAATATCGTTTTGAGGAGCAACTGTAATTACTAATCTTCTTAGTGCCCTTCCTTTAGTGGGAAGAGATTTGGTAGTTTGAGTTTGAGGAGGCTTTTCTGTAAGTCACCCTACTTTAGAGCGGCTCTTTACACTTCATTTTATTCTTCCCTTTATCCTAGCAATTTTTGTAATAATTCATATCATTTTTTTACATCAAGAAGGTTCTAGAAATCCTTTGGGGTTAGATTTAAATAGAGACAAAATTTATTTTTATCCTTATTTTTATCTTAAAGATATTTTAGGTGCATTTGTTTGTTTATTTTCATTTTCTGTAATCTGTATCAGTTCTCCTGATTTTTTTATAGATCCAGACAATTTTATCGAATGTAACCCTATAGTTACTCCACCTCATATCCAGCCAGAA-----------------------------------
		Pediculus_humanus_capitis_AY696015_ReedHonduras          ---------------------CATTATGAGGCTTCTACTAATTCGTTTTGAAGTGTAATTTTAATTGATTTTGATGTAAATAGAGGATGATTGATTCGTAGTTTTCATGCTAATGGCGCTTCTTTTTTCTTTATTCTTGTTTACGTTCATATTTGGCGTGGCTTATGATTTGGTTGTTTTACGCAAAAATATGTTTGATTTTCAGGAATTTCTATTCTTTTTCTTATGATAGCAGCAGCTTTTATGGGGTATGTTCTACCTTGAGGTCAAATGTCTTTTTGAGGGGCGACTGTAATTACTAATCTTTTAAGTGCTATTCCTATTGTTGGAGGAGATTTGGTTATTTGAGTGTGAGGAGGGTTTTCAGTTAGACATCCTACTTTAGAGCGATTGTTTACCCTTCACTTTCTTTTACCGTTTATCTTATTGGGATTTGTTATAGCTCACATTATTCTTCTTCATCAACACGGCTCTAGAAATCCTTTGGGGTTGGAGCTGGATAGTGATAAGGTTTATTTTTATCCTTATTTTTATCTAAAAGATATTTTAGGAGTTTTTGTGTGTTTGTTTTTATTTGTTTTGGTCTGCATTTATTCGCCGGACTTCTTTATGGACCCGGATAATTTTGTTGAATCAAACCCTATAATTA----------------------------------------------------------
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		Pediculus_humanus_capitis_AY696014_ReedUT                -------------------------------------------------------------------------------------GATGATTGATTCGTAGTTTTCATGCTAATGGCGCTTCTTTTTTCTTTATTCTTGTTTACGTTCATATTTGGCGTGGCTTATGATTTGGTTGTTTTACGCAAAAATATGTTTGATTTTCAGGAATTTCTATTCTTTTTCTTATGATAGCAGCAGCTTTTATGGGGTATGTTCTACCTTGAGGTCAAATGTCTTTTTGAGGGGCGACTGTAATTACTAATCTTTTAAGTGCTATTCCTATTGTTGGAGGAGATTTGGTTATTTGAGTGTGAGGAGGGTTTTCAGTTAGACATCCTACTTTAGAGCGATTGTTTACCCTTCACTTTCTTTTACCGTTTATCTTATTGGGATTTGTTATAGCTCACATTATTCTTCTTCATCAACACGGCTCTAGAAATCCTTTGGGGTTGGAGCTGGATAGTGATAAGGTTTATTTTTATCCTTATTTTTATCTAAAAGATATTTTAGGAGTTTTTGTGTGTTTGTTTTTATTTGTTTTGGTCTGCATTTATTCACCGGACT-------------------------------------------------------------------------------------------------------
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		Pediculus_humanus_capitis_AY696018_ReedHonduras          --------------------------TGAGGCTTCTACTAATTCGTTTTGAAGTGTAATTTTAATTGATTTTGATGTAAATAGAGGATGATTGATTCGTAGTTTTCATGCTAATGGCGCTTCTTTTTTCTTTATTCTTGTTTACGTTCATATTTGGCGTGGCTTATGATTTGGTTGTTTTACGCAAAAATATGTTTGATTTTCAGGAATTTCTATTCTTTTTCTTATGATAGCAGCAGCTTTTATGGGGTATGTTCTACCTTGAGGTCAAATGTCTTTTTGAGGGGCGACTGTAATTACTAATCTTTTAAGTGCTATTCCTATTGTTGGAGGAGATTTGGTTATTTGAGTGTGAGGAGGGTTTTCAGTTAGACATCCTACTTTAGAGCGATTGTTTACCCTTCACTTTCTTTTACCGTTTATCTTATTGGGATTTGTTATAGCTCACATTATTCTTCTTCATCAACACGGCTCTAGAAATCCTTTGGGGTTGGAGCTGGATAGTGATAAGGTTTATTTTTATCCTTATTTTTATCTAAAAGATATTTTAGGAGTTTTTGTGTGTTTGTTTTTATTTGTTTTGGTCTGCATTTATTCGCCGGACTTCTTT--------------------------------------------------------------------------------------------------
		Pediculus_humanus_capitis_AY316778_KittlerUK             ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CAAATGTCTTTTTGAGGGGCGACTGTAATTACTAATCTTTTAAGTGCTATTCCTATTGTTGGAGGAGATTTGGTTATTTGAGTGTGAGGAGGGTTTTCAGTTAGACATCCTACTTTAGAGCGATTGTTTACCCTTCACTTTCTTTTACCGTTTATCTTGTTGGGATTTGTTATAGCTCACATTATTCTTCTTCATCAACACGGCTCTAGAAATCCTTTGGGGTTGGAGCTGGATAGTGATAAGGTTTATTTTTATCCTTATTTTTATCTAAAAGATATTTTAGGAGTTTTTGTGTGTTTGTTTTTATTTGTTTTGGTCTGCATTTATTCGCCGGACTTCTTTATGGACCCGGATAATTTTGTTGAATCAAACCCTATAATTACGCCTCCACACATTCAGCCAGAGTGGTACTTTCTATTTGCGTATGCAATTTTACGGAG
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END;

BEGIN CODONS;
CODONPOSSET * CodonPositions = 
 N: 1 - 707 ; 
 CODESET * UNTITLED = Universal: all ; 
 END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
 END;