#NEXUS [written Sun Mar 05 14:39:54 EST 2017 by Mesquite version 3.2 (build 801) at Antoines-MacBook-Pro.local/192.168.2.6] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=97; TAXLABELS Pseudocyphellaria_citrina_LG688 Sticta_stipitata_LG1253 Sticta_ainoae_UCONN4149 Sticta_hypochra_2 Sticta_sp_LG1017 Sticta_hypochra_1 Sticta_gaudichaldia Sticta_caulescens Sticta_plumbea_LG1031 Sticta_macrophylla_LG3452 Sticta_macrophylla_LG946 Sticta_macrophylla_LG3445 Sticta_sp_LG4064 Sticta_sp_LG4074 Sticta_sp_LG4082 Sticta_sp_LG4111 Sticta_sp_LG4110 Sticta_sp_LG4083 Sticta_sp_LG4112 Sticta_sp_LG4109 Sticta_sp_LG4117 Sticta_sp_UCONN4123 Sticta_sp_UCONN4115 Sticta_sp_UCONN4070 Sticta_sp_UCONN4111 Sticta_sp_LG4084 Sticta_sp_UCONN4120 Sticta_sp_UCONN4094 Sticta_sp_LG4063 Sticta_sp_UCONN4137 Sticta_caperata_LG624 Sticta_caperata_LG962 Sticta_caperata_LG4069 Sticta_sp_LG801 Sticta_sp_UCONN4018 Sticta_sp_LG4099 Sticta_sp_UCONN4102 Sticta_sp_UCONN4096 Sticta_sp_UCONN4038 Sticta_sp_LG4114 Sticta_sp_UCONN4116 Sticta_variabilis_LG4058 Sticta_sp_LG4062 Sticta_sp_LG4066 Sticta_variabilis_LG1037 Sticta_variabilis_LG3451 Sticta_variabilis_LG4060 Sticta_sp_UCONN4128 Sticta_sp_UCONN4076 Sticta_sp_LG4093 Sticta_sp_LG941 Sticta_sp_LG4096 Sticta_sp_LG4100 Sticta_sp_LG800 Sticta_sp_LG991 Sticta_sp_LG1109 Sticta_sp_LG3447 Sticta_sp_LG3453 Sticta_sp_LG4107 Sticta_sp_LG4092 Sticta_sp_LG4059 Sticta_sp_LG4073 Sticta_sp_LG4070 Sticta_sp_LG4077 Sticta_sp_UCONN4139 Sticta_sp_LG4085 Sticta_sp_LG639 Sticta_sp_LG978 Sticta_sp_LG3450 Sticta_dichotoma_LG1005 Sticta_dichotoma_LG389 Sticta_dichotoma_LG985 Sticta_dichotoma_LG3448 Sticta_dichotoma_LG945 Sticta_damaecornis Sticta_subcaperata Sticta_squamata Sticta_martinii Sticta_lacera Sticta_filix_1 Sticta_sp_UCONN4028 Sticta_ainoae_UCONN4148 Sticta_canariensis_LG1333 Sticta_duplolimbata_LG1040 Sticta_ambavillaria_LG992 Sticta_umbilicariaeformis_LG925 Sticta_duplolimbata_LG919 Sticta_atlantica_LG3858 Sticta_sublimbata_LG1038 Sticta_canariensis_LG3741 Sticta_sublimbata_LG885 Sticta_beauvoisii_LG3303 Sticta_carolinensis_LG3302 Sticta_fuliginosa_LG795 Sticta_sylvatica_LG3536 Sticta_limbata_LG2230 Sticta_filix_2 ; 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Sticta_sylvatica_LG3536 AAAAGTCGTAAC-AAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTAC--------------CGCGA-GAGGCGT-CCGCGCC--TCGGGGGCTTCGGC-CCCGCACTTCGCACCC-TGTGGCTACC-GCACCGGTGTTGCTTTGGCGGCGC-ATGGCCGCCGGAG-GACCCG-TCA-AACCTCCCTGTCGTCCGAGTA-CTATCG-TAATCAAATA-AAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGCATTCCGAGGGGCATACCTGTTCGAGCGTCATTGCA-CCCCTCGAGCCTTCTCTTGGTGTTGAGCTGCGCGT--CCCT--CGGG---ACGGGCTCGAACGGCAGTGGCGG-TCCGGCGT-GCGGGCAAGTGCAGTAACCATTCGCTTGAAC-GGCGCGCCC-GGGTCCGGCCAGACCCTCACCGTTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATACCCGCTGAACTTA?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TTCATTCGGCCGGTGAGTTGTTACACACTCCTTAGCGGATTCCGACTTCCATGGCCACCGTCCGGCTGTCTGGATGAATTGACACTTTTTGTGGTGTCTGATGAGCGTGCATTCCGGCACCTTAACCTCGCGTTCGGTTCATCCCGCATCGCCAGTTCTGCTTACCAAAAATGGCCCACTAGTAACGGTGCATTCAAATGTCCACGTTCAACTAAGTAACAAGGACTTCTTACATATTTAAAGTTTGAGAATAGGTTAAGGCTGTTTCAGCCCCAAGGCCTCTAATCATTCGCTTTACCTCATAAAACTGAAAACGTTACTGCTATCCTGAGGGAAACTTCGACAGGAACCAGCTACTAGATGGTTCGATTGGTCTTTCGCCCCTATGCCTAGATTTGACGATCGATTTGCACGTCAGAACCGCTGCGAGCCTCCACCAGAGTTTCCTCTGGCTTCACCCTATCCGGGCATAGTTCACCATCTTTCGGGTCCCAACAGCTATGCTCATACTCAAATCCATCCGAAGACATCTGGATCGGTCGATGGTGCGCCGTCTGACGGGTTCCCACCTCCGTTCACTTTCATTCCGCGCCTGGGTTTGACACCCAAACACTCGCATAGATGTTAGACTCCTTGGTCCGTGTTTCAAGACGGGTCGCTTGCAACCATTACGCCAGCATCCTAGCCGAAGCGCGGTCCTCGGTCCGGGCGGGCGGCATTGCGACCCGGGCTATAAGACTCCCCGGGAGAAGCTACATTCCCGGGACTTTTATCCCGCCGCCAAACCGATGCTGGCCGGATCGCAGGCGAGTGCACCGCTG-ACAAGCAG-CGGCTGATCG-CCTCCGGACCGGTCTGATTGCAAGCGCTTCCCTTTCAACAATTTCACGTACTGTTTGACTCTCTTTCCAAAGTGCTTTTCATCTTTCGATCACTCTACTTGTCCGCTATCGGTCTCTGGCCAATATTTAGCTTTAGATGAAATTTACCACCCATTTTGAGCTGCATTCCCAAACAACTCGACTCGTCG-AAGGGGCTTCGCACGGGCTTGATTGCCGGTCGCATACGGGATTCTCACCCTCTACGACGTCCTGTTCCAAGGAACTTA-GACCGGCATCGCACCCGAAGCACCCTCTACAAATTACAACTCGGACCTCG--AGGAGGCCAGATTTCAAATTTGAGCT???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CTAACGGCTGAACCAGCAACTTGGAAGAATGAAAA-GCAATAGCTGATTGCATTTTTAATGTAGTTACTACTTGGTAGTTTAAATTTCTAGGTAGAATTATGATGATGACATTATCTATCTATTAGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACAAGTGTTATTCATCTTTAT-TAGGTTTAAAGGGTACCAAGACGGTTAATAAAGCCCAAAAGAAATGAATACGGGGGACACATTAACTAGAGTTATATGAAAGGAAGCTCTAAGGTACTGTTGAGTGGAGAGATGAAATTTTATGATACCAGATGATTGGCACAGATTTATGCGAAGGCATCTTCTTATGTAATAACTGACGTTGTAGGACGAAGGCTTAGGAAGTGAACAGGATTAGGTACCCCAGTAATCTAGGCAGAAAATGATGAATGTCATAGGGTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCAAGAGTAATTTGGCAACATTGGAACTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTAGATGATACACAAAAAAATATATTTACAAGCGCTGCACGGCTGTCTACAGTTAATGTCGTGAGACTTTGGTTAACTCCATTAAATTGACGAAAACCCTAATTTTATTTATAAATATAATTAACATTGTTATATTTGATGTTTTAAGAGGGAACAT-GACAAGTCA???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TTTTTAGA-CAATCCAGCATT-GTGGACGCTCTACGTAATCGAGACCCCAA-ACGGCGATTCGATGCGATATGGCGG-CTATGCAAAACCAAGATGGTTTGCGAAACGGCTACTGAGGGAGAAGATGATAACATGGACAAGTCAAAGGAACCAAAGCATGATCACGGTGGTTGCGGCAATGTCCAGCCTGAGGTCCGCCGAGAGGGAATGAAATTGAACGGTACCTGGAAGCCTCAGAAAGGGGACGAGGAGAATGAAGGGCAACAGCCTGAGAAGAAGCCAATTACGCCTCAAATGGCACTCAATATCTTCCGGCACATATCTACAGAAGAGAGTCACAAAATGGGTCTAAGTAACGATTACGCGCGTCCCGAATGGATGATCATTACAGTTCTTCCAGTCCCTCCCCCCCC-GGTCCGGCCGAGCATTTCAGTAGACGGAGGCAACGGGATGCGAGGTGAAGATGATTTGACATATAAACTTGGCGATATCATTCGTGCAAGCGGGAACGTGCGAGCCTGCGAAGCAGAGGGCTCACCTGCGCATGTCGTCGCAGACTTCGAGCAGCTGCTCCAATTCCATGTAGCAACATATATGGATAACGATATTGCCGGCCAACCACAAGCTTTGCAGAAGTCTGGGCGACCAGTCAAGTCAATTCGAGCTCGGCTCAAGGGGAAAGAAGGTCGTCTTCGGGGAAATCTTATGGGAAAGAGAGTAGACTTTTCCGCACGAACAGTAATTACGGGAGATCCGAATTTATCACTTGATGA-GGTTGGTGTTCCCAGAAGTATCGCAAGGACTTT-GACCTATCCAGAGACTGTGACACCATACAACATTCAAAAGCTTCACCAGCTTGTTAAAAACGGTCCCAATGATCATCCAGGCGCTAAGTACGTCATCCGCGATTCGGG-TGAGAGAATAGACTTACGCCATCATAAACGAGCTGGAGAAATTTCGCTTCAGTATGGGTGGAAAGTTGAGCGACACATTATTGACGGAGACTACATCATATTCAAC 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; END; BEGIN TREES; Title MrBayes_Tree; ID 015a9ff8ee9047; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE [0] n0 Pseudocyphellaria_citrina_LG688, [1] n1 Sticta_stipitata_LG1253, [2] n2 Sticta_ainoae_UCONN4149, [3] n3 Sticta_hypochra_2, [4] n4 Sticta_sp_LG1017, [5] n5 Sticta_hypochra_1, [6] n6 Sticta_gaudichaldia, [7] n7 Sticta_caulescens, [8] n8 Sticta_plumbea_LG1031, [9] n9 Sticta_macrophylla_LG3452, [10] n10 Sticta_macrophylla_LG946, [11] n11 Sticta_macrophylla_LG3445, [12] n12 Sticta_sp_LG4064, [13] n13 Sticta_sp_LG4074, [14] n14 Sticta_sp_LG4082, [15] n15 Sticta_sp_LG4111, [16] n16 Sticta_sp_LG4110, [17] n17 Sticta_sp_LG4083, [18] n18 Sticta_sp_LG4112, [19] n19 Sticta_sp_LG4109, [20] n20 Sticta_sp_LG4117, [21] n21 Sticta_sp_UCONN4123, [22] n22 Sticta_sp_UCONN4115, [23] n23 Sticta_sp_UCONN4070, [24] n24 Sticta_sp_UCONN4111, [25] n25 Sticta_sp_LG4084, [26] n26 Sticta_sp_UCONN4120, [27] n27 Sticta_sp_UCONN4094, [28] n28 Sticta_sp_LG4063, [29] n29 Sticta_sp_UCONN4137, [30] n30 Sticta_caperata_LG624, [31] 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'string:1.00000000e+00,1.00000000e+00' , 'prob+-sd' = 'string:100+-0' , length_95%HPD = 'string:1.25821400e-05,1.42498700e-03' ],n10:0.0004592866[%'prob(percent)' = 100 , prob = 1 , prob_stddev = 0.0 , length_mean = 0.00054711 , length_median = 0.00045929 , prob_range = 'string:1.00000000e+00,1.00000000e+00' , 'prob+-sd' = 'string:100+-0' , length_95%HPD = 'string:9.94872200e-06,1.30470400e-03' ],n11:0.000495782[%'prob(percent)' = 100 , prob = 1 , prob_stddev = 0.0 , length_mean = 0.00059659 , length_median = 0.00049578 , prob_range = 'string:1.00000000e+00,1.00000000e+00' , 'prob+-sd' = 'string:100+-0' , length_95%HPD = 'string:1.20855700e-05,1.43548100e-03' ]):0.001459118[%'prob(percent)' = 100 , prob = 0.99992 , prob_stddev = 0.00007542 , length_mean = 0.00155749 , length_median = 0.00145912 , prob_range = 'string:9.99866668e-01,9.99973334e-01' , 'prob+-sd' = 'string:100+-0' , length_95%HPD = 'string:3.73568100e-04,2.93641400e-03' ]):0.002302687[%'prob(percent)' = 100 , prob = 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