NEXUS
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[Matrix accession#: M3948]

BEGIN TAXA;
	TITLE M3948;
	DIMENSIONS  NTAX=17;
	TAXLABELS
		Brada_villosa_Sweden	Diplocirrus_glaucus_Sweden	Flabelliderma_ockeri	Flabelligena_sp.	Flabelligera_affinis_California	Flabelligera_affinis_Sweden	Flabelligera_infundibularis	Flota_sp._specimen_1	Flota_sp._specimen_2	Ilyphagus_octobranchus	Macrochaeta_clavicornis	Macrochaeta_sp.	Pherusa_plumosa_California	Pherusa_plumosa_Massachusetts	Poeobius_meseres	Therochaeta_collarifera	Brada_villosa_California
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M3948;
	DIMENSIONS NCHAR=681;
	FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = - ;
	MATRIX
		Brada_villosa_Sweden                  ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
		Diplocirrus_glaucus_Sweden            ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
		Flabelliderma_ockeri                  ---GATATTGGAACACTATATTTTATTTTTGGAATTTGATCTGGCCTATTAGGAACATCAATAAGGGTTTTAATTCGAACTGAATTAGGACAACCTGGCGCTTTTCTTGGAAGAGATCAAATTTATAATGTTATTGTAACAGCACATGCATTTCTCATAATTTTTTTTCTAGTTATACCTGTATTCATTGGAGGCTTTGGAAATTGACTTCTTCCTCTAATATTAGGAGCCCCAGATATAGCTTTTCCACGAATAAATAACATAAGATTCTGATTACTTCCAGCATCATTAATTTTATTAATTTCTTCAGCTGCAGTTGAACAAGGAGCTGGTACTGGTTGAACAGTATATCCACCTTTAGCAGCCAACATTTCTCACAGAGGACCATCTGTAGATTTAGCTATTTTTTCTCTTCATTTAGCAGGGATTTCTTCAATTCTTGGATCAATTAATTTTATTACAACAGTTCGTAATATACGACCAAAAGGAATAAACCCAGAACGCATTCCTTTATTTGTCTGAGCCGTAGTAATTACAACAGTTCTTCTATTATTATCGTTACCTGTTTTAGCAGGAGGAATTACAATATTATTAACAGATCGAAATCTAAATACCACATTTTTTGATCCTGCTGGAGGAGGAGATCCAATTCTATATCAACACTTATTTTGATTT------
		Flabelligena_sp.                      AAAGATATTGGTACACTATATTTCATTCTTGGTATTTGATCTGGTCTTTTAGGTACAACTATAAGGGTACTTATTCGAACGGAACTGGCCCAACCTGGGTCATTTCTAGGTAGAGATCAAATCTACAACGTCCTCGTTACTGCTCATGCATTTTTAATAATCTTTTTCTTGGTGATACCCATTTTTATTGGGGGTTTTGGAAACTGACTCCTGCCCTTAATAATAGGATGCCCTGACATAGCTTTCCCCCGAATAAACAATATAAGTTTCTGACTATTACCAGCATCTCTTCTTCTTCTCGTCTCTTCTGCGGCAGTTGAACAAGGAGCAGGTACGGGATGAACTGTCTACCCTCCTCTCTCTGCTAATATTTCACATAGGGGGCCCTCTGTAGATCTGGCTATTTTTTCTCTCCATCTGGCTGGAGTGTCTTCAATTCTAGGTTCAATTAATTTCATTACCACTGTGCGTAATATACGACCCAAAGGTATAACCCCAGAACGTATTCCTCTATTTGTTTGAGCCACAGTTCTCACTACAATTCTCCTTCTTCTTTCTCTGCCTGTGCTTGCCGGAGGTATTACTATGCTATTAACTGACCGTAATCTTAACACCTCATTTTTCGATCCTAGAGGGGGAGGGGATCCAATTCTGTATCAACACTTATTTTGATTTT-----
		Flabelligera_affinis_California       ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
		Flabelligera_affinis_Sweden           ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
		Flabelligera_infundibularis           -AAGATATTGGCACATTATATTTCATTTTTGGAATTTGATCTGGTTTACTAGGAACCTCTATAAGAGTTTTAATTCGTACTGAATTAGGGCAACCTGGAGCTTTTTTAGGAAGAGATCAAATTTATAACGTAATTGTTACTGCCCATGCATTTTTAATAATTTTCTTCTTAGTTATACCTGTATTTATCGGGGGCTTTGGAAATTGACTACTTCCCTTAATATTAGGCGCCCCTGATATAGCTTTTCCTCGTATAAATAATATAAGATTTTGATTACTCCCTGCCTCACTTATTTTATTAGTGTCCTCTGCAGCCGTAGAACAAGGTGCTGGGACTGGTTGAACAGTTTATCCCCCTCTTGCAGCAAATATCTCTCATAGGGGACCCTCAGTAGATCTGGCTATTTTTTCTCTTCATCTTGCAGGGGTATCCTCTATTTTAGGGTCTATTAATTTTATTACAACCGTTCGAAATATACGACCTAAAGGAATAACCCCTGAACGAATTCCTCTATTTGTTTGAGCTGTTGTTATTACTACGGTTCTTCTTCTTCTATCCCTTCCTGTATTAGCCGGAGGAATTACTATACTTCTAACTGATCGAAACCTTAATACCACATTTTTTGATCCTGCAGGGGGTGGAGATCCAATTTTATACCAACACCTATTTTGATTTTTTG--
		Flota_sp._specimen_1                  -AAGATATTGGTACTTTATATTTCATTTTAGGAATTTGAGGTGGCCTTTTAGGTACATCTATAAGTGTCCTTATTCGCACTGAATTAGGACAACCTGGGGCTTTTCTTGGAAGTGACCAAATCTATAACGTTGTTGTAACAGCACATGCCTTTTTAATAATTTTCTTTCTTGTTATACCTGTGTTTATTGGAGGTTTTGGAAATTGATTACTTCCCTTAATAATAGGCGCTCCTGATATAGCATTCCCTCGTATAAATAATATAAGATTCTGATTACTACCTGCAGCACTAACTCTATTAATTTCATCTGCTACAGTAGGACAGGGAGCAGGAACCGGCTGAACAGTGTATCCACCACTTGCAACCCACATTTCTCACAGAGGGCCATCTGTTGACCTTGCCATTTTTTCACTTCATTTGGCAGGAATTTCTTCAATTTTAGGCTCAATTAATTTCATCTCAACAGTTTATAATATACGCCAAAAAAAAACCCACTTAGAGCACATACCGCTTTTCGTCTGAGCCGTAGTTATTACCACATTTTTATTATTATTATCAATACCAGTCTTAGCAGGGGGGATTACTATACTTCTTACAGACCGTAATATTAATACAACTTTCTTTGACCCTTCAGGCGGAGGAGACCCCATTCTATTTCAACATCTATTTTGATTTTTTGGT
		Flota_sp._specimen_2                  -------------------------------------------GCCTTTTAGGTACATCTATAAGTGTCCTTATTCGCACTGAATTAGGACAACCTGGGGCTTTTCTTGGAAGTGACCAAATCTATAACGTTGTTGTAACAGCACATGCCTTTTTAATAATTTTCTTTCTTGTTATACCTGTGTTTATTGGAGGTTTTGGAAATTGATTACTTCCCTTAATAATAGGCGCTCCTGATATAGCATTCCCTCGTATAAATAATATAAGATTCTGATTACTACCTGCAGCACTAACTCTATTAATTTCATCTGCTACAGTAGGACAGGGAGCAGGAACCGGCTGAACAGTGTATCCACCACTTGCAACCCACATTTCTCACAGAGGGCCATCTGTTGACCTTGCCATTTTTTCACTTCATTTGGCAGGAATTTCTTCAATTTTAGGCTCAATTAATTTCATCTCAACAGTTTATAATATACGCCAAAAAAAAACCCACTTAGAGCACATACCGCTTTTCGTCTGAGCCGTAGTTATTACCACATTTTTATTATTATTATCAATACCAGTCTTAGCAGGGGGGATTACTATACTTCTTACAGACCGTAATATTAATACAACTTTCTTTGACCCTTCAGGCGGAGGAGATCCCATTCTATTTCAACATCTATTTTGATTTTTTG--
		Ilyphagus_octobranchus                ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
		Macrochaeta_clavicornis               ---------GTACATTATACTTTTATTTTAGGTATCTGAGCCGGACTCTTAGGAACAATAATAAGAGTAGTTATTCGTACTGAACTCAGACAACCCGGATCATTTCTAGGAAGTGATCAAATTTATAATGTTCTTGTAACTGCACATGCATTCTTAATAATTTTTTTTCTTGTAATACCTGTAATAATTGGGGGATTTGGTAATTGGCTTTTACCATTAATACTTGGCTGCCCCGATATAGCCTTTCCACGAATAAATAATATAAGGTTCTGACTTCTACCAGCAGCACTGCTACTATTAGTTTCATCTGCTGCTGTTGAACAAGGAGCTGGTACAGGATGAACTGTTTACCCCCCTTTATCAGCCAATATTTCCCATAGGGGCCCCTCTGTTGACCTCGCTATTTTTTCCCTTCATTTAGCTGGAATCTCATCAATTCTAGGTTCTATTAATTTTATTACAACAGTTCGAAATATACGACCAAATGGAATAACTCCAGAACGAATTCCTCTATTTGTATGAGCTGTTGTTTTAACAACAATTTTATTATTATTATCTTTACCTGTTCTTGCAGGAGGGATTACTATACTTTTAACCGATCGAAATCTTAATACATCATTTTTTGACCCTGGCGGAGGAGGTGACCCAGTTTTATATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGA
		Macrochaeta_sp.                       ------------------------------GGTATCTGAGCAGGATTATTAGGAACTATAATAAGAGTTTTAATTCGAACCGAACTAAGACAACCAGGTTCTTTCCTAGGAAGAGATCAAATTTATAACGTTTTAGTAACTGCTCATGCCTTCTTAATAATTTTCTTTCTCGTAATACCAGTATTTATTGGAGGATTCGGAAATTGATTACTTCCATTAATACTAGGATGTCCAGATATAGCCTTTCCACGAATAAATAACATAAGATTTTGACTTTTACCCGCATCTCTGCTTCTTCTAGTATCATCCGCGGCCGTTGAACAAGGAGCCGGTACAGGATGAACTGTATATCCCCCATTAGCTGCAAATATTTCCCACAGTGGCCCATCAGTTGACCTAGCTATTTTTTCTCTACACCTAGCAGGAATTTCCTCAATTCTAGGTTCTATTAACTTTATTACCACAGTACGCAATATACGCCCAAAAGGAATAACCCCCGAACGAATTCCTCTATTTGTATGAGCAGTAGTACTAACAACCATTTTATTACTACTGTCTCTACCAGTCCTAGCAGGAGGAATCACAATATTATTAACTGATCGTAATCTAAATACATCATTCTTCGATCCAGGAGGAGGAGGAGACCCAATTCTATACCAGCATTTATTTTGATTTTTTGGT
		Pherusa_plumosa_California            ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
		Pherusa_plumosa_Massachusetts         ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
		Poeobius_meseres                      AAAGATATTGGCACCTTATATTTTATTTTTGGCGTTTGATCTGGGCTTTTAGGAACATCCATAAGAGTTATTATCCGAACAGAATTAGGACAACCTGGTGCATTTTTAGGAAGAGACCAAATTTATAACGTTATTGTAACTGCACATGCATTCCTAATAATTTTCTTTTTAGTAATGCCTGTATTTATTGGTGGATTTGGTAATTGACTTCTACCATTAATATTAGGAGCTCCAGATATAGCATTCCCCCGAATAAATAATATAAGATTTTGGTTATTGCCCGCCTCATTAATTTTACTTGTTACCTCAGCGGCTGTTGAACAAGGAGCAGGAACAGGATGAACTGTATACCCCCCCCTATCTTCTAACATCTCCCATAGTGGCCCTTCCGTAGACCTAGCTATTTTCTCTCTACATTTAGCTGGTGTTTCTTCAATTCTAGCCTCTATTAACTTTATTACTACTATTCGTAACATACGTCCAAATGGTATAACTCCTGAACGAATCCCATTATTTATTTGAGCTACTCTTATTACAACAATCCTTCTACTACTCTCCTTACCAGTTTTAGCTGGGGGGATTACCATACTTTTAACAGATCGAAATTTAAATACAACATTCTTTGACCCCGCTGGAGGTGGAGACCCCGTATTATATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGT
		Therochaeta_collarifera               ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
		Brada_villosa_California              ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
	;
END;

BEGIN CODONS;
CODONPOSSET * CodonPositions = 
 N: 1 - 681 ; 
 CODESET * UNTITLED = Universal: all ; 
 END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
 END;