NEXUS
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[Matrix accession#: M3951]

BEGIN TAXA;
	TITLE M3951;
	DIMENSIONS  NTAX=18;
	TAXLABELS
		Pherusa_plumosa_California	Pherusa_plumosa_Massachusetts	Poeobius_meseres	Therochaeta_collarifera	Brada_villosa_California	Brada_villosa_Sweden	Diplocirrus_glaucus_Sweden	Flabelliderma_ockeri	Flabelligena_sp.	Flabelligera_affinis_California	Flabelligera_affinis_Iceland	Flabelligera_affinis_Sweden	Flabelligera_infundibularis	Flota_sp._specimen_1	Flota_sp._specimen_2	Ilyphagus_octobranchus	Macrochaeta_clavicornis	Macrochaeta_sp.
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M3951;
	DIMENSIONS NCHAR=568;
	FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = - ;
	MATRIX
		Pherusa_plumosa_California            ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
		Pherusa_plumosa_Massachusetts         ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
		Poeobius_meseres                      ------------------------------------------------------------------------------------------GCATAATAATTTGCCTTTTAATTGAAGGCTAGAATGAATGGATAAACGAAAATCTCCCTGTTTCTTATCAAC-CTCTAA--AAACTTATTTTTAGGTGAAAAAGCCTA-AATACATTTAAAAGACAAAAAGACCCTGCAGAGCTTTATAC-AA----AATTT---ATT---TAC---TT-TATAAACTAG-T--------------ATTTTGTTGGGGCGACATAGGATTAAGTAAAACATCCTC-TATAATA-AAGAATTACTATTCATAT-TAAAGATCC--T-TATA---TGAT---------CAAAGGCTT--AA-----AGCTACCTCAGGGATAACAGGCTTAT-CTTTCTTGAGAGTCCCTATCGACAGAAAACT------------------------------------------------------------------------------------------------
		Therochaeta_collarifera               ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
		Brada_villosa_California              ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
		Brada_villosa_Sweden                  ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
		Diplocirrus_glaucus_Sweden            ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
		Flabelliderma_ockeri                  ----------------------------------------------------------------TGCGGTATCCTGACCGTGCWAAGGTAGCATAATAATTTGCCTCTTAATTAGAGGCTAGAATGAATGGACAAACGAAAGTATTACTGTTTCTTATAAAT-AAATAA--AAATTTATGTTTAGGTGAAAAAGCCTA-AATTCTATTAAAAGACAAAAAGACCCTGCAGAGCTTAAT----ATAA--ATTT-T-CCC---TTT---TC-GAATTAAAA--T--------------ATTTTGTTGGGGCGACAAAAGATAATTTAAAGCATCTT--TAACATAAAAGGGTTACATCCCTATT-AATAGATCC---AAATA---TGAT---------CAAAGAT-T--AA-----AGCTACCTCAGGGATAACAGGCTTAT-CTTTCTCAAGAGTTCAAATCAACAGAAAGTTTTGGCACCTCGATGTTG-------------------------------------------------------------------------------
		Flabelligena_sp.                      AAACATTGCCTTATGAATAA-ATTATATAAGGTACATCCTGCCCAGTG-AATAT-TTCAACGGCCGCGGTATCCTGACCGTGCTAAGGTAGCATAATCATTTGCCTTTTAATTAAAGGCTTGTATGAACGGACAAACGAAAATTAAGCTGTCTCTTTAAAAA-CAATAA--AAATTAATCTTCTAGTGAAAAAGCTAG-AATATAAATAAAGGACAAAAAGACCCTATAGAACTTTAAT-TAACAGTATGCTATCATTAT-TCTATTTA-TAGATAAAAG---TAGCACTCTTATATTTTGGTTGGGGCGACTTAGGAATAACCTAAACTTCCTA-TTATACAATAAGCGCCTCTGCTTTCC-TAATGACCC--ATTTTAA--TGAT---------CATAAGAAT---A------GTTACCTTAGGGATAACAGACTAAT-TTTCCTTGAGAGACCATATTGACAGGAAAGTTTGGCACCTCGATGTTGGCTTAGGTACCCCTAAAGGTGCAGAAACT--------------------------------------------------
		Flabelligera_affinis_California       ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
		Flabelligera_affinis_Iceland          ------------------------------------------------------------------------------------------GCATAATAATTTGCCTTTTAATTAGAGGCTAGAATGAATGGACAAACGAAGATATTACTGTTTCTTATAAAT-AACTAA--AAATTTATATTTAGGTGAAAAAGCCTA-AATTCAATTAAAAGACAAAAAGACCCTGCAGAGCTTGAT----ATTT--ATTT-T-CTT---TTT---CA-GAAATAAAAA-T--------------ATTTTGTTGGGGCGACAAAGGATAAATTAAATCATCCT--TAAAATATACGGGTTACTTCCCTAAT-AATAGATCC--T-AATA---TGAT---------CAAAGAC-T--AA-----AGCTACCTCAGGGATAACAGGCTTAT-CTTTCTCAAGAGTTCATATCAACAGAAAGTC------------------------------------------------------------------------------------------------
		Flabelligera_affinis_Sweden           ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
		Flabelligera_infundibularis           ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGAATGGACAAACGTAAATATAACTGTTTCTTATAAAT-AAATAA--AAATTTATCTTTARGTGAAAAAGCCTA-AATTTTATTAAAAGACAAAAAGACCCTGCAGAGCTTAAT----------ATTTCCCTTT---TACAATTA-AAAATAAAA--T--------------ATTTTGTTGGGGCGACAAAGGATAATATAAATCATCCT--TAATAAATAAGGAACCCTATCCTCTT-AAAAGATCC-----TTAT-TTGAT---------CAAAGAC-T--AA-----AGCTACCTCAGGGATAACAGGCTTAT-CTTTCTCAAGAGTTCATATCTACAGAAAGTTTTGGCACCTCGATGTTGGCTTAGGAA----------------------------------------------------------------------
		Flota_sp._specimen_1                  AAACATTGTCTCTTGCAATATAAATAATAAGAGATACATCCTGCCCAGTGAA-ATTTCAACGGCCGCGGTATCCTGACCGTGCTAAGGTAGCAAAATAAATTGCCTTCTAATTGATGGCGAGAATGAATGGACACACGAAAACTAAACTGTTTCTTAAAAAT-ATCTAA--AATTTTATTTTTAGGTGAAAAAGCCTA-AATAAAACTAAAAGACAAAAAGACCCTATAGAGCTTCAT---AATT--AACTT---ATT---TATACACC-TATAAATTAC-TT-------------ATTTTGTTGGGGCGACAAAGGATTATATAAAACATCCTA-TACCTTATAAGAAAAATTATTCAAAT-CAATGACAC--TCTAAG---ATAT---------TAAAGGTAT--AA------GCTACCTTAGGGATAACAGGCTTAT-TTTTCTTGAGAGCCCATATCGACAGAAAAGTTTGGCACCTCGATGTTGGCTTAGAATTACCTAATAAAGCAAAAATTATATAC-----GGTAGGTTTGTTCAACCTTTAAAATTCTACGTGATCTGA
		Flota_sp._specimen_2                  ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
		Ilyphagus_octobranchus                ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
		Macrochaeta_clavicornis               ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
		Macrochaeta_sp.                       ------------------------------------------------------------------------------------AAGGTAGCATAATCATTTGCCTTTTAATTGAAGGCTTGTATGAATGGTAAAACGAATATATAACTGTCTCCTTAAAAT-ATATAA--AAATTATCCCTTTAGTAAAAAGACTAA-AATTCAAATAAAAGACAAAAAGACCCTGTAGAACTTGATTTAAATTTAAATACCATATTAA-CCTTTATT-TATAAAAGACAATTATCTAAATTCTAATTTGGTTGGGGCGACTTAGGAATATATAAAACTTCCT--AAAAATAAAAGATTTAATAATCTATC-AAATGACCC----ATCATTTTGTT---------CATATAAAA---A------GTTACCTCAGGGATAACAGACTTAT-TTTCCTTAAKARATCATATTGACAGGAAAGTTTGGCACCTCG-------------------------------------------------------------------------------------
	;
END;

BEGIN CODONS;
CODONPOSSET * CodonPositions = 
 N: 1 - 568 ; 
 CODESET * UNTITLED = Universal: all ; 
 END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
 END;