NEXUS
[File created by TreeBASE:  1/16/09  15:36:41]
[Matrix accession#: M4002]

BEGIN TAXA;
	TITLE M4002;
	DIMENSIONS  NTAX=99;
	TAXLABELS
		Otholobium_swartbergense_ae101	Orbexilum_simplex_ae102	Orbexilum_melanocarpum_ae103	Orbexilum_onobrychis_ae104	Pediomelum_reverchonii_ae105	Pediomelum_palmeri_ae106	Pediomelum_esculentum_ae107	Cullen_cinereum_ae108	Rupertia_hallii_ae109	Orbexilum_virgatum_ae110	Pediomelum_aromaticum_ae113	Pediomelum_rhombifolium_ae114	Pediomelum_hypogaeum_scaposum_ae115	Pediomelum_hypogaeum_scaposum_ae116	Psoralidium_tenuiflorum_ae117	Psoralidium_lanceolatum_ae118	Pediomelum_cuspidatum_ae120	Pediomelum_cyphocalyx_ae121	Pediomelum_cyphocalyx_ae123	Pediomelum_megalanthum_ae124	Pediomelum_megalanthum_retrorsum_ae125	Pediomelum_mephiticum_ae126	Pediomelum_argophyllum_ae127	Cullen_americanum_ae128	Orbexilum_melanocarpum_ae129	Orbexilum_onobrychis_ae130	Otholobium_striatum_ae131	Orbexilum_pedunculatum_gracile_ae134	Hoita_macrostachya_ae135	Orbexilum_virgatum_ae136	Orbexilum_lupinellus_ae137	Rupertia_hallii_ae138	Hoita_macrostachya_ae139	Rupertia_physodes_ae140	Pediomelum_subacaule_ae141	Pediomelum_subacaule_ae142	Pediomelum_canescens_ae143	Pediomelum_piedmontanum_ae144	Rupertia_physodes_ae146	Hoita_orbicularis_ae147	Hoita_orbicularis_ae148	Pediomelum_piedmontanum_ae149	Pediomelum_argophyllum_ae47	Orbexilum_onobrychis_ae48	Orbexilum_simplex_ae49	Pediomelum_megalanthum_retrorsum_ae50	Pediomelum_cyphocalyx_ae51	Pediomelum_rhombifolium_ae52	Pediomelum_linearifolium_ae53	Pediomelum_cuspidatum_ae54	Pediomelum_aromaticum_ae55	Pediomelum_californicum_ae56	Pediomelum_castoreum_ae57	Pediomelum_digitatum_ae58	Pediomelum_esculentum_ae59	Pediomelum_hypogaeum_ae60	Pediomelum_latestipulatum_appressum_ae61	Pediomelum_megalanthum_epipsilum_ae62	Pediomelum_megalanthum_ae63	Pediomelum_mephiticum_ae64	Pediomelum_pariense_ae65	Pediomelum_pentaphyllum_ae66	Pediomelum_reverchonii_ae67	Pediomelum_hypogaeum_scaposum_ae68	Psoralidium_junceum_ae69	Psoralidium_tenuiflorum_ae71	Psoralidium_lanceolatum_ae79	Pediomelum_argophyllum_ae73	Pediomelum_aromaticum_barnebyi_ae74	Pediomelum_aromaticum_tuhyi_ae75	Pediomelum_pariense_ae76	Pediomelum_pentaphyllum_ae77	Pediomelum_hypogaeum_subulatum_ae78	Desmodium_floridanum_ae80	Orbexilum_lupinellus_ae81	Pediomelum_canescens_ae82	Pediomelum_piedmontanum_ae83	Pediomelum_subacaule_ae84	Orbexilum_pedunculatum_ae85	Rupertia_physodes_ae87	Rupertia_rigida_ae88	Hoita_orbicularis_ae89	Pediomelum_humile_ae90	Bituminaria_bituminosa_ae91	Cullen_australasicum_ae92	Cullen_discolor_ae93	Cullen_tenax_ae94	Otholobium_bracteolatum_ae95	Otholobium_brachystachyum_ae96	Otholobium_mexicanum_ae98	Abrus_precatorius	Amphicarpaea_bracteata	Apios_americana	Glycine_canescens	Cologania_pallida	Glycine_max_cv_Essex	Glycine_microphylla	Phaseolus_vulgaris	Pueraria_montana_lobata
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M4002;
	DIMENSIONS NCHAR=10683;
	FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = - ;
	MATRIX
		Otholobium_swartbergense_ae101                 GGATCATTGTCGATGCCTC-AAAAATCAGACCGACCCGCGAACACGTTCCGTA--CACAG-CGT---CG-GG---GGGGGAGCG------GCGATC-----------------------------------GC--------GAGAACG--------------------------CCCC-------CCCC----------------------------------------------CT-CC---CG---------------GC-AAACACAAACCCCGGCGCTTCGTGCGCCAAGG-AAATC-AAACCTGTT----GAGTGC--GGCTCCCCGACGTGGCCCGGAGACGGCG-TCCCGCGG--GAGTCCCCACG-AAGCAT-CG---T---AATA-CACAATGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCATTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCACACATCGTTA--CCCCC----CAAACT------CTCCTCTCCTCCCCTCCCCCGCGGACCGGAGGAAGA---GGGAAC-----GTCCGGGGTGTGCATGCTGACCTCCCGCGGGCATCCCGCCCCGCGGTTGGTTCAAATCCGAGTCCGTGGCCGGGTGCGCCGTGGTAGAATGGTGGATGGGCCAACC-------ACGCCCGAGACCAACCACGC----GAGCCCCGGCC---TCAGAACTCTCCGACGACCCTCCGCGTGC---ATTC----TGTT--------GCACGCTCCCAACGAGACCTCAGGTCA??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GGAACTTACCAAGTGAGAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTCACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTTCCGAAAACAAAGAAAAGTTCAGAAAGTGATAAT--AAAAAAGGGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTATTCTAACAA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AATGAAGA---------TCCATTTGTGATAAAAATATTCA------CAAATGAAAGATGTGAATCAAATCAATTCC-------------AAGTTGAAGAAAAGATGGAATATTCATTGATCAAATTATTCACTTCATCATAATCTGATAGA----------------TCCCTTGAAGAACTGATCAATCAGACGAGAATAAAGATAGAGTCCTATTCTACATGTCAAT--------------------------ACTGACAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGATTTAATCAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCCAAAAAAAGGTCTGTTTAACTTTCTAA------TTTTTTTCCCATATCCTCTC-----GATCTTTAA---GTCGTTATTTATGTGTTTTATTCAGTTTCTATTCAGTTTATTCTTT-CACAACTAAATTGG----------------AATTTTTCTTTTTATTTT----CAAAAATTTCTTATGATAATTACAAGTCACAAGTTTTGAAATAT-----------------------------------------------ATATGTGAAACACATAGAATTTTTTTT------ATGATAAACGTACAAATGAATATATTC--TTTTTTTTTTGAGCAAGGAATTCT---CATATGCGTGATTAACAA--AACAATACAAAATAATTACTACTACTGA----------------AACTAACTTACAAACTTTGATTTTTCGTC--------------TTTTTTTTTACTTAGTTGATATAG---ATTCATTGACATATACTCCAGTAATCTTTT-AAAATAAAAATGAGTCTTAT--GCGGCAAGAAGGGTCGGGATAGCTCAGTG????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????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		Orbexilum_simplex_ae102                        GGATCATTGTCGATGCCTC-AAAAATCAGATCGACCCGCGAACACGTCCCGTA--CACAG-CGT---CGCGG---GGGGGAGCG------GCGATC-----------------------------------GG--------CAGAACG--------------------------CCTC-------CCCC----------------------------------------------CT-CC---CG---------------GC-AAACACAAACCCCGGCGCTTCGTGCGCCAAGGAAAATC-GAACCTGTC----GAGTGCGTGGCTCCCCGACGG--------------------------GAGTCGCCACG-AAGCAT-CA---C---AATA-CACAATGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCATTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCACACATCGTTA--CCCCC----CAAACC------CGTTC---------------------------------------------GTTCGGGGGGTGCACGCTGACCTCCCGCGGGCA-AC-GCCCTGCGGTTGGTTCAAATCCGAGTCCGTGGCCGGGTGCGCCGTGGTAGAATGGTGGATGGGCCAACC-------ACGCCCGAGACCAACCGCGT----CGACCCCGAGC---CCAGAACTCCACGACGACCCTGCGCGCGC---CATG----CGTG--------GCACGCTCCCAACGAGACCTCAGGTCATGTGGTCTCATCCAGTTACAAGCTATGCGCTATGGATCTGTACCAATTGTTGCCTCAACAGGTGGATTAGTTGACACTGTCAGAGAAGATTTCACTGGATTTCAGATGGGTGCCTTCAATGTTGAGTGTGATGCTGTGGATCCCGCGGATGTGAAGGCTATATCAAAGACTGTCAAAAGGGCCCTTTCAGTCTACGGAACTCCAGCTTTTACAGAAATAATCAAGAACTGCATGGCTCAAGATCTTTCATGGAAGGTGCCTGCTAAAAGGTGGGAGGAAGTGCTACTAAACTTGGGAGGTATAA---------TTCTTGC--TGACAATCCTTCACATCTA-------GTG-TTCTTTCCCGCCATAAGATTTCTTCTAATCATT--GACCTT-ACATTTTTCTTTAACTTCTATTCTTCACTGTGCTAGAGTA--------------ATAT------------CCTCCGCCAGTTCATAGTCTTCATCCTTCAAGTGTGTCCGCA-TAGCAAAAGTTCTAAA----CACTAACCATTA-------ATTTTTCAATATTTTGC--TAGAGTGA-AGTGGTACACCATAAGCTGTGATGAGATTTATATACTCCTGCCACCC---CTAATTATAAGACAAGACATAATTGACTAATTTACGCTTATTTAG-------TTAATTGCTTTAAATGTGTTTATAAAT---------------------------------AGACAATTC---TAT--------GACCGA-AGACTATAT---TTTTTTTAGTATAATTTCTATGACTGTCAATCGATCAGAAATTATGGTATGAATG-ACTTTTAAGATAGTTTTTACAAAAAAATTAATAAATTTATCATATATTTATCATATATGACAA-TTTTTGTCTTAAAAATAAT--TTACA-CCCAG--CACACAGACTATTTTCTCA-TAAA-----TTTTCCCCACAAC--TATATTGAAGCTACCAATCCAAATTCCAAACCATGTTTC-CTGT--------TTGATCTTAGTAACTGAATTTTGTTTTGGAAATAGGGCCACTCAGCCATCTCTCCCCAATTGAAAATATAGAANTACTTTGTTTATGTTATATCACATAAACAAGAAGAGCAAAAAAAGGCGCTTG---AAAAAAAAAAAGACTTC-TTTTTTTTTTATCTTATTTTTTATCTTATCTC--TTTTTTTTCT-----ATTTGATTTCTATT--------------------CAGTAT----------TCTATTATATC-TTCT-------------------TCTA-------------------------TTTTTGAGTTTC---CTTTTT--TCTTTTTCTACAGCCAAAGAGCCCGGCCAGTACCTAGTCGGGCTCT-----TTTTATTCC--------------------CATGAATCTTGAATACCAATGATTTATTTGAATTGAATGTATTTTTTTGG---------------AAAAAAA------GACTTGTAATTTAAACACGATCAAAC------------------------------------------------ATAACTAAGAGATACGGATTGATTCCTATGATATAAAACCAA----AATAAGATAATATC--AAAATG--------------------TCCTTTTT-----TATGGCTCCTTCTC-T-------------------------TTTTTTCTG---------GTAATGTAA-----------------------------------------------------------------------ATTTGAT------AT-TAAATTCTATAT---CTATTC--------TAT----ATATA-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTAATTATTA-------GA------ATATTATGCCCC-----------TCTATTTCTTT-ATTTATTTTGTCTGATTGCTTTGTTTGACAAAAG----------ATACAATANTNGNNTNGN--------ANNGGGTATAGTTNAGNGGNAAAAGTGGGAACTTACCAAGTGAGAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTCACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTTCCGAAAACAAAGAAAAGTTCAGAAAGTGATAAT--AAAAAAGGGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTATTCTAACAAATGGAGTTGACGATTTTTCCTTTTTGCATTAGGAAAA-----GAATCCTTCCATTTAAATTCCAGGAATGGATCAAAGATAAAC--------------------ATATATATATATAG---------------------ACTGA-AATACTATTTCAA----------TTGATTAATGAAGA---------TCCATTTGTGATAAAAATATTCA------CAAATGAAAGATGTGAATCAAATCAATTCC-------------AAGTTGAAGAAAAGATGGAATATTCATTGATCAAATTATTCACTCCATCATAATCTGATAGA----------------TCCCTTGAAGAACTGATCAATCAGACGAGAATAAAGATAGAGTCCTATTCTACATGTCAAT--------------------------ACTGACAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGATTTAAT-AAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCC---AAAAGGCCTGTTTAACTTTCTAA------TTTTTTTCCCATATCCTCTC-----GATCTTTAA---GTCGTTATTTATGTGTTTTATTCAGTTTCTATTCAGTTTATTCTTT-CACAACTAAATTGG----------------AA------TTTTTATTTT----CAAAAATTTCTTATCATAATTACAAGTCACAAGTTTTGAAATAT-----------------------------------------------ATATGTGAAACACATAGAATTTTTTTTATGATAATGATAAACGTACAAATGAATATATTA-------TTTTTGAGCAAGGAATTCT---CATATGCGTGATTAACAA--AACAATACAAAATAATGACTACTACTGA----------------AACGAACTTACAAACTTTGATTTTTCGTC-------------TTTTTTTTTGACTTAGTTGATATAG---ATTCATTGACATATACTCCAGTAATCTTTT-AAAATAAAAATGAGTCTTAT--GCGGCAAGAATGGTCGGGATAGCTCAGTGACACATTTCTATGAAGCAATCGGTTCGTCCATACCATTGGTAGAGCTTGTAAAACCACGACTGATCCAGAAAGGAATGAATGGAAAAAGTAGCATGTCGTATCGATGAAGAATTCTAAAAATATTTCATTCTCTT-------------------ATAGGAAGGATCCGA-------------CCAAAATTTGAGTTTGTGAATTCTTGGCTCGGAACAAAAAAATTCATTTTGGTTTATTTAATAAAGGGATAGAGCTTGGTGGCTCCAATTATAATA-----GGGAAACAAAAAGCAACGAGCTTTCATTTATTTTTTATTTGAATGATTACCCCATCTAATTGTACGTTAAAAAGAGGTTAGTGCTTGATATGGGAAAAGCTTTTCCAGTGAATGAA--TTATTTATTTTTGTTATGAGTCCTAACTATATAGCTA------TTTTCCATTCTATTTT----TGGGTAGCGATAAA-------TGTGTAAAAGAAAGAGTATATTGATAAAGATA--TTTTTTCCAAAATCAAAAGAGCGATTAGGTTGAAAA---------AAAAAAAAAATAAAGGATTCCTAACTAGCTTGTTATCCTAGAACAAAAAAAA-TTAGGTGGAAA-GGGCGATTAGCGAGAGTCCGTTGATGATTTTTACTTGTTTTCT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		Orbexilum_melanocarpum_ae103                   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		Cullen_cinereum_ae108                          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		Rupertia_hallii_ae109                          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		Pediomelum_rhombifolium_ae114                  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		Psoralidium_lanceolatum_ae118                  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		Pediomelum_mephiticum_ae126                    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		Cullen_americanum_ae128                        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		Hoita_macrostachya_ae135                       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		Rupertia_hallii_ae138                          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		Hoita_macrostachya_ae139                       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		Hoita_orbicularis_ae147                        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		Hoita_orbicularis_ae148                        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		Pediomelum_piedmontanum_ae149                  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		Pediomelum_argophyllum_ae47                    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		Pediomelum_aromaticum_ae55                     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		Pediomelum_californicum_ae56                   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		Pediomelum_digitatum_ae58                      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		Pediomelum_esculentum_ae59                     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		Pediomelum_mephiticum_ae64                     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		Pediomelum_reverchonii_ae67                    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		Pediomelum_hypogaeum_scaposum_ae68             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		Psoralidium_junceum_ae69                       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		Psoralidium_tenuiflorum_ae71                   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		Psoralidium_lanceolatum_ae79                   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		Pediomelum_argophyllum_ae73                    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		Pediomelum_hypogaeum_subulatum_ae78            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		Desmodium_floridanum_ae80                      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		Pediomelum_canescens_ae82                      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		Pediomelum_piedmontanum_ae83                   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		Hoita_orbicularis_ae89                         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		Glycine_microphylla                            GGATCATTGTCGATGCCTC--ACAATCAGATTGACCCGCGAATTTGTTTATC-CATCTAC-CGT---CGGGA---GGGAGGGAG------GAAGAC---------------------------------------------CAGGTCG------CCCCGTGCGGCTGGGCTCATCCTC--------CTC----------------------------------------------GT-CCTCACG---------------GC-AAACACAAACCCCGGCGCTTCGTGCGCCAAGG-AACTC-AAATCTGTT----AAGTGC--GACTCCCGGG---GGCCCGGAGACGGTG-TCCCGCGG--GCGTCGTCACG-ACACAT-CA---T---TACA-TACAATGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCATTAGGCCGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCACACATCGTTA--CCCCCAACGCTAACC---------------------------------------------TAGTG------TTGCGCGGGGTGTATGCTGACCTCCCGCGAGCA-CCTGTCTCGTGGTTGGTTGAAATCTGGGTTCATGGCCGACTTCGCCGTGACAAAATGGTGGATGAG----CA-------ACGCTCGAGACCAATCACGT----GCGAGCCGGTCAGTTATGGACTCACAGACGACCCTGTGCGTGC-----AC----------------GCACGCTCCCAACGAGACCTCAGGTCATGTGGTCTGGTTCAGTTGCATGCCATGCCATATGGAACGGTGCCCATTGTTTCCTCCACTGGTGGACTCGTTGACACCGTTCAAGAAGAGTATACTGGATTCCACATGGGAGCATTCAATGTTGAGTGTGAAGCTGTTGATCCAGTTGATGTGGAAAAGTTAGCAACTACTGTAAAGAGAGCCCTTGGAACCTATGGTACCCCAGCCATGACACAGATGATCCAGAGCTGCATGTCCCAAGACTTTTCATGGAAGGTACCAGCCAAACATTCGGAAAAGGTGCTGTTGAGCCTTGAGGGTATAGACTATGCCCTTCTTTTTCTCTATTTCCTTCTCATCTACACCTTGGTG-TTCCCTT-----ACAACATTATTTTTA--------------------CTCTTTAAACATTAAATGTT---TGTGAAAGAGTAAGTAGAGTAGAAACATAG------------CCT-------TGCATAATTTTGAT-AGAGGAGTG-------AATCGGCAAGATTATAAC-----------------------------TGGTGTTTTTCTGTAAAGC---------ATGCAATTTGCTGCTGTGTGAAGCAATTGTTTTGCTCACGA---CTGAC------CCAAGAGTAAAACAACTAAAGT-------------------TTGA--GCTTTA-----GGCTACCAAC---------------------------------AAAGAGTTA---------------------------------TTTT------------------GCCATTAGTCCCTTAGACCTCATTTTCTG---------TTGGGTCAGTCCCGAT----------------------------------------------TTTGCTTTTAA--CTCA--CTGCA---------ACAGAAAATGTTTT------------------------------------ACGTTACACCTCTAAGGCATGAGCCATGG----AGGGAAATGCAGTTTATCTCATCATTGGGGT---GATTCTGATGCAGGGCCACTCAGCCATCTATCCCCAATTGAAAA-ATAGAATTACTTTGTTTATGTTATATCACATAAACAAGAAGATCAAAAAATGGAGCTTG----AAAAAAAAAAGACTTC------TTTTTATCTTATTTTTTATCTTCTCTC--TTTTTTTTCT-----ATTTGATTTCGATT--------------------CATTAT----------TATATTCTATA-TTCT-------------------TTTA-------------------------TTTTTTAGTTTC---CTTTTT--TGTTTTTCTACAGCCAAAGAGCCCGGCCAGTACCTAGTCGGGCTCT-----TTTTATTCC--------------------CATGAATATTGAATAACAATGATTTATTTGAATGGAATGTACTTTATTCG---------------AAAAAAA------GACTTATAATTAAAAC-----CAAAC------------------------------------------------ATAAATAAGAGATACAGATTGATTCCTATGATATGAAATAAA-AAAAATCAGATAATATC--AAAATG--------------------TCCTTTTT-----TATGGCTCCTTCTC-T-------------------------TTTTTTCTG---------GTAACGTAA-----------------------------------------------------------------------ATTTGATTTTTATAT-TAAATTATTTTT--TCTATTA-----AATTAT----ATATA------------------------------------------------TGATATGTTAAAAAAATATGTT--AATTAAAAAAAAATACCTTCAGCAAAAACTAAATCCAAAAATGTAATTTACCCTGTTTT-----TCAAATTTCATTAGAAGATACTCTAATGAAACATGTCAATACTCGAATTATTAGAATATTGA------ATATTATGCCCC-----------TCTATTTCTTT-ATTTATTTTGTCTGATTGCTTTGTTCGACAAAAG----------ATACAATAATTGTATTGT--------AGCGGGTATAGTTTAGTGGTAAAAGTGGGAACTTACCAAGTGAGAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTCACAAAGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTTCCGAAAACAAAGAAAAGTTCAGAAAGTGATAAT--AAAAAAGGGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAAAGGAGTTGACGATTTTTCCTTTTTGCATTAGGAAAA-----GAATCCTTCCGTCAAAATTCCAGGAATGGATCAAAGATAAAC--------------------------ATATATAT---------------------ACTGA-AATAGTATTTCAA----------TTGATTAATGAAGA---------TCCATTTGTGATAAAAATATTCA------CAAATGAAAGATGTGAATCAAATCAATTCC-------------AAGTTGAAGAAAAGATGGAATATTCATTGATCAAATTATTCACTCCATCATAATCTGAAAAA----------------TCCCTTGAAGAACTGATCAATCAGACGAGAATAAAGATAGAGTCCTATTCTACATGTCAAT--------------------------CCCGACAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGATTTAAG-AAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCC---AAAATGCCTGTTTAACTTTCTAA----------TTTCTCATACCCTCTC-----TATCTTTAA---GTCGTTATTTATGTGCTTTATTCAGTTTATATTCAGTTTATTCTTT-CACAACTAAATTGG----------------AATTTTTCTTTTTATTTT----CAAAAATTTCTTATCATAATTACAAGTCACAAGTTTTGAAATAT-----------------------------------------------ATATGTGAAACACATAGAATTTTTTTTT-----ATGATAAACGTACAAATGAAGATTTTC-------TTTTTGAGCAAGGAATTCT---CATATGCGTGATTAACAA--AACAATACAAAATAATTCCTACTACTGA----------------AACTAACTTACAAACTTTTATTTTTCGTC----------TTTTTTTTTTTTTACTTAGTTGATATAG---ATTCATTGACATATACTCCAGTAATCTCAT-AAAATAAAAATGAGTCTTAT--GCGTCAAGAATGGTCGGGATAGCTCAGTGACACATTTCTATGAAGCAATCGGTTCGTCCATACCATTGGTAGAGCTTGTAAAACCACGACTGATCCATAAAGGAATGAATGGAAAAAGTAGCATGTCGTATCGATGAAGAATTCTAAAAAGATTTCATTCTCTT-------------------ATA----GGATCCGG-------------CCAAAATTTTTGTTTGTGAATTCTTGGCTCGGAACAAAAAA-TTAAGTTGGGTTTAATTAATAAAGGGATAGAGCTTGGTGGCTCCAATTATAATA-----GGGAAACAAAAAGCAACGAGCTTTCATTTATTTTTTTTTTGAATGATTACCCCATCTAATTGTACGTTAAAAAGAGATTAGTGCTTGATATGGGAAAAGCTTTTCCGGTGAATGGA--TTATTTATTTTTGTTATGAGTCCTAACTATATAGCTA------TTTTCCATTATATTTT----TGGGTAGCGATAAA-------TGTGTAAAAGAAAGAGTATATTGATAAAGATA--TTTTTTCCAAAATCAAAAGAGCGATTAGGTTG----------------AAAAAAATAAAGGATTCCTAACTAGCTTGTTATCCTAGAACAAAAA----TTAGGTGGAAAA--GCGATTAGAGAGAGTCCGTGGATGAGTTTTACTTGTTTTGT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		Phaseolus_vulgaris                             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		Pueraria_montana_lobata                        GGATCATTGTCGATGCCTC--ACGATCAGATTGACCCGCGAACTCGTTTTTC---------CATCTACCGGC---AGGCAGGCAAGGGTCGGGCTTCTTCCGTCCTCCCCTTGCTCTGCCTGCTGCGTTGGGT--------CGGGGGG-----------------------GGGCCTC--CT----CCT----------------------------------------------TC-CTTCCCA---------------AC-AAACACAAACCCCGGCGCTTCGTGTGCCAAGG-AACTC-CAATCTGTC----AAGTGC--GATTCCCAAC---GGCCCGGAGACGGTG-CCCCGCGG--GCGTTGTCACG-ACACA--CA---TTATTATA-CAAAATGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTTGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCATTAGGTGGAGGGCACGCCTGCCTGGGTGTCACACATCGTTA--CCCCAAACGCAAACAAA------TGTCTCACC-------------------GGACGA--------CCGTTGCGCAGTGGGGTGCACGCTGACCTCCCGCGAGCA-CC-GTGTCGTGGTTGGTTGAAAATCGAGTTCGTGGCCGAGTACGCCGTGATAGAATGGTGGATGAG-TAACA-------ACGCTCGAGACCGATCACGC-GCAGCGACTCGGTCGGCTACGGACTCCTTCGCGACCCTACG-GTGC---CTCCTCTTCGGA--------G-ACGCCCTCAACGAGACCTCAGGTCA?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CCACTCAGCCATCTCTCCCCAATTGAAAA-ATAGAATTACTTTGTTTATGTTATATCACATAAACAAGAAGAGCAAAAAATGGAGCTTG------AAAAAAAAGACTTC------TTTTTATCTTATTTTTTATCTTATCTA--TTTTTTTTCT-----ATTTGATTTCTATT--------------------CCTTAT---------------TATATA-TTCT-------------------TCTA-------------------------TTTTATAGTTTC---CTTTTT--TCTTTTTCTACAGCCAAAGAGCCCGGCCAGTACCTAGTCGGGCTCT-----TTTTATTCC--------------------CAT-------GAATAAGAATGATTGATTTAT-TTGAATGTATTTTATTCG---------------AAAAAAA------TACTTGTAATTTAAACACGATCAAAC------------------------------------------------ATAAATAAGAGATACAGATTGATTCCTATGATATAAAACCAA----AATAAGATAATATC--AAAATG--------------------TCCTTTTTTATTTTATGGCTCCTTCTA-T-------------------------TTTTTTCTG---------GTAACGTAA-----------------------------------------------------------------------GTTTTAT------AT-TAAATTATATATATGATATGTTAAAAAAATAT----GTTAAT------------------------------------------------------------------------AAAAAAAAAAAACACCTTCAGCAAAAACAAAATCCAAAAATGGAATTCACCCCGTTTT-----TCAAATTTCATTAGAAGATCCTCTAATGAAACATGTCAATACTCGAATTATTA-------GA------ATATTATGCCCC-----------TCTATTTCTTT-ATTTATTTTGTCTGATTGCTTTGTTCGACAAAAG----------ATACAATAATTGTA???????????????????????????????????????GGAACTTACCAAGTGAGAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTCACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCCGTTTTCCGAAAACAAAGAAAAGTTCGGAAAGTGATAAT--AAAAAAGGGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAACGGAGTTGACGATTTTTCCTTTTTGCATTAGGAAAA-----GAATCCGTCCATCAAAATTCCAGGAATGGATCAAAGATAAAC--------------------------ATATATAT---------------------ACTGA-AATACTATTTCAA----------TTGATTAATGAAGA---------TCCATTTGTGATAAAAATATTCA------CAAATGAAAGATGTGAATCAA-----TTCC-------------AAGTTGAAGAAAAGATGGAATATTCATTGATCAAATTATTCACTCCATCATAATCTGATAGA----------------TCCCTTGAAGAACTGATTAATCAGACGAGAATAAAGATAGAGTCCTATTCTACATGTCAAT--------------------------ACCGACAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTAAG-AAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCC---AAAAGACCTGGTTAACTTTCTAA-------TTTTTTCCCATATCCTCTC-----TATCTTTAA---GTCGTTATTTATGTGTTTTATTCAGTTTATATTCAGTTTATTCTTT-CACAACTAAATTGG----------------AATTTGTCTTTTTATTTT----CAAAAATTTCTTATCATAATTACAAGTCACAAGTTTTGAAATAT-----------------------------------------------ATATGTGAAAGACAGAGAATTTTTTTTA-----ATGATAAACGTACAAATGAATATCTTA-------TTTTTGAGCAAGGAATTCT---CATATGCGTGATTAACAA--AACAATACAAAATAATTACTACTACTGA----------------AACTAACTTACAAACTTTTATTTTTCGTC-------------TTTTTTTTTTACTTAGTTGATATAG---ATTCATTGACATAGACTCCAGTAATCTTTT-AAAATAAAAATGAGTCTT-T--GCGTCAAGAATGGTCGGGATAGCTCAGTGACACATTTCTATGAAGCAATCGGTTCGTCCATACCATTGGTAGAGCTTGTAAAACCACGACTGATCCAGAAAGGAATGAATGGAAAAAGTAGCATGTCGTATCGATGAAGAATTCTAAAAATATTTCATTCTT---------------------ATA----GGATCCGG-------------CCAAAATTTTTGTTTGTGAATTCTTAGCTCGGAACAAAAAAATTCAGTTGGGTTGAATTAATAAAGGGATAGAGCTTGGTAGCTCCAATTATAATA-----GGGAAACAAAAAGCAACGAGCTTTCATTTATTTTTTATTTGAATGATTCCCCCATCTAATTGTACGTTAAAAAGAGGTTAGTGCTTGATATGGGAAAAGCTTTTCTGGTGAATGGA--TTATTTATTTTTGTTATGAGTCCTAACTATATAGCTA------TTTTCCATTATCTTTT----GGGGTAGCGATAAA-------TGTGTAAAAGAAAGAGTATATTGATAAAGATA--TTTTTTCCAAAATCAAAAGAGCGATTAGGTTG--------------AAAAAAAAATAAAGGATTCCTAACTAGCTTGTTATCCTAGAACAAAAA----TTAGGTGGAAAAA-GCGATTAGAGAGAGTCCGTTGATGGATTTGACTTGTTTTCT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BEGIN ASSUMPTIONS;
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