#NEXUS

BEGIN TAXA;
	TITLE Dataset_3b;
	DIMENSIONS NTAX=11;
	TAXLABELS
		Juncus_bufonius Juncus_ranarius Juncus_articulatus Juncus_oxycarpus Juncus_tenuis Fuirena_ciliaris Pycreus_flavescens Isolepis_cernua Isolepis_reticularis Eleocharis_parvula Eleocharis_geniculata 
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE  'Dataset 3b Plants ITS+rbcL';
	DIMENSIONS  NCHAR=1901;
	FORMAT DATATYPE = DNA GAP = - MISSING = ?;
	MATRIX
	Juncus_bufonius        CGAGACCGGAATAGGATGACCCGCGCAC-AGTGATGGAACTCTCCGGGGCGGTG-GTACTGCCTCGGCCCCGTGGCGCCCCCCTG-----CCTGC-----GGGCA-GGAGGGCTCCGCGATTAAAACCCGGCGCGAAATTGACGCCAAGGTACACTGGAAAAC----AGCA---GGCTTCGGACCG-CGGCCGTGCCGTGTGAACGTCGCCTGAA--CA--ATGATGGAATGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACGTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAGGCCATTTGGCTGAGGGCACGCCTGCC---TGGGCGTCAGTTGCCCACGAACGCTCCCTGCCCGTCTTTTA----------------CGTGGCGGGATGCGGAGCATGGCCATCCTTGCCCTCG---GGCTCGGCGGGCCGAAGCATGTGGCTTGCCGATTGGGGCCGGCAGTGGCGAGTGGTGG----ATTGCTCACGCGAGCCGTACGTCGCCCGTCGTGCCC-CCGAGCGGGAAGCCTCGTGTCACC-CCGGACGCACGGA---------------------TGCC-GTCGGCATCCTCGGACCCCGGAGTTAAAGATTATAAATTAACTTATTATACTCCTGAGTATGAAACCAAAGATACTGATATTCTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCCGGAGTTCCACCTGAAGAAGCAGGAGCTGCGGTAGCTGCCGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTTTGGACTGACGGACTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTACCACATTGAACCTGTTGCTGGAGAAGAAAATCAATTTATTGCTTATGTAGCTTATCCTTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAATATGTTTACTTCCATTGTCGGTAATGTATTTGGTTTCAAAGCCCTACGAGCTCTACGTTTGGAGGATCTGCGAATTCCCCCTGCTTATTCAAAAACTTTCCAAGGACCACCTCATGGGATCCAAGTTGAAAGAGATAAGTTGAATAAATATGGTCGTCCTCTATTGGGATGTACTATTAAACCTAAATTGGGATTATCTGCAAAGAACTATGGTAGAGCAGTTTATGAATGTTTACGTGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAGAATGTAAACTCACAACCCTTTATGCGCTGGAGAGACCGTTTCTTATTTTGTGCCGAAGCAATTTATAAAGCACAGGCTGAAACAGGTGAAATCAAAGGGCACTACTTGAATGCTACTGCAGGTACATGTGAAGAAATGATCAAAAGGGCCGTATTTGCCAGAGAATTAGGAGTTCCTATCGTAATGCATGACTACTTAACCGGTGGATTCACTGCAAATACTAGTTTGGCTTTTTATTGTCGTGATAATGGTCTACTTCTTCACATCCACCGTGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAAAATCATGGTATGCATTTTCGTGTACTAGCTAAAGCATTACGTATGTCTGGTGGAGATCATATTCACTCCGGTACAGTAGTAGGAAAACTGGAAGGGGAACGTGAGATCACTTTAGGTTTTGTTGACTTATTACGTGATGATTTTATTGAAAAAGATCGCAGCCGCGGTATCTTTTTCACTCAAGATTGGGTCTCCATGCCAGGTGTTATACCCGTGGCTTCCGGGGGTATTCATGTTTGGCATATGCCTGCTTTGACCGAAATTTTTGGAGATGATTCCGTACTCCAGTTTGGTGGAGGAACTCTAGGGCACCCTTGGGGAAATGCACCTGGTGCAGTAGCTAACAGGGTTGCTTTAGAAGCATGTGTACA
	Juncus_ranarius        CGATATTGCAACAGGATGACCCGCGCAC-AGTGACGGAACTCTCCGGGGCGGAA-GTACCGCCTCGG-CCCGTGGCGCCTTCCTC-----CCTGCCTGCAGGCAA-GGAGGGCTCCGCGATTCAAAACCGGCACGAAATTGTCGCCAAGATACACAGGAAAAC----TGCA---GGCTTCGGGCGC-CGGCCGCGCCGTGT-CCCGTKGCCTGAA--CAATATGATGGAATGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACGTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAGGCCATCTGGTTGAGGGCACGCCTGCC---TGGGCGTCAGTTGCCCATGAACGCTCCTTCCCCATATTTTG----------------TTTGGCGGGATGCGGAGCATGGCCTTCCTTGTCCTCG---GGCTCGGCGGGCTGAAGCATGTGGCTTGCCAATTGGGGCCGGCAGTGGCGAGTGGTGG----ATTGCTCACGCGAGCCGTACGTCGCCCTTCGTGCCC---TGAGCGGAAGCCTCTTGTCACC-CCGGACGCATGGA---------------------TGCCTAACGGCTTCCTCGGACCCTGGAGTTAAAGATTATAAATTAACTTATTATACTCCTGAGTATGAAACCAAAGATACTGATATCCTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCCGGAGTTCCACCTGAAGAAGCCGGAGCTGCGGTAGCTGCCGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTTTGGACTGACGGACTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTATCACATTGAACCTGTTGCTGGAGAAGAAAATCAATTTATTGCTTATGTAGCTTATCCTTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAATATGTTTACTTCCATTGTCGGTAATGTATTTGGTTTCAAAGCCCTACGAGCTCTACGTTTGGAAGATCTGCGAATTCCCCCTGCTTATTCAAAAACTTTCCAAGGACCACCTCATGGGATCCAAGTTGAAAGAGATAAGTTGAATAAATATGGTCGTCCTCTATTAGGATGTACTATTAAACCTAAATTGGGATTATCTGCAAAGAACTATGGTAGAGCAGTTTATGAATGTTTACGTGGTG????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
	Juncus_articulatus     GTTAACCCAAATAGGATGACCCGTGCAC-CGTGATGGAATTCCCCGGGGCGGTG-ATGCCGCCTCGG-CCCGTGGAGCCTTCCCG-----CCCCC-----CGGCG-AGGAGGCTCCATGATTAAAAACCGGCGCGGATTTGACGCCAAGGTATACTCTTAAG-----GGCA---GCGGCCGGCAGA-CGGCTGTGCCGTTTGTTCGGCGCCCGAA-----AATGATGGAATGACTCTCGGCAACGGATATCTAGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAGGCCATCTGGCCGAGGGCACGCCTGCC---TGGGCGTCAGTTGCACTCGAACGCTCCGTGCCCATA-TTCA----------------TGTTGCCGGACGCGAACCCTGGCCCTCCGAGCCCTCG---GGCTTGACGGGCCGAAGAGCGTGGCTTGCCGATTCGGGCCGGCTGTGGCGAGTGGTGGACGAATCGCTCTCGCGACCCGTACGTCGCCCTCCGTCCCCGTTAGGTAGAAGCCCTAAGGATACC-CCGGACATGAGGG---------------------TGCCGACCGGCAACCTCGGACACAGGGGTTAAAGATTATAAATTAACTTATTATACTCCTGAGTATGAAACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCCGGAGTTCCACCTGAAGAAGCAGGAGCTGCGGTAGCTGCCGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTTTGGACTGATGGACTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGCTGTTACCACATTGAACCTGTTGCTGGAGAAGATAATCAATATATTGCTTATGTAGCTTATCCTTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAATATGTTTACTTCCATTGTAGGTAATGTATTTGGTTTCAAAGCCCTACGAGCTCTACGGTTAGAGGATCTACGAATTCCCCCTGCTTATTCAAAAACTTTCCAAGGCCCGCCTCATGGTATCCAAGTTGAAAGAGATAAGTTGAACAAATATGGTCGTCCTCTATTGGGATGTACTATTAAACCTAAATTGGGATTATCTGCAAAGAACTATGGTAGAGCAGTTTATGAATGTCTACGCGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAAAATGTAAACTCACAACCCTTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTTTGTGCTGAAGCAATTTATAAAGCACAGGCTGAAACAGGTGAAATCAAAGGACACTACTTGAATGCTACTGCAGGTACATGTGAAGAAATGATCAAAAGGGCTGTATTTGCCAGAGAATTGGGAGTTCCTATTGTAATGCATGACTACTTAACTGGAGGATTCACTGCAAATACTAGTTTGGCTTTTTATTGTCGTGATAATGGTCTACTTCTTCACATCCACCGCGCAATGCATGCAGTTATTGATAGGCAGAAAAATCACGGTATGCATTTTCGTGTATTAGCTAAAGCATTACGTATGTCTGGTGGAGATCATATTCACTCTGGTACAGTAGTAGGAAAACTGGAAGGTGAGCGTGAGATGACGTTAGGTTTTGTTGATTTATTACGTGATGATTTTATTGAAAAAGATCGCAGTCGCGGTATCTTTTTCACTCAAGATTGGGTTTCCATGCCAGGTGTTATACCCGTGGCTTCAGGGGGTATTCATGTTTGGCATATGCCTGCTTTGACCGAAATCTTTGGAGATGATTCCGTGCTTCAGTTTGGTGGAGGAACTTTAGGACACCCTTGGGGAAATGCACCTGGTGCAGTAGCTAATAGGGTAGCTTTAGAAGCATGTGTACA
	Juncus_oxycarpus       ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CAGGGGTTAAAGATTATAAATTAACTTATTATACTCCTGAGTATGAAACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCCGGAGTTCCACCTGAAGAAGCAGGAGCTGCGGTAGCTGCCGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTTTGGACTGATGGACTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGCTGTTACCACATTGAACCTGTTGCTGGAGAAGATAATCAATATATTGCTTATGTAGCTTATCCTTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAATATGTCTACTTCCATTGTGGGTAACGTATTTGGGTTCAA????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AACCCAAATTGGGATTAACCCCTAAAAAATTCGGTAGAGCTTGTTATGAATGTCTTCGTGGTGGACTTGATTTTACTAAAGATGATGAGAACGTGAACTCACAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTTTGTGCCGAAGCTATTTATAAAGCACAAGCTGAAACAGGTGAAATCAAAGGGCATTACTTGAATGCTACTGCGGGTACATGTGAAGAAATGATTAAAAGGGCTGTATTTGCCAGAGAATTGGGAGTTCCTATCGTAATGCATGACTACTTAACTGGAGGATTCACTGCAAATACTAGTTTGGCTTTTTATTGTCGTGATAATGGTCTACTTCTTCACATCCACCGCGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAAAATCACGGTATGCATTTTCGTGTATTAGCTAAAGCATTACGTATGTCTGGTGGAGATCATATTCACTCTGGTACAGTAGTAGGAAAACTGGAAAATGAGCGTGAGATGACGTTAGGTTTTGTTGATTTATTACGTGATGATTTTATTGAAAAAGATCGCAGTCGCGGTATCTTTTTCACTCAAGATTGGGTTTCCATGCCAGGTGTTATACCCGTGGCTTCAGGGGGTATTCATGTTTGGCATATGCCTGCTTTGACCGAAATCTTTGGAGATGATTCCGTRCTCCAGTTTGGTGGAGGAACTTTAGGACACCCT????????????????????????????????????????????????????????
	Juncus_tenuis          CGAGACCGGAATAGGATGACCCGCGCAC-AGTGATGGAACTCTCCGGGGCGGTG-GTACTGCCTCGGCCCCGTGGCGCCCCCCTG-----CCTGC-----GGGCA-GGAGGGCTCCGCGATTAAAACCCGGCGCGAAATTGACGCCAAGGTACACTGGAAAAC----AGCA---GGCTTCGGACCG-CGGCCGTGCCGTGTGAACGTCGCCTGAA--CA--ATGATGGAATGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACGTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAGGCCATTTGGCTGAGGGCACGCCTGCC---TGGGCGTCAGTTGCCCACGAACGCTCCCTGCCCGTCTTTTA----------------CGCGGCGGGATGCGGAGCATGGCCATCCTTGCCCTCG---GGCTCGGCGGGCCGAAGCATGTGGCTTGCCGATTGGGGCCGGCAGTGGCGAGTGGTGG----ATTGCTCACGCGAGCCGTACGTCGCCCGTCGTGCCC-CCGAGCGGGAAGCCTCGTGTCACC-CCGGACGCACGGA---------------------TGCC-GTCGGCATCCTCGGACCCCGGGGTTAAAGATTATAAATTAACTTATTATACTCCTGAGTATGAAACCAAAGATACTGATATTCTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCCGGAGTTCCACCTGAAGAAGCAGGAGCTGCGGTAGCTGCCGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTTTGGACTGACGGACTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTACCACATTGAACCTGTTGCTGGAGAAGAAAATCAATTTATTGCTTATGTAGCTTATCCTTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAATATGTTTACTTCCATTGTCGGTAATGTATTTGGTTTCAAAGCCCTACGAGCTCTACGTTTGGAGGATCTGCGAATTCCCCCTGCTTATTCAAAAACTTTCCAAGGACCACCTCATGGGATCCAAGTTGAAAGAGATAAGTTGAATAAATATGGTCGTCCTCTATTGGGATGTACTATTAAACCTAAATTGGGATTATCTGCAAAGAACTATGGTAGAGCAGTTTATGAATGTTTACGTGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAAAATGTAAACTCACAACCCTTTATGCGCTGGAGAGACCGTTTCTTATTTTGTGCCGAAGCAATTTATAAAGCACAGGCTGAAACAGGTGAAATCAAAGGGCACTACTTGAATGCTACTGCAGGTACATGTGAAGAAATGATCAAAAGGGCCGTATTTGCCAGAGAATTAGGAGTTCCTATCGTAATGCATGACTACTTAACCGGTGGATTCACTGCAAATACTAGTTTGGCTTTTTATTGTCGTGATAATGGTCTACTTCTTCACATCCACCGTGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAAAATCATGGTATGCATTTTCGTGTACTAGCTAAAGCATTACGTATGTCTGGTGGAGATCATATTCACTCCGGTACAGTAGTAGGAAAACTGGAAGGGGAACGTGAGATCACTTTAGGTTTTGTTGACTTATTACGTGATGATTTTATTGAAAAAGATCGCAGCCGCGGTATCTTTTTCACTCAAGATTGGGTCTCCATGCCAGGTGTTATACCCGTGGCTTCCGGGGGTATTCATGTTTGGCATATGCCTGCTTTGACCGAAATTTTTGGAGATGATTCCGTACTCCAGTTTGGTGGAGGAACTCTAGGGCACCCTTGGGGAAATGCACCTGGTGCAGTAGCTAACAGGGTTGCTTTAGAAGCATGTGTACA
	Fuirena_ciliaris       TTGCCTTCGGAGAACTTGATCGGTGCATACATAACAAAA-ACTCTGTCGAGGAG-TTGTCCCCTCGGCTACACCGGCCCGGCCCA--TGCTTACCCTCTGGGGGG--TGTTGGTTGTGTGTCGGAATACGGCGTCGGA-TGATGCCAAGGAACACGGGCAGACAGACAGCG---AGTCTTGCTCGG-GAGCTGTGCTGACT-GTCAACCCC--------AATGAAATGTACGACTCTCGGCAACGGATATCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACGTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAGG-GACCATCTCGAGGGCACGCCTGCCTCATGGGCGTTAGAAGCCCATTCACGCTCCGGTGTCTTTCCACATACCTCGAGGGAAGGGTATGGCCTGGTGCGGACATTGGCCCTCCGAGCCGTGA---GGCGCGGTGAGCTAAAGCATGTGGCCGTTCACATGGGGCCGGGTGCGGCGAGTGGTGG----GCT-GCTGCGCACGCCGTCC-CCGAACCCCGTGTCG-----GAAGAGGCGCTGGCTCGACC--CCTCGACGAGGATCACGTACTCTCAGTGTT--ATTCTGCGTGGCATCTTCGGACA???????????????????????????????????CCTGAGTACGAAACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCGTTCCGAGTAACTCCTCAACCCGGAGTCCCCCCTGAAGAAGCAGGAGCTGCAGTAGCGGCGGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTTTGGACTGATGGACTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGGCGATGCTATCATATCGAACCTGTTGTTGGAGAAGAAAATCAATATATTGCCTATGTAGCTTATCCTTTAGACCTTTTCGAAGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCTATTGTAGGTAATGTATTTGGTTTCAAAGCCTTACGAGCTCTACGCTTGGAAGACTTACGAATTCCTCCTGCTTATTCAAAAACTTTCCAAGGTCCACCTCATGGTATCCAATCTGAAAGAGATAAGTTGAACAAGTATGGTCGTCCTCTATTGGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGATTATCTGCAAAGAACTACGGTAGAGCATGTTATGAATGTCTACGTGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAAAACGTAAACTCACAACCATTTATGCGTTGGAGAGATCGTTTCTTGTTCTGTGCCGAAGCAATTTATAAATCACAGGCCGAAACAGGTGAAATCAAAGGGCACTACTTGAATGCTACTGCAGGTACATCTGAAGAAATGATCAAAAGAGCAGTATTTGCTAGAGAATTGGGAGTTCCTATCATTATGCATGACTACTTAACCGGGGGATTCACTGCAAATACTAGTTTGGCTTTTTATTGCCGTGATAATGGTCTACTTCTTCACATCCACCGTGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAAAACCATGGTATGCATTTCCGTGTATTAGCTAAAGCATTACGTATGTCTGGTGGAGATCATATTCACTCTGGTACAGTAGTAGGTAAACTGGAAGGGGAGCGTGAGATGACTTTAGGTTTTGTTGATTTATTACGTGATGATTATATTGAAAAAGATCGTAGTCGTGGTATCTTTTTCACTCAAGATTGGGTCTCTATGCCTGGTGTTATACCTGTGGCTTCAGGGGGTATCCATGTTTGGCATATGCCTGCTTTGACAGAAATCTTTGGAGATGATTCTGTACTTCAATTTGGTGGAGGAACCTTAGGACACCCTTGGGGAAATGCACCTGGTGCAGTAGCTAACAGGGTGGCTTTAGAAGCGTGCGTACA
	Pycreus_flavescens     TCGTTGCCTCGAAACCCGACC-GCGAACACGTAACGTAAAGCTGCCGGGGAGGGAACCCCTCCCCGGACCCACCGGCCCCGGCCG-----------------------CTCGGCCGGTCGTCGGAACACGGCGCGGAA-TGTCGCCAAGGAACACTGAACTGTCCACGGCA---CGTCGCACTCCG-CGGCGTC--------GTCGGGGCA------AAGAGAAACATTATGAATCTCGACAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACGTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAGG-GACCCTCCCGAGGGCACGCCTGCC---TGGGCGTTAGAAGCCCATCAACGCCCGGTCA--------------------------CCCGACCGCGTGCGGAGAGTGGCCCTCCGAGCCGCAGA--GGCACGGCGGGCTGAAGAGCGAGGCCG-TC-GACCGTGTTGGGATCGGCAAGTGGTGG----GCT-ACAGCGCATGCCGACC-CCGA--CCCGTGTTG-----GCGTCGGGCCATCACCGACT--CCACAACGATGATAACGTCGCCGCGGCGTCCGGCGCCGCGCGACGCATCCGGACCCAGGGGTTAAAGATTACAAACTTACTTATTATACTCCTGAGTACGAAACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCGTTCCGAGTAACTCCTCAACCTGGAGTCCCTCCTGAAGAAGCAGGAGCTGCAGTAGCGGCGGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTTTGGACTGATGGACTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGGCGATGCTATCATATCGAACCTGTTGCTGGAGAAGAAAATCAATATATTGCCTATATAGCTTATCCTTTAGACCTTTTCGAAAAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCTATTGTAGGTAATGTATTTGGTTTCAAAGCCTTACGAGCTCTACGCTTGGAAGACTTACGAATTCCTCCTGCTTATGCAAAAACTTTCCAAGGTCCACCTCACGGTATCCAAGCTGAAAGAGATAAGTTGAACAAGTATGGTCGTCCTCTATTGGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGATTATCCGCAAAGAATTACGGTAGAGCATGTTATGAATGTCTACGTGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAAAACGTAAACTCACAACCATTTATGCGTTGGAGAGATCGTTTCTTGTTCTGTGCCGAAGCAATTTATAAAGCACAAGCCGAAACAGGTGAAATCAAAGGGCACTACTTGAATGCTACTGCAGGTACATCTGAAGAAATGATCAAAAGAGCAGTATTTGCTAGAGAATTAGGAGTTCCTATCATCATGCATGACTACATAACTGGGGGATTCACTGCAAATACTAGTTTGTCTTTTTATTGCCGTGATAATGGTCTACTTCTGCACATCCACCGCGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAAAACCATGGTATTCATTTCCGTGTACTAGCTAAAGCATTACGTATGTCTGGTGGAGATCATATTCACTCTGGTACAGTAGTAGGTAAACTGGAAGGTGAGCGTGAGATGACTTTAGGTTTTGTTGATTTACTACGTGATGATTATATTGAAAAAGATCGTAGCCGTGGTATCTTTTTCACTCAAGATTGGGTCTCTATGCCTGGTGTTATACCTGTGGCTTCAGGGGGTATCCATGTTTGGCATATGCCTGCTTTGACCGAAATCTTTGGAGATGATTCTGTACTTCAATTTGGTGGCGGAACCTTAGGACACCCTTGGGGAAATGCACCTGGTGCAGTAGCTAACAGGGTGGCTTTAGAAGCGTGCGTACA
	Isolepis_cernua        TTGTTACCTTTGAACATGACC-GTGAACATGTAACGTAATGCTACCGGGGAGAG-CCATCTCCTCGGCCCTGCCGACCCCAGCCA-----------------------ATTGGTTGGGTGTCGGAATACGGCGCGGGA-TGTCGCCAAGGAACACTGATTTGCTGAGGCAA---GGTGACAATATG-TTGCACT--------GCTGACGCC-------AACTTAACATTATGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACGTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAGG-GATCCTCCCGAGGGCACGCCTGCC---TGGGCGTTAGAAGCCCATCAACACTCGGTCAACCTTTTTTTA-----------GAGGACGGACTTGATGTGGACAATGGACCTCCGAGCCAGTGATTGGCACGGTGGGCTGAAGTTAATGGTCG-TCGGATGGTGACTTGATCGACGAGTTGTGG----GCT-ACTGCGCATGTCGATC-AAGGCTACCATTTTG-----ATGTATGGCCTCTATACCCCAGTCGTAACGAGGGGATTGTTGTTGCAGCATC--TTGTTGTTTCACAATTTCGGACCCAGGGGTTAAAGATTACAAACTTACTTATTATACTCCTGAATACGAAACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCGTTCCGAGTAAGTCCTCAACCCGGAGTCCCTCCTGAAGAAGCAGGAGCTGCAGTAGCGGCGGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTTTGGACTGATGGACTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTATCATATCGAACCTGTTGTTGGAGAAGAAAATCAATTTATTGCCTATGTAGCTTATCCTTTAGACCTTTTCGAAGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCTATTGTAGGTAATGTATTTGGTTTCAAAGCCTTACGAGCTCTACGCTTGGAAGACTTACGAATTCCCCCTGCTTATTCAAAAACTTTCCAAGGCCCACCTCATGGTATCCAATCTGAAAGAGATAAGTTGAACAAGTATGGTCGTCCTCTATTGGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGATTATCCGCAAAGAATTACGGTAGAGCATGTTACGAATGTCTACGTGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAAAATGTAAACTCACAACCATTTATGCGTTGGAGAGATCGTTTCTTGTTCTGTGCCGAAGCAATTTATAAATCACAGGCTGAAACAGGTGAAATCAAAGGGCACTACTTGAATGCTACTGCAGCTACATCTGAAGAAATGATCAAAAGAGCAACATTTGCTAGAGAATTGGGAGTTCCTATCATAATGCATGACTACTTAACCGGGGGATTCACTACAAATACTAGTTTGGCTTTTTATTGCCGTGATAATGGTCTACTTCTGCACATTCACCGCGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAAAACCATGGTATGCATTTCCGTGTACTAGCTAAAGCATTACGTATGTCTGGTGGAGATCATATTCACTCTGGTACAGTAGTAGGTAAACTAGAAGGGGAACGTGAGATGACTTTAGGTTTTGTTGACTTACTACGTGATGATTATATTGAAAAAGATCGTAGTCGTGGTATCTTTTTCACTCAAGATTGGGTCTCTATGCCTGGTGTGATACCTGTGGCTTCAGGGGGTATCCATGTTTGGCATATGCCTGCTTTGACCGAAATCTTTGGAGATGATTCTGTACTTCAATTTGGTGGAGGAACCTTAGGACACCCTTGGGGAAATGCACCTGGTGCAGTAGCTAACAGGGTGGCTTTAGAAGCGTGCGTACA
	Isolepis_reticularis   TTGTTACCTTTGAACATGACC-GTGAACACGTAACATAATGCTGCCGGGGAGTT-CCATCTCCTCGGCCCTGCCGGCCCCAGCTT-----------------------ATTGGCTGGGTGTCGGAAAACGGCGCGGGA-TGTCGCCAAGGAACACTGATTTGCTGAGGC-A---GACGACAATACGCTCGTACT--------GCTGACGCC-------GACTTAACATTATGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACGTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAGG-GATCCTCCCGAGGGCACGCCTGCC---TGGGCGTTAGAAGCCCATCAACGCTC-TTCAACCCTTTTACA-----------GAGGATTGACTTGACGCGGACAATGGACCTCCGAGCCAGTAA-TGGCACGGTGGGCTGAAGTGAATGGTCG-TCGGATGGTAACAGGATCGGCGAGTGGTGG----GCT-ACTGCGCATGCCAATC-CCGGCTGCCATTTCG-----ACGTATGGCCTCTATACCCCAGTCGAAACGAGGGGATTGTCGTCACAGCATC--TTGTTGTGGGACGATTTCGGACC???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
	Eleocharis_parvula     TTGCCTTTCGAAAACACGACCGGTGCACGAGTAAAGAAATGCCGCCGGGGCGGG-CAACCTCCTCGGCTCCACCGGCCCCGAACA-GCTCCCGTCCTACGGGGCG-TGCTGGTCGTGGCGTCGGGACACGGCGCGGGT-TGACGCCAAGGAATACGTGTATGTCGAGGCAGG-CGGCGATGCTTCG-GCAACGCCCGATCT-GTCGAGGCCAAAG--AAATAAAACGAGATGACTCCCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACGTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAGG-GACCATCCCGAGGGCACGCCTGCC---TGGGCGTTAGAAGCCCATCCACGCTCGGC----------------------------ACGCGCCCGATGCGGAAAATGGCCCTCCGAGCCGCGA---GGCGCGACGGGCACAAGTGCACGGCCG-TCGGATGAGGTCGGGAGCGGCGAGTGGTGG----GCTAACTGCGCACGCCGCCT-CCGAGCCTCACGCCG-----ACTGGCGGCCCAGTCGGACC--TCGAAACGAGGAGCTCGTCGCCTAG----------CCGCGGCAGAGCCTCGGACCCAGGGGTTAAAGATTACAAACTTACTTATTATACTCCTGAGTACGAAACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCGTTCCGAGTAACTCCTCAACCCGGAGTCCCCCCTGAAGAAGCAGGAGCTGCAGTAGCGGCGGAATCTTCTACTGGTACATGGACCACTGTTTGGACTGATGGACTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGGCGATGCTATCATATCGAGCCTGTTGTTGGAGAAGAAGATCAATTTATTGCCTATGTAGCTTATCCTTTAGACCTTTTCGAAGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCTATTGTAGGTAATGTATTTGGTTTCAAAGCCTTACGAGCTCTACGCTTGGAAGACTTACGAATTCCCCCTGCTTATTCAAAAACTTTCCAAGGCCCACCTCACGGTATCCAATCTGAAAGAGATAAGTTGAACAAATATGGTCGTCCTCTATTGGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGATTATCCGCAAAGAACTACGGTAGAGCATGTTATGAATGTCTACGTGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAAAATGTAAACTCACAACCATTTATGCGTTGGAGAGATCGTTTCTTGTTCTGTGCCGAAGCAATTTATAAAGCACAGGCCGAAACAGGTGAAATCAAAGGGCACTACTTGAACGCTACTGCAGGTACATCTGAAGAAATGATCAAAAGAGCAGTATTTGCTAGAGAATTGGGAGTTCCTATCATAATGCATGATTACCTAACCGGGGGATTCACTGCAAATACTAGTTTGTCTTTTTATTGCCGTGATAATGGTCTACTTCTTCACATCCACCGCGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAAAACCATGGTATGCATTTCCGTGTATTAGCTAAAGCATTACGTATGTCTGGTGGAGATCATATTCACTCTGGTACAGTAGTAGGTAAACTGGAAGGGGAGCGTGAAATGACTTTAGGTTTTGTTGATTTATTACGTGATGATTATATTGAAAAAGATCGTAGTCGTGGTATCTTTTTCACTCAAGATTGGGTCTCTATGCCTGGTGTTATACCTGTGGCTTCAGGGGGTATCCATGTTTGGCATATGCCTGCTTTGACCGAAATCTTTGGAGATGATTCTGTACTTCAATTTGGTGGAGGAACCTTAGGACACCCTTGGGGAAATGCACCTGGTGCAGTAGCTAACAGGGTGGCTTTAGAAGCGTGCGTACA
	Eleocharis_geniculata  TTGCCTTTTAAAAACACGACCAGCGAACTTGTAATGAAATGCTGTTGGGGAGGT-CAGCCTCCTCGACTCCACCGACCCCGGACGTTCTCCCGCCTTTCGGGGCATTGCCGGTCGAGGTGTCGGAACACGGCGCGGGT-TGGCGCCAAGGAATACATGTTTGCTTAGGCAGGACTGCGATGCTTCG-TCGTCGCATGGTCT-GTCGAGGCCAAAGTAAGAAAAAATGAGATGACTCCCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACATGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCAAGG-GACCATCCCGAGGGCACGCCTGCCTCATGGGCGTTAGAAGCCCATCCACGCTCGGAGTCGGCGCCTTGC-----------AGGGCCCGGCCTGATGCGGACAGTGGCCCTCCGAGCCGCAA---GGCGCGACGGGCACAAGTGCACGGCCG-TCGGTTGAGGTCGGGATCAGCGAGTGGTGG----GCT-ACTGCGCACGCTGCAT-CAGCACCTCATGCCG-----ACACAGGGCCAAGTTGGACC--TCTAAACGAGGACTCCTGTCGTCGA------------GTGCGGCAGCCTCGGACCCAGGGGTTAAAGATTACAAACTTACTTATTACACTCCTGAGTACGAAACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCGTTCCGAGTAACTCCTCAACCCGGAGTCCCCCCTGAAGAAGCAGGAGCTGCAGTAGCGGCGGAATCTTCTACTGGTACATGGACCACTGTTTGGACTGATGGACTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGGCGATGCTATCATATCGAGCCTGTTGTTGGAGAAGAAAATCAATATATTGCCTATGTAGCTTATCCTTTAGACCTTTTCGAAGAAGGTTCTGTTACTAATATGTTTACTTCTATTGTAGGTAATGTATTTGGTTTCAAAGCCTTACGAGCTCTACGCTTGGAAGACTTACGAATTCCCCCTGCTTATTCAAAAACTTTCCAAGGCCCACCTCACGGTATCCAATCTGAAAGAGATAAGTTGAACAAATATGGTCGTCCTCTATTGGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGATTATCCGCAAAGAACTACGGTAGAGCATGTTATGAATGTCTACGTGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAAAATGTAAACTCACAACCATTTATGCGTTGGAGAGATCGTTTCTTGTTCTGTGCCGAAGCAATTTATAAATCACAGGCCGAAACAGGTGAAATCAAAGGGCACTACTTGAATGCTACTGCAGCTACATCTGAAGAAATGATCAAAAGAGCAGTATTTGCTAGAGAATTGGGAGTTCCTATCATAATGCATGATTACCTAACCGGGGGATTCACTGCAAATACTAGTTTGGCTTTTTATTGTCGTGATAATGGTCTACTTCTTCACATCCACCGCGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAAAACCATGGTATGCATTTCCGTGTATTAGCTAAAGCATTACGTATGTCTGGTGGAGATCATATTCACGCTGGTACAGTAGTAGGTAAACTGGAAGGGGAGCGTGAAATGACTTTAGGTTTTGTTGATTTATTACGTGATGATTATATTGAAAAAGATCGTAGTCGTGGTATCTTTTTCACTCAAGATTGGGTTTCTATGCCTGGTGTTATACCTGTGGCTTCAGGGGGTATCCATGTTTGGCATATGCCTGCTTTGACCGAAATCTTTGGAGATGATTCTGTACTTCAATTTGGTGGAGGAACCTTAGGACACCCTTGGGGAAATGCACCTGGTGCAGTAGCTAATAGAGTGGCTTTAGAAGCATGCGTACA
;
END;

BEGIN TREES;
	Title 'Dataset 3b Plants ITS+rbcL';
	LINK Taxa = Dataset_3b;
	TRANSLATE
[0] 		1 Juncus_bufonius,
[1] 		2 Juncus_ranarius,
[2] 		3 Juncus_articulatus,
[3] 		4 Juncus_oxycarpus,
[4] 		5 Juncus_tenuis,
[5] 		6 Fuirena_ciliaris,
[6] 		7 Pycreus_flavescens,
[7] 		8 Isolepis_cernua,
[8] 		9 Isolepis_reticularis,
[9] 		10 Eleocharis_parvula,
[10] 		11 Eleocharis_geniculata;
	TREE tree_1 = (((1:0.067615,2:0.018287):0.039101,((3:0.000001,4:0.05121):0.001802,5:0.000001):0.062499):0.098459,(6:0.082242,((7:0.028571,8:0.044675):0.038942,(9:0.069255,(10:0.020332,11:0.023872):0.059134):0.033582):0.0128):0.098459);
END;