#NEXUS
[written Thu Sep 28 08:55:12 CEST 2017 by Mesquite  version 3.31 (build 859) at jhackel-OptiPlex-9020/127.0.1.1]

BEGIN TAXA;
	TITLE Taxa;
	DIMENSIONS NTAX=47;
	TAXLABELS
		Monachather_paradoxus Eragrostis_walteri Coelachne_japonica Eleusine_indica Isachne_leersioides Amphipogon_caricinus Amphipogon_strictus Neyraudia_reynaudiana Coelachne_africana_RCH09 Hubbardia_heptaneuron Isachne_distichophylla Isachne_arundinacea Isachne_disperma Isachne_humicola_MSV563 Isachne_muscicola_MSV597 Isachne_humbertiana_MSV496 Isachne_mauritiana_MSV308 Eriachne_festucacea Eriachne_pallescens Eriachne_aristidea Eriachne_stipacea Eriachne_glauca Eriachne_triseta Eriachne_pulchella Pheidochloa_gracilis Eriachne_helmsii Eriachne_mucronata Eriachne_ciliata Danthonia_spicata Micraira_lazaridis Micraira_subulifolia Micraira_spiciforma Micraira_adamsii Elytrophorus_spicatus Elytrophorus_spicatus_JMK206 Merxmuellera_macowanii Styppeiochloa_hitchcockii_MSV993 Arundo_formosana Arundo_donax Hakonechloa_macra Molinia_caerulea_subsp._arundinacea Molinia_caerulea Molinia_caerulea_GB332012 Phragmites_australis Phragmites_mauritianus_MSV332 Styppeiochloa_gynoglossa_OMH16781 Styppeiochloa_sp._MSV1306 
	;

END;


BEGIN CHARACTERS;
	TITLE  Character_Matrix;
	DIMENSIONS  NCHAR=5936;
	FORMAT DATATYPE = DNA GAP = - MISSING = ?;
	MATRIX
	Monachather_paradoxus                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	Eragrostis_walteri                   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	Eleusine_indica                      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	Isachne_mauritiana_MSV308            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	Micraira_lazaridis                   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	Micraira_subulifolia                 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tcaaaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatggtcgtcctttattgggatgtactattaaaccaaaattgggattatccgcaaaaaattacggtagagcgtgttatgagtgtctacgcggtgggcttgattttaccaaagatgatgaaaacgtaaactcacaaccatttatgcgctggagagaccgttttgtcttttgtgctgaagcaatttataaagcacaggccgaaaccggtgaaatcaaggggcattacttgaatgcgactgcaggtacatgcgaagaaatgattaagagagctgtatttgcgagggaattaggggctcctattataatgcatgactacttaactggaggattcaccgcaaatactagtttggctcattattgccgcgacaacggcttacttcttcacattcaccgagcaatgcatgcagttattgatagacagaaaaatcatggtatgcatttccgtgtattagctaaagcattgcgtatgtctgggggagatcatatccacgccggtacagtagtaggtaagttagaaggggaacgcgaaatgactttaggttttgttgatttattgcgcgatgattttattgaaaaagaccgtgctcgcggtatctttttcactcaggactgggtatccatgccaggtgttataccggtggcttcagggggtattcatgtttggcatatgccagctctgaccgaaatctttggagacgattccgtattacaatttggtggaggaactttaggacacccttggggaaatgcacctggtgcagcagctaatcgagtggctttagaagcctgtgtacaagctcgtaacgaagggcgcgatcttgctcgtgaaggtaatgaaattatccgacaagcttgcaaatggagtcctgaactagcc
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tcaaaaactttccaaggtccgcctcatggtatccaagttgaaagggataagttgaacaagtatggtcgtcctttattgggatgtactattaaaccaaaattgggtttatccgcaaaaaattacggtagagcgtgttatgagtgtctacgcggtggacttgattttaccaaagatgatgaaaacgtaaactcacaaccatttatgcgctggagagaccgttttgtcttttgtgctgaagcaatttataaagcacaggccgaaaccggtgaaatcaaggggcattacttgaatgcgactgcaggtacatgcgaagaaatgattaagagagctgtatttgcgagggaattaggggttcctattgtaatgcatgactacttaactggaggattcaccgcaaatactagtttggctcattattgccgcgacaacggtctacttcttcacattcaccgagcaatgcatgcagttattgatagacagaaaaatcatggtatgcatttccgtgtattagctaaagcattgcgtatgtctgggggagatcatatccacgccggtacagtagtaggtaagttagaaggggaacgcgaaatgactttaggttttgttgatttattgcgcgatgattttattgaaaaagaccgtgctcgcggtatctttttcactcaggactgggtatccatgccaggtgttataccggtggcttcagggggtattcatgtttggcatatgccagctctgaccgaaatctttggagacgattccgtattacaatttggtggaggaactttaggacacccttggggaaatgcacctggtgcagcagctaatcgggtggctttagaagcctgtgtacaagctcgtaacgaagggcgcgatcttgctcgtgaaggtaatgaaattatccaacaagcttgcaaatggagtcctgaactagcc

;



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BEGIN ASSUMPTIONS;
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BEGIN CODONS;
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BEGIN MESQUITECHARMODELS;
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BEGIN TREES;
	Title 'Arundinoideae-Micrairoideae BEAST2 Maximum Clade Credibility Tree, younger calibration (38 Ma)';
	ID 015ec7436c607;
	LINK Taxa = Taxa;
	TRANSLATE
[0] 		1 Monachather_paradoxus,
[1] 		2 Eragrostis_walteri,
[2] 		3 Coelachne_japonica,
[3] 		4 Eleusine_indica,
[4] 		5 Isachne_leersioides,
[5] 		6 Amphipogon_caricinus,
[6] 		7 Amphipogon_strictus,
[7] 		8 Neyraudia_reynaudiana,
[8] 		9 Coelachne_africana_RCH09,
[9] 		10 Hubbardia_heptaneuron,
[10] 		11 Isachne_distichophylla,
[11] 		12 Isachne_arundinacea,
[12] 		13 Isachne_disperma,
[13] 		14 Isachne_humicola_MSV563,
[14] 		15 Isachne_muscicola_MSV597,
[15] 		16 Isachne_humbertiana_MSV496,
[16] 		17 Isachne_mauritiana_MSV308,
[17] 		18 Eriachne_festucacea,
[18] 		19 Eriachne_pallescens,
[19] 		20 Eriachne_aristidea,
[20] 		21 Eriachne_stipacea,
[21] 		22 Eriachne_glauca,
[22] 		23 Eriachne_triseta,
[23] 		24 Eriachne_pulchella,
[24] 		25 Pheidochloa_gracilis,
[25] 		26 Eriachne_helmsii,
[26] 		27 Eriachne_mucronata,
[27] 		28 Eriachne_ciliata,
[28] 		29 Danthonia_spicata,
[29] 		30 Micraira_lazaridis,
[30] 		31 Micraira_subulifolia,
[31] 		32 Micraira_spiciforma,
[32] 		33 Micraira_adamsii,
[33] 		34 Elytrophorus_spicatus,
[34] 		35 Elytrophorus_spicatus_JMK206,
[35] 		36 Merxmuellera_macowanii,
[36] 		37 Styppeiochloa_hitchcockii_MSV993,
[37] 		38 Arundo_formosana,
[38] 		39 Arundo_donax,
[39] 		40 Hakonechloa_macra,
[40] 		41 Molinia_caerulea_subsp._arundinacea,
[41] 		42 Molinia_caerulea,
[42] 		43 Molinia_caerulea_GB332012,
[43] 		44 Phragmites_australis,
[44] 		45 Phragmites_mauritianus_MSV332,
[45] 		46 Styppeiochloa_gynoglossa_OMH16781,
[46] 		47 Styppeiochloa_sp._MSV1306;
	TREE ArundinoideaeMicrairoideae_younger_38Ma = (((4:23.94516462,8:23.94516462):11.41105819[%posteriorProbability = 0.98622375 ],(29:21.71974981,36:21.71974981):13.636473[%posteriorProbability = 0.99850017 ]):8.893329114[%posteriorProbability = 0.51944228 ],((((38:1.779999495,39:1.779999495):23.23564935[%posteriorProbability = 1 ],(1:23.03240982,(6:6.264609754,7:6.264609754):16.76780006[%posteriorProbability = 1 ]):1.983239025[%posteriorProbability = 0.4772803 ]):8.336701751[%posteriorProbability = 1 ],(((2:14.70972532,(34:2.473241746,35:2.473241746):12.23648357[%posteriorProbability = 1 ]):10.59262043[%posteriorProbability = 1 ],(47:10.47518167,(37:7.207936883,46:7.207936883):3.267244786[%posteriorProbability = 0.99544495 ]):14.82716408[%posteriorProbability = 1 ]):3.246629655[%posteriorProbability = 0.9683924 ],(40:7.820919335,((44:1.064793319,45:1.064793319):5.097141594[%posteriorProbability = 1 ],(43:2.065518022,(41:0.8909632564,42:0.8909632564):1.174554765[%posteriorProbability = 0.84101766 ]):4.096416891[%posteriorProbability = 1 ]):1.658984423[%posteriorProbability = 0.76008221 ]):20.72805607[%posteriorProbability = 1 ]):4.803375185[%posteriorProbability = 0.99588935 ]):4.240956664[%posteriorProbability = 0.95694923 ],((30:11.95808822,(32:2.933586121,(31:1.789345209,33:1.789345209):1.144240912[%posteriorProbability = 0.82090879 ]):9.024502099[%posteriorProbability = 1 ]):18.81599075[%posteriorProbability = 1 ],(((3:5.723643839,9:5.723643839):13.09347051[%posteriorProbability = 1 ],((5:6.456037998,(12:4.043885279,13:4.043885279):2.412152719[%posteriorProbability = 0.9862793 ]):2.775900543[%posteriorProbability = 0.67159205 ],(10:7.452163279,(11:5.772055924,(14:1.904985011,(17:1.134063274,(15:0.4918536544,16:0.4918536544):0.6422096193[%posteriorProbability = 0.90389957 ]):0.770921737[%posteriorProbability = 0.84612821 ]):3.867070913[%posteriorProbability = 1 ]):1.680107355[%posteriorProbability = 0.83274081 ]):1.779775262[%posteriorProbability = 0.46117098 ]):9.585175812[%posteriorProbability = 1 ]):4.505103052[%posteriorProbability = 1 ],(19:16.03294471,((18:4.739277333,24:4.739277333):7.52669844[%posteriorProbability = 1 ],(25:9.990558028,((26:7.394852959,(27:3.341229178,28:3.341229178):4.053623781[%posteriorProbability = 1 ]):1.796109952[%posteriorProbability = 0.9732252 ],(23:7.043218687,(20:2.961809263,(21:1.160579744,22:1.160579744):1.801229519[%posteriorProbability = 1 ]):4.081409425[%posteriorProbability = 1 ]):2.147744223[%posteriorProbability = 0.99944451 ]):0.7995951176[%posteriorProbability = 0.56832574 ]):2.275417745[%posteriorProbability = 0.88595712 ]):3.766968936[%posteriorProbability = 0.89412288 ]):7.289272696[%posteriorProbability = 0.9998889 ]):7.45186156[%posteriorProbability = 1 ]):6.819228292[%posteriorProbability = 1 ]):6.656244665[%posteriorProbability = 1 ]):0.0[%posteriorProbability = 1 ] [% ] [%  setBetweenDouble = posteriorProbability ];

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BEGIN TREES;
	Title 'Arundinoideae-Micrairoideae BEAST2 Maximum Clade Credibility Tree, older calibration (47 Ma)';
	ID 015ec74391ea8;
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	TRANSLATE
[0] 		1 Monachather_paradoxus,
[1] 		2 Eragrostis_walteri,
[2] 		3 Coelachne_japonica,
[3] 		4 Eleusine_indica,
[4] 		5 Isachne_leersioides,
[5] 		6 Amphipogon_caricinus,
[6] 		7 Amphipogon_strictus,
[7] 		8 Neyraudia_reynaudiana,
[8] 		9 Coelachne_africana_RCH09,
[9] 		10 Hubbardia_heptaneuron,
[10] 		11 Isachne_distichophylla,
[11] 		12 Isachne_arundinacea,
[12] 		13 Isachne_disperma,
[13] 		14 Isachne_humicola_MSV563,
[14] 		15 Isachne_muscicola_MSV597,
[15] 		16 Isachne_humbertiana_MSV496,
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[17] 		18 Eriachne_festucacea,
[18] 		19 Eriachne_pallescens,
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[20] 		21 Eriachne_stipacea,
[21] 		22 Eriachne_glauca,
[22] 		23 Eriachne_triseta,
[23] 		24 Eriachne_pulchella,
[24] 		25 Pheidochloa_gracilis,
[25] 		26 Eriachne_helmsii,
[26] 		27 Eriachne_mucronata,
[27] 		28 Eriachne_ciliata,
[28] 		29 Danthonia_spicata,
[29] 		30 Micraira_lazaridis,
[30] 		31 Micraira_subulifolia,
[31] 		32 Micraira_spiciforma,
[32] 		33 Micraira_adamsii,
[33] 		34 Elytrophorus_spicatus,
[34] 		35 Elytrophorus_spicatus_JMK206,
[35] 		36 Merxmuellera_macowanii,
[36] 		37 Styppeiochloa_hitchcockii_MSV993,
[37] 		38 Arundo_formosana,
[38] 		39 Arundo_donax,
[39] 		40 Hakonechloa_macra,
[40] 		41 Molinia_caerulea_subsp._arundinacea,
[41] 		42 Molinia_caerulea,
[42] 		43 Molinia_caerulea_GB332012,
[43] 		44 Phragmites_australis,
[44] 		45 Phragmites_mauritianus_MSV332,
[45] 		46 Styppeiochloa_gynoglossa_OMH16781,
[46] 		47 Styppeiochloa_sp._MSV1306;
	TREE ArundinoideaeMicrairoideae_older_47Ma = (((4:25.51473709,8:25.51473709):18.12801628[%posteriorProbability = 1 ],(29:24.04658771,36:24.04658771):19.59616567[%posteriorProbability = 1 ]):6.644800175[%posteriorProbability = 1 ],((((38:2.230384827,39:2.230384827):27.71430993[%posteriorProbability = 1 ],(1:27.41533673,(6:7.330327094,7:7.330327094):20.08500957[%posteriorProbability = 1 ]):2.529359102[%posteriorProbability = 1 ]):10.60041475[%posteriorProbability = 1 ],(((2:17.2121582,(34:2.894149721,35:2.894149721):14.31800956[%posteriorProbability = 1 ]):12.54353237[%posteriorProbability = 1 ],(47:12.3972528,(37:8.435051084,46:8.435051084):3.962201715[%posteriorProbability = 1 ]):17.35843885[%posteriorProbability = 1 ]):4.032108784[%posteriorProbability = 1 ],(40:9.316613004,((44:1.243320495,45:1.243320495):6.021154579[%posteriorProbability = 1 ],(43:2.421456479,(41:1.067101121,42:1.067101121):1.354355395[%posteriorProbability = 1 ]):4.843018588[%posteriorProbability = 1 ]):2.05213796[%posteriorProbability = 1 ]):24.47118635[%posteriorProbability = 1 ]):6.757310152[%posteriorProbability = 1 ]):5.447061777[%posteriorProbability = 1 ],((30:14.50434589,(32:3.555436373,(31:2.209389806,33:2.209389806):1.346046567[%posteriorProbability = 1 ]):10.94890952[%posteriorProbability = 1 ]):22.50935507[%posteriorProbability = 1 ],(((3:6.358092546,9:6.358092546):16.23112452[%posteriorProbability = 1 ],((5:7.996238828,(12:4.780030727,13:4.780030727):3.2162081[%posteriorProbability = 1 ]):2.712279797[%posteriorProbability = 1 ],(10:9.343604088,(11:6.94736138,(14:2.293400317,(17:1.362520523,(15:0.5685346127,16:0.5685346127):0.7939869165[%posteriorProbability = 1 ]):0.9308798015[%posteriorProbability = 1 ]):4.653961033[%posteriorProbability = 1 ]):2.396242738[%posteriorProbability = 1 ]):1.364913523[%posteriorProbability = 1 ]):11.88069844[%posteriorProbability = 1 ]):5.251114398[%posteriorProbability = 1 ],(19:19.23509514,((18:5.56055975,24:5.56055975):9.00304842[%posteriorProbability = 1 ],(25:12.16666472,((26:8.592720985,(27:3.868072227,28:3.868072227):4.724648759[%posteriorProbability = 1 ]):2.213827491[%posteriorProbability = 1 ],(23:8.238084972,(20:3.493346423,(21:1.389244318,22:1.389244318):2.104103088[%posteriorProbability = 1 ]):4.744737566[%posteriorProbability = 1 ]):2.568463504[%posteriorProbability = 1 ]):1.360116243[%posteriorProbability = 1 ]):2.396944523[%posteriorProbability = 1 ]):4.671485901[%posteriorProbability = 1 ]):8.605236322[%posteriorProbability = 1 ]):9.17337057[%posteriorProbability = 1 ]):8.978470325[%posteriorProbability = 1 ]):4.295382261[%posteriorProbability = 1 ]):0.0[%posteriorProbability = 1 ] [% ] [%  setBetweenDouble = posteriorProbability ];

END;


Begin MESQUITE;
		MESQUITESCRIPTVERSION 2;
		TITLE AUTO;
		tell ProjectCoordinator;
		timeSaved 1506581713088;
		getEmployee #mesquite.minimal.ManageTaxa.ManageTaxa;
		tell It;
			setID 0 534374079316749587;
		endTell;
		getEmployee #mesquite.charMatrices.ManageCharacters.ManageCharacters;
		tell It;
			setID 0 7236770482926408887;
			mqVersion 331;
			checksumv 0 3 734973359 null  getNumChars 5936 numChars 5936 getNumTaxa 47 numTaxa 47   short true   bits 3458764513820540943   states 15   sumSquaresStatesOnly 5975111.0 sumSquares -6.364126705429795E22 longCompressibleToShort false usingShortMatrix true   NumFiles 1 NumMatrices 1;
			mqVersion;
		endTell;
		getWindow;
		tell It;
			suppress;
			setResourcesState false false 100;
			setPopoutState 300;
			setExplanationSize 0;
			setAnnotationSize 0;
			setFontIncAnnot 0;
			setFontIncExp 0;
			setSize 1861 995;
			setLocation 59 -4;
			setFont SanSerif;
			setFontSize 10;
			getToolPalette;
			tell It;
			endTell;
			desuppress;
		endTell;
		getEmployee  #mesquite.trees.BasicTreeWindowCoord.BasicTreeWindowCoord;
		tell It;
			makeTreeWindow #534374079316749587  #mesquite.trees.BasicTreeWindowMaker.BasicTreeWindowMaker;
			tell It;
				suppressEPCResponse;
				setTreeSource  #mesquite.trees.StoredTrees.StoredTrees;
				tell It;
					setTreeBlock 1;
					setTreeBlockID 015ec7436c607;
					toggleUseWeights off;
				endTell;
				setAssignedID 1767.1506581662582.987792662849310329;
				getTreeWindow;
				tell It;
					setExplanationSize 30;
					setAnnotationSize 20;
					setFontIncAnnot 0;
					setFontIncExp 0;
					setSize 1761 923;
					setLocation 59 -4;
					setFont SanSerif;
					setFontSize 10;
					getToolPalette;
					tell It;
					endTell;
					getTreeDrawCoordinator #mesquite.trees.BasicTreeDrawCoordinator.BasicTreeDrawCoordinator;
				tell It;
					suppress;
					setTreeDrawer  #mesquite.trees.SquareLineTree.SquareLineTree;
					tell It;
						setNodeLocs #mesquite.trees.NodeLocsStandard.NodeLocsStandard;
						tell It;
							branchLengthsToggle on;
							toggleScale on;
							toggleBroadScale off;
							toggleCenter on;
							toggleEven on;
							setFixedTaxonDistance 0;
						endTell;
						setEdgeWidth 4;
						showEdgeLines on;
						orientUp;
					endTell;
					setBackground White;
					setBranchColor Black;
					showNodeNumbers off;
					showBranchColors on;
					labelBranchLengths off;
					centerBrLenLabels on;
					showBrLensUnspecified on;
					showBrLenLabelsOnTerminals on;
					setBrLenLabelColor 0 0 255;
					setNumBrLenDecimals 6;
					desuppress;
					getEmployee #mesquite.trees.BasicDrawTaxonNames.BasicDrawTaxonNames;
					tell It;
						setColor Black;
						toggleColorPartition off;
						toggleColorAssigned on;
						toggleShadePartition off;
						toggleShowFootnotes on;
						toggleNodeLabels on;
						toggleCenterNodeNames off;
						toggleShowNames on;
						namesAngle ?;
					endTell;
				endTell;
					setTreeNumber 1;
					setDrawingSizeMode 0;
					toggleLegendFloat on;
					scale 0;
					toggleTextOnTree off;
					togglePrintName on;
					showWindow;
				endTell;
				desuppressEPCResponse;
				getEmployee #mesquite.trees.ColorBranches.ColorBranches;
				tell It;
					setColor Red;
					removeColor off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.ornamental.BranchNotes.BranchNotes;
				tell It;
					setAlwaysOn off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.ornamental.ColorTreeByPartition.ColorTreeByPartition;
				tell It;
					colorByPartition off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.ornamental.DrawTreeAssocDoubles.DrawTreeAssocDoubles;
				tell It;
					setOn on;
					toggleShow consensusFrequency;
					toggleShow bootstrapFrequency;
					toggleShow posteriorProbability;
					toggleShow consensusFrequency;
					toggleShow posteriorProbability;
					toggleShow bootstrapFrequency;
					setDigits 4;
					setThreshold ?;
					writeAsPercentage off;
					toggleCentred off;
					toggleHorizontal on;
					toggleWhiteEdges on;
					toggleShowOnTerminals on;
					setFontSize 10;
					setOffset 0  0;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.ornamental.DrawTreeAssocStrings.DrawTreeAssocStrings;
				tell It;
					setOn on;
					toggleCentred on;
					toggleHorizontal on;
					setFontSize 10;
					setOffset 0  0;
					toggleShowOnTerminals on;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.trees.TreeInfoValues.TreeInfoValues;
				tell It;
					panelOpen false;
				endTell;
			endTell;
			makeTreeWindow #534374079316749587  #mesquite.trees.BasicTreeWindowMaker.BasicTreeWindowMaker;
			tell It;
				suppressEPCResponse;
				setTreeSource  #mesquite.trees.StoredTrees.StoredTrees;
				tell It;
					setTreeBlock 2;
					setTreeBlockID 015ec74391ea8;
					toggleUseWeights off;
				endTell;
				setAssignedID 1798.1506581677487.3862427081875792534;
				getTreeWindow;
				tell It;
					setExplanationSize 30;
					setAnnotationSize 20;
					setFontIncAnnot 0;
					setFontIncExp 0;
					setSize 1761 923;
					setLocation 59 -4;
					setFont SanSerif;
					setFontSize 10;
					getToolPalette;
					tell It;
					endTell;
					setActive;
					getTreeDrawCoordinator #mesquite.trees.BasicTreeDrawCoordinator.BasicTreeDrawCoordinator;
				tell It;
					suppress;
					setTreeDrawer  #mesquite.trees.SquareLineTree.SquareLineTree;
					tell It;
						setNodeLocs #mesquite.trees.NodeLocsStandard.NodeLocsStandard;
						tell It;
							branchLengthsToggle on;
							toggleScale on;
							toggleBroadScale off;
							toggleCenter on;
							toggleEven on;
							setFixedTaxonDistance 0;
						endTell;
						setEdgeWidth 4;
						showEdgeLines on;
						orientUp;
					endTell;
					setBackground White;
					setBranchColor Black;
					showNodeNumbers off;
					showBranchColors on;
					labelBranchLengths off;
					centerBrLenLabels on;
					showBrLensUnspecified on;
					showBrLenLabelsOnTerminals on;
					setBrLenLabelColor 0 0 255;
					setNumBrLenDecimals 6;
					desuppress;
					getEmployee #mesquite.trees.BasicDrawTaxonNames.BasicDrawTaxonNames;
					tell It;
						setColor Black;
						toggleColorPartition off;
						toggleColorAssigned on;
						toggleShadePartition off;
						toggleShowFootnotes on;
						toggleNodeLabels on;
						toggleCenterNodeNames off;
						toggleShowNames on;
						namesAngle ?;
					endTell;
				endTell;
					setTreeNumber 1;
					setDrawingSizeMode 0;
					toggleLegendFloat on;
					scale 0;
					toggleTextOnTree off;
					togglePrintName on;
					showWindow;
				endTell;
				desuppressEPCResponse;
				getEmployee #mesquite.trees.ColorBranches.ColorBranches;
				tell It;
					setColor Red;
					removeColor off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.ornamental.BranchNotes.BranchNotes;
				tell It;
					setAlwaysOn off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.ornamental.ColorTreeByPartition.ColorTreeByPartition;
				tell It;
					colorByPartition off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.ornamental.DrawTreeAssocDoubles.DrawTreeAssocDoubles;
				tell It;
					setOn on;
					toggleShow consensusFrequency;
					toggleShow bootstrapFrequency;
					toggleShow posteriorProbability;
					toggleShow consensusFrequency;
					toggleShow posteriorProbability;
					toggleShow bootstrapFrequency;
					setDigits 4;
					setThreshold ?;
					writeAsPercentage off;
					toggleCentred off;
					toggleHorizontal on;
					toggleWhiteEdges on;
					toggleShowOnTerminals on;
					setFontSize 10;
					setOffset 0  0;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.ornamental.DrawTreeAssocStrings.DrawTreeAssocStrings;
				tell It;
					setOn on;
					toggleCentred on;
					toggleHorizontal on;
					setFontSize 10;
					setOffset 0  0;
					toggleShowOnTerminals on;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.trees.TreeInfoValues.TreeInfoValues;
				tell It;
					panelOpen false;
				endTell;
			endTell;
		endTell;
		getEmployee  #mesquite.charMatrices.BasicDataWindowCoord.BasicDataWindowCoord;
		tell It;
			showDataWindow #7236770482926408887 #mesquite.charMatrices.BasicDataWindowMaker.BasicDataWindowMaker;
			tell It;
				getWindow;
				tell It;
					setExplanationSize 30;
					setAnnotationSize 20;
					setFontIncAnnot 0;
					setFontIncExp 0;
					setSize 1761 923;
					setLocation 59 -4;
					setFont SanSerif;
					setFontSize 10;
					getToolPalette;
					tell It;
					endTell;
					setTool mesquite.charMatrices.BasicDataWindowMaker.BasicDataWindow.arrow;
					colorCells  #mesquite.charMatrices.ColorByState.ColorByState;
				tell It;
					setStateLimit 9;
					toggleUniformMaximum on;
				endTell;
					colorRowNames  #mesquite.charMatrices.TaxonGroupColor.TaxonGroupColor;
					colorColumnNames  #mesquite.charMatrices.CharGroupColor.CharGroupColor;
					colorText  #mesquite.charMatrices.NoColor.NoColor;
					setBackground White;
					toggleShowNames on;
					toggleShowTaxonNames on;
					toggleTight off;
					toggleThinRows off;
					toggleShowChanges off;
					toggleSeparateLines off;
					toggleShowStates on;
					toggleAutoWCharNames off;
					toggleAutoTaxonNames off;
					toggleShowDefaultCharNames off;
					toggleConstrainCW on;
					toggleBirdsEye off;
					toggleShowPaleGrid off;
					toggleShowPaleCellColors off;
					toggleShowPaleExcluded off;
					togglePaleInapplicable on;
					toggleShowBoldCellText off;
					toggleAllowAutosize off;
					toggleColorsPanel off;
					toggleLinkedScrolling on;
					toggleScrollLinkedTables off;
				endTell;
				showWindow;
				getWindow;
				tell It;
					forceAutosize;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.charMatrices.AlterData.AlterData;
				tell It;
					toggleBySubmenus off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.charMatrices.ColorCells.ColorCells;
				tell It;
					setColor Red;
					removeColor off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.categ.StateNamesStrip.StateNamesStrip;
				tell It;
					showStrip off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.charMatrices.AnnotPanel.AnnotPanel;
				tell It;
					togglePanel off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.charMatrices.CharReferenceStrip.CharReferenceStrip;
				tell It;
					showStrip off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.charMatrices.QuickKeySelector.QuickKeySelector;
				tell It;
					autotabOff;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.charMatrices.SelSummaryStrip.SelSummaryStrip;
				tell It;
					showStrip off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.align.AlignToDropped.AlignToDropped;
				tell It;
					gapCosts 16 6 1 1;
					subCosts  10 5 10 10 10 5 5 10 10 10 5 10;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.molec.ColorByAA.ColorByAA;
				tell It;
					emphasizeDegeneracy off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.molec.SequenceInfoEditor.SequenceInfoEditor;
				tell It;
					panelOpen false;
				endTell;
			endTell;
		endTell;
		endTell;
end;