NEXUS
[File created by TreeBASE:  1/16/09  15:39:39]
[Matrix accession#: M4218]

BEGIN TAXA;
	TITLE M4218;
	DIMENSIONS  NTAX=83;
	TAXLABELS
		Aplectrum_hyemale	Corallorhiza_bentleyi_2550.WV	Corallorhiza_bentleyi_B19.VA	Corallorhiza_bentleyi_B4.VA	Corallorhiza_striata_13b.CA	Corallorhiza_striata_13c.CA	Corallorhiza_striata_5a.CA	Corallorhiza_striata_8.CA	Corallorhiza_striata_9a.CA	Corallorhiza_striata_involuta_2155.OAX	Corallorhiza_striata_involuta_228a.MOR	Corallorhiza_striata_involuta_228b.MOR	Corallorhiza_striata_involuta_237a.MEX	Corallorhiza_striata_involuta_237c.MEX	Corallorhiza_striata_striata_120a.UT	Corallorhiza_striata_striata_120c.UT	Corallorhiza_striata_striata_120e.UT	Corallorhiza_striata_striata_125a.WY	Corallorhiza_striata_striata_125b.WY	Corallorhiza_striata_striata_135a.WY	Corallorhiza_striata_striata_135b.WY	Corallorhiza_striata_striata_177a.ID	Corallorhiza_striata_striata_177c.ID	Corallorhiza_striata_striata_187a.MT	Corallorhiza_striata_striata_187b.MT	Corallorhiza_striata_striata_1a.MI	Corallorhiza_striata_striata_1b.MI	Corallorhiza_striata_striata_206b.AB	Corallorhiza_striata_striata_206c.AB	Corallorhiza_striata_striata_219a.BC	Corallorhiza_striata_striata_219b.BC	Corallorhiza_striata_striata_223c.BC	Corallorhiza_striata_striata_223d.BC	Corallorhiza_striata_striata_2769a.MI	Corallorhiza_striata_striata_2769b.MI	Corallorhiza_striata_striata_2770a.MI	Corallorhiza_striata_striata_2770b.MI	Corallorhiza_striata_striata_29a.OR	Corallorhiza_striata_striata_29b.OR	Corallorhiza_striata_striata_2a.MI	Corallorhiza_striata_striata_2b.MI	Corallorhiza_striata_striata_39a.WA	Corallorhiza_striata_striata_39b.WA	Corallorhiza_striata_striata_3a.MI	Corallorhiza_striata_striata_3b.MI	Corallorhiza_striata_striata_48a.WA	Corallorhiza_striata_striata_48b.WA	Corallorhiza_striata_striata_DJ68.OR	Corallorhiza_striata_striata_HeshA.MB	Corallorhiza_striata_striata_HeshB.MB	Corallorhiza_striata_striata_JH1a.MN	Corallorhiza_striata_striata_JH1c.MN	Corallorhiza_striata_striata_JH2b.WI	Corallorhiza_striata_striata_JH2c.WI	Corallorhiza_striata_vreelandii_100a.NM	Corallorhiza_striata_vreelandii_100b.NM	Corallorhiza_striata_vreelandii_103a.NM	Corallorhiza_striata_vreelandii_103b.NM	Corallorhiza_striata_vreelandii_103f.NM	Corallorhiza_striata_vreelandii_103h.NM	Corallorhiza_striata_vreelandii_106a.NM	Corallorhiza_striata_vreelandii_106b.NM	Corallorhiza_striata_vreelandii_110a.AZ	Corallorhiza_striata_vreelandii_110b.AZ	Corallorhiza_striata_vreelandii_112a.AZ	Corallorhiza_striata_vreelandii_112b.AZ	Corallorhiza_striata_vreelandii_113a.AZ	Corallorhiza_striata_vreelandii_113b.AZ	Corallorhiza_striata_vreelandii_114a.UT	Corallorhiza_striata_vreelandii_114b.UT	Corallorhiza_striata_vreelandii_116a.UT	Corallorhiza_striata_vreelandii_116b.UT	Corallorhiza_striata_vreelandii_163b.CO	Corallorhiza_striata_vreelandii_163c.CO	Corallorhiza_striata_vreelandii_2190.HID	Corallorhiza_striata_vreelandii_2193.HID	Corallorhiza_striata_vreelandii_2773a.UT	Corallorhiza_striata_vreelandii_2773b.UT	Corallorhiza_striata_vreelandii_LR5.NL	Corallorhiza_striata_vreelandii_RB3.NL	Corallorhiza_striata_vreelandii_RB4.NL	Cremastra_appendiculata	Oreorchis_patens
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M4218;
	DIMENSIONS NCHAR=2407;
	FORMAT SYMBOLS = " A C G T 0 1 2 3 4 5 " MISSING = ? GAP = -  ;
	MATRIX
		Aplectrum_hyemale                              --------------------------------------------ATGTCACCACAAACAGAAACTAAAGCAAGCGTTGGATTTAAAGCTGGTGTTAAAGATTACAAATTGACTTATTATACTCCTGACTACGAAACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCGGGAGTTCCGCCTGAAGAAGCGGGGGCTGCGGTAGCTGCCGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACTGATGGACTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTACCACATCGAGGTCGTTGTTGGGGAGGAAAATCAATATAT--TGCTTATGTAGCTTATCCTTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCCATTGTGGGTAATGTTTTTGGTTTCAAAGCCCTGCGAGCTCTACGTCTGGAAGATCTGCGAATTCCCACTTCTTATTCCAAAACTTTCCAAGGTCCGCCTCATGGCATCCAAGTTGAAAGAGATAAATTGAACAAGTATGGTCGTCCCCTATTGGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGATTATCCGCAAAAAACTACGGTAGAGCGGTTTATGAATGTCTACGGGGTGGACTTGATTTTACTAAGGATGATGAAAACGTAAATTCACAACCATTTATGCGTTGGAGAGATCGTTTCTTATTTTGTGCCGAAGCAATTTATAAAGCGCAAGCCGAAACGGGTGAAATTAAAGGACATTACTTGAATGCAACTGCGGGTACATGTGAAGAAATGATGAAAAGAGCGATATTTGCTAGAGAATTGGGAGTTCCTATCGTAATGCATGACTACTTAACTGGGGGGTTCACCGCAAATACTACCTTGTCTCATTATTGCCGCGACAATGGTCTACTTCTTCACATACATCGCGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAAAATCATGGTATGCATTTTCGTGTACTAGCTAAAGCATTACGTATGTCTGGTGGAGATCATATTCACGCTGGTACAGTAGTGGGTAAACTGGAGGGGGAGCGTGAGATGACTTTGGGTTTTGTTGATTTGTTACGTGATGATTTTATTGAAAAAGATCGAA------------------GTCGTGGTATTTTTTT-CACTCAAGACTGGGTCTCTATGCCAGGTGTTCTGCCCGTGGCTTCAGGGGGTATTCATGTTTGGCATATGCCTGCCCTAACCGAAATCTTTGGGGATGATTCCGTACTACAGTTCGGTGGAGGAACTTTAGGACACCCTTGGGGAAATGCACCCGGCGCAGTAGCTAATCGGGTGGCTTTAGAAGCATGTGTACAAGCTCGTAATGAGGGACGTGATCTTGCTCGTGAAGGTAATGATATTATTCGTGAAGCTACCAAATGGAGCCCTGAGCTAGCCGCTGCTTGTGAAGTATGGAAAGAGATCACATTCGATTTCGACCCAGTGGATAAGCTAGATAAAGAGACAAAATAAGCGCGTATAATTCAGCAATTCCTGTTTGTTCTCCTAATTGATTGCAATGAAACTCTTGGAAAAAAAAAGGATC-TTAGAGGCCATAAA-GCTTTT-C-TTAGCTAAATCTATTTCC-CCGGACAGTCAAAAAGTTTTTTTGTGCGACAAAAAAAA-GTCTTGGGAAAATCTTAATTGACATGTTTTAAATAACTTCCAAATCTCCATTTTGAAATTGGAAGACAAATGATTCAATTTTACTAATGTATTGTATTTGTATTTCACTTCTCCTTATTAGTTAGAGTTAGATAATATGAAA---------------------GATAAGAATCTTTCTGTCTACTTGATTCAAAGTATTTAGTATTGTGTATTTTATTTTTTTTATCATCTTTTTTTTT--C--GATTTTTTCTATTATCAATTT-----TATTAATTTATTATTCTCTATTCTGAATT-CTTATTCGATTTATTGATATTGAATTCGTGAGAGGATTTTTTATTTCCTATGAATTGTGCTTTTCTCTTTTGAAAAGCACAATTACGATAGACAAGAAAGAATCTGAATATTTCATTATATTTTAGACTAA--------------GGTGTTGGGTCTCAAAATCGTT----------AGAAAGAAAATTATGAATTTTATATCTCAACTGAGAACAAAACTTTTGAGTTCTTACTGTTCTGGATAAACAAGAGCTGGGTTTCTAGTACGGAAAAGTTGATTATTAAAACTGAACTTACGAAGATGAAGATACTAAT---TAAGTCTTATTGATATTGAACATTTCCATATGAAGAATGGAAATGCATCTTTCTTCATTATTTCCTAAACTCTACTGAATATCATCAAATA------------------000000000000000
		Corallorhiza_bentleyi_2550.WV                  TTTGTTGTGAGAATTCTTA-TTCATGAGTTGTAGGGAGGGACTTATGTCACCACAAACATAAACTAAAGTAAGCGTTGGATTTAAAGCTGGTGTTAAAGATTACAAATTGACTTATTATACTCCTGACTACGAAACAAAAGATACTGATATCTTGACAGCATTCCGAGTAATTCCTCAATCGGGAGTTCCGCCTGAATAAGCGGGGACTACGGTAGCTGCCGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACTGATGGACTTACCAGTCTTGATCGTTATAAAGGATGATGCTACCATATCGAGGTCGTTGTTGGGGAGGAAAATCAATATAT--TGCTTATGTAGCTTATCCTTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCCATTGTGGGTAATGTATTTGGTTTCAAAGCCCTGCGAGCTCTACGTCTGGAAGATCTGCGAATTCCCACTTCTTATTCCAAAACTTTCCAAGGTCCGCCTCATGGCATCCAAGTTGAAAGAGATAAATTGAACAAGTATGGCCGTCCCCTATTGGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGA---------AAAAACTATGGTAGGGCAGTTTATGAATGTCTACGGGGTGGACTTGATTTTACTAAGGATGATGAAAACGTAAATTCACAACCATTTATGCGTTGGAGAGATCGTTTCTTATTTTGTGCCGAAGCAATTTATAAAGCGCAAGCCAAAACGGGTGAAATTAAAGGACATTACTTGAATGCAATTGCGGGTACATGTGAAGAAATGATGAAAAGAGCAGTATTTGCCAGAGAATTGGGAGTTCCTATCGTAATGCATGACTACTTAATTGGGGGGTTCACCGCAAATACTAGCTTGTCTCATTATTGCCGCGACAACGGTCTACTTCTTCACATCCATCGCGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAAAATCATGGTATGCATTTTAATGTACTAGCTAAAGCATTACGTATGTCTGGTGGAGATCATATTCACGCTGGTACAGTAGTGGGTAAACTGGAGAGGGAGCGTGAGATGACTTTGGGTTTTGTTTATTTGTTACGTGATGATTTTATTGAAAAAGATCAAA------------------ATCGTGATATTTTTTT-CACTCAAGACTGGGTCTTTATGCCAGGTGTTCCGCCCGTGGCTTCAGGGGGTATTCATGTTTGGCATATGCCTGCCCTAACCGAAATCTTTGGGGATGATTCCGTACTACAGTTCGGTGGAGAAACTTTAGGGCACCCTTGGGGAAATGCACCCGGCACATTAGCTAATCGGGTGGCTTTAGAAGCATGTGTACAAGCTCGTAATGAGGGACGTGATCTTGCTCGTGAAGTTAATGATATTATTCGTGAAGTTACCAAATGGAGCCCTTAGCTAGCTGCTGCTTGTGAAGTATGGAAAGAGATCACATTTGATTTCGATCCAGTGGATAAGCTAGATAAAGAGACAAAATAAGCGCGTATAATTCAGCAATTCCTGTTTGTTCTCCTAATTGATTGCAATGAAACTCTTGGAAAAAAAAAGGATCTTTAGAGGCAGTAAAAGCTTTTTCTTTAGCTAAATCTATTTCCACCGGACAGTCAAAAAGTTTTTTTGTGCGACAAAAAAAA-GTATTGGAAAAATCTTAATTGACATGTTTTAAATAACTTCCCAATTTCCATTTTGAAATTTGAAGACAAATGATTCAATTTTACTAATGTATTGTATTTGTATTTTACTTCTCCTTATTAATTAGAGCTAGGTAATATGAAA---------------------AATA------TTT---------------------------ATTGTGTATTTTATTTTTTTT---TTATTTTTGCTATTA--ATAATTTATTATT-----TTCATTATTTTCTATT----------------------CTTATTCTATTTATTTATATTGAATTCGTGAGATGATTTTTTATTTACTATGAATTGTGCTTTTCAAAATAGAAAAGCACAATTACGATAGACAAGGAAGAATCTGAATATTTCATTATATTTTAGACTAA--------------GGTGTTGGATCTCAAAATAGTTCAAAATAGTTAGAAAGAAAATTCTGAATTTTATATCTCAACTGAGAACAAAACTCTTGAGTTCTTACTTTTCTGGATAAATAAGAGCTGGGTTTCTAGTATGAAAAAGTTGATTATTAAAACTGAACTTACGAAGATGAAGATACTAATAATTAAGTCTTATTGATATTGAACATTTATATATGAAGAATGGAAATGCATCTTTATTCATTATTTTCTAAACTATATTGAATATCATTCAATATCAACAATTTAATATGAA010000001111111
		Corallorhiza_bentleyi_B19.VA                   TTTGTTGTGAGAATTCTTA-TTCATGAGTTGTAGGGAGGGACTTATGTCACCACAAACATAAACTAAAGTAAGCGTTGGATTTAAAGCTGGTGTTAAAGATTACAAATTGACTTATTATACTCCTGACTACGAAACAAAAGATACTGATATCTTGACAGCATTCCGAGTAATTCCTCAATCGGGAGTTCCGCCTGAATAAGCGGGGACTACGGTAGCTGCCGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACTGATGGACTTACCAGTCTTGATCGTTATAAAGGATGATGCTACCATATCGAGGTCGTTGTTGGGGAGGAAAATCAATATAT--TGCTTATGTAGCTTATCCTTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCCATTGTGGGTAATGTATTTGGTTTCAAAGCCCTGCGAGCTCTACGTCTGGAAGATCTGCGAATTCCCACTTCTTATTCCAAAACTTTCCAAGGTCCGCCTCATGGCATCCAAGTTGAAAGAGATAAATTGAACAAGTATGGCCGTCCCCTATTGGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGA---------AAAAACTATGGTAGGGCAGTTTATGAATGTCTACGGGGTGGACTTGATTTTACTAAGGATGATGAAAACGTAAATTCACAACCATTTATGCGTTGGAGAGATCGTTTCTTATTTTGTGCCGAAGCAATTTATAAAGCGCAAGCCAAAACGGGTGAAATTAAAGGACATTACTTGAATGCAATTGCGGGTACATGTGAAGAAATGATGAAAAGAGCAGTATTTGCCAGAGAATTGGGAGTTCCTATCGTAATGCATGACTACTTAATTGGGGGGTTCACCGCAAATACTAGCTTGTCTCATTATTGCCGCGACAACGGTCTACTTCTTCACATCCATCGCGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAAAATCATGGTATGCATTTTAATGTACTAGCTAAAGCATTACGTATGTCTGGTGGAGATCATATTCACGCTGGTACAGTAGTGGGTAAACTGGAGAGGGAGCGTGAGATGACTTTGGGTTTTGTTTATTTGTTACGTGATGATTTTATTGAAAAAGATCAAA------------------ATCGTGATATTTTTTT-CACTCAAGACTGGGTCTTTATGCCAGGTGTTCCGCCCGTGGCTTCAGGGGGTATTCATGTTTGGCATATGCCTGCCCTAACCGAAATCTTTGGGGATGATTCCGTACTACAGTTCGGTGGAGAAACTTTAGGGCACCCTTGGGGAAATGCACCCGGCACATTAGCTAATCGGGTGGCTTTAGAAGCATGTGTACAAGCTCGTAATGAGGGACGTGATCTTGCTCGTGAAGTTAATGATATTATTCGTGAAGTTACCAAATGGAGCCCTTAGCTAGCTGCTGCTTGTGAAGTATGGAAAGAGATCACATTTGATTTCGATCCAGTGGATAAGCTAGATAAAGAGACAAAATAAGCGCGTATAATTCAGCAATTCCTGTTTGTTCTCCTAATTGATTGCAATGAAACTCTTGGAAAAAAAAAGGATCTTTAGAGGCAGTAAAAGCTTTTTCTTTAGCTAAATCTATTTCCACCGGACAGTCAAAAAGTTTTTTTGTGCGACAAAAAAAA-GTATTGGAAAAATCTTAATTGACATGTTTTAAATAACTTCCCAATTTCCATTTTGAAATTTGAAGACAAATGATTCAATTTTACTAATGTATTGTATTTGTATTTTACTTCTCCTTATTAATTAGAGCTAGGTAATATGAAA---------------------AATA------TTT---------------------------ATTGTGTATTTTATTTTTTTT---TTATTTTTGCTATTA--ATAATTTATTATT-----TTCATTATTTTCTATT----------------------CTTATTCTATTTATTTATATTGAATTCGTGAGATGATTTTTTATTTACTATGAATTGTGCTTTTCAAAATAGAAAAGCACAATTACGATAGACAAGGAAGAATCTGAATATTTCATTATATTTTAGACTAA--------------GGTGTTGGATCTCAAAATAGTTCAAAATAGTTAGAAAGAAAATTCTGAATTTTATATCTCAACTGAGAACAAAACTCTTGAGTTCTTACTTTTCTGGATAAATAAGAGCTGGGTTTCTAGTATGAAAAAGTTGATTATTAAAACTGAACTTACGAAGATGAAGATACTAATAATTAAGTCTTATTGATATTGAACATTTATATATGAAGAATGGAAATGCATCTTTATTCATTATTTTCTAAACTATATTGAATATCATTCAATATCAACAATTTAATATGAA010000001111111
		Corallorhiza_bentleyi_B4.VA                    TTTGTTGTGAGAATTCTTA-TTCATGAGTTGTAGGGAGGGACTTATGTCACCACAAACATAAACTAAAGTAAGCGTTGGATTTAAAGCTGGTGTTAAAGATTACAAATTGACTTATTATACTCCTGACTACGAAACAAAAGATACTGATATCTTGACAGCATTCCGAGTAATTCCTCAATCGGGAGTTCCGCCTGAATAAGCGGGGACTACGGTAGCTGCCGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACTGATGGACTTACCAGTCTTGATCGTTATAAAGGATGATGCTACCATATCGAGGTCGTTGTTGGGGAGGAAAATCAATATAT--TGCTTATGTAGCTTATCCTTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCCATTGTGGGTAATGTATTTGGTTTCAAAGCCCTGCGAGCTCTACGTCTGGAAGATCTGCGAATTCCCACTTCTTATTCCAAAACTTTCCAAGGTCCGCCTCATGGCATCCAAGTTGAAAGAGATAAATTGAACAAGTATGGCCGTCCCCTATTGGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGA---------AAAAACTATGGTAGGGCAGTTTATGAATGTCTACGGGGTGGACTTGATTTTACTAAG-ATGATGAAAACGTAAATTCACAACCATTTATGCGTTGGAGAGATCGTTTCTTATTTTGTGCCGAAGCAATTTATAAAGCGCAAGCCAAAACGGGTGAAATTAAAGGACATTACTTGAATGCAATTGCGGGTACATGTGAAGAAATGATAAAAAGAGCAGTATTTGCCAGAGAATTGGGAGTTCCTATCGTAATGCATGACTACTTAATTGGGGGGTTCACCGCAAATACTAGCTTGTCTCATTATTGCCGCGACAACGGTCTACTTCTTCACATCCATCGCGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAAAATCATGGTATGCATTTTAATGTACTAGCTAAAGCATTACGTATGTCTGGTGGAGATCATATTCACGCTGGTACAGTAGTGGGTAAACTGGAGAGGGAGCGTGAGATGACTTTGGGTTTTGTTTATTTGTTACGTGATGATTTTATTGAAAAAGATCAAA------------------ATCGTGATATTTTTTT-CACTCAAGACTGGGTCTTTATGCCAGGTGTTCCGCCCGTGGCTTCAGGGGGTATTCATGTTTGGCATATGCCTGCCCTAACCGAAATCTTTGGGGATGATTCCGTACTACAGTTCGGTGGAGAAACTTTAGGGCACCCTTGGGGAAATGCACCCGGCACATTAGCTAATCGGGTGGCTTTAGAAGCATGTGTACAAGCTCGTAATGAGGGACGTGATCTTGCTCGTGAAGTTAATGATATTATTCGTGAAGTTACCAAATGGAGCCCTTAGCTAGCTGCTGCTTGTGAAGTATGGAAAGAGATCACATTTGATTTCGATCCAGTGGATAAGCTAGATAAAGAGACAAAATAAGCGCGTATAATTCAGCAATTCCTGTTTGTTCTCCTAATTGATTGCAATGAAACTCTTGGAAAAAAAAAGGATCTTTAGAGGCAGTAAAAGCTTTTTCTTTAGCTAAATCTATTTCCACCGGACAGTCAAAAAGTTTTTTTGTGCGACAAAAAAAA-GTATTGGAAAAATCTTAATTGACATGTTTTAAATAACTTCCCAATTTCCATTTTGAAATTTGAAGACAAATGATTCAATTTTACTAATGTATTGTATTTGTATTTTACTTCTCCTTATTAATTAGAGCTAGGTAATATGAAA---------------------AATA------TTT---------------------------ATTGTGTATTTTATTTTTTTT---TTATTTTTGCTATTA--ATAATTTATTATT-----TTCATTATTTTCTATT----------------------CTTATTCTATTTATTTATATTGAATTCGTGAGATGATTTTTTATTTACTATGAATTGTGCTTTTCAAAATAGAAAAGCACAATTACGATAGACAAGGAAGAATCTGAATATTTCATTATATTTTAGACTAA--------------GGTGTTGGATCTCAAAATAGTTCAAAATAGTTAGAAAGAAAATTCTGAATTTTATATCTCAACTGAGAACAAAACTCTTGAGTTCTTACTTTTCTGGATAAATAAGAGCTGGGTTTCTAGTATGAAAAAGTTGATTATTAAAACTGAACTTACGAAGATGAAGATACTAATAATTAAGTCTTATTGATATTGAACATTTATATATGAAGAATGGAAATGCATCTTTATTCATTATTTTCTAAACTATATTGAATATCATTCAATATCAACAATTTAATATGAA010000001111111
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