#NEXUS
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	Conasprella_wakayamaensis        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	Virroconus_ebraeus               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;



END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
	TYPESET * UNTITLED   =  unord:  1 -  13285;

END;

BEGIN CODONS;
	CODESET * UNTITLED   =  universal:  1 -  13285;


END;

BEGIN MESQUITECHARMODELS;
	ProbModelSet * UNTITLED   =  'Jukes-Cantor':  1 -  13285;
END;

BEGIN TREES;
	Title 'RAxML_mit_nt';
	ID 0164c6c1de0c25;
	LINK Taxa = Taxa;
	TRANSLATE
[0] 		1 Africonus_borgesi,
[1] 		2 Africonus_infinitus,
[2] 		3 Africonus_miruchae,
[3] 		4 Calamiconus_quercinus,
[4] 		5 Californiconus_californicus_DNA,
[5] 		6 Californiconus_californicus_RNA,
[6] 		7 Chelyconus_ermineus_DNA,
[7] 		8 Chelyconus_ermineus_RNA,
[8] 		9 Conasprella_wakayamaensis,
[9] 		10 Conus_marmoreus,
[10] 		11 Cylinder_gloriamaris_DNA,
[11] 		12 Cylinder_gloriamaris_RNA,
[12] 		13 Cylinder_textile,
[13] 		14 Cylinder_victoriae,
[14] 		15 Darioconus_episcopatus,
[15] 		16 Dendroconus_betulinus,
[16] 		17 Eugeniconus_nobilis,
[17] 		18 Fulgiconus_goudeyi,
[18] 		19 Gastridium_geographus,
[19] 		20 Gastridium_tulipa,
[20] 		21 Genuanuconus_genuanus,
[21] 		22 Harmoniconus_sponsalis,
[22] 		23 Kalloconus_ateralbus,
[23] 		24 Kalloconus_byssinus,
[24] 		25 Kalloconus_trochulus,
[25] 		26 Kalloconus_pulcher,
[26] 		27 Kalloconus_venulatus,
[27] 		28 Kioconus_levanati,
[28] 		29 Kioconus_tribblei_454,
[29] 		30 Kioconus_tribblei_DNA,
[30] 		31 Kioconus_tribblei_RNA,
[31] 		32 Lautoconus_guanche_DNA,
[32] 		33 Lautoconus_hybridus,
[33] 		34 Lautoconus_ventricosus,
[34] 		35 Lindaconus_spurius,
[35] 		36 Lividoconus_lividus,
[36] 		37 Miliariconus_miliaris,
[37] 		38 Monteiroconus_tabidus,
[38] 		39 Pionoconus_consors_DNA,
[39] 		40 Pionoconus_consors_RNA,
[40] 		41 Pionoconus_striatus,
[41] 		42 Profundiconus_teramachii,
[42] 		43 Puncticulis_arenatus,
[43] 		44 Rhizoconus_capitaneus,
[44] 		45 Rhizoconus_vexillum_DNA,
[45] 		46 Rhizoconus_vexillum_RNA,
[46] 		47 Rhombiconus_imperialis,
[47] 		48 Rolaniconus_varius,
[48] 		49 Splinoconus_biliosus,
[49] 		50 Tomopleura_sp,
[50] 		51 Virgiconus_virgo,
[51] 		52 Virroconus_coronatus,
[52] 		53 Virroconus_ebraeus;
	TREE 'RAxML_mit_nt' = (((51:0.3747736190318079,((4:0.0032533211494273485,45:0.0006594781397692707):0.26736066073039894[%bootstrapFrequency = 100 ],36:0.3134625789368487):0.2748108261566666[%bootstrapFrequency = 100 ]):0.08830359352736465[%bootstrapFrequency = 100 ],((((((5:0.00001347553727167966,6:0.007133618971348597):1.02031104483636[%bootstrapFrequency = 100 ],9:1.014694293361031):0.31479522475033056[%bootstrapFrequency = 100 ],(50:0.8533867943422072,42:1.2107327326251724):0.22568160778347957[%bootstrapFrequency = 99 ]):1.4316306476957912[%bootstrapFrequency = 100 ],(44:0.2048108913833125,46:0.23415420826065825):0.3695819872159133[%bootstrapFrequency = 100 ]):0.0971744625437614[%bootstrapFrequency = 63 ],(47:0.3991981117080468,21:0.2201395524766897):0.16171229490605254[%bootstrapFrequency = 100 ]):0.027923265489740112[%bootstrapFrequency = 30 ],((38:0.2844109280827751,((28:0.1021419249468776,((31:0.0032884113341354795,29:0.0030615685412587715):0.004618110901143025[%bootstrapFrequency = 100 ],30:0.003964448293817748):0.10230110984197924[%bootstrapFrequency = 100 ]):0.032179842837909624[%bootstrapFrequency = 91 ],49:0.22504390397796892):0.15315404912598615[%bootstrapFrequency = 100 ]):0.11525065838248584[%bootstrapFrequency = 100 ],48:0.6216639507196681):0.049005606197201776[%bootstrapFrequency = 63 ]):0.09426358627492891[%bootstrapFrequency = 100 ]):0.027075462786817377[%bootstrapFrequency = 94 ],(((16:0.3513809454872091,(17:0.3507753971698026,((15:0.26343256975636087,(13:0.16565134651835253,(14:0.049187826331615045,(12:0.0040524017198449655,11:0.00210610371605494):0.02554837267159966[%bootstrapFrequency = 100 ]):0.09694843138820995[%bootstrapFrequency = 100 ]):0.06621844647555644[%bootstrapFrequency = 100 ]):0.0754198372226358[%bootstrapFrequency = 100 ],10:0.2717822881233139):0.012115120193192599[%bootstrapFrequency = 85 ]):0.07767961924817961[%bootstrapFrequency = 100 ]):0.030371057654478496[%bootstrapFrequency = 99 ],((43:0.4007344029230827,((20:0.20573648158543634,19:0.19338622359028315):0.26710790303819987[%bootstrapFrequency = 100 ],(18:0.2767262757582721,((39:0.0029003168993550956,40:0.00001347553727167966):0.20167088333657915[%bootstrapFrequency = 100 ],41:0.18770383846173355):0.1965795808367238[%bootstrapFrequency = 100 ]):0.02120637397805174[%bootstrapFrequency = 56 ]):0.014411272760647801[%bootstrapFrequency = 61 ]):0.014576923292659845[%bootstrapFrequency = 72 ],(22:0.45708803622701516,(8:0.003661782991216299,7:0.00510139282045069):0.2572103091914578[%bootstrapFrequency = 100 ]):0.04074324449268337[%bootstrapFrequency = 77 ]):0.007114638767788495[%bootstrapFrequency = 37 ]):0.02102351648475725[%bootstrapFrequency = 88 ],((37:0.1102161449737515,(53:0.1279182177408057,52:0.09487104077579661):0.021728588669972366[%bootstrapFrequency = 92 ]):0.2528604432466628[%bootstrapFrequency = 100 ],(((24:0.0020686279286261456,26:0.0014936919886118704):0.0394328446092542[%bootstrapFrequency = 100 ],(23:0.01754464123810646,(27:0.012968408365007516,25:0.014800603909457132):0.0033982719253273833[%bootstrapFrequency = 100 ]):0.029989838967378606[%bootstrapFrequency = 100 ]):0.1877828572229549[%bootstrapFrequency = 100 ],((33:0.003156144995958598,32:0.00278449561954909):0.10344832485557402[%bootstrapFrequency = 100 ],(34:0.10053458161243257,(3:0.06501210778419578,(1:0.0371213765185529,2:0.034593387406293453):0.017763727809873675[%bootstrapFrequency = 100 ]):0.052005167902267606[%bootstrapFrequency = 100 ]):0.02500930624568051[%bootstrapFrequency = 99 ]):0.11660125288985494[%bootstrapFrequency = 100 ]):0.039589758862952414[%bootstrapFrequency = 100 ]):0.012095837970568877[%bootstrapFrequency = 66 ]):0.005638147954291311[%bootstrapFrequency = 35 ],35:0.42683410679453443);

END;


Begin MESQUITE;
		MESQUITESCRIPTVERSION 2;
		TITLE AUTO;
		tell ProjectCoordinator;
		timeSaved 1532343022359;
		getEmployee #mesquite.minimal.ManageTaxa.ManageTaxa;
		tell It;
			setID 0 6783812056980878959;
		endTell;
		getEmployee #mesquite.charMatrices.ManageCharacters.ManageCharacters;
		tell It;
			setID 0 7412069854549398989;
			mqVersion 331;
			checksumv 0 3 2455300860 null  getNumChars 13285 numChars 13285 getNumTaxa 53 numTaxa 53   short true   bits 2305843009213693967   states 15   sumSquaresStatesOnly 1.9548731E7 sumSquares -9.2233720368435036E18 longCompressibleToShort false usingShortMatrix true   NumFiles 1 NumMatrices 1;
			mqVersion;
		endTell;
		getWindow;
		tell It;
			suppress;
			setResourcesState false false 100;
			setPopoutState 300;
			setExplanationSize 0;
			setAnnotationSize 0;
			setFontIncAnnot 0;
			setFontIncExp 0;
			setSize 1104 851;
			setLocation 8 22;
			setFont SanSerif;
			setFontSize 10;
			getToolPalette;
			tell It;
			endTell;
			desuppress;
		endTell;
		getEmployee  #mesquite.trees.BasicTreeWindowCoord.BasicTreeWindowCoord;
		tell It;
			makeTreeWindow #6783812056980878959  #mesquite.trees.BasicTreeWindowMaker.BasicTreeWindowMaker;
			tell It;
				suppressEPCResponse;
				setTreeSource  #mesquite.trees.StoredTrees.StoredTrees;
				tell It;
					setTreeBlock 1;
					setTreeBlockID 0164c6c1de0c25;
					toggleUseWeights off;
				endTell;
				setAssignedID 3440.1532342994232.7619631497779225755;
				getTreeWindow;
				tell It;
					setExplanationSize 30;
					setAnnotationSize 20;
					setFontIncAnnot 0;
					setFontIncExp 0;
					setSize 1004 779;
					setLocation 8 22;
					setFont SanSerif;
					setFontSize 10;
					getToolPalette;
					tell It;
						setTool mesquite.trees.BasicTreeWindowMaker.BasicTreeWindow.arrow;
					endTell;
					setActive;
					getTreeDrawCoordinator #mesquite.trees.BasicTreeDrawCoordinator.BasicTreeDrawCoordinator;
				tell It;
					suppress;
					setTreeDrawer  #mesquite.trees.SquareLineTree.SquareLineTree;
					tell It;
						setNodeLocs #mesquite.trees.NodeLocsStandard.NodeLocsStandard;
						tell It;
							branchLengthsToggle off;
							toggleScale on;
							toggleBroadScale off;
							toggleCenter on;
							toggleEven on;
							setFixedTaxonDistance 0;
						endTell;
						setEdgeWidth 4;
						showEdgeLines on;
						orientUp;
					endTell;
					setBackground White;
					setBranchColor Black;
					showNodeNumbers off;
					showBranchColors on;
					labelBranchLengths off;
					centerBrLenLabels on;
					showBrLensUnspecified on;
					showBrLenLabelsOnTerminals on;
					setBrLenLabelColor 0 0 255;
					setNumBrLenDecimals 6;
					desuppress;
					getEmployee #mesquite.trees.BasicDrawTaxonNames.BasicDrawTaxonNames;
					tell It;
						setColor Black;
						toggleColorPartition off;
						toggleColorAssigned on;
						toggleShadePartition off;
						toggleShowFootnotes on;
						toggleNodeLabels on;
						toggleCenterNodeNames off;
						toggleShowNames on;
						namesAngle ?;
					endTell;
				endTell;
					setTreeNumber 1;
					setTree '(50:0.4266933971711036,(42:1.2107327326251724,((9:1.014694293361031,(5:0.00001347553727167966,6:0.007133618971348597):1.02031104483636<bootstrapFrequency = 100 >):0.31479522475033056<bootstrapFrequency = 100 >,((44:0.2048108913833125,46:0.23415420826065825):0.3695819872159133<bootstrapFrequency = 100 >,((21:0.2201395524766897,47:0.3991981117080468):0.16171229490605254<bootstrapFrequency = 100 >,((48:0.6216639507196681,(38:0.2844109280827751,(49:0.22504390397796892,(28:0.1021419249468776,(30:0.003964448293817748,(29:0.0030615685412587715,31:0.0032884113341354795):0.004618110901143025<bootstrapFrequency = 100 >):0.10230110984197924<bootstrapFrequency = 100 >):0.032179842837909624<bootstrapFrequency = 91 >):0.15315404912598615<bootstrapFrequency = 100 >):0.11525065838248584<bootstrapFrequency = 100 >):0.049005606197201776<bootstrapFrequency = 63 >,((51:0.3747736190318079,(36:0.3134625789368487,(4:0.0032533211494273485,45:0.0006594781397692707):0.26736066073039894<bootstrapFrequency = 100 >):0.2748108261566666<bootstrapFrequency = 100 >):0.08830359352736465<bootstrapFrequency = 100 >,(35:0.42683410679453443,(((37:0.1102161449737515,(52:0.09487104077579661,53:0.1279182177408057):0.021728588669972366<bootstrapFrequency = 92 >):0.2528604432466628<bootstrapFrequency = 100 >,(((24:0.0020686279286261456,26:0.0014936919886118704):0.0394328446092542<bootstrapFrequency = 100 >,(23:0.01754464123810646,(25:0.014800603909457132,27:0.012968408365007516):0.0033982719253273833<bootstrapFrequency = 100 >):0.029989838967378606<bootstrapFrequency = 100 >):0.1877828572229549<bootstrapFrequency = 100 >,((32:0.00278449561954909,33:0.003156144995958598):0.10344832485557402<bootstrapFrequency = 100 >,(34:0.10053458161243257,(3:0.06501210778419578,(1:0.0371213765185529,2:0.034593387406293453):0.017763727809873675<bootstrapFrequency = 100 >):0.052005167902267606<bootstrapFrequency = 100 >):0.02500930624568051<bootstrapFrequency = 99 >):0.11660125288985494<bootstrapFrequency = 100 >):0.039589758862952414<bootstrapFrequency = 100 >):0.012095837970568877<bootstrapFrequency = 66 >,((16:0.3513809454872091,(17:0.3507753971698026,(10:0.2717822881233139,(15:0.26343256975636087,(13:0.16565134651835253,(14:0.049187826331615045,(11:0.00210610371605494,12:0.0040524017198449655):0.02554837267159966<bootstrapFrequency = 100 >):0.09694843138820995<bootstrapFrequency = 100 >):0.06621844647555644<bootstrapFrequency = 100 >):0.0754198372226358<bootstrapFrequency = 100 >):0.012115120193192599<bootstrapFrequency = 85 >):0.07767961924817961<bootstrapFrequency = 100 >):0.030371057654478496<bootstrapFrequency = 99 >,((22:0.45708803622701516,(7:0.00510139282045069,8:0.003661782991216299):0.2572103091914578<bootstrapFrequency = 100 >):0.04074324449268337<bootstrapFrequency = 77 >,(43:0.4007344029230827,((19:0.19338622359028315,20:0.20573648158543634):0.26710790303819987<bootstrapFrequency = 100 >,(18:0.2767262757582721,(41:0.18770383846173355,(39:0.0029003168993550956,40:0.00001347553727167966):0.20167088333657915<bootstrapFrequency = 100 >):0.1965795808367238<bootstrapFrequency = 100 >):0.02120637397805174<bootstrapFrequency = 56 >):0.014411272760647801<bootstrapFrequency = 61 >):0.014576923292659845<bootstrapFrequency = 72 >):0.007114638767788495<bootstrapFrequency = 37 >):0.02102351648475725<bootstrapFrequency = 88 >):0.005638147954291311<bootstrapFrequency = 35 >):0.027075462786817377):0.09426358627492891<bootstrapFrequency = 94 >):0.027923265489740112<bootstrapFrequency = 100 >):0.0971744625437614<bootstrapFrequency = 30 >):1.4316306476957912<bootstrapFrequency = 63 >):0.22568160778347957<bootstrapFrequency = 100 >):0.4266933971711036<bootstrapFrequency = 99 >);';
					setDrawingSizeMode 0;
					toggleLegendFloat on;
					scale 0;
					toggleTextOnTree off;
					togglePrintName on;
					showWindow;
				endTell;
				desuppressEPCResponse;
				getEmployee #mesquite.trees.ColorBranches.ColorBranches;
				tell It;
					setColor Red;
					removeColor off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.ornamental.BranchNotes.BranchNotes;
				tell It;
					setAlwaysOn off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.ornamental.ColorTreeByPartition.ColorTreeByPartition;
				tell It;
					colorByPartition off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.ornamental.DrawTreeAssocDoubles.DrawTreeAssocDoubles;
				tell It;
					setOn on;
					toggleShow consensusFrequency;
					toggleShow bootstrapFrequency;
					toggleShow posteriorProbability;
					toggleShow consensusFrequency;
					toggleShow posteriorProbability;
					toggleShow bootstrapFrequency;
					setDigits 4;
					setThreshold ?;
					writeAsPercentage off;
					toggleCentred off;
					toggleHorizontal on;
					toggleWhiteEdges on;
					toggleShowOnTerminals on;
					setFontSize 10;
					setOffset 0  0;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.ornamental.DrawTreeAssocStrings.DrawTreeAssocStrings;
				tell It;
					setOn on;
					toggleCentred on;
					toggleHorizontal on;
					setFontSize 10;
					setOffset 0  0;
					toggleShowOnTerminals on;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.trees.TreeInfoValues.TreeInfoValues;
				tell It;
					panelOpen false;
				endTell;
			endTell;
		endTell;
		getEmployee  #mesquite.charMatrices.BasicDataWindowCoord.BasicDataWindowCoord;
		tell It;
			showDataWindow #7412069854549398989 #mesquite.charMatrices.BasicDataWindowMaker.BasicDataWindowMaker;
			tell It;
				getWindow;
				tell It;
					setExplanationSize 30;
					setAnnotationSize 20;
					setFontIncAnnot 0;
					setFontIncExp 0;
					setSize 1004 779;
					setLocation 8 22;
					setFont SanSerif;
					setFontSize 10;
					getToolPalette;
					tell It;
					endTell;
					setTool mesquite.charMatrices.BasicDataWindowMaker.BasicDataWindow.arrow;
					colorCells  #mesquite.charMatrices.ColorByState.ColorByState;
				tell It;
					setStateLimit 9;
					toggleUniformMaximum on;
				endTell;
					colorRowNames  #mesquite.charMatrices.TaxonGroupColor.TaxonGroupColor;
					colorColumnNames  #mesquite.charMatrices.CharGroupColor.CharGroupColor;
					colorText  #mesquite.charMatrices.NoColor.NoColor;
					setBackground White;
					toggleShowNames on;
					toggleShowTaxonNames on;
					toggleTight off;
					toggleThinRows off;
					toggleShowChanges off;
					toggleSeparateLines off;
					toggleShowStates on;
					toggleAutoWCharNames off;
					toggleAutoTaxonNames off;
					toggleShowDefaultCharNames off;
					toggleConstrainCW on;
					toggleBirdsEye off;
					toggleShowPaleGrid off;
					toggleShowPaleCellColors off;
					toggleShowPaleExcluded off;
					togglePaleInapplicable on;
					toggleShowBoldCellText off;
					toggleAllowAutosize off;
					toggleColorsPanel off;
					toggleLinkedScrolling on;
					toggleScrollLinkedTables off;
				endTell;
				showWindow;
				getWindow;
				tell It;
					forceAutosize;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.charMatrices.AlterData.AlterData;
				tell It;
					toggleBySubmenus off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.charMatrices.ColorCells.ColorCells;
				tell It;
					setColor Red;
					removeColor off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.categ.StateNamesStrip.StateNamesStrip;
				tell It;
					showStrip off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.charMatrices.AnnotPanel.AnnotPanel;
				tell It;
					togglePanel off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.charMatrices.CharReferenceStrip.CharReferenceStrip;
				tell It;
					showStrip off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.charMatrices.QuickKeySelector.QuickKeySelector;
				tell It;
					autotabOff;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.charMatrices.SelSummaryStrip.SelSummaryStrip;
				tell It;
					showStrip off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.align.AlignToDropped.AlignToDropped;
				tell It;
					gapCosts 16 6 1 1;
					subCosts  10 5 10 10 10 5 5 10 10 10 5 10;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.molec.ColorByAA.ColorByAA;
				tell It;
					emphasizeDegeneracy off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.molec.SequenceInfoEditor.SequenceInfoEditor;
				tell It;
					panelOpen false;
				endTell;
			endTell;
		endTell;
		endTell;
end;