NEXUS [File created by TreeBASE: 1/16/09 15:40:39] [Matrix accession#: M4294] BEGIN TAXA; TITLE M4294; DIMENSIONS NTAX=14; TAXLABELS Lepidium_apelatum_clone4 Lepidium_apelatum_clone3 Brassica_rapa_pekinensis Capsella_bursapastoris_clone1 Pachycladon_exilis_B Pachycladon_fastigiata_B Pachycladon_fastigiata_A Pachycladon_exilis_A Olimarabidopsis_cabulica Crucihimalaya_mollissima Transberingia_bursifolia_bursifolia Boechera_holboellii Arabidopsis_thaliana Arabidopsis_lyrata_lyrata ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE M4294; DIMENSIONS NCHAR=376; FORMAT datatype = dna gap = - missing = ? ; MATRIX Lepidium_apelatum_clone4 AAAAACGACTTGGGCATGTCTAACTACCCCATGGTTCCTGGGCACGAGGTTGTAGGAG-AAGTGGTGGAGGTTGGATCAGGTGTGAGCAAGTTCATGGTAGGAGACACAGTTGGAGTTGGATGTTTGGTTGGATGTTGTGGAGGTTGTAGTCCTTGTGAGAGAGATCTGGAACAGTATTGTCCTAAGAAGATTTGGAGCTACAACGATGTTTACTTTGATGGTCAACCAACACAAGGTGGCTTCGCTAAAGCCACCGTCGTTCACCAAAAGTTTGTGGTGAAGATTCCAGAAGGAATGCCGGTTGAGCAAGCTGCACCGTTACTATGTGCCGGTGTGACGGTTTACAGTCCATTGAGTCACTTTGGGCTAAAGGAA Lepidium_apelatum_clone3 AAAAATGATATGGGGATGTCTAATTACCCCATGGTTCCTGGGCACGAGGTTGTAGGAG-AAGTGGTGGAGGTTGGATCAGGTGTGCGCAAGTTCACAGTAGGGGATATAGTAGGAGTTGGATGTCTCGTTGGATGTTGTGGAGGTTGTAGCCCTTGTGAGAGAGATTTGGAACAGTATTGTCCCAAGAAGATTTGGAGCTACAACGATGTTTACTTCGATGGTCAGCCTACTCAAGGTGGCTTCGCTAAAGCCACCGTCGTCCACCAAAAGTTTGTGGTGAAGATTCCAGAAGGAATGGCGGTTGAGCAAGCTGCACCGCTACTATGCGCTGGTGTGACGGTGTACAGTCCACTGAGTCACTTCGGGCTAAAGCAA Brassica_rapa_pekinensis AAAAACGATCTCGGCACGTCTAACTACCCCATGGTTCCTGGGCACGAGGTTGTAGGGG-AAGTAGTAGAGGTGGGATCAGGTGTGAGTAAGTTCACCGTAGGGGATATAGTTGGAGTTGGTTGTCTCGTTGGATGTTGCGGTGGTTGTAGCCCCTGCGAGAGGGATCTCGAACAGTATTGTCCCAAGAAAATATGGAGTTACAACGATGTTTACATCGATGGTCAGCCTACACAAGGTGGCTTTGCTAAAGCCACTGTGGTTCACCAAAAGTTTGTGGTGAAGATTCCAGAAGGAATGGCGGTTGAGCAGGCAGCCCCGCTACTGTGCGCCGGTGTGACGGTGTACAGTCCACTGAGCCACTTTGGGCTGAAGAAA Capsella_bursapastoris_clone1 AAAAATGATCTTGGCATGTCTAACTACCCTATGGTTCCTGGGCATGAAGTGGTAGGGG-AAGTGGAGGAGGTGGGATCAGGTGTGAGCAAGTTCACCGTAGGGGATATAGTCGGAGTTGGTTGCCTCGTTGGGTGTTGTGGAGGCTGTAGCCCCTGTGAGAGAGATCTGGAACAGTACTGTCCCAAGAAGATTTGGAGCTACAATGATGTTTACATCGATGGTCAACCCACCCAAGGCGGCTTCGCTAAAGCCACCGTCGTTCACCAAAAGTTTGTCGTGAAGATTCCAGAAGGAATGGCGGTTGAGCAGGCTGCGCCGCTGCTGTGCGCTGGTGTGACGGTGTACAGTCCACTGAGCCACTTCGGTCTGAAACGA Pachycladon_exilis_B AAAAACGATATGGGCATGTCTAATTACCCCATGGTTCCTGGGCACGAGGTTGTGGGGG-AAGTGGTGGAGGTGGGATCAGGTGTGAGCAAGTTCACCGTAGGGGACATAGTCGGAGTTGGTTGCCTGGTTGGATGTTGTGGAGGTTGTAGCCCCTGCGAGAGAGATCTGGAACAGTATTGTCCCAAGAAGATCTGGAGCTACAACGATGTTTACACTGATGGTCAACCCACACAAGGCGGCTTCGCTAAAGCCACGGTCGTTCACCAAAAGTTTGTGTTGAAGATTCCAAAAGGAATGGCGGTTGAGCAGGCTGCGCCGCTACTGTGTGCTGGTGTGACGGTGTACAGTCCACTGAGCCACTTCGGTCTGAAACGA Pachycladon_fastigiata_B AAAAACGATCTGGGCATGTCTAATTACCCCATGGTTCCTGGGCACGAGGTTGTGGGGG-AAGTGGTGGAGGTGGGATCAGGTGTGAGCAAGTTCACCGTAGGGGACATAGTCGGAGTTGGTTGCCTGGTTGGATGTTGTGGAGGTTGTAGCCCCTGCGAGAGAGATCTGGAACAGTATTGTCCCAAGAAGATCTGGAGCTACAACGATGTTTACACTGATGGTCAACCCACACAAGGCGCCTTCGCTAAAGCCACGGTCGTTCACCAAAAGTTTGTGGTGAAGATTCCAGAAGGAATGGCGGTTGAGCAGGCTGCGCCGCTACTGTGTGCTGGTGTGACGGTGTACAGTCCACTGAGCCACTTCGGTCTGAAACGA Pachycladon_fastigiata_A --AAATGATCTGGGCATGTCTAACTACCCCATGGTTCCTGGGCATGAAGTGGTAGGGG-AAGTGGTGGAGGTGGGATCAGGTGTGAGCAAGTTCACCGTAGGGGATATAGTCGGAGTTGGTTGCCTCGTTGGATGTTGTGGAGGTTGTAGCCCCTGTGAGAGAGATCTGGAACAGTATTGTCCCAAGAAAATTTGGAGCTACAATGATGTTTACATCGATGGTCAACCCACACAAGGCGGCTTCGCTAAAGCCACCGTCGTTCACCAAAA---------------------------------------------------------------------------------------------------------- Pachycladon_exilis_A AAAAATGATCTGGGCATGTCTAACTACCCCATGGTTCCTGGGCATGAAGTGGTAGGGG-AAGTGGTGGAGGTGGGATCAGGTGTGAGCAAGTTCACCGTAGGGGATATAGTCGGAGTTGGTTGCCTCGTTGGATGTTGTGGAGGTTGTAGCCCCTGTGAGAGAGATCTGGAACAGTATTGTCCCAAGAAGATTTGGAGCTACAATGATGTTTACATCGATGGTCAACCCACACAAGGCGGCTTCGCTAAAGCCACCGTCGTTCACCAAAAG--------------------------------------------------------------------------------------------------------- Olimarabidopsis_cabulica AAAAATGACCTCGGCATGTCTAATTACCCTATGGTTCCTGGGCACGAAGTTGTAGGAG-AAGTGGAGGAGGTGGGATCAGATGTGAGCAAGTTCACAGTAGGGGACATAGTTGGAGTTGGTTGCCTCGTTGGATGTTGTGGAGGTTGTAGCCCCTGCGATAGAGATCTTGAACAGTATTGCCCTAAGAAGATTTGGAGCTACAACGATGTTTACATCGATGGTCAACCTACACAAGGCGGCTTCGCTAAAGCCACCGTCGTTCACCAAAAGTTTGTGGTGAAGATTCCAGAAGGAATGGCGGTTGAGCAGGCTGCGCCGCTACTGTGCGCTGGTGTGACGGTATACAGTCCACTGAGCCACTTCGGTCTGAAACGA Crucihimalaya_mollissima --AAATGATCTGGGCATGTCTAACTACCCCATGGTTCCTGGGCATGAAGTGGTAGGAG-AAGTGGTGGAGGTGGGATCAGGTGTGAGCAAGTTCACCGTAGGGGATATAGTCGGAGTTGGTTGTCTCGTTGGATGTTGTGGAGGTTGTAGCCCATGTGAGAGAGATCTGGAACAGTATTGTCCCAAGAAGATTTGGAGCTACAATGATGTTTACATCGATGGTCAACCCACACAAGGCGGCTTCGCTAAAGCCACCGTCGTTCACCAAAAGTTTGTGGTGAAGATTCCAGAAGGAATGGCGGTTGAGCAGGCTGCGCCGCTACTGTGCGCTGGTGTGACGGTGTACAGTCCAC----------------------- Transberingia_bursifolia_bursifolia AAAAATGATCTGGGCATGTCTAACTACCCCATGGTTCCTGGGCATGAAGTGGTAGGAG-AAGTGGTGGAGGTGGGATCAGGTGTGAGCAAGTTCACCGTAGGGGATATAGTCGGAGTTGGTTGTCTCGTTGGATGTTGTGGAGGTTGTAGCCCATGTGAGAGAGATCTGGAACAGTATTGTCCCAAGAAGATTTGGAGCTACAATGATGTTTACATCGATGGTCAACCCACACAAGGCGGCTTCGCTAAAGCCACCGTCGTTCACCAAAAGTTTGTGGTGAAGATTCCAGAAGGAATGGCGGTTGAGCAGGCTGCGCCGCTACTGTGCGCTGGTGTGACGGTGTACAGTCCACTGAGCCACTTCGGTTTGAAACGA Boechera_holboellii AAAAATGATCTGGGCATGTCTAACTACCCCATGGTTCCTGGGCATGAAGTGGTAGGGG-AAGTGATGGAGGTGGGATCAGGTGTGAGCAAGTTCACCGTAGGGGACATAGTCGGAGTTGGTTGCCTCGTTGGATGTTGTGGAGGTTGTAGCCCCTGTGAGAGAGATCTGGAACAGTATTGTCCCAAGAAGATTTGGAGCTACAATGATGTTTACTTCGATGGTCAACCCACACAAGGCGGCTTCGCTAAAGCCACCGTCGTTCACCAAAAGTTTGTGGTGAAGATTCCAGAAGGAATGGCGGTTGAGCAGGCTGCGCCGCTACTGTGCGCAGGTGTGACGGTGTACAGTCCACTGAGCCACTTCGGTCTGAAACGA Arabidopsis_thaliana AAAAATGATCTTGGCATGTCTAATTACCCCATGGTTCCTGGGCATGAAGTGGTAGGGG-AAGTAGTGGAGGTGGGATCAGATGTGAGCAAGTTCACCGTAGGGGACATAGTTGGAGTTGGTTGCCTCGTTGGATGTTGCGGAGGTTGTAGCCCCTGCGAGAGAGATCTGGAACAGTATTGTCCAAAGAAGATTTGGAGCTACAATGATGTTTACATCAATGGTCAACCTACACAAGGCGGCTTCGCTAAAGCCACCGTCGTTCACCAAAAGTTTGTGGTCAAGATTCCAGAAGGAATGGCGGTTGAGCAGGCTGCGCCGCTACTGTGCGCTGGTGTGACTGTGTACAGTCCACTGAGCCACTTTGGTCTGAAACAA Arabidopsis_lyrata_lyrata AAAAATGATCTTGGCATGTCTAACTACCCCATGGTTCCTGGGCATGAAGTGGTAGGGG-AAGTGGTGGAGGTTGGATCAGATGTGAGCAAGTTCACCGTAGGTGACATAGTTGGAGTTGGTTGCCTCGTTGGATGTTGCGGAGGTTGTAGCCCTTGCGAGAGAGATCTGGAACAGTATTGTCCCAAGAAGATTTGGAGCTACAACGATGTTTACATCGATGGTCAACCTACACAAGGCGGCTTCGCTAAAGCCACCGTCGTTCACCAAAAGTTTGTGGTGAAGATTCCAGAAGGAATGGCGGCTGAGCAGGCTGCGCCACTACTGTGCGCTGGTGTGACGGTGTATAGTCCACTGAGCCACTTCGGTCTGAAACAA ; END;