NEXUS
[File created by TreeBASE:  1/16/09  15:40:39]
[Matrix accession#: M4294]

BEGIN TAXA;
	TITLE M4294;
	DIMENSIONS  NTAX=14;
	TAXLABELS
		Lepidium_apelatum_clone4	Lepidium_apelatum_clone3	Brassica_rapa_pekinensis	Capsella_bursapastoris_clone1	Pachycladon_exilis_B	Pachycladon_fastigiata_B	Pachycladon_fastigiata_A	Pachycladon_exilis_A	Olimarabidopsis_cabulica	Crucihimalaya_mollissima	Transberingia_bursifolia_bursifolia	Boechera_holboellii	Arabidopsis_thaliana	Arabidopsis_lyrata_lyrata
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M4294;
	DIMENSIONS NCHAR=376;
	FORMAT datatype = dna gap = - missing = ? ;
	MATRIX
		Lepidium_apelatum_clone4                  AAAAACGACTTGGGCATGTCTAACTACCCCATGGTTCCTGGGCACGAGGTTGTAGGAG-AAGTGGTGGAGGTTGGATCAGGTGTGAGCAAGTTCATGGTAGGAGACACAGTTGGAGTTGGATGTTTGGTTGGATGTTGTGGAGGTTGTAGTCCTTGTGAGAGAGATCTGGAACAGTATTGTCCTAAGAAGATTTGGAGCTACAACGATGTTTACTTTGATGGTCAACCAACACAAGGTGGCTTCGCTAAAGCCACCGTCGTTCACCAAAAGTTTGTGGTGAAGATTCCAGAAGGAATGCCGGTTGAGCAAGCTGCACCGTTACTATGTGCCGGTGTGACGGTTTACAGTCCATTGAGTCACTTTGGGCTAAAGGAA
		Lepidium_apelatum_clone3                  AAAAATGATATGGGGATGTCTAATTACCCCATGGTTCCTGGGCACGAGGTTGTAGGAG-AAGTGGTGGAGGTTGGATCAGGTGTGCGCAAGTTCACAGTAGGGGATATAGTAGGAGTTGGATGTCTCGTTGGATGTTGTGGAGGTTGTAGCCCTTGTGAGAGAGATTTGGAACAGTATTGTCCCAAGAAGATTTGGAGCTACAACGATGTTTACTTCGATGGTCAGCCTACTCAAGGTGGCTTCGCTAAAGCCACCGTCGTCCACCAAAAGTTTGTGGTGAAGATTCCAGAAGGAATGGCGGTTGAGCAAGCTGCACCGCTACTATGCGCTGGTGTGACGGTGTACAGTCCACTGAGTCACTTCGGGCTAAAGCAA
		Brassica_rapa_pekinensis                  AAAAACGATCTCGGCACGTCTAACTACCCCATGGTTCCTGGGCACGAGGTTGTAGGGG-AAGTAGTAGAGGTGGGATCAGGTGTGAGTAAGTTCACCGTAGGGGATATAGTTGGAGTTGGTTGTCTCGTTGGATGTTGCGGTGGTTGTAGCCCCTGCGAGAGGGATCTCGAACAGTATTGTCCCAAGAAAATATGGAGTTACAACGATGTTTACATCGATGGTCAGCCTACACAAGGTGGCTTTGCTAAAGCCACTGTGGTTCACCAAAAGTTTGTGGTGAAGATTCCAGAAGGAATGGCGGTTGAGCAGGCAGCCCCGCTACTGTGCGCCGGTGTGACGGTGTACAGTCCACTGAGCCACTTTGGGCTGAAGAAA
		Capsella_bursapastoris_clone1             AAAAATGATCTTGGCATGTCTAACTACCCTATGGTTCCTGGGCATGAAGTGGTAGGGG-AAGTGGAGGAGGTGGGATCAGGTGTGAGCAAGTTCACCGTAGGGGATATAGTCGGAGTTGGTTGCCTCGTTGGGTGTTGTGGAGGCTGTAGCCCCTGTGAGAGAGATCTGGAACAGTACTGTCCCAAGAAGATTTGGAGCTACAATGATGTTTACATCGATGGTCAACCCACCCAAGGCGGCTTCGCTAAAGCCACCGTCGTTCACCAAAAGTTTGTCGTGAAGATTCCAGAAGGAATGGCGGTTGAGCAGGCTGCGCCGCTGCTGTGCGCTGGTGTGACGGTGTACAGTCCACTGAGCCACTTCGGTCTGAAACGA
		Pachycladon_exilis_B                      AAAAACGATATGGGCATGTCTAATTACCCCATGGTTCCTGGGCACGAGGTTGTGGGGG-AAGTGGTGGAGGTGGGATCAGGTGTGAGCAAGTTCACCGTAGGGGACATAGTCGGAGTTGGTTGCCTGGTTGGATGTTGTGGAGGTTGTAGCCCCTGCGAGAGAGATCTGGAACAGTATTGTCCCAAGAAGATCTGGAGCTACAACGATGTTTACACTGATGGTCAACCCACACAAGGCGGCTTCGCTAAAGCCACGGTCGTTCACCAAAAGTTTGTGTTGAAGATTCCAAAAGGAATGGCGGTTGAGCAGGCTGCGCCGCTACTGTGTGCTGGTGTGACGGTGTACAGTCCACTGAGCCACTTCGGTCTGAAACGA
		Pachycladon_fastigiata_B                  AAAAACGATCTGGGCATGTCTAATTACCCCATGGTTCCTGGGCACGAGGTTGTGGGGG-AAGTGGTGGAGGTGGGATCAGGTGTGAGCAAGTTCACCGTAGGGGACATAGTCGGAGTTGGTTGCCTGGTTGGATGTTGTGGAGGTTGTAGCCCCTGCGAGAGAGATCTGGAACAGTATTGTCCCAAGAAGATCTGGAGCTACAACGATGTTTACACTGATGGTCAACCCACACAAGGCGCCTTCGCTAAAGCCACGGTCGTTCACCAAAAGTTTGTGGTGAAGATTCCAGAAGGAATGGCGGTTGAGCAGGCTGCGCCGCTACTGTGTGCTGGTGTGACGGTGTACAGTCCACTGAGCCACTTCGGTCTGAAACGA
		Pachycladon_fastigiata_A                  --AAATGATCTGGGCATGTCTAACTACCCCATGGTTCCTGGGCATGAAGTGGTAGGGG-AAGTGGTGGAGGTGGGATCAGGTGTGAGCAAGTTCACCGTAGGGGATATAGTCGGAGTTGGTTGCCTCGTTGGATGTTGTGGAGGTTGTAGCCCCTGTGAGAGAGATCTGGAACAGTATTGTCCCAAGAAAATTTGGAGCTACAATGATGTTTACATCGATGGTCAACCCACACAAGGCGGCTTCGCTAAAGCCACCGTCGTTCACCAAAA----------------------------------------------------------------------------------------------------------
		Pachycladon_exilis_A                      AAAAATGATCTGGGCATGTCTAACTACCCCATGGTTCCTGGGCATGAAGTGGTAGGGG-AAGTGGTGGAGGTGGGATCAGGTGTGAGCAAGTTCACCGTAGGGGATATAGTCGGAGTTGGTTGCCTCGTTGGATGTTGTGGAGGTTGTAGCCCCTGTGAGAGAGATCTGGAACAGTATTGTCCCAAGAAGATTTGGAGCTACAATGATGTTTACATCGATGGTCAACCCACACAAGGCGGCTTCGCTAAAGCCACCGTCGTTCACCAAAAG---------------------------------------------------------------------------------------------------------
		Olimarabidopsis_cabulica                  AAAAATGACCTCGGCATGTCTAATTACCCTATGGTTCCTGGGCACGAAGTTGTAGGAG-AAGTGGAGGAGGTGGGATCAGATGTGAGCAAGTTCACAGTAGGGGACATAGTTGGAGTTGGTTGCCTCGTTGGATGTTGTGGAGGTTGTAGCCCCTGCGATAGAGATCTTGAACAGTATTGCCCTAAGAAGATTTGGAGCTACAACGATGTTTACATCGATGGTCAACCTACACAAGGCGGCTTCGCTAAAGCCACCGTCGTTCACCAAAAGTTTGTGGTGAAGATTCCAGAAGGAATGGCGGTTGAGCAGGCTGCGCCGCTACTGTGCGCTGGTGTGACGGTATACAGTCCACTGAGCCACTTCGGTCTGAAACGA
		Crucihimalaya_mollissima                  --AAATGATCTGGGCATGTCTAACTACCCCATGGTTCCTGGGCATGAAGTGGTAGGAG-AAGTGGTGGAGGTGGGATCAGGTGTGAGCAAGTTCACCGTAGGGGATATAGTCGGAGTTGGTTGTCTCGTTGGATGTTGTGGAGGTTGTAGCCCATGTGAGAGAGATCTGGAACAGTATTGTCCCAAGAAGATTTGGAGCTACAATGATGTTTACATCGATGGTCAACCCACACAAGGCGGCTTCGCTAAAGCCACCGTCGTTCACCAAAAGTTTGTGGTGAAGATTCCAGAAGGAATGGCGGTTGAGCAGGCTGCGCCGCTACTGTGCGCTGGTGTGACGGTGTACAGTCCAC-----------------------
		Transberingia_bursifolia_bursifolia       AAAAATGATCTGGGCATGTCTAACTACCCCATGGTTCCTGGGCATGAAGTGGTAGGAG-AAGTGGTGGAGGTGGGATCAGGTGTGAGCAAGTTCACCGTAGGGGATATAGTCGGAGTTGGTTGTCTCGTTGGATGTTGTGGAGGTTGTAGCCCATGTGAGAGAGATCTGGAACAGTATTGTCCCAAGAAGATTTGGAGCTACAATGATGTTTACATCGATGGTCAACCCACACAAGGCGGCTTCGCTAAAGCCACCGTCGTTCACCAAAAGTTTGTGGTGAAGATTCCAGAAGGAATGGCGGTTGAGCAGGCTGCGCCGCTACTGTGCGCTGGTGTGACGGTGTACAGTCCACTGAGCCACTTCGGTTTGAAACGA
		Boechera_holboellii                       AAAAATGATCTGGGCATGTCTAACTACCCCATGGTTCCTGGGCATGAAGTGGTAGGGG-AAGTGATGGAGGTGGGATCAGGTGTGAGCAAGTTCACCGTAGGGGACATAGTCGGAGTTGGTTGCCTCGTTGGATGTTGTGGAGGTTGTAGCCCCTGTGAGAGAGATCTGGAACAGTATTGTCCCAAGAAGATTTGGAGCTACAATGATGTTTACTTCGATGGTCAACCCACACAAGGCGGCTTCGCTAAAGCCACCGTCGTTCACCAAAAGTTTGTGGTGAAGATTCCAGAAGGAATGGCGGTTGAGCAGGCTGCGCCGCTACTGTGCGCAGGTGTGACGGTGTACAGTCCACTGAGCCACTTCGGTCTGAAACGA
		Arabidopsis_thaliana                      AAAAATGATCTTGGCATGTCTAATTACCCCATGGTTCCTGGGCATGAAGTGGTAGGGG-AAGTAGTGGAGGTGGGATCAGATGTGAGCAAGTTCACCGTAGGGGACATAGTTGGAGTTGGTTGCCTCGTTGGATGTTGCGGAGGTTGTAGCCCCTGCGAGAGAGATCTGGAACAGTATTGTCCAAAGAAGATTTGGAGCTACAATGATGTTTACATCAATGGTCAACCTACACAAGGCGGCTTCGCTAAAGCCACCGTCGTTCACCAAAAGTTTGTGGTCAAGATTCCAGAAGGAATGGCGGTTGAGCAGGCTGCGCCGCTACTGTGCGCTGGTGTGACTGTGTACAGTCCACTGAGCCACTTTGGTCTGAAACAA
		Arabidopsis_lyrata_lyrata                 AAAAATGATCTTGGCATGTCTAACTACCCCATGGTTCCTGGGCATGAAGTGGTAGGGG-AAGTGGTGGAGGTTGGATCAGATGTGAGCAAGTTCACCGTAGGTGACATAGTTGGAGTTGGTTGCCTCGTTGGATGTTGCGGAGGTTGTAGCCCTTGCGAGAGAGATCTGGAACAGTATTGTCCCAAGAAGATTTGGAGCTACAACGATGTTTACATCGATGGTCAACCTACACAAGGCGGCTTCGCTAAAGCCACCGTCGTTCACCAAAAGTTTGTGGTGAAGATTCCAGAAGGAATGGCGGCTGAGCAGGCTGCGCCACTACTGTGCGCTGGTGTGACGGTGTATAGTCCACTGAGCCACTTCGGTCTGAAACAA
	;
END;