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Bacidia_sipmanii ??????????????????????????????????????????????????????????????????????AATATCAACAACGTTGAATAAAATTCTGGGTAAAATTTTGATAATGACAAATTTTATCTATATGTCTTGACCAATTTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAACACGTTGAAGACTAGTGTTATTCATCTTTAATAGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGCAGATAAAGCCTT--TGGGGACTAATATGCTAGAGTTACTTGTGAGGGGGCTTAAAAGTACTATTGGTTTAGAGATAAAATTCTTCGAG-ACCACTTATC--------------TGGCACAGGTAAAGGTGAAAGCGTCTCCCTATGTGATAACTGACGTTGAAGGACGAAGGCTTTGAATAGCGAATAGGATTAGATACCCTAGTAGTCGAAGCAGAGAATGATGAGTGCCATAAACTAGA------TTTAGTTTATAAATGAAAGTGTAAGCACTCCACCTTATGAGTAAAGTGGCAACGCCGGAATTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATAATCCACAAAAAACCTTACCACAACTTGAATAGC----------------------------------TACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTCAGTTAATGTCGTGAGA-TTTGGTTAGATCCATTAAATTAACGCAAACCCTTGCTTTATTTTTATATAATGCATCTCT-CCATCACAACGGATTTGATAAAAGGGACTAAGAC????????????????????????CCGAGAG-------------GAGCCTCGTGCTCCAG------------GGGG-CTTCGG----TCCCTGCTTCTC-AACCCTATGAATTACA-TTCCATCATCAAGCTTTGTTGCATTGGCGG--GTGCG----------------------------------AATGCC---CCCGCCAGCAGCGCA-CT-CAAACTCGATT--TCAAT------GCAGTCCGAGT-AGCACGATA-AATAAG-CAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTCTGG-TATTCCAGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTG-C-AACCCTCAAGC-CTAGCTTGGTCATGGG--CG-TCGCCCCAC------GCG-----GGGCGTGCCTGAAAAGCAGTG-GGAGTCCGG--T-GCGAC-TTTGGGCGTAGTAAATTT----TC-TC----CCGCTCTGAAAGCCTC---GCGCCGCGG------TGCCCAGAACCCCCTATATCTCCAA---TGAATTGACC Bacidina_brittoniana ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ATGAGAC-------------GGGCTCGGCGCTCGAG------------GGGG-CTTCGG----CCTCCGCCTCTC-AACCCTGTGTAT-ACC-TACCACT-GTTGCTTTGGCGGGCCTTGGGG--TCATGC----------CCATGCCAGGTCTC-GGCC-CGGTGAGTG---CCCGTCAGAAGCCCC-CT-AAAATCCGTTTCATCAGT------GTTGTCCGAGT-CTTATATCA-ATAAGC-AAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGGAAATTCCGGAGGGCATACCTGTCCGAGCGTCATTA-C-AACCCTCAAGC-GTAGCTTGGTATTGGG--CC-TCGCTCCCCGCC---AAG-----GGGCGTGCCTGCAAAGTAGTG-GCGGTCCGG--G-GTGGC-CTTGAACGTAGTAGTTTT----CT-CC----CCGTTCCAAAGGTTC----TCTCCGTGGC----CTGTCAG-AATGCGCCAACTTTCAA?????????????? Bacidina_delicata ??????????????????????????????????????????????????????????????????????GGTATTGACTTAGTTGAATAAAGTTCTGAGTAA-GTCTAGATGATGACTTAATTTACTCATGTGTCTTGACCAAAGTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAAGACGTTAAAGACTAGTGTTATTCATCATTAGCAGGTTTAAAGGGTACTTAGACGGCAAACCAAGCCATAGAAGGGACTAGTTTGCTAGAGTTGCTTGTGAAGGGGCTTTTAAGTACTGGTGGAGTAGAGATAAAATGCAGATAT-ACCTTTTTTCGTAAGAAAAAAAAATGGCACTGGTAAAGGCGAAGGCATCCCCTTATGTGTAAACTGACGTTAAAGGACGAAGGCTTTGAACCGCGAATAGGATTAGATACCCTAGTAGTCAAAGCAGAGAATTATGAGTGCCATAGATTAGGTTTATTTTTGATCTATAAATGAAAGTGCAAGCACTCCACCTTATGAGTAACGTGGCAACACCGAAATTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAGACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATGATCCGCAAAAAACCTTACCACAACTTGCATATACTTATTTTG------------------ATTTGTATACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTAAGTTAATGTCGTGAGACTTTGATTAGATTCATTTAATTGACGTAATCCCTC?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CAGAGAG-------------GAGCTCCGCGCTCCAG------------GGGG-TTC--G----CCCCCGCCTCTC-AACCCTGTGAAA-ATC-ATACCTATGTTGCTTTGGCGGGCCTTGGGG--TCACGC----------TCATGCCAGGTTC---GCC-TGGCGAGTG---CCCGCCGGAAGCCCA-CC-AAAACTCGTTTAATCTTT------GCGGTCAGAGT-CCAAACACA-AATAAAGCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGG-TATTCCGGGGGGCATACCTGTTCGAGCGTCGTTA-C-ACCTCTCAAGC-GTAGCTTGGTATTGGG--CC-TCGCTCCCCCCTCGCGGG-----GGGCGTGCCTGAAAAGTAGTG-GCGGCCCGG--C-GTGGC-TTTGAACCTAGTAACATA----CCATC----TCGTTCTGAAGGCTC----GCGGCGTGGC----TTGCCAT-AACCCCATCATTTTCAAG-----AATTGACC Bacidina_neosquamulosa ??????????????????????????????????????????????????????????????????????GATATTGACTTAGTTGAATAAAGTTCTGAGTGA-ATCTAGATAATGACTTAATTTGCTCATGTGTCTTGACCAAAGTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAAGACGTTAAAGACTAGTGTTATTCATCATTAGCAGGTTTAAAGGGTACTTAGACGGCAAATCAAGCCAT--AAGGGACTAGTTTGCTAGAGTTTTATGTGAAGGGGCTTTAAAGTACTGGTGGTGTAGAGATAAAATGCTGTTAT-ACCTTTTTTT--------------TGGCACTGGTAAAGGCGAAGGCATCCCCTTATGTGGTAACTGACGTTAAAGGACGAAGGCTTTGAGTCGCGAATAGGATTAGATACCCTAGTAGTCAAAGGAGAAAATTATGAGTGCCATAGATTAGA------TTTGATCTATAAATGAAAGTGCAAGCACTTCACCTTATGAGTAACGTGGCAACACCGAAATTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATGATCCACAAAAAACCTTACCACAACTTGTATATA----------------------------------CACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTAAGTTAATGTCGTGAGACTTTGATTAGATTCATTAAATTGACGTAAACCCTCGTTTTACTTTTACGTAGAATGGTTCA-CCGCTATATTGGAAACGATAACAGGGAATAAGAC????????????????????????CAGAGAG-------------GAGCTTCGCGCTCCAG------------GGGG-TTC--G----CCTCCGCCTCTC-AACCCTGTGTAA-ATC-ATACCTTTGTTGCTTTGGCGGGCCTTGGGG--TCATGC----------TCATGCCGGGCTTTTGCCT-GAGCGAGTG---CTCGCCGGAAGCCTA-CC-AAAACTCGTTTAATTTAT------GCTGTCAGAGT-CTAAACACA-AATAAAGCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGG-TATTCCGGGGGGCATACCTGTTCGAGCGTCATTA-C-ACCTCTCAAGC-GTAGCTTGGTATTGGG--CC-TCGCTCCCTCAC----GG-----GGGCGTGCCTGAAAAGTAGTG-GCGGTCCGG--C-GTGGC-CTTGAACGTAGTAAATTT----TC-TC----CCGTTCTGAAGGTCC----GCGTCGTGGC----TGGCCAGAATCACCCACATTTTCAAG-----AATTGACC Bacidina_phacodes AATAGCCTAACGGCTGAACCAGCAATTTGGAAGAATGTATAGCGAAAGCTAGTTACAT--AATAT---GTAATATCGATTATATCGAATAAAGTTCTGAGTAA-ATCTAGATTATGACTTAATTTACTCACGTGTCTTGACTAAAATGCGTGCCAGCAGTCGCGGTAAGACGTATAAGACTAGTGTTATTCATCTTTAGCAGGTTTAAAGG-TACTTAGACGGCAGATCAAGCCATT--AGGGACTAGTTTGCTAGAGTTACTTGTAAAGGGGCTTTAAAGTACTAATGGAGTAGAGATAAAATGCTAATAT-ACCTTTTTTCGTGAGAAT--ATGATGGCACTGATAAAGGCGAAGGCATCCCCTCATGTGATA--------------------GCTTTGTGTTGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCGAAGCAGAGAATGATGAGTGTCATAGATT-------AATTTAATCTATAAATGAAAGTGCAAGCACTCCACCTTAAGAGTAATGTGGCAACACCGAAATTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATGACCCGCAAAAAACCTTACCA-----TGAATAT----------------------------------TTACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTAAGTTAATGTCGTGAGAATTTGGTTAGCTCCATTAAATTGACGTAAACCCTCGTTTTATTTTTATATAGAACGGTTCA-CCGCTATATTGGATATGATAATAGGGAAGAAGACAAGTCATCATGGCCTGAATGTTATAAGAGAAAATAATGCGGCTTGGGGTTCGTCCCCAAGCCGCCTACGGGTGAGG-CCTCGG----CCCCCGTCTCTCTAACCCTGTGATT-ATC-TACCATT-GTTGCTTTGGCGGGCCTTGATG--CCACGCCAGTCGTGGCTCATGCCAGGTTC---GCC-CGGCGAGTG---CCCGTCGAAAGCCCC-AC-AAAACTCGTTTTATCAAT------GTCGTCCGAGT-CTTGTATCA-ATTAAGTAAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGG-TATCCCGGGGGGCATACCTGTCCGAGCGTCATTA-C-ATCCCTCAAGC-GTAGCTTGGTATTGGG--CCCTCGCTCCCCGCC---AAG-----GGGCGTGCCTGAAAAGTAGTG-GCGGTCCGG--T-GTGAC-CTTGAACGTATTAAAATT----TT-TC----TCGTTCCAAAGGTTCCTC-ACGCCGTGGC----CTGCCAGCAAACCATTTTTTATCAC?????????????? Eschatogonia_prolifera_I AATGGCCTAACGGCTGAACCAGCAATTTGGAAGAATGTATAGCAACAGCTAATTGTAT--AACATTATGCAATATCAACTTAGTTGAATAAAGTTCTAAGTAA-ATTTAGATAATGACTTAATTTACTAATGTGTCTTGACTAAAATACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTATAAGGCTAGTGTTATTCATCTTTATTAGGTTTAAAGGGTACTCAGACGGCAAATAAAGCTGTAATAAGAACTAATTTGCTAGAGTTACTTGTAAAGGGGCCTCAAAGTACTGATGGAGTAGAGATAAAATTCTAGTAT-ACCTTATTTCAATAGAAA-TATTATGGCACTGGTAAAGGCGAAAGCATCCCCTTATGTGATAACTGACGTTAAAGTACGAAGGCTTTGTGTCTCGAATAGGATTAGACACCCTAGTAGTCAAAGCAGAAAATGATGAGTGTCATAGATTGGAA-TAAGTTTAATCTATAAATGAAAATGTAAGCACTCCACCTTAAGAATAATGTGGCAACACTGAAATTGAAATCATTAGACCACTTCTGAG??????????????????????TAATTTGATAATCCGCAAAAAACCTTACCACAACTTGAATATTTATATTTTG------------------ATATATTTACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTAAGTCGATGTCGTGAGATTACGGTTAGATCCGCTAAATTGACGTAAACCCTTATTTTATTTTTATATAAAATAGTTCA-CCTTTATACAGGACATGCTAACAGGGAATAAGGCAAGTCATCATGGCCTGAATGTTGTTTGGGAG-------------GAGCTTCGGGCTCCAG------------GGGG-CTGCGG----CC-CCGCCTTTC-CACCCCGTGATT-ACC-TACCAACGTTTGCTTGGGTGGGGCTTGAGG--TCGTGC----------TCATGCCGGGAGT--GCCC-CGGCGAGTC---CCCGCCAGAAGCCCG-CC-GAAACGCGATTTTTTTATCAGGTTGCTGTCTGGGG-AACTTGTCA-ACCGAGCCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCRATAAG??????????????????TCAGTGAATCATCGAGTTTTTGAACGCACATTGCACCCCTCGG-TATCCCGGGAGGTATGCCTGTCCGAGCGTCATGG-CTGACCCTCAAGCCGTAGCTTGGTATTGGG--CG-TCGCCTTCCCT-CCAGGG-----AGGTGTGCCTGAAAAGTAACG-GCGGTCCGC--C-GGGGCTTTTGGATGCAGTCAATCCTTTATC-CG----CCATCCTGAAAGGCCC---GTTCCACGTCGGACCCGCCGCACCATTCCGTCGACCTCGC---ACGATTGACC Eschatogonia_prolifera_II AATGGCCTACCGGCTGAACCAGCAATTTGGAAGAATGTATAGCAACAGCTAATTGTAT--AACATTATGCAATATCAACTTAGTTGAATAAAGTTCTAAGTAA-ATTTAGATAATGACTTAATTTACTAATGTGTCTTGACTAAAATACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTATAAGGCTAGTGTTATTCATCTTTATTAGGTTTAAAGGGTACTCAGACGGCAAATAAAGCTGTAATAAGAACTAATTTGCTAGAGTTACTTGTAAAGGGGCCTCAAAGTACTGATGGAGTAGAGATAAAATTCTAGTAT-ACCTTATTTCAATAGAAA-TATTATGGCACTGGTAAAGGCGAAAGCATCCCCTTATGTGATAACTGACGTTAAAGTACGAAGGCTTTGTGTCTCGAATAGGATTAGACACCCTAGTAGTCAAAGCAGAAAATGATGAGTGTCATAGATTGGAA-TAAGTTTAATCTATAAATGAAAATGTAAGCACTCCACCTTAAGAATAATGTGGCAACACTGAAATTGAAATCATTAGACCACTTCTGAGATCAGTAGTGAAGTATGTCGTTTAATTTGATAATCCGCAAAAAACCTTACCACAACTTGAATATTTATATTTTG------------------ATATATTTACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTAAGTCGATGTCGTGAGATTACGGTTAGATCCGCTAAATTGACGTAAACCCTTATTTTATTTTTATATAAAATAGTTCA-CCTTTATACAGGACATGCTAACAGGGAATAAGGCAAGTCATCATGGCCTGAATGTTGTTTGGGAG-------------GAGCTTCGGGCTCCAG------------GGGG-CTGCGG----CC-CCGCCTTTC-CACCCCGTGATT-ACC-TACCAACGTTTGCTTGGGCGGGGCTTGAGG--TCGTGC----------TCATGCCGGGAGT--GCCC-CGGCGAGTC---CCCGCCAGAAGCCCG-CC-GAAACGCGATTTTTTTATCAGGTTGCTGTCTGGGG-AACTTGTCA-ACCGAGCCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAG????????????????????????????????TCAGTGAATCATCGAGTTTTTGAACGCACATTGCACCCCTCGG-TATCCCGGGAGGTATGCCTGTCCGAGCGTCATGG-CTGACCCTCAAGCCGTAGCTTGGTATTGGG--CG-TCGCCTCCCCT-CCAGGG-----AGGTGTGCCTGAAAAGTAACG-GCGGTCCGC--C-GGGGCTTTTGGATGCAGTCAATCCTTTATC-CG----CCATCCTGAAAGGCCC---GTTCCACGTCGGACCCGCCGCACCATTCCGTCGACCTCGC---ACGATTGACC Physcidia_wrightii_I AATAGCCTAACGGCTGAACCAGCAATTTGGAAGAATGTATAGCAATAGCTAGTTGCAT--AGTGTTATGTAATATCAACTATGTTGAATAAAGTTCTGAGTAA-ATCTAGATAATGACTTAATTTACTCACGTGTCTTGACTAAAGTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAAGACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATCTTGAGTAGGTTTAAAGGGTACTTAGACGGCAGATCAAGCCATAATAGGGACTAGTTTGCTAGAGTTACACGCAAAGGGGCTTAAAAGTACTAATGGAGTAGAGATAAAATGCTAATAT-ACCTTTTTTCGTAAGAAA-TAAAATGGCACTGGTAAAGGCGAAAGCATCCTCTTATGTGATAACTGACGTTAAAGGACGGAGGCTTTGGGTCGCGAATAGGATTAGATACCCTAGTAGTCAAAGCAGAGAATTATGAGTGTCATAGATTGGAAATAAGTTTAATCTATAAATGAAAGTGCAAGCACTCCACCTTGAGAGTAATGTGGCAACACCGAAATTTAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATAATCCGCAAAAAACCTTACCACAACTTGAATATTTATATTTTA------------------ATATATTTACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTATGTTAATGTCGTGAGAATTTGGCTA-ACCCATTAAATTGACGCAAACCCTCGTTCTACTTTTATGTAAAACGGTTCA-CCACTATGTTGGATAAGATAATAGGGAACAAGACAAGTCATCATGGCCTGAATGTTGT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Physcidia_wrightii_II ???????TAACGGCTGAACCAGCAATTTGGAAGAATGTATAGCAATAGCTAGTTGCAT--AGTGTTATGTAATATCAACTATGTTGAATAAAGTTCTGAGTAA-ATCTAGATAATGACTTAATTTACTCACGTGTCTTGACTAAAGTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAAGACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATCTTGAGTAGGTTTAAAGGGTACTTACACGGCAGATCAAGCCATAATAGGGACTAGTTTGCTAGAGTTACACGCAAAGGGGCTTAAAAGTACTAATGGAGTAGAGATAAAATGCTAATAT-ACCTTTTTTCGTAAGAAA-TAAAATGGCACTGGTAAAGGCGAAAGCATCCTCTTATGTGATAACTGACGTTAAAGGACGGAGGCTTTGGGTCGCGAATAGGATTAGATACCCTAGTAGTCAAAGCAGAGAATTATGAGTGTCATAGATTGGAAATAAGTTTAATCTATAAATGAAAGTGCAAGCACTCCACCTTGAGAGTAATGTGGCAACACCGAAATTTAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATAATCCGCAAAAAACCTTACCACAACTTGAATATTTATATTTTA------------------ATATATTTACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTATGTTAATGTCGTGAGAATTTGGCTA-ACCCATTAAATTGACGCAAACCCTCGTTCTACTTTTATGTAAAACGGTTCA-CCACTATGTTGGATAAGATAATAGGGAACAAGACAAGTCATCATGGCCTGAATGTTGT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Toninia_cinereovirens ??TAGCCTAACGGCTG-ACCAGCAATTTGGATGAACGAACCCTTAACGGGGGTTGCAT--AACGT---GCAACATCAACTTGGTTGAATAAAGTTCTGAGTAA-AGTTAGATAATGACTTAATTTACTCATATGTCTTGACTAAAATACGTGCCAGCAGTCGCGGTAAGACGTATAAGACTAGTGTTATTCATCTTTAGTGGGTTTAAAGGGTACTTAGACGGCAGATCAAGCTAT--TAAGGACTAGTTTGCTAGAGTTACTTGTGAAGGGGCTTAAAAGTACTAATGGAGTAGAGATAAAATGCTAGTAT-ACCTTTTTTCGAGAGAA--TAATATGGCACTGGTAAAGGCGAAAGCATCCCCTTATGTGATA--------------------GCTTTGAGTCGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCGAAGGAGAGAATGATGAGTGTCATAGATT-------AATTTAATCTATAAATGAAAGTGCAAGCACTCCACCTTAAGAGTAATGTGGCAACACCGAAACTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTACTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATGACCCGCAAAACACCTTACCA-----TGAATATT----------------------------------TACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTAAGTTAATGTCGTGAGACTTTGGTTAGATCCATTAAATTGACGTAAACCCTCGTTTTACTTTTATGTAGAACGGTTCA-CCGCTATATTGGATATGATAATAGGGAACAAGACAAGTCATCATGGCCTGAATGTTATCAGAGAG-------------GAGCTCCGTGCTCCAG------------GGGG-TCTCGG----CCCCCGTCTCTC-AACCCCGTGATT-ATC-TACCGTTTGTTGCTTTGGCAGGCCTTGGGG--TCACGC----------TCATGCCGGCTC----GCC-CGGCGAGTG---CCTGCCAGAAGCCCA-TC-GAAACTCGCTGTATTAGT------GATGTCCGAGT-CTTATGTCA-ATGGAA-CAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGG-TATTCCGGGGGGCATGCCTGTCCGAGCGTCATTA-C-ATCCCTCAAGC-ACAGCTTGGTTTTGGG--CG-TCGCTCCCC---GCCAAG-----GGGCGTGCCTGAAAAGTAGTGTGCGGTCCGG--T-GCGGC-TTTGAACGTAGTAAATAC----AC-TC----TCGTTCTGAAAGCCCTCG-CACCCGTGAC----CTGCCAG---AACGCGCCATCTCTTA---C????????? Waynea_californica ???????TAACGGCTGAACCAGCAATTTGAAGGAATGTATAGCAATAGCTAGTTGCAT--ATTATTATGCAATATCGACTATGTTGAATAAAGTTCTGAGTAA-ATCTAGATTATGACTTAGCTTACTCACATGTCTTGACCAAATTGCGTGCCAGCAGTCGCGGTAAGACGTATAAGACTAGTGTTATTCATCTTAAGTGGGTTTAAAGGGTACTTAGACGGCAGATCAAGCTATAGAAAGAACTAGTCTGCTAGAGTTACTTGTGAAGGGGCTTAAAAGTACTAATGGAGTAGAGATAAAATGCTAACAT-ACCTTTTTCCGTAAGGAG-AGTAATGGCACTGGTAAAGGCGAAAGCATCCTCTTATATGATAACTGACGTTGAAGGACGAAGGCTTTGGATCGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCAAAGGAGAGACTGATGAGTGTCATAGATTGGAT-TAAGTTTAATCTATAAATGAAAGTGCAAGCACTCCACCTTAAGAGTAATGTGGCAACACCGAAATTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATGATCCGCAAAACACCTTACCACAACTTGAATATTTATAGTTAG------------------CTATATTTACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTAAGTTAATGTCGTGAGATTTTGGTTAGATCCATTAAATTGACGTAAACCCTCGTTTTACTTTAATGTAGAACGGTTCA-CCGCTATATTGGATATGATAAGAGGGAAGAAGACAAGTCATCATGGCCTGAATGTTGT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? ; END; BEGIN TREES; Title Krogia_mtSSU_ITS_NJ; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE [0] 1 Krogia_coralloides_I, [1] 2 Krogia_coralloides_II, [2] 3 Krogia_antillarum_I, [3] 4 Krogia_antillarum_II, [4] 5 Krogia_antillarum_III, [5] 6 Krogia_antillarum_IV, [6] 7 Krogia_bornensis_I, [7] 8 Krogia_bornensis_II, [8] 9 Krogia_bornensis_III, [9] 10 Krogia_isidiata_I, [10] 11 Krogia_isidiata_II, [11] 12 Krogia_macrophylla_I, [12] 13 Krogia_macrophylla_II, [13] 14 Krogia_macrophylla_III, [14] 15 Krogia_macrophylla_IV, [15] 16 Aciculopsora_salmonea, [16] 17 Bacidia_rosella, [17] 18 Bacidia_rubella, [18] 19 Bacidia_sipmanii, [19] 20 Bacidina_brittoniana, [20] 21 Bacidina_delicata, [21] 22 Bacidina_neosquamulosa, [22] 23 Bacidina_phacodes, [23] 24 Eschatogonia_prolifera_I, [24] 25 Eschatogonia_prolifera_II, [25] 26 Physcidia_wrightii_I, [26] 27 Physcidia_wrightii_II, [27] 28 Toninia_cinereovirens, [28] 29 Waynea_californica; TREE PAUP_1 = ((19:0.067988,(17:0.038733,18:0.020631):0.010664):0.0880815,((24:0.00158,25:0.000873):0.180108,(((1:0.00255,2:0.0):0.068097,(4:0.0,(3:0.003952,(5:0.006181,6:0.006046):0.0):0.011108):0.053811):0.047151,(((21:0.041953,22:0.037844):0.090102,(23:0.072901,28:0.083449):0.012736):0.008088,((26:0.0,(16:0.112158,27:0.000698):0.000986):0.069199,((20:0.037781,29:0.00000235022):0.071659,((7:0.0,(10:0.054559,11:0.019556):0.121507):0.00000146123,(9:0.0000000682131,(8:0.0,(14:0.015565,(15:0.019621,(12:0.0,13:0.001575):0.00762):0.005369):0.023763):0.001548):0.039056):0.048993):0.003836):0.001217):0.006646):0.02061):0.0880815)[% ] [% ] [% setBetweenBits = selected ]; END;