NEXUS
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[Matrix accession#: M4310]

BEGIN TAXA;
	TITLE M4310;
	DIMENSIONS  NTAX=25;
	TAXLABELS
		Macroptilium_psammodes	Lupinus_paraguariensis	Camptosema_paraguariense	Camptosema_praeandinum	Camptosema_rubicundum	Camptosema_scarlatinum	Camptosema_coccineum	Camptosema_coriaceum	Collaea_aschersoniana	Collaea_stenophylla	Collaea_paraguariensis	Collaea_argentina	Collaea_cipoensis	Galactia_benthamiana	Galactia_boavista	Galactia_dubia	Galactia_fiebrigiana	Galactia_latisiliqua	Galactia_lindenii	Galactia_longifolia	Galactia_marginalis	Galactia_martii	Galactia_neesii	Galactia_striata	Galactia_texana
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M4310;
	DIMENSIONS NCHAR=529;
	FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = - ;
	MATRIX
		Macroptilium_psammodes         GTTCTAATTTTTTTCCTATCTCCTCTCTATCTT???????????TAAGTCGTTAT?TTATGTGTTTT????ATTCGATTTATTCTTTCCCAACTAAATTGTAATTTTTATTTTCATCCATTTCCTATCTATCATAATTTTCTTACATAATGACAAGT?????CACTAGTT???????TTGGAATATCTATATAGATAGATATATGTGAAACA???CATATAATTTTTTTGAATGAGAAAGG????TATAAATGAATATATTCTTTTTTAGCAAGGAATTTAAATATGCGTAATTAACGATTAACAATATAAAAGAATTATTCCTACGGAAACT????????????????????CACTTACAAGTACAAACTTTTT?T?TTTTACTT?????AGTTGATATAGATTCATTTACATATATTCCAAAAATGTTTTCAAATCAA???????AGTCTTAAGCTGTAAGAATGGACGGGATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGAGGACTGAACATCTCTCGTGTCCC?CAGTTCAAAT
		Lupinus_paraguariensis         ?GGTTCACTCTCTAATTATTTCTCCTAAATTAAATATC???TTTTTTTTTATTCG?TTATGTGTCTTATTCATTCAGTCCATTCTTTTACAAATGGATTTGAGTGGAATTTTTCTTTTTTTTATCAC???????????????????????????AATCACAACACAAGTC???????TTTGAATAT???????GTTTAATATATATTAAACANNCCATTTTTTTATATTATATGATAAACAAACCTACAAACGAACATCTTATCCTTGAGCAATGAGCAAGCAAGCCTCATATTAATGATTAACAATACATAATGATTAGGACTACTGAAAAAAAAAAAAAAATTAAATTTAAAAATACAAAAGTA????????T?T?TTTTATTT?????AGTTGACATAGATTCATTGACATATATTCAAGTANTCTCTT?????????AAAATGGAGATGCTGCGCCAAGAATGGT????????????????????????????????????????????????????????????
		Camptosema_paraguariense       TGTTTAATTCTATAATTATTTATCCTCTATCTTCTTT????TATTTATTTATTAT?TTATGTGTTTT????ACTCAGTTTATTCTTTCACAAACAGATTCGAGTGGAATTTT??T?TTTCTTATCAT???????????????????????????AAT?????CACAAGTC???????TTGGAATAT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ATGGTTAACAATACAAAATCATTATTACTACTGAAACT????????????????????AACTTCCAAGGTC????????????TTTTTTTT?????ACTTGATATAGACTCATTGACATATACTCCAGTAATCTCTTAAAATAAAAAAAATGAGGCTGATGTGTCAAGAATGGTCGGGATAGCTCAGCTGGTAGAGCAGAGGACTGAAAATC?CTCGTGTCAC?CAGTTCAAAT
		Camptosema_praeandinum         TGTTTAATTCTATAATTATTTATCCTCTATCTTCTTT????TATTTATTATTTATATGATGTGTTTT????ACTCAGTTTATTCTTTCACAAACAGATTCGAGTGGAATTTT??T?TTTCTTATCAT???????????????????????????AAT?????CACAAGTC???????TTGGAATAT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ATGGTTAACAATACAAAATCATTATTACTACTGAAACT????????????????????AACTTCCAAGGTC????????????TTTTTTTTTT???ACTTGATATAGACTCATTGACATATACTCCAGTAATCTCTTAAAATAAAAAAAATGAGGCTGATGTGTCAAGAATGGTCGGGATAGCTCAGCTGGTARAGCARAGGACTGAAAATC?CTCGTGTCACCCAGTTCAAAT
		Camptosema_rubicundum          TGTTTAATTCTATAATTATTTATCCTCTATCTTCTTT????TATTTATTATTT?????ATGTGTTTT????ACTCAGTTTATTCTTTCACAAACAGATTCGAGTGGAATTTT??T?TTTCTTATCAT???????????????????????????AAT?????CACAAGTC???????TTGGAATAT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ATGGTTAACAATACAAAATCATTATTACTACTGAAACT????????????????????AACTTCCAAGGTC????????????TTTTTTTTTTTTTACTTGATATAGACTCATTGACATATACTCCAGTAATCTCTTAAAATAAAAAAAATGAGGCTGATGTGTCAAGAATGGTCGGGATAGCTCAGCTGGTAGAGCAGAGGACTGAAAATC?CTCGTGTCAC?CAGTTCAAAT
		Camptosema_scarlatinum         TGTTTAATTCTATAATTATTTATCCTCTATCTTCTTT????TATTTATTATTTATGTGATGTGTTTT????ACTCAGTTTATTCTTTCACAAACAGATTCGAGTGGAATTTT??TTTTTCTTATCAT???????????????????????????AAT?????CACAAGTC???????TTGGAATAT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ATGGTTAACAATACAAAATCATTATTACTACTGAAACT????????????????????AACTTCCAAGGTC??????????T?TTTTTTTTTT???ACTTGATATAGACTCATTGACATATACTCCAGTAATCTCTTAAAATAAAAAAAATGAGGCTGATGTGTCAAGAATGGTCGGGATAGCTCAGCTGGTAGAGCAGAGGACTGAAAATC?CTCGTGTCAC?CAGTTCAAAT
		Camptosema_coccineum           TATTTAATTCTATAATTATTTATCCTCTATCTTCTTTTATTTATTTATTAATTAT?TTATGTGTTTT????ACTCAGTTTATTCTTTCACAAACAGATTCGAGTGGAATTCT??T?TTTCTTATCAT???????????????????????????AAT?????CACAAGTCACAAGTCTTGGAATAT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ATGGTTAACAATACAAAATCATTATTACTACTGAAACT????????????????????AACTTCCAAGGTC????????T?T?TTTTTTTT?????ACTTGATATAGACTCATTGACATATACTCCAGTAATCTCTTAAAATAAAAAAAATGAGGCTGATGTGTCAAGAATGGTCGGGATAGCTCAGCTGGTAGAGCAGAGGACTGAAAATC?CTCGTGTCAC?CAGTTCAAAT
		Camptosema_coriaceum           TATTTAATTCTATAATTATTTATCCTCTATCTTCTTTTATTTATTTATTAATTAT?TTATGTGTTTT????ACTCAGTTTATTCTTTCACAAACAGATTCGAGTGGAATTCT??T?TTTCTTATCAT???????????????????????????AAT?????CACAAGTCACAAGTCTTGGAATAT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ATGGTTAACAATACAAAATCATTATTACTACTGAAACT????????????????????AACTTCCAAGGTC????????T?T?TTTTTTTT?????ACTTGATATAGACTCATTGACATATACTCCAGTAATCTCTTAAAATAAAAAAAATGAGGCTGATGTGTCAAGAATGGTCGGGATAGCTCAGCTGGTAGAGCAGAGGACTGAAAATC?CTCGTGTCAC?CAGTTCAAAT
		Collaea_aschersoniana          TGTTTAATTCTATAATTATTTATCCTCTATCTTCTTT????TATTTATTATTTATGTGATGTGTTTT????ACTCAGTTTATTCTTTCACAAACAGATTCGAGTGGAATTTT??T?TTTCTTATCAT???????????????????????????AAT?????CACAAGTC???????TTGGAATAT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ATGGTTAACAATACAAAATCATTATTACTACTGAAACT????????????????????AACTTCCAAGGTC????????????TTTTTTTTTT???ACTTGATATAGACTCATTGACATATACTCCAGTAATCTCTTAAAATCAAAAAAATGAGGCTGATGTGTCAAGAATGGTCGGGATAGCTCAGCTGGTAGAGCAGAGGACTGAAAATC?CTCGTGTCAC?CAGTTCAAAT
		Collaea_stenophylla            TGTTT?ATTCTATAATTATTTATCCTCTATCTTCTTT????TATTTATTCTTTATGTGATGTGTTTT????ACTCAGTTTATTCTTTCACAAACAGATTCGAGTGGAATTTT??T?TTTCTTATCAT???????????????????????????AAT?????CACAAGTC???????TTGGAATAT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ATGGTTAACAATACAAAATCATTATTACTACTGAAACT????????????????????AACTTCCAAGGTC????????????TTTTTTTTTT???ACTTGATATAGACTCATTGACATATACTCCAGTAATCTCTTAAAATCAAAAAAATGAGGCTGATGTGTCAARAATGGTCGGGATAGCTCAGCTGGTARAGCAGAGGACTGAAAATC?CTCGTGTCAC?CAGTTCAAAT
		Collaea_paraguariensis         TGTTTAATTCTATAATTATTTATCCTCTATCTTCTTT????TATTTATTATTTATGTGATGTGTTTT????ACTCAGTTTATTCTTTCACAAACAGATTCGAGTGGAATTTT??T?TTTCTTATCAT???????????????????????????AAT?????CACAAGTC???????TTGGAATAT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ATGGTTAATAATACRAAATCATTATTACTACTGAAAKT????????????????????AACTTCCAAGGTC????????????TTTTTTTTTT???ACTTGATATAGACTCATTGACATATACTCCAGTAATCTCTTAAAATCAAAAAAATGAGGCTGATGTGTCAAGAATGGTCGGGATAGCTCAGCTGGTAGAGCAGAGGACTGAAAATC?CTCGTGTCAC?CAGTTCAAAT
		Collaea_argentina              TGTTTAATTCTATAATTATTTATCCTCTATCTTCTTT????TATTTATTATTTATGTGATGTGTTTT????ACTCAGTTTATTCTTTCACAAACAGATTCGAGTGGAATTTT??T?TTTCTTATCAT???????????????????????????AAT?????CACAAGTC???????TTGGAATAT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ATGGTTKACAATACAAAATCATTATTACTACTGAAACT????????????????????AACTTCCAAGGTC????????T?T?TTTTTTTT?????ACTTGATATAGACTCATTGACATATACTCCAGTAATCTCTTAAAATCAAAAAAATGAGGCTGATGTGTCAAGAATGGTCGGGATAGATCAGCTGGTAGAACAGAGGACTGAAAATC?CTCGTGTCAC?CAGTTCAAAT
		Collaea_cipoensis              TGTTTAATTCTATAATTATTTATCCTCTATCTTCTTT????TATTTATTATTTATGTGATGTGTTTT????ACTCAGTTTATTCTTTCACAAACAGATTCGAGTGGAATTTT??T?TTTCTTATCAT???????????????????????????AAT?????CACAAGTC???????TTGGAATAT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ATGGTTAACAATACAAAATCATTATTACTACTGAAACT????????????????????AACTTCCAAGGTC????????T?T?TTTTTTTT?????ACTTGATATAGACTCATTGACATATACTCCAGTAATCTTTTAAAATAAAAAAAATGAGGCTGATGTGTCAAGAATGGTCGGGATAGCTCAGCTGGTAGAGCAGAGGACTGAAAATC?CTCGTGTCAC?CAGTTCAAAT
		Galactia_benthamiana           TGTTTAATTCTATAATTATTTATCCTCTATCTTCTTT????TATTTATTATTTATGTGATGTGTTTT????ACTCAGTTTATTCTTTCACAAACAGATTCGAGTGGAATTTT??T?TTTCTTATCAT???????????????????????????AAT?????CACAAGTC???????TTGGAATAT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AGGGTTAACAATACAAAATCATTATTACTACTGAAACT????????????????????AACTTCCAAGGTC????????T?T?TTTTTTTTTT???ACTTGATATAGACTCATTGACATATACTCCAGTAATCTCTTAAAATAAAAAAAATGAGGCTGATGTGTCAAGAATGGTCGGGATAGCTCAGCTGGTAGAGCAGAGGACTGAAAATC?CTCGTGTCAC?CAGTTCAAAT
		Galactia_boavista              TGTTTAATTCTATAATTATTTATCCTCTATCTTCTTT????TATTTATTATTTATATGATGTGTTTT????ACTCAGTTTATTCTTTCACAAACAGATTCGAGTGGAATTTT????TTTCTTATCAT???????????????????????????AAT?????CACAAGTC???????TTGGAATAT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ATGGTTAACAATACAAAATCATTATTACTACTGAAACT????????????????????AACTTCCAAGGTC????????T?T?TTTTTTTT?????ACTTGATATAGACTCATTGACATATACTCCAGTAATCTCTTAAAATAAAAAAAATGAGGCTGATGTGTCAAGAATGGTCGGGATAGCTCAGCTGGTAGAGCAGAGGACTGAAAATC?CTCGTGTCAC?CAGTTCAAAT
		Galactia_dubia                 TGTTTAATTCTATAATTATTTATCCTCTATCTTCTTT????TATTTATTATTTATGTGTTGTGTTTT????ACTCAGTTTATTCTTTCACAAACAGATTCGAGTGGAATTTT??T?TTTCTTATCAT???????????????????????????AAT?????CACAAGTC???????TTGGAATAT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AGGGTTAACAATACAAAATCATTATTACTACTGAAACT????????????????????AACTTCCAAGGTC??????????TTTTTTTTTTTT???ACTTGATATAGACTCATTGACATATACTCCAGTAATCTCTTAAAATAAAAAAAATGAGGCTGATGTGTCAAGAATGGTCGGGATAGCTCAGCTGGTAGAGCAGAGGACTGAAAATC?CTCGTGTCAC?CAGTTCAAAT
		Galactia_fiebrigiana           TGTTTAATTCTATAATTATTTATCCTCTATCTTCTTT????TATTTATTATTTATGTGATGTGTTTT????ACTCAGTTTATTCTTTCACAAACAGATTCGAGTGGAATTTT??T?TTTCTTATCAT???????????????????????????AAT?????CACAAGTC???????TTGGAATAT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AGGGTTAACAATACAAAATCATTATTACTACTGAAACT????????????????????AACTTCCAAGGTC????????T?T?TTTTTTTTTT???ACTTGATATAGACTCATTGACATATACTCCAGTAATCTCTTAAAATAAAAAAAATGAGGCTGATGTGTCAAGAATGGTCGGGATAGCTCAGCTGGTAGAGCAGAGGACTGAAAATC?CTCGTGTCAC?CAGTTCAAAT
		Galactia_latisiliqua           TGTTTAATTCTATAATTATTTATCCTCTATCTTCTTT????TATTTATTATTTATGTGATGTGTTTT????ACTCAGTTTATTCTTTCACAAACAGATTCGAGTGGAATTTT??T?TTTCTTATCAT???????????????????????????AAT?????CACAAGTC???????TTGGAATAT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGGGTTAACAATACAAAATCATTATTACTACTGAAACT????????????????????AACTTCCAAGGTC????????T?T?TTTTTTTTTT???ACTTGATATAGACTCATTGACATATACTCCAGTAATCTCTTAAAATAAAAAAAATGAGGCTGATGTGTCAAGAATGGTCGGGATAGCTCAGCTGGTAGAACAGAGGACTGAAAATC?CTCGTGTCAC?CAGTTCAAAT
		Galactia_lindenii              TGTTTAATTCTATAATTATTTATCCTCTATCTTCTTT????TATTTATTATTTATGTGATGTGTTTT????ACTCAGTTTATTCTTTCACAAACAGATTCGAGTGGAATTCT??T?TTTCTTATCAT???????????????????????????AAT?????CACAAGTC???????TTGGAATAT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AGGGTTAACAATACAAAATCATTATTACTACTGAAACT????????????????????AACTTCCAAGGTC????????TTT?TTTTTTTT?????ACTTGATATAGACTCATTGACATATACTCCAGTAATCTCTTAAAATAAAAAAAATGAGGCTGATGTGTCAACAATGGTCGGGATAGCTCAGCTGGTAGAGCAGAGGACTGAAAATC?CTCGTGTCAC?CAGTTCAAAT
		Galactia_longifolia            TGTTTAATTCTATAATTATTTATCCTCTATCTTCTTT????TATTTATTATTTATGTGATGTGTTTT????ACTCAGTTTATTCTTTCACAAACAGATTCGAGTGGAATTTT??T?TTTCTTATCAT???????????????????????????AAT?????CACAAGTC???????TTGGAATAT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AGGGTTAACAATACAAAATCATTATTACTACTGAAACT????????????????????AACTTCCAAGGTC??????????T?TTTTTTTTTT???ACTTGATATCT?CTCATTGACATATACTCCAGTAATCTCTTAAAATAAAAAAAATGAGGCTGATGTGTCAAGAATGGTCGGGATAGCTCAGCTGGTAGAGCAGAGGACTGAAAATC?CTCGTGTCAC?CAGTTCAAAT
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		Galactia_texana                TGTTTAATTCTATAATTATTTATSCTCTATCTTCTTT????TATTTATTATTTATGTGATGTGTTTT????ACTCAGTTTATTCTTTCACAAACAGATTCGAGTGGAATTTT??T?TTTCTTATCAT???????????????????????????AAT?????CACAAGTC???????TTGGAATAT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AGGGTTAACAATACAAAATCATTATTACTACTGAAACT????????????????????AACTTCCAAGGTC????????T?T?TTTTTTTTT????ACTTGATATAGACTCATTGACATATACTCCAGTAATCTCTTAAAATTAAAAAAATGAGGCTGATGTGTCAAGAATGGTCGGGATAGCTCAGCTGGTAGAGCAGAGGACTGAAAATC?CTCGTGTCAC?CAGTTCAAAT
	;
END;

BEGIN CODONS;
CODONPOSSET * CodonPositions = 
 N: 1 - 529 ; 
 CODESET * UNTITLED = Universal: all ; 
 END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
 END;