NEXUS
[File created by TreeBASE:  1/16/09  15:40:48]
[Matrix accession#: M4316]

BEGIN TAXA;
	TITLE M4316;
	DIMENSIONS  NTAX=15;
	TAXLABELS
		Atropa_belladonna	Nolana_werdermannii	Nolana_coelestis	Lycium_americanum	Lycium_cestroides	Lycium_chanar	Lycium_chilense	Lycium_cinereum	Lycium_ferocissimum	Lycium_hirsutum	Lycium_nodosum	Lycium_parishii	Lycium_shockleyi	Lycium_villosum	Phrodus_microphyllus
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M4316;
	DIMENSIONS NCHAR=8417;
	FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = - ;
	MATRIX
		Atropa_belladonna          GAACGTAATGCTCATAACTTCCCTCTAGACCTAGCTGCTATCGAAGCTCCATCTACAAATGGATAAGATCCCAGTCTAGTCTATAGGAGGTTTTGAAAAGAAAGGAGCAATAATCATTTTCTTGTTCTATCAAGAGGGTGCTATTGCTCCTTTCTTTTTTTCTTTTTATATTATAAATTTACTAGTATTTTACTTACATAGACTTTTT-GTTTACATTATAGAAAAAGAAGGAGAGGGTATTTTCCTGCATTTATTCATGATTGAGTATTCTATTTTGATTTTGTATTTATTTAAAATTGTAGAAATATAACTTGTTCCTTTTGTTGCTAATGTTACT-----------ATTTCATTTCAAAAAAAAAATATATATAATTTTGACTTCATATTCTTATCTTT-----------------GAAATAAGAAATAAGATAAATA-TTTCGAACTTTAATCTTTTGTTTTCTAATTTAAATAATGTAAAAATGGAATGTAAGTAGGCGAGGGGGCGGATGTAGCCACTCATAATAGCCTATGAATAAGCAATCGTCGAGATTGAGTAAGCTATTTTAGTTTAGTAATGATTCAAATGGATCACTAACAATAAAAAGTTGTTCAAATAGGAATTTGAAGTTGAAGGTTCATTATTTTAGATTTGAGTTTAGAGTCTTAG-TTTTTTTTATTTAACCTGGGGCTTTCCTATATTTTATGCTTTCCTCGAATTGAACTCTTGTAAATAAACCGTTCTATACTCAATTAAGG-----AATAGAGTTCAAAAAGTTTTTGTTTTCATTGTTTAATCAGCTATTTCC------TTTTTATTTTATAAATCTAAAACAAAAAATGGATTTTAAAGACCAAATAGAAAGAAAAAAAACCTATTTTGCATTACTCAAAATTGACAATTAGTCATACAGAATTTCATTAAGCAATTTTATCTATTGGGTTAAGGGCAAGATATACATGGGGGTCTATATAATAATTCAGAGAAAATAAAAAGGTTTCAAAATAGAATCAATTAGTTTCAATGAGTTCTTAACTTTCACTAAAGATTTTTATATATGTTCTTCTATAGATATGGAAATATAATGTAAATATATAA---------TTTTTTTTAATTGAATTCTGCAAATAGGTCGATGGGGAAAATAAAACTCCCCACCTTGGAATAGAAATTATCTTTATTTTTTTGTCAAC-AAAAAAGTTATTATTCAGT-------AAATAGAGGATTTCCTAATTCAATTATTTTATATATCAATCAGAAAAGCGAAGAGAGTTCTATTACGTATTGATTGGTGAGCTAATCAATATC-------AAATATGAAAGGGAAATCGTTAAATTATGCAATTATTATCTAA----------------------------TTGAATAATTTTTTCAAGTTGATTCAAATTGTTCTAACGTTTTATTACTTATTTATTTTTGTTTGGCGTACAAAAAAACTTTTTGAATTCCCGGTAGAAAGAGATTTCGCTAATGAAAAAGCCTTTAATGCTACCCAATATCCCTTCCTTTTCCAAATAGATGTCGAAGTGCGTTTTTTTGGAACTGCCATTTAGAAATTAAAAAATTACTCATTGTTATAGCTGGATGTGAAAGACATCTATTGTTCAAAACGAATTCTTTTTACTACTATTTATTTTCGAGCTAATAGTGTCCTCCTCAAATAAAACATTATCGAGATAGGCAAAAGATATGTGAAAATTGCATAATACTGGAAATA----TGGAAATAAAAAAAGAAGTCCAATATGTGTG-TTTTTTTTTTCAAGTTTTTCTATTCCATAAAACATTCAGAATCGTAAAAAAGAAAAGGTTCTCTATTGACTGGTATCTTTATTTCACAATTTCACA-----TTCTTTTTGATTCAAAAAATCTATACCTATAGAATTTGCTAATCGGCTGTTCTGTAGAAATGACGAAATAAAATTAGTTGAACTT-------------------------------AAAAATACTCGATTTCTATTTATGGTTCCACATTTCATTTACATGCAATAAAATACCTCGAGAGGTTTAAAGATACGAACCTCATTTTTACTTCAGGAAATGAAAAACTTGAATCCCC-------GTTCGATTCACTGCTCAAACTTGGATAAAAAATAGGCCTATTTCAAAGGAGACTAGTAATTAATCCCTTTCATATCATTTGACCAATTGTAACTTCTTGATTTCAATAGTTGAAGTATTTAGCAAAGACTC--------AGAATAAGTAAGAATAGAAAATTAGATTTAAGTTTTAAATTAGTTTAAGTTAGTCCATATTTTGACTTTTTATTGACTACTTTCAAAAGAGGTAAGATCCGGTGAATCGGAAACAATTAATTAAGAATTAAAAACTTACTAAGTGATCACTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAACAAAAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTTCTGAAAACAAACAAAGGTTCAGAAAAAAA-GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTATTCTAACAAATGGAGTGAAATGCGTTGGTAGAGGAATCTTTACATCGAAACTTCAGAAAGAAAAAGAATGAAGTGAAGGATAAACATATATACATACGTATTGAATACTATATCAAATGATTAATGACGACCCGAATCCGTATTTTTT-CTATAAAAAATAGAAGAATTGGTGTGAATCGATTCTACATTGAAGAAAGAATCGAATATTCATTGATCAAATCATTCACTCCATA-----GTCTGATAGATCTTTTGAAAAACTGATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCGTTCTACATGTCAATACCGGCAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAAAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCCAAAAAGACTATTTCACTCCCCAACTATTTATCCGACCCCCTTTCCTTAGCGATTCCAAACTCCTTATCTTTCTCATTCACTCTATTCTTTTATAAATGGATTTGAGCGTAAATGGCTTTCTCTTATCACAAGTCTTGTGATATATATGATACCCATAGAAATGAACATCTTTGAGCAAGGAATCTCTAGTTGAATGATTCCCGATCAATACAATATCATTACTCATACTGAAACTTACAAAGTCATCTTTTTGAAGATCGAAGAAATTCCCCGGCTTTGATAAAATTTTTTAATCTACTTTTGTCCTTTTAATTGACATAGACCCCAGTTCTCTAATAAAATGAGGATACTCCATTGGGAATAGCCGGGATAGCTCAGATGCTCTAACCTCTGAGCTAAGCGGGCCCACATAACAGAAATCTTATATGCATAGTAATTGACTAAACTACTGGAATTGGAATCTTAGTTATTAACTATTCAATATTATATTGAATATTCTAGAACATAAGGATTAATATAGCGATATAGAATTTCGATTTATCACAA------------TTCTAATACTAATATTATTAAATAGTGATTGGAAATATTGGTAATATTCTTTTATTTTCATTTTCAATTTGAATGGGAAATATTCTTTTTCATTTCTTTTTTTGGCATTTGAAATAGTTTTTATTATAGTTCTATATTTGATTCTATATCATATATATCTCTCATTCTATATTTATATTTATTTCAAATTCTAATTGTTTAATGGAATAGTTAGTTATAACTAATGAGACATTCCTCCGCTTTCAGGAGAAAGTGAAGATAAAAAACAAGAATCGATCGTTCAAGTATTCCAAATTGAATGGCAAAATGACAGGAAGAGAGACATATGGATGGGGTATATATCCATCTATATTGAATTGCGGATTCCGAAATGATAAAATCATTTTTGATTGGACAAAAAAAGGTCTCCTATAGAAG-----TAAGAAAATCAAAGAGGAGAAAACACGTTTTCGAGATAGGAATCGGTATCTAATGAATTCAATGGTTCCAATATAAATGAAAGAAAAAGAATAAGGAATGACATCACAACGAGATCCTAATCTCAAAACAAAAAGAAAGGGGGATATGGCGATTCTTTTTTATCTCCGGATCGGGTATTTCTGAAGTACAAAGGGGGTTATATCATCTCATGGCGGA--------TTGGCGAATTATTGGGCCGAGCTGGATTTGAACCAGCGTAGACATATTGCCAACGAATTTACAGTCCGTCCCCATTAACCACTCGGGCATCGACCCAGGAAGAATCAATTTTAGACTTATTGGTAATCCATGATCAACTTCCTTTCGTAATACCCTACCCCCAGGGGAATTCGAATCCCCGCTGCCTCCTTGAAAGAGAGATGTCCTAAACCACTAGACGATGGGGGCCCGCTTGACCAACGGCCATCATACTATGATCATAGTATGATCAGTTTTTTGAAATTGTCAATATAATCGAA---------CGATTCTAT-CCGAGGGATCTTTCCCCCTT-TCAGAATTGCATAGAATTTTTTTTTATTCGTCATTGAGGAATTATTCATTAGAATCGCTATTAGAAATCTAGTCGTAGTATTTTTTTATTTTTGAATTATTTCAATTGAATTTATTTCTATTATTTTAGTTTAGATTATTTAGTATTTCGAATTTTATTTAGAATTTACTTTTTTTATTTAGAAATTTCTAAATAAAAAAA-GTAATAAATACAAAAAATAGAAATAATAAGGAAGAGTAGGATTTTTTCAGGGAATGATTGGTCCGTCAGAAAAGGAAAAAGGTGTGAAATTCTATTTTTTTTAACTTTCATTTGATTCATTGTTAAAACGAGATATCCTTATCTCCCTCCCACCAAGACAGGAACTTAACAAACGAGAAATCTAGTAAGCGGGATCAAGCGGAAAATTCTTTTTTCTCCAAGAATTTAGTTCAGGAGACAAGTAGAATCTCTTCATTCCATGATTCGATGAAATATCTTGAATTTTATGTTGAATTGCTAGGTGTATGTAC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		Nolana_werdermannii        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		Nolana_coelestis           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		Lycium_cestroides          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		Lycium_chilense            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		Lycium_cinereum            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		Lycium_ferocissimum        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		Lycium_nodosum             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		Phrodus_microphyllus       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BEGIN CODONS;
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BEGIN ASSUMPTIONS;
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 OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
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