#NEXUS [written Wed Feb 03 17:19:34 SGT 2021 by Mesquite version 3.61 (build 927) at NoPsechrids.local/10.0.1.2] BEGIN TAXA; TITLE COI; DIMENSIONS NTAX=32; TAXLABELS Ovatisporangium_sp._5_MAFF_241149 Ovatisporangium_sp._5_STE_U_7848 Ovatisporangium_sp._5_STE_U_7847 Ovatisporangium_sp._5_STE_U_7846 Ovatisporangium_sp._5_STE_U_7845 Ovatisporangium_sp._5_STE_U_7844 Ovatisporangium_sp._5_STE_U_7843 'Phytopythium helicoides CBS_28631' 'Phytopythium chamaehyphon CBS_25930' 'Phytopythium nanjingense Chen_218' 'Phytopythium fagopyri CBS_293.35' 'Phytopythium aichiense CBS_137195' 'Phytopythium delawarense CBS_123040' 'Phytopythium citrinum CBS_119171' 'Phytopythium litorale CBS_118360' 'Phytopythium carbonicum CBS_112544' 'Phytopythium montanum CBS_111349' 'Phytopythium mercuriale CBS_122443' 'Phytopythium megacarpum CBS_112351' 'Phytopythium boreale CBS_55188' 'Phytopythium oedochilum CBS_29237' 'Phytopythium ostracodes CBS_76873' Phytopythium_iriomotense_GUCC7020 'Phytopythium mirpurense 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AATCATAAAGATATCGGTACCTTATATTTAATTTTCGGTGCTTTTTCAGGTATAGTTGCAACTACTATGTCTGTTTTAATTAGAATAGAATTATCACAACCCGGTAATCAAATCTTTATGGGAAATCATCAATTATATAATGTTATGGTTACAGCACACGGATTATTAATGTTATTTTTTGTTGTTATGCCTATATTAGTTGGTGGTTTTGGTAACTGGTTTGTACCTTTAATGTTAGGTGCTCCTGATATGGCTTTTCCACGTTTAAATAATATTAGTTTTTGGTTATTACCTCCATCATTATTATTATTAGTATCTTCTGCTTTAGTAGAATCAGGTGCGGGTACAGGTTGGACTGCTTATCCACCTTTATCAAGTGTTGCAGCACATTCAGGACCTTCTGTAGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATTTATCAGGTATTTCTTCTTTATTAGGTGCAATTAATTTTATTGCAACTATTTTTAATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTATGCATAGAATGCCTTTATTCGTTTGGTCAATATTAATTACAGCTTTTCTTTTAGTATTAACTTTACCTGTATTTTCTGGTGCTATTACAATGTTATTAACTGATAGAAATTTTAATACT----------------------------------------------------- 'Phytopythium palingenes CCIBt_3981' -------------------------------------------------------------------TGTCTGTTTTAATTAGAATAGAATTATCACAACCAGGTAATCAAATCTTTATGGGAAATCATCAATTATATAATGTTATGGTTACAGCACATGGTTTATTAATGTTATTCTTTGTTGTTATGCCTATATTAGTGGGTGGTTTTGGTAACTGGTTTGTTCCTTTAATGTTAGGTGCTCCAGATATGGCTTTCCCACGTTTAAATAATATTAGTTTTTGGTTATTACCTCCATCATTATTATTATTAGTATCTTCTGCTTTAGTAGAATCAGGTGCTGGTACAGGTTGGACTGCTTATCCACCTTTATCTAGTGTAGCTGCACATTCAGGACCTTCTGTAGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATTTATCAGGTATTTCATCATTATTAGGTGCTATTAATTTTATTGCAACTATTTTTAATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTATGCATAGAATGCCTTTATTTGTTTGGTCTATTTTAATTACAGCTTTTCTTTTAGTATTAACTTTACCTGTTTTTTCAGGTGCTATTACTATGTTATTAACCGATAGAAATTTTAACACATCTTTTTATGATCCTGCAGGTGGTGGTGATCCAGTATTATTCCAACATTTA-- 'Phytopythium leanoi USTCMS_4102' AATCATAAAGATATTGGTACTTTATATTTAATTTTTGGTGCTTTTTCAGCTGTAGTTGCAACAACTATGTCTGTATTAATTAGAATAGAATTATCTCAACCTGGTAATCAAATTTTTATGGGAAATCATCAGTTATATAATGTTATGGTTACAGCACACGGATTATTAATGTTATTCTTTGTTGTTATGCCTATATTAGTAGGTGGTTTTGGTAATTGGTTTGTTCCTTTAATGTTAGGAGCACCTGATATGGCTTTTCCACGTTTAAATAATATTAGTTTTTGGTTATTACCACCATCATTATTATTATTAGTATCTTCTGCTCTTGTAGAGTCAGGTGCTGGTACAGGTTGGACAGCTTATCCACCATTATCAAGTGTAGCTGCACACTCTGGACCTTCTGTAGATTTAGCTATATTTAGTTTACATTTATCAGGTATTTCATCTTTATTAGGTGCTATAAATTTTGTTGCAACTATTTTTAATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTATGCATAGAATGCCTTTATTTGTTTGGTCTATATTAATTACCGCTTTCCTTTTAATAATAACATTACCTGTATTTTCAGGAGCAATTACTATGTTATTAACCGATAGAAATTTTAATACTT---------------------------------------------------- 'Phytopythium kandeliae NBRC_32620' AATCATAAAGATATTGGTACTTTATATTTAATTTTTGGTGCTTTTTCAGCTGTAGTTGCTACAACTATGTCTGTAATAATTAGAATAGAATTATCACAACCAGGTAATCAAATTTTTATGGGAAACCACCAATTATATAATGTTATGGTTACAGCACATGGATTATTAATGTTATTCTTTGTTGTTATGCCTATATTAGTAGGTGGTTTTGGTAATTGGTTTGTTCCTTTAATGTTAGGTGCACCTGATATGGCTTTTCCACGTTTAAATAATATTAGTTTTTGGTTATTACCACCATCATTATTATTATTAGTGTCTTCTGCTCTTGTAGAATCTGGTGCTGGTACAGGTTGGACAGCTTATCCACCATTATCTAGTGTAGCTGCACACTCAGGACCTTCTGTAGATTTAGCTATATTTAGTTTACATTTATCAGGTATTTCATCTTTATTAGGTGCTATAAATTTTGTTGCAACTATTTTTAATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTATGCATAGAATGCCTTTATTTGTTTGGTCTATATTAATTACTGCTTTTCTTTTAATAATAACATTACCTGTATTTTCAGGAGCAATTACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTTAATACTT---------------------------------------------------- 'Pythium cucurbitacearum CBS_74896' AATCATAAAGATATTGGTACTTTATATTTAATTTTTGGTGCTTTTTCAGCAATAGTTGCAACTGTAATGTCTGTATTAATTAGAATTGAATTAGCACAACCAGGTAATCAAATTTTTATGGGAAACCATCAAGTATATAATGTTATGATTACAGCACACGGTTTATTAATGATATTTTTTGTGGTTATGCCTATATTAGTTGGTGGTTTTGGTAACTGGTTTGTACCTATAATGGTAGGAGCACCTGATATGGCTTTTCCTCGTTTAAATAATATTAGTTTTTGGTTATTACCACCATCTTTATTACTATTAGTATCTTCTGCTTTAGTTGAATCAGGTGCAGGTACCGGTTGGACAGCTTACCCACCATTATCAAGTGTAGCTGCACATTCAGGACCTTCAATAGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATTTATCAGGTATTTCTTCATTATTAGGTGCAATTAATTTTATTGTTACTATTTTTAATATGAGAGCTCCTGGATTAAGTATGCATAGAATGCCTTTATTTGTATGGTCTCTTTTAATTACAGCTTTTCTTTTAGTTATAACTTTACCAGTATTTTCAGGTTCAATAACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTTAATACTTCTTTTTATGACCCAGCAGGAGGAGGAGATCCAGTATTATTCCAACATTTA-T 'Phytopythium vexans CBS_11980' AATCATAAAGATATTGGTACTTTATATTTAATTTTTGGTGCTTTTTCAGCAATAGTTGCAACTGTAATGTCTGTATTAATTAGAATTGAATTAGCACAACCAGGTAATCAAATTTTTATGGGAAACCATCAAGTATATAATGTTATGATTACAGCACATGGTTTATTAATGATATTTTTTGTGGTTATGCCTATATTAGTTGGTGGTTTTGGTAACTGGTTTGTACCTATAATGGTAGGAGCACCTGATATGGCTTTTCCTCGTTTAAATAATATTAGTTTTTGGTTATTACCACCATCTTTATTACTATTAGTATCATCTGCTTTAGTTGAATCAGGTGCAGGTACTGGTTGGACAGCTTATCCACCATTATCAAGTGTAGCTGCACACTCAGGACCTTCAATAGATTTAGCTATTTTTAGTTTACACTTATCAGGTATTTCTTCATTATTAGGCGCAATTAATTTTATTGTTACTATTTTTAATATGAGAGCTCCTGGATTAAGTATGCATAGAATGCCTTTATTTGTATGGTCTCTTTTAATTACAGCTTTTCTTTTAGTTATAACTTTACCAGTATTTTCAGGTTCAATAACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTTAATACTTCTTTTTATGACCCAGCTGGAGGAGGAGATCCAGTATTATTCCAACATTTATT 'Phytophthora batemanensis CBS_679.84' AATCATAAAGATATTGGTACTTTATATTTAATTTTTAGTGCATTTGCTGGTATGGTTGGTACAACTTTATCTGTTTTAATTAGAATGGAATTGGCACAACCAGGTAATCAAATTTTTATGGGAAATCATCAATTATATAATGTAATTGTAACTGCACATGCTTTTGTTATGGTATTCTTTTTAGTAATGCCTGCATTAATTGGTGGTTTTGGTAATTGGTTTGTTCCTTTAATGATTGGTGCTCCTGATATGGCTTTTCCTCGTATGAATAATATTAGTTTTTGGTTATTACCTCCTTCTTTATTATTATTAGTTTCATCAGCTCTTGTAGAATCTGGTGCTGGTACAGGTTGGACTGTTTATCCACCTTTATCAAGTGTACAAGCTCACTCAGGACCTTCAGTAGATTTAGCAATTTTTAGTTTACATTTATCAGGTATTTCATCATTATTAGGTGCAATTAATTTTATTTCAACTATTTATAATATGAGAGCACCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTTTGGTCTATATTAATTACTGCTTTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCTGGAGCATTAACAATGCTTTTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCATTTTATGATCCATCAGGAGGGGGTGATCCAGTATTATATCAACATTTATT 'Phytophthora boehmeriae CBS_291.29' AATCATAAAGATATTGGGACTTTATATTTAATTTTTAGTGCTTTTTCTGGTATTGTTGGTACAACATTCTCTCTTTTAATTAGAATGGAATTATCACAACCAGGTAATCAAATTTTAATGGGTAATCATCAATTATATAATGTAATTGTTACTGCACATGCTTTTATAATGGTATTTTTTTTAGTTATGCCTGCTTTAATAGGTGGTTTTGGTAATTGGTTTGTTCCTTTAATGATAGGTGCTCCGGATATGGCTTTTCCACGTATGAATAATATTAGTTTTTGGTTATTACCTCCATCATTATTATTATTAGTTTCATCTGCTTTAGTTGAATCAGGTGCAGGTACCGGTTGGACAGTTTATCCACCTTTATCAAGTGTTCAAGCACATTCAGGACCTTCTGTAGATTTAGCAATTTTTAGTTTACATTTATCAGGTATTTCTTCTTTATTAGGTGCTATTAATTTTATATCAACTATTTATAATATGAGAGCACCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTTTGGTCTATATTAATTACAGCTTTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCTGGTGCAATTACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCATTTTATGATCCTTCTGGTGGAGGTGATCCAGTATTATATCAACATTTATT ; END; BEGIN ASSUMPTIONS; TYPESET * UNTITLED = unord: 1- 680; END; BEGIN CODONS; CODESET * UNTITLED = universal: 1- 680; END; BEGIN MESQUITECHARMODELS; ProbModelSet * UNTITLED = 'Jukes-Cantor': 1- 680; END; BEGIN TREES; Title 'Phytopythium COI 32 taxa MaxLikelihood'; ID 01745430e4551; LINK Taxa = COI; TRANSLATE [0] 1 Ovatisporangium_sp._5_MAFF_241149, [1] 2 Ovatisporangium_sp._5_STE_U_7848, [2] 3 Ovatisporangium_sp._5_STE_U_7847, [3] 4 Ovatisporangium_sp._5_STE_U_7846, [4] 5 Ovatisporangium_sp._5_STE_U_7845, [5] 6 Ovatisporangium_sp._5_STE_U_7844, [6] 7 Ovatisporangium_sp._5_STE_U_7843, [7] 8 'Phytopythium helicoides CBS_28631', [8] 9 'Phytopythium chamaehyphon CBS_25930', [9] 10 'Phytopythium nanjingense Chen_218', [10] 11 'Phytopythium fagopyri CBS_293.35', [11] 12 'Phytopythium aichiense CBS_137195', [12] 13 'Phytopythium delawarense CBS_123040', [13] 14 'Phytopythium citrinum CBS_119171', [14] 15 'Phytopythium litorale CBS_118360', [15] 16 'Phytopythium carbonicum CBS_112544', [16] 17 'Phytopythium montanum CBS_111349', [17] 18 'Phytopythium mercuriale CBS_122443', [18] 19 'Phytopythium megacarpum CBS_112351', [19] 20 'Phytopythium boreale CBS_55188', [20] 21 'Phytopythium oedochilum CBS_29237', [21] 22 'Phytopythium ostracodes CBS_76873', [22] 23 Phytopythium_iriomotense_GUCC7020, [23] 24 'Phytopythium mirpurense CBS_124523', [24] 25 'Phytopythium dogmae USTCMS_4101', [25] 26 'Phytopythium palingenes CCIBt_3981', [26] 27 'Phytopythium leanoi USTCMS_4102', [27] 28 'Phytopythium kandeliae NBRC_32620', [28] 29 'Pythium cucurbitacearum CBS_74896', [29] 30 'Phytopythium vexans CBS_11980', [30] 31 'Phytophthora batemanensis CBS_679.84', [31] 32 'Phytophthora boehmeriae CBS_291.29'; TREE Imported_tree_1 = ((((((((28:0.01292546,27:0.02176004):0.02640653[%bootstrapFrequency = 99 ],24:0.03911345):0.00443268[%bootstrapFrequency = 25 ],((20:0.00147452,19:0.00380393):0.02664426[%bootstrapFrequency = 100 ],22:0.03386978):0.00748829[%bootstrapFrequency = 37 ]):0.00282156[%bootstrapFrequency = 16 ],18:0.04080367):0.00575669[%bootstrapFrequency = 18 ],(23:0.02184289,21:0.03783171):0.01371497[%bootstrapFrequency = 72 ]):0.01355803[%bootstrapFrequency = 19 ],(((30:0.00718542,29:0.00629877):0.11381678[%bootstrapFrequency = 100 ],(17:0.01641278,16:0.02315244):0.01357462[%bootstrapFrequency = 91 ]):0.01027672[%bootstrapFrequency = 31 ],((14:0.00988189,13:0.00814425):0.00400347[%bootstrapFrequency = 37 ],(15:0.02165926,12:0.01414012):0.00459475[%bootstrapFrequency = 50 ]):0.00735207[%bootstrapFrequency = 72 ]):0.00547074[%bootstrapFrequency = 16 ]):0.00654384[%bootstrapFrequency = 25 ],(((((((((3:0.0,2:0.0):0.0[%bootstrapFrequency = 4 ],4:0.0):0.00000001[%bootstrapFrequency = 5 ],5:0.0):0.0[%bootstrapFrequency = 8 ],(6:0.0,1:0.01745837):0.0[%bootstrapFrequency = 6 ]):0.0[%bootstrapFrequency = 3 ],7:0.0):0.03085455[%bootstrapFrequency = 99 ],11:0.02269454):0.00910592[%bootstrapFrequency = 75 ],(9:0.02637665,8:0.02023657):0.00868179[%bootstrapFrequency = 61 ]):0.00741067[%bootstrapFrequency = 49 ],(25:0.02689808,10:0.02585292):0.01430601[%bootstrapFrequency = 41 ]):0.01020878[%bootstrapFrequency = 41 ],26:0.03978492):0.00000001[%bootstrapFrequency = 31 ]):0.11653099[%bootstrapFrequency = 100 ],(32:0.04452537,31:0.09046975):0.11653099)[% ] [% ] [% setBetweenDouble = bootstrapFrequency ]; END; BEGIN TREES; Title 'Phytopythium COI 32 taxa Bayesian'; ID 01745434a7304; LINK Taxa = COI; TRANSLATE [0] 1 Ovatisporangium_sp._5_MAFF_241149, [1] 2 Ovatisporangium_sp._5_STE_U_7848, [2] 3 Ovatisporangium_sp._5_STE_U_7847, [3] 4 Ovatisporangium_sp._5_STE_U_7846, [4] 5 Ovatisporangium_sp._5_STE_U_7845, [5] 6 Ovatisporangium_sp._5_STE_U_7844, [6] 7 Ovatisporangium_sp._5_STE_U_7843, [7] 8 'Phytopythium helicoides CBS_28631', [8] 9 'Phytopythium chamaehyphon CBS_25930', [9] 10 'Phytopythium nanjingense Chen_218', [10] 11 'Phytopythium fagopyri CBS_293.35', [11] 12 'Phytopythium aichiense CBS_137195', [12] 13 'Phytopythium delawarense CBS_123040', [13] 14 'Phytopythium citrinum CBS_119171', [14] 15 'Phytopythium litorale CBS_118360', [15] 16 'Phytopythium carbonicum CBS_112544', [16] 17 'Phytopythium montanum CBS_111349', [17] 18 'Phytopythium mercuriale CBS_122443', [18] 19 'Phytopythium megacarpum CBS_112351', [19] 20 'Phytopythium boreale CBS_55188', [20] 21 'Phytopythium oedochilum CBS_29237', [21] 22 'Phytopythium ostracodes CBS_76873', [22] 23 Phytopythium_iriomotense_GUCC7020, [23] 24 'Phytopythium mirpurense CBS_124523', [24] 25 'Phytopythium dogmae USTCMS_4101', [25] 26 'Phytopythium palingenes CCIBt_3981', [26] 27 'Phytopythium leanoi USTCMS_4102', [27] 28 'Phytopythium kandeliae NBRC_32620', [28] 29 'Pythium cucurbitacearum CBS_74896', [29] 30 'Phytopythium vexans CBS_11980', [30] 31 'Phytophthora batemanensis CBS_679.84', [31] 32 'Phytophthora boehmeriae CBS_291.29'; TREE Imported_tree_1 = (((((((7:0.006306,6:0.00633,5:0.006318,4:0.00628,3:0.006362,2:0.006344,1:0.06524):0.139936[%posteriorProbability = 0.99 ],11:0.110581):0.094454[%posteriorProbability = 0.93 ],9:0.098225,8:0.122535):0.089057[%posteriorProbability = 0.88 ],(25:0.07593,10:0.133566):0.073022[%posteriorProbability = 0.53 ]):0.086628[%posteriorProbability = 0.72 ],26:0.108796):0.082636[%posteriorProbability = 0.53 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