#NEXUS [written Fri Aug 10 00:02:29 IRDT 2018 by Mesquite version 3.51 (build 898) at Sony/192.168.1.102] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=61; TAXLABELS Pythium_afertile_KJ595440 Pythium_kashmirense_KJ595429 Pythium_plurisporium_KJ595405 Pythium_catenulatum_KJ595404 Pythium_rhizo_oryzae_KJ595420 Pythium_torulosum_KJ595374 Pythium_graminicola_AF196593 Pythium_inflatum_KJ595352 Pythium_vanterpoolii_KJ595371 Pythium_pyrilobum_KJ595349 Pythium_myriotylum_KJ595365 Pythium_arrhenomanes_AF196587 Pythium_aphanidermatum_KJ595344 Pythium_deliense_KJ595372 Pythium_insidiosum_KJ595391 Pythium_undulatum_KJ595348 Pythium_anandrum_AB362328 Phytophthora_infestans_KJ654169 Pythium_heterothallicum_AB512919 Pythium_ultimum_var_ultimum_KJ595382 Pythium_rostratifingens_KJ595416 Pythium_rostratum_KJ595388 Pythium_middletonii_AB362318 Pythium_longisporangium_KJ595426 Pythium_debaryanum_KJ595399 Pythium_abappressorium_KJ595409 Pythium_longipapillum_NR1 Pythium_longipapillum_NS05 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ATTAATTTTCACCATGATTTAATGTTTTTTTTAATCATTGTGACTGTTTTTGTGTGCTGGTTATTATTTAGAGTAATAACTTTATTCGACGAAAAGAAAAACCCTATCCCAGCAACTTTTGTACATGGAGCTACTATTGAAATTATTTGGACTACTATTCCAGCATTAATTTTATTAACAGTAGCAGTTCCATCTTTCGCTTTATTATATTCAATGGATGAAATTATTGATCCTATAATTACTTTAAAAGTTATAGGTAGTCAATGGTATTGGAGTTATGAATATTCTGATAATTTAGAATTTGCGGATGAACCTTTAATTTTTGATAGTTATATGGTTCAAGAAGATGATTTAGTTATAGGTCAATTTAGACTTTTAGAAGTGGATAACCGTATTGTTGTGCCTACTAATAGTCATATTAGAGTATTAATAACAGCTTCTGATGTTTTACATTCTTGGGCTATACCTTCTTTAGGTATTAAATTAGATGCATGTCCAGGTCGTTTAAATCAAACTTCAATGTTTATT ; END; BEGIN ASSUMPTIONS; TYPESET * UNTITLED = unord: 1- 528; END; BEGIN CODONS; CODESET * UNTITLED = universal: 1- 528; END; BEGIN MESQUITECHARMODELS; ProbModelSet * UNTITLED = 'Jukes-Cantor': 1- 528; END; BEGIN TREES; TITLE 'COXII Pythium panel (Representatives) Rice Isolates (Combined) Bayesian Fig2'; ID 01651f849b497; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE [0] 1 Pythium_afertile_KJ595440, [1] 2 Pythium_kashmirense_KJ595429, [2] 3 Pythium_plurisporium_KJ595405, [3] 4 Pythium_catenulatum_KJ595404, [4] 5 Pythium_rhizo_oryzae_KJ595420, [5] 6 Pythium_torulosum_KJ595374, [6] 7 Pythium_graminicola_AF196593, [7] 8 Pythium_inflatum_KJ595352, [8] 9 Pythium_vanterpoolii_KJ595371, [9] 10 Pythium_pyrilobum_KJ595349, [10] 11 Pythium_myriotylum_KJ595365, [11] 12 Pythium_arrhenomanes_AF196587, [12] 13 Pythium_aphanidermatum_KJ595344, [13] 14 Pythium_deliense_KJ595372, [14] 15 Pythium_insidiosum_KJ595391, [15] 16 Pythium_undulatum_KJ595348, [16] 17 Pythium_anandrum_AB362328, [17] 18 Phytophthora_infestans_KJ654169, [18] 19 Pythium_heterothallicum_AB512919, [19] 20 Pythium_ultimum_var_ultimum_KJ595382, [20] 21 Pythium_rostratifingens_KJ595416, [21] 22 Pythium_rostratum_KJ595388, [22] 23 Pythium_middletonii_AB362318, [23] 24 Pythium_longisporangium_KJ595426, [24] 25 Pythium_debaryanum_KJ595399, [25] 26 Pythium_abappressorium_KJ595409, [26] 27 Pythium_longipapillum_NR1, [27] 28 Pythium_longipapillum_NS05, [28] 29 Pythium_longipapillum_NRh8, [29] 30 Pythium_nagaii_KJ595402, [30] 31 Pythium_spinosum_KJ595366, [31] 32 Pythium_macrosporum_AB512916, [32] 33 Pythium_okanoganense_KJ595373, [33] 34 Pythium_nunn_AF196609, [34] 35 Pythium_orthogonon_KJ595379, [35] 36 Pythium_acanthophoron_KJ595376, [36] 37 Pythium_perplexum_KJ595395, [37] 38 Pythium_mastophorum_KJ595378, [38] 39 Pythium_oryzicollum_Kr7, [39] 40 Pythium_oryzicollum_Ts3, [40] 41 Pythium_oryzicollum_KB1, [41] 42 Pythium_adhaerens_KJ595386, [42] 43 Pythium_chondricola_KJ595354, [43] 44 Pythium_porphyrae_KJ595377, [44] 45 Pythium_monospermum_KJ595350, [45] 46 Pythium_heteroogonium_079_1, [46] 47 Pythium_heteroogonium_KSr13, [47] 48 Pythium_heteroogonium_TMr4, [48] 49 Pythium_periplocum_KJ595369, [49] 50 Pythium_hydnosporum_KJ595364, [50] 51 Pythium_amasculinum_KJ595390, [51] 52 Pythium_lycopersicum_KJ595343, [52] 53 Pythium_oligandrum_KJ595381, [53] 54 Pythium_ornamentatum_KJ595428, [54] 55 Pythium_acanthicum_KJ595380, [55] 56 Pythium_aquatile_KJ595355, [56] 57 Pythium_sukuiense_KJ595408, [57] 58 Pythium_dissotocum_KJ595351, [58] 59 Pythium_oopapillum_KJ595431, [59] 60 Pythium_apleroticum_KJ595400, [60] 61 Pythium_grandisporangium_KJ595367; TREE Fig._2 = (1:0.018923,2:0.042808,(3:0.095501,((7:0.05307,8:0.101254):0.057902[%posteriorProbability = 1 ],(9:0.055152,12:0.211342):0.06365[%posteriorProbability = 0.93 ],((10:0.165493,15:0.311065):0.08911[%posteriorProbability = 0.76 ],(13:0.027893,14:0.116609):0.093025[%posteriorProbability = 0.99 ],(19:0.176167,20:0.104443,((18:0.367233,(16:0.081121,17:0.02761):0.185933[%posteriorProbability = 1 ]):0.124979[%posteriorProbability = 0.92 ],(((21:0.049438,22:0.052858):0.249273[%posteriorProbability = 1 ],(23:0.085937,24:0.143505):0.053802[%posteriorProbability = 0.59 ]):0.054649[%posteriorProbability = 0.51 ],((25:0.053845,26:0.068897):0.027432[%posteriorProbability = 0.76 ],(30:0.047142,(27:0.005153,28:0.004573,29:0.016476):0.112888[%posteriorProbability = 1 ]):0.043724[%posteriorProbability = 0.76 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