#NEXUS BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=53; TAXLABELS Thekopsora_sp._2_JXJ.2018_MH780989 Thekopsora_sp._1_JXJ.2018_MH780990 Thekopsora_sp._1_JXJ.2018_MH780991 Thekopsora_sp._2_JXJ.2018_MH780992 Thekopsora_sp._2_JXJ.2018_MH780993 Thekopsora_sp._2_JXJ.2018_MH780994 Thekopsora_sp._2_JJ.2018_MG787108 Thekopsora_sp._2_JJ.2018_MG787110 Thekopsora_sp._2_JXJ.2018_MH780995 Thekopsora_sp._2_JXJ.2018_MH780996 Thekopsora_sp._2_JJ.2018_MG787109 Thekopsora_sp._1_JJ.2018_MG787102 Thekopsora_sp._1_JJ.2018_MG787103 Thekopsora_sp._1_JJ.2018_MG787104 Thekopsora_sp._1_JJ.2018_MG787105 Thekopsora_sp._1_JJ.2018_MG787106 Thekopsora_sp._1_JJ.2018_MG787107 Thekopsora_sp._3_JJ.2018_MG787111 Thekopsora_sp._3_JJ.2018_MG787112 Thekopsora_sp._3_JJ.2018_MG787113 Thekopsora_rubiae_MG787114 Thekopsora_rubiae_MG787115 Pucciniastrum_agrimoniae_MG787116 Pucciniastrum_agrimoniae_MG787117 Pucciniastrum_agrimoniae_MG787118 Pucciniastrum_agrimoniae_MG787119 Pucciniastrum_agrimoniae_MG787120 Pucciniastrum_agrimoniae_MG787121 Pucciniastrum_tiliae_MG787122 Pucciniastrum_tiliae_MG787123 Pucciniastrum_tiliae_MG787124 Pucciniastrum_tiliae_MG787125 'Melampsora larici-populina MG787126' Thekopsora_nipponica_KC415792 Thekopsora_nipponica_KC415794 Thekopsora_rubiae_KC415799 Thekopsora_rubiae_KC415802 Pucciniastrum_kusanoi_AB221426 Pucciniastrum_tiliae_AB221453 Pucciniastrum_tiliae_AB221455 Pucciniastrum_agrimoniae_KJ486537 Pucciniastrum_boehmeriae_AB221449 Thekopsora_nipponica_KC415793 Thekopsora_rubiae_KC415801 Thekopsora_rubiae_KC415789 Thekopsora_rubiae_KC415790 Thekopsora_rubiae_KC415791 Thekopsora_lanpingensis_KF551220 Thekopsora_lanpingensis_KF551222 Thekopsora_lanpingensis_KF551225 Thekopsora_lanpingensis_KF551224 Thekopsora_sp._TY.2013b_KF551219 Thekopsora_ostryae_KC415796 ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE ITS_alignment; DIMENSIONS NCHAR=738; FORMAT DATATYPE = DNA GAP = - MISSING = ?; MATRIX Thekopsora_sp._2_JXJ.2018_MH780989 ATCATTATTAGAACCAAAAAAATGGGTGCACTTAACTGTGACTCTAT---AATCTAATA----CAACAAACC--ATTTTAAACCCAAAACTGTCTTGTGTGCTTTAAC------AAGTATAGCATTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGAC--TTTAACTGTT--------CAAGTTGC---ATTACCCCCCCTCATAAGTGACC-CTTTATTTTTTGAACTCATTAACAC-ATAAAAA-GTTTTAAGAATGTAAAATTATGGGA-TGTTGG--AATTGA-AAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACGCAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAAACCTCTCATTCTGATTCTTTATTTTGT-TAAGGA-GTTG-GTGATGGATGTTGAGTG-TTGCCG---TAATTGGCTCGCTTTAAATACATAAGTACTTTTA--TTGAT--AAAT-AAATGG------ATAAATACTTGGTGTGATATTTTATAATGAATCATCAAGGAGTGTAGAGTTTGTTGGTCTTTTCCTGAAAAACTTTG-CAGCCA--TTTAAAT---TTT-AATAAATAGCTTTCTAACCCTA----------GATGTAAATGTTGACCC-TTTAAACCTCAAATCA Thekopsora_sp._1_JXJ.2018_MH780990 ATCATTATTAGAACAAA--------GTGCACTTAAATGTGACTCT-----TATATGAGAT---TATCAAACC--ATTTTAAACCCAAAACTGTCTAGTGTGCTCTAAC------RAGTATAGCTTTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGAC--TTT-ATTGTT--------TCAGTTGC---ATTACCCCCCCTCATAAGTTACC-CCTTATTCGCTGAACTCATT-ACAC-TTAAAAA-GTTTTAGGAATGTAAAATACAGAAACTGTTGGGAAATTAA-ATATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACGCAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACTTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCATCCTGATTCTTTATTTTGT-TAAGGA-GTTG-GTGATGGATGTTGAGTG-CTGCCG---TAATTGGCTCGCTTTAAATACATAAGTACTTTTA--TTGAC--AAATGAAATGG------ATATTTACTTGGTGTGATATTGTATTATGAATCATCAAGGAGTGCAG---TT------------------AACTCTG-CAGCCAATTTTGAAG---TT--GATAAATAGCTTCCTAACCCCC----------ACTGAACGTGTTGACCCTTTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_sp._1_JXJ.2018_MH780991 ATCATTATTAGAACAAA--------GTGCACTTAAATGTGACTCT-----TATATGAGAT---TATCAAACC--ATTTTAAACCCAAAACTGTCTAGTGTGCTCTAAC------AAGTATAGCTTTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGAC--TTT-ATTGTT--------TCAGTTGC---ATTACCCCCCCTCATAAGTTACC-CCTTATTCGCTGAACTCATT-ACAC-TTAAAAA-GTTTTAGGAATGTAAAATACAGAAACTGTTGGGAAATTAA-ATATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACGCAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACTTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCATCCTGATTCTTTATTTTGT-TAAGGA-GTTG-GTGATGGATGTTGAGTG-CTGCCG---TAATTGGCTCGCTTTAAATACATAAGTACTTTTA--TTGAC--AAATGAAATGG------ATATTTACTTGGTGTGATATTGTATTATGAATCATCAAGGAGTGCAG---TT------------------AACTCTG-CAGCCAATTTTGAAG---TT--GATAAATAGCTTCCTAACCCCC----------ACTGAACGTGTTGACCCTTTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_sp._2_JXJ.2018_MH780992 ATCATTATTAGAACCAAAAAAATGGGTGCACTTAACTGTGACTCTAT---AATCTAATA----CAACAAACC--ATTTTAAACCCAAAACTGTCTTGTGTGCTTTAAC------AAGTATAGCATTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGAC--TTTAACTGTT--------CAAGTTGC---ATTACCCCCCCTCATAAGTGACC-CTTTATTTTTTGAACTCATTAACAC-ATAAAAA-GTTTTAAGAATGTAAAATTATGGGA-TGTTGG--AATTGA-AAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACGCAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAAACCTCTCATTCTGATTCTTTATTTTGT-TAAGGA-GTTG-GTGATGGATGTTGAGTG-TTGCCG---TAATTGGCTCGCTTTAAATACATAAGTACTTTTA--TTGAT--AAAT-AAATGG------ATAAATACTTGGTGTGATA-TTTATAATGAATCATCAAGGAGTGTAGAGTTTGTTGGTCTTTTCCTGAAAAACTTTG-CAGCCA--TTTAAAT---TTT-AATAAATAGCTTTCTAACCCTA----------GATGTAAATGTTGACCC-TTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_sp._2_JXJ.2018_MH780993 ATCATTATTAGAACCAAAAAAATGGGTGCACTTAACTGTGACTCTAT---AATCTAATA----CAACAAACC--ATTTTAAACCCAAAACTGTCTTGTGTGCTTTAAC------AAGTATAGCATTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGAC--TTTAACTGTT--------CAAGTTGC---ATTACCCCCCCTCATAAGTGACC-CTTTATTTTTTGAACTCATTAACAC-ATAAAAA-GTTTTAAGAATGTAAAATTATGGGA-TGTTGG--AATTGA-AAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACGCAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCAAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAAACCTCTCATTCTGATTCTTTATTTTGT-TAAGGA-GTTG-GTGATGGATGTTGAGTG-TTGCCG---TAATTGGCTCGCTTTAAATACATAAGTACTTTTA--TTGAT--AAAT-AAATGG------ATAAATACTTGGTGTGATA-TTTATAATGAATCATCAAGGAGTGTAGAGTTTGTTGGTCTTTTCCTGAAAAACTTTG-CCGCCA--TTTAAAT---TTT-AATAAATAGCTTTCTAACCCTA----------GATGTAAATGTTGACCC-TTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_sp._2_JXJ.2018_MH780994 ATCATTATTAGAACCAAAAAAATGGGTGCACTTAACTGTGACTCTAT---AATCTAATA----CAACAAACC--ATTTTAAACCCAAAACTGTCTTGTGTGCTTTAAC------AAGTATAGCATTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGAC--TTTAACTGTT--------CAAGTTGC---ATTACCCCCCCTCATAAGTGACC-CTTTATTTTTTGAACTCATTAACAC-ATAAAAA-GTTTTAAGAATGTAAAATTATGGGA-TGTTGG--AATTGA-AAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACGCAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATTGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAAACCTCTCATTCTGATTCTTTATTTTGT-TAAGGA-GTTG-GTGATGGATGTTGAGTG-TTGCCG---TAATTGGCTCGCTTTAAATACATAAGTACTTTTA--TTGAT--AAAT-AAATGG------ATAAATACTTGGTGTGATA-TTTATAATGAATCATCAAGGAGTGTAGAGTTTGTTGGTCTTTTCCTGAAAAACTTTG-CAGCCA--TTTAAAT---TTT-AATAAATAGCTTTCTAACCCTA----------GATGTAAATGTTGACCC-TTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_sp._2_JJ.2018_MG787108 ATCATTATTAGAACCAAAAAAATGGGTGCACTTAACTGTGACTCTAT---AATCTAATA----CAACAAACC--ATTTTAAACCCAAAACTGTCTTGTGTGCTTTAAC------AAGTATAGCATTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGAC--TTTAACTGTT--------CAAGTTGC---ATTACCCCCCCTCATAAGTGACC-CTTTATTTTTTGAACTCATTAACAC-ATAAAAA-GTTTTAAGAATGTAAAATTATGGGA-TGTTGG--AATTGA-AAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACGCAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAAACCTCTCATTCTGATTCTTTATTTTGT-TAAGGA-GTTG-GTGATGGATGTTGAGTG-TTGCCG---TAATTGGCTCGCTTTAAATACATAAGTACTTTTA--TTGAT--AAAT-AAATGG------ATAAATACTTGGTGTGATA-TTTATAATGAATCATCAAGGAGTGTAGAGTTTGTTGGTCTTTTCCTGAAAAACTTTG-CAGCCA--TTTAAAT---TTT-AATAAATAGCTTTCTAACCCTA----------GATGTAAATGTTGACCC-TTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_sp._2_JJ.2018_MG787110 ATCATTATTAGAACCAAAAAAATGGGTGCACTTAACTGTGACTCTAT---AATCTAATA----CAACAAACC--ATTTTAAACCCAAAACTGTCTTGTGTGCTTTAAC------AAGTATAGCATTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGAC--TTTAACTGTT--------CAAGTTGC---ATTACCCCCCCTCATAAGTGACC-CTTTATTTTTTGAACTCATTAACAC-ATAAAAA-GTTTTAAGAATGTAAAATTATGGGA-TGTTGG--AATTGA-AAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACGCAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAAACCTCTCATTCTGATTCTTTATTTTGT-TAAGGA-GTTG-GTGATGGATGTTGAGTG-TTGCCG---TAATTGGCTCGCTTTAAATACATAAGTACTTTTA--TTGAT--AAAT-AAATGG------ATAAATACTTGGTGTGATA-TTTATAATGAATCATCAAGGAGTGTAGAGTTTGTTGGTCTTTTCCTGAAAAACTTTG-CAGCCA--TTTAAAT---TTT-AATAAATAGCTTTCTAACCCTA----------GATGTAAATGTTGACCC-TTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_sp._2_JXJ.2018_MH780995 ATCATTATTAGAACCAAAAAAATGGGTGCACTTAACTGTGACTCTAT---AATCTAATA----CAACAAACC--ATTTTAAACCCAAAACTGTCTTGTGTGCTTTAAC------AAGTATAGCATTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGAC--TTTAACTGTT--------CAAGTTGC---ATTACCCCCCCTCATAAGTGACC-CTTTATTTTTTGAACTCATTAACAC-ATAAAAA-GTTTTAAGAATGTAAAATTATGGGA-TGTTGG--AATTGA-AAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACGCAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATTGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAAACCTCTCATTCTGATTCTTTATTTTGT-TAAGGA-GTTG-GTGATGGATGTTGAGTG-TTGCCG---TAATTGGCTCGCTTTAAATACATAAGTACTTTTA--TTGAT--AAAT-AAATGG------ATAAATACTTGGTGTGATA-TTTATAATGAATCATCAAGGAGTGTAGAGTTTGTTGGTCTTTTCCTGAAAAACTTTG-CAGCCA--TTTAAAT---TTT-AATAAATAGCTTTCTAACCCTA----------GATGTAAATGTTGACCC-TTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_sp._2_JXJ.2018_MH780996 ATCATTATTAGAACCAAAAAAATGGGTGCACTTAACTGTGACTCTAT---AATCTAATA----CAACAAACC--ATTTTAAACCCAAAACTGTCTTGTGTGCTTTAAC------AAGTATAGCATTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGAC--TTTAACTGTT--------CAAGTTGC---ATTACCCCCCCTCATAAGTGACC-CTTTATTTTTTGAACTCATTAACAC-ATAAAAA-GTTTTAAGAATGTAAAATTATGGGA-TGTTGG--AATTGA-AAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACGCAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAAACCTCTCATTCTGATTCTTTATTTTGT-TAAGGA-GTTG-GTGATGGATGTTGAGTG-TTGCCG---TAATTGGCTCGCTTTAAATACATAAGTACTTTTA--TTGAT--AAAT-AAATGG------ATAAATACTTGGTGTGATA-TTTATAATGAATCATCAAGGAGTGTAGAGTTTGTTGGTCTTTTCCTGAAAAACTTTG-CAGCCA--TTTAAAT---TTT-AATAAATAGCTTTCTAACCCTA----------GAGGTAAAGGTTGACCC-TTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_sp._2_JJ.2018_MG787109 ATCATTATTAGAACCAAAAAAATGGGTGCACTTAACTGTGACTCTAT---AATCTAATA----CAACAAACC--ATTTTAAACCCAAAACTGTCTTGTGTGCTTTAAC------AAGTATAGCATTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGAC--TTTAACTGTT--------CAAGTTGC---ATTACCCCCCCTCATAAGTGACC-CTTTATTTTTTGAACTCATTAACAC-ATAAAAA-GTTTTAAGAATGTAAAATTATGGGA-TGTTGG--AATTGA-AAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACGCAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAAACCTCTCATTCTGATTCTTTATTTTGT-TAAGGA-GTTG-GTGATGGATGTTGAGTG-TTGCCG---TAATTGGCTCGCTTTAAATACATAAGTACTTTTA--TTGAT--AAAT-AAATGG------ATAAATACTTGGTGTGATA-TTTATAATGAATCATCAAGGAGTGTAGAGTTTGTTGGTCTTTTCCTGAAAAACTTTG-CAGCCA--TTTAAAT---TTT-AATAAATAGCTTTCTAACCCTA----------GATGTAAATGTTGACCC-TTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_sp._1_JJ.2018_MG787102 ATCATTATTAGAACAAA--------GTGCACTTAAATGTGACTCT-----TATATGAGAT---TATCAAACC--ATTTTAAACCCAAAACTGTCTAGTGTGCTCTAAC------AAGTATAGCTTTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGAC--TTT-ATTGTT--------TCAGTTGC---ATTACCCCCCCTCATAAGTTACC-CCTTATTCGCTGAACTCATT-ACAC-TTAAAAA-GTTTTAGGAATGTAAAATACAGAAACTGTTGGGAAATTAA-ATATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACGCAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACTTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCATCCTGATTCTTTATTTTGT-TAAGGA-GTTG-GTGATGGATGTTGAGTG-CTGCCG---TAATTGGCTCGCTTTAAATACATAAGTACTTTTA--TTGAC--AAATGAAATGG------ATATTTACTTGGTGTGATATTGTATTATGAATCATCAAGGAGTGCAG---TT------------------AACTCTG-CAGCCAATTTTGAAG---TT--GATAAATAGCTTCCTAACCCCC----------ACTGAACGTGTTGACCCTTTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_sp._1_JJ.2018_MG787103 ATCATTATTAGAACAAA--------GTGCACTTAAATGTGACTCT-----TATATGAGAT---TATCAAACC--ATTTTAAACCCAAAACTGTCTAGTGTGCTCTAAC------AAGTATAGCTTTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGAC--TTT-ATTGTT--------TCAGTTGC---ATTACCCCCCCTCATAAGTTACC-CCTTATTCGCTGAACTCATT-ACAC-TTAAAAA-GTTTTAGGAATGTAAAATACAGAAACTGTTGGGAAATTAA-ATATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACGCAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACTTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCATCCTGATTCTTTATTTTGT-TAAGGA-GTTG-GTGATGGATGTTGAGTG-CTGCCG---TAATTGGCTCGCTTTAAATACATAAGTACTTTTA--TTGAC--AAATGAAATGG------ATATTTACTTGGTGTGATATTGTATTATGAATCATCAAGGAGTGCAG---TT------------------AACTCTG-CAGCCAATTTTGAAG---TT--GATAAATAGCTTCCTAACCCCC----------ACTGAACGTGTTGACCCTTTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_sp._1_JJ.2018_MG787104 ATCATTATTAGAACAAA--------GTGCACTTAAATGTGACTCT-----TATATGAGAT---TATCAAACC--ATTTTAAACCCAAAACTGTCTAGTGTGCTCTAAC------AAGTATAGCTTTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGAC--TTT-ATTGTT--------TCAGTTGC---ATTACCCCCCCTCATAAGTTACC-CCTTATTCGCTGAACTCATT-ACAC-TTAAAAA-GTTTTAGGAATGTAAAATACAGAAACTGTTGGGAAATTAA-ATATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACGCAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACTTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCATCCTGATTCTTTATTTTGT-TAAGGA-GTTG-GTGATGGATGTTGAGTG-CTGCCG---TAATTGGCTCGCTTTAAATACATAAGTACTTTTA--TTGAC--AAATGAAATGG------ATATTTACTTGGTGTGATATTGTATTATGAATCATCAAGGAGTGCAG---TT------------------AACTCTG-CAGCCAATTTTGAAG---TT--GATAAATAGCTTCCTAACCCCC----------ACTGAACGTGTTGACCCTTTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_sp._1_JJ.2018_MG787105 ATCATTATTAGAACAAA--------GTGCACTTAAATGTGACTCT-----TATATGAGAT---TATCAAACC--ATTTTAAACCCAAAACTGTCTAGTGTGCTCTAAC------GAGTATAGCTTTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGAC--TTT-ATTGTT--------TCAGTTGC---ATTACCCCCCCTCATAAGTTACC-CCTTATTCGCTGAACTCATT-ACAC-TTAAAAA-GTTTTAGGAATGTAAAATACAGAAACTGTTGGGAAATTAA-ATATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACGCAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACTTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCATCCTGATTCTTTATTTTGT-TAAGGA-GTTG-GTGATGGATGTTGAGTG-CTGCCG---TTATTGGCTCGCTTTAAATACATAAGTACTTTTA--TTGAC--AAATGAAATGG------ATATTTACTTGGTGTGATATTGTATTATGAATCATCAAGGAGTGCAG---TT------------------AACTCTG-CAGCCAATTTTGAAG---TT--GATAAATAGCTTCCTAACCCCC----------ACTGAACGTGTTGACCCTTTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_sp._1_JJ.2018_MG787106 ATCATTATTAGAACAAA--------GTGCACTTAAATGTGACTCT-----TATATGAGAT---TATCAAACC--ATTTTAAACCCAAAACTGTCTAGTGTGCTCTAAC------GAGTATAGCTTTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGAC--TTT-ATTGTT--------TCAGTTGC---ATTACCCCCCCTCATAAGTTACC-CCTTATTCGCTGAACTCATT-ACAC-TTAAAAA-GTTTTAGGAATGTAAAATACAGAAACTGTTGGGAAATTAA-ATATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACGCAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACTTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCATCCTGATTCTTTATTTTGT-TAAGGA-GTTG-GTGATGGATGTTGAGTG-CTGCCG---TTATTGGCTCGCTTTAAATACATAAGTACTTTTA--TTGAC--AAATGAAATGG------ATATTTACTTGGTGTGATATTGTATTATGAATCATCAAGGAGTGCAG---TT------------------AACTCTG-CAGCCAATTTTGAAG---TT--GATAAATAGCTTCCTAACCCCC----------ACTGAACGTGTTGACCCTTTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_sp._1_JJ.2018_MG787107 ATCATTATTAGAACAAA--------GTGCACTTAAATGTGACTCT-----TATATGAGAT---TATCAAACC--ATTTTAAACCCAAAACTGTCTAGTGTGCTCTAAC------GAGTATAGCTTTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGAC--TTT-ATTGTT--------TCAGTTGC---ATTACCCCCCCTCATAAGTTACC-CCTTATTCGCTGAACTCATT-ACAC-TTAAAAA-GTTTTAGGAATGTAAAATACAGAAACTGTTGGGAAATTAA-ATATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACGCAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACTTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCATTCTGATTCTTTATTTTGT-TAAGGA-GTTG-GTGATGGATGTTGAGTG-CTGCCG---TTATTGGCTCGCTTTAAATACATAAGTACTTTTA--TTGAC--AAATGAAATGG------ATATTTACTTGGTGTGATATTGTATTATGAATCATCAAGGAGTGCAG---TT------------------AACTCTG-CAGCCAATTTTGAAG---TT--GATAAATAGCTTCCTAACCCCC----------ACTGAACGTGTTGACCCTTTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_sp._3_JJ.2018_MG787111 ATCATTATTA-----AATTAAAAGGGTGCACTTCATTGTGACTCTATATAAATTTAAAA----CTATAACCC----TTTAAACCCAAAACTGTCTTGTGTGCTTTAAC------AAGTATAGCATTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGAC--TTT-ATTGTT--------CAAGTTGC---ATTACCCCCCCTTATAAGTGACC-CCTTATTTTTTGAAATCATTAACAC-TTAAAAT-GTTTTTAGAATGTAAAATTGAATCA-TGTCGG--AATT---AAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACGCAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCGTCCTGATTCTTTATTTAGT-TAAGGA-GTTG-GTGACGGATGTTGAGTG-TTGCCG---TAATTGGCTCACTTTAAATACATAAGTACTTTTA--TTGAT--AAAT-AAATGG------AGAAATACTTGGTGTGATA-----TTCTTGATCATCGAGGAGTGTAGGGTTT-------------------ACTCTG-CAGCCA--TTTGAAT---TTT-GATAAATAGCTTCCTAACCCCA----------GATATA-----TGACCC-TTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_sp._3_JJ.2018_MG787112 ATCATTATTA-----AATTAAAAGGGTGCACTTCATTGTGACTCTATATAAATTTAAAA----CTATAACCC----TTTAAACCCAAAACTGTCTTGTGTGCTTTAAC------AAGTATAGCATTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGAC--TTT-ATTGTT--------CAAGTTGC---ATTACCCCCCCTTATAAGTGACC-CCTTATTTTTTGAAATCATTAACAC-TTAAAAT-GTTTTTAGAATGTAAAATTGAATCA-TGTCGG--AATT---AAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACGCAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCGTCCTGATTCTTTATTTAGT-TAAGGA-GTTG-GTGACGGATGTTGAGTG-TTGCCG---TAATTGGCTCACTTTAAATACATAAGTACTTTTA--TTGAT--AAAT-AAATGG------AGAAATACTTGGTGTGATA-----TTCTTGATCATCGAGGAGTGTAGGGTTT-------------------ACTCTG-CAGCCA--TTTGAAT---TTT-GATAAATAGCTTCCTAACCCCA----------GATATA-----TGACCC-TTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_sp._3_JJ.2018_MG787113 ATCATTATTA-----AATTAAAAGGGTGCACTTCATTGTGACTCTATATAAATTTAAAA----CTATAACCC----TTTAAACCCAAAACTGTCTTGTGTGCTTTAAC------AAGTATAGCATTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGAC--TTT-ATTGTT--------CAAGTTGC---ATTACCCCCCCTTATAAGTGACC-CCTTATTTTTTGAAATCATTAACAC-TTAAAAT-GTTTTTAGAATGTAAAATTGAATCA-TGTCGG--AATT---AAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACGCAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCGTCCTGATTCTTTATTTAGT-TAAGGA-GTTG-GTGACGGATGTTGAGTG-TTGCCG---TAATTGGCTCACTTTAAATACATAAGTACTTTTA--TTGAT--AAAT-AAATGG------AGAAATACTTGGTGTGATA-----TTCTTGATCATCGAGGAGTGTAGGGTTT-------------------ACTCTG-CAGCCA--TTTGAAT---TTT-GATAAATAGCTTCCTAACCCCA----------GATATA-----TGACCC-TTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_rubiae_MG787114 ATCATTATTA-----AATTAAAAGGGTGCACTTCATTGTGACTCTATATAAATTTAAAA----TTATAACCC----TTTAAACCCAAAACTGTCTTGTGTGCTTTAAC------GAGTATAGCATTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGAC--TTT-ATTGTT--------CAAGTTGC---ATTACCCCCCCTTATAAGTGACC-CCTTATTTTTTGAAATCATTAACAC-TTAAAAT-GTTTTTAGAATGTAAAATTGAATCA-TGTCGG--AATT---AAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACGCAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCGTCCTGATTCTTTATTTAGT-TAAGGA-GTTG-GTGACGGATGTTGAGTG-TTGCCG---TAATTGGCTCACTTTAAATACATAAGTACTTTTA--TTGAT--AAAT-AAATGG------AGAAATACTTGGTGTGATA-----TTCTTGATCATCGAGGAGTGTAGGGTTT-------------------ACTCTG-CAGCCA--TTTGAAT---TTT-GATAAATAGCTTCCTAACCCCA----------GATATA-----TGACCC-TTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_rubiae_MG787115 ATCATTATTA-----AATTAAAAGGGTGCACTTCATTGTGACTCTATATAAATTTAAAA----TTATAACCC----TTTAAACCCAAAACTGTCTTGTGTGCTTTAAT------GAGTATAGCATTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGAC--TTT-ATTGTT--------CAAGTTGC---ATTACCCCCCCTTATAAGTGACC-CCTTATTTTTTGAAATCATTAACAC-TTAAAAT-GTTTTTAGAATGTAAAATTGAATCA-TGTCGG--AATT---AAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACGCAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCGTCCTGATTCTTTATTTAGT-TAAGGA-GTTG-GTGACGGATGTTGAGTG-TTGCCG---TAATTGGCTCACTTTAAATTCATAAGTACTTTTA--TTGAT--AAAT-AAATGG------AGAAATACTTGGTGTGATA-----TTCTTGATCATCGAGGAGTGTAGGGTTT-------------------ACTCTG-CAGCCA--TTTGAAT---TTT-GATAAATAGCTTCCTAACCCCA----------GATATA-----TGACCC-TTTAGACCTCAAATCA Pucciniastrum_agrimoniae_MG787116 ATCATTATTAAA---AAGTAAAGGAGTGCACTTTATTGTGGCTCTGAACCTTTTAAATA----TATTTAACC--CATTAAAACCCAAAGCTGTTATGTGTGCCTTTTT------TGGTATAGCATCTCAGCAGTAG----TTCA---AC--TTGTGTTGTCTTTTCACATAAGCTCTGACATTACCCCCCTTTATAAGTGACC-CCCTTTTTGTTAATTTGATGAACTCTTTAAAAATGTTTTAAGAATGTAAACCCCTATAA--------AAATT----AATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCATTCCAATTCTTTATTTTATATAAGGA-GTTGTGTAATGGATGTTGAGTG-TTGCTG---TCATTGGCTCACTTTAAATATATAAGTAATTTTAT-TTGAA--AAAATAAATGG------AGCAATACTTGGTGTAATA-TTTATTAT---TCATTGAGGAGTGTGG--TTT------------------AATTACTACAGCCA--TTTGT-----TTCGGATAAATAGCTTCCTAACCCCA-------------------TTTTTCAAATTTAGACCTCAAATCA Pucciniastrum_agrimoniae_MG787117 ATCATTATTAAA---AAGTAAAGGAGTGCACTTTATTGTGGCTCTGAACCTTTTAAATA----TATTTAACC--CATTAAAACCCAAAGCTGTTATGTGTGCCTTTTT------TGGTATAGCATCTCAGCAGTAG----TTCA---AC--TTGTGTTGTCTTTTCACATAAGCTCTGACATTACCCCCCTTTATAAGTGACC-CCCTTTTTGTTAATTTGATGAACTCTTTAAAAATGTTTTAAGAATGTAAACCCCTATAA--------AAATT----AATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCATTCCAATTCTTTATTTTATATAAGGA-GTTGTGTAATGGATGTTGAGTG-TTGCTG---TCATTGGCTCACTTTAAATATATAAGTAATTTTAT-TTGAA--AAAATAAATGG------AGCAATACTTGGTGTAATA-TTTATTAT---TCATTGAGGAGTGTGG--TTT------------------AATTACTACAGCCA--TTTGT-----TTCGGATAAATAGCTTCCTAACCCCA----------TTT-------TTCAAA--TTTAGACCTCAAATCA Pucciniastrum_agrimoniae_MG787118 ATCATTATTAAA---AAGTAAAGGAGTGCACTTTATTGTGGCTCTGAACCTTTTAAATA----TATTTAACC--CATTAAAACCCAAAGCTGTTATGTGTGCCTTTTT------TGGTATAGCATCTCAGCAGTAG----TTCA---AC--TTGTGTTGTCTTTTCACATAAGCTCTGACATTACCCCCCTTTATAAGTGACC-CCCTTTTTGTTAATTTGATGAACTCTTTAAAAATGTTTTAAGAATGTAAACCCCTATAA--------AAATT----AATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCATTCCAATTCTTTATTTTATATAAGGA-GTTGTGTAATGGATGTTGAGTG-TTGCTG---TCATTGGCTCACTTTAAATATATAAGTAATTTTAT-TTGAA--AAAATAAATGG------AGCAATACTTGGTGTAATA-TTTATTAT---TCATTGAGGAGTGTGG--TTT------------------AATTACTACAGCCA--TTTGT-----TTCGGATAAATAGCTTCCTAACCCCA----------TTT-------TTCAAA--TTTAGACCTCAAATCA Pucciniastrum_agrimoniae_MG787119 ATCATTATTAAA---AAGTAAAGGAGTGCACTTTATTGTGGCTCTGAACCTTTTAAATA----TATTTAACC--CATTAAAACCCAAAGCTGTTATGTGTGCCTTTTT------TGGTATAGCATCTCAGCAGTAG----TTCA---AC--TTGTGTTGTCTTTTCACATAAGCTCTGACATTACCCCCCTTTATAAGTGACC-CCCTTTTTGTTAATTTGATGAACTCTTTAAAAATGTTTTAAGAATGTAAACCCCTATAA--------AAATT----AATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCATTCCAATTCTTTATTTTATATAAGGA-GTTGTGTAATGGATGTTGAGTG-TTGCTG---TCATTGGCTCACTTTAAATATATAAGTAATTTTAT-TTGAA--AAAATAAATGG------AGCAATACTTGGTGTAATA-TTTATTAT---TCATTGAGGAGTGTGG--TTT------------------AATTACTACAGCCA--TTTGT-----TTCGGATAAATAGCTTCCTAACCCCA----------TTT-------TTCAAA--TTTAGACCTCAAATCA Pucciniastrum_agrimoniae_MG787120 ATCATTATTAAA---AAGTAAAGGAGTGCACTTTATTGTGGCTCTGAACCTTTTAAATA----TATTTAACC--CATTAAAACCCAAAGCTGTTATGTGTGCCTTTTT------TGGTATAGCATCTCAGCAGTAG----TTCA---AC--TTGTGTTGTCTTTTCACATAAGCTCTGACATTACCCCCCTTTATAAGTGACC-CCCTTTTTGTTAATTTGATGAACTCTTTAAAAATGTTTTAAGAATGTAAACCCCTATAA--------AAATT----AATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCATTCCAATTCTTTATTTTATATAAGGA-GTT--GTAATGGATGTTGAGTG-TTGCTG---TCATTGGCTCACTTTAAATATATAAGTAATTTTAT-TTGAA--AAAATAAATGG------AGCAATACTTGGTGTAATA-TTTATTAT---TCATTGAGGAGTGTGG--TTT------------------AATTACTACAGCCA--TTTGT-----TTCGGATAAATAGCTTCCTAACCCCA----------TTT-------TTCAA---ATTAGACCTCAAATCA Pucciniastrum_agrimoniae_MG787121 ATCATTATTAAA---AAGTAAAGGAGTGCACTTTATTGTGGCTCTGAACCTTTTAAATA----TATTTAACC--CATTAAAACCCAAAGCTGTTATGTGTGCCTTTTT------TGGTATAGCATCTCAGCAGTAG----TTCA---AC--TTGTGTTGTCTTTTCACATAAGCTCTGACATTACCCCCCTTTATAAGTGACC-CCCTTTTTGTTAATTTGATGAACTCTTTAAAAATGTTTTAAGAATGTAAACCCCTATAA--------AAATT----AATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCATTCCAATTCTTTATTTTATATAAGGA-GTT--GTAATGGATGTTGAGTG-TTGCTG---TCATTGGCTCACTTTAAATATATAAGTAATTTTAT-TTGAA--AAAATAAATGG------AGCAATACTTGGTGTAATA-TTTATTAT---TCATTGAGGAGTGTGG--TTT------------------AATTACTACAGCCA--TTTG------TTCGGATAAATAGCTTCCTAACCCCA----------TTT-----------TCAAATTAGACCTCAAATCA Pucciniastrum_tiliae_MG787122 ATCATTATTAAA---AGTTAAATGAGTGCACTTTATTGTGGCTCAAACATCTTTTAA------CATCAACCCATTTTTTAAACCCAAAGCTGTCTTGTGTGCTTTCTTTATTGAGAGTATAGCATTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGACAATTT-ATTGTT--------CAAGTTGC---ATTACCCCCCCTCATAAGTGACC-CCCCATTTTTTGAAATCATTAACACATTAAAAA-GTTTTAAGAATGTAAACCCCCTTTA---------AAATG--AAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCATTCCAATTCTTTATTAATT-TGAAGATGTTG-GTAATGGATGTTGAGTGTTTGCTGTGTTAAACAGCTCACTTTAAATATATAAGTACATTTAT-TTGAT--AAAT-AAGTGG------AGAAATACTTGGTGTGATA----ATTATCATTCATCAAGGAATGTTAAAGTA------------GTAAAATACTTTGACAGCCA--TTTGAAT---TTCAAGTTGATAGCTTCCTAACCCCA----------ATTTTA-----TAAACTTTTTAGACCTCAAATCA Pucciniastrum_tiliae_MG787123 ATCATTATTAAA---AGTTAAACGAGTGCACTTTATTGTGGCTCAAACATCTTTTAA------CATCAACCCATTTTTTAAACCCAAAGCTGTCTTGTGTGCTTTCTTTATTGAGAGTATAGCATTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGACAATTT-ATTGTT--------CAAGTTGC---ATTACCCCCCCTCATAAGTGACC-CCCCATTTTTTGAAATCATTAACACATTAAAAA-GTTTTAAGAATGTAAACCCCCTTTA---------AAATG--AAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCATTCCAATTCTTTATTAATT-TGAAGATGTTG-GTAATGGATGTTGAGTGTTTGCTGTGTTAAACAGCTCACTTTAAATATATAAGTACATTTAT-TTGAT--AAAT-AAGTGG------AGAAATACTTGGTGTGATA----ATTATCATTCATCAAGGAATGTTGAAGTA------------GTAAAATACTTTGACAGCCA--TTTGAAT---TTCAAGTTGATAGCTTCCTAACCCCA----------ATTTTA-----TAAACTTTTTAGACCTCAAATCA Pucciniastrum_tiliae_MG787124 ATCATTATTAAA---AGTTAAATGAGTGCACTTTATTGTGGCTCAAACATCTTTTAA------CATCAACCCATTTTTTAAACCCAAAGCTGTCTTGTGTGCTTTCTTTATTGAGAGTATAGCATTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGACAATTT-ATTGTT--------CAAGTTGC---ATTACCCCCCCTCATAAGTGACC-CCCCATTTTTTGAAATCATTAACACATTAAAAA-GTTTTAAGAATGTAAACCCCCTTTA---------AAATG--AAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCATTCCAATTCTTTATTAATT-TGAAGATGTTG-GTAATGGATGTTGAGTGTTTGCTGTGTTAAACAGCTCACTTTAAATATATAAGTACATTTAT-TTGAT--AAAT-AAGTGG------AGAAATACTTGGTGTGATA----ATTATCATTCATCAAGGAATGTTAAAGTA------------GTAAAATACTTTGACAGCCA--TTTGAAT---TTCAAGTTGATAGCTTCCTAACCCCA----------ATTTTA-----TAAACTTTTTAGACCTCAAATCA Pucciniastrum_tiliae_MG787125 ATCATTATTAAA---AGTTAAACGAGTGCACTTTATTGTGGCTCAAACATCTTTTAA------CATCAACCCATTTTTTAAACCCAAAGCTGTCTTGTGTGCTTTCTTTATTGAGAGTATAGCATTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGACAATTT-ATTGTT--------CAAGTTGC---ATTACCCCCCCTCATAAGTGACC-CCCCATTTTTTGAAATCATTAACACATTAAAAA-GTTTTAAGAATGTAAACCCCCTTTA---------AAATG--AAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCATTCCAATTCTTTATTAATT-TGAAGATGTTG-GTAATGGATGTTGAGTGTTTGCTGTGTTAAACAGCTCACTTTAAATATATAAGTACATTTAT-TTGAT--AAAT-AAGTGG------AGAAATACTTGGTGTGATA----ATTATCATTCATCAAGGAATGTTGAAGTA------------GTAAAATACTTTGACAGCCA--TTTGAAT---TTCAAGTTGATAGCTTCCTAACCCCA----------ATTTTA-----TAAACTTTTTAGACCTCAAATCA 'Melampsora larici-populina MG787126' ATCATTAATA-------CATGTTGAGCGCACTTTAATGTGACTCTTT----GTATAAAC----CATTACCCC-----CCAAACCCAGAGGTGCATTGTGGCCCGTCAA------AAGGTTAGCAGTGTATCAGTACGTATCTCAAAGGCAACTT---------------TGATTTAC---ATTACCC------ATCATTTACC---------------CCCATTTACAC-TTAAGAA-GTTTTAAGAATGATAACCA------------------TAA-CTATATAACTTTCAGCAATGGATCTCTAGGCTCTCACGTCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGGTTATTCCGAAAGGTACGCCTGTTTGAATGTCACGAAACCCCC-----CTCGGCCCTCATTCTTTCTAAAAGCATGG-GGGACGGATTCTGAGTG-TTGGCGTG-TCAACGCCTCGCTTCAAATAGATTAGCACTTTTGG-ATGGT--ATAC-TATTAGTTCAAAAGACGTACTTGATGTTGTA-TTTATATT---TCATTGAG----GCAGTCTTTGGTCGCTCC---------GACTAT--CCGCTA--ATAGGGCAACTT--GAAGAATAGCTTCCTAACCCTATCAACTTAATTAAGTAATTAATTAATC-TTTAGACTTCAAATCA Thekopsora_nipponica_KC415792 ATCATTATTAAAACAAG--------GTGCACTTAATTGTGACCCCTTATATATGTGAGA----CATCAAACC--ATTTTAAACCCAAAACTGTCTGGTGTGCTTTAAC------GAGTATAGCTTTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGAC--TTT-ATTGTT--------TCAGTTGC---ATTACCCCCCCTCATAAGTTACC-CCTTATTCGCTGAACTCATT-ACAC-TTAAAAA-GTTTTAGGAATGTAAAATACAGAAACTGTTGG--GATATATATATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACGCAGTGAAATGTGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCATAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCATCCTGATTCTTTATTTCGT-TAAGGA-GTTG-GTGATGGATGTTGAGCG-CTGCCG---TGATTGGCTCGCTTTAAATACATAAGTACTTTTA--TTGACAAAAATGAAATGG------ATATTTACTTGGTGTGATATTTAATTATGAATCATCAAGGAGTGTAG---TT------------------AACTCTG-CAGCCA--TTTTGACCATGTT-GGTAAATAGCTTCCTAACCCCC----------ATTGAACCTGTTGACCCTTTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_nipponica_KC415794 ATCATTATTAAAACAAG--------GTGCACTTAATTGTGACCCCTTATATATGTGAGA----CATCAAACC--ATTTTAAACCCAAAACTGTCTGGTGTGCTTTAAC------GAGTATAGCTTTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGAC--TTT-ATTGTT--------TCAGTTGC---ATTACCCCCCCTCATAAGTTACC-CCTTATTCGCTGAACTCATT-ACAC-TTAAAAA-GTTTTAGGAATGTAAAATACAGAAACTGTTGG--GATATATATATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACGCAGTGAAATGTGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAGCGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCATAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCATCCTGATTCTTTATTTCGT-TAAGGA-GTTG-GTGATGGATGTTGAGCG-CTGCCG---TGATTGGCTCGCTTTAAATACATAAGTACTTTTA--TTGACAAAAATGAAATGG------ATATTTACTTGGTGTGATATTTAATTATGAATCATCAAGGAGTGTAG---TT------------------AACTCTG-CAGCCA--TTTTGACCATGTT-GGTAAATAGCTTCCTAACCCCC----------ATTGAACCTGTTGACCCTTTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_rubiae_KC415799 ATCATTATTA-----AATTAAAAGGGTGCACTTCATTGTGACTCTATATAAATTTAAAA----TTATAACCC----TTTAAACCCAAAACTGTCTTGTGTGCTTTAAC------GAGTATAGCATTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGAC--TTT-ATTGTT--------CAAGTTGC---ATTACCCCCCCTTATAAGTGACC-CCTTATTTTTTGAAATCATTAACAC-TTAAAAT-GTTTTTAGAATGTAAAATTGAATCA-TGTCGG--AATT---AAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACGCAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCGTCCTGATTCTTTATTTAGT-TAAGGA-GTTG-GTGACGGATGTTGAGTG-TTGCCG---TAATTGGCTCACTTTAAATACATAAGTACTTTTA--TTGAT--AAAT-AAATGG------AGAAATACTTGGTGTGATA-----TTCTTGATCATCGAGGAGTGTAGGGTTT-------------------ACTCTG-CAGCCA--TTTGAAT---TTT-GATAAATAGCTTCCTAACCCCA----------GATATA-----TGACCC-TTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_rubiae_KC415802 ATCATTATTA-----AATTAAAAGGGTGCACTTCATTGTGACTCTATATAAATTTGAAA----TTATAACCC----TTTAAACCCAAAACTGTCTTGTGTGCTTTAAC------GAGTATAGCATTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGAC--TTT-ATTGTT--------CAAGTTGC---ATTACCCCCCCTTATAAGTGACC-CCTTATTTTTTGAAATCATTAACAC-TTAAAAT-GTTTTTAGAATGTAAAATTGAATCA-TGTCGG--AATT---AAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACGCAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCGTCCTGATTCTTTATTTAGT-TAAGGA-GTTG-GTGACGGATGTTGAGTG-TTGCCG---TAATTGGCTCACTTTAAATACATAAGTACTTTTA--TTGAT--AAAT-AAATGG------AGAAATACTTGGTGTGATA-----TTCTTGATCATCGAGGAGTGTAGGGTTT-------------------ACTCTG-CAGCCA--TTTGAAT---TTT-GATAAATAGCTTCCTAACCCCA----------GATATA-----TGACCC-TTTAGACCTCAAATCA Pucciniastrum_kusanoi_AB221426 ATCATTATTAAA---AGTTAAACGAGTGCACTTTATTGTGGCTCAAAACATCTTTTAA-----CATACACCCATTTTTTAAACCCAAAGCTGTCTTGTGTGCTTTCTTTATTGAGAGTATAGCATTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGACAATTT-ATTGTT--------CAAGTTGC---ATTACCCCCCCTCATAAGTGACC-CCCCATTTTTTGAAATCATTAACACATTAAAAA-GTTTTAAGAATGTAAACCCC------CCTTTA--AAATGA-AAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCATTCCAATTCTTTATTAATT-TGAAGATGTTG-GTAATGGATGTTGAGTGTTTGCTGTGTTAAACAGCTCACTTTAAATATATAAGTACATTTAT-TTGAT--AAAT-AAGTGG------AGAAATACTTGGTGTGATA----ATTATCATTCATCAAGGAATGTTGGAGTA------------GTAAAATACTTTGACAGCCA--TTTGAAT---TTCAAGTTGATAGCTTCCTAACCCCA---------------ATTTTTTAATACCTTTAGACCTCAAATCA Pucciniastrum_tiliae_AB221453 ATCATTATTAAA---AGTTAAACGAGTGCACTTTATTGTGGCTCAAACATCTTTTAA------CATCAACCCATTTTTTAAACCCAAAGCTGTCTTGTGTGCTTTCTTTATTGAGAGTATAGCATTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGACAATTT-ATTGTT--------CAAGTTGC---ATTACCCCCCCTCATAAGTGACC-CCCCATTTTTTGAAATCATTAACACATTAAAAA-GTTTTAAGAATGTAAACCCCCTTTA---------AAATG--AAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCATTCCAATTCTTTATTAATT-TGAAGATGTTG-GTAATGGATGTTGAGTGTTTGCTGTGTTAAACAGCTCACTTTAAATATATAAGTACATTTAT-TTGAT--AAAT-AAGTGG------AGAAATACTTGGTGTGATA----ATTATCATTCATCAAGGAATGTTGAAGTA------------GTAAAATACTTTGACAGCCA--TTTGAAT---TTCAAGTTGATAGCTTCCTAACCCCA----------ATTTTA-----TAAACTTTTTAGACCTCAAATCA Pucciniastrum_tiliae_AB221455 ATCATTATTAAA---AGTTAAACGAGTGCACTTTATTGTGGCTCAAACATCTTTTAA------CATCAACCCATTTTTTAAACCCAAAGCTGTCTTGTGTGCTTTCTTTATTGAGAGTATAGCATTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGACAATTT-ATTGTT--------CAAGTTGC---ATTACCCCCCCTCATAAGTGACC-CCCCATTTTTTGAAATCATTAACACATTAAAAA-GTTTTAAGAATGTAAACCCCCTTTA---------AAATG--AAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCATTCCAATTCTTTATTAATT-TGAAGATGTTG-GTAATGGATGTTGAGTGTTTGCTGTGTTAAACAGCTCACTTTAAATATATAAGTACATTTAT-TTGAT--AAAT-AAGTGG------AGAAATACTTGGTGTGATA----ATTATCATTCATCAAGGAATGTTGAAGTA------------GTAAAATACTTTGACAGCCA--TTTGAAT---TTCAAGTTGATAGCTTCCTAACCCCA----------ATTTTA-----TAAACTTTTTAGACCTCAAATCA Pucciniastrum_agrimoniae_KJ486537 ATCATTATTAAA---AAGTAAAGGAGTGCACTTTATTGTGGCTCTGAACCTTTTAAATA----TATTTAACC--CATTAAAACCCAAAGCTGTTATGTGTGCCTTTTT------TGGTATAGCATCTCAGCAGTAG----TTCA---AC--TTGTGTTGTCTTTTCACATAAGCTCTGACATTACCCCCCTTTATAAGTGACC-CCCTTTTTGTTAATTTGATGAACTCTTTAAAAATGTTTTAAGAATGTAAACCCCTATAA--------AAATT----AATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCATTCCAATTCTTTATTTTATATAAGGA-GTTGTGTAATGGATGTTGAGTG-TTGCGG---TCATTGGCTCACTTTAAATATATAAGTAATTTTAT-TTGAA--AAAATAAATGG------AGCAATACTTGGTGTAATA-TTTATTAT---TCATTGAGGAGTGTGG--TTT------------------AATTACTACAGCCA--TTTGT-----TTCGGATAAATAGCTTCCTAACCCCA-------------------TTTTTCAAATTTAGACCTCAAATCA Pucciniastrum_boehmeriae_AB221449 ATCATTATTAAA---AGTTAAACGAGTGCACTTTATTGTGGCTCAAAACATCTTTTAA-----CATACACCCATTTTTTAAACCCAAAGCTGTCTTGTGTACTTTCTTTATTGAGAGTATAGCATTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGACAATTT-ATTGTT--------CAAGTTGC---ATTACCCCCCCTCATAAGTGACC-CCCCATTTTTTGAAATCATTAACACATTAAAAA-GTTTTAAGAATGTAAACCCC------CCTTTA--AAATGA-AAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCATTCCAATTCTTTATTAATT-TGAAGATGTTG-GTAATGGATGTTGAGTGTTTGCTGTGTTAAACAGCTCACTTTAAATATATAAGTACATTTAT-TTGAT--AAAT-AAGTGG------AGAAATACTTGGTGTGATA----ATTATCATTCATCAAGGAATGTTGGAGTA------------GTAAAATACTTTGACAGCCA--TTTGAAT---TTCAAGTTGATAGCTTCCTAACCCCA---------------ATTTTTTAATACCTTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_nipponica_KC415793 ATCATTATTAAAACAAG--------GTGCACTTAATTGTGACCCCTTATATATGTGAGA----CATCAAACC--ATTTTAAACCCAAAACTGTCTGGTGTGCTTTAAC------GAGTATAGCTTTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGAC--TTT-ATTGTT--------TCAGTTGC---ATTACCCCCCCTCATAAGTTACC-CCTTATTCGCTGAACTCATT-ACAC-TTAAAAA-GTTTTAGGAATGTAAAATACAGAAACTGTTGG--GATATATATATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACGCAGTGAAATGTGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCATAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCATCCTGATTCTTTATTTCGT-TAAGGA-GTTG-GTGATGGATGTTGAGCG-CTGCCG---TGATTGGCTCGCTTTAAATACATAAGTACTTTTA--TTGACAAAAATGAAATGG------ATATTTACTTGGTGTGATATTTAATTATGAATCATCAAGGAGTGTAG---TT------------------AACTCTG-CAGCCA--TTTTGACCATGTT-GGTAAATAGCTTCCTAACCCCC----------ATTGAACCTGTTGACCCTTTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_rubiae_KC415801 ATCATTATTA-----AATTAAAAGGGTGCACTTCATTGTGACTCTATATAAATTTAAAA----TTATAACCC----TTTAAACCCAAAACTGTCTTGTGTGCTTTAAC------GAGTATAGCATTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGAC--TTT-ATTGTT--------CAAGTTGC---ATTACCCCCCCTTATAAGTGACC-CCTTATTTTTTGAAATCATTAACAC-TTAAAAT-GTTTTTAGAATGTAAAATTGAATCA-TGTCGG--AATT---AAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACGCAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCGTCCTGATTCTTTATTTAGT-TAAGGA-GTTG-GTGACGGATGTTGAGTG-TTGCCG---TAATTGGCTCACTTTAAATACATAAGTACTTTTA--TTGAT--AAAT-AAATGG------AGAAATACTTGGTGTGATA-----TTCTTGATCATCGAGGAGTGTAGGGTTT-------------------ACTCTG-CAGCCA--TTTGAAT---TTT-GATAAATAGCTTCCTAACCCCA----------GATATA-----TGACCC-TTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_rubiae_KC415789 ATCATTATTA-----AATTAAAAGGGTGCACTTCATTGTGACTCTATATAAATTTAAAA----TTATAACCC----TTTAAACCCAAAACTGTCTTGTGTGCTTTAAC------GAGTATAGCATTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGAC--TTT-ATTGTT--------CAAGTTGC---ATTACCCCCCCTTATAAGTGACC-CCTTATTTTTTGAAATCATTAACAC-TTACAAT-GTTTTTAGAATGTAAAATTGAATCA-TGTCGG--AATT---AAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACGCAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCGTCCTGATTCTTTATTTAGT-TAAGGA-GTTG-GTGACGGATGTTGAGTG-TTGCCG---TAATTGGCTCACTTTAAATACATAAGTACTTTTA--TTGAT--AAAT-AAATGG------AGAAATACTTGGTGTGATA-TTCAT----GATCATCGAGGAGTGTAGGGTTT-------------------ACTCTG-CAGCCA--TTTGAAT---TTT-GATAAATAGCTTCCTAACCCCA----------GATATA-----TGACCC-TTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_rubiae_KC415790 ATCATTATTA-----AATTAAAAGGGTGCACTTCATTGTGACTCTATATAAATTTAAAA----TTATAACCC----TTTAAACCCAAAACTGTCTTGTGTGCTTTAAC------GAGTATAGCATTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGAC--TTT-ATTGTT--------CAAGTTGC---ATTACCCCCCCTTATAAGTGACC-CCTTATTTTTTGAAATCATTAACAC-TTACAAT-GTTTTTAGAATGTAAAATTGAATCA-TGTCGG--AATT---AAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACGCAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCGTCCTGATTCTTTATTTAGT-TAAGGA-GTTG-GTGACGGATGTTGAGTG-TTGCCG---TAATTGGCTCACTTTAAATACATAAGTACTTTTA--TTGAT--AAAT-AAATGG------AGAAATACTTGGTGTGATA-----TTCGTGATCATCGAGGAGTGTAGGGTTT-------------------ACTCTG-CAGCCA--TTTGAAT---TTT-GATAAATAGCTTCCTAACCCCA----------GATATA-----TGACCC-TTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_rubiae_KC415791 ATCATTATTA-----AATTAAAAGGGTGCACTTCATTGTGACTCTATATAAATTTAAAA----TTATAACCC----TTTAAACCCAAAACTGTCTTGTGTGCTTTAAC------GAGTATAGCATTTCAGTAGTACGC--ATCAGGGAC--TTT-ATTGTT--------CAAGTTGC---ATTACCCCCCCTTATAAGTGACC-CCTTATTTTTTGAAATCATTAACAC-TTACAAT-GTTTTTAGAATGTAAAATTGAATCA-TGTCGG--AATT---AAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACGCAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCCCTCGTCCTGATTCTTTATTTAGT-TAAGGA-GTTG-GTGACGGATGTTGAGTG-TTGCCG---TAATTGGCTCACTTTAAATACATAAGTACTTTTA--TTGAT--AAAT-AAATGG------AGAAATACTTGGTGTGATA-TTCAT----GATCATCGAGGAGTGTAGGGTTT-------------------ACTCTG-CAGCCA--TTTGAAT---TTT-GATAAATAGCTTCCTAACCCCA----------GATATA-----TGACCC-TTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_lanpingensis_KF551220 ATCATTATTA----AAAGTATAAGAGTGCACTTCATTGTGGCT-TGAACCCTTTTAAAACACACATTAACCC----TATAAACCCAAAGTTGTCTAGTGTGCTT----------CGGTATAGCTTTTCAACAGTATGT--TTCA-------TTC-GTCTTT--------TCGGGTGTTCGATTATCCCCCTTTATAAGTGACCTCCTTATTTTTTGAAATCATTATAAC-ACATAAA-GTTTTAAGAATGTAAACCCC----------------CTTA-ATATATAACTTTTAACAATGGATCTCTCGGCTCTCACATCGATGAAGTACACAGTGAATTGTGAAATGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAACCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCATAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCGTCCACATTCTTTATTTGAC-TAAGGA-GTTGTGTGACGGATGTTGAGCG-CTGCCG---TAATTGGCTCGCTTTAAATATATAAGTACTTTTA--TTGAT--AAAT-AAATGG------AGATATACTTGATGTAATAATATTATTTTATTCATTGAGGAGTGCGACTGTA----------------AAAAGGTTG-CAGCCA--TTTGAGT---TTT-GATAAATAGCTTCCTAAACCCA------------TGTTATTCATAACACATTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_lanpingensis_KF551222 ATCATTATTA----AAAGTATAAGAGTGCACTTCATTGTGGCTT-GAACCCTTTTAAAACACACATTAACCC----TATAAACCCAAAGTTGTCTAGTGTGCTT----------CGGTATAGCTTTTCAACAGTATGT--TTCA-------TTC-GTCTTT--------TCGGGTGTTCGATTATCCCCCTTTATAAGTGACCTCCTTATTTTTTGAAATCATTATAAC-ACATAAA-GTTTTAAGAATGTAAACCCCC----------------TTA-ATATATAACTTTTAACAATGGATCTCTCGGCTCTCACATCGATGAAGTACACAGTGAATTGTGAAATGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAACCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCATAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCGTCCACATTCTTTATTTGAC-TAAGGA-GTTGTGTGACGGATGTTGAGCG-CTGCCG---TAATTGGCTCGCTTTAAATATATAAGTACTTTTA--TTGAT--AAAT-AAATGG------AGATATACTTGATGTAATAATATTATTTTATTCATTGAGGAGTGCGACTGTA----------------AAAAGGTTG-CAGCCA--TTTGAGT---TTT-GATAAATAGCTTCCTAAACCCA------------TGTTATTCATAACACATTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_lanpingensis_KF551225 ATCATTATTA----AAAGTATAAGAGTGCACTTCATTGTGGCTT-GAACCCTTTTAAAACACACATTAACCC----TATAAACCCAAAGTTGTCTAGTGTGCTT----------CGGTATAGCTTTTCAACAGTATGT--TTCA-------TTC-GTCTTT--------TCGGGTGTTCGATTATCCCCCTTTATAAGTGACCTCCTTATTTTTTGAAATCATTATAAC-ACATAAA-GTTTTAAGAATGTAAACCCCC----------------TTA-ATATATAACTTTTAACAATGGATCTCTCGGCTCTCACATCGATGAAGTACACAGTGAATTGTGAAATGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAACCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCATAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCGTCCACATTCTTTATTTGAC-TAAGGA-GTTGTGTGACGGATGTTGAGCG-CTGCCG---TAATTGGCTCGCTTTAAATATATAAGTACTTTTA--TTGAT--AAAT-AAATGG------AGATATACTTGATGTAATAATATTATTTTATTCATTGAGGAGTGCGACTGTA----------------AAAAGGTTG-CAGCCA--TTTGAGT---TTT-GATAAATAGCTCCCTAAACCCA------------TGTTATTCATAACACATTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_lanpingensis_KF551224 ATCATTATTA----AAAGTATAAGAGTGCACTTCATTGTGGCTT-GAACCCTTTTAAAACACACATTAACCC----TATAAACCCAAAGTTGTCTAGTGTGCTT----------CGGTATAGCTTTTCAACAGTATGT--TTCA-------TTC-GTCTTT--------TCGGGTGTTCGATTATCCCCCTTTATAAGTGACCTCCTTATTTTTTGAAATCATTATAAC-ACATAAA-GTTTTAAGAATGTAAACCCCC----------------TTA-ATATATAACTTTTAACAATGGATCTCTCGGCTCTCACATCGATGAAGTACACAGTGAATTGTGAAATGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAACCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCATAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCGTCCACATTCTTTATTTGAC-TAAGGA-GTTGTGTGACGGATGTTGAGCG-CTGCCG---TAATTGGCTCGCTTTAAATATATAAGTACTTTTA--TTGAT--AAAT-AAATGG------AGATATACTTGATGTAATAATATTATTTTATTCATTGAGGAGTGCGACTGTA----------------AAAAGGTTG-CAGCCA--TTTGAGT---TTT-GATAAATAGCTTCCTAAACCCA------------TGTTATTCATAACACATTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_sp._TY.2013b_KF551219 ATCATTATTAAA---AGTAAAATGAGTGCACTTTATTGTGGCTCAAACCTCTTTTAAAT----CTTTAACCC--TTTTTAAACCCAAAGCTGTCTTGTGTGCTTCATTTTTTTGAAGTATAGCATTTCAGTAGTACGCA-ATCACGGAC--TTT-ATTGTT--------CATGTTGC---ATTACCCCCCCTTATAAGTGACC-CCTTATTTTTTGAAATCATTAACA--TTAAAAA-GTTTTAAGAATGTAAACCCCCCTTA---------AATTAATATATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCATTCCAATTCTTCATTAACT-TGAAGATGTTG-GTAATGGATGTTGAGTG-CTGCTGTGTTAAACAGCTCACTTTAAATATATAAGTACATTTG--TTGAT--AAAT-AAATGG------AGAAATACTTGGTGTGATA----ATTATCATTCATCGAGGAATGTTGATGTA--------------GTAATACTTTGACAGCCA--TTTGAGT---TTC-AGTAAATAGCTTCCTAACCATA------------TATAATCATTTGAAC-TTTAGACCTCAAATCA Thekopsora_ostryae_KC415796 ATCATTATTAAA---ATGTAAAGGAGAGCACTTTATTGTGACTCTGGAACCTTTAAATA----TAA--------ATTTTAAACCCAAAGCTGTTATGTGTGCCTTTT-------AGGTATAGCATCTCAGTAGTACGT-------------CTTGACTTGT-GTTTACATGAGTTTTGACATTACCCCCC-TTATAAGTGACC-CCCCTTTTTGTTAATTGATGGACTT-TAAATAATGTTTTAAGAATGTAAACCCC----------------CTAA-TAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCATTCTGATTCTTTATTTGATATAAGGA-GTTG-GT-ATGGATGTTGAGTG-TTGCCG---TCATTGGCTCGCTTTAAATACATAAGTACTTTTGTCTTGAA--AAAT-GAATGG------AGAAATACTTGGTGTAATAT----TTATGTTTCATTAAGGAGTGTGGTTTTT-------------------ATACTG-CAGCCA--TTTGT-----TTGGGATAAATAGCTTCCTAACCCTA---------------TTATATTTAAAC-TTTAGACCTCAAATCA ; END; BEGIN TREES; Title ITS_alignment; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE [0] 1 Thekopsora_sp._2_JXJ.2018_MH780989, [1] 2 Thekopsora_sp._1_JXJ.2018_MH780990, [2] 3 Thekopsora_sp._1_JXJ.2018_MH780991, [3] 4 Thekopsora_sp._2_JXJ.2018_MH780992, [4] 5 Thekopsora_sp._2_JXJ.2018_MH780993, [5] 6 Thekopsora_sp._2_JXJ.2018_MH780994, [6] 7 Thekopsora_sp._2_JJ.2018_MG787108, [7] 8 Thekopsora_sp._2_JJ.2018_MG787110, [8] 9 Thekopsora_sp._2_JXJ.2018_MH780995, [9] 10 Thekopsora_sp._2_JXJ.2018_MH780996, [10] 11 Thekopsora_sp._2_JJ.2018_MG787109, [11] 12 Thekopsora_sp._1_JJ.2018_MG787102, [12] 13 Thekopsora_sp._1_JJ.2018_MG787103, [13] 14 Thekopsora_sp._1_JJ.2018_MG787104, [14] 15 Thekopsora_sp._1_JJ.2018_MG787105, [15] 16 Thekopsora_sp._1_JJ.2018_MG787106, [16] 17 Thekopsora_sp._1_JJ.2018_MG787107, [17] 18 Thekopsora_sp._3_JJ.2018_MG787111, [18] 19 Thekopsora_sp._3_JJ.2018_MG787112, [19] 20 Thekopsora_sp._3_JJ.2018_MG787113, [20] 21 Thekopsora_rubiae_MG787114, [21] 22 Thekopsora_rubiae_MG787115, [22] 23 Pucciniastrum_agrimoniae_MG787116, [23] 24 Pucciniastrum_agrimoniae_MG787117, [24] 25 Pucciniastrum_agrimoniae_MG787118, [25] 26 Pucciniastrum_agrimoniae_MG787119, [26] 27 Pucciniastrum_agrimoniae_MG787120, [27] 28 Pucciniastrum_agrimoniae_MG787121, [28] 29 Pucciniastrum_tiliae_MG787122, [29] 30 Pucciniastrum_tiliae_MG787123, [30] 31 Pucciniastrum_tiliae_MG787124, [31] 32 Pucciniastrum_tiliae_MG787125, [32] 33 'Melampsora larici-populina MG787126', [33] 34 Thekopsora_nipponica_KC415792, [34] 35 Thekopsora_nipponica_KC415794, [35] 36 Thekopsora_rubiae_KC415799, [36] 37 Thekopsora_rubiae_KC415802, [37] 38 Pucciniastrum_kusanoi_AB221426, [38] 39 Pucciniastrum_tiliae_AB221453, [39] 40 Pucciniastrum_tiliae_AB221455, [40] 41 Pucciniastrum_agrimoniae_KJ486537, [41] 42 Pucciniastrum_boehmeriae_AB221449, [42] 43 Thekopsora_nipponica_KC415793, [43] 44 Thekopsora_rubiae_KC415801, [44] 45 Thekopsora_rubiae_KC415789, [45] 46 Thekopsora_rubiae_KC415790, [46] 47 Thekopsora_rubiae_KC415791, [47] 48 Thekopsora_lanpingensis_KF551220, [48] 49 Thekopsora_lanpingensis_KF551222, [49] 50 Thekopsora_lanpingensis_KF551225, [50] 51 Thekopsora_lanpingensis_KF551224, [51] 52 Thekopsora_sp._TY.2013b_KF551219, [52] 53 Thekopsora_ostryae_KC415796; TREE PAUP_1 = (33:0.364098,((48:0.0,(49:0.0,50:0.001769,51:0.0):0.0):0.204617,((53:0.08034,((23:0.0,41:0.001829):0.005648,(24:0.0,25:0.0,26:0.0,(27:0.0,28:0.002811):0.002717):0.000000166187):0.078943):0.09645,((52:0.046086,((38:0.0,42:0.001709):0.019605,(30:0.0,32:0.0,39:0.0,40:0.0,(29:0.0,31:0.0):0.003457):0.006734):0.035963):0.083288,((19:0.0,(18:0.0,(20:0.0,(22:0.003627,(37:0.001802,(36:0.0,(44:0.0,(21:0.0,(45:0.0,(46:0.0,47:0.001806):0.0):0.00372):0.0):0.0):0.0):0.0):0.00371):0.0):0.0):0.026914,((1:0.001635,4:0.0,5:0.003291,7:0.0,8:0.0,10:0.003298,11:0.0,(6:0.0,9:0.0):0.001639):0.038779,((34:0.0,35:0.00165,43:0.0):0.04296,(2:0.0,3:0.0,12:0.0,13:0.0,14:0.0,(15:0.0,16:0.0,17:0.00173):0.00348):0.013857):0.066273):0.032897):0.078563):0.028191):0.00000413427):0.364098)[% ] [% ] [% setBetweenBits = selected ]; END;