NEXUS
[File created by TreeBASE:  7/26/07  21:09:50]
[Matrix accession#: M2495]

BEGIN TAXA;
	TITLE M2495;
	DIMENSIONS  NTAX=34;
	TAXLABELS
		Anisophyllea_corneri	Anisophyllea_fallax	Begonia_herbacea	Begonia_oxyloba	Coccinia_sessilifolia	Combretocarpus_rotundatus	Coriaria_myrtifolia	Coriaria_nepalensis	Coriaria_ruscifolia	Coriaria_sarmentosa	Corynocarpus_laevigatus	Datisca_cannabina	Datisca_glomerata	Dendrosicyos_socotranus	Ecballium_elaterium	Gurania_tubulosa	Gynostemma_pentaphyllum	Hillebrandia_sandwicensis	Lagenaria_breviflora	Marah_fabaceous	Neoalsomitra_sarcophylla	Octomeles_sumatrana	Schizopepon_bryoniifolius	Seyrigia_humbertii	Tetrameles_nudiflora	Xerosicyos_danguyi	Fagus_grandifolia	Juglans_nigra	Brexia_madagascariensis	Glycine_max	Larrea_tridentata	Oxalis_stricta	Prunus_persica	Ziziphus_obtusifolia
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M2495;
	DIMENSIONS NCHAR=12073;
	FORMAT SYMBOLS = " A C G T 4 5 6 7 8 9 B D E F H J K L M N P Q R 0 1 2 " MISSING = ? GAP = -  ;
	MATRIX
		Anisophyllea_corneri            GAATAA-ATGAAA-----CTTTGATGAATAACTAATTAATT----TCCTTTCTTTCAGTTATTCCTT--TCCCTTTTTTTGGTCTATTAA-------TAACAAAA-CAGATTTTTCCAATGTATAAAATAAAAATTCCAATGGCTTTTGCTACTATAACCTTCCCGACCACGATTTT--------------------------------TTTCTTTTTTTTTTAGGCATTTCACCT-CAAAATAAGAAA----TTGTATTGATA--------TTAGGTATCAAAAAAA-CATAGT--------AAATAATAAACA-AAATAGAAATAGATAAC-GAAATAGTGGGTTCCATCGTTTCTATGGTTTCTTCTTAA-----ACGGTGAGGTCCTTTCTATACACCGGAGCTACTTCTTTT---------------ATTTAACCAATACTAT{GT}G---TGAACTTGTACA-GTTCACCCTCT-----TCGGCTCTACCCATGAA-----TTATCTGGTAG-TC-GGTCTT-----TCACAATGAGATCCACTTAT-----ACAGTAACGGTAGGTAATTATGAAG-----ATTAGCTGGGTAGCTGACCCTCT-TAGTCCGTTCTTGAAAGAATAGG-----------------GGCTATAA------TCTTT-CGGTTAAATAGT-----ATTTCCTCCGCTTAATGGATAA----ACATTTG-----TTACCAAT-----GGAGAATTCTTTCTCATCTTAAATTGAA--------AATTGAGGTGATTGGGTTT-------GCACCAATAGAAACCATAAATTT-A-ATA--CACAATA--------------CAAGGATACAATAAATCTTTGTTTTT---AGA--------------TTTTAGATAG--TGAATGGAGTTCTTC----CATTCTATCCTAT--------TCACTGGTATTA-----ATCACTGATACTGGAAAAATTTTTTCTTTTCTTTTGTCCCAGTCC1001110210111111110?GACTTAATT-----GAGCTTTGGTATGG-AAACCT-ACCAAGTGATAATTTTCAAATTCAGAGAAACCCTAGAATTAAAAATGGGCAATCCTGAGCCAAA------TCCTATTTTCTGA---AAATAAAT-----AAAGGTTTC----GAAAAAGAGAAAAAA---------------GGGTAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTA------ACAAATGGAG-----TTGATTGTGTT-GCATT?--CATTAGTAAA------GG-----AATCATTTCAGTGAAAGACCTTAAAG-----GATGAAAGATAAACCTATA--------------?????GTACTGAAATACTATTT-CAAA-----TGATT-----AATGATGATCCGAATCTGGATTGTTATTTT---------TACAACA-----------------------------AATAATATATGAAAAATGAA--CGAATTGTTGTGAATCGATTTCAATTTCAATCTCCAAGTTAAAAACAGAATCGAATATTCATTGATCAAAT--CATTCACTCCATTATA-ATAGTCTAATAGATCTTTT------GAAGAACTGATTAATCAGACGAAAATAGAATAAAGATAGAGTCCCATTTTACG-TGTCAATCCTGACAAAAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTAAAAAA-?TCGTG?GGGTTCAAGTCCC-TC-TATCCCCAAAA----CCTT-----AAA???GACCGTAAATTT---CTTTCTTAT-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTTATCACAAGTCTT---------------GTG?-------TATATATGATACACGTACAACTGAACGTACTTGAGCAAGGAATCCTGATTT-CCAATTTGAA-TGATTA------ACAATCCATATCATTTGTCTACTGTATTGAAACTTTC---AAAGTCTTCTTTTT----------GAAG--ATACAAGAAATTCCGGGGCTTGGATA----AGACTTTAGAATCCCTTTTTT-?--TATTTTTAATT-------GACATAGACCCAAGTCGTCTATTAAAA--TATTAAAATA---AGTATGA-TGCCCCAGAAAAGGTCGGGATAGCTCAGTTGGTAGAGCA??????????????0011111020011011011????100111011T0101TTTGGGTATGGGTTCTTATCGAGCTGCTTTATTTCATTTGATTACTCACGCTTATTCGAAAGCTTTATTGTTTTTAGGATCCGGATCAATTATTCATTCAATGGAACCCGTTGTTGGATATTCTCCAGACAAAAGTCAGAATATGGGTCTTATGGGCGGTTTAAGAAAGCATGTTCCACTTACAAAAAATGCTTTTTTATTAGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCACCCCTTGCCTGCTTTTGGTCCAAAGATGAAATTCTTAATGATAGTTGGTTGTATTCACCAATTTTTGGAATAATAGCTTGTTCTACTGCGGGATTAACCGCATTTTATATGTTTCGTATCTATTTACTTACTTTTGAAGGACATTTCAACTTTCATTTTAAAAATTACAGCGGAAAAATAAAGAATTCCCTTTATTCAATATCTTTATGG------GGTAAAGAAGGCTCAAAAACCGTTAAAAAAGACTTTGGTTTATTATCGTTATTAACAATG------------AATAATAATGAAAGGTCTTCTTTT---------TTTTGGAAAAAGATG---TATCGACTTGAGAGAAATGTAAGATAT------ATGATGCGACCCTGTCTTTCTATTCCATATTTTGGTACT01111-------GTTTCCACACTTGAAAAAAAAAACTTGGGACGTATCGCTCAAATTATTGGTCCGGTACTGGATGTAGCTTTTCCACCGGGCAAAATGCCTAATATTTACAACGCTCTAGTAGTTAAGGGGCGAGATACTGTCGGTCAACAAATTAATGTGACTTGTGAAGTACAGCAATTATTAGGAAATAATCGAGTTAGAGCTGTAGCTATGAGTGCTACAGATGGTCTAACGAGAGGAATGGAAGTGATTGACACGGGGGCTCCCCTAAGTGTTCCAGTCGGTGGAGCGACTCTAGGACGAATTTTCAACGTGCTGGGGGAGCCTATTGATAATTTGGGTCCTGTAGATACTCGCACAACATCTCCTATTCATAGATCTGCGCCCGCCTTTATACAGTTAGACACAAAATTATCCATTTTTGAAACAGGAATTAAAGTAGTAGATCTTTTAGCCCCTTATCGCCGTGGAGGAAAAATAGGACTATTTGGGGGAGCTGGAGTGGGTAAAACAGTACTCATTATGGAATTGATCAACAACATTGCCAAAGCTCACGGGGGTGTATCCGTATTTGGTGGAGTAGGTGAACGTACTCGTGAAGGAAATGATCTTTACATGGAAATGAAAGAATCTGGAGTAATTAATGAACAAAATATTGCAGAATCGAAAGTGGCTCTAGTTTACGGTCAGATGAATGAACCGCCAGGAGCTCGTATGAGAGTTGGGTTAACTGCCCTAACTATGGCGGAATATTTCCGAGATGTTAATAAACAAGACGTGCTTCTATTTATAGACAATATCTTCCGTTTCGTCCAAGCGGGATCGGAAGTATCTGCCTTACTGGGTAGAATGCCTTCTGCTGTGGGTTATCAACCCACTCTTAGTACCGAAATGGGTTCTTTACAAGAAAGAATTACTTCTACCAAAAAAGGGTCCATAACTTCTATCCAAGCGGTTTATGTACCTGCGGACGATTTGACCGATCCTGCTCCTGCCACGACATTTGCACATTTAGATGCTACTACCGTACTATCAAGAGGATTAGCTGCCAAAGG{CT}ATTTATCCGGCAGTAGATCCTTTAGATTCAACATCAACTATGCTACAACCTCGGATCGTTGGTGAAGAACATTATGAAACTGCGCAAAGAGTTAAACAAACTTTACAACGTTACAAAGAACTTCAGGACATTATAGCTATCCTTGGGTTGGACGAATTATCCGAAGAGGATCGCTTAATCGTAGCAAGAGCACGAAAAATTGAGCGTTTCTTATCACAACCTTTTTTCGTAGCAGAAGTATTTACCGGTTCTCCGGGAAAATATGTTGGTCTATCAGAAACGATTAGAGGGTTTCAATTAATCCTTTCCGGAGAATTAGATAGTCTTCCTGAACAAGCCTTTTATTTGGTAGGTAACATCGATGAAGCTACTGCGAAGGCTACAAACTTA------GAAATGGGGAGCAAATTGAATAA??????????????????????????AAGTGTTGGATTCAAAGCTGGTGTTAAAGATTATAAATTAACTTATTATACTCCTGAGTATCAAACCAAGGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCCGGAGTTCCACCGGAAGAAGCAGGTGCCGCTGTAGCTGCTGAATCTTCTACCGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGTCTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTATGGCATCGAGCCTGTTCCCGGAGAAGAAAGTCAATTTATTGCTTATGTAGCTTATCCCTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCCGTTACCAACATGTTTACTTCCATTGTGGGTAATGTATTTGGGTTCAAAGCCCTGCGCGCTCTACGTCTGGAGGATTTACGAATCCCTCCTGCTTATGTTAAAACTTTCCTAGGGCCACCTCATGGTATCCAAGTTGAAAGAGATAAATTGAACAAGTATGGCCGCCCCCTATTGGGATGTACTATTAAACCT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		Anisophyllea_fallax             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		Coccinia_sessilifolia           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		Combretocarpus_rotundatus       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		Coriaria_myrtifolia             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		Coriaria_nepalensis             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		Corynocarpus_laevigatus         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		Dendrosicyos_socotranus         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		Ecballium_elaterium             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		Gynostemma_pentaphyllum         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		Hillebrandia_sandwicensis       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		Schizopepon_bryoniifolius       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		Seyrigia_humbertii              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		Fagus_grandifolia               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		Brexia_madagascariensis         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		Prunus_persica                  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		Ziziphus_obtusifolia            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BEGIN ASSUMPTIONS;
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 . 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 
 1 . 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 
 1 1 . 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 
 1 1 1 . 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 
 1 1 1 1 . 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 
 1 1 1 1 1 . 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 
 1 1 1 1 1 1 . 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 
 1 1 1 1 1 1 1 . 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 
 1 1 1 1 1 1 1 1 . 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 
 1 1 1 1 1 1 1 1 1 . 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 
 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 . 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 
 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 . 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 
 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 . 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 
 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 . 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 
 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 . 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 
 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 . 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 
 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 . 1 1 1 1 1 1 1 1 1 
 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 . 1 1 1 1 1 1 1 1 
 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 . 1 1 1 1 1 1 1 
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