#NEXUS [ Title ] begin taxa; dimensions ntax=50; taxlabels Polystichum_mohrioides3_1596 Polystichum_mohrioides2_1582 Polystichum_mohrioides1_1604 Polystichum_plicatum3_302 Polystichum_plicatum2_293 Polystichum_plicatum1_288 Polystichum_chilense Polystichum_multifidum2_370 Polystichum_platyphyllum Polystichum_montevidense Polystichum_andinum Polystichum_subintegerrimum3_371 Polystichum_subintegerrimum1_166065 Polystichum_subintegerrimum2_251 Polystichum_multifidum1_306 Polystichum_cystostegia Polystichum_vestitum Polystichum_proliferum Polystichum_fallax Polystichum_tetragonum Polystichum_caudescens Polystichum_transkeiense Polystichum_rhizophyllum Polystichum_concinnum Polystichum_dubium Polystichum_lehmannii Polystichum_hartwegii Polystichum_lonchitis Polystichum_orbiculatum Polystichum_pungens Polystichum_talamancanum Polystichum_acrostichoides Polystichum_dudleyi Polystichum_lemmonii Polystichum_munitum Polystichum_scopulinum Polystichum_altum Polystichum_lentum Polystichum_chunii Polystichum_disjunctum Polystichum_semifertile Polystichum_longipaleatum Polystichum_punctiferum Polystichum_stenophyllum Polystichum_tripteron Cyrtomium_macrophyllum Phanerophlebia_nobilis Arachniodes_denticulata Dryopteris_intermedia Ctenitis_eatonii ; end; begin characters; dimensions nchar=1032; format missing=? gap=- matchchar=. datatype=nucleotide; matrix Polystichum_mohrioides3_1596 TTACGGGTAAGAGTGAAACACCCAACTTGGGAGAATTTCGAGTTGCTACCGATCAATCAG CTTCGAAAAAAATTTCTCAATTCTGCGTGCGTTTGGGGGCCAAACAAAGATTACGTTTCA ATTATGGATTGACGGAACGCTAACTACTAAAATACGTGCGTATCGCTAGAAAAACTAAGG GTTCAACGGGCCAGGTACCACTGCAATTACTCGAGATGCGTCTAGACAATGTGATTTTTC ACTTAGGTATGGCTTCCACGATTCCAGCCGCTAGACAGTTAGTTAATCACAGACATATTT TAGTGAACAATCGTATTGTAGATATACCAAGTTATCGCCGTAAGCCAAGAGATATTATTA CTGTTCGAAATCGGCCAACTTCCTGTAATGCACTGAAGGGTAAGTTTCCCGGAGGGGACA ACCCACCGGATCACTTGGCCGTTTCTCTATCAGAAGGCAACAGGCCAACAGGATTGGTGA ATCGTATCGCCAGTCGAGAATCCGTCAATTTGAATATAAATGAATTGTTAGTTGTTGAGT TATTACTCCCGCAAAGCTTAGTGATCATTTATTAAATTAATAATTTAATCGAAAAAA-TG AATCAGAAAAATTGGAGGTCTCTGCAATGGAAACCTAAGCAAAGGA----CTTGAGA-TG ATGAAATTA----AATAAGCAGATTACTTA-GGAAG----TGGCAAAAGTTTTTTAATCT AGCTTGTTCCTTTATTTGGGGCAAAAATGAAATCATAATAATTTACTTTATAGAACTATT CTACTTCTGAGCAAATTAATTTAGTACATGA---AGTATCTGAATTACCCGTCCACATCA CTTCAACTAAATCCGTACTGAGGGATTACCTAT-------------------------TT ATTTTTATTGTTTCTACTGAGACGATCCTTCGGCT-----AAAGTTGGATGACTTGATTT GAAATCCCGACTCCAGCCCGTCTTCTTCAAATCGGCAATTTAGCTAGATTCCGGTGAGGA AAGGGAAAATAA Polystichum_mohrioides2_1582 TTACGGGTAAGAGTGAAAC?CCCAACTTGGGAGAATTT?GAGTTGCTACCGATCAATCAG CTTCGAAAAAAATTTCTCAATTCTGCGTGCGTTTGGGGGCCAAACAAAGATTACGTTTCA ATTATGGATTGACGGAACGCTAACTACTAAAATACGTGCGTATCGCTAGAAAAACTAAGG GTTCAACGGGCCAGGTACCACTGCAATTACTCGAGATGCGTCTAGACAATGTGATTTTTC ACTTAGGTATGGCTTCCACGATTCCAGCCGCTAGACAGTTAGTTAATCACAGACATATTT TAGTGAACAATCGTATTGTAGATATACCAAGTTATCGCCGTAAGCCAAGAGATATTATTA CTGTTCGAAATCGGCCAACTTCCTGTAATGCACTGAAGGGTAAGTTTCCCGGAGGGGACA ACCCACCGGATCACTTGGCCGTTTCTCTATCAGAAGGCAACAGGCCAACAGGATTGGTGA ATCGTATCGCCAGTCGAGAATCCGTCAATTTGAATATAAATGAATTGTTAGTTGTTGAGT TATTACTCCCGCAAAGCTTAGTGATCATTTATTAAATTAATAATTTAATCGAAAAAA-TG AATCAGAAAAATTGGAGGTCTCTGCAATGGAAACCTAAGCAAAGGA----CTTGAGA-TG ATGAAATTA----AATAAGCAGATTACTTA-GGAAG----TGGCAAAAGTTTTTTAATCT AGCTTGTTCCTTTATTTGGGGCAAAAATGAAATCATAATAATTTACTTTATAGAACTATT CTACTTCTGAGCAAATTAATTTAGTACATGA---AGTATCTGAATTACCCGTCCACATCA CTTCAACTAAATCCGTACTGAGGGATTACCTAT-------------------------TT ATTTTTATTGTTTCTACTGAGACGATCCTTCGGCT-----AAAGTTGGATGACTTGATTT GAAATCCCGACTCCAGCCCGTCTTCTTCAAATCGGCAATTTAGCTAGATTCCGGTGAGGA AAGGGAAAATAA Polystichum_mohrioides1_1604 TTACGGGTAAGAGTGAAACACCCAACTTGGGAGAATTTCGAGTTGCTACCGATCAATCAG CTTCGAAAAAAATTTCTCAATTCTGCGTGCGTTTGGGGGCCAAACAAAGATTACGTTTCA ATTATGGATTGACGGAACGCTAACTACTAAAATACGTGCGTATCGCTAGAAAAACTAAGG GTTCAACGGGCCAGGTACCACTGCAATTACTCGAGATGCGTCTAGACAATGTGATTTTTC ACTTAGGTATGGCTTCCACGATTCCAGCCGCTAGACAGTTAGTTAATCACAGACATATTT TAGTGAACAATCGTATTGTAGATATACCAAGTTATCGCCGTAAGCCAAGAGATATTATTA CTGTTCGAAATCGGCCAACTTCCTGTAATGCACTGAAGGGTAAGTTTCCCGGAGGGGACA ACCCACCGGATCACTTGGCCGTTTCTCTATCAGAAGGCAACAGGCCAACAGGATTGGTGA ATCGTATCGCCAGTCGAGAATCCGTCAATTTGAATATAAATGAATTGTTAGTTGTTGAGT TATTACTCCCGCAAAGCTTAGTGATCATTTATTAAATTAATAATTTAATCGAAAAAA-TG AATCAGAAAAATTGGAGGTCTCTGCAATGGAAACCTAAGCAAAGGA----CTTGAGA-TG ATGAAATTA----AATAAGCAGATTACTTA-GGAAG----TGGCAAAAGTTTTTTAATCT AGCTTGTTCCTTTATTTGGGGCAAAAATGAAATCATAATAATTTACTTTATAGAACTATT CTACTTCTGAGCAAATTAATTTAGTACATGA---AGTATCTGAATTACCCGTCCACATCA CTTCAACTAAATCCGTACTGAGGGATTACCTAT-------------------------TT ATTTTTATTGTTTCTACTGAGACGATCCTTCGGCT-----AAAGTTGGATGACTTGATTT GAAATCCCGACTCCAGCCCGTCTTCTTCAAATCGGCAATTTAGCTAGATTCCGGTGAGGA AAGGGAAAATA- Polystichum_plicatum3_302 ???????????????????????????????????????????????????????????? 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