NEXUS
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[Matrix accession#: M179c3x5x98c11c52c38]

BEGIN TAXA;
	TITLE M179c3x5x98c11c52c38;
	DIMENSIONS  NTAX=29;
	TAXLABELS
		Cronartium_quercuum_echinatae	Cronartium_comptoniae	Peridermium_Powell_limb_r.	Peridermium_Inyo_limb_r.	Cronartium_Stalactiform_limb_r.	Cronartium_arizonicum	Cronartium_coleosporioides_ID	Cronartium_coleosporioides_CO	Peridermium_white_sp._gall_r.	Peridermium_yellow_sp._gall_r.	Cronartium_ribicola_Korea	Cronartium_ribicola_CA	Cronartium_strobilinum	Cronartium_quercuum_virginianae	Peridermium_harknessii	Cronartium_quercuum_fusiforme	Cronartium_on_Quercus_agrifolia	Cronartium_on_Lithocarpus	Cronartium_conigenum	Cronartium_comandrae_AZ	Cronartium_comandrae_MT	Cronartium_comandrae_SE	Peridermium_bethelii	Cronartium_occidentale	Cronartium_appalachianum	Cronartium_flaccidum	Peridermium_pini	Pucciniastrum_goeppertianum	Chrysomyxa_arctostaphyli
	;
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BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M179c3x5x98c11c52c38;
	DIMENSIONS NCHAR=789;
	FORMAT  MISSING=? GAP=- SYMBOLS= " N X A T G C 0 1 2 3 4";
	MATRIX
		Cronartium_quercuum_echinatae         ATTAAAAA-----G-CAAAGGAGTGCACTTAATT--GTGGCTCTGAACCTTTTA-AATATA-TTTAAACCCATTCTX-------AAAAX----------CTCAAAGTTGTTATGTGTGCC---------TTTTTTGXGTATAGCATCTCAGCAGTAATGTCACCTTGTG--CTG--TTCTTTCACATAAGCCCTGAAAATTACCCCCCXTTTAAAAGTGACCCC---------TTTTTTTTGTTA-----XAATACTCTTTATAAAAATGTTTTTAAGAATGT--AAG--X--CCCC-TTTAAAAAA----TAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGC-CCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCAT--GAAA---CCCTCTCATTCCAATTCTTTATTT------TATATAA-GGA--TTTGTGTAATGGATGTTGAGTGTTGCTGTCAT-----------TGGCTCACTTTAAA-XTATATAAGTACTTTTATTTG-----------------AAAAATAAATAAATGGAGTAATACTTGGTGTAATATTTA--TTATTCATTGAGGA-XGTG--TAGTT---TAATTACT-ACAGCCATTT--GTTTCAGAT--AAATAGCTTCCTAAXCCCC--------ATTTTATCTTCAATTTTX-AGACCTCAAATCAGG--110
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		Peridermium_Powell_limb_r.            ATTAAAAA-----G-CAAAGGAGTGCACTTTATT--GTGGCTCTGAACCTTTTA-AATATA-TTTTAACCCATTTTX-------AAAAX----------CCCAAAGTTGTTGTGTGTGCC---------TTTTTTGXGTATAGCATCTCAACAGTAXTGTTAACTTGTG--TTG--TTGTTTCACATGAGCTCTGACXATTACCCCCCXTTTATAAGTGACCXX-----------TTTTTTGTTATTATTAGTTACTCX---X-AAAATGTTTTTAAGAATGT--AAA--X--CCCC-TTTAAAA------AAAXATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCAAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCAT--GAAA---CCCTCTCATTCCAATCCTTATATTT-----TATATAA-GGAA-TTTGTGTAATGGATGTTGAGTGTTGCTGTCAT-----------TAGCTCACTTTAAATATATATAAGTACTTTTATTTG--------------------------AAAATGGAGTAATACTTGGTGTAATATTTA--TTATTCATTGAGGA-XGTG--TAGTT------XTACT-ACAGCCATTT--GTTTCAGAT--AAATAGCTTCCTAAXCCCCCCCCC---ATTTTTTTTTCAATTTTX-AGACCTCAAATCAGG--4--
		Peridermium_Inyo_limb_r.              ATTAAAAA-----G-CAAAGGAGTGCACTTTATT--GTGGCTCTGAACCTTTTA-AATATA-TTTTAACCCATTTTX-------AAAAX----------CCCAAAGTTGTTGTGTGTGCC---------TTTTTTGXGTATAGCATCTCAACAGTAXTGTTAACTTGTG--TTG--TTGTTTCACATGAGCTCTGACXATTACCCCCCXTTTATAAGTGACCXX-----------TTTTTTGTTATTATTAGTTACTCX---X-AAAATGTTTTTAAGAATGT--AAA--X--CCCC-TTTAAAAA-----AAAXATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCAAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCAT--GAAA---CCCTCTCATTCCAATCCTTATATTT-----TATATAA-GGAA-TTTGTGTAATGGATGTTGAGTGTTGCTGTCAT-----------TAGCTCACTTTAAATATATATAAGTACTTTTATTTGAAGAAAAAAAATAAAATAAAATAAAATAAATGGAGTAATACTTGGTGTAATATTTA--TTATTCATTGAGGA-XGTG--TAGTT------XTACT-ACAGCCATTT--GTTTCAGAT--AAATAGCTTCCTAAXCCCCCCC------ATTTTTTTTCAATTTTX-AGACCTCAAATCAGG-----
		Cronartium_Stalactiform_limb_r.       ATTAAAAA-----G-TAAAGGAGTGCACTTTATT--GTGGCTCTGAACCTTTTA-AATATA-TTTTAACCCATTTTX-------AAAAX----------CCCAAAGTTGTTGTGTGTGCC--------TTTTTTTGXGTATAGCATCTCAACAGTAXTGTTAACTTGTG--TTG--TTGTTTCACATGAGCTCTGACXATTACCCCCCCTTTATAAGTGACCXX---------TTTTTTTTGTTATTATTAGTTACTCX---X-AAAATGTTTTTAAGAATGT--AAA--X--CCCC-TTTAAAA------AAAXATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCAAATCTTTGAATGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCAT--GAAA---CCCTCTCATTCCAATTCTTATATTT-----TATATAA-GGAA-TTTGTGTAATGGATGTTGAGTGTTGCTGTCAT-----------TAGCTCACTTTAAATATATATAAGTACTTTTATTTG---------------AAAAATATATATATATGGAGTAATACTTGGTGTAATATTTA--TTATTCATTGAGGA-XGTG--TAGTT------XTACT-ACAGCCATTT--GTTTCAGAT--AAATAGCTTCCTAAXCCCCCC--------ATTTTTTTCAATTTTX-AGACCTCAAATCAGG0-4--
		Cronartium_arizonicum                 ATTAAAAA-----G-CAAAGGAGTGCACTTTATT--GTGGCTCTGAACCTTTTA-AATATA-TTTTAACCCATTTTX-------AAAAX----------CCCAAAGTTGTTGTGTGTGCC---------TTTTTTGXGTATAGCATCTCAACAGTAXTGTTAACTTGTG--TTG--TTGTTTCACATGAGCTCTGACXATTACCCCCCXTTTATAAGTGACCXX-----------TTTTTTGTTATTATTAGTTACTCX---X-AAAATGTTTTTAAGAATGT--AAA--X--CCCC-TTTAAA-------AAAXATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCAAATCTTTGAATGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCAT--GAAA---CCCTCTCATTCCAATCCTTATATTT-----TATATAA-GGAA-TTTGTGTAATGGATGTTGAGTGTTGCTGTCAT-----------TAGCTCACTTTAAATATATATAAGTACTTTTATTTG-------------------AAAAAAATAAATGGAGTAATACTTGGTGTAATATTTA--TTATTCATTGAGGA-XGTG--TAGTT------XTACT-ACAGCCATTT--GTTTCAGAT--AAATAGCTTCCTAAXCCCCCCCCC--ATTTTTTTTTTCAATTTTX-AGACCTCAAATCAGG---0-
		Cronartium_coleosporioides_ID         ATTAAAAA-----G-CAAAGGAGTGCACTTTATT--GTGGCTCTGAACCTTTTA-AATATA-TTCTAACCCATTTTX-------AAAAX----------CCCAAAGTTGTTATGTGTACC---------TTTTTTGGGTATAGCATCTCAACAGTAXCGTTAACTTGTG--TTG--TTGTTTCACATGAGCTCTGACXATTACCCCCCCTTTATAAGTGACCXX-----------TTTTTTATTATTATTAATTACTCX---X-AAAATGTTTTTAAGAATGT--AAA--X--CCCT-TTTAAAAAATAT-ATATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCAAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCAT--GAAA---CCCTCTCATTCCAATTCATTATTT------TATATAA-TGA--TTTGTGTAATGGATGTTGAGTGTTGCTGTCAT-----------TAGCTCACTTTAAA-XTATATAAGTACTTTTATTTG-------------------AAAAAAATAAATGGAGTAATACTTGGTGTAATATTTA--TTATTCATTGAGGA-XGTG--TAGTT---T--ATACT-ACAGCCATTT--GTTTCAGAT--AAATAGCTTCCTAAXCCCTC----ATTATTTTTTTTTCAATTTTX-AGACCTCAAATCAGG--301
		Cronartium_coleosporioides_CO         ATTAAAAA-----G-CAAAGGAGTGCACTTTATT--GTGGCTCTGAACCTTTTA-AATATA-TTCTAACCCATTTTX-------AAAAX----------CCCAAAGTTGTTATGTGTACC---------TTTTTTGGGTATAGCATCTCAACAGTAXCGTTAACTTGTG--TTG--TTGTTTCACATGAGCTCTGACXATTACCCCCCCTTTATAAGTGACCXX-----------TTTTTTATTATTATTAATTACTCX---X-AAAATGTTTTTAAGAATGT--AAA--X--CCCC-TTTAAAAAATAT-ATATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCAAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCAT--GAAA---CCCTCTCATTCCAATTCATTATTT------TATATAA-TGA--TTTGTGTAATGGATGTTGAGTGTTGCTGTCAT-----------TAGCTCACTTTAAA-XTATATAAGTACTTTTATTTG-------------------AAAAAAATAAATGGAGTAATACTTGGTGTAATATTTA--TTATTCATTGAGGA-XGTG--TAGTT---T--ATACT-ACAGCCATTT--GTTTCAGAT--AAATAGCTTCCTAAXCCCTC----ATTATTTTTTTTTCAATTTTX-AGACCTCAAATCAGG--301
		Peridermium_white_sp._gall_r.         ATTAAAAA-----G-CAAAGGAGTGCACTTAATT--GTGGCTCTGAACCTTTTA-AATATA-TTTTAACCCATTTTX-------GAAAX----------CCAAAAGTTGTTATGTGTGCC---------TTTTTTGXGTATAGCATCTCAACAGTAXTGTCAACTTGTG--TTG--TTGTTTCACATGAGCTCTGACATTTACCCCCCCCCC------------TTTTTTATTTTTATTTTATCTATTATAATTACTCTTTATAAAAATGTTTTTAAGAATGTATAAA--X--CCCC-TTTAAAAAA----TAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATTGAATCTTTGAATGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCAT--GAAA---CCCTCTCATTCCAATTCTTTATTT------TATATAA-GGA--TTTGTGTAATGGATGTTGAGTGTTGCTGTCAT-----------TGGCTCACTTTAAA-XTATATAAGTACTTTTATTTG-------------------AAAAAAATAAATGGAGTAATACTTGGTGTAATATTTA--TTATTCATTGAGGA-XGTG--TAGTT---TAATTACT-ACAGCCATTT--GTTTCAGAT--AAATGGCTTCCTAAXCCCC--------ATTTTATTTTCAATTTTX-AGACCTCAAATCAGG-3100
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		Cronartium_ribicola_Korea             ATTAAAAA-----G-CAAAGGAGTGCACTTTATT--GTGGCTCTAAACCTTTTA-AATATA-TTTTAACCCATTTTX-------AAAAX----------CCCAAAGTTGTTATGTGTGCC---------TTTTTTGXGTATAGCATCTCAACAGTAXCGTTAACTTGTG--TTG--TTGTTTCACATGAGCTCTGACXATTACCCCCCXTTTATAAGTGACCCCCC---------TTTTTTGTTA-----XATTACTCTTCATAAAAATGTTTTTAAGAATGT--AAA--X--CCCC-TTTAAAAAAA---TGATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATTGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCAT--GAAA---CCCTCTCATTCCAATTCTTTACCT------TATATAA-GGA--GTTGTGTAATGGATGTTGAGTGTTGCTGTCAT-----------TGGCTCACTTTAAA-XTATATAAGTACTTTTATTTG-----------------AAAATAAAATAAATGGAGTAATACTTGGTGTAATATTTA--TTATTCATTGAGGA-XGTG--TAGTT---TAATTACT-ACAGCCATTT--GTTTCAGAT--AAATAGCTTCCTAAXCCAC-------------ATTTTCAATTTTX-AGACCTCAAATCAGG--2--
		Cronartium_ribicola_CA                ATTAAAAA-----G-CAAAGGAGTGCACTTTATT--GTGGCTCTAAACCTTTTA-AATATA-TTTTAACCCATTTTX-------AAAAX----------CCCAAAGTTGTTATGTGTGCC---------TTTTTTGXGTATAGCATCTCAACAGTAXCGTTAACTTGTG--TTG--TTGTTTCACATGAGCTCTGACXATTACCCCCCXTTTATAAGTGACCCCCCC-------TTTTTTTGTTA-----XATAACTCTTTATAAAAATGTTTTTAAGAATGT--AAA--X--CCCC-TTTAAAAAAA---AAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATTGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCAT--GAAA---CCCTCTCATTCCAATTCTTTATTT------TATATAA-GGA--GTTGTGTAATGGATGTTGAGTGTTGCTGTCAT-----------TGGCTCACTTTAAA-XTATATAAGTACTTTTATTTG-------------------AAAAAAATAAATGGAGTAATACTTGGTGTAATATTTA--TTATTCATTGAGGA-XGTG--TAGTT---TAATTACT-ACAGCCATTT--GTTTCAGAT--AAATAGCTTCCTAAXCCAC-------------ATTTTCAATTTTX-AGACCTCAAATCAGG--20-
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		Cronartium_quercuum_fusiforme         ATTAAAAA-----G-CAAAGGAGTGCACTTAATT--GTGGCTCTGAACCTTTTA-AATATA--TTTAACCCATTCTX-------AAAAX----------CTCAAAGTTGTTATGTGTGCC---------TTTTTTGXGTATAGCATCTCAGCAGTAXTGTCACCTTGTG--CTG--TTATTTCACATGAGCTCTGACAATTACCCCCCXTTTATAAGTGACCXX-------TTTTTTTTT-GTTA-----XAATACTCTTTATAAAAATGTTTTTAAGAATGT--AAA--X--CCCC-TTTAAAAAA----TAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATTGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCAT--GAAA---CCCTCTCATTCCAATTCTTTATTT------TATATAA-GGA--TTTGTGTAATGGATGTTGAGTGTTGCTGTCAT-----------TGGCTCACTTTAAA-XTATATAAGTACTTTTATTTG-----------------AAAAATAAATAAATGGAGTAATACTTGGTGTAATATTTA--TTATTCATTGAGGA-XGTG--TAGTT---TAATTGCT-ACAGCCATTT--GTTTCAGAT--AAATAGCTTCCTAAXCCCC--------ATTTTATCTTCAATTTTX-AGACCTCAAATCAGG-2110
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		Cronartium_conigenum                  ATTAAAAA-----G-CAAAGGAGTGCACTTCATT--GTGGCTCTGAACCTTTTA-AATATA-TTTTAACCCATTTTX-------AAAAX----------CTCAAAGTTGTTATGTGTGCC---------TTTTTTGXGTATAGCATCTCAGCAGTAXTGTCAACTTGTG--TTG--TTGTTTCACATGAGCTCTGGCAATTACCCCCCXTTTATAAGTGACCCC----ATTTTTTTTCTTTATTA-----XATTACTCTTTATAAAAATGTTTTTAAGAATGT--AAA--X--CCCC-TTTAAAAAAAA--TAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCAT--GAAA---CCCTCTCATTCCAATTCTTTATTT------TATATAA-GGA--TTTGTGTAATGGATGTTGAGTGTTGCTGTCAT-----------TGGCTCACTTTAAA-XTATATAAGTACTTTTATTTX-----------------------AAATGAATGGAGTAATACTTGGTGTAATATTTA--TTATTCATTGAGGA-XGTG--TAGTT---TAATTACT-ACAGCCATTT--GTTTCAGAT--AAATAGCTTCCTAAXCCCC--------ATTTTATCTTCAATTTTX-AGACCTCAAATCAGG---20
		Cronartium_comandrae_AZ               ATTAAAAA-----G-CAAAGGAGTGCACTTTATT--GTGGCTCTGAACCTTTTA-AATATA-ATTTAACCCATTTTX-------AAAAA----------CCCAAAGTTGTTATGTGTGCC---------TTTTTTGXGTATAGCATCTCAACAGTAXCGTTAACTTGTG--TTG--TTGTTTCACATGAGCTCTGACXATTACACCCCXTTTATAAGTGACCCX-----------TTTTTTGTTA-----XATTACTCTTTATAAAAATGTTATTAAGAATGT--AAA--X--CCCC-TTTAAAAAAA---TAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCAAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCAT--GAAA---CCCTCTCATTCCAATTCTTTATTT------TATATAA-GGA--TTTGTGTAATGGATTTTGAGTGTTGCTGTCAT-----------TGGCTCACTTTAAA-XTATATAAGTACTTTTATTTG-----------------------AAATAAATGGAGCAATACTTGGTGTAATATTTA--TTATTCATTGAGGA-XGTG--TAGTT---TAACAACT-ACAGCCATTT--GATTCAGAT--AAATAGCTTCCTAAXCCCC-----------ATTTTTTCAATTTTX-AGACCTCAAATCAGG--22-
		Cronartium_comandrae_MT               ATTAAAAA-----G-CAAAGGAGTGCACTTTATT--GTGGCTCTGAACCTTTTA-AATATA-ATTTAACCCATTTTX-------AAAAA----------CCCAAAGTTGTTATGTGTGCC---------TTTTTTGXGTATAGCATCTCAACAGTAXCGTTAACTTGTG--TTG--TTGTTTCACATGAGCTCTGACXATTACACCCCXTTTATAAGTGACCCX-----------TTTTTTGTTA-----XATTACTCTTTATAAAAATGTTATTAAGAATGT--AAA--X--CCCC-TTTAAAAAAA---TAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCAT--GAAA---CCCTCTCATTCCAATTCTTTATTT------TATATAA-GGA--TTTGTGTAATGGATTTTGAGTGTTGCTGTCAT-----------TAGCTCACTTTAAA-XTATATAAGTACTTTTATTTG-----------------------TAA-AAATGGAGCAATACTTGGTGTAATATTTA--TTATTCATTGAGGA-XGTG--TAGTT---TAACAACT-ACAGCCATTT--GATTCAGAT--AAATAGCTTCCTAAXCCCC-------------ATTTTCAATTTTX-AGACCTCAAATCAGG--2--
		Cronartium_comandrae_SE               ATTAAAAA-----G-CAAAGGAGTGCACTTTATT--GTGGCTCTGAACCTTTTA-AATATA-ATTTAACCCATTTTX-------AAAAA----------CCCAAAGTTGTTATGTGTGCC---------TTTTTTGXGTATAGCATCTCAACAGTAXCGTTAACTTGTG--TTG--TTGTTTCACATGAGCTCTGACXATTACACCCCXTTTATAAGTGACCCX-----------TTTTTTGTTA-----XATTACTCTTTATAAAAATGTTATTAAGAATGT--AAA--X--CCCC-TTTAAAAAAA---TAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCAAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCAT--GAAA---CTCTCTCATTCCAATTCTTTATTT------TATATAA-GGA--TTTGTGTAATGGATTTTGAGTGTTGCTGTCAT-----------TAGCTCACTTTAAA-XTATATAAGTACTTTTATTTG-----------------------AAATAAATGGAGCAATACTTGGTGTAATATTTA--TTATTCATTGAGGA-XGTG--TAGTT---TAACAACT-ACAGCCATTT--GATTCAGAT--AAATAGCTTCCTAAXCTCT---------ATCATTTTTCAATTTTX-AGACCTCAAATCAGG--22-
		Peridermium_bethelii                  ATTAAAAA-----G-CAAAGGAGTGCACTTTATT--GTGGCTCTGAACCTTTTA-AATATA-ATTTAACCCATTTTX-------AAAAA----------CCCAAAGTTGTTATGTGTGCC---------TTTTTTGXGTAGAGCATCTCAACAGTAXCGTTAACTTGTG--TTG--TTGTTTCACATGAGCTCTGACXATTACACCCCXTTTATAAGTGACCCCCCCCCTTTTTTTTAATTATTATTATTAATTACTCTTTATAAAAATGTTTTTAAGAATGT--AAA--X--TCTC-TTTAAAAAAA---TAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATTGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCAT--GAAA---CCCTCTCATTCCAATTCTTTATTT------TATATAA-GGA--TTTGTGTAATGGATTTTGAGTGTTGCTGTCAT-----------TGGCTCACTTTAAA-XTATATAAGTACTTTTATTTG--------------------AAATAAAAAATGGAGCAATACTTGGTGTAATATTTA--TTATTCATTGAGGA-XGTG--TAGTT---TAACAACT-ACAGCCATTT--GATTCAGAT--AAATAGCTTCCTAAXCCCC-------------ATTTTCAATTTTX-AGACCTCAAATCAGG--2--
		Cronartium_occidentale                ATTAAAAA-----G-CAAAGGAGTGCACTTTATT--GTGGCTCTGAACCTTTTA-AATGTA-TTTTAACCCGTTTCX-------AAAAX----------CCCAAAGTTGTTATGTGTGCCTTTTTTTTTTCTTTTGXGTATAGCATCTCAACAGTAXCGTTAACTTGTG--TTG--TTGTTTCACATGAGCTCTGACXATTACCCCCCXTTTATAAGTGACCCX--------TTTTTGTTTGTTA-----XATTACTCX---X---AATGTTTTTAAGAATGT--AAA--X--CCCC-TTTAAAA------AAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATTGAATCTTTGAACGCACCTTGC-CCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCAT--GAAA---CCCTCTCATTCCAATTCTTATATTT-----TATATAA-GGA-TTTTGTGTAATGGATGTTGAGTGTTGCTGTCAT-----------TGGCTCACTTTAAA-XAATATAAGTACTTTTATTTG---------------------AAAATAAAATGGAGTAATACTTGGTGTAATATTTA--TTATTCATTGAGGA-XGTG--TAGTT---TAATTACT-ACAGCCATTTGTGTTTCAGATTTAAATAGCTTCCTAAACCCCC------------ATTTTCAATTTTT-AGACCTCAAATCAGG-04--
		Cronartium_appalachianum              ATTAAAAA-----G-CAAAGGAGTGCACTTTATT--GTGGCTCTGAACCTTTTA-AATATA-TCTTAACCCATTTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAAACAACCCAAAGTTGTTATGTGTGCC--------TTCTTTTGXGTATAGCATCTCAACAGTAXCGTTAACTTGTG--TTG--TTGTTTCACATGAGCTCTGACXATTACCCCCCXTTCATAAGTGACCCX--------TTTTTTTGTACTA-----XTTTACTCTTTATAAAAATGTCTCTAAGAATGT--AAA--X--CCCC-TTTATA-------TAATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATTGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCAT--GAAA---CCCTATCATTCTGATTCTTTATTTTTATA-TATATAA-GGA--GTTGTGTAATGGATGTTGAGTGTTGCTGTCATAC---------TAGCTCACTTTAAA-XTATATAAGTAATTTTATTTG-------------------AAAAAACAAAATGGAGTAATACTTGGTGTAATATTTA--TTATTCATTGAGGA-XGTG--TAGTT---TA-TTACT-ACAGCCATTT-TGTTTCAAAT--AAATAGCTTTCTAAXCCCC----------ATATTTTTCAATTTTT-AGACCTCAAATCAGG00---
		Cronartium_flaccidum                  ATTAAAAAAAAAAGGCAAAGGGGTGCCCTTTATTTTGTGGCTCTGAACCTTTTA-AATATA-TTTTAACCCATTTTT-------AAAAX----------CCCAAAGTTGTTATGTGTGCC---------TTTTTTGXGTATAGCATCTCAACAGTAXCGTTAACTTGTG--TTG--TTGTTTCACATGAGCTCTGACXATTACCCCCCXTTTATAAGTGACCCX-------TTTTTTTTTTAATTA----XATTACTCTTTATAAAAATGTTCTTAAGAATGTAAAAAAAAAACCCC-TXTATA-------AAAXATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCAAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCAT--GAAA---CCCTCTCATTCCAATTCTTATATATTTTTTTATATAA-GGATTTTTGTGTAATGGATGATGAGTGTTGCTATTAATTATATATATATAGCTCACTTTAAA-XTATATAAGTACTTTTATTTG---------------------AAAAATAAATGGAGTAATACTTGGTGTAATATTTATATTATTCATTGAGGAGTGTG--TAGTTTTTTAATTACTTACAGCCATTTATTTTTCAGAT--AAATAGCTTCTTAAXCCCC------------AATTTCCATTTTTTTAGACCTCAAATCAGG-2-32
		Peridermium_pini                      ATTAAAAAAAAAAGGCAAAGGGGTGCCCTTTATTTTGTGGCTCTGAACCTTTTA-AATATA-TTTTAACCCATTTTT-------AAAAX----------CCCAAAGTTGTTATGTGTGCC---------TTTTTTGXGTATAGCATCTCAACAGTAXCGTTAACTTGTG--TTG--TTGTTTCACATGAGCTCTGACXATTACCCCCCXTTTATAAGTGACCCX-------TTTTTTTTTTAATTA----XATTACTCTTTATAAAAATGTTCTTAAGAATGTAAAAAAAAAACCCC-TXTATA-------AAAXATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCAAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TATTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCAT--GAAA---CCCTATCATTCCAATTCTTATATATTTTTTTATATAA-GGATTTTTGTGTAATGGATGATGAGTGTTGCTATTAATTATATATATATAGCTCACTTTAAA-XTATATAAGTACTTTTATTTG---------------------AAAAATAAATGGAGTAATACTTGGTGTAATATTTATATTATTCATTGAGGAGTGTG--TAGTTTTTTAATTACTTACAGCCATTTATTTTTCAGAT--AAATAGCTTCTTAAXCCCC------------AATTTCCATTTTTTTAGACCTCAAATCAGG-2-32
		Pucciniastrum_goeppertianum           ATTAAAAA-----GTC-AATGAGTGCACTTTATT--GTGGCTC-AAACCTTTT--AATAT-CT-TTAACCCATTATX-------AAAXX----------CCCAAAACTGTCTTGTGTACA---------TTTTATGAGTATAGCATTTCAGTAGTAXCGXCATCATGAG--CTTTATTG-TTCAX---AGXT-TGXCXATTACCCCCCCCTTATAAGTGACCCC-------TTTATTTTTTGAAATCAT-XTAAACGTTTTATGTAAAXGTT-TTAAGAATGT--AAA--X--CCA--TGTGGAATTAAATATATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGG-TACTCCAAAAGGTACACCTGTTTGAGTGTCAT--GAAA---CCCTCTCATTCCAGTCTTTTTTTTATATA-TATATAAAGGA-TTCTG-GTGATGGATGTTGAGTGTTGCCGGTGT-----------TGGCTCACTTTAAA-XTACATAAGTACTTTTATTXG---------------------ATAAATAAATGGAGAAATACTTGGTGTGATATTTA--TTATTCATTGAGGAATGTGAATAGCT---TG-CTACTTACAGCCATTTGAGTTTTXGAT--AAATAGCTTCCTAAXCCCA--------AATTCATTTTGACCTTTX-AGACCTCAAATCAGG-----
		Chrysomyxa_arctostaphyli              ATTAAAAAA----GTTTTAAGAGTGCACTTCATT--GTGGCTCT-AACCTTTTACAATGTACTTTTCACCCTTTTTTTT-----AAAXX----------CCCAAAACTGTTATGTGTACC--------TTTTTTTGXGTATAGCATCTCAGTAGTAXCGXCATCATGTGAATTT--TTAATTCACA--AGXT-TGXCXATTACCCCC----------------------------TTTTTTGAAA-----XTTAACACX-TATAAAAAXGTT-CTAAGAATGT--AAA--X--CCCCCTTTAAA-------TTATATAACTTTTAACAATGGATCTCTTGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCAAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGGATATTCCGAAA-GTACACCTGTTTGAGTGTCAT--GAAA---CCCTCTCATTTCAATTTT-ATA--------TATATAATTGA-GAAGTTGAAATGGATGTTGGGTGTTGCTGTTAT-----------TGGCTCACCTTAAA-XTATATAAGTACTTTTATTXG--------------------CAAAAATAAATGGA-T-ATACTTGGTGTAATATTTA--TTATTCATTGAGGAGTGTG-GTGCCTGAAAAA-TACT-ACAGCCATTTGACTTTTXGAT--AGATAGCTTCCGAAXCCCC--------AATGTATATTATATTTTT-AGACCTCAAATCAGG0----
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END;