#NEXUS BEGIN TAXA; TITLE cox1; DIMENSIONS NTAX=202; TAXLABELS Phytophthora_aleatoria Phytophthora_alpina Phytophthora_cactorum Phytophthora_hedraiandra Phytophthora_idaei Phytophthora_pseudotsugae Phytophthora_Xserendipita Phytophthora_clandestina Phytophthora_iranica Phytophthora_tentaculata Phytophthora_andina Phytophthora_infestans Phytophthora_ipomoeae Phytophthora_mirabilis Phytophthora_phaseoli Phytophthora_urerae Phytophthora_nicotianae Phytophthora_Xpelgrandis Phytophthora_botryosa Phytophthora_citrophthora Phytophthora_colocasiae Phytophthora_himalsilva Phytophthora_insulinativitatica Phytophthora_meadii Phytophthora_mekongensis Phytophthora_multibullata Phytophthora_occultans Phytophthora_terminalis Phytophthora_Xvanyenensis Phytophthora_amaranthi Phytophthora_capsici Phytophthora_glovera Phytophthora_mengei Phytophthora_mexicana Phytophthora_siskiyouensis Phytophthora_tropicalis Phytophthora_theobromicola Phytophthora_acerina Phytophthora_capensis Phytophthora_citricola Phytophthora_emzansi Phytophthora_multivora Phytophthora_pachypleura Phytophthora_pini Phytophthora_plurivora Phytophthora_acacia Phytophthora_acaciivora Phytophthora_bisheria Phytophthora_elongata Phytophthora_frigida Phytophthora_oleae Phytophthora_multivesiculata Phytophthora_ilicis Phytophthora_nemorosa Phytophthora_pluvialis Phytophthora_pseudosyringae Phytophthora_psychrophila Phytophthora_transitoria_CZ118 Phytophthora_transitoria_CZ119 Phytophthora_transitoria_CZ120 Phytophthora_transitoria_CZ121 Phytophthora_transitoria_CZ001 Phytophthora_alticola Phytophthora_arenaria Phytophthora_boodjera Phytophthora_cathayensis Phytophthora_megakarya Phytophthora_palmivora Phytophthora_panamensis_PA019 Phytophthora_panamensis_PA040 Phytophthora_panamensis_PA108 Phytophthora_panamensis_PA329 Phytophthora_panamensis_PA328 Phytophthora_quercetorum Phytophthora_agathidicida Phytophthora_castaneae Phytophthora_cocois Phytophthora_heveae Phytophthora_aquae_cooljarloo Phytophthora_balyanboodja Phytophthora_chesapeakensis Phytophthora_condilina Phytophthora_cooljarloo Phytophthora_gemini Phytophthora_humicola Phytophthora_inundata Phytophthora_kwongonina Phytophthora_oreophila Phytophthora_pseudorosacearum Phytophthora_rosacearum Phytophthora_personensis Phytophthora_amnicola Phytophthora_bilorbang Phytophthora_borealis Phytophthora_chlamydospora Phytophthora_crassamura Phytophthora_fluvialis Phytophthora_gibbosa Phytophthora_gonapodyides Phytophthora_gregata Phytophthora_lacustris Phytophthora_litoralis Phytophthora_megasperma Phytophthora_mississippiae Phytophthora_moyootj Phytophthora_ornamentata Phytophthora_pinifolia Phytophthora_riparia Phytophthora_thermophila Phytophthora_Xstagnum Phytophthora_asparagi Phytophthora_abietivora Phytophthora_attenuata Phytophthora_europaea Phytophthora_flexuosa Phytophthora_formosa Phytophthora_fragariae Phytophthora_intricata Phytophthora_rubi Phytophthora_tyrrhenica Phytophthora_uliginosa Phytophthora_uniformis Phytophthora_vulcanica Phytophthora_Xalni Phytophthora_Xcambivora Phytophthora_Xheterohybrida Phytophthora_Xincrassata Phytophthora_Xmultiformis Phytophthora_asiatica Phytophthora_cajani Phytophthora_melonis Phytophthora_niederhauserii Phytophthora_pisi Phytophthora_pistaciae Phytophthora_sojae Phytophthora_variabilis_TJ1495 Phytophthora_variabilis_TJ1496 Phytophthora_variabilis_TJ1497 Phytophthora_variabilis_TJ1498 Phytophthora_variabilis_TJ915 Phytophthora_vignae Phytophthora_cinnamomi Phytophthora_mediterranea Phytophthora_parvispora Phytophthora_fragariaefolia Phytophthora_nagaii Phytophthora_cryptogea Phytophthora_drechsleri Phytophthora_erythroseptica Phytophthora_medicaginis Phytophthora_pseudocryptogea Phytophthora_richardiae Phytophthora_sansomeana Phytophthora_trifolii Phytophthora_brassicae Phytophthora_cichorii Phytophthora_dauci Phytophthora_porri Phytophthora_lactucae Phytophthora_primulae Phytophthora_pseudolactucae Phytophthora_foliorum Phytophthora_hibernalis Phytophthora_lateralis Phytophthora_ramorum Phytophthora_austrocedrae Phytophthora_obscura Phytophthora_syringae Phytophthora_stricta Phytophthora_aquimorbida Phytophthora_chrysanthemi Phytophthora_estuarina Phytophthora_hydrogena Phytophthora_hydropathica Phytophthora_irrigata Phytophthora_macilentosa Phytophthora_parsiana Phytophthora_rhizophorae Phytophthora_virginiana Phytophthora_macrochlamydospora_G1 Phytophthora_macrochlamydospora_G2 Phytophthora_quininea Phytophthora_insolita Phytophthora_polonica Phytophthora_prodigiosa Phytophthora_cacuminis Phytophthora_captiosa Phytophthora_constricta Phytophthora_fallax Phytophthora_afrocarpa Phytophthora_boehmeriae Phytophthora_gallica Phytophthora_gondwanensis Phytophthora_intercalaris Phytophthora_kernoviae Phytophthora_morindae Phytophthora_lilii Phytophthora_castanetorum Phytophthora_quercina Phytophthora_tubulina Phytophthora_versiformis Nothophytophthora_valdiviana ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE Phytophthora_COX1; DIMENSIONS NCHAR=867; FORMAT DATATYPE = DNA GAP = - MISSING = ?; MATRIX Phytophthora_aleatoria ATATGAGAGCTCCTGGATTAAGTTTCCATAGATTACCTTTATTTGTATGGTCTATATTAATTACAGCATTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCTGGAGCAATTACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCTTTTTATGATCCCTCTGGAGGAGGTGATCCAATATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGTCACCCCGAAGTTTATGTTTTAATTTTACCAGCTTTTGGTAT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Phytophthora_botryosa ATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTCGTTTGGTCTGTATTAATTACAGCATTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCTGGTGCGATTACTATGTTATTAACCGATAGAAATTTAAATACTTCTTTTTATGATCCTTCAGGTGGAGGTGATCCAGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGTCATCCAGAAGTTTATATTTTAATTTTACCAGGATTTGGTATTATTAGTCAAGTTTCTGCTGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGAATGGTTTATGCAATGCTATCTATAGGTTTATTAGGTTCAATTGTTTGGGCACATCACATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACTAGAGCTTATTTTTCAGCAGCTACTATGATTATTGCAGTTCCTACTGGTATTAAAATTTTTAGTTGGTTAGCTACTTTATGGGGAGGTTCTTTAAAATTTGAAACTCCTTTATTATTTACTTTAGGATTTATTTTATTATTTGTTATGGGAGGTGTAACAGGTGTAGCTATGTCAAATTCAGGTTTAGATATTGCAATACATGATACTTACTATATTGTAGGACATTTCCATTATGTATTATCTATGGGTGCTGTTTTTGGTATATTTACTGGTTTTTATTTTTGGATCGGTAAAATTTCAGGACGTAGATATCCAGAAATTTTAGGTCAAATCCATTTTTGGTTATTTTTTATAGGTGTAAATGTAACTTTCTTTCCAATGCATTTCTTAGGTTTAGCCGGTATGCCTAGAAGAATTCCTGATTTTCCTGATGCAATGAGTGGTTGGAATGCTGTAAGTAGTTTTGGTTCTTATA Phytophthora_citrophthora ATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTTTGGTCTGTATTAATTACAGCATTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCTGGTGCAATTACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCTTTCTATGATCCTTCAGGTGGAGGTGATCCAGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGTCATCCAGAAGTTTATATTTTAATTTTACCTGGATTTGGTAT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Phytophthora_multivora ATATGCGAGCTCCAGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTTTGGTCTGTTTTAATTACAGCATTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCGGGTGCAATTACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCTTTTTATGATCCTTCTGGAGGAGGTGATCCTGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGTCACCCAGAAGTTTATATTTTAATTTTACCTGGATTTGGTATAATTAGTCAAGTTTCGGCAGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGAATGGTATATGCAATGTTATCTATAGGTTTATTAGGTTCAATCGTTTGGGCACATCATATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTTGATACTAGAGCTTATTTTTCAGCAGCTACTATGATTATTGCAGTACCTACTGGTATTAAAATTTTCAGTTGGTTAGCTACTTTATGGGGTGGTTCTTTAAAATTTGAAACTCCTTTATTATTTACTTTAGGATTTATTTTATTATTTGTTATAGGAGGTGTAACTGGTGTAGTTATGTCAAATTCTGGTTTAGATATTGCAATACATGATACTTATTATATTGTAGGACATTTTCATTATGTTTTATCTATGGGTGCTGTTTTTGGTATATTTACTGGATTCTATTTTTGGATTGGTAAAATTTCAGGACGTAGATATCCAGAAATATTAGGTCAAATTCATTTTTGGTTATTTTTTATTGGAGA???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Phytophthora_condilina ATATGAGAGCTCCAGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTTTGGTCTGTATTAATTACAGCTTTTCTTTTATTATTAACCTTACCTGTATTAGCTGGTGCAATTACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCTTTTTATGATCCATCTGGTGGGGGTGATCCGGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTCGGTCATCCTGAAGTTTATATTTTAATTTTACCCGCTTTTGGTATTATTAGTCAAGTAGCTGCAGCTTTTGCAAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGAATGGTTTATGCAATGTTATCAATAGGTTTATTAGGTTGTATTGTATGGGCACATCATATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACTAGAGCTTATTTTTCAGCAGCTACTATGATTATTGCAGTACCTACTGGAATTAAAATTTTTAGTTGGTTAGCAACTTTATGGGGAGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCTTTATTATTTGTTTTAGGCTTTATTTTATTATTTGTTATTGGTGGTGTAACTGGTGTAGCTATGTCTAATTCAGGTTTAGATATTGCAATACATGATACTTATTATATTGTAGGACATTTTCATTATGTATTATCTATGGGTGCTGTTTTTGGTATATTTACTGGATTTTATTTTTGGATTGGAAAAATTTCTGGTCGTCAATATCCTGAAATTTTAGGTCAAATTCATTTTTGGTTATTCTTTATTGGTGA???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Phytophthora_crassamura ATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTTTGGTCTGTATTAATTACAGCTTTTCTTTTATTATTAACATTACCCGTTTTAGCTGGTGCCATTACCATGTTATTAACAGATAGAAATTTAAATACTTCTTTTTATGATCCATCTGGTGGGGGGGATCCCGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTCGGTCATCCAGAAGTTTATATTTTAATTTTACCAGCTTTTGGTATTATTAGTCAAGTTGCTGCCGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTCGGTTATTTAGGAATGGTTTATGCAATGTTATCTATTGGTTTATTAGGTTGTATTGTATGGGCACATCATATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACTAGAGCTTATTTTTCAGCCGCTACTATGATTATTGCTGTACCTACTGGTATTAAAATTTTTAGTTGGTTAGCAACTTTATGGGGAGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCTTTATTATTTGTTTTAGGTTTTATTTTATTATTTGTTGTTGGTGGTGTAACAGGAGTAGCAATGTCTAATTCAGGTTTAGATATTGCAATCCATGATACTTATTATATTGTAGGACATTTTCATTATGTATTATCTATGGGTGCTGTTTTTGGTATATTTACTGGATTTTATTTTTGGATTGGAAAAATTTCTGGTCGTAAATATCCTGAAATTTTAGGTCAAATCCATTTTTGGTTATTCTTTATAGGTGTAAATATTACCTTTTTTCCAATGCATTTTTTAGGATTAGCTGGTATGCCTAGAAGAATTCCTGATTTTCCTGATGCAATGAGTGGTTGGAATGCTGTAAGTAGTTTTGGTTCTTATA Phytophthora_fluvialis 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ATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTCGTTTGGTCTGTATTAATTACTGCATTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCTGGTGCAATTACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAATACCTCTTTCTATGATCCATCTGGTGGGGGTGATCCTGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTCGGTCACCCTGAAGTTTATATCTTAATTTTACCAGCATTTGGTATTATTAGTCAAGTTTCAGCAGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGTATGGTTTATGCAATGTTATCTATTGGTTTATTAGGTTCAATTGTATGGGCACACCATATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACTAGAGCTTATTTCTCAGCTGCTACCATGATTATTGCAGTACCAACTGGTATTAAAATATTTAGTTGGTTAGCTACTTTATGGGGTGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCTTTATTATTTACCTTAGGGTTTATTTTATTATTTGTAATGGGTGGTGTAACTGGTGTAGCTATGTCTAATTCAGGTTTAGATATTGCATTACATGATACTTATTATATTGTAGGACACTTTCACTATGTATTATCTATGGGTGCTGTTTTTGGTATCTTTACTGGATTTTATTTTTGGATAGGAAAAATTTCAGGTCGTAGATATCCTGAAATATTAGGTCAAATCCATTTTTGGTTATTCTTTATTGGAGTAAATGTTACTTTCTTTCCAATGCATTTTTTAGGTTTAGCTGGTATGCCTAGAAGAATTCCTGATTTTCCTGATGCTATGAGTGGTTGGAATGCTGTTAGTAGTTTGGGGTCTTATA Phytophthora_pisi ATATGAGAGCTCCCGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTTTGGTCTGTATTAATTACAGCTTTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCTGGTGCAATTACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAACACCTCTTTCTATGATCCATCAGGTGGGGGTGATCCAGTATTATACCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGTCACCCTGAAGTTTATATTTTAATTTTACCAGCATTTGGTATTATTAGTCAAGTTTCATCAGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGTATGGTTTATGCAATGTTATCTATTGGTTTATTAGGTTCAATTGTATGGGCACACCATATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACTAGAGCTTATTTCTCAGCGGCTACTATGATTATTGCAGTACCTACTGGTATTAAAATATTTAGCTGGTTAGCTACTTTATGGGGTGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCATTATTATTTACTTTAGGATTTATTTTATTATTTGTAATGGGTGGTGTAACCGGTGTAGCTATGTCTAATTCAGGTTTAGATATTGCATTACATGATACTTATTATATTGTAGGACACTTTCATTATGTATTATCTATGGGTGCTATTTTTGGTATATTTACTGGATTTTATTTTTGGATTGGTAAAATTTCAGGACGTAGATATCCAGAAGTATTAGGTCAAATTCATTTTTGGTTATTCTTTATAGGTGTAAATATTACTTTCTTTCCAATGCATTTCTTAGGTTTAGCCGGTATGCCTAGAAGAATTCCAGATTTTCCCGATGCTATGAGTGGATGGAATGCTGTTAGTAGTTTTGGGTCTTATA Phytophthora_pistaciae ATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTCGTTTGGTCTGTATTAATTACAGCATTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCTGGTGCAATTACTATGTTATTAACAGATAGAAATTTAAATACTTCTTTCTATGATCCATCAGGTGGGGGTGATCCAGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTCGGTCATCCTGAAGTTTATATTTTAATTTTACCAGCATTTGGTATTATTAGTCAAGTTTCAGCAGTTTTTGCTAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGAATGGTTTATGCAATGTTATCTATTGGTTTATTAGGTTCAATTGTATGGGCACACCATATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACTAGAGCTTATTTCTCAGCTGCTACCATGATTATTGCAGTACCTACAGGTATTAAAATATTTAGTTGGTTAGCTACTTTATGGGGTGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCATTATTATTTACTTTAGGATTTATTTTATTATTCGTAATGGGTGGTGTAACTGGTGTAGCTATGTCTAATTCAGGTTTAGATATTGCATTACATGATACTTATTATATTGTAGGACATTTCCACTATGTATTATCTATGGGTGCTGTTTTTGGTATATTTACTGGATTTTATTTTTGGATTGGGAAAATTTCAGGTCGTAGATATCCTGAAGTATTAGGTCAAATTCATTTTTGGTTATTCTTTATTGGAGTAAATATTACTTTCTTTCCGATGCATTTTTTAGGTTTAGCTGGTATGCCTAGAAGAATTCCAGATTTCCCTGATGCTATGAGTGGTTGGAATGCTGTTAGTAGTTTTGGGTCTTATA Phytophthora_sojae ATATGAGAGCCCCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTTTGGTCTGTATTAATTACAGCATTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCTGGTGCAATTACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCTTTCTATGATCCATCTGGTGGGGGTGATCCAGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGTCACCCTGAAGTTTATATTTTAATTTTACCAGCATTTGGTATTATTAGTCAAGTTTCAGCAGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGAATGGTTTATGCAATGTTATCTATTGGTTTATTAGGTTCAATTGTATGGGCACACCATATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACTAGAGCTTATTTCTCAGCAGCTACTATGATTATTGCAGTACCTACTGGTATTAAAATATTTAGTTGGTTAGCTACTTTATGGGGTGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCATTATTATTTACTTTAGGATTTATTTTATTATTTGTAATGGGTGGTGTTACTGGTGTAGCTATGTCTAATTCAGGTTTAGATATTGCATTACATGATACTTATTATATTGTAGGACACTTTCATTATGTATTATCTATGGGTGCCGTTTTTGGTATATTTACTGGATTTTATTTTTGGATTGGTAAAATTTCAGGACGTAGATATCCAGAAGTATTAGGTCAAATTCATTTTTGGTTATTCTTTATAGGTGTAAATATTACTTTCTTTCCAATGCATTTCTTAGGTTTAGCGGGTATGCCTAGAAGAATTCCAGATTTTCCTGATGCTATGAGTGGATGGAATGCTGTTAGTAGTTTTGGGTCTTATA Phytophthora_variabilis_TJ1495 ATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTCGTTTGGTCTGTATTAATTACAGCATTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCTGGTGCAATTACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCTTTCTATGATCCATCAGGTGGAGGAGATCCTGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGTCACCCTGAAGTTTATATCTTAATTTTACCAGCATTTGGTATTATTAGTCAAGTTTCAGCAGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGAATGGTTTATGCAATGTTATCTATTGGTTTATTAGGTTCAATTGTATGGGCACACCATATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACTAGAGCTTATTTCTCAGCAGCTACTATGATTATTGCAGTACCTACAGGTATTAAAATATTTAGTTGGTTAGCTACTTTATGGGGTGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCTTTATTATTTACTTTAGGATTTATTTTATTATTCGTAATGGGTGGTGTAACTGGTGTAGCTATGTCTAATTCGGGTTTAGATATTGCATTACATGATACTTATTATATTGTAGGACACTTCCATTATGTATTATCTATGGGTGCTGTTTTTGGTATATTTACTGGATTTTATTTTTGGATAGGAAAAATTTCAGGTCGTAGATATCCAGAAGTATTAGGTCAAATTCATTTTTGGTTATTCTTTATTGGGGTAAATATTACTTTTTTTCCAATGCATTTCTTAGGTTTAGCTGGTATGCCTAGAAGAATTCCAGATTTCCCTGATGCTATGTGTGGTTGGAATGCTGTTAGTAGTTTTGGGTC????? Phytophthora_variabilis_TJ1496 ATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTCGTTTGGTCTGTATTAATTACAGCATTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCTGGTGCAATTACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCTTTCTATGATCCATCAGGTGGAGGAGATCCTGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGTCACCCTGAAGTTTATATCTTAATTTTACCAGCATTTGGTATTATTAGTCAAGTTTCAGCAGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGAATGGTTTATGCAATGTTATCTATTGGTTTATTAGGTTCAATTGTATGGGCACACCATATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACTAGAGCTTATTTCTCAGCAGCTACTATGATTATTGCAGTACCTACAGGTATTAAAATATTTAGTTGGTTAGCTACTTTATGGGGTGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCTTTATTATTTACTTTAGGATTTATTTTATTATTCGTAATGGGTGGTGTAACTGGTGTAGCTATGTCTAATTCGGGTTTAGATATTGCATTACATGATACTTATTATATTGTAGGACACTTCCATTATGTATTATCTATGGGTGCTGTTTTTGGTATATTTACTGGATTTTATTTTTGGATAGGAAAAATTTCAGGTCGTAGATATCCAGAAGTATTAGGTCAAATTCATTTTTGGTTATTCTTTATTGGGGTAAATATTACTTTTTTTCCAATGCATTTCTTAGGTTTAGCTGGTATGCCTAGAAGAATTCCAGATTTCCCTGATGCTATGTGTGGTTGGAATGCTGTTAGTAGTTTTGGGTC????? Phytophthora_variabilis_TJ1497 ATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTCGTTTGGTCTGTATTAATTACAGCATTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCTGGTGCAATTACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCTTTCTATGATCCATCAGGTGGAGGAGATCCTGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGTCACCCTGAAGTTTATATCTTAATTTTACCAGCATTTGGTATTATTAGTCAAGTTTCAGCAGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGAATGGTTTATGCAATGTTATCTATTGGTTTATTAGGTTCAATTGTATGGGCACACCATATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACTAGAGCTTATTTCTCAGCAGCTACTATGATTATTGCAGTACCTACAGGTATTAAAATATTTAGTTGGTTAGCTACTTTATGGGGTGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCTTTATTATTTACTTTAGGATTTATTTTATTATTCGTAATGGGTGGTGTAACTGGTGTAGCTATGTCTAATTCGGGTTTAGATATTGCATTACATGATACTTATTATATTGTAGGACACTTCCATTATGTATTATCTATGGGTGCTGTTTTTGGTATATTTACTGGATTTTATTTTTGGATAGGAAAAATTTCAGGTCGTAGATATCCAGAAGTATTAGGTCAAATTCATTTTTGGTTATTCTTTATTGGGGTAAATATTACTTTTTTTCCAATGCATTTCTTAGGTTTAGCTGGTATGCCTAGAAGAATTCCAGATTTCCCTGATGCTATGTGTGGTTGGAATGCTGTTAGTAGTTTTGGGTC????? Phytophthora_variabilis_TJ1498 ATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTCGTTTGGTCTGTATTAATTACAGCATTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCTGGTGCAATTACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCTTTCTATGATCCATCAGGTGGAGGAGATCCTGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGTCACCCTGAAGTTTATATCTTAATTTTACCAGCATTTGGTATTATTAGTCAAGTTTCAGCAGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGAATGGTTTATGCAATGTTATCTATTGGTTTATTAGGTTCAATTGTATGGGCACACCATATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACTAGAGCTTATTTCTCAGCAGCTACTATGATTATTGCAGTACCTACAGGTATTAAAATATTTAGTTGGTTAGCTACTTTATGGGGTGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCTTTATTATTTACTTTAGGATTTATTTTATTATTCGTAATGGGTGGTGTAACTGGTGTAGCTATGTCTAATTCGGGTTTAGATATTGCATTACATGATACTTATTATATTGTAGGACACTTCCATTATGTATTATCTATGGGTGCTGTTTTTGGTATATTTACTGGATTTTATTTTTGGATAGGAAAAATTTCAGGTCGTAGATATCCAGAAGTATTAGGTCAAATTCATTTTTGGTTATTCTTTATTGGGGTAAATATTACTTTTTTTCCAATGCATTTCTTAGGTTTAGCTGGTATGCCTAGAAGAATTCCAGATTTCCCTGATGCTATGTGTGGTTGGAATGCTGTTAGTAGTTTTGGGTC????? Phytophthora_variabilis_TJ915 ATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTCGTTTGGTCTGTATTAATTACAGCATTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCTGGTGCAATTACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCTTTCTATGATCCATCAGGTGGAGGAGATCCTGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGTCACCCTGAAGTTTATATCTTAATTTTACCAGCATTTGGTATTATTAGTCAAGTTTCAGCAGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGAATGGTTTATGCAATGTTATCTATTGGTTTATTAGGTTCAATTGTATGGGCACACCATATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACTAGAGCTTATTTCTCAGCAGCTACTATGATTATTGCAGTACCTACAGGTATTAAAATATTTAGTTGGTTAGCTACTTTATGGGGTGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCTTTATTATTTACTTTAGGATTTATTTTATTATTCGTAATGGGTGGTGTAACTGGTGTAGCTATGTCTAATTCGGGTTTAGATATTGCATTACATGATACTTATTATATTGTAGGACACTTCCATTATGTATTATCTATGGGTGCTGTTTTTGGTATATTTACTGGATTTTATTTTTGGATAGGAAAAATTTCAGGTCGTAGATATCCAGAAGTATTAGGTCAAATTCATTTTTGGTTATTCTTTATTGGGGTAAATATTACTTTTTTTCCAATGCATTTCTTAGGTTTAGCTGGTATGCCTAGAAGAATTCCAGATTTCCCTGATGCTATGTGTGGTTGGAATGCTGTTAGTAGTTTTGGGTC????? Phytophthora_vignae ATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTTTGGTCTGTTTTAATTACTGCATTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCCGGTGCAATTACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAACACCTCTTTTTATGATCCATCAGGTGGGGGAGATCCTGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGACATCCTGAAGTTTATATCTTAATTTTACCGGCTTTTGGTATTATTAGTCAAGTTTCAGCAGCCTTTGCTAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGAATGGTTTATGCAATGTTATCTATCGGTTTATTAGGTTCAATTGTATGGGCACATCATATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACTAGAGCTTATTTCTCAGCAGCTACTATGATTATTGCAGTACCTACTGGTATTAAAATATTTAGTTGGTTAGCTACTTTATGGGGTGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCATTATTATTTACTTTAGGATTTATTTTATTATTCGTAATGGGTGGTGTAACTGGTGTAGCTATGTCTAATTCAGGTTTAGATATTGCATTACATGATACTTATTATATTGTAGGACATTTCCACTATGTATTATCTATGGGTGCTGTTTTTGGTATATTTACTGGATTTTATTTTTGGATTGGAAAAATTTCAGGTCGTAGATATCCAGAAATATTGGGTCAAATACATTTTTGGTTATTTTTTATAGGAGTAAATATTACTTTCTTTCCAATGCATTTTTTAGGTTTAGCTGGTATGCCTAGAAGAATTCCAGATTTCCCAGATGCTATGAGTGGTTGGAATGCTGTTAGTAGTTTTGGATCTTATA Phytophthora_cinnamomi ATATGCGAGCTCCCGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCATTATTTGTATGGTCTGTATTAATTACAGCATTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCTGGAGCAATTACTATGTTGTTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCTTTTTATGATCCTTCTGGGGGGGGTGATCCAGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGACATCCTGAAGTTTATATTTTAATTTTACCAGCATTTGGTATTATTAGTCAAGTTTCAGCAGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGAATGGTTTATGCAATGTTATCTATAGGTTTATTAGGTTCTATTGTTTGGGCACATCATATGTTTACAGTTGGTTTAGATGTGGATACTCGAGCTTACTTTTCAGCAGCTACTATGATTATTGCTGTACCTACTGGTATTAAAATTTTTAGTTGGTTAGCTACTTTATGGGGAGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCATTATTATTCACTTTAGGATTTATTTTATTATTTGTTATGGGTGGAGTAACTGGTGTAGCTATGTCTAACTCTGGTTTAGATATTGCATTACACGATACCTATTATATTGTAGGGCATTTCCATTATGTTTTATCTATGGGGGCTGTTTTTGGTATCTTTACTGGATTTTATTTTTGGATTGGAAAAATTTCAGGTCGTCGATATCCTGAAATATTAGGTCAAATACATTTTTGGTTATTTTTTATCGGAGTAAATATTACCTTTTTTCCAATGCATTTTTTAGGTTTAGCCGGTATGCCTAGAAGAATACCAGATTTTCCAGATGCTATGAGTGGATGGAATGCTGTTAGTAGTTTTGGTTCGTATA Phytophthora_mediterranea ATATGAGAGCTCCAGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTGTGGTCTGTATTAATTACAGCATTTTTATTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCTGGAGCAATTACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCTTTTTATGACCCTTCTGGAGGAGGTGATCCTGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGGCACCCTGAAGTTTATATTTTAATTTTACCAGCATTTGGTATTATTAGTCAAGTTTCAGCAGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGAATGGTTTATGCAATGTTATCTATCGGTTTATTAGGTTCAATTGTTTGGGCACACCATATGTTTACAGTTGGTTTAGATGTAGATACTAGAGCTTATTTCTCAGCAGCTACTATGATTATTGCCGTACCTACTGGTATTAAAATTTTTAGTTGGTTAGCTACTTTATGGGGTGGTTCTTTAAAATTTGAAACTCCATTATTATTTACTTTAGGATTTATTTTATTATTCGTTATGGGTGGAGTAACCGGTGTAGCTATGTCAAATTCTGGTTTAGATATTGCATTACATGATACTTATTATATTGTAGGACATTTCCATTATGTTTTATCAATGGGAGCTGTTTTTGG??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Phytophthora_parvispora ATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTATGGTCTGTATTAATTACCGCATTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCTGGAGCCATTACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCTTTTTATGATCCTTCAGGTGGAGGTGATCCAGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTCGGTCACCCTGAAGTTTACATTTTAATTTTACCTGCTTTTGGTATTATTAGTCAAGTTTCTGCGGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGAATGGTTTATGCAATGTTATCTATTGGTTTATTAGGATGTATTGTTTGGGCACACCATATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACTAGAGCTTATTTTTCAGCAGCTACTATGATTATTGCTGTACCTACAGGTATTAAAATTTTTAGTTGGTTAGCTACTTTATGGGGAGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCTTTATTATTTACTTTAGGATTTATTTTACTATTTGTTATGGGTGGAGTAACTGGTGTAGCTATGTCTAATTCTGGTTTAGATATTGCATTACATGATACTTATTATATTGTAGGACATTTCCATTATGTTTTATCAATGGGGGCAGTTTTTGGTATATTTACTGGATTTTATTTTTGGATTGGAAAAATTTCAGGTCGTCAATATCCCGAAGTATTAGGTCAAATACATTTTTGGTTATTTTTTATAGGAGTAAATGTTACCTTTTTTCCAATGCATTTCTTAGGTTTAGCAGGTATGCCTAGAAGAATTCCCGATTTTCCTGATGCTATGAGTGGATGGAATGCTGTTAGTAGTTTTGGATCATATA Phytophthora_fragariaefolia 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ATATGAGAGCACCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTTTGGTCTGTATTAATTACAGCTTTTCTTTTATTATTAACCTTACCTGTATTAGCTGGAGCAATTACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAATACGTCTTTTTATGATCCATCAGGTGGGGGTGATCCAGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTCGGTCATCCGGAAGTTTATATTTTAATTTTACCAGCTTTTGGTATTATTAGTCAAGTTTCTGCGGCATTTGCAAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGTATGGTTTATGCCATGTTATCTATAGGTTTATTAGGTTCTATTGTTTGGGCACATCACATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTTGATACTCGAGCTTATTTCTCAGCAGCTACTATGATTATTGCTGTACCAACTGGTATTAAAATTTTTAGTTGGTTAGCTACTTTATGGGGCGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCTTTATTATTTACTTTAGGTTTTATTTTATTATTTGTAATGGGTGGTGTAACTGGTGTTGCTATGTCTAATTCAGGCCTAGATATCGCTTTACATGATACTTATTATATTGTAGGACATTTTCATTATGTATTATCTATGGGTGCTGTTTTTGGTATTTTTACTGGATTTTATTTTTGGATTGGAAAAATATCAGGTCGTAGATATCCCGAAGTTTTAGGTCAAATTCATTTTTGGTTATTCTTTATTGGTGTAAATGTAACCTTTTTTCCAATGCATTTCTTAGGTTTAGCCGGTATGCCTAGAAGAATACCTGATTTTCCTGATGCTATGAGTGGTTGGAATGCTGTGAGTAGTTTCGGTTCATATA Phytophthora_erythroseptica 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ATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTTTGGTCTGTATTAATTACAGCTTTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCTGGTGCAATTACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAACACCTCTTTCTACGATCCATCAGGTGGGGGTGATCCAGTATTATACCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGTCACCCTGAAGTTTATATTTTAATTTTACCAGCATTTGGTATTATTAGTCAAGTTTCAGCAGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTTGGGTATTTAGGTATGGTTTATGCAATGTTATCTATTGGTTTATTAGGTTCAATTGTATGGGCACACCATATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACTAGAGCGTATTTCTCAGCAGCTACTATGATTATTGCAGTACCTACTGGTATTAAAATATTTAGTTGGTTAGCTACTTTATGGGGTGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCATTATTATTTACTTTAGGATTTATTTTATTATTTGTAATGGGTGGTGTAACCGGTGTAGCTATGTCTAATTCAGGTTTAGATATTGCATTACATGATACTTATTATATTGTAGGACATTTCCATTATGTATTATCTATGGGTGCTGTTTTTGGTATATTTACTGGATTTTATTTTTGGATTGGTAAAATTTCAGGACGTAGATATCCAGAAGTATTAGGTCAAATTCATTTCTGGTTATTCTTTATAGGTGTAAATATTACTTTCTTTCCAATGCATTTCTTAGGTTTAGCTGGTATGCCTAGAAGAATTCCAGATTTTCCAGATGCTATGAGTGGATGGAATGCTGTTAGTAGTTTTGGATCTTATA Phytophthora_morindae ATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTGTGGTCTATTTTAATTACAGCTTTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCAGGTGCTATTACAATGTTATTAACTGATAGAAATTTTAATACTTCATTTTATGATCCTTCTGGTGGAGGTGATCCTGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTCTTTGGTCACCCAGAAGTTTATGTTTTAATTTTACCAGCTTTTGGTATTATTAGTCAAGTTGCTGCAGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGTATGGTTTATGCTATGTTATCTATTGGTTTATTAGGTTCTATTGTATGGGCTCACCATATGTTTACTGTAGGTTTAGATGTAGATACTAGAGCTTATTTTTCAGCAGCTACTATGATTATTGCTGTACCTACTGGTATTAAAATTTTTAGTTGGTTAGCTACTTTATGGGGTGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCTTTATTATTTGTTTTAGGTTTTATTTTATTATTCGTTATGGGTGGTGTAACCGGTGTTGTTATGTCTAATTCAGGTTTAGATATTGCTTTACATGATACTTATTATATTGTAGGACATTTCCACTATGTATTATCTATGGGTGCTGTATTTGGTATTTTTACTGGATTTTATTTTTGGATTGGAAAAATTTCAGGACGTAGATATCCAGAAATTTTAGGTCAAATTCATTTTTGGTTATTCTTTATTGGTGTAAATATTACTTTCTTTCCAATGCATTTTTTAGGATTAGCAGGTATGCCTAGAAGAATTCCAGATTTCCCTGATGCTATGAGTGGTTGGAATGCTGTAAGTAGTTTTGGTTCATATA Phytophthora_lilii ATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTTTCCATAGATTACCTTTATTTGTATGGTCTGTATTAATTACAGCATTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCTGGTGCAATTACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCATTTTATGATCCGTCTGGGGGAGGTGATCCGGTATTATATCAA??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Phytophthora_castanetorum ATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTCGTTTGGTCTGTATTAATTACAGCTTTTCTTTTATTATTAACTTTACCCGTATTAGCTGGTGCAATTACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCTTTTTATGATCCTTCGGGAGGAGGAGATCCTGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGTCATCCTGAAGTTTATATTTTAATTTTACCCGCTTTTGGTATTATTAGTCAAGTTTGTTCAGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGGATGGTTTATGCTATGCTATCTATCGGTTTATTAGGTTCAATTGTATGGGCACATCATATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACTAGAGCTTATTTTTCTGCAGCTACTATGATTATTGCTGTACCTACTGGTATTAAAATTTTTAGTTGGTTAGCAACTTTATGGGGTGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCCTTATTATTTACTTTAGGTTTTATATTATTATTTGTTATGGGTGGAGTAACTGGTGTAGTTATGTCTAATTCAGGTTTAGATATTGCATTACATGATACTTATTATATTGTAGGACATTTCCATTATGTATTATCTATGGGGGCTGTTTTTGGTATATTTACTGGATTTTATTTTTGGATTGGAAAAATTTCAGGTCGCAGATATCCAGAAGTTTTGGGTCAAATTCATTTTTGGTTATTCTTTATTGGAGTAAATGTTACTTTTTTTCCAATGCATTTTTTAGGTTTAGCTGGTATGCCTCGAAGAATTCCTGATTTTCCTGATGCAATGAGTGGTTGGAATGCTGTAAGTAGTTTTGGTTC????? Phytophthora_quercina ATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTCGTTTGGTCTGTATTAATTACAGCTTTTCTTTTATTATTAACTTTACCCGTATTAGCTGGTGCAATTACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCTTTTTATGATCCTTCGGGGGGAGGAGATCCTGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGTCATCCTGAAGTTTATATTTTAATTTTACCCGCTTTTGGTATTATTAGTCAAGTTTCTGCAGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGAATGGTTTATGCTATGCTATCTATAGGTTTATTAGGTTCAATTGTATGGGCACATCATATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACTAGAGCTTATTTTTCTGCAGCTACTATGATTATTGCTGTACCTACTGGTATTAAAATTTTTAGTTGGTTAGCAACTTTATGGGGCGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCCTTATTATTTACTTTAGGTTTTATATTATTATTTGTTATGGGTGGAGTAACTGGTGTAGTTATGTCTAATTCCGGTTTAGATATTGCATTACATGATACTTATTATATTGTAGGACATTTCCATTATGTATTATCTATGGGGGCTGTTTTTGGTATATTTACTGGATTTTATTTTTGGATTGGAAAAATTTCAGGTCGCAGATATCCTGAAGTTTTGGGTCAAATTCATTTTTGGTTATTCTTTATTGGAGTAAATGTTACTTTTTTTCCAATGCATTTTTTAGGTTTAGCTGGTATGCCTCGAAGAATTCCTGATTTTCCTGATGCAATGAGTGGTTGGAATGCTGTAAGTAGTTTTGGTTCTTATA Phytophthora_tubulina ATATGAGAGCCCCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTTTGGTCTGTATTAATTACTGCTTTTCTTTTGTTATTAACTTTACCCGTATTAGCCGGTGCAATTACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCTTTTTATGATCCTTCGGGAGGTGGGGATCCTGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTCGGTCATCCTGAAGTTTATATTTTAATTTTACCAGCTTTTGGTATTATTAGTCAAGTTTCTGCAGCCTTTGCTAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGAATGGTTTATGCTATGTTATCTATAGGTTTATTAGGTTCGATTGTATGGGCACATCATATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACTAGAGCTTATTTTTCTGCAGCTACGATGATTATTGCTGTACCTACTGGTATTAAAATTTTTAGTTGGTTAGCCACTTTATGGGGAGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCTTTATTATTTACTTTAGGTTTTATATTATTATTTGTTATGGGGGGTATAACTGGTGTAGCTATGTCTAATTCGGGGTTAGATATTGCATTGCATGATACTTATTATATTGTAGGACATTTTCATTATGTATTATCTATGGGTGCTGTTTTTGGTATATTTACTGGATTTTATTTTTGGATTGGGAAAATTTCAGGTCGTAGATATCCAGAAATTCTAGGTCAAATTCATTTTTGGTTATTTTTTATTGGAGTAAATGTTACTTTTTTTCCAATGCATTTTTTAGGTTTAGCTGGTATGCCAAGAAGAATTCCGGATTTCCCCGACGCAATGAGTGGTTGGAATTCTGTGAGTAGTTTTGGTTC????? Phytophthora_versiformis ATATGAGAGCTCCAGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTTTGGTCTGTATTAATTACCGCTTTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCAGGTGCAATTACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCTTTTTATGATCCTTCAGGAGGGGGTGATCCTGTATTATATCAACATTTATT??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Nothophytophthora_valdiviana ATATGAGAGCTCCCGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTTTGGTCTGTTTTAATTACAGCCTTTCTTTTATTACTAACTTTACCTGTTTTAGCTGGAGCAATTACTATGTTATTAACAGATAGAAATTTAAACACTTCTTTTTATGACCCATCTGGTGGAGGAGATCCTGTATTGTATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGACATCCTGAAGTTTATGTATTAATATTACCAGCTTTTGGTATTATTAGTCAAGTTTCTGCAGCTTTTGCAAAAAAAAATGTTTTTGGTTATTTAGGTATGGTTTATGCTATGTTATCTATAGGTTTATTAGGTTCAATTGTATGGGCACATCATATGTTTACTGTAGGTTTAGATGTTGATACTAGAGCTTATTTTTCTGCAGCTACAATGATTATTGCAGTACCTACCGGTATTAAAATTTTTAGTTGGTTAGCTACTTTATGGGGAGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCTTTATTATTTGTTTTAGGTTTTATTTTATTATTCGTTGTTGGTGGTGTAACTGGTGTTGTTATGTCAAATTCAGGCTTAGATATTGCAATTCATGATACTTATTATATTGTAGGACATTTTCATTATGTTTTATCTATGGGTGCTGTATTTGGTATTTTTACTGGATTTTATTTTTGGATTGGAAAAATTTCTGGTCGTAGATATCCTGAAATTTTAGGTCAAATACACTTTTGGTTATTCTTTATTGGAGTAAATTTAACTTTTTTCCCAATGCATTTTCTAGGTTTAGCTGGTATGCCAAGAAGAATTCCAGATTTTCCAGATGCTATGAGTGGTTGGAATGCTATTAGTAGTTTTGGTTC????? ; END; BEGIN TREES; Title Phytophthora_COX1; LINK Taxa = cox1; TRANSLATE [0] 1 Phytophthora_aleatoria, [1] 2 Phytophthora_alpina, [2] 3 Phytophthora_cactorum, [3] 4 Phytophthora_hedraiandra, [4] 5 Phytophthora_idaei, [5] 6 Phytophthora_pseudotsugae, [6] 7 Phytophthora_Xserendipita, [7] 8 Phytophthora_clandestina, [8] 9 Phytophthora_iranica, [9] 10 Phytophthora_tentaculata, [10] 11 Phytophthora_andina, [11] 12 Phytophthora_infestans, [12] 13 Phytophthora_ipomoeae, [13] 14 Phytophthora_mirabilis, [14] 15 Phytophthora_phaseoli, [15] 16 Phytophthora_urerae, [16] 17 Phytophthora_nicotianae, [17] 18 Phytophthora_Xpelgrandis, [18] 19 Phytophthora_botryosa, [19] 20 Phytophthora_citrophthora, [20] 21 Phytophthora_colocasiae, [21] 22 Phytophthora_himalsilva, [22] 23 Phytophthora_insulinativitatica, [23] 24 Phytophthora_meadii, [24] 25 Phytophthora_mekongensis, [25] 26 Phytophthora_multibullata, [26] 27 Phytophthora_occultans, [27] 28 Phytophthora_terminalis, [28] 29 Phytophthora_Xvanyenensis, [29] 30 Phytophthora_amaranthi, [30] 31 Phytophthora_capsici, [31] 32 Phytophthora_glovera, [32] 33 Phytophthora_mengei, [33] 34 Phytophthora_mexicana, [34] 35 Phytophthora_siskiyouensis, [35] 36 Phytophthora_tropicalis, [36] 37 Phytophthora_theobromicola, [37] 38 Phytophthora_acerina, [38] 39 Phytophthora_capensis, [39] 40 Phytophthora_citricola, [40] 41 Phytophthora_emzansi, [41] 42 Phytophthora_multivora, [42] 43 Phytophthora_pachypleura, [43] 44 Phytophthora_pini, [44] 45 Phytophthora_plurivora, [45] 46 Phytophthora_acacia, [46] 47 Phytophthora_acaciivora, [47] 48 Phytophthora_bisheria, [48] 49 Phytophthora_elongata, [49] 50 Phytophthora_frigida, [50] 51 Phytophthora_oleae, [51] 52 Phytophthora_multivesiculata, [52] 53 Phytophthora_ilicis, [53] 54 Phytophthora_nemorosa, [54] 55 Phytophthora_pluvialis, [55] 56 Phytophthora_pseudosyringae, [56] 57 Phytophthora_psychrophila, [57] 58 Phytophthora_transitoria_CZ118, [58] 59 Phytophthora_transitoria_CZ119, [59] 60 Phytophthora_transitoria_CZ120, [60] 61 Phytophthora_transitoria_CZ121, [61] 62 Phytophthora_transitoria_CZ001, [62] 63 Phytophthora_alticola, [63] 64 Phytophthora_arenaria, [64] 65 Phytophthora_boodjera, [65] 66 Phytophthora_cathayensis, [66] 67 Phytophthora_megakarya, [67] 68 Phytophthora_palmivora, [68] 69 Phytophthora_panamensis_PA019, [69] 70 Phytophthora_panamensis_PA040, [70] 71 Phytophthora_panamensis_PA108, [71] 72 Phytophthora_panamensis_PA329, [72] 73 Phytophthora_panamensis_PA328, [73] 74 Phytophthora_quercetorum, [74] 75 Phytophthora_agathidicida, [75] 76 Phytophthora_castaneae, [76] 77 Phytophthora_cocois, [77] 78 Phytophthora_heveae, [78] 79 Phytophthora_aquae_cooljarloo, [79] 80 Phytophthora_balyanboodja, [80] 81 Phytophthora_chesapeakensis, [81] 82 Phytophthora_condilina, [82] 83 Phytophthora_cooljarloo, [83] 84 Phytophthora_gemini, [84] 85 Phytophthora_humicola, [85] 86 Phytophthora_inundata, [86] 87 Phytophthora_kwongonina, [87] 88 Phytophthora_oreophila, [88] 89 Phytophthora_pseudorosacearum, [89] 90 Phytophthora_rosacearum, [90] 91 Phytophthora_personensis, [91] 92 Phytophthora_amnicola, [92] 93 Phytophthora_bilorbang, [93] 94 Phytophthora_borealis, [94] 95 Phytophthora_chlamydospora, [95] 96 Phytophthora_crassamura, [96] 97 Phytophthora_fluvialis, [97] 98 Phytophthora_gibbosa, [98] 99 Phytophthora_gonapodyides, [99] 100 Phytophthora_gregata, [100] 101 Phytophthora_lacustris, [101] 102 Phytophthora_litoralis, [102] 103 Phytophthora_megasperma, [103] 104 Phytophthora_mississippiae, [104] 105 Phytophthora_moyootj, [105] 106 Phytophthora_ornamentata, [106] 107 Phytophthora_pinifolia, [107] 108 Phytophthora_riparia, [108] 109 Phytophthora_thermophila, [109] 110 Phytophthora_Xstagnum, [110] 111 Phytophthora_asparagi, [111] 112 Phytophthora_abietivora, [112] 113 Phytophthora_attenuata, [113] 114 Phytophthora_europaea, [114] 115 Phytophthora_flexuosa, [115] 116 Phytophthora_formosa, [116] 117 Phytophthora_fragariae, [117] 118 Phytophthora_intricata, [118] 119 Phytophthora_rubi, [119] 120 Phytophthora_tyrrhenica, [120] 121 Phytophthora_uliginosa, [121] 122 Phytophthora_uniformis, [122] 123 Phytophthora_vulcanica, [123] 124 Phytophthora_Xalni, [124] 125 Phytophthora_Xcambivora, [125] 126 Phytophthora_Xheterohybrida, [126] 127 Phytophthora_Xincrassata, [127] 128 Phytophthora_Xmultiformis, [128] 129 Phytophthora_asiatica, [129] 130 Phytophthora_cajani, [130] 131 Phytophthora_melonis, [131] 132 Phytophthora_niederhauserii, [132] 133 Phytophthora_pisi, [133] 134 Phytophthora_pistaciae, [134] 135 Phytophthora_sojae, [135] 136 Phytophthora_variabilis_TJ1495, [136] 137 Phytophthora_variabilis_TJ1496, [137] 138 Phytophthora_variabilis_TJ1497, [138] 139 Phytophthora_variabilis_TJ1498, [139] 140 Phytophthora_variabilis_TJ915, [140] 141 Phytophthora_vignae, [141] 142 Phytophthora_cinnamomi, [142] 143 Phytophthora_mediterranea, [143] 144 Phytophthora_parvispora, [144] 145 Phytophthora_fragariaefolia, [145] 146 Phytophthora_nagaii, [146] 147 Phytophthora_cryptogea, [147] 148 Phytophthora_drechsleri, [148] 149 Phytophthora_erythroseptica, [149] 150 Phytophthora_medicaginis, [150] 151 Phytophthora_pseudocryptogea, [151] 152 Phytophthora_richardiae, [152] 153 Phytophthora_sansomeana, [153] 154 Phytophthora_trifolii, [154] 155 Phytophthora_brassicae, [155] 156 Phytophthora_cichorii, [156] 157 Phytophthora_dauci, [157] 158 Phytophthora_porri, [158] 159 Phytophthora_lactucae, [159] 160 Phytophthora_primulae, [160] 161 Phytophthora_pseudolactucae, [161] 162 Phytophthora_foliorum, [162] 163 Phytophthora_hibernalis, [163] 164 Phytophthora_lateralis, [164] 165 Phytophthora_ramorum, [165] 166 Phytophthora_austrocedrae, [166] 167 Phytophthora_obscura, [167] 168 Phytophthora_syringae, [168] 169 Phytophthora_stricta, [169] 170 Phytophthora_aquimorbida, [170] 171 Phytophthora_chrysanthemi, [171] 172 Phytophthora_estuarina, [172] 173 Phytophthora_hydrogena, [173] 174 Phytophthora_hydropathica, [174] 175 Phytophthora_irrigata, [175] 176 Phytophthora_macilentosa, [176] 177 Phytophthora_parsiana, [177] 178 Phytophthora_rhizophorae, [178] 179 Phytophthora_virginiana, [179] 180 Phytophthora_macrochlamydospora_G1, [180] 181 Phytophthora_macrochlamydospora_G2, [181] 182 Phytophthora_quininea, [182] 183 Phytophthora_insolita, [183] 184 Phytophthora_polonica, [184] 185 Phytophthora_prodigiosa, [185] 186 Phytophthora_cacuminis, [186] 187 Phytophthora_captiosa, [187] 188 Phytophthora_constricta, [188] 189 Phytophthora_fallax, [189] 190 Phytophthora_afrocarpa, [190] 191 Phytophthora_boehmeriae, [191] 192 Phytophthora_gallica, [192] 193 Phytophthora_gondwanensis, [193] 194 Phytophthora_intercalaris, [194] 195 Phytophthora_kernoviae, [195] 196 Phytophthora_morindae, [196] 197 Phytophthora_lilii, [197] 198 Phytophthora_castanetorum, [198] 199 Phytophthora_quercina, [199] 200 Phytophthora_tubulina, [200] 201 Phytophthora_versiformis, [201] 202 Nothophytophthora_valdiviana; TREE BI = (202:0.07190205,(10:0.05519054,37:0.01842983,41:0.04520248,42:0.05927203,51:0.02877472,111:0.06849468,172:0.1085207,178:0.09637761,190:0.04795946,197:0.03087628,201:0.03959521,(17:0.001671074,18:0.006269542):0.03919142,(145:0.01419387,146:0.01429491):0.06578853,(192:0.06905858,194:0.09848148):0.02077763,(143:0.03194952,(142:0.07172164,144:0.05619772):0.0298593):0.03503313,(181:0.006468934,(180:0.006216519,182:0.001388165):0.01240672):0.0621544,(196:0.05693597,(191:0.07258607,193:0.03143414):0.02603038):0.03557539,(188:0.1140815,(187:0.05461678,(186:0.04462289,189:0.02283017):0.0245068):0.03419913):0.05366251,((55:0.06100341,56:0.04176448):0.01862628,(53:0.02568372,(54:0.02114467,57:0.04005204):0.0080306):0.034145):0.04229646,(39:0.03697787,45:0.009096015,(40:0.02359389,43:0.01031129,(38:0.009682186,44:0.009799658):0.007306526):0.007100661):0.0177249,(52:0.05137416,(46:0.043902,47:0.0456955,48:0.03032297,49:0.02586506,50:0.03693764):0.02525999):0.01637851,((76:0.004917925,(75:0.0176751,77:0.006375279):0.007563706):0.02603914,(200:0.08591986,(198:0.009610008,199:0.006316302):0.02760478):0.01462614):0.02495632,(1:0.02253732,2:0.0262672,5:0.03090922,(3:0.005132886,6:0.01178406):0.008364913,(4:0.002597874,7:0.001220556):0.009138853):0.02744313,(33:0.02659044,35:0.04193,(30:0.03089876,32:0.002636198,36:0.02590502,(31:0.001474893,34:0.007592549):0.008863926):0.01229177):0.01294935,(8:0.001362996,11:0.004053815,13:0.01093663,14:0.007586127,15:0.01531694,16:0.002708908,(9:0.001482548,12:0.001321741):0.01003771):0.08928563,((22:0.008614235,28:0.005554595):0.02354939,(19:0.01423456,23:0.02410999,25:0.01434317,29:0.01591615):0.006240345,(21:0.03172831,(20:0.004759098,(26:0.008511796,27:0.003185395):0.008360492):0.01439858):0.007501113):0.01606726,((184:0.07464512,(183:0.004915439,185:0.003944784):0.03668399):0.04654071,(176:0.04845951,(170:0.03571194,(173:0.05010639,175:0.01633352,177:0.0084498,(174:0.001257521,179:0.002588917):0.01049202):0.01133946):0.01068412):0.02143391):0.01913803,(68:0.1015309,(74:0.007038489,(66:0.02910498,67:0.05884665):0.02183515,(64:0.01795324,(63:0.003343417,65:0.002958539):0.01740869):0.006652677,(69:0.001355265,70:0.001180376,71:0.001320127,72:0.001285025,73:0.00118595):0.01308193):0.01478369):0.02195435,((162:0.09258638,164:0.07799368,(165:0.04315151,(24:0.0009767526,163:0.001037601):0.05785355):0.01082078,(166:0.03147088,(168:0.03719234,(167:0.03345654,((155:0.04891433,161:0.01306334):0.01419633,(157:0.06618451,159:0.05453754):0.01965664,(156:0.05613316,(158:0.01195852,160:0.01168985):0.05338284):0.02253012):0.08737568):0.01918443):0.01196266):0.03193135):0.02612528,(169:0.07309116,((148:0.03604848,(58:0.002895944,59:0.002970232,60:0.00285727,61:0.003127741,62:0.003062561):0.08118663):0.01763044,(153:0.017025,(150:0.009035004,154:0.03700678):0.04864538,((78:0.02073742,151:0.001941239):0.01703721,(152:0.01838277,(147:0.001140147,149:0.002731102):0.01553166):0.02244445):0.02670859):0.009742304):0.03214951):0.02802753):0.02111485,(((136:0.001147276,137:0.001150078,138:0.001099836,139:0.001274096,140:0.001202374):0.01447063,((135:0.01448665,(133:0.01169459,(129:0.002740759,195:0.001173531):0.01638433):0.01296495):0.02896724,((132:0.03732853,134:0.021468):0.007342533,(131:0.02071555,(130:0.003845953,141:0.003047924):0.019612):0.02729746):0.008609674):0.007212168):0.02485507,(123:0.08279091,(115:0.007203374,(112:0.02456852,114:0.02385161,(120:0.03752491,121:0.01832751,(127:0.009228033,(118:0.00613228,(113:0.006858609,(126:0.001254087,(116:0.0279122,122:0.006804194,(117:0.03458022,119:0.01717596):0.003455941,(125:0.003845304,(124:0.001219068,128:0.001155922):0.007742621):0.006438898):0.003347179):0.003304281):0.002869034):0.00287106):0.02361486):0.0108059):0.01102215):0.03821404):0.01745586):0.01281844,(92:0.0318397,93:0.0660663,107:0.0911064,(94:0.04509359,95:0.02568189):0.01728926,(104:0.01300166,110:0.02724104):0.02266494,(108:0.02798281,(101:0.001260024,171:0.001288675):0.05175069):0.03494348,(109:0.02916889,(102:0.03853635,(97:0.008794836,105:0.01789695):0.02548125):0.03009125):0.01719684,(88:0.0154443,(90:0.01757254,(83:0.02051397,87:0.01131719,89:0.02207768):0.007847916):0.006309635):0.01948884,((98:0.03514681,100:0.01293505):0.02721875,(99:0.06449023,(106:0.02160824,(96:0.02386726,103:0.02698571):0.01767896):0.009437267):0.01218064):0.0105221,(91:0.02739261,(79:0.03765833,84:0.0462214,((80:0.009306954,81:0.01285795):0.03414448,(82:0.009140273,85:0.0200443,86:0.009594326):0.01663224):0.0114824):0.008457234):0.01734974):0.02749148):0.07190205); 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