NEXUS
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[Matrix accession#: M413]

BEGIN TAXA;
	TITLE M413;
	DIMENSIONS  NTAX=21;
	TAXLABELS
		Gonioctena_viminalis	Gonioctena_olivacea	Gonioctena_rufipes	Gonioctena_linnaeana	Gonioctena_variabilis	Gonioctena_fornicata_a	Gonioctena_fornicata_b	Gonioctena_occidentalis	Gonioctena_interposita_1	Gonioctena_interposita_2	Gonioctena_intermedia	Gonioctena_quinquepunctata	Gonioctena_holdausi	Gonioctena_pallida_1	Gonioctena_pallida_2	Gonioctena_tredecimmaculata	Gonioctena_nigroplagiata	Gonioctena_kamikawai	Gonioctena_rubripennis	Oreina_cacaliae	Chrysomela_tremula
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M413;
	DIMENSIONS NCHAR=495;
	FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = -  ;
	MATRIX
		Gonioctena_viminalis              AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAAAATTGGATCAATAATTCATAAATCAATGTTATATTACAAAAAAAGTTAAATAAATTTTTTAATCGCCCCAATCAAATTATAAATCAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAA-TATA-AATTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATTTAACTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTTTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTCAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAATATTTCAGTGGGCAGGCCAGACCTAAAATTAACATCCCACCCAAA
		Gonioctena_olivacea               ?GACCCAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAACTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAAAATTGGATCAATAAATCATACATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTAATTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAAAAAAAATGAATAAAAAAATACTAAAATAAAAAA-TTTA-TTTTAAAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATATTAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCCTTTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCACCAACA
		Gonioctena_rufipes                ???CCTAATA-TTTCAGCTTCTGCACCGAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTATATCTTATAATC-AAAAAAAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTATTATACAAAAAAAGTTAATAATATTTTTCAATCGCCCCAATCAAATTATAAATTAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAA-TAAA-AACTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTCAATTTAATTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTACTTTTTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCA?GGCCATTTAAATAATTCAGTGGG???GCCAGACCTAAA?TTAAATTCCGACCCAAA
		Gonioctena_linnaeana              AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATAAACTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATCAAAAAAAAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTATATTACAAAAAAAGTTTATCATATTTTTCAATCACCCCAATCAAATTATAGATCAAATTTAATAATTAAATTCTAAAATAAAAAA-TATG-TACTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATTTAAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAACAGAGACAGTTATTTTTTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAATAATTCAGTGGGCAGGCCAGACCTAAAATTAAAT??CAACCCAAA
		Gonioctena_variabilis             AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAATTGGATCAATTATTCATATAAATATGTAATAATACAAAAAAAGTTTAATAAATTTTTCAATCACCCCAATCAAATTATAAA-ATAAATAAATAAATAAATACTAAAATATAAAA-TTAAATTTTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAAAATTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTATAATAAAATTAAATAGAGACAGTCATTTTCTTATATAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCCCACACA
		Gonioctena_fornicata_a            AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTATTATATAAAAAAAGTTAATTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAAAAAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAACTTTA-TTTTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAACAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTCTAATTAAGAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCCTTCAAAT-TTTCAGCGGGCAGGTCAGACCTTAAATTATAATCCCAACCACA
		Gonioctena_fornicata_b            AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTATTATATAAAAAAAGTTAATTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAAAAAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAACTTTA-TTTTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAACAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTCTAATTAAGAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCCTTCAAAT-TTTCAGCGGGCAGGTCAGACCTTAAATTATAATCCCAACCACA
		Gonioctena_occidentalis           AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAAAATTGGATCAATAATTCATAAATCAATGTTATATTACAAAAAAAGTTAAATAAATTTTTTAATCGCCCCAATCAAATTATAAATCAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAA-TATA-AACTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATTTAACTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTTTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTCAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAATATTTCAGTGGGCAGGCCAGACCT-AAATTA?????CCACCCAAC
		Gonioctena_interposita_1          AGACCTAATC-TTTCAGCTTCTGCACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAACTGGATCAATGATTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTACTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAGA-AAAAATTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TTTA-TACTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGCTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCCCCCACA
		Gonioctena_interposita_2          AGACCTAATC-TTTCAGCTTCTGCACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAACTGGATCAATGATTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTACTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAGA-AAAAATTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TTTA-TACTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGCTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCCCCCACA
		Gonioctena_intermedia             AGACCTAATT-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAACTATTGGATCAATAACTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTACTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAA-AAAAATTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TATA-TTCTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTGTATTATAATCCCCCCCACA
		Gonioctena_quinquepunctata        ?CACCTAATT-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCT?ATAATC--AAAATAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTAATAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAA-AAAAATTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TATA-ATTTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTATATTATAATCCCCCCCACA
		Gonioctena_holdausi               AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAAAATTGGATCAATAACTCATAAATTAATGGTATATTACAAAAAAAGTTAAATAAATTTTTTAATCGCCCCAATCAAATTATAAATCAAATTTAATACATAAATTCTAAAATAAAAAA-TATA-AATTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATTTAACTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTTTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTCAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAATATTTCAGTGGGCAGGCCAGACCTAAAATTA?????CCACCCAAA
		Gonioctena_pallida_1              ?GACCTAATA-TTTCAGCTTCTACACCAAAAATTAACTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAACTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTACTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAGA-AAAAATTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TTTA-TACTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCCCCCACA
		Gonioctena_pallida_2              ?GACCTAATA-TTTCAGCTTCTACACCAAAAATTAACTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAACTGGATCAATGATTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTACTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAGA-AAAAATTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TTTA-TACTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCCCCCACA
		Gonioctena_tredecimmaculata       ????CTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATAAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTGTAATC--AAAATAATTGGATCAATAATTCATAAATCAATGTTACTATATAATAAAAGTTTTCTAAATTTCACAATCACCCCAATTAAATTATAAACTAAATTTAATAATTAAATTCTAAAATACAAAA-TATA-AATTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACTAAACTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTATATAGAGACAGCTATTTTCTTATCTAACCT-TTCATTCCAGATTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAAT-CTTCAGTGGGCAGGTCGGACCTTAAATC??????CCACCCACA
		Gonioctena_nigroplagiata          AGACCTAATT-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATAAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTGTAATC--AAAATAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTAATTATACAAAAAAAGTTTATTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAA-AAAAATTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAA-TTTATTTTTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGCTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCCTTCAAAT-CTTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAA?????????CCCCACACA
		Gonioctena_kamikawai              AGACCTAATA-TTTCAGCTTCTACACCAAAAATTTACTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATTATTGGATCAAGAAATCATAAATTAATGAATAATTACAAAAAAAGTTAATTAAATTTTTCAATCACCCCAATCAAATTATAAATCAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATATAAAA-TATA-ATATATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTCAATTATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTCAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAATATATCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTAAATTCCCACCCAAA
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		Chrysomela_tremula                AGACCTAATA-TTTTAGCTCCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTTGATTTGAACTCTAAAAAAAAATAACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTAATCTTATAATC--ACTAAATTTGGATCAAATATTCATTAATTAATGTTAAATTATAAAAAAAGTTAAATTAATTTTTTAATCACCCCAACTAAATAAATACCTAAATTAATAAAATTAATTCTAAATATAATAA-TTTA-TTTATATATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATGAAATTTAAGCTTTTTAACTTAAATATAAAATTCTAATAAAATTAAATAAAGACAGTTATTTTTTTATCCAACCC-TTCATTCCAGCTTTCAATTAAAAAACTATTGATTATGCTACCTTAGCACGGTTAAAATACCGCGGCCATTC-AAT-TCTCATTGGGCAGGCTAGACTTTAAAT???????CCACCCCCA
	;
END;

BEGIN CODONS;
CODESET * UNTITLED = Universal: all ; 
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BEGIN ASSUMPTIONS;
USERTYPE onlyTv STEPMATRIX = 4 
 A C G T 
 . 1 0 1 
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 1 0 1 . 
 ; 
 
 OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
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 CHARSET 16s = 1 - 495 ; 
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 CHARSET 3rdpos = ; 
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