NEXUS
[File created by TreeBASE:  7/26/07  20:56:28]
[Matrix accession#: M417]

BEGIN TAXA;
	TITLE M417;
	DIMENSIONS  NTAX=21;
	TAXLABELS
		Gonioctena_olivacea	Gonioctena_rufipes	Gonioctena_linnaeana	Gonioctena_variabilis	Gonioctena_fornicata_a	Gonioctena_fornicata_b	Gonioctena_occidentalis	Gonioctena_interposita_1	Gonioctena_interposita_2	Gonioctena_intermedia	Gonioctena_quinquepunctata	Gonioctena_holdausi	Gonioctena_pallida_1	Gonioctena_pallida_2	Gonioctena_tredecimmaculata	Gonioctena_nigroplagiata	Gonioctena_kamikawai	Gonioctena_rubripennis	Oreina_cacaliae	Chrysomela_tremula	Gonioctena_viminalis
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M417;
	DIMENSIONS NCHAR=358;
	FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = -  ;
	MATRIX
		Gonioctena_olivacea               GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATTATATTTTAAAAATAAAAATCTAAAATTATAT-TTAATGTAACCCATTTCTACTTTTTTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATTAAAAATCTTGAATATTATAATTCTTATAAAATATTC-AATTACGATGATATGTAAATTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGACTATCGATTACAGAACAAGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTAAAGAACATAACTATTACTAATCTAGCATTATAA-ATTACATTTATAACCCAC
		Gonioctena_rufipes                ACATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCTTATTATTTTAAAAATAATAATCCCTAATTATTA-TTATTGTAACCCATTTCTACTTTTTTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTATGATAATAAATTTCGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGCAAACTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTGTCAATTATAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTGATACTAAATTAGCCTAAATA-AATACGCTTATAACCAAC
		Gonioctena_linnaeana              GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAAATAATTAATCAATATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTACTTTAAAAATAATAATCCCTAATTTTAA-TTAATGTAACCCATTTCTACTTTTTTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTATAATAATAAATCTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAACTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCAATTATAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAACTTAG-TCAAATA-AATACATTTATAACCACC
		Gonioctena_variabilis             GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATCAACTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATTTTATATTACAAATAAAAATCCTAAATTATAT-TTAATGTAACCCATTTCTTCTTTTTTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATAAAAAATCTTGAATATTATTATTCTTATAAAATATTCAAATTACGATGATATGTAAATTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTATAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGTTATTTAA-ATTACATTTATAACCAAC
		Gonioctena_fornicata_a            GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATAAATTAATTAAAATTACCTTCAAATCCAAATTCATATTACTTTAAAAATAATAATCTTCAATTATTT-TTAATGTAACCCATTTCTTCTTTTATATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTATTATCAAAATTCTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAATTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGTTTTATAA-ATTACATTTAAAACCAAC
		Gonioctena_fornicata_b            GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATAAATTAATTAAAATTACCTTCAAATCCAAATTCATATTACTTTAAAAATAATAATCTTCAATTATTT-TTAATGTAACCCATTTCTTCTTTTATATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTATTATCAAAATTCTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAATTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGTTTTATAA-ATTACATTTAAAACCAAC
		Gonioctena_occidentalis           GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCACATTCATATTACTTTAAAAATAATAATCCTTAATTTTAA-TTAATGTAACCCATTTCTACTTTCTTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTATTATAATAAATTTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAACTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGACTGTCAATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAACTTTCAAGAACATAACTAATATTAACTCAGCTTAAATA-AATACACTTATAACCAAC
		Gonioctena_interposita_1          ACATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAACAAAATAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATAATCTTAAATTATAT-TTAATGTAACCCATTTCTTCTTTTCCATATACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATAAAAATTCTTGAATATTATAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAATTAACAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTATTACTAATTTAGTTTTTAAA-ATTACACTTAAAACCAAC
		Gonioctena_interposita_2          ACATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAACAAAATAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATAATCTTAAATTATAT-TTAATGTAACCCATTTCTTCTTTTCCATATACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATAAAAATTCTTGAATATTATAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAATTAACAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTATTACTAATTTAGTTTTTAAA-ATTACACTTAAAACCAAC
		Gonioctena_intermedia             GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAACAAATTAATTAAAATTACTCTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATAATCTTAAATTATAT-TTATTGTAACCCATTTCTTCTTTATCATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATAAAAATTCTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAATTAATAAACAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGCTTTTAAA-ATTACATTTAAAACCAAC
		Gonioctena_quinquepunctata        GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATAAATTAATTAAAATTACTCTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATAATCTTAAATTATAT-TTATTGTAACCCATTTCTTCTTTCCCATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATAAAAATTCTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAATTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGCTTTTAAA-ATTACATTTAAAACCAAC
		Gonioctena_holdausi               GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATATTTCCCAATTTTAA-TTATTGTAACCCATTTCTACTTTCATATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTATTATAATAAATTTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAACTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGACTGTCAATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAACTTTCAAGAACATAACTAATACTAACTTAGCTTAAACA-AATACACTTATAACCAAC
		Gonioctena_pallida_1              ACATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAACAAAATAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATAATCTTAAATTATAT-TTAATGTAACCCATTTCTTCTTTTCCATATACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATAAAAATTCTTGAATATTATAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAATTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTATTACTAATTTAGTTTTTAAA-ATTACACTTAAAACCAAC
		Gonioctena_pallida_2              ACATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAACAAAATAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATAATCTTAAATTATAT-TTAATGTAACCCATTTCTTCTTTTCCATATACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATAAAAATTCTTGAATATTATAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAATTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTATTACTAATTTAGTTTTTAAA-ATTACACTTAAAACCAAC
		Gonioctena_tredecimmaculata       GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATGAATTTATTAAAATTACCCTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATAATCCCTAAATTTAT-TTATTGTAACCCATTTCTTCTTTTTTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-CTTTATTCTAATACATCTTGAATATTTAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAACTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCAATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGCTTTAATATAATACATTTATAACCAAA
		Gonioctena_nigroplagiata          GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAAT?ATAATCCTAAATTATTTATTAATGTAACCCATTTCTTCTTTCTTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATTAAAATTTTTAAATATTAAAATTCTTATAAAATATTTAAATTACGATGATATGTAAATTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCAATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGCTTAATAA-ATTACATTTATAAACAAC
		Gonioctena_kamikawai              GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTTATATTACTTTAAAAATAATAATCCTTAATTTTTT-TTAATGTAACCCATTTCTTCTTCTGTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTATTATAATAAATCTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATACTCAAATTACGACGATATGTAAGCTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCAATTATAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGCATAATAA-TATACATTTAAAACCAAC
		Gonioctena_rubripennis            GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATAATCCTAAATTTTTT-TTATTGTAACCCATTTCTTCTTTTTTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTATTATAGTAAATTTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGATGATATGTAAACTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGACTATCAATTATAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGTTTTTAAT-AATACATTTAGAACCAAC
		Oreina_cacaliae                   ACATATTTTAGAGCTAAAATCAATTTAATTAATTAATTAAATTTACTCTCAAATCCAAATTCATATTATTTTATAAATAATAATCCTTAAATAATT-TTATTGTAACCCATTTCTTCTTTTTTATAAACTGCACCTTGATCTGATTTATTTTTATTATAAAAAATCTTGAATATTATTATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATACAAACTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCAATTATAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGCATATAAA-AATACATTTAAAACAAAC
		Chrysomela_tremula                ACATATTTTAGAGCT-AAATCATTTTAATTAATTAATTTAAATTACTGTCAAATCCTTATTCAAATTACTTTAAAAGTAACCATCCCAAAATTTTA-TTATAGTAACCCATTTCTTCTTACTAATAAACTACACCTTGATCTGATTTT-TTTTATTATAATAAATCTTGAATATTTAAATTCTAATAAAATATTCAAACTACGACGATATGTAAACTAATATAGTAAGTGAATTAAATCGTGGATTATCAATCACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTTGAGAATATACCTTATACTAATTTAGTCTATAAA-AATACATTTTAACCCAAC
		Gonioctena_viminalis              GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATCAATTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTACTTTAAAAATAATATTTCCTAATTTTAG-TTACTGTAACCCATTTCTACTTTTGTATAAACTACACCTTGATCT?ATTTA-TTTTATTATAGTAAATTTCGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAACTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGACTGTCAATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAACTTTCAAGAACATAGCTAATACTAACTTAGTCTAAATA-AATACACTTATAACCAAC
	;
END;

BEGIN CODONS;
CODESET * UNTITLED = Universal: all ; 
 END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
USERTYPE onlyTv STEPMATRIX = 4 
 A C G T 
 . 1 0 1 
 1 . 1 0 
 0 1 . 1 
 1 0 1 . 
 ; 
 
 OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
 CHARSET sequence = 1 - 352 ; 
 CHARSET gaps = 353 - 358 ; 
 CHARSET 12s = 1 - 358 ; 
 CHARSET 16s = ; 
 CHARSET COII = ; 
 CHARSET 1stpos = ; 
 CHARSET 2ndpos = ; 
 CHARSET 3rdpos = ; 
 END;