NEXUS
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[Matrix accession#: M447]

BEGIN TAXA;
	TITLE M447;
	DIMENSIONS  NTAX=10;
	TAXLABELS
		Physalaemus_sp._A	Physalaemus_ephippifer	Physalaemus_enesefae	Physalaemus_pustulosus	Physalaemus_petersi	Physalaemus_cf._freibergi	Physalaemus_coloradorum	Physalaemus_pustulatus	Physalaemus_caicai	Physalaemus_sp._C
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M447;
	DIMENSIONS NCHAR=543;
	FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = -  ;
	MATRIX
		Physalaemus_sp._A               CACCCTGAAGTTTATATTCTAATTCTTCCAGGTTTTGG?ATTATTTCTCATATTGTAACCTATTATTCGAGTAAAAAAGAACCATTTGGATATATGGGAATAGTGTGAGCTATAATGTCAATTGGCTTATTAGGCTTTATTGTATGAGCCCATCATATATTTACAACTGACTTAAATGTAGATACACGTGCCTATTTTACATCAGCAACAATAATTATTGCCATTCCAACTGGAGTCAAAGTCTTTAGCTGATTAGCTACTATGCACGGAGGTATTATTAAATGACATGCCGCTATATTATGGGCTTTAGGGTTTATTTTCCTTTTTACAGTTGGTGGATTAACAGGAATTGTTTTAGCTAACTCATCTCTTGATATTGTTCTTCATGACACTTATTATGTAGTAGCACATTTCCACTATGTTTTATCTATAGGAGCTGTTTTTGCTATTATGGCAGGCTTTGTACACTGATTTCCTCTATTTACTGGATATACACTCCACGAAACTTGAACAAAGATTCACTTTGGTGTAATATTTGCTGGT
		Physalaemus_ephippifer          CACCCTGAAGTTTATATCCTTATTCTTCCAGGTTTTGGAATTATTTCTCATATCGTAACCTATTATTCAAGTAAAAAAGAACCATTCGGATATATGGGTATAGTGTGAGCTATAATATCTATTGGTTTATTAGGATTTATTGTATGAGCGCATCATATATTCACAACTGATTTAAATGTAGATACACGTGCCTATTTTACATCAGCAACAATAATTATTGCCATTCCAACTGGGGTTAAAGTCTTTAGTTGATTAGCTACTATGCATGGAGGAATTATTAAATGACATGCCGCTATATTATGAGCTTTAGGATTTATTTTCCTCTTTACAGTTGGTGGGTTAACAGGAATTGTTCTAGCTAATTCATCTCTTGATATTGTTCTTCATGATACTTATTATGTAGTAGCACATTTCCATTATGTTTTATCTATGGGAGCTGTCTTTGCAATTATAGCAGGCTTTGTACACTGATTTCCTTTATTTACTGGGTATACACTCCACGAAACTTGAACAAAGATTCACTTTGGAGTAATATTT?CTGGT
		Physalaemus_enesefae            CATCCTGAAGTTTACATCCTTATTCTACCAGGCTTCGGCATTATCTCTCACATTGTCACTTATTATTCAAGTAAAAAGGAACCGTTTGGCTACATGGGAATAGTTTGAGCCATAATATCAATTGGCTTATTAGGTTTTATCGTTTGAGCTCATCATATATTTACAACTGACTTAAACGTAGATACCCGAGCTTATTTTACATCAGCAACAATAATTATTGCAATCCCAACCGGAGTAAAAGTATTTAGCTGATTAGCTACAATGCATGGAGGTATTATTAAATGACATGCAGCTATGTTATGGGCTTTGGGGTTTATTTTCCTTTTTACAGTTGGAGGATTAACAGGAATTGTTCTAGCCAACTCATCTCTTGATATTGTTCTTCATGATACTTATTACGTAGTAGCCCACTTCCATTATGTTTTATCTATAGGAGCTGTTTTTGCAATTATAGCAGGTTTTGTGCACTGATTCCCTCTTTTTACTGGTTATACTCTTCACGAAACTTGAACAAAAATTCACTTTGGAGCAATATTTGCTGGG
		Physalaemus_pustulosus          CACCCAGAAGTTTATATTTTAATTCTCCCAGGATTTGGAATTATTTCCCATATTGTTACATACTACTCAAGTAAAAAGGAACCTTTTGGTTATATAGGCATAGTTTGAGCTATAATATCAATTGGCCTACTTGGCTTTATCGTTTGAGCTCATCATATGTTTACAACTGATCTGAACGTAGACACACGAGCTTATTTTACTTCTGCAACAATAATCATCGCAATTCCAACCGGCGTAAAAGTCTTTAGTTGATTAGCAACTATACATGGGGGTATTATTAAATGACATGCCGCTATATTATGAGCCTTAGGCTTTATTTTCTTATTTACTGTAGGGGGACTAACAGGCATTGTTCTCGCTAATTCATCTCTAGACATTGTATTACATGATACATATTATGTTGTAGCCCACTTTCATTATGTTTTGTCTATAGGGGCTGTATTTGCTATTATGGCAGGATTTGTTCATTGATTTCCCCTATTTACAGGTTACTCTCTTCACGAGACTTGAACAAAAATTCATTTTGGTGTAATATTTGCAGGT
		Physalaemus_petersi             CATCCAGAAGTTTACATCTTAATTCTCCCTGGGTTTGGTATTATTTCCCATGTTGTCACTTATTATTCAAGCAAAAAAGAACCTTTTGGTTATATAGGTATAGTATGAGCAATAATATCAATTGGATTACTTGGTTTTATTGTATGAGCACATCATATATTTACTACAGATTTAAATGTAGATACACGAGCCTATTTTACTTCAGCAACAATAATTATTGCTATTCCAACTGGTGTTAAAGTTTTTAGCTGATTAGCTACTATACACGGGGGAATTATTAAATGACACGCCGCTATACTATGAGCCCTAGGATTCATTTTCTTGTTTACAGTGGGCGGA?TAACAGGTATTGTTCTTGCTAATTCTTCACTGGATATTGTTCTTCATGATAC?TATTATGTTGTAGCTCATTTTCACTACGTGTTATCAATAGGAGCCGTATTTGCTATTATAGCAGGATTTGTTCATTGATTTCCTTTATTTACTGGTTAT?CCCTTCATGAAAC?TGAACCAAAATCCATTTTGGAGTAATGTTTGCAGGA
		Physalaemus_cf._freibergi       CACCCAGAAGTATATATTTTAATTCTCCCCGGCTTCGGTATTATTTCCCATGTTGTCACTTATTACTCAAGTAAAAAAGAACCTTTTGGTTATATAGGAATGGTTTGAGCAATAATATCTATCGGGTTATTGGGTTTCATTGTATGAGCCCATCACATATTTACCACAGACTTAAATGTAGATACACGAGCCTATTTTACT?????????????????????????????????GTAAAAGTTTTTAGCTGATTAGCTACTATACATGGGGGAATTATTAAGTGACACGCCGCCATACTTTGAGCCTTAGGATTTATTTTCTTGTTTACAGTAGGCGGACTAACAGGTATTGTTCTTGCTAACTCCTCTCTTGATATTGTACTTCATGATACTTATTACGTTGTAGCTCATTTTCACTACGTACTATCAATAGGAGCCGTATTTGCTATTATAGCAGGATTTGTTCATTGATTTCCTTTATTTTCTGGTTATACCCTTCATGAAACTTGAACAAAAATTCACTTTGGGGTGATGTTCGCAGGG
		Physalaemus_coloradorum         CATCCAGAAGTTTATATCCTTATTCTCCCCGGTTTGGGCATTATCTCCCACATTGTAACATATTACTCAAGTAAAAAAGAACCTTTCGGATATATGGGAATAGTATGAGCAATAATATCTATTGGCTTACTTGGYTTTATTGTCTGAGCACACCATATGTTTACAACAGACCTAAATGTAGACACACGAGCCTATTTTACCTCAGCAACAATAATTATTGCCATTCCCACAGGTGTAAAAGTATTTAGTTGATTAGCTACTATGCACGGAGGAATTATTAAATGACACGCCGCAATACTATGAGCTCTCGGATTTATTTTTCTATTTACAGTAGGCGGACTGACGGGCATTGTTCTTGCCAATTCTTCTCTAGATATTGTTCTTCATGACACCTATTATGTGGTAGCTCACTTTCACTATGTCTTATCAATAGGG?CTGTATTTGCTATTATAGCGGGCTTTGTTCACTGATTCCCCTTATTTACCGGATATACTCTTCATGAGACTTGAACTAAAATTCACTTTGGAGTAA-----------
		Physalaemus_pustulatus          CACCCAGAAGTTTACATTCTCATTCTCCCGGGATTTGGTATTATTTCTCACATTGTAACATATTATTCAAGCAAAAAAGAACCTTTTGGTTACATAGGAATAGTTTGAGCAATAATATCTATTGGTTTACTTGGTTTTATCGTTTGAGCACACCATATGTTTACAACAGACCTAAATGTAGATACACGAGCTTATTTCACCTCAGCAACAATAATTATTGCTATCCCCACGGGCGTAAAAGTATTTAGTTGATTAGCTACTATGCATGGGGGAATTATTAAATGACACGCCGCAATACTATGAGCTTTGGGGTTCATCTTTTTATTTACAGTGGGGGGATTAACAGGCATTGTTCTTGCCAACTCTTCCCTAGATATTGTTCTTCATGACACTTACTATGTAGTAGCTCATTTTCACTATGTTTTATCCATGGGGGCTGTATTTACCATTATAGCAGGCTTTATCCATTGATTCCCTTTATTTACTGGATATACTCTTCATGAGACGTGAACAAAAATCCACTTCGGAGTAATATTTTTTGGA
		Physalaemus_caicai              CACCCAGAAGTCTATATTCTTATTTTACCCGGCTTCGGAATTATCTCTCATATTGTAACCTATTATTCAAGTAAAAAAGAACCTTTGGGCTACATGGGTATGGTCTGAGCAATAATATCTATTGGTCTTTTAGGCTTCATTGTTTGAGCACATCATATATTTACAACGGACCTTAACGTGGATACACGAGCCTACTTCACCTCAGCAACAATAATTATTGCCATTCCTACCGGTGTAAAAGTCTTTAGCTGATTAGCCACTATACATGGGGGAATTATTAAATGACACGCCGCAATACTGTGAGCTTTAGGATTTATTTTTCTATTTACTGTGGGAGGACTCACAGGCATCGTTCTCGCCAACTCCTCCCTTGACATTGTTCTTCATGACACCTATTACGTAGTAGCTCACTTTCACTATGTTTTATCCATGGGAACTGTATTTGCTATTATAGCTGGCTTTATTCACTGATTTCCACTATTTACTGGATATACACTTCATGAAACCTGAACAAAAATTCACTTTGGTATTATATTTTCAGGA
		Physalaemus_sp._C               CACCCAGAAGTCTATATTCTTATCTTACCCGGTTTCGGCATTATTTCCCATATCGTAACTTATTATTCCAACAAAAAAGAACCTTTTGGATATATGGGCATGGTTTGAGCAATGATGTCTATTGGCCTTCTAGGCTTTATTGTTTGAGCACATCACATGTTCACAACAGACCTAAACGTGGATACACGAGCTTATTTCACCTCCGCAACAATAATTATTGCTATCCCCACTGGTGTTAAAGTATTTAGTTGATTAGCTACTATGCACGGAGGAATTATTAAATGACACGCCGCAATATTATGAGCTCTAGGATTTATTTTTCTATTTACTGTTGGAGGACTCACAGGCATTGTTCTTGCCAACTCCTCTCTAGATATTGTCCTTCATGACACCTACTATGTAGTAGCTCATTTTCACTATGTTTTATCTATGGGAGCTGTCTTTGCTATTATAGCCGGTTTTGTACACTGATTTCCTTTATTTACCGGATATACACTTCATGAAACCTGAACAAAAATCCACTTCGGAGTTATGTTC??????
	;
END;

BEGIN CODONS;
CODESET * UNTITLED = Universal: all ; 
 END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
 TYPESET * DCC = unord: 1 - 543 ; 
 TYPESET DCC2 = unord: 1 - 543 ; 
 WTSET * dcc = 1000: 1 - 543 ; 
 EXSET NONDNA = ; 
 END;