NEXUS [File created by TreeBASE: 7/26/07 20:56:55] [Matrix accession#: M508] BEGIN TAXA; TITLE M508; DIMENSIONS NTAX=6; TAXLABELS Peltidocotyle_lenha_INVE_22021 Peltidocotyle_lenha_INVE_21912 Peltidocotyle_lenha_INVE_22373 Peltidocotyle_rugosa_INVE_22374 Monticellia_coryphicephala Crepidobothrium_sp. ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE M508; DIMENSIONS NCHAR=617; FORMAT MISSING = - GAP = " DATATYPE = DNA ; MATRIX Peltidocotyle_lenha_INVE_22021 TGTGTGAATTCGTGTGAATCGCAGACTGCTTTGAACATCGACATCTTGAACGCACATTGCGGCTACAGGCTTGCCTGTGGCCACGTCTGACCGAGGGTCGGCTTATAAACTATCACCGCGCCTAAAAAGCGGTGGCTTGTGGGAGTGCCAGCTAGCGCAAACGAACCTGTCG-CCTCCAACGTAACCTTGTGTTTGT-ACGGGTGCGTTGGGGGTTTTTGGTTTTTTGTTAGACTGCAATGGCTTCCCTCCAATTTTGCTTTTATAGCATGTTACCCAGTTTAACGTCTGGCTTATGGTTT-GGTGAAGCCGCTAGTCGTCCTCC---TTCTCCTCCTAGTTGTGTGAGCATTGTAAGTACTGCTG-TGTGGTGG---AGATGGTTTGCGACTTGGGTTCCGCTTGGCCGTGGCTTAGTGTGTGTTTTTGTGTAA----TATAAAGCACGCTGAGTGGATGGCCCATGTGAAGCGGTAGT--AGCCAAATCGACTGTGT---TAG-CCGGTTAACAGTAAAAGGGTGACCACTAGTATGATTGGCGTTGA-AACGAGTATGTG-----ACGCTCAACGCCGAAGCTTCTTCCTGACCTCGGATCAGTCGTGATTACC Peltidocotyle_lenha_INVE_21912 TGTGTGAATTCGTGTGAATCGCAGACTGCTTTGAACATCGACATCTTGAACGCACATTGCGGCTACAGGCTTGCCTGTGGCCACGTCTGACCGAGGGTCGGCTTATAAACTATCACCGCGCCTAAAAAGCGGTGGCTTGTGGGAGTGCCAGCTAGCGCAAACGAACCTGTCG-CCTCCAACGTAACCTTGTGTTTGT-ACGGGTGCGTTGGGGGTTTTTGGTTTTTTGTTAGACTGCAATGGCTTCCCTCCAATTTTGCTTTTATAGCATGTTACCCAGTTTAACGTCTGGCTTATGGTTT-GGTGAAGCCGCTAGTCGTCCTCC---TTCTCCTCCTAGTTGTGTGAGCATTGTAAGTACTGCTG-TGTGGTGG---AGATGGTTTGCGACTTGGGTTCCGCTTGGCCGTGGCTTAGTGTGTGTTTTTGTGTAA----TATAAAGCACGCTGAGTGGATGGCCCATGTGAAGCGGTAGT--AGCCAAATCGACTGTGT---TAG-CCGGTTAACAGTAAAAGGGTGACCACTAGTATGATTGGCGTTGA-AACGAGTATGTG-----ACGCTCAACGCCGAAGCTTCTTCCTGACCTCGGATCAGTCGTGATTACC Peltidocotyle_lenha_INVE_22373 TGTGTGAATTCGTGTGAATCGCAGACTGCTTTGAACATCGACATCTTGAACGCACATTGCGGCTACAGGCTTGCCTGTGGCCACGTCTGACCGAGGGTCGGCTTATAAACTATCACCGCGCCTAAAAAGCGGTGGCTTGTGGGAGTGCCAGCTAGCGCAAACGAACCTGTCG-CCTCCAACGTAACCTTGTGTTTGT-ACGGGTGCGTTGGGGGTTTTTGGTTTTTTGTTAGACTGCAATGGCTTCCCTCCAATTTTGCTTTTATAGCATGTTACCCAGTTTAACGTCTGGCTTATGGTTT-GGTGAAGCCGCTAGTCGTCCTCC---TTCTCCTCCTAGTTGTGTGAGCATTGTAAGTACTGCTG-TGTGGTGG---AGATGGTTTGCGACTTGGGTTCCGCTTGGCCGTGGCTTAGTGTGTGTTTTTGTGTAA----TATAAAGCACGCTGAGTGGATGGCCCATGTGAAGCGGTAGT--AGCCAAATCGACTGTGT---TAG-CCGGTTAACAGTAAAAGGGTGACCACTAGTATGATTGGCGTTGA-AACGAGTATGTG-----ACGCTCAACGCCGAAGCTTCTTCCTGACCTCGGATCAGTCGTGATTACC Peltidocotyle_rugosa_INVE_22374 TGTGTGAATTCGTGTGAATCGCAGACTGCTTTGAACATCGACATCTTGAACGCACATTGCGGCTACAGGCTTGCCTGTGGCCACGTCTGACCGAGGGTCGGCTTATAAACTATCACCGCGCCTTAAAAGCGGTGGCTTGTGGGAGTGCCAGCTAGCGCAAATGAACATGTAG-CCTCCAACGTAGCCCTGTGTTTGT-ACGGGTGCGTTGGAGGCTTTTGTGTTTAAGTTAGACTGCAATGGCTTCCCTCCAATTTTGCTTTTATAGCATGTTACCCAGTTTAACGTCTGGCTTATGGTTT-GGTGAAGCCGCTAGTCGTCCTCCGCCTCCTCCTCCTCGTTGTGTGAGCATTGTAAGTACTGCCG-TGTGGGGGGGGAGATGGTTTGCGACTTGGGTTCCGCTTGGCCGTGGCTTAGTGTGTGTTTTTGTGTAA----TATAAAGCACGCTGAGTGGAATGACCATGTGAAGCGGTAGT--AGCCAAATCGACTGTGT---TAG-CCAGTTAACAA-AAGAGGGTGACCACTTGTATGATTGGCGTTGA-AAAGAGTGTGTA-----AAGCTCAACGCCGAAGCTTC---CTGACCTCGGATCAGTCGTGATTACC Monticellia_coryphicephala TGTGTGAATTCGTGTGAATCGCAGACTGCTTTGAACATCGACATCTTGAACGCACATTGCGGCTACAGGCTTG---GTGGCCACGTCTGACCGAGGGTCGGCTTATAAACTATCACTGCGCCTAAAAAGCAGTGGCTTGGGGGAATGCCAGCTAGCGCAAACGGACCTAAAGGCCTCCTGCGTTGCTCAATCTTTAGTATGGGCGCGTAGGGGGCTTGTGG-TTTTAGTTAGATTTCCATGGCTTCCTTCTAATTTTGCTTTTATAGCATGTTACCCAGTTTAACGTCTGGCTTATGGTTTTGGTGCAGCCGCTGGTTGCCTTCC------------TCGTTGTGATAGCATTGTAGGTACTACTGCTGTGAGGGG-----------GCGACTGTGGTTCTGCTTGGCCGTGGCTTAGTGTGT-TTTTGTTGTAAATGTTGTAAAGCACGCTGAGTGTATGGACCATGTAAGGCGGCAGCCTCGACCAACTGTGTGTGTGTATAGGCCTGTTAACAA-AAAAGGGTGACAACTGTGATAATTGGTGTGTAGACACTGTGTGTG---------TGTATGTGTATGTATC-----AGCC-----CCAATGCTTCCTACC Crepidobothrium_sp. TGTGTGAATTCGTGTGAATCGCAGACTGCTTTGAACATCGACATCTTGAACGCACATTGCGGCTACAGGCTTGCCTGTGGCCACGTCTGACCGAG-----GCTTATAAACTATCACTGTGCCTAAAAAGCAGTGGCGTGGGGGATTGCCAGCTAACGCAATCAGG-ATATCG-CCTCCTGCGTTGCCACATGTTATTCATGGGCTCGCAGGAGGCGTTT-TTCCTTTGTTAGATTACAATGGCTTCCTTCCAATTTTGCTTTTATAGCATGTTACCCAGTTTAACGTCTGGCTTATGGTTT-GGTGCAGCCGCTCGTCGCCTTGC------------TCGTTGTGTAAGCATTGTAAGTACTGCTG---TGAGGGG------------CGACTGTGGTTCCGCTTGGCCGTGGCTTAGTGTG----TTTGTGTAC----TGTAAAGCACGCTGAGTGTATGGACCATATAAGGCGGCAGTTCAGCCAAATG---TATGT----AGGCCTGTTAACAA-GAAAGGGTGACCACTAGTACAATTGGTGTTGATAATGTTGTTGTGTTATCATTATCAACGTCGAAGCTTC---CTGACCTCGGATCAGTCGTGAATACC ; END; BEGIN CODONS; GENCODE UNIVNUC ; END; BEGIN ASSUMPTIONS; OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; END;