NEXUS
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[Matrix accession#: M680]

BEGIN TAXA;
	TITLE M680;
	DIMENSIONS  NTAX=12;
	TAXLABELS
		Psithyrus_vestalis	Psithyrus_sylvestris	Psithyrus_rupestris	Psithyrus_norvegicus	Psithyrus_bohemicus	Psithyrus_barbutellus	Bombus_terrestris	Bombus_pratorum	Bombus_lucorum	Bombus_lapidarius	Bombus_hypnorum	Apis_mellifera
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M680;
	DIMENSIONS NCHAR=532;
	FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = :  ;
	MATRIX
		Psithyrus_vestalis          ATTATAATAATAAAAAATTATTCATTAAACTTTGATCAAATTAATTTATTTTCCTGATCAATTTGTATTACTGTTATTTTATTATCTTTATCTTTACCCGTTTTAGCAGGAGCTATTACAATACTTCTATTTGATCGAAATTTTAATACATCATTCTTTGATCCAATAGGTGGAGGTGATCCAATTCTTTACCAACATTTATTCTGATTTTTTGGACATCCAGAAGTTTATATTTTAATCCTTCCAGGATTTGGATTAATTTCACAAATTATTATAAATGAAAGAGGAAAAAAAGAAACTTTTGGAAATCTTAGTATAATTTACGCAATATTAGGTATTGGATTCTTAGGTTTTATTGTTTGAGCTCACCATATATTCACTGTAGGATTAGATGTTGATACACGAGCATATTTTACATCAGCAACAATAATTATTGCAATTCCTACAGGAATTAAAATTTTTAGTTGACTAGCTACATATCATGGATCAAAAATAAACATAAATATTACAATTATTTGATCAATTGGATTTA
		Psithyrus_sylvestris        ATTATAATAATAAAAAATTACTCAATAAATTTTGATCAAATCAATTTATTTTCTTGATCTGTTTGTATTACTGTAATTTTATTAACTTTATCTTTACCAGTTTTAGCTGGTGCAATTACAATATTATTATTTGATCGAAACTTTAATACATCATTTTTTGATCCAATAGGTGGTGGTGATCCTATTCTTTATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGTCATCCAGAAGTTTATATTCTAATTCTACCAGGATTTGGATTAATTTCACAAATTATTATAAATGAAAGAGGAAAAAAAGAAACTTTTGGAAATTTAAGAATAATTTATGCAATATTAGGAATTGGATTCTTAGGATTTATTGTTTGAGCTCATCATATATTTACTGTAGGATTAGATGTTGATACACGAGCATACTTTACATCTGCTACAATAATTATTGCAATTCCAACAGGAATTAAAGTTTTTAGTTGACTAGCAACTTATCATGGATCAAAAATAAATTTAAATATTACAATTATTTGATCAATTGGATTTA
		Psithyrus_rupestris         ATTATAATAATAAAAAATTATTCATTAAATTATGATCAAATTAATCTATTTTCATGATCAATTTATATTACTGTAATTTTATTAACTTTATCTTTACCTGTTTTAGCAGGAGCAATTACAATATTATTATTTGATCGAAATTTTAATACATCATTTTTTGATCCAATAGGTGGTGGAGATCCTATTCTTTATCAACATCTATTTTGATTTTTTGGACATCCAGAAGTATATATTTTAATTCTTCCAGGATTTGGATTAATTTCTCAAATTATTATAAATGAAAGAGGAAAAAAAGAAACTTTTGGAAATTTAAGAATAATTTATGCAATATTAGGAATTGGATTTTTAGGATTTATTGTTTGAGCTCATCATATATTTACTGTTGGTTTAGATGTTGATACACGAGCATATTTTACATCAGCAACAATAATTATTGCAATTCCAACAGGAATTAAAGTTTTTAGTTGACTAGCAACTTATCATGGATCAAAATTAAATCTTAGAATTACAATTATTTGAACAATTGGATTTA
		Psithyrus_norvegicus        ATTATAATAATAAAAAATTATTCAATAAATTTTGATCAAATTAATTTATTCTCTTGATCCGTTTGTATTACTGTAATTTTATTAACCTTATCTTTACCTGTTTTAGCAGGTGCAATTACAATATTATTATTTGATCGAAATTTTAATACATCATTTTTTGATCCAATAGGAGGAGGTGATCCAATTCTTTATCAACATCTATTTTGATTTTTTGGACATCCAGAAGTATATATTTTAATTCTTCCAGGATTTGGATTAATCTCACAAATAATAATAAATGAAAGAGGAAAAAAAGAAACGTTTGGAAATTTAAGAATAATTTATGCAATATTAGGAATTGGATTCTTAGGTTTCATTGTTTGAGCTCATCATATATTTACTGTAGGTATAGATGTTGATACACGAGCATATTTTACATCTGCAACAATAATTATTGCAATTCCAACAGGAATTAAAGTATTTAGTTGACTAGCAACTTACCATGGATCTAAAATAAATTTAAATATTACAATTATTTGATCAATTGGATTTA
		Psithyrus_bohemicus         ATTATAATAATAAAAAATTATTCATTAAACTTTGATCAAATCAATCTATTCTCCTGATCAGTATGTATTACTGTAATTTTATTATCTCTATCTTTACCTGTTTTAGCAGGAGCAATTACAATATTATTATTTGATCGAAATTTCAATACATCATTCTTTGATCCTATAGGAGGAGGTGATCCAATTCTTTATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGACATCCAGAAGTTTATATTTTAATTCTTCCGGGATTTGGATTAATTTCACAAATAATTATAAACGAAAGAGGAAAAAAAGAAACTTTTGGAAATTTAAGAAGCGTTTATGCAATACTAGGTATTGGATTTTTAGGATTTATTGTTTGAGCTCATCATATATTTACTGTTGGAATAGATGTAGACACACGAGCATATTTTACATCAGCAACAATAATTATTGCAATTCCTACAGGAATTAAAGTTTTTAGTTGACTAGCAACTTATCATGGATCAAAAATAAACTTAAATATTACAATCATTTGATCAATTGGATTTA
		Psithyrus_barbutellus       ATTATAATAATAAAAAATCATTCATTAAATTTTGATCAAATTAATTTATTTCCCTGATCAATTTGTATTACTGTAATTTTATTAACTTTATCATTACCAGTATTAGCAGGAGCAATTACTATACTATTATTTGATCGAAATTTTAATACATCATTTTTTGACCCAATAGGTGGAGGAGATCCAATTCTTTATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGACACCCAGAAGTTTATATTTTAATTCTTCCAGGATTTGGATTAATTTCACAAATTATTATAAATGAAAGTGGAAAAAAAGAAACTTTTGGAAATTTAAGAATAATTTATGCAATATTAGGTATTGGATTTTTAGGATTTATTGTTTGAGCTCATCATATATTTACTGTAGGAATAGATGTTGATACACGAGCTTATTTTACATCAGCAACAATAATTATTGCAATTCCTACAGGAATTAAAGTATTCAGTTGACTAGCAACTTATCATGGATCAAAAATTAATTTAAATATTTCTATTATTTGATCAATTGGATTTA
		Bombus_terrestris           ATTTTATTAATAAAAAATTTTTCATTAAATTATGATCAAATTAATTTATTTTCATGATCAGTATGTATTACAGTAATTTTATTAATTCTATCTTTACCAGTATTAGCCGGTGCAATTACTATATTATTATTTGATCGAAATTTTAATACTTCATTTTTTGACCCAATAGGAGGAGGAGACCCAATCCTTTATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGCCACCCAGAAGTATATATTTTAATTTTACCAGGATTTGGATTAATCTCTCAAATTATTATAAATGAAAGAGGTAAAAAAGAAACCTTTGGAAATTTAAGAATAATTTATGCTATATTAGGAATTGGATTTTTAGGTTTTATTGTTTGAGCTCATCATATATTTACTGTAGGATTAGATGTTGATACACGAGCATATTTTACATCAGCTACAATAATTATTGCCGTACCTACAGGAATTAAAGTTTTTAGATGATTAGCAACATATCATGGTTCAAAAATAAATTTCAATATTACAATTATCTGATCAATTGGATTTA
		Bombus_pratorum             ATTATATTAATAAAAAATTTTTCATTAAATTATGATCAAATTAATTTATTTTCTTGATCAGTTTGTATTACAGTAATATTATTAATTCTATCTTTACCAGTTTTAGCAGGAGCAATTACTATACTTCTTTTTGATCGAAATTTCAATACATCTTTTTTTGATCCTATAGGAGGTGGAGATCCAATTTTATATCAACATCTATTTTGATTTTTTGGACATCCAGAAGTTTATATTTTAATTCATCCAGGATTTGGATTAATCTCTCAAATTATTATAAATGAAAGAGGAAAAAAAGAAACTTTTGGAAATTTAAGAATAATTTATGCAATATTAGGAATTGGATTTTTAGGATTTATTGTTTGAGCTCATCATATATTTACTGTTGGTTTAGATGTTGATACTCGAGCATATTTTACATCAGCTACAATAATTATTGCTGTACCTACAGGAATTAAAGTATTCAGTTGATTAGCAACTTATCATGGTTCAAAAACAAATTTTAATATTACAATTATTTGATCAATCGGATTTA
		Bombus_lucorum              ATTTTAATAATAAAAAATTTTTCATTAAATTATGATCAAATTAACTTATTTTCATGATCAGTATGTATTACTGTAATTTTATTAATTTTATCTTTACCAGTATTAGCTGGAGCAATTACTATATTACTTTTTGATCGAAATTTTAATACCTCATTTTTTGACCCTATAGGTGGAGGAGATCCAATTTTATATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGGCACCCAGAAGTATATATTTTAATTTTACCAGGATTTGGATTAATTTCGCAAGTTATTATAAATGAAAGAGGTAAAAAAGAAACCTTTGGAAATTTAAGAATAATTTATGCTATATTAGGAATTGGATTTTTAGGATTTATTGTTTGAGCTCACCATATATTTACTGTTGGATTAGATGTAGATACACGAGCATATTTTACATCTGCTACAATAATTATTGCTGTACCTACAGGAATTAAAGTTTTTAGATGATTAGCTATATATCATGGTTCAAAAATAAATTTTAATATTACAATTATTTGATCAATTGGATTTA
		Bombus_lapidarius           ATTATATTAATAAAAAATTTTTCATTAAATTATGATCAAATTAATTTATTTTCCAGATCAGTTTGTATTACAGTAATATTATTAATTCTATCTTTACCAGTTTTAGCAGGAGCAATTACTATACTTCTTTTTGATCGAAATTTCAATACATCTTTATTTGATCCTATAGGAGGTGGAGATCCAATTTTATATCAACATCTATTTTGATTTTATGGACATCCAGAAGTTTATATTTTAATTCTTCCAGGATTAGGATTATTATCTCAAATTATTATAAATGAAAGAGGAAAAAAAGAAATTTTTGGCAATTTAAGATTAATTTATGCCATAATAGGAATTGGATTTTTAGGATTTATCGTTTGAGCTCATCATATATTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACACGAGCTTATTTTACATCAGCAACTATAATTATTGCTGTTCCAACAGGAATTAAAGTATTTAGATGATTAGCTACTTATCATGGATCAAAAGTAAATTTTAATATTACAATCATTTGATCAATTGGATTTA
		Bombus_hypnorum             ATTATATTAATAAAAAATTTTTCATTAAATTATGATCAAATTAATTTATTCTCTTGATCAGTTTGTATTACAGTAATATTATTAATTTTATCTTTACCAGTTTTAGCAGGAGCAATTACTATACTTCTTTTTGATCGAAATTTTAATACATCTTTCTTCGATCCAATAGGAGGAGGTGATCCTATTCTTTATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGACATCCAGAAGTTTATATTTTAATTCTACCTGGATTTGGATTAATTTCTCAAATTATTATAAATGAAAGAGGAAAAAAAGAAACTTTTGGAAATTTAAGAATAATTTATGCAATATTAGGAATTGGATTTTTAGGATTTATTGTTTGAGCTCACCATATATTTACTGTTGGATTAGATGTTGATACTCGAGCTTATTTTACATCAGCTACAATAATTATTGCTGTTCCAACAGGAATTAAAGTATTTAGATGATTAGCAACTTATCACGGATCAAAAATAAATTTTAATATTACTATCATTTGATCAATTGGATTTA
		Apis_mellifera              ATTATAATAATAAAAAATTTTTCTATAAATTATGACCAAATTTCATTATTTCCATGATCAGTTTTTATTACAGCAATTTTATTAATTATATCATTACCTGTATTAGCTGGAGCAATTACTATACTATTATTTGATCGAAATTTTAATACATCATTTTTCGATCCTATAGGAGGTGGAGATCCAATTCTTTATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGTCATCCAGAAGTTTATATTTTAATTTTACCTGGATTTGGATTAATCTCTCATATTGTAATAAATGAAAGAGGAAAAAAAGAAATTTTTGGTAATTTAAGAATAATTTATGCAATATTAGGAATTGGATTTCTAGGTTTTATTGTTTGAGCACATCACATATTTACAGTCGGATTAGATGTTGATACTCGAGCATATTTTACTTCAGCAACAATAATCATTGCTGTACCAACAGGAATTAAAGTTTTTAGATGATTAGCAACTTATCATGGTTCAAAATTAAAATTAAATATTTCAATTTTATGATCACTAGGTTTTA
	;
END;

BEGIN CODONS;
CODONPOSSET * CodonPositions = 
 N: 1 - 532 ; 
 CODESET * UNTITLED = Universal: all ; 
 END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
 END;