NEXUS
[File created by TreeBASE:  7/26/07  20:58:20]
[Matrix accession#: M785]

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	TITLE M785;
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		Downingia_pusilla_e           TCG-AAACCTGCAACAACG-CAGAAC-GACCCG--CGAACACGTTATCAACACTTCT-TTAAGTCCGCCCGCCCGGGGTC-TCCCCGTCCGGACGG-CACCTAA--CGAACCCCGGCGCGATCC-GCGCCAA-GGAATACGAAAAA--ACTCGAGGGCTGCCC-GTCCCGGTCGATGCCCGTTCGCGGG-GCCTTCGGCCGGTC-CCGGTGCTAGTC-CCTTAGTGA-AAACACATCGCGTCGCCCCCCA---AAGCACCACGTGTGC--GCGGGGAGCGGATATTGGCCTCCCGTGCCCCCTCCTACACAGGGGACGGACGCGGTTGGCTAAAAATGGAGTCCCCGGTTGAGGAC-GCACGACAAGTGGTGGTTTTAAATCTAAC-TGTCGTC-CAGTCGTGCGCAC-GTCCTTAGTCGTTGGTGCTTCGACCCTTGCGCG-TCGTCCCCATTTT-CAATGGAA-CGGCGCTTCGA
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		Downingia_cuspidata_i         TCG-AAACCTGCAACAACG-CAGAAC-GACCCG--CGAACACGTTATCAACACTTCT-TTAAGTCCGCCCGCCCGGGGTC-TCCCCGTCCGGACGG-CACCTAA--CGAACCCCGGCGCGATCC-GCGCCAA-GGAATACGAAAAA--ACTCGAGGGCTGCCC-GTCCCGGTCGATGCCCGTTCGCGGGCGCCTTCGGCCGGTC-CCGGTGCAAGTC-CCTTAGTGA-AAACACATCGCGTCGCCCCCCA---AAGCACCACGTGTGC--GCGGGGAGCGGATATTGGCCTCCCGTGCCCCCTCCTGCACAGGGGACGGACGCGGTTGGCTAAAAATGGAGTCCCCGGTTGAGGAC-GCACGACAAGTGGTGGTTTTAAATCTAAC-TGTCGTC-CAGTCGTGCGCAC-GTCCTTAGTCGTTGGTGCTTCGACCCTTGCGCG-TCGTCCCCATTCT-CAATGGAA-CGGCGCTTCGA
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		Downingia_bicornuta_a         TCG-AAACCTGCAACAAAG-CAGAA?-GACC-G--CGAACACATTATCAACACTTCT-TTAAGTCCGCCCCCCCGGGGTC-TCCCCGTCGGGACGG-CACCTAA--CGAACCCCGGCGCGATCC-GCGCCAA-GGAATACAAAAA--TACTCGAGGGTTGCCC-GTCCCGGTCRAYRCCCGTTCGCGGGTGCCTTCGGTCGGTC-CCGGTGCA-GTC-TCTTAGTGAAAAACACATCGCGTCGCCCCCCA---AAGCACCACGTGTGC--GCGGGGAGCGGATATTGGCCTCCCGTGCCCCCTCCTCTAACCGGGAGG-ACGCGGTTGGCTAAAAATGGAGTCCCCGATTGAGGAC-GCACGACAAGTGGTGGTTTTAAATCTAAC-TGTCGTC-CAGTCGAGCGCAT-GTCCTTAGTCGTTGGTGCTTCGACCCTTGCGCG-CCGTC-TCATTCT-CAATGG?A????????????
		Downingia_ornatissima_e       TCG-AAACCTGCAACAAAG-CAGAAT-GACCCG--CGAACATGTTATCTAAACTTCT-TTAAGTCCGCCCCCCCGGGGTC-TCCCCGTCGGGACGG-CACCTAA--CGAACCCCGGCGCGATCC-GCGCCAA-GGAATACAAAAAAA--CTCGAGGTCTGCCC-GTCCCGGTCGATGCCCGTTCGCGGGCGCCGTCGGCCGGTC-TCGGTGCA-GCA-TCTTAGTGA-AAACACATCGCGTCGCCCCCCA---AAGCACCACGTGTGC--GCGGGGAGCGGATATTGGCCTCCCGTGCCCCCCCCC--AAG--GGAGGGACGCGGTTGGCTAAAAATGGAGTCCCTGATTGAGGAC-GCACGACAAGTGGTGGTTTTAAATCTAAC-TGTCGTC-CAGTCGTGCGCAC-GTCCTTGATCGTTGGTGCTTCGACCCTTACGCG-ACGTC-CCATTCT-CAATGGAA-CGGCGCTTCGA
		Downingia_ornatissima_d       TCG-AAACCTGCAACAAAG-CAGAAT-GACCCG--CGAACAYGTTATCTAAACTTCT-TTAASTCCGCCCCCCCGGGGTC-TCCCCGTCGGGACGG-CACCTAA--CGAACCCCGGCGCGATCC-GCGCCAA-GGAATACAAAAAAA--CTCGAGGTCTGCCC-GTCCCGGTCGATGCCCGTTCGCGGGCGCCGTCGGCCGGTC-TCGGTGCA-GCA-TCTTAGTGA-AAACACATCGCGTCGCCCCCCA---AAGCACCAYGTGTGC--GTGGGGAGCGGATATTGGCCTCCCGTGYCCCC-CCATCAAG--GGAGGGACGCGGTTGGCTAAAAATGGAGTCCCTGATTGAGGAC-GCACGACAAGTGGTGGTTTTAAATCTAAC-TGTCGTC-CACTCGTGCGCAC-GTCCTTGATCGTTGGTGCTTCGACCCTTACGCG-ACGTC-CCATTCT-CAATGGAA-CGGCGCTTCGA
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		Downingia_bicornuta_e         TCG-AAACCTGCAACAAAG-CAGAAC-GACCCG--CGAACACGTTATCAACACTTCT-TTAAGTCCGTCCCCC-GGGGTC-TCCCCGTCGGGGCGGGCACCTAA--CGAACCCCGGCGCGATCC-GCGCCAA-GGAATACAA-AAATA-CTCGAGGGCTGCCC-GTCCCGGTCGATGCCCGTTCGCGGGTGCCTTCGGCCGGTC-CTGGTGGCAGTC-TCTTAGTGA-AAACACATCGCGTCGCCCCCCA---AAGCACCACGTGTGC--GCGGGGAGCGGATATTGGCCTCCCGTGCCCCCTCCTCTAACCGGGAGGGACGCGGCTGGCTAAAAATGGAGTCCCCGATTGAGGAC-GCACGACAAGTGGTGGTTTTAAATCTAAC-TGTCGTC-CAGTCGTGCGCAC-GTCCTAAGTCGTTGGTGCTTCGACCCTTGCGCG-CCGTC-CCATTCT-GAATGGAA-CGACGCTTCGA
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BEGIN CODONS;
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BEGIN ASSUMPTIONS;
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