NEXUS
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[Matrix accession#: M825]

BEGIN TAXA;
	TITLE M825;
	DIMENSIONS  NTAX=16;
	TAXLABELS
		Stylocheilus_longicauda	Phyllaplysia_taylori	Phyllaplysia_sp.	Petalifera_ramosa_Philippines	Petalifera_ramosa_Canary_Islands	Notarchus_indicus_Philippines	Notarchus_indicus_Japan	Dolabrifera_dolabrifera	Dolabella_auricularia_Mexico	Dolabella_auricularia_Guam	Bursatella_leachii	Aplysia_punctata	Aplysia_cervina	Akera_bullata	Haminoea_virescens	Bulla_gouldiana
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M825;
	DIMENSIONS NCHAR=432;
	FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = -  ;
	MATRIX
		Stylocheilus_longicauda                AGCTTAGAGA---AATTATTCTAGGTGAAGCCTGCCCGGTGAAGA----TTTAACGGCCGCGGTACCCTGACCGTGCTAAGGTAGCGTAATCAGTTGACTTTTAAATGAAGTCTAGTATGAATGGATCAATGGGATTAAGCTGTCTCTTTTTTATTTTATTGAAATTACTAATTAGGTGAAAAGGCCTAAAAGTGAAAAAGGACGAGAAGACCCTTAGAGTTTTAATAATAAATTTTTGTTGGGGCGACAAGAAGACATAAT-TAACTCTTCTAAAATAAAATTT--ACTTGCCGGTTTTTCCAAGAATGGATAAACTACCTAAGGGATAACAGCATAATCCA--TTTATGGGTTTGTGACCTCGATGTTGGACTAGGAAACTTGTATCCTAGCAGGATATATAGTTAGGTTCTGTTCGAACTTTTTCTCCT
		Phyllaplysia_taylori                   AGCCTAGAGA--AAATTATTCTAGGTGAAGCCTGCCCGGTGATTTAA--TTTAACGGCCGCGGTACTT-GACCGTGCTAAGGTAGCGTAATCAGTTGACTTTTAAATGAAGTCTTGTATGAATGGATTTATGGGATTAAGCTGTCTCTTCTGTACTTTATTGAAATTACTAACTAGGTGAAAAGGCCTAGGAATGAAAAAGGACGAGAAGACCCTTAGAGTTTTTATA-ACGATTTTTGTTGGGGCGACAAGAAGACATCTA-TAACTCTTCTATTATAAAACTT-ATCTTGCCGGGTTTTCCAAGTATGGATAAACTACCTGAGGGATAACAGCATAATCCA--TTAATGGGTTTGTGACCTCGATGTTGGACTAGGAAACTTACATCCTAGCAGGATGTATAGTTAGGTTCTGTTCGAACTTTTTCTCCT
		Phyllaplysia_sp.                       AGTCTAGAGA-AAAGTTATTCTAGATGAAGCCTGCCCGGTGATCAGA--TTTAACGGCCGCGGTACTTTGACCGTGCTAAGGTAGCGTAATCAGTTGACTTTTAAATGAAGTCTTGTATGAATGGATTTATGGGATTAAGCTGTCTCTTCCGCACTCTATTGAAATTACTAACTAGGTGAAAAGGCCTAGAAATGAAAAAGGACGAGAAGACCCTTAGAGTTTTTATAAAGAATTTTTGTTGGGGCGACAAGAAGACATCTA-TAACTCTTCTGTTGTAAAGTTT---ACTGCCGGGTTTTTCAAGAACGGATAAACTACCTGAGGGATAACAGCATAATCCA--TTAATGGGTTTGTGACCTCGATGTTGGACTAGGAAACTTGCATTCTAGCAGAATGTATAGTAAGGTTCTGTTCGAACTTTTTATCCT
		Petalifera_ramosa_Philippines          AGCCTAGAGAGA--ATTATTCTAGGTGAAGCCTGCCCAGTGAAA--CTTTTCAACGGCCGCGGTACTTTGACCGTGCTAAGGTAGCGTAATCAGTTGACTTTTAAATGAAGTCTTGTATGAATGGATCCATGGGATTAAGCTGTCTCTTCCTTACTCTATTGAAATTACTAACTAGGTGAAAAGGCCTAGGAATGAAAAAGGACGAGAAGACCCTTAGAGTTTTAATC-ATGATTTTTGTTGGGGCGACAAGAAGACATATA-TAACTCTTCTATAAAAAGATCC--ACTTGCCGGTTTTTTCAAGTATGGATAAACTACCTGAGGGATAACAGCATAATCCA---TTTTGGGTTTGTGACCTCGATGTTGGACTAGGAAACTTATGTCCTAGCAGGATGTATAGTTAGGTTCTGTTCGAACTTTTTCTCCT
		Petalifera_ramosa_Canary_Islands       AGCCTAGAGGGA--ATCATTCTAGGTGAAGCCTGCCCAGTGAAA--TTTTTCAACGGCCGCGGTACTTTGACCGTGCTAAGGTAGCGTAATCAGTTGACTTTTAAATGAAGTCTTGTATGAATGGATCCATGGGATTAAGCTGTCTCTTCCTTACTCTATTGAAATTACTAACTAGGTGAAAAGGCCTAGGAATGAAAAAGGACGAGAAGACCCTTAGAGTTTTAATC-ATGATTTTTGTTGGGGCGACAAGAAGACATATA-TAACTCTTCTATAAAAAGATCT--ACTTGCCGGTTTTTTCAAGTATGGATAAACTACCTGAGGGATAACAGCATAATCCA---TTTTGGGTTTGTGACCTCGATGTTGGACTAGGAAACTTATGTCCTAGCAGGATGTATAGTTAGGTTCTGTTCGAACTTTTTCTCCT
		Notarchus_indicus_Philippines          AGCCTGGGGA---ATTGATTCTAGGTGAGACCTGCCCGGTGAATTA--TTTTAACGGCCGCGGTACTTTGACCGTGCTAAGGTAGCGTAATCAGTTGACTTTTAAATGAAGTCTTGTATGAATGGATCTTTGGGATTAAGCTGTCTCTACCTTATTCTATTGAAATTACTAACTAGGTGAAAAGGCCTAGGAATGAAAAAAGACGAGAAGACCCTTAGAGTTTTTACT-AAAGTTTTTGTTGGGGCGACAAGAAGACATATA-TAACTCTTCTATTATACGA-TTG--CATGCCGATCTTATTAAGAATGGATAAACTACCTGAGGGATAACAGCATAATCCAG---TATGGGTTTGTGACCTCGATGTTGGACTAGGAATCTTATGCCCTAGCCGGGTGTA-AGGAAGGTTCTGTTCGAACTATTATTCCT
		Notarchus_indicus_Japan                AGCCTGGGGA---ATTGA-TCTAGGTGAGACCTGCCCGGTGAATTA--TTTTAACGGCCGCGGTACTTTGACCGTGCTAAGGTAGCGTAATCAGTTGACTTTTAAATGAAGTCTTGTATGAATGGATCTTTGGGATTAAGCTGTCTCTACCTTATTCTATTGAAATTACTAACTAGGTGAAAAGGCCTAGGAATGAAAAAAGACGAGAAGACCCTTAGAGTTTTTACT-AAAGTTTTTGTTGGGGCGACAAGAAGACATATA-TAACTCTTCTATTATACGA-TTG--CATGCCGATCTTATTAAGAATGGATAAACTACCTGAGGGATAACAGCATAATCCAG---TATGGGTTTGTGACCTCGATGTTGGACTAGGAATCTTATGCCCTAGCCGGGTGTA-AGGAAGGTTCTGTTCGAACTATTATTCCT
		Dolabrifera_dolabrifera                AGCCTAGAGGGAGAATGATTCTAGGTGAAGCCTGCCCGGTGATTGAG--TTTAACGGCCGCGGTACTTTGACCGTGCTAAGGTAGCATAATCAGTTGACTTTTAAATGAAGTCTTGTATGAATGGATTTATGGGATTAAGCTGTCTCTTCCCTATTTTATTGAAGTTACTAACTAGGTGAAAAGGCCTAGGAATGAAAAAGGACGAGAAGACCCTTAGAGTTTTAATA-ACGATTTTTGTTGGGGCGACAAGAAGACATCTA-TAACTCTTCTAGTGTAAG-TTT-AACTTGCCGGTTTTTTCAAGTATGGATAAACTACCTGAGGGATAACAGCATAATCCA--TTAATGGGTTTGTGACCTCGATGTTGGACTAGGAAACTTATATCCTAGCAGGATGTATAGTTAGGTTCTGTTCGAACTTTTTCTCCT
		Dolabella_auricularia_Mexico           AGCCTAGAGG--GAATTATTTTAGGTGAAGCCTGCCCAGTGATAGAGA-TTTAACGGCCGCGGTACTTTGACCGTGCTAAGGTAGCATAATCAGTTGACTTTTAAATGAAGTCTTGTATGAATGGATCCATGGGATTAAGCTGTCTCTTCCTTATTCTGTTGAAATTACTAAATAGGTGAAAAGGCCTATAAATGAAAAAAGACGAGAAGACCCTTAGAGTTTTTATA-AAGATTTTTGTTGGGGCGACAAGAAGACATTAT-AAACTCTTCTAGTATATAGTTTG-ACTTGCCGATTTTTTTAAGTATGGATAAACTACCTGAGGGATAACAGCATAATCCAATTTTTTGGGTTTGTGACCTCGATGTTGGACTAGGAAACTTATACTCTAGCAGAGTGTAAAGTTAGGTTCTGTTCGAACTTTTCTTCCT
		Dolabella_auricularia_Guam             AGCCTAGAGG--GAATAATTCTAGGTGAAGCCTGCCCAGTGACAGAGATTTTAACGGCCGCGGTACTTTGACCGTGCTAAGGTAGCATAATCAGTTGACTTTTAAATGAAGTCTTGTATGAATGGATCCATGGGATTAGGCTGTCTCTTCCTTACTCTATTGAAATTACTAAATAGGTGAAAAGGCCTATAAATGAAAAAAGACGAGAAGACCCTTAGAGTTTTTATGAAGGATTTTTGTTGGGGCGACAAGAAGACATTTAGTAACTCTTCTGGTAGACAATTTGAACTTGCCGATTCTTTTAAGTATGGATAAACTACCTGAGGGATAACAGCATAATCCAA-TTTTTGGGTTTGTGACCTCGATGTTGGACTAGGAAACTTGTACTCTAGCAGGGTATAAAGTTAGGTTCTGTTCGAACTTTTCTTCCT
		Bursatella_leachii                     AGCCTAGAGA--AAATTATTCTAGGTGAAGCCTGCCCAGTGAAAA--TTTTTAACGGCCGCGGTACTTTGACCGTGCTAAGGTAGCGTAATCAGTTGACTTTTAAATGAAGTCTTGTATGAATGGATCTATGGGATTAAGCTGTCTCTTATCTACTATACTGAAATTACTAATTAGGTGAAAAGGCCTAAAAATGAAAAAGGACGAGAAGACCCTTAGAGTTTTGATTATAAATTTTTGTTGGGGCGACGGGAAGACATTA--TAACTCTTCTATAATAAGACTT--ACTTGCCGGTTTTTTCAAGTATGGATAAACTACCTGAGGGATAACAGCATAATCCA--TTAATGGGTTTGTGACCTCGATGTTGGACTAGGAAACTTATATTCTAGCAGAATATATAGTTAGGTTCTGTTCGAACTTTCTCTCCT
		Aplysia_punctata                       AGCCTAGGGA--GAATTATCTTAGGTAAAACCTGCCCGGTGACTAGA-TTTTAACGGCCGCGGTACTTTGACCGTGCTAAGGTAGCGTAATCAGTTGACTTTTAAATGAAGTCTTGTATGAATGGATTTATGGGATTAAGCTGTCTCTTTTGTATTCTATTGAAATTACTAATTAGGTGAAAAGGCCTAAAAATGAAAAAAGACGAGAAGACCCTTAGAGTTTTAATA-ATGGTTTTTGTTGGGGCGACAAGAAGACACTTATTAACTCTTCTATTACAAAATAC--TCTTGCCGGTTCTTTTAAGTATGGATAAACTACCTTAGGGATAACAGCATAATCCAG---TTTGGGTTTGTGACCTCGATGTTGGACTAGGAAAGTTACACCCTAGCAGGGTGTATATTTAGGTTCTGTTCGAACTTCTCTTCCT
		Aplysia_cervina                        AGCCTAGGGA--AAATTATCCTAGGTGAAACCTGCCCGGTGACTAGA-TTTTAACGGCCGCGGTACTTTGACCGTGCTAAGGTAGCGTAATCAGTTGACTTTTAAATGAAGTCTTGTATGAATGGATTTATGGGATTAAGCTGTCTCTTTTGTATTCTATTGAAATTACTAATTAGGTGAAAAGGCCTATAAATGAAAAAAGACGAGAAGACCCTTAGAGTTTTAATAATAGGTTTTTGTTGGGGCGACAAGAAGACATATA-TAACTCTTCTATTAGAAAGAT---ACTTGCCGGTTCTTTTAAGTATGGATAAACTACCTTAGGGATAACAGCATAATCCAG---TTTGGGTTTGTGACCTCGATGTTGGACTAGGAAAATTATGCCCTAGCAGGGTGTATATTTAGGTTCTGTTCGAACTTCTTTTCCT
		Akera_bullata                          AGCCTAAAGA---ATGGATTTTAGGTAAAGCCTGCCCAGTGAGAAA---TTTAACGGCCGCGGTACTTTGACCGTGCTAAGGTAGCGTAATCAGTTGACTTTTAAATGGAGTCTTGTATGAATGGATTAATGGAATTTAGCTGTCTCTTTCTTATTCTATTGAAATTACTAACTAGGTGAAAAGGCCTAGGAATGAAAAAAGACGAGAAGACCCTTAGAGTTTTAAACAAAGGTTTTTGTTGGGGCGACAAGAAGACA---AGTAACTCTTCTAGAGAAAA----GAACATGCCGACTTTTATAAGATTGGATAAACTACCTTAGGGATAACAGCATAATCTAG-TAATTAGGTTTGTGACCTCGATGTTGGACTAGGAAACTAACACTCTAGCAGAGTGTTTGGTGAGGTTCTGTTCGAACTTATATTCCT
		Haminoea_virescens                     AGCCCTAAGA----TTAATTTAGGGTAATGCCTGCCCAATGAGAAA---TTTAATGGCCGCGGTACTTTGACCGTGCTAAGGTAGCATAATCAATTGACTTTTAAATGAAGTCTGGAATGAAAGGAGGAACGGAATTTAGCTGTCTTAATTTTTTTAGTTTGAAGTTACTAACTAAGTGAAAAGGCTTAGGAAAGATAAAAGACGAGAAGACCCTAAGAGTTTTTAAT--ATATTTTTGTTGGGGCGACATAGGG-TCAAATTTTAAACACCCTTGATATATAT------GA-CGGATTTTTCATGATAAGATAAACTACCTTAGGGATAACAGCATAATTTT---TTTAAAGTTTGTGACCTCGATGTTGGACTAGGAAGCCTTTAGGCTAGCTGCCT-AATAGGGGGATTCTGTTCGAATTTTCACTCCT
		Bulla_gouldiana                        AGCCCTAAGT---AATGATTTAGGGTGAGGCCTGCCCAATGAGTAA-TCTTTAATGGCCGCGGTACTTTGACCGTGCTAAGGTAGCATAATCAGTTGACTTTTGAATGAAGTCTGGAATGAATGGGAGAACGGAATTTAGCTGTCTCAACCTCTTTATTATGAATTTACTAATTAAGTGAAAAGGCTTAAGAAAGATAAAAGACGAGAAGACCCTGAGAGTTTTGTT---ATGATTTCGTTGGGGCGACGGATAA-TCAG---TGGAACATTCTTAATTAACAG------GA-CGGTTTTATCATGAGTGGATAAACTACCTCAGGGATAACAGCATAATCTT----TTTAGGTTTGTGACCTCGATGTTGGACTAGGAAGCTTTATGGCTAGCCGCCT-TTAAAGGGGATTCTGTTCGAATTCTTACTCCT
	;
END;

BEGIN CODONS;
CODONPOSSET * CodonPositions = 
 N: 1 - 432 ; 
 CODESET * UNTITLED = Universal: all ; 
 END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
 END;