NEXUS
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[Matrix accession#: M1032]

BEGIN TAXA;
	TITLE M1032;
	DIMENSIONS  NTAX=8;
	TAXLABELS
		Jarilla_chocola_AF378624	Jarilla_heterophylla_AF378625	Jacaratia_corumbensis_AF378622	Carica_microcarpa_AF378623	Cylicomorpha_AF378626	Cylicomorpha_AF378627	Moringa_longituba_AF378643	Moringa_drouhardii_AF378628
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M1032;
	DIMENSIONS NCHAR=317;
	FORMAT MISSING = ? GAP = - DATATYPE = DNA ;
	MATRIX
		Jarilla_chocola_AF378624             GATATGGGCGATGTTACGCTAATAACATA-TTTTTACCTGAAAAACAGCTTGTTCCATTAGGCCGCATTCG-----TTTTATCTTAGTCTTTTTT-AGGGCTTTTAAACTCGTAACTGCGCAAAACAGTTGTTTGGATTACTTTAATCATTTTCTCCTGAGTAAAGTCAATAAATAAAATTATTGATTTATTGTT-----CCAGAAAAAAAAAAA-?AAAACACCC?CCTTAAAACTATC-TATTCCAAGCCGTTT?CCCGAAT?AAG?AT?G?AGTTTTA?ATTCCCGTTATC?GGTATCAAA?--AAA?AAA?TG
		Jarilla_heterophylla_AF378625        GATATGGGCGATGTTACGCTAATAACATA-TTTTTACCTGAAAAACAGCTTGTTCCATTAGGCCGCATTCG-----TTTTATCTTAGTCTTTTTT-AGGGCTTTTAAACTCGTAACTGCGCAAAACAGTTGTTTGGATTACTTGAATCATTTTCTCCTGAGTAAAGTCAATAAATAAAATTATTGATTTATTGTT-----CCAGAAAAAAAAAA--GAAA?CA?CCTCCTTAAAACTATC-TATTCCAAGCCGTTTTCCCGAATTAAGTATTGTAGTTTTA?ATT?CCGTTCTCAGGTATCAAAG--AAATAAA?TG
		Jacaratia_corumbensis_AF378622       GATATGGGCGATGTTACGCTAATAACATA-TTTTTACCTGAAAAACAGCTTATTCCATTAGGCCGCCTTAG-----TTTTATCTTAGTATTTTTT-ATGGCTTTTAAACTCGTAACTGCGCA-------------------------------CTCCTGAGTAAAGTCAATAAATAAAATTATTGATTTATTGTT-----CCAGAAAAATAAAAAAGAAAACAACCTCCTTAAAACTATC-TATTCCAAGCCGTTTTCCCGAATTAAGTATTGTATTTTTATAATACCGTTCTTAGGTATCAAAGG--AATAAAAAG
		Carica_microcarpa_AF378623           --AATGGGCGATGTTACGCTAATAATATA-TTTTTACCTGAAAAACAGCTTGTTCCATTAGGCCGCCTTAG-----TTTTATCTTAGTATTTTTT-ATGGCTTTTAAACTCGTAACTGCGCAAAACAGTTGTTTGGATTACTTTAATCATTTTCTCCTGAGTAAAGTCAATAAATAAAATTATTGATTTATTGTT-----CCAGAAAAAAAAAA--GAAAA-AACCTCCTTAAAACTATC-TATTCCAAGCCGTTTTCCCGAATTAAGTATTGTAT?GTTATAAGACCGTT?TTAGGTATCAA?GG--AATAAAAAG
		Cylicomorpha_AF378626                GATATGGGCGATGTTACGCTAATAACATA-GTTTTAACTGAAAAACAGCTTGTTCCATTAGGCCGCATTAG-----TTTTATCTTAGTCTTTTTT-ATGGCTTTTAAACTCGTAACTGCGCAAAACAGTTGTTTGGATTATTTTACTCATTTTCTCCTGAGTAAAGTCAATAAATAAAATTATTGATTTATTGTT-----CCAGAAAAAA------GAAAACAACCTCCTTAAAACTATC-TATTCCGAGCCGTTTTCCCGAATTAA------------------ACCGTTCTTAGGTATCAAAG--AAATAAAAAG
		Cylicomorpha_AF378627                GATATGGGCGATGTTACGCTAATAACATA-TTTTTAACTGAAAAACAGCTTGTTCCATTAGGCCGCATTAG-----TTTTATCTTAGTCTTTTTT-ATGGCTTTTAAACTCGTAACTGCGCAAAACAGTTGTTTGGATTATTTTACTCATTTTCTCCTGAGTAAAGTCAATAAATAAAATTATTGATTTATTGTT-----CCAGAAAAAA------GAAAACAACCTCCTTAAAACTATC-TATTCCGAGCCGTTTTCCCGAATTAA------------------ACCGTTCTTAGGTATCAAAG--AAATAAAAAG
		Moringa_longituba_AF378643           GATATGGGCGATGTTACGCTAATAACATATATTTT-CCTGGAAAACAGCTTGTTCCATTAACCTGCATTAGTTTTATTTTATCTTAGTCTTTTTTTAGGACTTTTAATCTCGTAACTGCGCAAAACAGTTCTCTGGATTACTTTAATCATTTTCTCCCGAATAAACTCAATAAATCAAATTATTGATTTATTTTATTCTTCCAGAAAAAAAAAAA-GAAAACA?CCTCCTTAAAACTATCYTATCCCGAGTGGTTTTCCCGAATCCAGTATTGTATTTTTACATAACCGTTYTTAGGTAT-AAAGGG-AATAAAA-T
		Moringa_drouhardii_AF378628          GATATGGGCGATGTTACGCTAATAACATATATTTT-CCTGGAAAACAGCTTGTTCCATTAACCTGCATTAGTTTTATTTTATCTTAGTCTTTTTTTAGGACTTTTAATCTCGTAACTGCGCAAAACAGTTCTCTGGATTACTTTAATCATTTTCTCCCGAGTAAACTCAATAAATCAAATTATTGATTTATTTTATTCTTCCAGAAAAAAAAAAAAGAAACCCCCCCCCTTAAAACTATC-TACCCCGAGTGGTTTCCCCGAACCCAGTATTGTATTTTT?CAAACCCGTTTTTGGGTA?-AA-GGGGAATAAA-TT
	;
END;

BEGIN CODONS;
GENCODE UNIVNUC 
 ; 
 END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
 
 END;