NEXUS [File created by TreeBASE: 7/26/07 21:02:02] [Matrix accession#: M1404] BEGIN TAXA; TITLE M1404; DIMENSIONS NTAX=43; TAXLABELS Cornus_kousa Nicotiana_tabacum Gentiana_procera Menyanthes_trifoliata Boopis_anthemoides Campanula_ramulosa Barnadesia_caryophylla Coriandrum_sativum Hedera_helix Pittosporum_japonicum Griselinia_lucida Desfontainia_spinosa Columellia_oblonga Weigela_hortensis Diervilla_sessilifolia Heptacodium_miconioides Leycesteria_formosa Triosteum_perfoliatum Symphoricarpos_albus Lonicera_orientalis Lonicera_prolifera Viburnum_sieboldii Viburnum_plicatum Viburnum_acerifolium Sambucus_caerulea Sambucus_racemosa Adoxa_moschatellina Sinadoxa_corydalifolia Tetradoxa_omeiensis Morina_coulteriana Triplostegia_glandulifera Centranthus_ruber Nardostachys_jatamansii Patrinia_rupestris Phyllactis_bracteata Valeriana_officinalis Knautia_intermedia Pterocephalus_lasiospermus Dipsacus_sativus Linnaea_boraealis Kolkwitzia_amabilis Dipelta_floribunda Abelia_grandiflora ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE M1404; DIMENSIONS NCHAR=1428; FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? 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Weigela_hortensis ??????????????????????????AAGTGCTGGATTCAAAGCGGGCGTTAAAGATTACAAATTGACTTATTATACTCCT?ACTATGAAACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCATTTCGAGTAACTCCTCAACCTGGAGTTCCACCTGAAGAAGCAGGGGCCGCGGTAGCTGCCGAATCTTCAACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGACTTACCAGCCTTGATCGTTACAAAGGGCGATGCTACCACATCGAGCCCGTTGCTGGAGAAGAAAATCAATATATTGCTTATGTAGCTTACCCATTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCTATTGTGGGTAATGTATTTGGGTTCAAAGCCCTGCGCGCTCTACGTCTGGAAGATCTGCGAATCCCTGCCGCTTATGCTAAAACTTTCCAAGGCCCGCCTCATGGCATCCAAGTTGAGAGAGATAAATTGAACAAGTATGGTCGCCCCCTGTTGGGATGTACTATTAAACCTAAATTGGGGTTATCTGCTAAAAACTACGGTAGAGCGGTTTATGAATGTCTACGTGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAGAACGTGAACTCCCAACCATTTATGCGTTGGAGAGATCGTTTCTTATTTTGTGCCGAAGCCCTTTATAAAGCACAAGCTGAAACAGGTGAAATCAAAGGGCATTACTTGAATGCTACTGCAGGTACATGTGAAGAAATGATCAAAAGGGCTGTATTTGCCAGAGAATTGGGAGTTCCTATCGTAATGCACGACTACTTAACAGGGGGATTCACTGCAAATACTAGCTTGGCTTTTTATTGCCGAGATAATGGCCTACTTCTTCACATCCACCGCGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAGAATCATGGTATACACTTTCGTGTACTAGCTAAAGCGTTACGTATGTCTGGTGGAGATCATATTCACTCCGGTACCGTAGTAGGTAAACTTGAAGGGGAAAGAGAGATCACTTTGGGCTTTGTTGATTTACTGCGCGATGATTTTATTGAAAAAGATCGAAGTCGCGGTATTTATTTCACTCAAGATTGGG?CTCTCTACCGGGTGTTCTGCCCGTGGCTTCGGGGGGTATTCACGTTTGGCATATGCCCGCTCTGACCGAGATCTTTGGGGATGATTCCGTCCTACAGTTCGGCGGAGGAACTTTAGGACACCCTTGGGGAAATGCGCCCGGTGCCGTAGCTAATCGAGTCGCTCTAGAAGCATGTGTACAAGCTCGTAATGAGGGACGTGATCTTGCTCGTGAGGGTAATGAAATTATCCGT?AGGCTTGCAAAT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Diervilla_sessilifolia ??????????????????????????AAGTGCTGGATTCAAAGCGGGCGTTAAAGATTACAAATTGACTTATTATACTCCTGACTATGAAACCAAAGATACTGATATATTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCTGGAGTTCCACCTGAAGAAGCAGGGGCCGCGGTAGCTGCCGAATCTTCAACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGACTTACCAGCCTTGATCGTTACAAAGGGCGATGCTACCACATCGAGCCCGTTGCTGGAGAAGAAAATCAATATATTGCTTATGTAGCTTACCCATTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCTATTGTGGGTAATGTATTTGGGTTCAAAGCCCTGCGCGCTCTACGTCTGGAAGATCTGCGAATCCCTGCCGCTTATGCTAAAACTTTCCAAGGCCCGCCTCATGGCATCCAAGTTGAGAGAGATAAATTGAACAAGTATGGTCGCCCCCTGTTGGGATGTACTATTAAACCTAAATTGGGGTTATCTGCTAAAAACTACGGTAGAGCGGTTTATGAATGTCTACGTGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAGAACGTGAACTCCCAACCATTTATGCGTTGGAGAGATCGTTTCTTATTTTGTGCCGAAGCCCTTTATAAAGCACAAGCTGAAACAGGTGAAATCAAAGGGCATTACTTGAATGCTACTGCAGGTACATGTGAAGAAATGATCAAAAGGGCTGTATTTGCCAGAGAATTGGGAGTTCCTATCGTAATGCACGACTACTTAACAGGGGGATTCACTGCAAATACTAGCTTGGCTTATTATTGCCGAGATAATGGCCTACTTCTTCACATCCACCGTGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAGAATCATGGTATACACTTTCG?GTACTAGCTAAAGCGTTACGTATGTCTGGTGGAGATCATATTCACTCCGGTACCGTAGTAGGTAAACTTGAAGGGGAAAGAGAGATCACTTTGGGCTTTGTTGATTTACTGCGCGATGATTTTATTGAAAAAGATCGAAGTCGCGGTATTTATTTCACTCAAGATTGGGTCTCTCTACCGGGTGTTCTGCCCGTGGCTTCGGGGGGTATTCACGTTTGGCATATGCCCGCTCTGACCGAGATCTTTGGGGATGATTCCGTCCTACAGTTCGGCGGAGGAACTTTAGGACACCCTTGGGGAAATGCGCCCGGTGCCGTAGCTAATCGAGTCGCTCTAGAAGCATGTGTACAAGCTCGTAATGAGGGACGTGATCTTGCTCGTGAGGGTAATGAAATTATCCGTGGGGCCTGCAAATGGAGTCCTGAACTAGCTGCTGCTTGTGAGGTATGGAAGGAGATCAAATTTGAATTTGAAGCAATGGATACTTTGAAT Heptacodium_miconioides ??????????????????????????AAGTGCTGGATTCAAAGCGGGTGTTAAAGATTACAAATTGACTTATTATACTCCTGACTATGAAACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCATTTCGAGTAACTCCTCAACCTGGAGTTCCACCTGAAGAAGCAGGG?????AGTAGCTGCCGAATCTTCAACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGACTTACCAGCCTTGATCGTTACAAAGGGC??TGCTACCACATCGAGCCCGTTGCTGGAGAAGAAACTCAAT?TATTGCTTATGTAGCTTACCCA?????CCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCTATTGTGGGTAATGTATTTGGGTTCAAA???CTGCGTGCTCTACGTCTGGAAGATCTGCGAATCCCTGTCGCTTATGTTAAAACTTTCCAAGGCC???CTCATGGCATCCAAGTTGAGAGAGATAAATTGAACAAGTACGGTCGCCCCCTGTTGGGATGTACTATTAAACCTAAATTAGGGTTATCTGCTAAAAACTACGGTAGAGCGGTTTATGAATGTCTACGTGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAGAACGTGAACTCCCAACCATTTATGCGTTGGAGAGATCGTTTCTTATTTTGTGCCGAAGCCCTTTATAAAGCACAAGCTGAAACGGGTGAAATCAAAGGGCATTACTTGAATGCTACTGCAGGTACATGTGAAGAAATGATGAAAAGGGCTGTATTTGCCAGAGAATTGGGAGTTCCTATCGTAATGCACGACTACTTAACAGGGGGATTCACTGCAAATACTACCTTGGCTCATTATTGCCGAGATAATGGCCTACTTCTTCACATCCACCGCGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAGAATCATGGTATACACTTTCGTGTACTAGCTAAAGCGTTACGTATGTCTGGTGGAGATCATATTCACTCCGGTACCGTAGTAGGTAAACTTGAAGGGGAAAGAGAGATCACTTTGGGCTTTGTTGATTTACTGCGCGATGATTTTATTGAAAAAGATCGAAGTCGCGGTATTTATTTCACTCAAGATTGGGTCTCTTTACCGGGTGTTCT??CCGTGGCTTCGGGGGGTATTCACGTTTGGCATATGCCCGCTTTGACCGAGATCTTTGGGGATGATTCC?TCCTACAGTTCGGCGGAGGAACTTTAGGACACCCTTGGGGAAAT?C?CCCGGT??CGTAGCTAATCGAGTCGCTCTAGAAGCATGTGTACAAGCTCGTAATGAGGGACGTGATCTTGCTCGTGAGGGTAATGAAATTATCCGAGAG?CTTCCAAAT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Triosteum_perfoliatum ??????????????????????????AAGTGTTGGATTCAAAGCGGG?GTTAAAGATTACAAATTGACTTATTATACTCCTGACTATGAAACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCTGGAGTTCCACCTGAAGAAGCAGGGGCCGCGGTAGCTGCTGAATCTTCAACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGACTTACCAGCCTTGATCGTTACAAAGGGCGATGCTACCACATCGAGCCCGTTGCTGGAGAAGAAAGTCAATTTATTGCTTATGTAGCTTACCCATTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCTATTGTGGGTAATGTGTTTGGGTTCAAAGCCCTGCGCGCTCTACGTCTGGAAGATCTGCGAATCCCTGTCTCTTATGTTAAAACTTTCCAAGGCCCGCCTCATGGTATCCAAGTTGAGAGAGATAAATTGAACAAGTACGGTCGCCCTCTGTTGGGATGTACTATTAAACCTAAATTGGGGTTATCTGCTAAAAACTACGGTAGGGCGGTTTATGAATGTCTACGTGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAGAACGTGAACTCCCAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTTTGTGCCGAAGCCCTTTATAAAGCACAAGCTGAAACAGGTGAAATCAAAGGGCATTACTTGAATGCTACTGCAGGTACATGTGAAGATATGATGAAAAGGGCTGTATTTGCCAGAGAATTGGGAGTTCCTATCGTAATGCACGATTACTTAACAGGGGGATTCACTGCAAATACCACCCTGGCTCACTATTGCCGAGATAATGGCCTACTTCTTCACATCCACCGCGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAGAATCATGGTATGCACTTTCGTGTACTAGCTAAAGCGTTACGTATGTCTGGTGGAGATCATATTCACGCCGGTACCGTAGTAGGTAAACTTGAAGGGGAAAGAGAAATCACTTTGGGCTTTGTTGATTTACTGCGCGATGATTTTATTGAAAAAGATCGAAGTCGCGGTATTTATTTCACTCAAGATTGGGTCTCTCTACCGGGTGTTCTGCCCGTGGCTTCGGGGGGTATTCACGTTTGGCATATGCCCGCTCTGACCGAGATCTTTGGAGATGATTCCGTCCTACAGTTCGGCGGAGGAACTTTAGGACACCCTTGGGGAAATGCACCCGGT???GTAGCTAATCGAGTCGCTCTAGAAGCATGTGTACAAGCTCGTAATGAGGGGCGTGATCTTGCTCGTGAGGGTAATGAAATTATCCGTGCGGCTTGCAAAT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Lonicera_orientalis 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Lonicera_prolifera 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Viburnum_sieboldii 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Tetradoxa_omeiensis 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Morina_coulteriana 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Patrinia_rupestris 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Valeriana_officinalis 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Knautia_intermedia 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Pterocephalus_lasiospermus 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Dipsacus_sativus 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Linnaea_boraealis 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Kolkwitzia_amabilis ??????????????????????????AAGTGCTGGATTCAAAGCGGGCGTTAAAGAGTACAAATTGACTTATTATACTCCTGACTATGAAACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCTGGAGTTCCACCTGAAGAGGCAGGGGCCGCGGTAGCTGCCGAATCTTCAACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGACTTACCAGCCTTGATCGTTACAAAGGGCGATGCTACCACATCGAGCCCGTTGCTGGAGAAGAAAATCAATTTATTGCTTATGTAGCTTACCCATTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCTATTGTGGGTAATGTATTTGGGTTCAAAGCCCTGCGCGCTCTACGTCTGGAAGATCTGCGAATCCCTGCTGCTTATGTTAAAACTTTCCAAGGCCCGCCTCATGGCATCCAAGTTGAGAGAGATAAATTGAACAAGTATGGTCGCCCCCTGTT???ATGTACTATTAAACCTAAATTGGGGTTATCTGCTAAAAACTATGGTAGAGCCGTTTATGAATGTCTACGTGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAGAACGTGAACTCCCAACCATTTATGCGTTGGAGAGATCGTTTCTTATTTTGTACCGAAGCCCTTTATAAAGCACAAGCTGAAACAGG?????????AGGGCATTACTTGAATGCTACTGCAGGTACATGTGAAGAAATGATCAAAAGGGCTGTATTTGCCAGAGAATTGGGAGTTCCTATCGTAATGCACGACTACTTAACAGGGGGATTCACTGCAAATACTAGCTTGGCTCACTATTGCCGAGATAATGGCCTACTTCTTCACATCCACCGCGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAGAATCATGGTATGCATTTTCGTGTACTAGCTAAAGCGTTACGTATGTCTGGTGGAGATCATATTCACTCCGGTACCGTAGTAGGTAAACTTGAAGGGGAAAGAGAGATCACTTTGGGCTTTGTTGATTTACTGCGCGATGATTTTATTGAAAAAGATCGAAGTCGCGGTATTTATTTCACTCAAGATTGGGTCTCTCTACCGGGTGTTCTGCCCGTGGCTTCGGGGGGTATTCACGTTTGGCATATGCC?GCTCTGACCGAGATCTTTGGGGATGATTCTGTCCTACAGTTCGGCGGAGGAACTTTAGGACACCCTTGGGGAAATCCGCCCGGTGCCGTAGCTAATCGAGTCGCTCTAGAAGCATGTGTACAAGCTCGTAATGAGGGACGTGATCTTGCTCGTGAGGGTAATGAAATTATGC???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Dipelta_floribunda ??????????????????????????AAGTGCTGGATTCAAAGCGGGCGTTAAAGATTACAAATTGACTTATTATACTCCTGACTATGAAACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCTGGAGTTCCACCTGAAGAAGCAGGGGCCGCGGTAGCTGCCGAATCTTCAACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGACTTACCAGCCTTGATCGTTACAAAGGGCGATGCTACCACATCGAGCCCGTTGCTGGAGAAGAAAATCAATATATTGCTTATGTAGCTTACCCATTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCTATTGTGGGTAATGTATTTGGGTTCAAAGCCCTGCGCGCTCTACGTCTGGAAGATCTGCGAATCCCTACCGCTTATGTTAAAACTTTCCAAGGCCCGCCTCATGGCATCCAAGTTGAGAGAGATAAATTGAACAAGTATGGTCGCCCCCTGTTGGGATGTACTATTAAACCTAAATTGGGGTTATCTGCTAAAAACTATGGTAGAGCGGTTTATGAATGTCTACGTGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAGAACGTGAACTCCCAACCATTTATGCGTTGGAGAGATCGTTTCTTATTTTGTGCCGAAGCCCTTTATAAAGCACAAGCTGAAACAGGTGAAATCAAAGGGCATTACTTGAATGCTACTGCAGGTACATGTGAAGAAATGATCAAAAGGGCTGTATTTGCCAGAGAATTGGGAGTTCCTATCGTAATGCACGACTACTTAACAGGGGGATTCACTGCAAATACTAGCTTGGCTCATTATTGCCGAGATAATGGCCTACTTCTTCACATCCACCGCGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAGAATCATGGTATACACTTTCGTGTACTAGCTAAAGCGTTACGTATGTCTGGTGGAGATCATATTCACTCCGGTACCGTAGTAGGTAAACTTGAAGGGGAAAGAGAGATCACTTTGGGCTTTGTTGATTTACTGCGCGATGATTTTATTGAAAAAGATCGAAGTCGCGGTATTTATTTCACTCAAGATTGGGTCTCTCTACCGGGTGTTCTGCCCGTGGCTTCGGGGGGTATTCACGTTTGGCATATGCCCGCTCTGACCGAGATCTTTGGGGATGATTCTGTCCTACAGTTCGGCGGAGGAACTTTAGGACACCCTTGG???AATGCGCCCGGTGCCGTAGCTAATCGAGTCGCTCTAGAAGCATGTGTACAAGCTCGTAATGAGGGACGTGATCTTGCTCGTGAGGGTAATGAAATTATCCGTGGGGCTTGCAAAT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Abelia_grandiflora ??????????????????????????????????????????????????????????????????ACTTATTATACTCCTGACTATGAAACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCTGGAGTTCCACCTGAAGAAGCAGGGGCCGCGGTAGCTGCCGAATCTTCAACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGACTTACCAGCCTTGATCGTTACAAAGGGCGATGCTACCACATCGAGCCCGTTGCTGGAGAAGAAAATCAATATA?TGCTTATGTAGCTTACCCATTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCTATTGTGGGTAATGTATTTGGGTTCAAAGCCCTGCGCGCTCTACGTCTGGAAGATCTGCGAATCCCTGTCGCTTATACTAAAACTTTCCAAGGCCCGCCTCATGGCATCCAAGTTGAGAGAGATAAATTGAACAAGTATGGTCGCCCCCTGTTGGGATGTACTATTAAACCTAAATTGGGGTTATCTGCTAAAAACTATGGTAGAGCGGTTTATGAATGTCTACGTGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAGAACGTGAACTCCCAACCATTTATGCGTTGGAGAGATCGTTTCTTATTTTGTGCCGAAGCCCTTTATAAAGCACAAGCTGAAACAGGTGAAATCAAAGGGCATTACTTGAATGCTACTGCAGGTACATGTGAAGAAATGATCAAAAGGGCTGTATTTGCCAGAGAATTGGGAGTTCCTATCGTAATGCACGACTACTTAACAGGGGGATTCACTGCAAATACTAGCTTGGCTCAATATTGCCGAGATAATGGCCTACTTCTTCACATCCACCGCGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAGAATCATGGTATACACTTTCGTGTACTAGCTAAAGCGTTACGTATGTCTGGTGGAGATCATATTCACTCCGGTACCGTAGTAGGTAAACTTGAAGGGGAAAGAGAGATCACTTTGGGCTTTGTTGATTTACTGCGCGATGATTTTATTGAAAAAGATCGAAGTCGCGGTATTTATTTCACTCAAGATTGGGTCTCTCTACCGGGTGTTCTGCCCGTGGCTTCGGGGGGTATTCACGTTTGGCATATGCCCGCTCTGACCGAGATCTTTGGGGATGATTCTGTACTACAGTTCGGCGGAGGAACTTTAGGACACCCTTGGGGAAATGCGCCCGGTGCCGTAGCTAATCGAGTCGCTCTAGAAGCATGTGTACAAGCTCGTAATGAGGGACGTGATCTTGCTCGTGAGGGTAATGAAATTATCCGTGGGGCTTGCAAAT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? ; END; BEGIN ASSUMPTIONS; EXSET * rbcLprimer = 1 - 26 ; END;