NEXUS
[File created by TreeBASE:  7/26/07  21:02:05]
[Matrix accession#: M1412]

BEGIN TAXA;
	TITLE M1412;
	DIMENSIONS  NTAX=53;
	TAXLABELS
		Acidodontium_heteroneuron	Acidodontium_megalocarpum	Acidodontium_ramicola	Acidodontium_seminerve	Acidodontium_sprucei	Acidodontium_subrotundum	Anomobryum_conicum	Anomobryum_julaceum	Brachymenium_acuminatum	Brachymenium_angolense	Brachymenium_capitulatum	Brachymenium_globosum	Brachymenium_nepalense	Brachymenium_pulchrum	Brachymenium_systylium	Bryum_algovicum	Bryum_alpinum	Bryum_arachnoideum	Bryum_archangelicum	Bryum_argenteum	Bryum_bicolor	Bryum_billarderi	Bryum_blandum	Bryum_caespiticium	Bryum_capillare	Bryum_cellulare	Bryum_cyatiphyllum	Bryum_cyclophyllum	Bryum_donianum	Bryum_funkii	Bryum_gemmiparum	Bryum_lisae	Bryum_meesioides	Bryum_muehlenbeckii	Bryum_pachytheca	Bryum_pallens	Bryum_pallescens	Bryum_pseudotriquetrum	Bryum_purpurascens	Bryum_uliginosum	Bryum_wrightii	Epipterygium_tozeri	Haplodontium_reticulatum	Haplodontium_megalocarpum	Leptostomum_macrocarpum	Mielichhoferia_himalayana	Mnium_hornum	Plagiobryum_zieri	Pohlia_cruda	Rhodobryum_giganteum	Rhodobryum_keniae	Rhodobryum_spathulatum	Rhodobryum_umbraculum
	;
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BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M1412;
	DIMENSIONS NCHAR=3204;
	FORMAT SYMBOLS = " A C G T 0 1 2 3 4 5 " MISSING = ? GAP = -  ;
	MATRIX
		Acidodontium_heteroneuron       ---------AGACGCTACGGACTTAAATAATTTGAGCTTTAGTAGAAAAACTTACTAAATGT{AT}AGCTTTCAAATTCAGGGAA{AT}CTTAGGTTGAAAAAAA--TATAAGCAATCCTGAGCCAAATTTT-------ATTGTA------TATTAAGAATGAATGAAAATAAAATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTATTCTAACAAAAAAA-TTTTATATTTT-------ATTTAATTAAATTTTATTTT----------------CTATTTATTAA-----------------TAAAAAGAAAATCTAATTT-ATTTATAAATT--CTTTTTAAATATTAA--------------TATTAAGCGAGGATAA---------AGATAGAGTCCAATTTTACATGTTATGTTAATTTTAGCAACAATTTAAATTGTAGTAAAAAGAAAATCCGTTGGCTTTATTGACCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTACCCCCAAAATTGTAGTTTTTTATTGACATTGGTTTCAAGTTTATGTTAAGATATTTCAATAAAAAA-GCCGGAATAGCTCAGTTGGTCTAGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCGTGTCACC-----------------------AAACTC-ATTATGCAGGATATAAAAA---TCGTTATTCCACAACTTCAAGGTTTTCACGCTCTTAGACAAAAGTATTTTAAATTTTCATTATTTTAATCAACGACTAATATAA-TTTTTTATAAATCATAG?TGAGCTAGTAAATTAATAACTTCTTTTTTTT-CATAGAACTTAAGTAATAAATATATATCTAT-ATTTTTATGTAT-ATTCTTACTTTTTAC--TTTTTTTTTAATTTTTCAAATTTTTTAAATATTAAAAAAA----TTA-AAATTTATAATT---ATTTA-T-TA-----TTTATATAAATTTAT-----------------------------------------------------TTA-CTTAAATAAAATTTTTTATTTAAGTTATTATTAAATAAAAA-ACAATAAAAAA-TTATAGAAAAATTATTTTTAAATAAGAGTAATTAATCAAATTGTAAGTTTTCTAATAATCCAGTTACGAATCTTTTTTTTTT-AATAAATAATTTTTTATTAGACTCAACGTAGTTTACAGTTTTTATTATATGTTACTATGACAAAACAATATCATTTTATTAAAACAAATTTTTGTCTGTTTTAATTTATGATTT-ATTT-AAAAAAA------ATATTTTGATTTTTTT--AAATAAAAAGCTCATCTGGAGTAGAAACGTTTTTAATAGTTAACTCAACATCCCTCCCTGGATACAGTGGTGTTTGCCTCT?----------------------------CAC-----------------GTTTTTTTAATC-TGTATAAAAAATAAAAAA-CTCGAAAATTTCCGCTGTAAGCTGGAAATTAATTCTTTACTTTTTATTGAAATAACTCAATAAATGAATTAGTAAAAACTAAAAATATTCGTTTAAATTTTTTTTTTATAAAAA-TATTTATGAAGCAAAAAAAA-------------------CGTAATAATA-TATTATTATT---------------AAATTTGTATGGTTAAAAATCATCTTAAAAAAA-CAG-TGTAATAAAA-CAGCAATTTTTTTTTT----------------AATAA---TTAATTCAAT-AAAAAAGTTTTACATCAAAAAAGACTAATGCATTTGATGATAGAAAATAAAAAAACTTCACTGAAAAAAAA----CCTAAACACTTATTTAAAAGTAATGAAAACGATGTGATCTATAATTGACCAAAAATTATTATT---AAATAAATACATTTAATTATT---AGATAGGATGGCGAAAAAAACCAAGTTTAAAAAAA-TAACAACA-AATATTAAT------------------AGTTATTTTTA-ATTAAAACTAAATGAGTA-TATATT---CGCCCATGAAATTTTAATTTGAAATATTATTAATATTTTTTT--ATATTATTTTTACCATTATTGTAAGAA-TCACTTCTATTTTTTT---ATTAATTC---AAAATTTTTGTT--------------------AATAGAAAAAA-CATATAAAATTTTTAAATTTCTAACAAATTT----------ATTCATGAGAAGCCGGATGAAATAAAACTTTCATGTCCGATTTTGAAATAGAGACAAAAAAGTCGACTGTGACCCTAAAAGAACAAAATTTCGTAAACAACATAGAGGACGAATGAAAGGAATATCTACTCGAGGTAATTCTATCTGTTTTGGTAAATTTGCTCTTCAAGCACTTGAACCAGCTTGGATTACATCTCGACAAATAGAAGCAGGACGACGAGCAATTACCCG-TTATGCACGTCGTGGTGGAAAAATT-------------------TAGGACCTGTGTAAGAATAATACGCCGTTTAGGAGCTTTACCAGGACTAACTAATAAAACACCTCAGTTAAAAACTAATTCGATCAATCAATCAATATCTAATAAAAAAATTTCTCAATATCGCATTCGTTTGGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGAATAACAGAGCGACAATTACTTAATTATGTACGTATTGCTAGAAAAGCAAAAGGGTCAACAGGTGAAGTCTTATTACAATTACTTGAAATGCGCTTAGATAACGTTATTTTTCGATTAGGTATGGCTCCTACAATTCCTGGAGCAAGGCAACTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATGATCGTATAGTAAATATACCAAGTTATCGGTGTAAACCTGAGGATTCTATTACTATAAAAAATCGACAAAAATCTCAGGCTATAATTAGTAAAAATTTAAATTTGTATCAAAAATATAAAACACCAAATCATTTAACTTATAATTTTTTAAAAAAAAAAGGATTAGTTAATCAAATACTAGATCGTGAATCAATTGGTTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGCCAAGCTTAATTAACAACTAAGAGTATTTGTAATTATATACATAAT-AAAAATTTGCAA----GG-AAAGAGAGGGATC-----------000110000000011010110000101010010?00000100001
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