NEXUS
[File created by TreeBASE:  7/26/07  21:02:09]
[Matrix accession#: M1423]

BEGIN TAXA;
	TITLE M1423;
	DIMENSIONS  NTAX=37;
	TAXLABELS
		Rhodobryum_keniae	Plagiobryum_zieri	Haplodontium_reticulatum	Haplodontium_megalocarpum	Bryum_ruderale	Bryum_radiculosum	Bryum_pseudotriquetrum	Bryum_pachtyheca	Bryum_orthothecium	Bryum_meesioides	Bryum_lisae	Bryum_gemmiferum	Bryum_funkii	Bryum_donianum	Bryum_cyclophyllum	Bryum_coronatum	Bryum_clavatum	Bryum_cellulare	Bryum_caucasicum	Bryum_capillare	Bryum_caespiticium	Bryum_bicolor	Bryum_argenteum	Bryum_alpinum	Bryum_algovicum	Brachymenium_pulchrum	Brachymenium_preissianum	Brachymenium_philonotula	Brachymenium_globosum	Brachymenium_acuminatum	Anomobryum_prostratum	Anomobryum_julaceum	Anomobryum_humillimum	Anomobryum_conicum	Acidodontium_subrotundum	Acidodontium_sprucei	Acidodontium_ramicola
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M1423;
	DIMENSIONS NCHAR=6661;
	FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = -  ;
	MATRIX
		Rhodobryum_keniae               CGATCGGTAGACGCTACGGACTTAAATAATTTGAGCTTTAGTAGAAAA-CTTACTAAATGCAAGCTTTCAAATTCAGGAAAACTTAAGTTGAAAAAAA--TATAAGCAATCCTGAGCCAAATTTT-----ATTGTA------TAT----------TAAAAATAAGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTATCCTAACAAAAAAAATTTTATATTTTCTATTTTATTTAATTAAATTTTATTTTTATTTAATTAAATTTTATTTTTATTAA-----------------TAAAAATAAAATTTAATTTATTTATAAGTTCTTTTTAAATATTAA--------------TATTAAGCGAGGATAAAGATAGAGTCCAATTTTACATGTTAGGTTAATTTTAGCAACAATTTAAATTGTAGTAAAAAGAAAATCCGTTGGCTTTATTGACCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTACCCCCAAAATTTTATTTTTTTATTGACATAGGCTTCAAGTTTATGTTAGGATAAGCCAATAAAAA-GCCGGAATAGCTCAGTTGGT--AGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCGTGTCACCAGT-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTTTTTT--CATAAAACTTAATTAATGAATATATATCTATATTCTTATGTATTATTCGTATTTTTTACTTTTTTTTT--AATTTTTCACATTTTTTACATATTAAAAAAA----TTAAAATTTATAA-TTATTATTTAT-TA-----TTTATATAAATTTATCT-------------------TTTTTAAAATTAAATAAAATTTTTTATTTAATTTATTATCAAATAAAAA-ACAATAAAAAA-TTATATAAAAATTATTTTTAAATAAGAGGACTTAATCAAATTGTAAGTTTTCTAATAATCCAGTTACGAATCTTTTTATTTTTGATAAATAATTTTTTATTAGACTCAACGTAGTTTACAGTTTTTATTATATGTTACTATGACAAAACAATATCATTTTATTGAAACAGATTTTTGTCTGTTTTAATTTATGATTTATTT-AAAAAAA-----AATATTTTGATTTTTTTAAATAAACAGCTCATCTGGAGTAGAAACGTTCTTAATAGTTAACTCAACATCCCTCCCTGGATACAGTGGTGTTTGCCTCTGATTTCGTCC-------------------------------------------------------------TAAAAAAACTCGAAAATTTCCACTGCAAACTGGAAATTAATTCTTTACTTTTTATTGAAATAACTCAATAAATGAATTATTAAAAACTAAAAATATTTGTTTAAATTTTTTTTTTATAAAAATATTTATGAAGCAAAAAAAA-----C-TAATAAT-GTATTATTATTATTATT---------AAATTTGTATGGTTAAAATTATCTTAAAAAA-CAG-TGTAATAAAACAGCAAAATTTTTTT-AACAATAATTAATTTAAT-AAAAAAGTTTTACATCAAAAAAGACTAATCCATTTGATGATAGAAAATAAAAAAACTTCACTGGAAAAAAAA-CCTAAACACTTATTTAAAAGTAATGAAAACGATGTGATCTATAATTGACCAAAA-TTATTATT---AAATAAATACATT-AATTATTAGATAGGATGGCGAAAAAAACCAAGTTTGAAAAAATAAAAAA-AATATTAAT----AATTATTTTTT-ATTAAAACTAAATGAGTTAATAT---TCGCCCATGAAATTTTAATTTAAAATATTATTAATATTTTTTTT-ATATTATTTTTACTATTATTGTAAGAA-TTATTTCTATTTTTTT---ATCAATTCAAAAATTTTGTT--------------------AATAGAAAAAAA-ATATAAAAAATTTAAATTTCTAACAATTTTATTCATGTTTATTCATGAGAAGCCGGATGAAATAAAACTTTCATGTCCGATTTTGAAATAGAGGCAAAAAAGTCGACTGTGACCCTAAAAGAACAAAATTTCGTAAACAACATAGAGGACGAATGAAAGGAATATCTACTCGAGGTAATTCTATCTGTTTTGGTAAATTTGCTCTTCAAGCACTTGAACCAGCTTGGATTACATCTCGACAAATA---------------------------------------------------------------------------CCTCGTGTAAGAATAATA-CGCCGTTTAGGAGCTTTACCAGGACTAACTAATAAAATACCCCAGTTAAAAACTAATTCGATCAATCAATCAATATCTAATAAAAAAATTTCTCAATATCGCATTCGTTTGGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGAATAACAGAGCGACAATTACTTAATTATGTACGTATTGCTAGAAAAGCAAAAGGGTCAACAGGTGAAGTGTTATTACAATTACTTGAAATGCGCTTAGATAACGTTATTTTTCGATTAGGTATGGCTCCTACGATTCCTGGAGCAAGGCAACTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATGATCGTATAGTAAATATACCGAGTTACCGGTGTAAACCTGAGGATTCTATTACTATAAAAGATCGACCCAAATCTCAGGCTATAATTAGTAAAAATCTAAATTTGTATCAAAAATATAAAACACCAAATCATTTAACTTATAATTTTTTAAAAAAAAAAGGATTAGTTAATCAAATACTAGATCGTGAATCCATTGGTTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAAGCTTAATTAGCAACTAAGAGTATTTTTAATTATATACATAAT-AAAAATTT--GCAACTTCGGAAA------------------AGCTTGGAAGGCTAAGGGTTATAATCGACACTTT------AATATTGTCTCTATTTCAAAA-------------------------CCGAACATGAAATTTTAATATCATACGGCTTCTTTATGAACTAGAAAAATTTTTCTATTATTTTATTATTACGTATTATAATAAATTCATATCATCTATGTTAGTTTATTTTTATTAA-ATAACTTTATAGATGATCCTTTTATAAA----TTTTTCTTTTATA----AAAA------TTTATAATTACTTCGTTCTTTATTTCTATTAAAATAAATCATTAGGAAAATATTTTTTACCGAGCTTTAATA--------AAAATATTAATAAATTCAGCAAACTAAATTTATTATTTTAGAGCTTACTTGCTTTAATTTATTTGATTTTTTATTCAATTAAA----GATTTAGTTACGAAAAAAATATTTTTGTTTTTTCT-CCATAGATTTTTAGTTGCAAAAATTTTTAATTAAAAAAAAAAATTCCGTGTTGTTTTT-----------ATTTTC------ATTATTATAGGAATTTTGTTTTT--CTGTCTTAAGAAAGATTTAAAATCTTTTTAGAAATAAAGTTATTAGTCCAAAATTTACAATAAATTTAAAGACCCTTTAACTATATTTAAGTTAATTATAGAACG-AATCACACTTTTACCACTAA-C------------------------TTTAAATTAATAATTTTTACTAAAAAA-------TAGCGCTAAATATTATTTGTTTTGCAAAATAAATTTACAATCACT---------ATTAGTGAA------------AAATA-TATTC----AATTTAAA-AAATTTTTTATTTTACAA--------ATAAATAATTTCATTTTAAAGAACAGTTGACATAATAATATATTTTGTGTAATACTATAAATTAACAAGTTTTTATACTTGGGTAACTTATTATTATTATTTTACAAACCAAGTTTTACCATGACTGCAACTTTAGAAAGACGCGAAAGCGCAAGCCTATGGGGTCGCTTTTGCGACTGGGTTACCAGCACTGAAAACCGCCTTTACATCGGATGGTTCGGTGTATTAATGATCCCTACCCTATTAACTGCAACCTCTGTATTCATTATTGCTTTCATCGCAGCTCCTCCTGTAGATATTGATGGCATTCGTGAACCTGTTTCTGGTTCTCTTCTTTACGGAAACAACATCATCTCTGGTGCTATCATTCCTACTTCTGCAGCTATCGGTTTGCACTTTTATCCAATTTGGGAAGCTGCTTCCGTCGATGAATGGCTATACAATGGTGGTCCTTATGAACTAATCGTTCTTCACTTTTTACTTGGTGTAGCTTGCTACATGGGTCGTGAATGGGAACTTAGCTT-CCGTTTAGGTATGCGTCCTTGGATCGCTGTTGCATATTCAGCTCCTGTTGCGGCTGCTGCTGCTGTTTTCTTGATTTATCCTATTGGTCAAGGAAGCTTTTCTGACGGTATGCCTTTAGGAATCTCTGGTACTTTTAACTTCATGATTGTGTTCCAAGCTGAACACAACATCCTTATGCACCCATTCCACATGCTTGGTGTAGCTGGCGTATTCGGCGGCTCTCTATTTAGTGCTATGCATGGTTCCTTGGTAACTTCAAGTTTAATCCGAGAAACTACTGAGAATGAGTCTGCTAATGCAGGTTACAAGTTTGGTCAAGAGGAAGAAACTTATAACATCGTAGCTGCTCACGGTTACTTTGGTAGACTTATTTTCCAATACGCTAGCTTTAACAACTCTCGTTCTTTACACTTCTTTTTAGCTGCTTGGCCTGTAGTAGGTATCTGGTTTACTGCATTAGGTATCAGCACAATGGCTTTCAACCTAAATGGTTTCAACTTTAACCAATCTGTTGTTGATAGTCAAGGCCGTGTAATTAACACTTGGGC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		Plagiobryum_zieri               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		Haplodontium_reticulatum        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		Haplodontium_megalocarpum       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		Bryum_ruderale                  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		Bryum_radiculosum               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		Bryum_donianum                  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		Bryum_cyclophyllum              -------G-------ACGGACTTAAATAATTTGAGCTTTAGTAGAAAAACTTACTAAATGCAAGCTTTCAAATTCAGGGAAACTTAGGTTGAAAAAAA--TATAAGCAATCCTGAGCCAAATTTT-----ATTGTA------TAT----------TAAAAATAAGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTATCCTAACAAAAAA--TTTTATATTTT-------ATTTAATTAAATTTTATTTT----------------ATATTTATTAA-----------------TAAAAATAAAATCTAATTTATTTACAAGTTCCTTTTAAATATTAATTTTTAAATATTAAGATTAAGCGAGGATAAAGATAGAGTCCAATTTTACATGTTATGTTAATTTTAGCAACAATTTAAATTGTAGTAAAAAGAAAATCCGTTGGCTTTATTGACCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTACCCCCAAAACTGTAGTTTTTTATTGACATAGTTTTCAAGTTTATGTTAAGATATGTAAATAAAAAAGCCGGAATAGCTCAGTTGGT--AGAGCAGAGGACTGAAAATCCTCGTG---------------------------------------GCAGGATATAAAAATCGTTATTCACAACTTCAAGGTTTTCATGCTCTTAGACAAAAGTATTTTAAATTTTCATTATTTTAATCAACGACTAATATAATTTTTTATAAATCATAGTTGAGCTAGTAAATTAATAACTTCTTTTTTT--CATAGAACTTAATTGATGAATATATATCTATATTTTTATCTAT-ATTCGTATTTTTTACTTTTTTTT---AATTTTTCAGATTTTTTACATATTAAAAAAA----TTAAAATTTATAA----TTATTTGT-TA-----TCGATATAAATTTATTTGATGATAA------------------------------------------------ATTAAATAAAAA-ACAATAAAAAA-TTATAGAAAAATTATTTTTAAATAAGAGTAATTAATCAAATTGTAAGTTTTCTAATAATCCAGTTACGAATCTTTTTATTTTTAATAAATAATTTTTTATTAGACTCAACGTAGTTTACAGTTTTTATTATATGTTACTATGACAAAACAATATCATTTTATTAAAACAGATTTTTGTCTGTTTTAATTTATGATTTATTT-AAAAAAA------AGATTTTGATTTTTTTAAATAAAAAGCTCATCTGGAGTAGAAACGTTTTTAATAGTTAACTCAACATCCCTCCCTGGATACAGTGGTGTTTGCCTCTGATTTCGTCCAC----------------GACTCGTTG-AAATC-GATGTTTTTTGAATC-AATATAATAAATAAAAAAACTCGAAAATTTCCGCTGCAAACGGGAAATTAATTCTTTACTTTTTATTGAAATAACTCAATAAATGAATTAGTAAAAACTAAAAATATTCGTTTAAATTTTTTTTT-ATAAAAATATTTATAAAGCAAAAAAAA-----CGTAATAAT-ATATTATTATT---------------AAATTTGTATGGTTAAAATTATCTTAAAAA--CAG-TGTAATAAAACAGCAATTTTTTT---AACAATAATTAATTAAAT-AAAAAAGTTTTACATCAAAAAAGACTAATCCATTTGATGATAGAAAATAAAAAAACTTCACTGGAAAAAAAA-CCTAAACACTTATTTAAAAGTAATGAAAACGATGTAATCTATAATTAACCAAAA-TTATTATT---AAATAAATATATTTAATTATTAGATAGGATGGCGAAAAAAACCAAGTTTAAAAAAATAACAAAAAATATTAAT----AATTATTTTTT-ATTAAAACTAAATGAGTTAATAT---TCGCCCATGAAATTTTAATTTAAAATATTATTAATATTTTTTT--ATGTTATTTTTACCATTATTGTAAGAA-TTACTTCTATTTTTTT---ATCAATACAAAATTTTTGTT--------------------AATAGAAAAAA-CATATAAAATTTTTAAATTTCTAACAAATTT----------ATTCATGAGAAGCCGGATGAAATAAAACTTTCATGTCCGATTTTGGAATAGAGACAAAAAAGTCGACTGTAACCCTAAAAGAACAAAATTTCGTAAACAACATAGAGGACGAATGAAAGGAATATCTACTCGAGGTAATTCTATCTGTTTTGGTAAATTTGCCCTTCAAGCACTTGAACCAGCTTGGATTACATCTCGACAAATAGAAGCAGGACGACGAGCAATTACTCG-TTATGCACGTCGTGGTGG--------------------------------TCGTGT-AGAATAATA-CGTCGTTTAGGAGCTTTACCAGGACTAACTAATAAAATACCCCAGTTAAAAACTAATTCGATCAATCAATCAATATCTAATAAAAAAATTTCTCAATATCGCATTCGTTTGGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGAATAACAGAGCGACAATTACTTAATTATGTACGTGTTGCTAGAAAAGCAAAAGGGTCAACAGGTGAAGTCTTATTACAATTACTTGAAATGCGCTTAGATAACGTTATTTTTCGATTAGGTATGGCTCCTACAATTCCTGGAGCAAGGCAACTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATGATCGTATAGTAAATATACCAAGTTATCGGTGTAAACCTGAGGATTTTATTACTATAAAAGATCGACAAAAATCTCAGGCTATAATTAGTAAAAATTTAAATTTGTATCAAAAATATAAAACACCAAATCATTTAACTTATAATTTTTTAAAAAAAAAAGGATTAGTTAATCAAATACTGGATCGTGAATCCATTGGTTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGCCAAGCTTAATTAACAACTAAGAATATTTGTAATTCTATACATAAT-AAAAATTT--G-AACTTCGGAAAGAGAG-------------------------TAAGGGTTATAGTCGACACTTG------AATATTGCCTCTATTTCAAAA-------------------------CCGAACATGAAATTTTAATATCACACGGCTTCTTTATGAATTAAAGA-TTTTTTCTATTATTTTATTAATACGTATTATAATAAATTCATAGCATCTACGTTAGTTTATTTTTATAAA-AAAACTTTATAGATGATCCTTTTATAAA----TTTTT-----ATA----TAAAAAAAA-TTTATAATTATTTCGTTCTTTATTTCTATTAAAATAAATCATTAGGAAAATATTTTTTACCGAGCTTTAATA--------AAAATATTAATAAATTTAGCAAACTAAATTTATTATTTTAAAGTTTACTTGCTTTAAGTTATTTGATTTTTTATTCAAATAAATTAAGATTTAGTTACGAAAAAAATATTTTT-TTTTTTCT-CCATAGATTTTTAGTTGCAAAAATTTTTAATAAAAAAGAA---TTCCGTGTT-----------------ATTTTTATT---ATTATTATAGGAATTTTGCTTTT--CTGTCTTAAGAAAGATTTAAAATCTTTTTAGAAATAAAGTTATTAGTCCAAAATTTACAATAAATTTAAAGACCCTTTAACTATATTTAAGTTAATTT-------------------------------------------TTTAATACAAC-TTAAATTAATTATTTTTACTAAAAAA-------CCATGTTAAATATTATTTATTTTGCAAAATAAATTTATAATCAATTACTT----AATAGTAAA------------CAATA-TATTC----AATTTAAA-CAATTTTTTATTTCACAA--------ATAAATAATTTCATTTTAAAGAACAGTTGACATAATAATATATTTTGTGTAATACTATAAATTAACAAGTTTTTATACTTGGGTAACTTATTATTATTATTTTACAAACCAAGTTTTACCATGACTGCAACTTTAGAAAGACGCGAAAGCGCAAGCCTATGGGGTCGCTTTTGCGACTGGGTTACCAGCACTGAAAACCGCCTTTACATCGGATGGTTCGGTGTATTAATGATCCCTACCCTATTAACTGCAACCTCTGTATTCATTATTGCTTTCATCGCAGCTCCTCCTGTAGATATTGATGGCATTCGTGAGCCTGTTTCTGGTTCTCTTCTTTACGGAAACAACATCATTTCTGGTGCTATCATTCCTACTTCTGCAGCTATCGGTTTGCACTTTTATCCAATTTGGGAAGCTGCTTCCGTAGATGAATGGCTATACAATGGTGGTCCTTATGAACTAATCGTTCTTCACTTTTTACTTGGTGTAGCTTGCTACATGGGTCGTGAATGGGAACTTAGCTT-CCGTTTAGGTATGCGTCCTTGGATCGCTGTTGCATATTCAGCTCCTGTTGCGGCTGCTACTGCTGTTTTCTTGATTTATCCTATTGGTCAAGGAAGCTTTTCTGACGGTATGCCTTTAGGAATCTCTGGTACTTTTAACTTCATGATTGTGTTCCAAGCTGAACATAACATCCTTATGCACCCATTCCACATGCTTGGTGTAGCTGGCGTATTCGGCGGCTCTCTATTTAGTGCTATGCATGGTTCCTTGGTAACTTCAAGTTTAATCCGAGAAACTACTGAGAATGAGTCTGCTAATGCAGGTTACAAGTTTGGTCAAGAGGAAGAAACTTACAACATCGTAGCTGCTCACGGTTACTTTGGTAGACTTATTTTCCAATACGCTAGCTTTAATAACTCTCGTTCTTTACACTTCTTTTTAGCTGCTTGGCCTGTAGTAGGTATCTGGTTTACTGCATTAGGTATTAGCACAATGGCTTTCAACCTAAATGGTTTCAACTTTAACCAATCTGTTGTTGATAGTCAAGGCCGTGTAATTAACACTTGGGC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		Bryum_coronatum                 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		Bryum_clavatum                  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		Bryum_caucasicum                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		Bryum_caespiticium              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		Bryum_bicolor                   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		Bryum_argenteum                 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		Bryum_alpinum                   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		Bryum_algovicum                 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		Brachymenium_pulchrum           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		Brachymenium_globosum           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		Acidodontium_sprucei            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		Acidodontium_ramicola           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	;
END;

BEGIN CODONS;
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 END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
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 END;