#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on July 25, 2021; 19:19 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Woo V., Funke M., Smith J., Lockhart P., & Garnock-jones P. 2011. New World Origins of Southwest Pacific Gesneriaceae: Multiple Movements Across and Within the South Pacific. American Journal of Botany, 172(3): 434-357. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S10156] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=47; TAXLABELS Achimenes_misera Asteranthera_ovata_05 Besleria_labiosa Boea_hygroscopica Chirita_gemella Coronanthera_clarkeana_Panie Coronanthera_deltoidifolia_Aoupinie Coronanthera_pancheri Coronanthera_sericea_Koghis Coronanthera_sericea_Thy Coronanthera_species_Nakada Coronanthera_species_Tchingou Coronanthera_squamata Cremosperma_castroanum Cremosperma_humidum Cremosperma_reldioides Depanthus_glaber Diastema_affine Fieldia_australis Fieldia_australis_CHR Gasteranthus_atratus Gasteranthus_calcaratus_ssp._calcaratus Gasteranthus_corallinus Gasteranthus_crispus Gasteranthus_quitensis Gasteranthus_villosus Gloxinia_sarmentiana Lenbrassia_australiana_110 Lenbrassia_australiana_116 Mitraria_coccinea Napeanthus_costaricensis Napeanthus_jelskii Napeanthus_sp._JLC_7604 Nautilocalyx_melittifolius Negria_rhabdothamnoides_Mt_Gower Negria_rhabdothamnoides_Mt_Lidgbird Niphaea_oblonga Rhabdothamnus_solandri_Aldermen_Island Rhabdothamnus_solandri_Homunga Rhabdothamnus_solandri_Pauatahanui Rhabdothamnus_solandri_Shoe_island Rhabdothamnus_solandri_Wanganui Rhytidophyllum_tomentosum Sanango_racemosum Sarmienta_repens Sinningia_conspicua Vanhouttea_lanata ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa2; DIMENSIONS NTAX=25; TAXLABELS Asteranthera_ovata Besleria_sp. Columnea_byrsina Coronanthera_clarkeana Depanthus_glaber Fieldia_australis Gasteranthus_delphinoides Gesneria_christii Glossoloma_panamense Kohleria_spicata Lenbrassia_australiana Mitraria_coccinea Napeanthus_apodemus Napeanthus_macrostoma Negria_rhabdothamnoides Primulina_tabacum Ramonda_myconi Rhabdothamnus_solandri Rytidophyllum_auriculatum Sarmienta_repens Sinningia_richii Sinningia_speciosa Solenophora_obliqua Sphaerorrhiza_sarmentiana Streptocarpus_primulifolius ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M4460] TITLE combined_full; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=2827; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Asteranthera_ovata_05 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Besleria_labiosa 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Chirita_gemella 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Coronanthera_deltoidifolia_Aoupinie 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Coronanthera_pancheri 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Coronanthera_sericea_Koghis 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Coronanthera_species_Nakada 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Cremosperma_humidum 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Cremosperma_reldioides 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Depanthus_glaber 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Diastema_affine 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Fieldia_australis 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Fieldia_australis_CHR 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Gasteranthus_corallinus 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Gasteranthus_crispus 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Gasteranthus_quitensis 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Gasteranthus_villosus 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Lenbrassia_australiana_116 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Mitraria_coccinea 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Napeanthus_costaricensis 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Napeanthus_jelskii 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Negria_rhabdothamnoides_Mt_Lidgbird 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Rhytidophyllum_tomentosum 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Sanango_racemosum 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Sarmienta_repens 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Sinningia_conspicua 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Vanhouttea_lanata 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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .] Asteranthera_ovata 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Besleria_sp. 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Columnea_byrsina 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Coronanthera_clarkeana 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Depanthus_glaber 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Fieldia_australis 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Gasteranthus_delphinoides 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Glossoloma_panamense 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Kohleria_spicata 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Lenbrassia_australiana 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Mitraria_coccinea 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Napeanthus_apodemus 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Napeanthus_macrostoma 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Negria_rhabdothamnoides 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Primulina_tabacum 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Ramonda_myconi 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Rytidophyllum_auriculatum 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Sarmienta_repens 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Sinningia_richii 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Sinningia_speciosa 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Solenophora_obliqua 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Sphaerorrhiza_sarmentiana 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Streptocarpus_primulifolius GTGGATCATACCTTTCCTTCCACTTCCAGTTCCTATGTTAATAGGAATGGGACTTCATCTTTTTCCGACAGCAACAAAAG?TCTTCGTCGTATGTGGGCCTTTACCAGTATTTTATTGTTAAGTATAGTTATGATTTTTTCAATTAATCTGTCTATTCAGTTAATAAATAGCAGTTCTATCTATCAATATATATGGTCTTGGACTCTCGATAATGATTTTTGTTTAGACTTTGGGTACTTTATCGATCCACTTACTTCTATTATGTCAATGTTAATTACTACTGTTGGAATTATGGTTCTTATTTATAGTGATAATTATATGGCTCATGATCAAGGCTATTTGAGATTTTTTGCTTATATGAGTTTTTTCAGTACTTCTATGTTGGGATTAGTTACTAGTTCGAATTTGAT?CAAATTTATATTTTTTGGGAATTGGTTGGAATGTGTTCATATCTATTAATAGGGTTTTGGTTTACACGACCTTTTGCAGCAAATGCTTGTCAAAAAGCATTTGTAACTAATCGTGTAGGGGATTTTGGTTTATTACTAGGAATTTTAGGTTTTTATTGGATAACAGGTAGTTTTGAATTTCGGGATTTATTCGAAATATTCAATAACTTGATTTATAATAATGAAGTCAATTCTCCATTTGTTACGTTGTGTGCTGCTCTATTATTTTCCGGTGCAGTTGCTAAATCTGCACAATTTCCTCTTCATGTATGGTTACCTGATGCTATGGAGGGACCTACTCCTATTTCAGCTCTCATACATGCTGCTACTATGGTAGCAGCGGGGATTTTTCTTGTAGCTCGGCTTCTTCCTCTTTTCATAGTTATACCTTATATAATGAATTTGATCTCGGTTATAGGGATAATAACAGTATTTTTAGGAGCTACTTTAGCTCTTGCTCAAAAAGACATTAAGAGAGGTTTAGCTTATTCGACAATGTCTCAATTGGGTTATATGATGTTAGCTCTAGG?ATGGGGTCTTATCGAAGTGCTTTATTTCATTTGATTACTCATGCTTATTCCAAAGCATTATTATTTTTAGGGTCTGGATCCATTATTCATTCCATGGAAACTCTTGTTGGCTATTCTCCGGATAAAAGTCAGAATATGGTTATTATGGGTGGGTTAACAAAACATGTACCGATTACCAAGATCTCTTTTTTATTCGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCCCCTCTTGCGTGTTTTTGGTCAAAAGATGAAATTCTTAATGATAGTTGGTTGTATTCTCCTATTTTCGCAATAATAGCTTGGTCCACAGCAGGATTAACCTCATTTTATATGTTTCGAATCTATTTACTTACTTTTGAGGGGCACTTTAACAGTAATTTTCAAACTTCCTGTAC?AAACAAAACACCCTTTTATATTCCATATCTTTATGGGGT---------AAAAA?????TTAACAAAAATTTTCATTTAGTAAAGATCTATAATCAAAAAAGTACTTTCTTTTTTCGAAAAAAAGCATATCGAAATGATGAGGATGTAAGAAA------AATAA???GGCCTGTTGTTGCTATTGCTCATGTTGATAATAAAGTAGTTTATTCCTATCCTTATGAATCGGAGAATACTATGCTATTCCTTACATTTGTATTAGGTTTATTTACTTTGTTTGTTGGATTTCTAGGAAATCCTTTTAATCA------AGA?????????TTTGGATATTTTAACCAAATGGTTATCTCCATCTATCAACCTTTTACATCAAAAGACAAACGATTCACTAAATTGGTATGAATTTTTTAAAGATGCAATCTTTTCAGTCAGTATAGCTTATTTCGGAATATTTCTAGCATCTTTTTTATATAAACCCATTTATTCCTCTTTCAAAAATTTAGATTTAATCAATTCATTTGTTAAACAGGGTGCCAAGCGAGTTGT?TGGGACAAAATTCTAAATATTATATATGATTGGTCATATAATCGTGCTTATATAGATACTTTTTATACAACATCCTTCACTGGGGCGATAAGAGGATTGACTCAATTAACTCATTTTTTTGATAAACGAGTAGTTGATGGG???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ATCGAAAGTCGCCATCAAAGATCTGGTGCTTACAAAGAAG---------------------AGCTCTAGCTCT------------AGGAGCAGTTCCTCCCCTTCAGAATGTGAAGTTGTGTTG------AAT---GGTGAGGCTTTTGAAGATGGGAGCTGCTTACTA---CCCCCGGAT------------TCGAAGAGAAAACCAGTATCGACGAATGCC------GACAAATGTAGAGGA---GCTAGAGATCCAGCACAGAGTGCATCGAATCTAGCTAAAGAATCGAGGGCTAAGGCAAGAGCAAGAGCTAGGGAAAGAACAAGGGAGAAACTGTGCATCAAGAAGCTGAATGAATCAAGAAACATG---------------------------------------------------------AACAACAGTTTGTTT------------GCATCT------AATAGCCAGCCTGTCCTTCATTGCCCCATAACTGAT------GAAGCTACTGCAACTCAAGAAGACCTATTTCAA------------GAATCCAGTGTCATTAAAAGGATGCTAAGGCACCAACA---GTCGTTTTTCGGGTTT------------------------CATTGC---GGCGCCCTAGCGTCTCCTATTGTCAATGAGAACTGGGATGTTGGCAGCTTAACC---TCACAATCGGGGCGAGTAATAACCTCTCGGCGCGGCAAGCGCCAAGGAAAACAATATTGGATGCCTCTCCTGTCCTGGTGCTGTCCGCG-GTACCCAAGGCGTGACGAGGAACGTC--TATAGAGTACGTATAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCATCAGGTTGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCA-CGCATCTCGTCGCCACCCCCACAGACAGATCTTCGGTTCCCCACCACAAGTGTCGGGAGCGGAAGCATGCTGGGGAGTGTGCGGATA--TTGGCCTCCCGTTA-CCTCGT--GTAGCGGCTG-GCCCAAACAGGATACCGTGTCGATGGATGTCACACGATACGTGGTGGTTGGATTCCACAACTCTCGTAACTGTCGTGTGAGACC---TCATCGAGAC----------------ACGAGCAC-GACCCCGTGGCACCGGCTGCCCTCGA---CTTG-TATG-AAACCTACTAAGTGAAGACTTTCAATTTCAGAGAAACCCTGGAA--TTAATAAAAATGGGCAATCCTGAGCCAGATCCT-TGTTTTCTCAAAACAAGGGTTCAG-AGAGCGAGAGAAAGGTTAT-AGG-----TGCAGAGACTCAATGGAAGC--TGTTCTAACAAATGGAGTTTACTGCGTTGGTAGGGGAATT--------GAGACTTCAGGAAGGATG-------------AAACGTATCTATTGAATAC-----------------ATTAATAATGGCCCGAATCTGTATCTGGG?TTTTTGTATATGAAAAATGGAAGGATTGGTGTGAATTGATTTCACATTGATAAAAGAATCGAATATTCATTGATCAAATAATTCACCCCATAGTCCGATAGATCTCTT-----AAAGAATTGATTAAT------CAGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCGTTCTACATGTCAATACCGGCAACAATGAAACTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAAAAAAAAAAATCCTTAT---AATT-----GACTCCTAAAATATTT-------ATCCTATCCGCTTTGTTCGTTAAAGGTTCAAAATTCCTTTATCTTT------CTAATTCTTTTAGAAATGTCTTTGGGCGTAAATGACTTTCTCTT--------------TGAT----ATAGAATACACATTCAAATGAAGCAAGGAATCCCTATTGGAATAATTCACAATCAATAGCATTACGCATACTGACACTTAGAAAGTCGTCTTTTTAAAGATCCAAG---------------------------------------------------------------------------------TCCTCTAATAAAATGAGGATGGGATGATACATTAGGAAT???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????0000020010111010000?12221110101101111101000110010100022000000000???????? ; END; BEGIN SETS; CHARSET indels (CHARACTERS = combined_reduced) = 5834-5905; CHARSET question_mark (CHARACTERS = combined_reduced) = 5833; END; BEGIN TREES; TITLE Tb10771; LINK TAXA = Taxa2; TRANSLATE 1 Primulina_tabacum, 2 Ramonda_myconi, 3 Streptocarpus_primulifolius, 4 Sarmienta_repens, 5 Rhabdothamnus_solandri, 6 Depanthus_glaber, 7 Lenbrassia_australiana, 8 Negria_rhabdothamnoides, 9 Fieldia_australis, 10 Mitraria_coccinea, 11 Asteranthera_ovata, 12 Coronanthera_clarkeana, 13 Kohleria_spicata, 14 Sinningia_richii, 15 Sinningia_speciosa, 16 Sphaerorrhiza_sarmentiana, 17 Gesneria_christii, 18 Rytidophyllum_auriculatum, 19 Solenophora_obliqua, 20 Columnea_byrsina, 21 Glossoloma_panamense, 22 Napeanthus_apodemus, 23 Napeanthus_macrostoma, 24 Gasteranthus_delphinoides, 25 Besleria_sp.; TREE Fig._3 = [&R] (((1,3),2),(((((((18,17),(19,13)),((20,21),(14,15))),16),(((4,10),(11,9)),(((6,7),8),(5,12)))),(22,23)),(24,25))); END; BEGIN TREES; TITLE Tb10770; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Asteranthera_ovata_05, 2 Negria_rhabdothamnoides_Mt_Gower, 3 Coronanthera_species_Nakada, 4 Napeanthus_sp._JLC_7604, 5 Chirita_gemella, 6 Rhabdothamnus_solandri_Homunga, 7 Cremosperma_reldioides, 8 Sinningia_conspicua, 9 Boea_hygroscopica, 10 Gasteranthus_atratus, 11 Coronanthera_deltoidifolia_Aoupinie, 12 Gloxinia_sarmentiana, 13 Coronanthera_sericea_Koghis, 14 Coronanthera_sericea_Thy, 15 Achimenes_misera, 16 Napeanthus_jelskii, 17 Besleria_labiosa, 18 Sanango_racemosum, 19 Rhabdothamnus_solandri_Aldermen_Island, 20 Diastema_affine, 21 Rhabdothamnus_solandri_Shoe_island, 22 Gasteranthus_villosus, 23 Rhytidophyllum_tomentosum, 24 Depanthus_glaber, 25 Nautilocalyx_melittifolius, 26 Gasteranthus_calcaratus_ssp._calcaratus, 27 Lenbrassia_australiana_110, 28 Gasteranthus_quitensis, 29 Cremosperma_castroanum, 30 Vanhouttea_lanata, 31 Napeanthus_costaricensis, 32 Coronanthera_pancheri, 33 Negria_rhabdothamnoides_Mt_Lidgbird, 34 Niphaea_oblonga, 35 Lenbrassia_australiana_116, 36 Coronanthera_species_Tchingou, 37 Rhabdothamnus_solandri_Pauatahanui, 38 Coronanthera_clarkeana_Panie, 39 Mitraria_coccinea, 40 Fieldia_australis, 41 Gasteranthus_corallinus, 42 Fieldia_australis_CHR, 43 Cremosperma_humidum, 44 Rhabdothamnus_solandri_Wanganui, 45 Coronanthera_squamata, 46 Sarmienta_repens, 47 Gasteranthus_crispus; TREE Fig._2 = [&R] ((((((((1,46),(40,42)),39),(((2,33),24),(27,35))),((((3,32,(36,45)),38),(11,(13,14))),(((6,37),(21,44)),19))),((((4,31),16),18),((((7,29),43),17),(((10,(26,41)),(22,28)),47)))),((8,30),((12,(((15,34),20),23)),25))),(5,9)); END;