#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on October 18, 2019; 13:22 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Bã¤rmann E.V., Rößner G.E., & Wörheide G. 2013. A revised phylogeny of Antilopini (Bovidae, Artiodactyla) using combined mitochondrial and nuclear genes. Molecular Phylogenetics and Evolution, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S12859] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=40; TAXLABELS Aepyceros_melampus Antidorcas_marsupialis Antilope_cervicapra Capra_sp. Cephalophini_sp. Damaliscus_sp. Dorcatragus_megalotis Eudorcas_rufifrons Eudorcas_thomsonii Gazella_bennettii Gazella_cuvieri Gazella_dorcas Gazella_gazella Gazella_leptoceros Gazella_spekei Gazella_subgutturosa Gazella_subgutturosa_marica Hippotragus_niger Kobus_ellipsiprymnus Litocranius_walleri Madoqua_guentheri Madoqua_kirki Madoqua_saltiana Nanger_dama Nanger_granti Nanger_soemmerringi Neotragus_batesi Neotragus_moschatus Oreotragus_oreotragus Ourebia_ourebi Pantholops_hodgsoni Procapra_gutturosa Procapra_picticaudata Procapra_przewalskii Raphicerus_campestris Raphicerus_melanotis Raphicerus_sharpei Redunca_fulvorufula Saiga_tatarica Tragelaphus_sp. ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M13373] TITLE Antilopini_All_Genes; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=8167; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1990 2000 2010 2020 2030 2040 2050 2060 2070 2080 2090 2100 2110 2120 2130 2140 2150 2160 2170 2180 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] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 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ATGACCAACATTCGAAAATCACACCCACTAATAAAAATTATTAATAACGCATTCATTGACCTACCAGCCCCATCAAACATTTCATCATGATGAAACTTCGGTTCTCTCCTAGGCATCTGCCTAATCCTACAAATCCTAACAGGCCTATTTCTAGCAATACACTACACATCTGACACAACAACAGCATTTTCCTCTGTCACCCATATTTGCCGAGATGTCAACTACGGATGGATTATCCGATATATACATGCAAACGGAGCATCAATGTTCTTCATCTGTCTATTCATGCATGTAGGACGAGGCTTATACTACGGATCATACTTATTTCTAGAAACATGAAACATTGGAATTATTCTTCTATTCGCAACAATAGCCACAGCATTCATAGGCTATGTCCTGCCATGAGGACAAATATCATTCTGAGGAGCAACAGTCATTACAAATCTCCTCTCAGCAATCCCATACATTGGTACAAACCTAGTAGAATGAATCTGAGGAGGGTTTTCAGTAGACAAAGCAACCCTCACCCGATTTTTCGCTTTCCACTTCATCCTCCCATTCATCATTGCGGCACTAGCCATAGTCCACCTACTCTTTCTTCACGAAACAGGATCTAACAACCCTACAGGAATCTTATCAGATTCAGATAAAATTCCATTCCACCCTTACTATACTATTAAAGACATCCTAGGAATCCTATTAATAATTCTAGTCCTAATACTCCTAGTACTATTCATACCCGACCTACTAGGAGACCCAGACAACTACATCCCCGCAAACCCACTCAACACCCCTCCCCACATCAAGCCCGAATGATACTTCCTGTTCGCATACGCAATCCTACGATCAATCCCCAATAAACTAGGAGGAGTCCTGGCCTTAGTTCTTTCAATCCTAATCCTAGCCCTCATACCAATACTCCACATATCTAAACAACGAAGCATGATATTCCGACCAATTAGTCAGTGCCTATTCTGAATCCTAGTAGCCGATCTACTTACACTCACATGAATTGGAGGACAACCAGTTGAACATCCATATATCATTATTGGCCAACTAGCATCCATCATATATTTCACCCTTATCCTAGTCATAATACCAGTAGCCAGCACCATCGAAAACAACCTCCTAAAATGAAAAATGACACACCAAACCCATGCTTATCACATAGTAAACCCAAGCCCCTGACCCCTCACAGGAGCATTATCCGCCCTCTTAATAACATCCGGTTTAATTATATGATTTCACTTTAACTCAACAATCCTACTAATACTCGGCTTAACAACAAATATACTCACAATATATCAATGATGACGAGATATTATCCGAGAAAGCACTTTCCAAGGCCATCACACTCCAACCGTCCAAAAAGGTCTTCGCTATGGAATAATTCTCTTCATTATCTCTGAGGTCCTATTCTTCACTGGATTTTTCTGAGCATTTTACCACTCAAGCCTTGCCCCTACGCCTGAACTAGGTGGTTGCTGACCCCCAACAGGAATTCATCCACTCAACCCCTTAGAAGTCCCACTACTCAATACCTCCGTCCTTCTGGCCTCAGGAGTTTCTATTACTTGAGCTCATCACAGCCTCATAGAAGGAAATCGCAACCACATATTACAAGCCCTATTTATTACCATTGCACTAGGCGTATACTTCACACTGCTACAAGCCTCAGAATACTACGAAGCACCCTTTACTATTTCAGACGGAGTTTACGGCTCAACCTTTTTCGTAGCCACAGGTTTTCACGGCCTACACGTCATCATTGGATCTACCTTCCTAATCGTTTGTTTTTTTCGTCAACTAAAATTCCACTTCACTTCTAGCCACCACTTTGGTTTCGAAGCTGCTGCCTGATATTGACACTTTGTAGACGTAGTATGACTTTTCCTTTACGTCTCTATCTATTGATGAGGCTCATACAGGTTTGGTCCTAGCCTTCCCGTTGACTCCCAATAAACTTACACATGCAAGCATCTACACCCCGGTGAG-AATGCCCTCTGAATACCA-AGACTAAGAGGAGCGGGTATCAAGC--ACACACTT--GTAGCTCATGACACCTTGCTTAACCACACCCCCACGGGAGACAGCAGTGACAAAAATTAAGCCATAAACGAAAGTTTGACTAAGTTATATTGACTA-GGGTTGGTAAATTTCGTGCCAGCCACCGCGGTCATACGATTAACCCAAGTTAACGGGAATACGGCGTAAAACGTGTTTAAGCATTACACTA-AATAGAGTTAAATCCTAATTAAACTGTAAAAAGCCATAATTATAGTGAAAGTAAACGACGAAAGTAACTCTACTACAGCTGACACACTATAGCTAAGACCCAAACTGGGATTAGATACCCCACTATGCTCAGCCCTAAACACAAATAATCATAA-AACAAGATTATTCGCCAGAGTACTACCGGCAACGGCCCAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTTTATACCCTTCTAGAGGAGCCTGTTCTATAATCGATAAACCCCGATAAACCTCACCATTTCTTGCTAATACAGTCTATATACCGCCATCTTCAGCAAACCCTAAAAAGG-AACAAAAGTAAGCACAATCATAGT-ATATAAAAACGTTAGGTCAAGGTGTAACCTATGGAATGGAAAGAAATGGGCTACATTTTCTATCATAAGAAAACCCAATAA-CGAAAGTCACTATGAAACTAATGACTAAAGGAGGATTTAGTAGTAAACTAAGAATAGAGTGCTTAGTTGAATTAGGCCATGAAGCACGCACACACCGCCCGTCACCCTCCTCAAGTGACCATAATGCACTTAAACCTATTATCACGCATAAGTAATATG-AGAGGAGACAAGTCGTAACAAGGTAAGCGTACTGGAAAGTGTGCTTGGATAAATACTAAATCTAGCCCAAACATCACCTTAACTAAATTACCAAAATAAAAT---AAAATAAAACATTCACCCTTC-AATTTAAAGTATAGGAGATAGAAATTC-TAAACATGGCGCTATAGAGAAAGTACCGTAAGGGAATGATGAAAGAAAATAA-TTAAAGTATAAAAAAGCAAAGATTACCCCTTGTACCTTTTGCATAATGAATTAACTAGTAAAAA-CTTAACAAAACGAATTTCAGCTAAGTAACCCGAAACCAGACGAGCTACTTATAAACAGTCCATCAAGAACTAACTCATCTATGTGGCAAAATAGTGAGAAGATTTGTAAGTAGAGGTGACATGCCTAACGAGCCTGGTGATAGCTGGTTGTCCAGAAAATGAATCTCAGTTCAGCTTTAAA-GATACCAAAAA--TACAAACAAACCTCACTGTATCTTTAAAAGTTAGTCTAAAAGGGTACAGCTTTTTAGA-AACGGATACAACCTTGACTAGAGAGTAAGATATAATATCATCATAGTAGGCCTAAAAGCAGCCACCAATTAAGAAAGCGTTAAAGCTCAACAACAAAAAAATATAATAATCCCAACAACAAATAA-CTAACTCCTAGCCCCGATACTGGACTAATCTATTATTAAA--TAGAAGTAATAATGTTAATATGAGTAACAAGAAA-CATTTTCTC-CTCGCACAAACCTAAATCAGTACCTGATAATATTCTGACTGTTAACAGTAAATAAAAACAACCCAACAATAAATAATTTATTAATAACACTGTTAATCCAACACAGGAGTGCACCCCAGGAAAGATTAAAAGAAGTAAAAGGAACTCGGCAAACAT-AAACCCCGCCTGTTTACCAAAAACATCACCTCCAGCATTTCCAGTATTGGAGGCACTGCCTGCCCAGTGACTAACTGTTAAACGGCCGCGGTATCCTGACCGTGCAAAGGTAGCATAATCATTTGTTCTCTAAATAAGGACTTGTATGAATGGCCACACGAGGGTTTTACTGTCTCTTACTTCCAATCAGTGAAATTGACCTTCCCGTGAAGAGGCGGGAATAAATAAATAAGACGAGAAGACCCTATGGAGCTTTAACTAACTAGTCCAAAGAGAATAAACCA--AACCACCAAGGAA-TAAAAATACTCCTG-ATGGACTAGCAGTTTTGGTTGGGGTGACCTCGGAGAACAAAAAATCCTCCGAACGATTCTAAAAACCAGACTCACCAGTCAAATT-ATTCT-ATCGC-TTATTGACCCAAAAA-TTTGATCAACGGAACAAGTTACCCTAGGGATAACAGCGCAATCCTATTCAAGAGTCCTTATCGACAATAGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGACACCCCGATGGTGCAACCGCTATCAAAGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAGTCCTACGTGATCTGAGTTCAGACCGGAGCAATCCAGGTCGGTTTCTATCTATT-AT-GTATTTCTCCCAGTACGAAAGGACAAGAGAAATAAGGCCAACTTTAAACAAGCGCCTCAAACCAATTAATGAACTCATCTCAATTA-ATCTTACAAACATG--CCCGCCCAAGAAA-AGGGCTCAATGCCTGCGCTCGGCTCCCAGAGGCGGCTGCTGGGTTCCCTTAACTGCACACCCCCAGCCACCCTCCCCCTCACACTGGCCCCCAATCGGACCGGGCCCCAGTGCCTGGAGGTGTCCATCCCCGACGGGCTCTTTCTCAGCCTGGGGCTGGTGAGTCTTGTGGAGAACGTGCTGGTGGTGGCCGCCATTGCCAAGAACCGCAACCTGCATTCCCCCATGTACTACTTCATCTGCTGCCTGGCTATGTCCGACCTGCTGGTGACCATCAGCAATGTGCTGGAGACGGCAGTCATGCTGCTGCTGGAGGCCGGTGTCCTGGCCACCCAGGCGGCCGTGGTACAGCAGCTGGACAATGTCATCGACGTGCTCATCTGCAGCTCCATGGTGTCCAGCCTCTGCTTCCTGGGTGCCATCGCTGTGGACCGCTACATCTCCATCTTCTATGCGCTGCGGTACCACAGTGTTGTGACACTGCCCCGGGCGTGGAGGATCATTGCAGCCATCTGG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Antidorcas_marsupialis 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Antilope_cervicapra 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Capra_sp. ATGACCAACATCCGAAAAACCCACCCATTAATAAAAATTGTAAACAACGCATTTATTGACCTTCCAACCCCATCAAATATCTCATCATGATGAAACTTTGGATCCCTCCTAGGCATTTGCCTAATTTTACAGATCCTGACAGGCCTATTCCTAGCAATACACTATACATCCGACACAATAACAGCATTCTCCTCTGTAACTCACATTTGTCGAGATGTGAATTATGGCTGAATTATCCGATACATACACGCAAACGGAGCATCAATATTCTTTATCTGCCTATTCATACATGTCGGACGAGG{CT}CTATATTATGGATCGTATACCTTTCTAGAAACATGAAACATTGGAGTAATCCTCCTGCTCGCAACAATAGCCACAGCATTCATAGGCTATGTCTTACCATGAGGACAAATATCATTCTGAGGGGCAACAGTCATCACTAATCTTCTCTCAGCAATCCCATATATTGGCACAAACCTAGTCGAATGAATCTGAGGAGGATTCTCAGTAGATAAAGCCACCCTCACCCGATTCTTCGCTTTCCACTTTATCCTCCCATTCATCATTGCAGCCCTCGCCATAGTCCACCTACTCTTCCTCCACGAAACAGGATCCAACAATCCCACAGGAATTCCATCAGACACAGACAAAATCCCATTTCACCCTTACTACACCATTAAAGATATCCTAGGCGCCATACTACTAATTCTTGTTCTAATATTACTAGTACTATTCACACCTGACCTACTCGGAGACCCAGACAACTATATCCCAGCAAACCCACTCAATACACCCCCTCATATCAAACCTGAGTGGTACTTCCTATTTGCATACGCAATCCTACGATCAATCCCCAACAAACTAGGAGGAGTCCTAGCCCTAGTCCTCTCAATCCTAATCTTAGTACTTATACCTTTCCTCCACACATCTAAACAACGAAGCATAATATTCCGCCCAATCAGCCAATGCATATTCTGGATCCTGGTAGCAGATCTATTAACACTTACATGAATTGGAGGACAGCCAGTCGAACATCCCTACATTATTATTGGACAACTAGCATCTATTATATACTTCCTCATCATTCTAGTAATAATACCAGCGGCTAGCACCATTGAAAATAACCTCCTAAAATGAAGAATGACACACCAAACCCATGCTTATCACATAGTAAATCCAAGCCCTTGACCCCTCACAGGAGCACTATCCGCCCTCCTATTAACATCCGGCCTCATCATATGATTTCACTTCAGCTCAACCGTCCTACTAACCCTAGGTCTAACAACAAATATGCTTACAATATACCAATGATGACGAGATGTGATTCGAGAAAGTACCTTTCAAGGTCACCATACTCCAGCCGTTCAAAAAGGCCTTCGCTATGGAATAATTCTTTTTATCATTTCCGAAGTTTTATTCTTTACTGGATTTTTCTGAGCTTTTTATCACTCGAGCCTTGCCCCCACACCCGAATTAGGCGGCTGCTGACCCCCAACAGGCATTCACCCACTTAATCCCCTAGAAGTCCCATTACTTAACACTTCCGTCCTTCTAGCCTCAGGAGTTTCCATCACCTGAGCTCACCATAGCCTTATGGAAGGAGACCGTAACCACATGTTACAAGCCTTATTTATTACCATTATACTAGGCCTATACTTCACATTACTACAGGCATCAGAATATTATGAAGCACCATTCACAATTTCAGACGGGGTCTACGGTTCAACTTTCTTTGTAGCCACAGGATTCCACGGTCTTCATGTTATCATCGGATCTACCTTTTTGATTGTCTGCTTTTTCCGTCAACTAAAATTTCACTTCACCTCTAATCATCATTTCGGTTTCGAAGCTGCTGCCTGATACTGACACTTTGTAGACGTAGTGTGACTTTTCCTCTATGTATCCATCTATTGATGAGGCTCACATAGGTTTGGTCCCAGCCTTCCTGTTAACTTTCAACAGACTTACACATGCAAGCATCCACGCCCCGGTGAGTAACGCCCTCCAAATAATA-AGACTAAGAGGAGCAGGTATCAAGC--ACACATCTT-GTAGCTTACAACGCCTTGCTTAACCACACCCCTACGGGAGACAGCAGTGACAAAAATTAAGCCATAAACGAAAGTTTGACTAAGTCATGTTGACCA-GGGTTGGTAAATCTCGTGCCAGCCACCGCGGTCATACGATTAACCCGAGCTAACAGGAATACGGCGTAAAACGTGTTAAAGCACTACATTA-AATAGAGTTAAATTCTAATTAAACTGTAAAAAGCCATAATTACAACAAAAATAAATGACGAAAGTAACCCTACTGCAGCTGATACACTATAGCTAAGACCCAAACTGGGATTAGATACCCCACTATGCTTAGCCCTAAACATAAATAATTACAGAAACAAAATTATTCGCCAGAGTACTACCGGCAACAGCCCGAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTTTATACCCTTCTAGAGGAGCCTGTTCTATAATCGATAAACCCCGATAAACCTCACCAATCCTTGCTAATACAGTCTATATACCGCCATCTTCAGCAAACCCTAAAAAGG-AACAAAAGTAAGCTCAATCACAAC-ACATGAAGACGTTAGGTCAAGGTGTAACCCATGGAATGGGAAGAAATGGGCTACATTTTCTACCTTAAGAAAATTAATA---CGAAAGCCATTATGAAATTAATGACCAAAGGAGGATTTAGTAGTAAATTAAGAATAGAGTGCTTAGTTGAATTAGGCCATGAAGCACGCACACACCGCCCGTCACCCTCCTCAAGTAAATATAATGCACTCAAGCCTATTAACACGCATCAACTACATG-AGAGGAGATAAGTCGTAACAAGGTAAGCATACTGGAAAGTGTGCTTGGATAAATACTATATCTAGCCCAATCCCCTCCCCAATCTAAACTACCAAAACAGTCT--AAAACAAAACATTTACCCC---AATT-AAAGTATAGGAGATAGAAATTT-TAAATATGGCGCTATAGAGAAAGTACCGTAAGGGAATGATGAAAGAAAAAGAATTAAAGTACAAAAAAGCAAAGATTAACCCTTGTACCTTTTGCATAATGAATTAACGAGCAAAAAACTTAACAAAACGAATTTTAGCTAAGTAACCCGAAACCAGACGAGCTACTTATGGGCAGTTTATCA-GAACTAACTCATCTATGTGGCAAAATAGTGAGGAGACCCATAAGTAGAGGTGACATGCCTAACGAGCCTGGTGATAGCTGGTTGTCCAGAAAATGAATTTTAGTTCAGCTTTAAA-GATACCAAAAA--TACAAATAAATCTTACTGTATTTTTAAAAGTTAGTCTAAAAAGGTTCAGCCTTTTAGA-AATGGGTACAACCTTCACTAGAGAGTAAGACTTTACAACACCATAGTAGGCCTAAAAGCAGCCATCAATTAAGAAAGCGTTAAAGCTCAACAATAAAGACAAAATTAATCCCAACAATAGTGCAA-CTAACTCCTAGACCTAATACTGGACCACTCTATTGTCTAA--TAGAAGCAATAATGTTAATATGAGTAACAAGAAA-TATTTTCTC-CCTGCACAAGTTTAAGTCAGTATCTGATAATATTCTGACTGTTAACAGTAAATAAAAACAACCTAACGATAAATAATTTATTAATTACACTGTTAACCCAACACAGGAGTGCACCC-AGGAAAGATTAAAAGAAGTAAAAGGAACTCGGCAAACAC-AAACCCCGCCTGTTTACCAAAAACATCACCTCCAGCATTTCCAGTATCGGAGGCACTGCCTGCCCAGTGACTAGACGTTAAACGGCCGCGGTATCCTGACCGTGCAAAGGTAGCATAATCATTTGTTCTCTAAATAAGGACTTGTATGAACGGCCACACGAGGGTTTTACTGTCTCTTACTTCCAATCAGTGAAATTGACCTCCCCGTGAAGAGGCGGGAATGAATTAACAAGACGAGAAGACCCTATGGAGCTTTAACTAACTAGTCCAAAAGAAATAAATCT--AACCACTAAGGGA-TAATAACATTCTTT-ATGGACTAGCAGTTTTGGTTGGGGTGACCTCGGAGAACAAGACATCCTCCGAGCGATTTTAAAGACTAGACTTACAAGTCAAACC-AAATT-ATCGC-TTATTGATCCAAAAAACTTGATCAACGGAACAAGTTACCCTAGGGATAACAGCGCAATCCTATTCAAGAGTCCATATCGACAATAGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGACATCCTGATGGTGCAACCGCTATCAAAGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAGTCCTACGTGATCTGAGTTCAGACCGGAGCAATCCAGGTCGGTTTCTATCTGTT-AT-GTATTTCTCCCAGTACGAAAGGACAAGAGAAATAAGGCCAACTTCAACAAAGCGCCTTAAACCAATTAATGACCTTATCTCAATTA-ATTTTACAAACAAAA-CCTGCCCTAGAAA-AGGGCCTAATGCCTGCACTCGGCTCCCCGAGGCGGCTGCTGGGTTCCCTTAACTGCACACCCCCAGCCACCCTCCCCCTCACACTGGCCCCCAATCGGACAGGGCCCCAGTGCCTGGAGGTGTCCATCCCCAACGGGCTCTTTCTCAGCCTGGGGCTGGTGAGTCTTGTGGAGAACGTGCTGGTGGTGGCCGCCATCGCCAAGAACCGCAACCTGCACTCCCCCATGTACTACTTCATCTGCTGCCTGGCCATGTCCGACCTGCTGGTGAGCGTCAGCAACGTGCTGGAGACGGCAGTCATGCTGCTGCTGGAGGCTGGTGTCCTGGCCACCTGGGCGGCCGTGGTACAGCAGCTGGACAATGTCATTGACGTGCTCATCTGCAGCTCCATGGTGTCCAGCCTCTGCTTCCTGGGTGCCATCGCTGTGGACCGCTACATCTCCATCTTCTACGCCCTGCGGTACCACAGTGT{CT}GTGACACTGCCCCGCGCGTGGAGGATCATTGCAGCC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Cephalophini_sp. 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Damaliscus_sp. 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Eudorcas_thomsonii 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Gazella_bennettii 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Gazella_cuvieri 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Gazella_dorcas 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Gazella_gazella 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Gazella_leptoceros 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Gazella_spekei 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Gazella_subgutturosa 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Gazella_subgutturosa_marica 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Hippotragus_niger ATGATCAATATCCGAAAAACTCACCCACTGATAAAAATTGTAAACAACGCATTCATTGACCTCCCAACCCCACCAAATATCTCATCGTGATGAAACTTCGGCTCCCTCCTAGGTATCTGCTTAATTCTACAAATCCTGACGGGCCTATTCCTAGCAATACACTACACATCCGACACGATAACAGCATTCTCCTCTGTCACTCATATTTGCCGAGATGTCAACTACGGCTGAATCATTCGATACATACACGCAAACGGGGCATCAATATTCTTCATCTGCCTATTCATGCATGTAGGACGAGGCCTCTATTACGGATCATACACCTTCCTAAAAACATGAAACATCGGAGTAATTCTCTTATTCACAACAATAGCTACAGCATTCATAGGCTATGTCCTGCCATGAGGACAAATATCATTCTGAGGAGCAACAGTCATCACTAATCTCCTCTCAGCAATCCCATATATCGGCACAAACCTAGTCGAATGAATCTGAGGGGGATTCTCCGTAGACAAAGCAACCCTCACCCGATTCTTTGCTTTCCACTTTATTCTCCCTTTTATCATTACTGCCCTCGCCATAGTACACCTACTCTTTCTTCACGAAACAGGCTCCAACAACCCCACAGGAATTTCATCAGACGCAGACAAAATCCCGTTCCATCCTTACTATACTATTAAAGACATCCTAGGTGCCCTACTACTAATCTTAGCCCTCATATTACTAGTACTGTTCGCACCCGACCTACTTGGAGACCCAGATAACTACACCCCAGC{AG}AACCCACTCAATACACCCCCTCACATCAAGCCCGAATGATATTTCTTATTTGCATACGCAATCCTCCGATCAATTCCCAATAAACTAGGAGGAGTTCTAGCCCTAATCTTCTCAATTCTAATTCTAGTACTTATACCTGCACTCCATACATCCAAACAACGAAGCATGATATTCCGGCCAATCAGCCAATGTATCTTCTGAATCTTAGTGGCAGACTTACTAACACTCACATGAATTGGAGGACAACCAGTTGAACACCCATATATTATTATCGGACAATTAGCATCTATCATATACTTCCTACTCATCCTAGTGCTAATACCAATGGCCGGTTCTATCGAAAACAAACTCCTAAAATGAAGAATGACACACCAAACGCATGCTTACCACATAGTAAACCCAAGCCCCTGACCCCTTACAGGAGCACTATCTGCCCTCCTAATAACATCTGGCTTAATTATATGGTTCCACTTCAATTCAACAACCCTGTTAATGCTCGGCCTAACAACAAACACACTAACAATATATCAATGATGACGAGATATTATCCGAGAGAGTACATTTCAAGGCCACCATACTCCTGCCGTCCAAAAAGGCCTTCGCTACGGAATAATCTTATTTATCATCTCAGAAGTTTTATTCTTTACCGGATTTTTCTGAGCTTTTTATCACTCAAGTCTTGCTCCCACACCCGAACTAGGCGGCTGTTGACCCCCGACAGGCATTCACCCACTCAATCCCCTAGAAGTCCCACTACTCAACACTTCTGTTCTCTTAGCCTCAGGAGTCTCAATTACCTGAGCCCACCATAGCCTCATAGAAGGAAACCGCAATAACATATTACAAGCCCTATTCATCACTATTGCCCTAGGTGTCTACTTCACACTACTGCAAGCCTCAGAATATTATGAAGCACCTTTTACTATCTCAGATGGAGTCTATGGCTCAACCTTCTTCGTAGCCACGGGATTCCACGGCCTCCATGTAATCATTGGATCCACCTTCTTAATCGTCTGCTTCTTCCGCCAACTAAAATTCCACTTTACCTCTAGCCACCACTTTGGCTTTGAAGCTGCTGCCTGATATTGACATTTCGTAGACGTAGTATGACTTTTCCTCTATGTCTCTATCTATTGATGAGGATCATATAGGTTTGGTCCCAGCCTTCCTGTTAGCTCTCAATAGACCTACACATGCAAGCATCCACGCCCCGGTGAG-AATGCCCTCTAAGTAACC-AGACTATGAGGAGCGGGTATCAAGC--ACACTACTA-GTAGCTCATGACACCTTGCTTAGCCACACCCCCACGGGAAACAGCAGTGATAAAAATTAAGCCATGAACGAAAGTTTGACTAAGCCATATTGACTA-GGGTTGGTAAATCTCGTGCCAGCCACCGCGGTCATACGATTAACCCAAGTTAACAGGAATACGGCGTAAAACGTGTTAAAGCGCCACATCA-AATAGAGTTGAGTTTTAATTAAACTGTAAAAAGCCATAATTATAATAAAAATAAACGACGAAAGTAACTCTACAACAGCTGACACACTATAGCTAAGACCCAAACTGGGATTAGATACCCCACTATGCTTAGCCCTAAACATAAATAATTATAAAAACAAAATTATTCGCCAGAGTACTACCGGCAACGGCCCAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTTTATACCCTTCTAGAGGAGCCTGTTCTGTAATCGATAAACCCCGATAAACCTCACCAATCCTTGCTAATACAGTCTATATACCGCCATCTTCAGCAAACCCTAAAAAAGGAATAAAAGTAAGCATAATCATTAC-ACATAAAAACGTTAGGTCAAGGTGTAACCTATGGAATGGGAAGAAATGGGCTACATTTTCTAATTCAAGAAAACCCACA---CGAAAGTTATTATGAAACTAATAACCAAAGGAGGATTTAGCAGTAAGCTAAGAATAGAGTGCTTAGCTGAACCAGGCCATGAAGCACGCACACACCGCCCGTCACCCTCCTCAAGTAATTACATGCACCTAAACTTATTACACGCATCAACAATATG---AGAGGAGACAAGTCGTAACAAGGTAAGCATACTGGAAAGTGTGCTTGGACAAACACCACACCTAGCCCAAACTTCCACTTTCTAGTATAACAACCAGAACAAAATAAAATAAAACATTTATTTC---AATTTAAAGTATAGGAGATAGAAATTC-TAAATATGGCGCTATAGAAAAAGTACCGTAAGGGAACGATGAAAGAGAAAG--TCAAAGTACAAAAAAGCAAAGATTAACCCTTGTACCTTTTGCATAATGAGTTAACGAGCAAAAAACTTAACAAAGCGAACTTTAGCTAAGTAACCCGAAACCAGACGAGCTACTTACGGACAGTTTACCA-GAACCAACTCATCTATGTGGCAAAATAGTGAGAAGATCCATAAGTAGAGGTGACACGCCTAACGAGCCTGGTGATAGCTGGTTGTCCAGGAAATGAATCTTAGTTCAGCTTTAAA-GATACCAAAAA--TACAAACAGATCCCACTGTATCTTTAAAAGCTAGTCTAAAAGGGTACAGCCTTTTAGA-AACGGGTACAACCTTCACTAGAGAGTAAAATTTAACAACACCATAGTAGGCCTAAAAGCAGCCATCAATTAAGAAAGCGTTAAAGCTCAACAATAACAACGATATTGATCCCAGCAGTAAACAA--TCAACTCCTAGCCATAATACTGGACTATTCTATAACAAAA--TAGAAGCAATAATGTTAATATGAGTAACAAGAAA-TATTTTCTC-CCCGCACAAGTTTAAATCAGTACCTGATAGTATACTGATTATTAACAGTAGATCAATATAACCCAACAATTAATAGCTTATCAATCTTACTGTTAATCCGACACAGGAGTGCACTC-AGGAAAGATTCAAAGAAGTAAAAGGAACTCGGCAAACAC-AAACCCCGCCTGTTTACCAAAAACATCACCTCCAGCATTCCCAGTATTGGAGGCACTGCCTGCCCAGTGAC-AAACGTTAAACGGCCGCGGTATTCTGACCGTGCAAAGGTAGCATAATCATTTGTTCTCTAAATAAGGACTTGTATGAATGGCCACACGAGGGTTTTACTGTCTCTTACTTCCGATCAGTGAAATTGACCTCCCCGTGAAGAGGCGGGGATGAACTAACAAGACGAGAAGACCCTATGGAGCTTCAACTAACTAATCCAAAGAAAACAAACTC--AATCACCAAGAGA-TAAAAACACTCTTT-ATGGGTTAGCAGTTTCGGTTGGGGTGACCTCGGAGAATAAAAAATCCTCCGAGCGATTTTAAAGACTAGACCTACAAGTCAAACC-AAATT-ATCGC-TTATTGATCCAAATA-TTTGATCAACGGAACAAGTTACCCTAGGGATAACAGCGCAATCCTATTCAAGAGTCCATATCGACAATAGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGACATCCCGATGGTGCAGCCGCTATCAAAGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAGTCCTACGTGATCTGAGTTCAGACCGGAGCAATCCAGGTCGGTTTCTATCTGTT-AT-GTATTTCTCCCAGTACGAAAGGACAAGAGAAATGGGGCCAACTTCAATAAAGCGCCCCAGACCAATTAATGACCTTATCTCAATTA-ACCTCACAGACAACT-CCCGCCCTAGAAA-AGGGCCCAATGCCTGCGCTCGGCTCCCAGAGGCGGCTGCTGGGTTCCCTTAACTGCACATCCCCAGCCACCCTCCCCCTCACACTGGCCCCCAATCAGACAGGGCCCCAGTGCCTGGAGGTGTCCATCCCCGACGGGCTTTTTCTCAGCCTGGGGCTGGTGAGTCTTGTGGAGAACGTGCTGGTGGTGGCCGCCATCGCCAAGAACCGCAACCTGCATTCCCCCATGTACTACTTCATCTGCTGCCTGGCCATGTCCGACCTGCTGGTGAGCGTCAGCAACGTGCTGGAGACGGCAGTCATGCTGCTGCTGGAGGCTGGTGTCCTGGCCACCCGGGCGGCCATGGTACAGCAGCTGGACAATGTCATCGACGTGCTCATCTGCAGCTCCATGGTGTCCAGCCTCTGCTTCCTGGGTGCCATCGCTGTGGACCGCTACATCTCCATCTTCTACGCCCTGCGGTACCACAGTGTCGTGACACTACCCCGGGCGTGGAGGATCATTGCGGCCATC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Kobus_ellipsiprymnus 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Litocranius_walleri 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Neotragus_batesi 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Procapra_przewalskii 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Raphicerus_campestris 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Raphicerus_melanotis 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Raphicerus_sharpei 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Redunca_fulvorufula 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Saiga_tatarica 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Tragelaphus_sp. ATGATTAACATTCGAAAATCTCACCCGTTAATAAAAATCGTAAACAACGCATTCATTGACCTCCCAACCCCACCAAACATCTCATCATGATGAAATTTCGGATCACTTCTAGGGATCTGCCTAGTTCTGCAAATCCTTACAGGTTTATTTCTAGCAATACACTACACATCAGACACAATAACAGCATTTTCCTCCGTCACCCACATCTGTCGAGACGTAAACTACGGCTGAATCATCCGGTATATGCATGCAAATGGAGCTTCAATATTTTTCATTTGCTTATATATGCACGTAGGACGAGGACTGTACTACGGGTCATACACTTTCCTAGAAACATGAAATATCGGAGTAATTCTTCTATTCACAGTAATAGCCACAGCGTTCATAGGATACGTACTACCATGAGGGCAAATGTCATTCTGAGGAGCAACAGTTATCACGAACCTCCTATCAGCAATCCCATACATTGGCACCAACCTAGTCGAATGAATCTGAGGAGGGTTTTCAGTGGACAAAGCAACCCTAACCCGATTTTTCGCCTTCCACTTCATCCTTCCATTTATTATCGCAGCACTAGCCCTTGTCCACCTTCTATTCCTCCACGAAACAGGATCCAACAACCCAACAGGAATCTCGTCAGACACAGACAAAATCCCATTCCACCCCTACTATACAATTAAAGACATTCTAGGTGCCCTATTACTAATTCTAGCTCTAATACTTCTAGTGCTGTTTGCACCTGATCTCCTTGGAGACCCCGACAACTATACCCCAGCAAACCCACTCAACACACCCCCTCACATTAAACCCGAATGGTACTTCCTATTCGCATACGCAATTCTGCGATCAATCCCAAATAAACTAGGAGGGGTCCTAGCCCTAGTACTCTCAATCCTAATCCTTATCTTAATACCTCTACTGCATGCATCCAAACAACGAAGCATAATATTCCGACCATTGAGCCAATGCCTATTCTGAATCTTAGTAGCAGACCTACTCACACTCACATGAATTGGAGGGCAACCAGTCGAACACCCATATATCATCATCGGACAACTAGCATCTATTATATACTTCCTCCTTATTTTAGTATTAATGCCAGCAATTAGCATAATCGAAAATAATTTATTAAAGTGAAGAATGACACACCAAACACATGCTTACCACATAGTAAACCCAAGCCCTTGACCCCTTACAGGAGCCCTATCCGCCCTACTAATAACATCAGGCCTAACCATGTGATTCCACTACAACTCAACAATTCTCCTAATGCTCGGCCTAACAACTAATATACTGACAATATATCAATGATGACGAGATATTATCCGAGAAAGCACCTTTCAAGGACATCACACTCCAGCCGTCCAAAAAGGCCTTCGCTACGGAATAATCCTCTTTATCATCTCTGAAGTCCTATTCTTCACCGGCTTCTTCTGAGCATTCTACCACTCAAGCCTTGCCCCCACACCAGAATTAGGAGGCTGCTGACCCCCAACAGGCATTCACCCTCTCAACCCCATAGAAGTCCCGCTACTCAACACCTCTGTTTTACTGGCTTCAGGAGTCTCTATTACTTGAGCTCACCATAGCCTAATAGAAGGAGACCGCAACCACATACTACAAGCCCTATTTATCACTATCGCACTAGGGATCTATTTTACACTACTACAGGCCTCAGAATATTATGAAGCACCCTTTACCATCTCAGACGGGGTATATGGATCAACCTTTTTCGTAGCTACAGGCTTCCATGGCCTCCACGTCATTATTGGATCTACATTCCTAATCGTATGCTTTTTCCGCCAACTAAAGTTTCATTTTACCTCTAGCCACCACTTTGGCTTTGAAGCCGCTGCCTGATACTGACACTTCGTAGACGTAGTGTGACTTTTCTTATACGTATCTATTTATTGATGAGGCT--CATAGGCTTGGTCCTGGCCTTCCTGTTGTCTGTTAACAAACTTACACATGCAAGCATCCACATCCCAGTGAG-AATGCCCTCCAGGTAACA-CGACCAAAAGGAGCTGGTATCAAGC--ACACACCC--GTAGCTCATGACACCTTGCTTAACCACACCCCCACGGGAAACAGCAGTGATAAAAATTAAGCCATAAACGAAAGTTCGACTTAGTTATGTTAATTA-GGGTTGGTAAATTTCGTGCCAGCCACCGCGGCCATACGATTAACCCAAGCTAACAGGAGTACGGCGTAAAATGTGTTAAAGCGTCACACTA-AATAGAGCTAAATCTTAATTAAGCTGTAAAAAGCCATAATTATTATAAAA-TAAATAACGAAGGTAGCTCTACAACAGCTGACACACTATAGCTAAGACCCAAACTGGGATTAGATACCCCACTATGCTTAGCCCTAAACATAGATAATTATATAAACAAAATTATTCGCCAGAGTACTACTAGCAACAGCTTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTTCATACCCCCCTAGAGGAGCCTGTTCTATAATCGATAAACCCCGATAAACCTCACCAATTCTTGCTAATACAGTCTATATACCGCCATCTTCAGCAAACCCTAAAAAGG-AACAAAAGTAAGCGTAATCATAGT-ACATAAAAACGTTAGGTCAAGGTGTAACCTATGAAATGGGAAGAAATGGGCTACATTTTCTTAGATCAAGAAAACTAATATACGAAAGTTATTATGAAATTAATAACTAAAGGAGGATTTAGCAGTAAACTAAGAACAGAGTGCTTAGTTGAACCAGGCCATGAAGCACGCACACACCGCCCGTCACCCTCCTCAAATAAATATAATGTCCCAAAACCTATTCACATGCATTAACAATATG-AGAGGAGACAAGTCGTAACAAGGTAAGCATACTGGAAAGTGTGCTTGGATAAATACTAAATCTAGCCCGAAGATT---AAACTCACCATAACCAAAGAAAAAT--AAAACAAAACATTTACCTCT-CAATCTAAAGTATAGGAGATAGAAATTT-TAAATACGGCGCTATAGAGAAAGTACCGTAAGGGAATGATGAAAGAAAGAAATTTAAAGTACAAAAAAGCAAAGATTACCCCTTGTACCTTTTGCATAATGAATTAACTAGCACAAAACTTAACAAAACGAATTTTAGCTAAGTAACCCGAAACCAGACGAGCTACTCACAAACAGTTTACCAAGAACTAACTCATCTATGTGGCAAAATAGTGAGAAGATTTATGAGTAGAGGTGACATGCCTAACGAGCCTGGTGATAGCTGGTTGTCCAGAAAATGAATCTCAGTTCAGCTTTAAA-AATACCAAAAA--TTTAAATAAATTCCACTGTATTTTTAAAAGTTAATCTAAAAAGGTACAGCCTTTTAGATAAAGGATACAACCTTAAATAGAGAGTAAGATCTAAAAACACCATAGTAGGCCTAAAAGCAGCCACCAATTAAGAAAGCGTTAAAGCTCAACAATAAAACTGATAAAAATTTCAAAAACAAGAAG--CCAACTCCTAGCCCTAATACTGGACTAATCTATTAAAAAA--TAGAAGCAATAATGTTAATATGAGTAACAAGAAA-TATTTTCTC-CCTGCATGAGCTTAAATCAGTAACTGATAATACCCTGATTATTAACAGTTAATAAAAATAACCCAATAATTAACAATTTATTAGCTATACTGTTAACCCAACACAGGAGTGCACTTAAGGAAAGATTAAAAGAAGTAAAAGGAACTCGGCAAACAC-AAACCCCGCCTGTTTACCAAAAACATCACCTCCAGCATCACCAGTATTGGAGGCACTGCCTGCCCAGTGAC-AATAGTTTAACGGCCGCGGTATCCTGACCGTGCAAAGGTAGCATAATCATTTGTTCTCTAAATAAGGACTTGTATGAATGGCCACACGAGGGTTTTACTGTCTCTTACTTCCAATCAGTGAAATTGACTTTCCCGTGAAGAGGCGGGAATAAACTAATAAGACGAGAAGACCCTATGGAGCTTCAACTAATCAGTCCAAAGAAAATAAACTAA-TATTGCTCAGGAAATAACAATATTTTCCTATGGCCTGACAGTTTCGGTTGGGGCGACCTCGGAGAATAAAAAATCCTCCGAACGATTATAAAGACTAGACCTACAAGTCAAATC-ACTCA-ATCGC-TTATTGATCCAAAAA-CTTGATCAACGGAACAAGTTACCCTAGGGATAACAGCGCAATCCTATTCAAGAGTCCATATCGACAATAGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGACATCCAGATGGTGCAACCGCTATCAAAGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAGTCCTACGTGATCTGAGTTCAGACCGGAGCAATCCAGGTCGGTTTCTATCTATTTAT-GTATTTCTCCCAGTACGAAAGGACAAGAGAAATTAGGCCAACTTAAAATAAGCGCCTCAAAGTAACTAATGATCCCGTCTCAATTA-GCAATACAAAAACT--CCAGCCCTAGAGACAGGGCTCAATGCCTGCACTGGGCTCCCAGAGGCGGCTGCTGGGTTCCCTTAACTGCACGCCCCCAGCCACTCTCCCCCTCACACTGGCCCCCAACCGGACGGGGCCCCAGTGCCTGGAGGTGTCCATCCCTGACGGGCTCTTTCTCAGCCTGGGGCTGGTGAGTCTCGTGGAGAACGTGCTGGTAGTGGCTGCCATCGCCAAGAACCGCAACCTGCACTCCCCCATGTACTACTTTATCTGCTGCCTGGCTGTGTCTGACCTGCTGGTGAGCGTCAGCAACGTGCTGGAGACGGCAGTCATGCTGCTGCTGGAGGCCAGTGTCCTGGCCACCCGGGCGGCCGTGGTGCAGCAGCTGGACAATGTCATCGACGTGCTCATCTGCGGCTCCATGGTGTCCAGCCTCTGCTTCCTGGGTGCCATCGCTGTGGACCGCTACATCTCCATCTTCTACGCCCTGCGGTACCACAGCGTTGTGACACTGACTCGGGCGTGGAGGATCATTGCGGCCATCTGG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; END; BEGIN SETS; CHARSET MC1R (CHARACTERS = Antilopini_All_Genes) = 4494-5429; CHARSET 16S (CHARACTERS = Antilopini_All_Genes) = 2891-4493; CHARSET PRKCI (CHARACTERS = Antilopini_All_Genes) = 7652-8167; CHARSET SPTBN1 (CHARACTERS = Antilopini_All_Genes) = 6197-7052; CHARSET allgenes (CHARACTERS = Antilopini_All_Genes) = 1-1140; CHARSET KCAS (CHARACTERS = Antilopini_All_Genes) = 5430-6196; CHARSET THYR (CHARACTERS = Antilopini_All_Genes) = 7053-7651; CHARSET 12S (CHARACTERS = Antilopini_All_Genes) = 1924-2890; CHARSET coxiii (CHARACTERS = Antilopini_All_Genes) = 1141-1923; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * UNTITLED (CHARACTERS = Antilopini_All_Genes) = N: 1924-4493 5430-5653 6311-7010 7122-7543 7706-8149, 1: 1-1923\3 4494-5429\3 5654-6310\3 7011-7121\3 7544-7705\3 8150-8165\3, 2: 2-1924\3 4495-5430\3 5655-6311\3 7012-7122\3 7545-7706\3 8151-8166\3, 3: 3-1925\3 4496-5431\3 5656-6312\3 7013-7123\3 7546-7707\3 8152-8167\3; END; BEGIN TREES; TITLE 'Antilopini reduced-taxon set'; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Aepyceros_melampus, 2 Antidorcas_marsupialis, 3 Antilope_cervicapra, 4 Capra_sp., 5 Cephalophini_sp., 6 Damaliscus_sp., 7 Dorcatragus_megalotis, 8 Eudorcas_rufifrons, 9 Eudorcas_thomsonii, 10 Gazella_bennettii, 11 Gazella_cuvieri, 12 Gazella_dorcas, 13 Gazella_gazella, 14 Gazella_leptoceros, 15 Gazella_subgutturosa_marica, 16 Gazella_spekei, 17 Gazella_subgutturosa, 18 Hippotragus_niger, 19 Kobus_ellipsiprymnus, 20 Litocranius_walleri, 21 Madoqua_guentheri, 22 Madoqua_kirki, 23 Madoqua_saltiana, 24 Nanger_dama, 25 Nanger_granti, 26 Nanger_soemmerringi, 27 Neotragus_batesi, 28 Neotragus_moschatus, 29 Oreotragus_oreotragus, 30 Ourebia_ourebi, 31 Pantholops_hodgsoni, 32 Procapra_gutturosa, 33 Procapra_picticaudata, 34 Procapra_przewalskii, 35 Raphicerus_campestris, 36 Raphicerus_melanotis, 37 Raphicerus_sharpei, 38 Redunca_fulvorufula, 39 Saiga_tatarica, 40 Tragelaphus_sp.; TREE PAUP = [&R] (40,((1,28),((19,38),(((29,5),((4,31),(6,18))),(30,((32,(35,(7,22))),((2,39),(20,((3,12),(9,24)))))))))); TREE PAUP = [&R] (40,((1,28),((19,38),(((29,5),((4,31),(6,18))),(30,(((32,35),(7,22)),((2,39),(20,((3,12),(9,24)))))))))); TREE RAxML = [&R] (40:0.10791815306965226,((1:0.10326864232045133,28:0.12492437818547741):0.009634367801720263,((19:0.06144263734566326,38:0.0773324387082619):0.0503240128694499,(((4:0.08093185284183307,31:0.06850800579538126):0.02093462312424418,(6:0.0843939065189243,18:0.08872568762726885):0.011143174271071204):0.026637405517118046,((29:0.11163820292433307,5:0.0753697571348515):0.014924382905954022,((32:0.06800283150165481,(35:0.11051414755311012,(7:0.07292287009398139,22:0.06257678482625013):0.023816105962777934):0.010484203476302936):0.0024284861495267765,(30:0.08816663815202652,(39:0.07081118319642958,((2:0.07782597940640046,20:0.057489470873393816):0.01391751754449684,((3:0.039552970052915984,12:0.04053525442940616):0.0043642230682550895,(9:0.03557077216374931,24:0.02455182071145595):0.01125379395897683):0.02877576229257861):0.0033354542008157415):0.02485273368447439):0.006128073328495872):0.039641273372268145):8.349078701252559E-4):0.0018718539081826408):0.009635390729030956):0.10791815306965226); 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Gazella_subgutturosa, 18 Hippotragus_niger, 19 Kobus_ellipsiprymnus, 20 Litocranius_walleri, 21 Madoqua_guentheri, 22 Madoqua_kirki, 23 Madoqua_saltiana, 24 Nanger_dama, 25 Nanger_granti, 26 Nanger_soemmerringi, 27 Neotragus_batesi, 28 Neotragus_moschatus, 29 Oreotragus_oreotragus, 30 Ourebia_ourebi, 31 Pantholops_hodgsoni, 32 Procapra_gutturosa, 33 Procapra_picticaudata, 34 Procapra_przewalskii, 35 Raphicerus_campestris, 36 Raphicerus_melanotis, 37 Raphicerus_sharpei, 38 Redunca_fulvorufula, 39 Saiga_tatarica, 40 Tragelaphus_sp.; TREE PAUP = [&U] ((33,(32,34)),(((35,(36,37)),(7,(23,(21,22)))),(30,((2,39),(20,(((8,9),(25,(24,26))),(3,(13,(16,(12,((10,17),(15,(11,14))))))))))))); TREE PAUP = [&U] ((33,(32,34)),(((36,(35,37)),(7,(23,(21,22)))),(30,((2,39),(20,(((8,9),(25,(24,26))),(3,(13,(16,(12,((10,17),(15,(11,14))))))))))))); TREE RAxML = [&U] ((33:0.007703168056496679,(32:0.0017916660325615278,34:0.0012528165606469038):0.005655949730143136):0.018577075214975924,(((35:0.023125229828077444,(36:0.031299861567767026,37:0.0136432993359934):0.006594679772598825):0.05041493588596882,(7:0.04844796399335063,(23:0.04069849118227787,(21:0.023682044591818066,22:0.013764689604103075):0.016670321278616312):0.014724837393700946):0.015291281051134241):0.00782572701613778,(30:0.06211978384068146,(39:0.04966118309852284,((2:0.05312218243260415,20:0.041262963326859546):0.009622895950068,(((8:0.0036371416146362763,9:0.002547869784464985):0.022883870668970276,(24:0.007697372041260242,(25:0.013330095179708177,26:0.0045847659611141225):0.00221913924331569):0.013060113775883743):0.006315487069540947,(3:0.02886858964711606,((12:0.009903307062468687,(13:0.011506948088325607,16:0.007403366082591019):0.0018599363211697006):0.0017467928631399482,((10:0.0072569504525560715,17:0.008058336693528787):0.002825613653697818,(15:0.004153215586711159,(11:6.468300433742765E-4,14:0.0017342360662921785):0.003670033667962693):0.006120955027993961):0.00353458090621939):0.017844835094146968):0.003038872720499767):0.019648632439766375):0.0022712582422056275):0.014247120585908926):0.0064872308688785595):0.018577075214975924); TREE MrBayes = [&U] ((33:0.008701,(32:0.001903,34:0.001473):0.006052)0.97:0.019177,(((35:0.023639,(36:0.032173,37:0.014632)1.00:0.007248)1.00:0.052048,(7:0.050104,(23:0.042009,(21:0.024721,22:0.014069)1.00:0.017628)1.00:0.015635)1.00:0.01597)1.00:0.008578,(30:0.063823,(39:0.051055,((2:0.054531,20:0.042286)1.00:0.01005,(((8:0.003879,9:0.002733)1.00:0.023166,(24:0.008054,(25:0.013706,26:0.004874)0.98:0.002451)1.00:0.013583)1.00:0.006645,(3:0.029664,((12:0.010236,(13:0.011749,16:0.007855)0.84:0.002129)0.86:0.002031,((10:0.007494,17:0.008392)1.00:0.00309,(15:0.004359,(11:8.44E-4,14:0.0019)1.00:0.003909)1.00:0.006343)1.00:0.00394)1.00:0.018268)0.96:0.003407)1.00:0.020026)0.88:0.003006)1.00:0.015294)1.00:0.007012)1.00:0.019177); END; BEGIN TREES; TITLE 'Antilopini full-taxon set'; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Aepyceros_melampus, 2 Antidorcas_marsupialis, 3 Antilope_cervicapra, 4 Capra_sp., 5 Cephalophini_sp., 6 Damaliscus_sp., 7 Dorcatragus_megalotis, 8 Eudorcas_rufifrons, 9 Eudorcas_thomsonii, 10 Gazella_bennettii, 11 Gazella_cuvieri, 12 Gazella_dorcas, 13 Gazella_gazella, 14 Gazella_leptoceros, 15 Gazella_subgutturosa_marica, 16 Gazella_spekei, 17 Gazella_subgutturosa, 18 Hippotragus_niger, 19 Kobus_ellipsiprymnus, 20 Litocranius_walleri, 21 Madoqua_guentheri, 22 Madoqua_kirki, 23 Madoqua_saltiana, 24 Nanger_dama, 25 Nanger_granti, 26 Nanger_soemmerringi, 27 Neotragus_batesi, 28 Neotragus_moschatus, 29 Oreotragus_oreotragus, 30 Ourebia_ourebi, 31 Pantholops_hodgsoni, 32 Procapra_gutturosa, 33 Procapra_picticaudata, 34 Procapra_przewalskii, 35 Raphicerus_campestris, 36 Raphicerus_melanotis, 37 Raphicerus_sharpei, 38 Redunca_fulvorufula, 39 Saiga_tatarica, 40 Tragelaphus_sp.; TREE RAxML = [&R] (40:0.07487484666406462,((1:0.076654892533812,(28:0.05269043822378794,27:0.06632168876209654):0.03583853683217668):0.005437317205660859,((29:0.07670255927975014,5:0.053895015826317456):0.010129519911242998,((19:0.04464199716788999,38:0.0551836433330103):0.035849408723316566,(((4:0.0575676520568033,31:0.049525486274079794):0.015005730509973093,(6:0.05925966380784791,18:0.06087333588462671):0.007306439364228729):0.017720784071568022,((30:0.06301219418601317,(39:0.05103729195022348,((2:0.05526503242797887,20:0.04280234707769772):0.00972502896185545,(((8:0.0036556407288149684,9:0.0026301556695741165):0.023576801769275436,(24:0.007941381522015576,(26:0.004602792874334212,25:0.013754179907665833):0.00227387520807037):0.013338290815410879):0.00639081352026355,((((10:0.00738196030106953,17:0.008219277109737988):0.002869262445494922,(15:0.004240078786754862,(11:6.726168807770753E-4,14:0.0017480194924684653):0.0037091337016220837):0.006212295161334685):0.0036630010379191374,(12:0.010236656521576327,(16:0.007546471548968518,13:0.011851413989709863):0.0018177318002202082):0.0017488954260338066):0.018575162240047884,3:0.02992390069966394):0.0031856148077793823):0.02167702570953125):0.0023434707106777543):0.0168676766762818):0.004385853681349909,(((35:0.023911640976069383,(37:0.014424268224123021,36:0.03240186555067511):0.006858882112885748):0.051883570843037616,(7:0.04993236332388119,((21:0.024225783673305225,22:0.014681682801621828):0.0175485381122281,23:0.041304144616959734):0.0151584812666852):0.016828572771975605):0.007054247376548641,(33:0.007013407130828765,(34:0.0012412187521058955,32:0.0018361217077468572):0.006683500190196767):0.040113886951362455):0.0015982469764924537):0.027442324512310632):9.429685534981436E-4):0.0018535256873132152):0.005391160967160363):0.07487484666406462); TREE PAUP_MP2 = [&R] (40,(1,((27,28),((((4,31),(6,18)),((19,38),(29,5))),((((((3,(((((10,17),((11,14),15)),12),16),13)),((8,9),((24,26),25))),(2,20)),39),((7,((21,22),23)),((35,37),36))),(30,((32,34),33))))))); TREE PAUP_MP3 = [&R] (40,(1,((27,28),((((4,31),(6,18)),((19,38),(29,5))),((((((3,(((((10,17),((11,14),15)),12),16),13)),((8,9),((24,26),25))),(2,20)),39),((7,((21,22),23)),(35,(36,37)))),(30,((32,34),33))))))); TREE MrBayes = [&R] (40:0.156061,(1:0.079628,(27:0.069086,28:0.054496)1.00:0.037712)0.80:0.006071,((29:0.080599,5:0.055962)1.00:0.010786,(19:0.045867,38:0.057802)1.00:0.037251,((4:0.059892,31:0.051049)1.00:0.016088,(6:0.062019,18:0.063286)1.00:0.007938)1.00:0.019025,((((((3:0.03117,(((10:0.007614,17:0.008661)1.00:0.003113,((11:8.69E-4,14:0.001924)1.00:0.003946,15:0.004488)1.00:0.006518)1.00:0.004594,(12:0.01065,(13:0.011906,16:0.008297)0.50:0.002051)0.54:0.002054)1.00:0.019113)0.99:0.003566,((8:0.00395,9:0.002824)1.00:0.024166,(24:0.008246,(25:0.01429,26:0.004951)0.99:0.002568)1.00:0.013973)1.00:0.006859)1.00:0.022398,(2:0.057367,20:0.044408)1.00:0.010176)0.90:0.003061,39:0.052897)1.00:0.018141,30:0.065357)1.00:0.004841,(((7:0.052102,((21:0.025585,22:0.0151)1.00:0.018802,23:0.043174)1.00:0.016304)1.00:0.018036,(35:0.024676,(36:0.033588,37:0.015598)1.00:0.007615)1.00:0.05385)1.00:0.007931,((32:0.001975,34:0.001487)1.00:0.007156,33:0.007949)1.00:0.041217)0.69:0.002548)1.00:0.029058)1.00:0.007014); TREE PAUP_MP1 = [&R] (40,(1,((27,28),((((29,5),(19,38)),((4,31),(6,18))),(((((3,(((((10,17),((11,14),15)),12),16),13)),((8,9),((24,26),25))),((2,20),39)),((7,((21,22),23)),((35,37),36))),(30,((32,34),33))))))); END;