#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on July 25, 2021; 21:08 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Cardoso D.B., Queiroz L.P., Pennington R., Cavalcante de lima H., Fonty E., Wojciechowski M., & Lavin M. 2012. Revisiting the phylogeny of papilionoid legumes: New insights from comprehensively sampled early-branching lineages. American Journal of Botany, 99(12): 1991–2013. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S12998] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=263; TAXLABELS Acosmium_cardenasii_JX124460 Acosmium_diffusissimum_JX124463 Acosmium_lentiscifolium_JX124466 Acrocarpus_fraxinifolius_AY899683 Adesmia_lanata_AF208901 Aeschynomene_indica_AF208927 Airyantha_schweinfurthii_AF310997 Aldina_insignis_JN168670 Aldina_latifolia_JX275891 Alexa_bauhiniiflora_JX295858 Alexa_canaracunensis_AF311376 Alexa_grandiflora_JX275892 Amburana_acreana_JX275890 Amburana_cearensis_AF309846 Amburana_cearensis_JX275950 Amicia_glandulosa_AF208902 Amorpha_fruticosa_AF208899 Amphimas_pterocarpoides_JX275961 Anarthrophyllum_cumingii_AY618488 Andira_anthelmia_JX275930 Andira_carvalhoi_JX275925 Andira_galeottiana_AF208893 Andira_humilis_JX275924 Andira_inermis_AF309853 Andira_legalis_JX275923 Andira_marauensis_JX275929 Andira_nitida_JX275922 Andira_ormosioides_JX275927 Andira_sp_JX275926 Andira_surinamensis_JX275928 Angylocalyx_sp_AF311366 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Bauhinia_galpinii_EU361875 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Goniorrhachis_marginata_EU361959 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Intsia_bijuga_EU361981 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Amburana_cearensis_JX275950 AATTGGATTGAGCCTTGGTATGGAAACCTACCAAGTGTGAA-CTTTCAAATTCAGAGAAATCCTGGAATTAATAATGGG-CAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTT-------CCGAAAAC-AAA---------GAAGA-----TTTCAGAAAGA----------------AA-----------------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAA-----CGGAATTGATG------ACATTTCCTTT--CGCGTT----------AGGAAAGG----A----------------------------------------------------------------------------------TCAAGG--------ATAAACA----------TATATG--------------------------CATATATGGACTTAAATACTAT-----TTCAA---------------TTGATTAA----TGAA------------GA-----CTCCAAA----TCTCTATTT-----TTGAATA-----TTTAT-------------------------CCACAAATGAAA-----------GATGTGAATC---AAATCAA---TTCCAG----GTTGAA--------GAAAGAATCGAATA---------TTCATTGATCAAATCATTCACTTC--ATCATA----------GTCTGATAGA---------TCTTTTGACGAA--CTGATTAATCAGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACAACAA--------------------TGAAATTTAGAGTAAGAGGAAAATCCGTCGATTTTCGAAATCGTGAGGG Amicia_glandulosa_AF208902 AATTGGATTGAGCCTTGGTATGGAAACTTACCAAGTGATAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATAAACAATGGG-CAATCCTGAGCCAAATCCCATTTT-------CCGAAAGC-AAA---------GAAAG-----GTAAAGAAACT-------------GAGAATAAAAAA----------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAA-----TGGAGTTAACG------ACATTTCCTTT--CTCGTT----------ACGAAAGG----AATCCTT------TCATCGAAA------------TTTCAG-------------------------------------AAAGG---------------ATATATG----------TATA---------------CAT-C------TATTTATTTGTACTAAAATAGTATA----TTCAA---------------TTGATTAA----TGAA------------GA-----CTGCAAA----TCTCTATTT-----GTGAATC-----CTTAT------------------------ACCACAAACGAAA-----------GA-----------AAAA------TTCCAA----GTTGAA--------GAAAGAATTGAACA---------TTCACTAATCAAATCATTCACTCC--ATCAAA----------ATCTGAGAGG---------TCTTTTGAATAA--CTGATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACAACAA--------------------TGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAGAAATCGTGA??? 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Andira_anthelmia_JX275930 ???????????GCCTTGGTATGGAAACCAACCAAGTGAGAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAACAATGGG-CAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTT-------CCGAAAAC-AAA---------GAAAA-----GTTCAGAAAGC-------------GAGAATAAAAAAA---------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAA-----TGGAGTTGACG------ACATTTCCTTT--CGCGTT----------AGGAAAGG----AACCCTT------CCATCGAAA------------TTCCAG--------------------------------AAAGGAAAGGATCAAGG--------ATAAACA----------TATATA------------------------TACGTATATGTACTGAAATACTAT-----TTCAA---------------TTGATTAA----TGAA------------GA-----CTCCAAA----TCTCTATTT-----GTGAATA-----TTTAT------------------------ATCACAAATGAAA-----------GATGTGAATC---AAATCAA---TTCCAA----GTTGAA--------GAAAGAATCGAATA---------TTCATTGATCAAATCATTCACTCC--ATCATA----------GTCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAA--CTGATTAATCAGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACAACAA--------------------TGAAATTTATAGTCAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAGAAATCGTGAGGG Andira_carvalhoi_JX275925 ????????????CCTTGGTATGGAAACCAACCAAGTGAGAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAACAATGGG-CAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTT-------CCGAAAAC-AAA---------GAAAA-----GTTCAGAAAGC-------------GAGAATAAAAAAA---------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAA-----TGGAGTTGACG------ACATTTCCTTT--CGCGTT----------AGGAAAGG----AACCCTT------CCATCGAAA------------TTCCAG--------------------------------AAAGGAAAGGATCAAGG--------ATAAACA----------TATATA------------------------TACGTATATGTACTGAAATACTAT-----TTCAA---------------TTGATTAA----TGAA------------GA-----CTCCAAA----TCTCTATTT-----GTGAATA-----TTTAT------------------------ATCACAAATGAAA-----------GATGTGAATC---AAATCAA---TTCCAA----GTTGAA--------GAAAGAATCGAATA---------TTCATTGATCAAATCATTCACTCC--ATCATA----------GTCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAA--CTGATTAATCAGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACAACAA--------------------TGAAATTTATAGTCAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAGAAATCGTGAGGG Andira_galeottiana_AF208893 AATTGGATTGAGCCTTGGTATGGAAACCTACCAAGTGAGAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAACAATGGG-CAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTT-------CCGAAAAC-AAA---------GAAAA-----GTTCAGAAAGC-------------GAGAATAAAAAAA---------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAA-----TGGAGTTGACG------ACATTTCCTTT--CGCGTT----------AGGAAAGG----AACCCTT------CCATCGAAA------------TTCCAG--------------------------------AAAGGAAAGGATCAAGG--------ATAAACA----------TATATA------------------------TACGTATATGTACTGAAATACTAT-----TTCAA----TTGATTAACAATTGATTAA----TGAA------------GA-----CTCCAAA----TATCTATTT-----GTGAATA-----TTTAT------------------------ATCACAAATGAAA-----------GATGTGAATC---AAATCAA---TTCCAA----GTTGAA--------GAAAGAATCGAATA---------TTCATTGATCAAATCATTCACTCC--ATCATA----------GTCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAA--CTGATTAATCAGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCCACATGTCAATACCGACAACAA--------------------TGAAATTTATAGTCAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAGAAATCGTGAGG? 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Andira_legalis_JX275923 AATTGGATTGAGCCTTGGTATGGAAACCAACCAAGTGAGAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAACAATGGG-CAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTT-------CCGAAAAC-AAA---------GAAAA-----GTTCAGAAAGC-------------GAGAATAAAAAAA---------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAA-----TGGAGTTGACG------ACATTTCCTTT--CGCGTT----------AGGAAAGG----AACCCTT------CCATCGAAA------------TTCCAG--------------------------------AAAGGAAAGGATCAAGG--------ATAAACA----------TATATA------------------------TACGTATATGTACTGAAATACTAT-----TTCAA---------------TTGATTAA----TGAA------------GA-----CTCCAAA----TCTCTATTT-----GTGAATA-----TTTAT------------------------ATCACAAATGAAA-----------GATGTGAATC---AAATCAA---TTCCAA----GTTGAA--------GAAAGAATCGAATA---------TTCATTGATCAAATCATTCACTCC--ATCATA----------GTCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAA--CTGATTAATCAGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACAACAA--------------------TGAAATTTATAGTCAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAGAAATCGTGAGGG Andira_marauensis_JX275929 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Baphiopsis_parviflora_AF309861 ?????????????C--GGTATGG-AACGGTC?AAGTGAG?A-CTTTCACATTCAGAGAAACCCTGGAATTCACAATGGG-CAATCCTGAGCCAAATCCCGTTTT-------CCGAAAAC-AAAAAA------GAAA------GTTCAGAAAGC-------------GAGAATAAAAAAA---------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTATTCGAACAAA-----TGGAGTTGACG------ACATTTCCTTT--CGCATT----------AGGAAATG----AATCCTT------CCATCCAAA------------TCTCCG--------------------------------AAAGGAAAGAATCAAGG--------AGAACCA----------TATATA------------------------TATGTATATGTAATGAAATACTCT-----TTCAA---------------TTTATTTA----TGAA------------AA-----CTCCAAA----TTTATATTT-----GTGAATA-----TTTCT------------------------ATCACAAATAAAA-----------GATCTGAATC---AAATCAA---TTCCAA----GTTGAA--------TAAAAGATGGAATA---------TTC{AC}TTGATCAAATCATTCACTCC--ATAATA----------ATCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAA--CTTATGAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTTTACATGTCAATACGGACCACAA--------------------TGAAAT{GT}A{AC}TAGTAAGA{CG}GAAA-T????????????????????????? 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Diplotropis_incexis_JX124440 ?????????????????????????????????????????-??????????????????CCCTGGAATTAACAATGGG-CAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTT-------CCGAAAAC-AAA---------GAAAA-----GTTCAGAAAGC-------------GAGAATAAAAAA----------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAA-----TGGAGTTGACG------ACATTTCCTTT--CGCATT----------AGGAAAGG----AATCCTT------CCATCGAAA------------TTCCGG--------------------------------AAAAGAAAGGATCAAGG--------ATAAACA----------TATATA------------------------TACGTATATGTACTGAAATATTAT-----TTCAA---------------TTGATTAA----TGAA------------GA-----CTGAAAA----TCTCTATTT-----GTGAATA-----TTTAT------------------------ATCACAAATAAAA-----------GATGTGAATC---AAATCAT---TTCCAA----GTTGAA--------GAAAGAATTGAATA---------TTCATTGATCAAATCATTCATTCT--ATCAGA----------GTCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAG--CTGATTAATCAGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACAACAA--------------------TGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAGAAATCGTGAGGG Diplotropis_martiusii_JX124438 AATTGGATTGAGCCTTGGTATGGAAACTTACCAAGTGATAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAACAATGGG-CAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTT-------CCGAAAAC-AAA---------GAAAA-----GTTCAGAAAGC-------------GAGAATAAAAAA----------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAA-----TGGAGTTGACG------ACATTTCCTTT--CGCATT----------AGGAAAGG----AATCCTT------CCATCGAAA------------TTCCGG--------------------------------AAAAGAAAGGATCAAGG--------ATAAACA----------TATATA------------------------TACGTATATGTACTGAAATATTAT-----TTCAA---------------TTGATTAA----TGAA------------GA-----CTGAAAA----TCTCTATTT-----GTGAATA-----TTTAT------------------------ATCACAAATAAAA-----------GATGTGAATC---AAATCAT---TTCCAA----GTTGAA--------GAAAGAATTGAATA---------TTCATTGATCAAATCATTCATTCT--ATCAGA----------GTCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAG--CTGATTAATCAGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACAACAA--------------------TGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAGAAATCGTGAGGG Dipteryx_alata_AF208896 AATTAGATTGAGCCTTGGTATGGAAACCTACCAAGTGAGAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAACAATGGG-AAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTT-------CCGAAAAC-AAA---------GAAGA-----GTTCATAAAGC-------------GAGAGTAAAGTAAAAAA-----------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGTTGTTCGAACAAA-----TGGAGTTGACA------ACATTTCTTTT--CGCGTT----------AGGAAAGG----AATCCTT------CCATCGAAA------------TTCCAG--------------------------------AAAGGAAAGGATCAATG--------ATAAATA----------TATATA--------------------TATATACGTATATGTACTGAAATACTAT-----TTCAA---------------TTGATTAA----TGAA------------GA-----CTCCAAAAA--TCTATATTTTTGAATTGAATA-----TTTAT------------------------ATCACAAATGAAA-----------GATGTGAATC---AA--------TTCCAA----GTTGAA--------GAAAGAATCGAATA---------TTCATTGATCAAATCATTCACTCC--ATCATA----------GCCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAA--CTGATTAATCAGATAAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTTAATACCGACAACAA--------------------TGAAATTTATAGTAAAAGGAAAATCCGTCGACTTTAGAAATCG?????? Dipteryx_magnifica_JX275901 AATTAGATTGAGCCTTGGTATGGAAACCTACCAAGTGAGAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAACAATGGG-AAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTT-------CCGAAAAC-AAA---------GAAGA-----GTTCATAAAGC-------------GAGAGTAAAGTAAAAAA-----------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGTTGTTCGAACAAA-----TGGAGTTGACA------ACATTTCTTTT--CGCGTT----------AGGAAAGG----AATCCTT------CCATCGAAA------------TTCCAG--------------------------------AAAGGAAAGGATCAATG--------ATAAATA----------TATATA----------------------TATACGTATATGTACTGAAATACTATTTTATTTC---------------------TTAA----TGAA------------GA-----CTCCAAAAA--TCTATATTTTTGAATTGAATA-----TTTCT------------------------ATCACAAATGAAA-----------GATGTGAATC---AA--------TTCCAA----GTTGAA--------GAAAGAATCGAATA---------TTCATTGATCAAATCATTCACTCC--ATCATA----------GCCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAA--CTGATTAATCAGATGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTTAATACCGACAACAA--------------------TGAAATTTATAGTAAAAGGAAAATCCGTCGACTTTAGAAATCGTGAGGG Dipteryx_odorata_EF466268 ????????????CCTTGGTATGG-AACCTACCAAGTGAGAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAACAATGGG-AAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTT-------CCGAAAAC-AAA---------GAAGA-----GTTCATAAAGC-------------GAGAGTAAAGTAAAAAA-----------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGTTGTTCGAACAAA-----TGGAGTTGACA------ACATTTCTTTT--CGCGTT----------AGGAAAGG----AATCCTT------CCATCGAAA------------TTCCAG--------------------------------AAAGGAAAGGATCAATG--------ATAAATA----------TATATA------------------TATATATACGTATATGTACTGAAATACTAT-----TTCAA---------------TTGATTAA----TGAA------------GA-----CTCCAAAAA--TCTATATTTTTGAATTGAATA-----TTTAT------------------------ATCACAAATGAAA-----------GATGTGAATC---AA--------TTCCAA----GTTGAA--------GAAAGAATCGAATA---------TTCATTGATCAAATCATTCACTCC--ATCATA----------GCCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAA--CTGATTAATCAGATGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTTAATACCGACAACAA--------------------TGAAATTTATAGTAAAAGGAAAATCCGTCGACTTTAGAAATCGTGAGGG Dipteryx_oleifera_AF309856 ?????????????????????????????????????????-????????????????????????????AACAATGGG-AAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTT-------CCGAAAAC-AAA---------GAAGA-----GTTCATAAAGC-------------GAGAGTAAAGTAAAAAA-----------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGTTGTTCGAACAAA-----TGGAGTTGACA------ACATTTCTTTT--CGCGTT----------AGGAAAGG----AATCCTT------CCATCGAAA------------TTCCAG--------------------------------AAAGGAAAGGATCAATG--------ATAAATA----------TATATA--------------------TATATACGTATATGTACTGAAATACTAT-----TTCAA---------------TTGATTAA----TGAA------------GA-----CTCCAAAAA--TCTATATTTTTGAATTGAATA-----TTTAT------------------------ATCACAAATGAAA-----------GATGTGAATC---AA--------TTCCAA----GTTGAA--------GAAAGAATCGAATA---------TTCATTGATCAAATCATTCACTCC--ATCATA----------GCCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAA--CTGATTAATCAGATGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTTAATACCGACAACAA--------------------TGAAATTTATAGTAAAAGG?????????????????????????????? Dipteryx_polyphylla_JX275900 AATTAGATTGAGCCTTGGTATGGAAACCTACCAAGTGAGAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAACAATGGG-AAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTT-------CCGAAAAC-AAA---------GAAGA-----GTTCATAAAGC-------------GAGAGTAAAGTAAAAAA-----------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGTTGTTCGAACAAA-----TGGAGTTGACA------ACATTTCTTTT--CGCGTT----------AGGAAAGG----AATCCTT------ACATCGAAA------------TTCCAG--------------------------------AAAGGAAAGGATCAATG--------ATAAATA----------TATATA---TATATAAAATATATATATATATACGTATATGTACTGAAATACTATTTTATTTCAA---------------TTGATTAA----TGAA------------GA-----CTCCAAAAA--TCTATATTTTTGAATTGAATA-----TTTAT------------------------ATCACAAATGAAA-----------GATGTGAATC---AA--------TTCCAA----GTTGAA--------GAAAGAATCGAATA---------TTCATTGATCAAATCATTCACTCC--ATCATA----------GCCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAA--CTGATTAATCAGATGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTTAATACCGACAACAA--------------------TGAAATTTATAGTAAAAGGAAAATCCGTCGACTTTAGAAATCGTGAGGG Dipteryx_punctata_JX275899 AATTAGATTGAGCCTTGGTATGGAAACCTACCAAGTGAGAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAACAATGGG-AAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTT-------CCGAAAAC-AAA---------GAAGA-----GTTCATAAAGC-------------GAGAGTAAAGTAAAAAA-----------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGTTGTTCGAACAAA-----TGGAGTTGACA------ACATTTCTTTT--CGCGTT----------AGGAAAGG----AATCCTT------CCATCGAAA------------TTCCAG--------------------------------AAAGGAAAGGATCAATG--------ATAAATA----------TATATA--------------------TATATACGTATATGTACTGAAATACTAT-----TTCAA---------------TTGATTAA----TGAA------------GA-----CTCCAAAAA--TCTATATTTTTGAATTGAATA-----TTTAT------------------------ATCACAAATGAAA-----------GATGTGAATC---AA--------TTCCAA----GTTGAA--------GAAAGAATCGAATA---------TTCATTGATCAAATCATTCACTCC--ATCATA----------GCCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAA--CTGATTAATCAGATAAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTTAATACCGACAACAA--------------------TGAAATTTATAGTAAAAGGAAAATCCG?????????????????????? Discolobium_psoraleifolium_AF208964 ????????????CCTTGGTATGGAAACTTACCAAGTGAGAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCCGGAATTAACAATGGG-CAATCCTGAGCCAAATCCCGTTTT-------CCGAAACC-AAA---------GAAAA-----GTTAAGAAAGC-------------GAGAATAAAAAA----------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACATA-----TGGGGTTGACG------ACATTTCCTTT--CTCGTT----------AGGAAAGG----AATCTTT------CCATCGAAA------------TTCTAG--------------------------------AAAGGAAA------------------TA--CG------TG-ATATATGTG--TATA----------------TACGTATTTGTACTGAAATACTAT-----TTCAA---------------TTGATTAA----TGAA------------AA-----CTCCAAA----TCTCTATTT-----GTGAATC-----TTTAT------------------------ATCACAAATGAAA-----------GATGTGAATC---AAATCAA---TTCCAA----GTTGAA--------GAAAGAATTGAATA---------TCCACTGATCAAATCATTCACTCC--ATCATT----------GTCGGATAGA---------TCTTTTGAAGAA--TTGATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACAACAA--------------------TGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTAAGAAATCGTGAGGG Dussia_lehmannii_AF309849 ???????????????????ATGGAAACCTACCAAGTGAGAA-CTTTCAAATTCAGAGAAATCCTGGAATTAACAATGGG-CAATCCTGAGCCAAATCCAGTTTT-------CCGAAAAC-AAA---------GAAGA-----GTTCAGAAAGC-------------TAGAATAAAAAAA---------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAA-----CGGAGTTGACG------ACATTTCCTTT--CGCGTT----------AGGAAAGG----AATCCTTC-----CCA-----------------------G-------------------------------------AAAGGATCAAGG--------ATAAACA----------TATATA----------------------TATACGTATATGTACTGAAATACTAT-----TTCAA---------------TTGATTAA----TGAA------------GA-----CTCAAAA----TCTCTATTT-----TTGAATA-----TTTAT------------------------ATCACAAATGAAA-----------GATGTGAATC---AAATCAA---TTCCAG----GTTGAA--------GAAAGAATCAAATA---------TTCATTGATCAAATCATTCACTCC--ATCATA----------GTCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAA--CTGATTAATCAGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACAACAA--------------------TGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAGAAATCGTGA??? Dussia_tessmannii_JX275896 AATTGGATTGAGCCTTGGTATGGAAACCTACCAAGTGAGAA-CTTTCAAATTCAGAGAAATCCTGGAATTAACAATGGG-CAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTT-------CCGAAAAC-AAA---------GAAGA-----GTTCAGAAAGC-------------TAGAATAAAAAAA---------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAA-----CGGAGTTGACG------ACATTTCCTTT--CGCGTT----------AGGAAAGG----AATCCTTC-----CCA-----------------------G-------------------------------------AAAGGATCAAGG--------ATAAACA----------TATATA------------------TATATATACGTATATGTACTGAAATACTAT-----TTCAA---------------TTGATTAA----TGAA------------GA-----CTCAAAA----TCTCTATTT-----TTGAATA-----TTTAT------------------------ATCACAAATGAAA-----------GATGTGAATC---AAATCAA---TTCCAG----GTTGAA--------GAAAGAATCGAATA---------TTCATTGATCAAATCATTCACTCC--ATCATA----------GTCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAA--CTGATTAATCAGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACAACAA--------------------TGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAGAAATCGTGAGGG Etaballia_guianensis_AF208960 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Grazielodendron_riodocense_AF208952 ??????????????TTGGTATGGAAACTTACCAAGTGATAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCCGGAATTAACAATGGG-CAATCCTGAGCCAAATCCCGTTTT-------ACGAAAGC-AAA---------GAAAA-----GTTAAGAAAGC-------------GAGAATAAAAAAA---------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAA-----TGGAGTTGACG------ACATTTCCTTT--CGCGTT----------AGGAAAGG----AATCCTT------CCATAGAAA------------TTCTAG-------------------------------------AAAGG---------------ATATACG----------TATATATGTATATA----------------TACGTATTTGTACTGAAATACTAT-----TTCAA---------------TTGATTAA----TGAA------------GA-----CTCCAAA----TCTCTATTT-----GTGAATC-----TTTAT------------------------ATCACAAATGAAA-----------GATGTGAATC---AA--------TTCCAA----GTTGAA--------GAAAGAATTGAATA---------TTCACTGATCAAATCATTCACTCC--ATCAAA----------GTCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAA--CTGATTAATCGAACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACAACAA--------------------TGAAATTTATAGTAAGAGGAAA-TCCGTC-AC????????????????? Guianodendron_praeclarum_JX124443 AATTGGATTGAGCCTTGGTATGGAAACTTACCAAGTGATAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAACAATGGG-CAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTT-------CCGAAAAC-AAA---------GAAAA--------------GC-------------GAGAATAAAAAAAA--------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAA-----TGGAGTTGACG------ACATTTCCTTT--CGCATT----------AGGAAAGG----AATCCTT------CCATCGAAA------------TTCCGG--------------------------------AAAAGAAAGGATCAAGG--------ATAAACA----------TATATA------------------------TACGTATATGTACTGAAATATTAT-----TTCAA---------------TTGATTAA----TGAA------------GA-----CTGAAAA----TCTCTATTT-----GTGAATA-----TTTAT------------------------ATCACAAATAAAA-----------GATGTGAATC---AAATCAT---TTCCAA----GTTGAA--------GAAAGAATTGAATA---------TTCATTGATCAAATCATTCATTCC--ATCAGA----------GTCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAG--CTGATTAATCAGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTAAATGTCAATACCGACAACAA--------------------TGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAGAAATCGTGAGGG Gymnocladus_chinensis_EU361814 AATTGGATTGAGCCTTGGTATGGAAACCTACCAAGTGAGAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAACAATGGG-CAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTT-------CCGAAAAC-CAA---------GAAGA-----GTTCAGAAAGC-------------GAGAATAAAACAA---------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAA-----TGGAGTTGACG------ACATTTCGTTT--CGTT------------AGTAAAGG----AATCCTT------CCATCGAAA------------CTCCAG--------------------------------AAAAGAAAGGATCAAGG--------ATGAACA----------TATATA----------------------TATACGTATACGTACTGAAATACTAT-----TTCAA---------------TTGATT---------A------------GA-----CCCCAAATATATATATATA------TTTCATA-----TTTAT------------------------ATGACAAATGAAA-----------GATGTGAATC---GA--------TTCCAA----GTTGAA--------GAAAGAATCGAATA---------TTCATTGATCAAATCATTGACTCC--ATCATA----------GTCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAA--CTGATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACAACAA--------------------TGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGA?????????????????? Harleyodendron_unifoliolatum_JX187643 AATTGGATTGAGCCTTGGTATGGAAACTTAGCAAGTGAGAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAACAATGGG-CAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTT-------CCGAAAAC-AAA---------GAAAA-----GTTCAGAAAGC-------------GAGAATAAAAAAA---------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAA-----TGGAGTTGACG------ACATTTCCTTT--CGCGTT----------AGGAAAGG----AATCCTT------CCATCGAAA------------TTCCAG--------------------------------AAAGGAAAGGATCAAGG--------ATAAACA----------TATATA-----------------ATATATATACGTATATGTACTGAAATACTAT-----TTCAA---------------TGGATTAA----TGAA------------GA-----CTCCAAA----TCTCTATTT-----GTGAATA-----TTTAT------------------------ATAACAAATGAAA-----------GATGTGAATC---AAATC--------CAA----GTTGAA--------GAAAGAATTGAATA---------TTCATTGATCAAATCATTCAGTCC--ATCATA----------GTCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAA--CTGATTAATCAGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACAACAA--------------------TGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAGAAATCGTGAGGG Holocalyx_balansae_AF310999 ????????TGAGCCTTGGTATGG?AACTTACCAAGTGAGAA-?TTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAACAATGGG-CAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTT-------CCGAAAAC-AAA---------GAAAA-----GTTCAGAAAGC-------------GAGAATAAAAAAA---------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACAAA-----TGGAGTTGACG------ACATTTCCTTT--CGCGTT----------AGTAAAGG----AATCCTT------CCATCGAAA------------TTCCAG--------------------------------AAAGGAAAGGATCAAGG--------ATAAACG----------TATATA-----------------ATATATATACGTATATGTACTGAAATACTAT-----TTCAA---------------TGAATTAA----TGAA------------GA-----CTACAAA----TCTCTATTT-----GTGAATA-----TTTAT------------------------ATCACAAATGAAA-----------GATGTGAATC---AAATCAA---TTCCAA----GTTGAA--------GAAAGAATTGAATA---------TTCATTGATCAAATCATTCACTCC--ATCATA----------GTCTGATAGA---------TCTTTTGAAGAA--CTGATTAATCAGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATT?TACATGTCAATACCGACAACAA--------------------TGAAATTTATAGTAAGAGGAAA?TCC?TCGACT?TAGAA?????????? 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Ormosia_amazonica_AF309484 ????????????????GGTATGGAAACTTACCAAGTGAAAA-CTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAACAATGGG-CAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTT-------CCGAAAAC-AAA---------GAAAA-----GTTCAGAAACC-------------GAGAATAAAAAA----------------GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAATAAA-----TGGAGTTGACG------AGATTTCCTTT--CGCGTT----------AGGAAAGG----AGTCCTT------CCATCGAAA------------TTCCCG--------------------------------AAAGGAAAGGATCAAGG--------ATAAACA----------TATATA------------------------TACGTATATGTACTGAAATATTAT-----TTCCA---------------TTGATTAT----TGAG------------GA-----CTGAAAA----TTTCTATTT-----GGGAATA-----TTTAT------------------------ATCACAAATGAAA-----------AATATGAATC---AAATCAA---TTCCAA----GTTGAA--------GAATGAATCGAATA---------TTCATTCATCAAATCATTCACTCC--ATCATA----------GTCGGATAGA---------TCTTTTGAAGAG--CTAATTAATCAGACGAGAATAAAGATAAAGTCCCATTCTGCATGTCAATACCGACAACAA--------------------TGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGT-G??????????????????? 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