#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on July 24, 2021; 3:29 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Mirabolfathy M., Ju Y., Hsieh H., & Rogers J. 2012. Obolarina persica sp. nov., associated with dying Quercus in Iran. Mycoscience, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S13302] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=23; TAXLABELS Annulohypoxylon_cohaerens Biscogniauxia_anceps Biscogniauxia_arima Biscogniauxia_atropunctata Biscogniauxia_capnodes Biscogniauxia_citriformis_129 Biscogniauxia_citriformis_88113012 Biscogniauxia_cylindrispora Biscogniauxia_formosana Biscogniauxia_granmo Biscogniauxia_latirima_89101101 Biscogniauxia_latirima_90080703 Biscogniauxia_mediterranea Biscogniauxia_nummularia Biscogniauxia_philippinensis_var._microspora Biscogniauxia_simplicior Biscogniauxia_uniapiculata Camillea_tinctor Hypoxylon_rubiginosum Obolarina_dryophila Obolarina_persica Theissenia_cinerea Theissenia_rogersii ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa2; DIMENSIONS NTAX=23; TAXLABELS Annulohypoxylon_cohaerens Biscogniauxia_anceps Biscogniauxia_arima Biscogniauxia_atropunctata Biscogniauxia_capnodes Biscogniauxia_citriformis_129 Biscogniauxia_citriformis_88113012 Biscogniauxia_cylindrispora Biscogniauxia_formosana Biscogniauxia_granmo Biscogniauxia_latirima_89101101 Biscogniauxia_latirima_90080703 Biscogniauxia_mediterranea Biscogniauxia_nummularia Biscogniauxia_philippinensis_var._microspora Biscogniauxia_simplicior Biscogniauxia_uniapiculata Camillea_tinctor Hypoxylon_rubiginosum Obolarina_dryophila Obolarina_persica Theissenia_cinerea Theissenia_rogersii ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa3; DIMENSIONS NTAX=23; TAXLABELS Annulohypoxylon_cohaerens Biscogniauxia_anceps Biscogniauxia_arima Biscogniauxia_atropunctata Biscogniauxia_capnodes Biscogniauxia_citriformis_129 Biscogniauxia_citriformis_88113012 Biscogniauxia_cylindrispora Biscogniauxia_formosana Biscogniauxia_granmo Biscogniauxia_latirima_89101101 Biscogniauxia_latirima_90080703 Biscogniauxia_mediterranea Biscogniauxia_nummularia Biscogniauxia_philippinensis_var._microspora Biscogniauxia_simplicior Biscogniauxia_uniapiculata Camillea_tinctor Hypoxylon_rubiginosum Obolarina_dryophila Obolarina_persica Theissenia_cinerea Theissenia_rogersii ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M14155] TITLE 'RPB2-TUB-ACT Matrix'; LINK TAXA = Taxa3; DIMENSIONS NCHAR=3374; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Biscogniauxia_formosana 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Biscogniauxia_mediterranea 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Biscogniauxia_nummularia 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Biscogniauxia_philippinensis_var._microspora 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Theissenia_rogersii 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((1,2),((((17,((5,(3,4)),((14,((9,(8,(6,7))),(13,(12,(10,11))))),(15,16)))),(18,19)),(20,21)),(22,23))); END; BEGIN TREES; TITLE BA_result; LINK TAXA = Taxa2; TRANSLATE 1 Annulohypoxylon_cohaerens, 2 Hypoxylon_rubiginosum, 3 Theissenia_rogersii, 4 Theissenia_cinerea, 5 Biscogniauxia_citriformis_129, 6 Biscogniauxia_citriformis_88113012, 7 Biscogniauxia_simplicior, 8 Biscogniauxia_arima, 9 Biscogniauxia_granmo, 10 Biscogniauxia_uniapiculata, 11 Camillea_tinctor, 12 Biscogniauxia_mediterranea, 13 Biscogniauxia_atropunctata, 14 Obolarina_dryophila, 15 Obolarina_persica, 16 Biscogniauxia_philippinensis_var._microspora, 17 Biscogniauxia_latirima_90080703, 18 Biscogniauxia_latirima_89101101, 19 Biscogniauxia_cylindrispora, 20 Biscogniauxia_formosana, 21 Biscogniauxia_capnodes, 22 Biscogniauxia_nummularia, 23 Biscogniauxia_anceps; TREE BA_tree = [&R] (1,2,((3,4),(((5,6),(7,8)),(9,(((10,(11,(12,(13,(14,15))),(16,(17,18)))),(19,20)),(21,(22,23))))))); END;