#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on July 26, 2021; 21:04 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Edwards E., Nyffeler R., & Donoghue M.J. 2005. Basal cactus phylogeny: Pereskia paraphyly and implications for early cactus evolution. American Journal of Botany, 92: 1177-1188. 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Austrocylindropuntia_subulata 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Blossfeldia_liluputana 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Brasilopuntia_brasiliensis 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Calymmanthium_substerile 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Ceraria_fruticulosa 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Echinocactus_platyacanthus 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Grahamia_bracteata 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Maihuenia_patagonica 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Maihuenia_poeppigii 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Pereskia_aureiflora 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Pereskia_bahiensis 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Pereskia_bleo 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Pereskia_grandifolia_var._grandifolia 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Pereskia_guamacho 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Pereskia_horrida_var._horrida 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Pereskia_marcanoi 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Pereskia_quisqueyana 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Pereskia_stenantha 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Pereskia_weberiana 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Pereskiopsis_porteri 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Portulaca_oleracea 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Portulacaria_afra 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; END; BEGIN SETS; CHARSET rbcL (CHARACTERS = 'EdwardsetalAJB92:1177-1188') = 593-2023; CHARSET chlormito (CHARACTERS = 'EdwardsetalAJB92:1177-1188') = 1-5017; CHARSET cox3 (CHARACTERS = 'EdwardsetalAJB92:1177-1188') = 1-592; CHARSET trnKmatK (CHARACTERS = 'EdwardsetalAJB92:1177-1188') = 2492-5017; CHARSET phyC (CHARACTERS = 'EdwardsetalAJB92:1177-1188') = 5018-6150; CHARSET psbA (CHARACTERS = 'EdwardsetalAJB92:1177-1188') = 2024-2491; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = 'EdwardsetalAJB92:1177-1188') = N: 1-6150; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = 'EdwardsetalAJB92:1177-1188') = N: 1-6150; END; BEGIN TREES; TITLE Tb7404; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Ceraria_fruticulosa, 2 Portulacaria_afra, 3 Portulaca_oleracea, 4 Talinum_paniculatum, 5 Anacampseros_telephiastrum, 6 Grahamia_coahuilensis, 7 Grahamia_bracteata, 8 Pereskia_bahiensis, 9 Pereskia_diaz_romeroana, 10 Calymmanthium_substerile, 11 Pereskia_grandifolia_var._grandifolia, 12 Pereskia_guamacho, 13 Pereskia_lychnidiflora, 14 Pereskia_sacharosa, 15 Echinocactus_platyacanthus, 16 Pereskia_horrida_var._horrida, 17 Pereskia_weberiana, 18 Pereskia_aculeata, 19 Pereskia_aureiflora, 20 Pereskia_zinniiflora, 21 Pereskia_quisqueyana, 22 Pereskia_portulacifolia, 23 Pereskia_bleo, 24 Pereskia_marcanoi, 25 Maihuenia_poeppigii, 26 Pereskia_stenantha, 27 Cereus, 28 Maihuenia_patagonica, 29 Brasilopuntia_brasiliensis, 30 Quiabentia_verticillata, 31 Quiabentia_zehntneri, 32 Pereskiopsis_A, 33 Pereskiopsis_porteri, 34 Austrocylindropuntia_subulata, 35 Blossfeldia_liluputana, 36 Opuntia_dilleni, 37 Tephrocactus_articulatus, 38 Pereskia_nemorosa; TREE Fig._1a = [&R] (4,(((6,5),7),(3,((13,((23,((24,(22,20)),21)),(12,19))),((((14,38),(26,11)),((16,17),18),((25,28),(((27,10),15),35))),((34,37),(36,29),((31,30),(33,32)))))))); END; BEGIN TREES; TITLE Tb7406; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Ceraria_fruticulosa, 2 Portulacaria_afra, 3 Portulaca_oleracea, 4 Talinum_paniculatum, 5 Anacampseros_telephiastrum, 6 Grahamia_coahuilensis, 7 Grahamia_bracteata, 8 Pereskia_bahiensis, 9 Pereskia_diaz_romeroana, 10 Calymmanthium_substerile, 11 Pereskia_grandifolia_var._grandifolia, 12 Pereskia_guamacho, 13 Pereskia_lychnidiflora, 14 Pereskia_sacharosa, 15 Echinocactus_platyacanthus, 16 Pereskia_horrida_var._horrida, 17 Pereskia_weberiana, 18 Pereskia_aculeata, 19 Pereskia_aureiflora, 20 Pereskia_zinniiflora, 21 Pereskia_quisqueyana, 22 Pereskia_portulacifolia, 23 Pereskia_bleo, 24 Pereskia_marcanoi, 25 Maihuenia_poeppigii, 26 Pereskia_stenantha, 27 Cereus, 28 Maihuenia_patagonica, 29 Brasilopuntia_brasiliensis, 30 Quiabentia_verticillata, 31 Quiabentia_zehntneri, 32 Pereskiopsis_A, 33 Pereskiopsis_porteri, 34 Austrocylindropuntia_subulata, 35 Blossfeldia_liluputana, 36 Opuntia_dilleni, 37 Tephrocactus_articulatus, 38 Pereskia_nemorosa; TREE Fig._3 = [&R] (2,1,(4,(3,(((6,5),7),((((23,((24,(22,20)),21)),(12,19)),13),((((14,38),((8,26),11)),((16,(17,9)),18)),(((36,29),(34,37),((31,30),(33,32))),((25,28),(((27,10),15),35))))))))); END; BEGIN TREES; TITLE Tb7408; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Ceraria_fruticulosa, 2 Portulacaria_afra, 3 Portulaca_oleracea, 4 Talinum_paniculatum, 5 Anacampseros_telephiastrum, 6 Grahamia_coahuilensis, 7 Grahamia_bracteata, 8 Pereskia_bahiensis, 9 Pereskia_diaz_romeroana, 10 Calymmanthium_substerile, 11 Pereskia_grandifolia_var._grandifolia, 12 Pereskia_guamacho, 13 Pereskia_lychnidiflora, 14 Pereskia_sacharosa, 15 Echinocactus_platyacanthus, 16 Pereskia_horrida_var._horrida, 17 Pereskia_weberiana, 18 Pereskia_aculeata, 19 Pereskia_aureiflora, 20 Pereskia_zinniiflora, 21 Pereskia_quisqueyana, 22 Pereskia_portulacifolia, 23 Pereskia_bleo, 24 Pereskia_marcanoi, 25 Maihuenia_poeppigii, 26 Pereskia_stenantha, 27 Cereus, 28 Maihuenia_patagonica, 29 Brasilopuntia_brasiliensis, 30 Quiabentia_verticillata, 31 Quiabentia_zehntneri, 32 Pereskiopsis_A, 33 Pereskiopsis_porteri, 34 Austrocylindropuntia_subulata, 35 Blossfeldia_liluputana, 36 Opuntia_dilleni, 37 Tephrocactus_articulatus, 38 Pereskia_nemorosa; TREE Fig._2b = [&R] (1,(2,(4,(3,(((6,5),7),(((((23,((24,(22,20)),21)),(12,19)),((((27,10),15),35),((14,38),((26,8),11)))),((16,(9,17)),18)),(13,((25,28),((34,37),((36,29),((31,30),(33,32)))))))))))); END; BEGIN TREES; TITLE Tb7405; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Ceraria_fruticulosa, 2 Portulacaria_afra, 3 Portulaca_oleracea, 4 Talinum_paniculatum, 5 Anacampseros_telephiastrum, 6 Grahamia_coahuilensis, 7 Grahamia_bracteata, 8 Pereskia_bahiensis, 9 Pereskia_diaz_romeroana, 10 Calymmanthium_substerile, 11 Pereskia_grandifolia_var._grandifolia, 12 Pereskia_guamacho, 13 Pereskia_lychnidiflora, 14 Pereskia_sacharosa, 15 Echinocactus_platyacanthus, 16 Pereskia_horrida_var._horrida, 17 Pereskia_weberiana, 18 Pereskia_aculeata, 19 Pereskia_aureiflora, 20 Pereskia_zinniiflora, 21 Pereskia_quisqueyana, 22 Pereskia_portulacifolia, 23 Pereskia_bleo, 24 Pereskia_marcanoi, 25 Maihuenia_poeppigii, 26 Pereskia_stenantha, 27 Cereus, 28 Maihuenia_patagonica, 29 Brasilopuntia_brasiliensis, 30 Quiabentia_verticillata, 31 Quiabentia_zehntneri, 32 Pereskiopsis_A, 33 Pereskiopsis_porteri, 34 Austrocylindropuntia_subulata, 35 Blossfeldia_liluputana, 36 Opuntia_dilleni, 37 Tephrocactus_articulatus, 38 Pereskia_nemorosa; TREE Fig._1b = [&R] (4,(3,(((6,5),7),(13,(23,((24,(22,20)),21)),(12,19),((14,38),(26,11)),((16,17),18),(25,28),(((27,10),15),35),((34,37),(36,29),((31,30),(33,32))))))); END; BEGIN TREES; TITLE Tb7407; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Ceraria_fruticulosa, 2 Portulacaria_afra, 3 Portulaca_oleracea, 4 Talinum_paniculatum, 5 Anacampseros_telephiastrum, 6 Grahamia_coahuilensis, 7 Grahamia_bracteata, 8 Pereskia_bahiensis, 9 Pereskia_diaz_romeroana, 10 Calymmanthium_substerile, 11 Pereskia_grandifolia_var._grandifolia, 12 Pereskia_guamacho, 13 Pereskia_lychnidiflora, 14 Pereskia_sacharosa, 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