#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on July 25, 2021; 19:32 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Wojciechowski M., Lavin M., & Sanderson M. 2004. A phylogeny of legumes (Leguminosae) based on analysis of the plastid matK gene resolves many well-supported subclades within the family. American Journal of Botany, 91: 1846-1862. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1509] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=330; TAXLABELS Abrus_precatorius Acacia_greggii Acacia_hindsii Acacia_melanoxylon Acacia_willardiana Acosmium_panamense Adenanthera_pavonina Adesmia_lanata Adesmia_volckmanii Aeschynomene_americana Aeschynomene_indica Aeschynomene_pfundii Aeschynomene_purpusii Aeschynomene_rudis Albizia_julibrissin Alhagi_maurorum Amblygonocarpus_andongens Amburana_cearensis Amherstia_nobilis Amicia_glandulosa Ammodendron_argenteum Amorpha_fruticosa Amphicarpaea_bracteata Anarthrophyllum_desideratum Andira_galeottiana Angylocalyx_sp. Anthyllis_vulneraria Aotus_ericoides Apios_americana Apoplanesia_paniculata Arachis_major Arachis_pintoi Arcoa_gonavensis Astragalus_americanus Astragalus_canadensis Astragalus_lonchocarpus Astragalus_nothoxys Ateleia_herbertsmithii Austrosteenisia_blackii Baphia_madagascariensis Baphia_massaiensis Baptisia_australis Bauhinia_tomentosa Berlinia_congolensis Bobgunnia_madagascariensis Bolusanthus_speciosus Bossiaea_cordigera Bowdichia_virgiloides_1 Bowdichia_virgiloides_2 Brachypterum_robusta Brachystegia_spiciformis Brongniartia_alamosana Brownea_sp. Brya_ebenus Caesalpinia_andamanica Calia_arizonica Calia_secundiflora Callerya_atropurpurea Callerya_reticulata Calliandra_californica Calliandra_surinamensis Calpocalyx_heitzii Calpurnia_aurea Campylotropis_macrocarpa Caragana_arborescens Carmichaelia_williamsii Cascaronia_astragalina Centrolobium Ceratonia_siliqua Cercidium_floridum Cercis_canadensis Cercis_gigantea Cercis_occidentalis Chaetocalyx_brasiliensis Chaetocalyx_nigricans Chaetocalyx_scandens Chamaecrista_fasciculata Chapmannia_floridana Chapmannia_gracilis Chapmannia_sericea Chloroleucon_manganse Cicer_arietinum Cicer_canariense Cicer_pinnatifidum Cladrastis_delavayi Cladrastis_lutea Cladrastis_platycarpa Clianthus_puniceus Cologania_hintoniorum Colophospermum_mopane Colutea_arborescens Conzattia_multiflora Coronilla_varia Coursetia_axillaris Coursetia_glandulosa Coursetia_insomnifolia Cranocarpus_martii Crotalaria_pumila Cyamopsis_senegalensis Cyathostegia_mathewsii Cyclolobium_brasiliense Cynometra_mannii Cytisus_scoparius Dalbergia_congestiflora Dalbergia_sissoo Dalbergiella_nyasae Dalea_pulchra Daviesia_latifolia Derris_laxiflora Desmanthus_cooleyi Desmodium_psilocarpum Dialium_guianensis Dichrostachys_richardiana Dinizia_excelsa Diphysa_americana Diphysa_floribunda Diphysa_thurberii Diplotropis_brasiliensis Diplotropis_martiusii Dipogon_lignosus Dipteryx_alata Discolobium_psoraleifolium Discolobium_pulchellum Dolichos_trinervatus Dussia_macroprophyllata Entada_abyssinica Enterolobium_contortisiliq Enterolobium_cyclocarpum Errazurizia_benthami Erythrina_cristi_galli Erythrostemon_gilliesii Eysenhardtia_orthocarpa Faidherbia_albidea Fiebrigiella_gracilis Fordia_leptobotrya Galactia_striata Galega_orientalis Gastrolobium_punctatum Genista_monspessulana Genistidium_dumosum Geoffroea_decorticans Geoffroea_spinosa Gleditsia_sinensis Gleditsia_triacanthos Gliricidia_brenningii Gliricidia_ehrenbergii Gliricidia_maculata Glycine_max Glycyrrhiza_lepidota Gompholobium_minus Grazielodendron_riodocense Gymnocladus_chinensis Haematoxylum_brasiletto Harpalyce_arborescens Havardia_mexicana Hebestigma_cubense Hedysarum_boreale Holocalyx_balansae Hovea_purpurea Hymenaea_courbaril Hymenolobium_mesoamericana Hypocalyptus_coluteoides Indigofera_sphaerocarpa Indigofera_suffruticosa Inga_punctata Inocarpus_fagifer Isotropis_foliosa Kotschya_ochreata Lablab_purpureus Lathyrus_aphaca Lathyrus_latifolius Lathyrus_sativus Lennea_modesta Lens_culinaris Leucaena_retusa Lonchocarpus_lanceolatus Lotus_japonicus Lotus_purshianus Luetzeburgia_auriculata Lupinus_argenteus Lupinus_consentii Lupinus_tegeticulatus Lysiloma_watsonii Maackia_amurensis Machaerium_sp Macrotyloma_uniflorum Maraniona_lavinii Marina_parryi Medicago_lanigera Medicago_monantha Medicago_sativa Medicago_truncatula Melilotus_alba Melilotus_indica Microlobium_foetidus Millettia_grandis Millettia_thonningii Mundulea_sericea Myrocarpus_frondosus Myrospermum_frutescens Myrospermum_sousanum Neodunnia_richardiana Neptunia_monosperma Nissolia_hirsuta Nissolia_shottii Oddoniodendron_micranthum Olneya_tesota Onobrychis_montana Ononis_arvensis Ononis_natrix Ormocarpopsis_calcicola Ormocarpopsis_itremoensis Ormocarpum_bernierianum Ormocarpum_kirkii Ormocarpum_yemenense Ormosia_colombiana Ormosia_formosana Ornithopus_compressus Otholobium_glandulosum Oxytropis_deflexa Oxytropis_lambertii Paraderris_elliptica Parkia_timoriana Parkinsonia_aculeata Parochetus_communis Parryella_filifolia Peltophorum_dubium Pentaclethra_macroloba Pentaclethra_macrophylla Petalostylis_labicheoides Peteria_thompsonae Phaseolus_coccineus Phaseolus_microcarpus Phaseolus_vulgaris Philenoptera_eriocalyx Philenoptera_laxiflora Pickeringia_montana Pictetia_aculeata Pictetia_angustifolia Pictetia_marginata Piptadeniastrum_africanum Piptanthus_nepalensis Piscidia_piscipula Pisum_sativum Platycyamus_regnellii Platymiscium_stipulare Platypodium_elegans Poecilanthe_parviflora Poeppigia_procera Poiretia_angustifolia Poissonia_heterantha Poissonia_hypoleuca Poissonia_weberbaueri Poitea_campanilla Poitea_glyciphylla Poitea_immarginata Polygala_californica Pongamiopsis_amygdalina Prioria_copaifera Prosopidastrum_mexicana Prosopis_glandulosa Prosopis_pallida Pseudoprosopis_gilletii Psoralea_cinerea Psoralidium_tenuiflorum Psorothamnus_arborescens Pterocarpus_indicus Pterocarpus_macrocarpus Pterodon_pubescens Pueraria_montana Quillaja_saponaria Ramorinoa_girolae Riedeliella_graciliflora Robinia_neomexicana Robinia_pseudoacacia Rupertia_physodes Samanea_saman Senna_candolleana Senna_covesii Sesbania_drummondii Sesbania_emerus Sesbania_grandiflora Sesbania_vesicaria Sophora_davidii Sophora_nuttalliana Spartium_junceum Sphenostylis_angustifolia Sphinctospermum_constrictum Strophostyles_umbellata Stylosanthes_capitata Stylosanthes_hamata Styphnolobium_japonicum Suriana_maritima Sutherlandia_frutescens Swainsona_pterostylis Swartzia_flaemingii Swartzia_jorori Swartzia_simplex Sweetia_fruticosa Tephrosia_heckmanniana Tessmannia_lescrauwaetii Tetrapleura_tetraptera Thermopsis_rhombifolia Tipuana_tipu Trifolium_beckwithii Trifolium_hirtum Trifolium_lupinaster Trifolium_nanum Trifolium_repens Trigonella_cretica Trigonella_foenum_graecum Trigonella_kotschyi Uribea_tamarindoides Vatairea_macrocarpa Vatairea_sp_nov Vauquelinia_californica Vicia_americana Vicia_faba Vicia_hirsuta Vicia_ludoviciana Vicia_sativa Vigna_subterranea Vigna_umbellata Vigna_unguiculata Wajira_albescens Wisteria_frutescens Wisteria_sinensis Xeroderris_stuhlmannii Xylia_africana Zornia_sp. ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M1110] TITLE plastid_matK; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=1711; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1720 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Abrus_precatorius 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Acacia_greggii 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Acacia_hindsii 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Acacia_melanoxylon 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Adesmia_lanata 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Aeschynomene_indica 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Aeschynomene_pfundii 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Aeschynomene_purpusii 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Aeschynomene_rudis 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Albizia_julibrissin 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Amherstia_nobilis 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Amicia_glandulosa 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Ammodendron_argenteum 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Amorpha_fruticosa 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Amphicarpaea_bracteata 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Anarthrophyllum_desideratum 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Andira_galeottiana 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Angylocalyx_sp. 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Anthyllis_vulneraria 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Aotus_ericoides 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Apoplanesia_paniculata 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Arachis_major 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Arachis_pintoi 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Arcoa_gonavensis 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Astragalus_americanus 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Astragalus_canadensis 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Astragalus_lonchocarpus 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Astragalus_nothoxys 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Ateleia_herbertsmithii 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Austrosteenisia_blackii 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Baphia_madagascariensis 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Baphia_massaiensis 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Baptisia_australis 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Bauhinia_tomentosa 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Berlinia_congolensis 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Bobgunnia_madagascariensis 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Bolusanthus_speciosus 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Bossiaea_cordigera 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Bowdichia_virgiloides_1 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Bowdichia_virgiloides_2 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Brachypterum_robusta 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Brachystegia_spiciformis 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Brya_ebenus 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Caesalpinia_andamanica 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Calia_secundiflora 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Calpurnia_aurea 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Campylotropis_macrocarpa 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Carmichaelia_williamsii 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Cascaronia_astragalina 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Centrolobium 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Ceratonia_siliqua 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Cercis_canadensis 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Cercis_gigantea 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Cercis_occidentalis 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Chaetocalyx_brasiliensis 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Chaetocalyx_nigricans 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Chaetocalyx_scandens 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Chamaecrista_fasciculata 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Chapmannia_floridana 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Chapmannia_gracilis 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Chapmannia_sericea 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Chloroleucon_manganse 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Cicer_arietinum 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Cicer_canariense 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Cicer_pinnatifidum 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Cladrastis_delavayi 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Cladrastis_lutea 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Cladrastis_platycarpa 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Clianthus_puniceus 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Cologania_hintoniorum 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Colophospermum_mopane 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Colutea_arborescens 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Conzattia_multiflora 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Coronilla_varia 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Coursetia_axillaris 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Coursetia_glandulosa 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Coursetia_insomnifolia 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Cranocarpus_martii 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Crotalaria_pumila 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Cyamopsis_senegalensis 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Cyathostegia_mathewsii 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Cyclolobium_brasiliense 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Cynometra_mannii 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Cytisus_scoparius 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Dalbergia_congestiflora 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Dalbergia_sissoo 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Dalbergiella_nyasae 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Dalea_pulchra 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Daviesia_latifolia 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Derris_laxiflora 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Desmanthus_cooleyi 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Desmodium_psilocarpum 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Dialium_guianensis 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Dichrostachys_richardiana 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Dinizia_excelsa 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Diphysa_americana 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Diphysa_floribunda 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Diphysa_thurberii 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Diplotropis_brasiliensis 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Diplotropis_martiusii 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Dipogon_lignosus 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Dipteryx_alata 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Discolobium_psoraleifolium 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Discolobium_pulchellum 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Dolichos_trinervatus 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Dussia_macroprophyllata 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Entada_abyssinica 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Enterolobium_cyclocarpum 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Errazurizia_benthami 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Erythrina_cristi_galli 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Erythrostemon_gilliesii 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Eysenhardtia_orthocarpa 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Faidherbia_albidea 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Fiebrigiella_gracilis 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Fordia_leptobotrya 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Galactia_striata 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Galega_orientalis 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Gastrolobium_punctatum 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Genista_monspessulana 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Genistidium_dumosum 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Geoffroea_decorticans 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Geoffroea_spinosa 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Gleditsia_sinensis 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Gleditsia_triacanthos 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Gliricidia_brenningii 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Gliricidia_ehrenbergii 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Gliricidia_maculata 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Glycine_max 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Gompholobium_minus 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Grazielodendron_riodocense 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Gymnocladus_chinensis 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Haematoxylum_brasiletto 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Harpalyce_arborescens 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Havardia_mexicana 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Hebestigma_cubense 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Hedysarum_boreale 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Holocalyx_balansae 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Hymenaea_courbaril 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Hymenolobium_mesoamericana 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Hypocalyptus_coluteoides 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Indigofera_sphaerocarpa 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Indigofera_suffruticosa 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Inga_punctata 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Inocarpus_fagifer 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Isotropis_foliosa 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Kotschya_ochreata 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Lablab_purpureus 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Lathyrus_aphaca 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Lathyrus_latifolius 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Lathyrus_sativus 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Lennea_modesta 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Lens_culinaris 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Leucaena_retusa 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Lonchocarpus_lanceolatus 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Lotus_japonicus 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Lotus_purshianus 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Luetzeburgia_auriculata 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Lupinus_argenteus 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Lupinus_consentii 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Lupinus_tegeticulatus 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Lysiloma_watsonii 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Maackia_amurensis 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Machaerium_sp 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Macrotyloma_uniflorum 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Maraniona_lavinii 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Marina_parryi 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Medicago_lanigera 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Medicago_monantha 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Medicago_sativa 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Medicago_truncatula 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Melilotus_alba 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Melilotus_indica 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Microlobium_foetidus 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Millettia_grandis 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Millettia_thonningii 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Mundulea_sericea 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Myrocarpus_frondosus 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Myrospermum_frutescens 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Myrospermum_sousanum 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Neodunnia_richardiana 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Neptunia_monosperma 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Nissolia_hirsuta 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Nissolia_shottii 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Oddoniodendron_micranthum 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Olneya_tesota 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Onobrychis_montana 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Ononis_arvensis 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Ononis_natrix 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Ormocarpopsis_calcicola 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Ormocarpopsis_itremoensis 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Ormocarpum_bernierianum 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Ormocarpum_kirkii 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Ormosia_colombiana 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Ormosia_formosana 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Ornithopus_compressus 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Otholobium_glandulosum 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Oxytropis_lambertii 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Paraderris_elliptica 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Parkia_timoriana 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Parryella_filifolia 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Peltophorum_dubium 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Pentaclethra_macroloba 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Pentaclethra_macrophylla 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Petalostylis_labicheoides 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Peteria_thompsonae 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Phaseolus_coccineus 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Phaseolus_microcarpus 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Phaseolus_vulgaris 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Philenoptera_eriocalyx 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Philenoptera_laxiflora 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Pictetia_aculeata 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Pictetia_angustifolia 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Pictetia_marginata 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Piptadeniastrum_africanum 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Piscidia_piscipula 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Pisum_sativum 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Platypodium_elegans 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Poecilanthe_parviflora 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Poeppigia_procera 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Poiretia_angustifolia 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Poissonia_heterantha 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Poissonia_hypoleuca 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Poissonia_weberbaueri 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Poitea_campanilla 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Poitea_glyciphylla 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Poitea_immarginata 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Polygala_californica 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Pongamiopsis_amygdalina 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Prioria_copaifera 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Prosopis_glandulosa 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Prosopis_pallida 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Pseudoprosopis_gilletii 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Psoralea_cinerea 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Psoralidium_tenuiflorum 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Psorothamnus_arborescens 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Pterocarpus_indicus 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Pterodon_pubescens 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Pueraria_montana 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Quillaja_saponaria 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Ramorinoa_girolae 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Riedeliella_graciliflora 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Robinia_neomexicana 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Robinia_pseudoacacia 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Rupertia_physodes 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Samanea_saman 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Senna_candolleana 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Senna_covesii 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Sesbania_drummondii 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Sesbania_emerus 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Sesbania_grandiflora 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Sesbania_vesicaria 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Sophora_davidii 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Sophora_nuttalliana 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Spartium_junceum 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Sphenostylis_angustifolia 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Sphinctospermum_constrictum 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Strophostyles_umbellata 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Stylosanthes_capitata 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Styphnolobium_japonicum 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Suriana_maritima 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Sutherlandia_frutescens 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Swainsona_pterostylis 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Swartzia_flaemingii 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Swartzia_jorori 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Swartzia_simplex 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Sweetia_fruticosa 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Tephrosia_heckmanniana 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Tessmannia_lescrauwaetii 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Tetrapleura_tetraptera 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Thermopsis_rhombifolia 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Trifolium_beckwithii 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Trifolium_hirtum 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Trifolium_lupinaster 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Trifolium_nanum 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Trifolium_repens 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Trigonella_cretica 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Trigonella_foenum_graecum 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Trigonella_kotschyi 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Vatairea_macrocarpa 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Vicia_americana 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Vicia_faba 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Vicia_hirsuta 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Vicia_ludoviciana 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Vicia_sativa 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Vigna_subterranea 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Vigna_umbellata 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Wisteria_frutescens 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Wisteria_sinensis ATGAAGGAATATCAAGTA---------TATTTAGAACGA---GATAGATCTCGCCAACAGGAC------TTCCTATACCCACTTATTTTTCGGGAGTATATTTATGGACTTGCTTATAGTCATGATTTT------AATAGATCCATTTTTGTGGAAAATGTAGGT------TATGACAAG------AAATCTAGTTTACTAATTGTAAAACGTTTAATTACTCGAATGTATCAACAGAATCATTTGATCATTTCCGCTAATGATTCTAACAAAAAT------CCATTTTTAGGGTATAATAATAATTTTTATTCTCAAATAATATCAGACGGTTTTGCCGTCGTTGTGGAAATTCCATTTTTCCTACAATTAAGCTCTTCC---------TTAGAGGAGGCAGAAATCGTAAAATCTTATCATAATTTGCGATCAATTCATTCCATTTTTCCCTTTTTGGAGGATAAATTGACATATTTTAATTATGTGTCAGATATACGAATACCCTATCCTATCCATCTGGAAATCTTAGTTCAAATCCTTCGCTACTGGGTGAAAGATGCCTCTTTTTTTCATTTATTACGGTTTTTTCTTTAT------AATTTTTGTAATAGGAAT------------AGTCTTATTACTCCA------------AAAAAATCGATTTCTACCTTTTCA------AAAAGTAATCCAAGATTATTCTTGTTCCTCTATAATTTTTATGTATGTGAATATGAATCTATCTTCCGTTTTCTACGTAACCAATCCTCTCATTTACGATTAAAATCTTTTAGCGTTTTTTTTGAGCGAATCTTTTTTTATGCAAAAAGAGAACAT------CTTGTAAAAGTTTTTCCT------AAGGATTTTTCGTCT------ACCTTAACATTCTTCAAGGATCCTTTCATTCATTATGTTAGATATCAAGGAAAATCCATTCTGGCTTCAAAGAATGCGCCTCTTTTGATGAATAAATGGAAACACTATTTTATCCATTTATGGCAATGTTTTTTTGATGTTTGGTCTCAACCAGGAACGATCCATATAAACCAATTA---TCCGAACATTCA---------TTTCACTTTTTA------GGCTATTTTTCAAATGTGCGGCTAAATCGTTCAGTGGTACGGAGTCAAATGCTGCAAAATACATTTCTAATCGAAATTGTTATCAAAAAGCTTGATATAATAGTTCCAATTATTCCTCTAATTAGATCATTGGCTAAAGCGAAATTTTGTAATGTATTAGGGCATCCCATTAGTAAGTCGGTCTGGGCCGATTCATCCGATTTTGATATTATTGACCGATTTTTGCGAATATGCAGAAATCTTTCTCATTATTACAATGGATCCTCAAAAAAAAAAAATTTGTATCGAATAAAATATATACTTCGGCTTTCTTGTATTAAAACTTTGGCTTGTAAACACAAAAGTACTGTACGCGCTTTTTTGAAAAAATCTGGTTCAGAAGAATTATTGGAAGAATTCTTT---ACAGAGGAAGAAGAGATTCTTTCTTTGATTTTTCCA------AGAGCTTCTTCTACTTTGCAG------AGATTACATAGAAATCGGATTTGGTATTTGGATATTCTTTTC---AGCAAC------GATCTGGTCAAT---CATGAATGA---AAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAA Xeroderris_stuhlmannii ATGGAGGAGTATCAAGTC---------TATTTAGAACTA---GATAGATCTCGCCATCAGGAC------TTCCTATATCCACTTATTTTTCGGGAGTATATTTATGGACTCGCTTATGGTCATGATTTA------AATAGATCCATTTTTGTAGAAAATATAGGT------TATGACAAT------AAATCTAGTTTACAAATTGTAAAGCGTTTAATTACTCGAATGTATCAACAGACTCATTTGATCATTTCTGCTAATGATTCTAACAAAAAT------CTATTTTGGGGGTATAACAATAATTTTTATTCTCAGATAATAGCAGAGGGTTTTGTTGTCATCGTGGAAATTCCATTTTCTCTACAATTAAGCTTTTCC---------TTAGAGAAGTCAGAAATCATAAAATCTTATAATAATTTGCGATCAATTCATTCAATTTTTCCCTTTTTCGAGGATAAATTTACATATTTAAATTATGAGTCAGATATACTAATACCCTATCCTATCCATCTGGAAATCTTGGTTCAAATCCTTCGATACTGGATGAAAGATGTCCCTTTCTTTCATTTATTAAGGTTGTTTCTTTAT------TACTATTGTAATTGGAAT------------AGTCTTATTACTCCA------------AAAAAATCGATTTCTACTTTTTCA------AATAGTAATCTAAGATTTTTCTTGTTCGTATATAATTTTTATGTATGGGAATACGAATCTATCTTTCTTTTTCTACGTAACAAATCCTCTCATTTACGATTAAAACCTTTTCGCGTTTTTTTTGAACGAATTTTTTTCTATGCAAAAATAGAACAT------CTTGTAGAAGTCTTTGCT------AAGGATTTTTCGTAT------ACCTTATCATTCTTCAAGGATCCTTTCATTCATTATGTTAGATATCAAGGAAAATCCATTTTGGTTTCAAAGAATACGCCTCTTTTGATGAATAAATGGAAATACTATTTTATCCATTTATGGCAATGTCATTTTGATGTTTGGTCTCAACCAGGAATGATCCATATAAACCAATTA---TCCGAGCATTCA---------TTTCACTTTTTG------GGCTATTTTTCAAATTTGCGGATAAATCTTTCAATAGTACGGAGTCAAATGTTGCAAAATTCATTTCTAATCGAAATTGTTATGAAAAAGCTTGATACAATAGTTCCAATTATTCTTCTAATTAGATCATTGGTTAAAGCGAAATTTTGTAATGTATTGGGGCATCCCATTAGTAAGCCGGTTTGGGCCGATTCATCCGATTTTGATATTATTGACCGATTTTTGCGGATATGCAGAAATTTTTCTCATTATTACAATGGATCCGCAAAAAAAAAGAGTTTGTATCGAATAAAATATATACTTCGGCTTTCTTGTATTAAAACTTTGGCTCGTAAACACAAAAGTACTGTACGCGCTTTTTTGAAAAGATTAGGTTCAGAAAAATTATTGGAAGAATTCTTT---ACAGAAGAAGAAGAGATTTTTTCTTTGATCTTTCCA------AAAACTTCTTCTACTTTACAG------AGGTTATATAGAGGCCGGATTTGGTATTTGGATATTCTTTTC---AGCAAG------GATCTGGTCAAT---CATTCATAA---AAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAA Xylia_africana 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Zornia_sp. ATGGAGGAATATCAAATC---------TATTTAGAACTA---GATGGATCTTTCCAACGGAAC------TTCCTATACCCACTTATTTTTCGGGAGTATATTTATGGACTCGTCTATGGTCATGATTTAAAGAAAAATAGATCTATTTTGGTGGAAAATGTGGAT------TATGATAAG------AAATATAGTTTCCTAATTGTAAAACGTTTAATTACTCGAATGTATCAACAGAATCATTTGCTTCTTTTTGCTAATGATTCGAAAAAAAAT------CTATTTTTAGGGTATAACAAGAATTTGTATTCTCAAATAATATCAGAAGGTTTTGCCATCGTTGTGGAAATTCCATTTTCCCAACAATTGAAATTGAGTTCTTCC---TTAGAGGAGGTCGAAATCCTAAAATCTTTTCAAAATTTGCGATCAATTCATTCCATTTTTTCCTTTTTCGAGGATAAATTTACATATTTAAATTTTGTTTCAAATGTACGAATACCCTATCCTATCCATTTCGAAATCTTGGTTCAAACC????????????????????????CCCTTCTTTCATTCTTTAAGATTGTTTGTTTAT------GAGTATGACTATTCGAAT------TGGAATAGTCTTATTACTCAA------------AAAAAACTTTTTTCTACTTTATCA------AGAAGTAATCCAAGATTTTTCTTATTCCTATATAATTTTTTTGTATGTGAACACGAATCCATCTTCCTTTTTCTACGTAATAAATCCTCTCATTTACGATTCAATTCTTTTAGCCTTCTTTTTGAGCGAATCCAATTATATGCAAAAATTGAACAT------CTTGTCGAAGTCTTTGCT------AAGGATTTTTCATCT------ACCTTATCATTCTTCAAGGATCCTTTGATTCATTATGTTAGATATCAAGGAAAATCCATTCTGGCTTCAAAGAATGTGCCTCTTTTGCTGAATAAATGGCAATACTATCTCATCTATTTCTGGCAATGTCATTTTAATGTTTGGTCTCAAGCAGGAACGATCCATATAAAACAATTATTATCCGAGCATTCA---------TTTCACTTTTTTTGGGGGGGCTATCTTTCAAATGTACGGCTCAATTTTTCACTGGTACGGAGTCAAATGTTAGAAAATTCATTTCCAATCG???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TTGGCTCGTAAACACAAGAGTACTGTACGCGCTTTTTTGAAAAGATTAGATTCACAAGAATTATTGGAAGAATTCTTT---ACAGAAGACGAAGAGATTCTTTCTTTGATCTTTCCA------AGAGCTTCTTCCACTTTGCAG------AGGTTATATAGGGGTCGTATTTGGTATTTGGATATTATTTTC---AGTAAC------GATCTAGTCAAT---CACCAATGA---AAAACAAAAGCAAGAAAAAAACAGACAAAAAAAAAAA ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = plastid_matK) = N: 1-1711; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = plastid_matK) = N: 1-1711; END; BEGIN TREES; TITLE Tb7705; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Zornia_sp., 2 Xylia_africana, 3 Xeroderris_stuhlmannii, 4 Wisteria_sinensis, 5 Wisteria_frutescens, 6 Wajira_albescens, 7 Vigna_unguiculata, 8 Vigna_umbellata, 9 Vigna_subterranea, 10 Vicia_sativa, 11 Vicia_ludoviciana, 12 Vicia_hirsuta, 13 Vicia_faba, 14 Vicia_americana, 15 Vauquelinia_californica, 16 Vatairea_sp_nov, 17 Vatairea_macrocarpa, 18 Uribea_tamarindoides, 19 Trigonella_kotschyi, 20 Trigonella_foenum_graecum, 21 Trigonella_cretica, 22 Trifolium_repens, 23 Trifolium_nanum, 24 Trifolium_lupinaster, 25 Trifolium_hirtum, 26 Trifolium_beckwithii, 27 Tipuana_tipu, 28 Thermopsis_rhombifolia, 29 Tetrapleura_tetraptera, 30 Tessmannia_lescrauwaetii, 31 Tephrosia_heckmanniana, 32 Sweetia_fruticosa, 33 Swartzia_simplex, 34 Swartzia_jorori, 35 Swartzia_flaemingii, 36 Swainsona_pterostylis, 37 Sutherlandia_frutescens, 38 Suriana_maritima, 39 Styphnolobium_japonicum, 40 Stylosanthes_hamata, 41 Stylosanthes_capitata, 42 Strophostyles_umbellata, 43 Sphinctospermum_constrictum, 44 Sphenostylis_angustifolia, 45 Spartium_junceum, 46 Sophora_nuttalliana, 47 Sophora_davidii, 48 Sesbania_vesicaria, 49 Sesbania_grandiflora, 50 Sesbania_emerus, 51 Sesbania_drummondii, 52 Senna_covesii, 53 Senna_candolleana, 54 Samanea_saman, 55 Rupertia_physodes, 56 Robinia_pseudoacacia, 57 Robinia_neomexicana, 58 Riedeliella_graciliflora, 59 Ramorinoa_girolae, 60 Quillaja_saponaria, 61 Pueraria_montana, 62 Pterodon_pubescens, 63 Pterocarpus_macrocarpus, 64 Pterocarpus_indicus, 65 Psorothamnus_arborescens, 66 Psoralidium_tenuiflorum, 67 Psoralea_cinerea, 68 Pseudoprosopis_gilletii, 69 Prosopis_pallida, 70 Prosopis_glandulosa, 71 Prosopidastrum_mexicana, 72 Prioria_copaifera, 73 Pongamiopsis_amygdalina, 74 Polygala_californica, 75 Poitea_immarginata, 76 Poitea_glyciphylla, 77 Poitea_campanilla, 78 Poissonia_weberbaueri, 79 Poissonia_hypoleuca, 80 Poissonia_heterantha, 81 Poiretia_angustifolia, 82 Poeppigia_procera, 83 Poecilanthe_parviflora, 84 Platypodium_elegans, 85 Platymiscium_stipulare, 86 Platycyamus_regnellii, 87 Pisum_sativum, 88 Piscidia_piscipula, 89 Piptanthus_nepalensis, 90 Piptadeniastrum_africanum, 91 Pictetia_marginata, 92 Pictetia_angustifolia, 93 Pictetia_aculeata, 94 Pickeringia_montana, 95 Philenoptera_laxiflora, 96 Philenoptera_eriocalyx, 97 Phaseolus_vulgaris, 98 Phaseolus_microcarpus, 99 Phaseolus_coccineus, 100 Peteria_thompsonae, 101 Petalostylis_labicheoides, 102 Pentaclethra_macrophylla, 103 Pentaclethra_macroloba, 104 Peltophorum_dubium, 105 Parryella_filifolia, 106 Parochetus_communis, 107 Parkinsonia_aculeata, 108 Parkia_timoriana, 109 Paraderris_elliptica, 110 Oxytropis_lambertii, 111 Oxytropis_deflexa, 112 Otholobium_glandulosum, 113 Ornithopus_compressus, 114 Ormosia_formosana, 115 Ormosia_colombiana, 116 Ormocarpum_yemenense, 117 Ormocarpum_kirkii, 118 Ormocarpum_bernierianum, 119 Ormocarpopsis_itremoensis, 120 Ormocarpopsis_calcicola, 121 Ononis_natrix, 122 Ononis_arvensis, 123 Onobrychis_montana, 124 Olneya_tesota, 125 Oddoniodendron_micranthum, 126 Nissolia_shottii, 127 Nissolia_hirsuta, 128 Neptunia_monosperma, 129 Neodunnia_richardiana, 130 Myrospermum_sousanum, 131 Myrospermum_frutescens, 132 Myrocarpus_frondosus, 133 Mundulea_sericea, 134 Millettia_thonningii, 135 Millettia_grandis, 136 Microlobium_foetidus, 137 Melilotus_indica, 138 Melilotus_alba, 139 Medicago_truncatula, 140 Medicago_sativa, 141 Medicago_monantha, 142 Medicago_lanigera, 143 Marina_parryi, 144 Maraniona_lavinii, 145 Macrotyloma_uniflorum, 146 Machaerium_sp, 147 Maackia_amurensis, 148 Lysiloma_watsonii, 149 Lupinus_tegeticulatus, 150 Lupinus_consentii, 151 Lupinus_argenteus, 152 Luetzeburgia_auriculata, 153 Lotus_purshianus, 154 Lotus_japonicus, 155 Lonchocarpus_lanceolatus, 156 Leucaena_retusa, 157 Lens_culinaris, 158 Lennea_modesta, 159 Lathyrus_sativus, 160 Lathyrus_latifolius, 161 Lathyrus_aphaca, 162 Lablab_purpureus, 163 Kotschya_ochreata, 164 Isotropis_foliosa, 165 Inocarpus_fagifer, 166 Inga_punctata, 167 Indigofera_suffruticosa, 168 Indigofera_sphaerocarpa, 169 Hypocalyptus_coluteoides, 170 Hymenolobium_mesoamericana, 171 Hymenaea_courbaril, 172 Hovea_purpurea, 173 Holocalyx_balansae, 174 Hedysarum_boreale, 175 Hebestigma_cubense, 176 Havardia_mexicana, 177 Harpalyce_arborescens, 178 Haematoxylum_brasiletto, 179 Gymnocladus_chinensis, 180 Grazielodendron_riodocense, 181 Gompholobium_minus, 182 Glycyrrhiza_lepidota, 183 Glycine_max, 184 Gliricidia_maculata, 185 Gliricidia_ehrenbergii, 186 Gliricidia_brenningii, 187 Gleditsia_triacanthos, 188 Gleditsia_sinensis, 189 Geoffroea_spinosa, 190 Geoffroea_decorticans, 191 Genistidium_dumosum, 192 Genista_monspessulana, 193 Gastrolobium_punctatum, 194 Galega_orientalis, 195 Galactia_striata, 196 Fordia_leptobotrya, 197 Fiebrigiella_gracilis, 198 Faidherbia_albidea, 199 Eysenhardtia_orthocarpa, 200 Erythrostemon_gilliesii, 201 Erythrina_cristi_galli, 202 Errazurizia_benthami, 203 Enterolobium_cyclocarpum, 204 Enterolobium_contortisiliq, 205 Entada_abyssinica, 206 Dussia_macroprophyllata, 207 Dolichos_trinervatus, 208 Discolobium_pulchellum, 209 Discolobium_psoraleifolium, 210 Dipteryx_alata, 211 Dipogon_lignosus, 212 Diplotropis_martiusii, 213 Diplotropis_brasiliensis, 214 Diphysa_thurberii, 215 Diphysa_floribunda, 216 Diphysa_americana, 217 Dinizia_excelsa, 218 Dichrostachys_richardiana, 219 Dialium_guianensis, 220 Desmodium_psilocarpum, 221 Desmanthus_cooleyi, 222 Derris_laxiflora, 223 Daviesia_latifolia, 224 Dalea_pulchra, 225 Dalbergiella_nyasae, 226 Dalbergia_sissoo, 227 Dalbergia_congestiflora, 228 Cytisus_scoparius, 229 Cynometra_mannii, 230 Cyclolobium_brasiliense, 231 Cyathostegia_mathewsii, 232 Cyamopsis_senegalensis, 233 Crotalaria_pumila, 234 Cranocarpus_martii, 235 Coursetia_insomnifolia, 236 Coursetia_glandulosa, 237 Coursetia_axillaris, 238 Coronilla_varia, 239 Conzattia_multiflora, 240 Colutea_arborescens, 241 Colophospermum_mopane, 242 Cologania_hintoniorum, 243 Clianthus_puniceus, 244 Cladrastis_platycarpa, 245 Cladrastis_lutea, 246 Cladrastis_delavayi, 247 Cicer_pinnatifidum, 248 Cicer_canariense, 249 Cicer_arietinum, 250 Chloroleucon_manganse, 251 Chapmannia_sericea, 252 Chapmannia_gracilis, 253 Chapmannia_floridana, 254 Chamaecrista_fasciculata, 255 Chaetocalyx_scandens, 256 Chaetocalyx_nigricans, 257 Chaetocalyx_brasiliensis, 258 Cercis_occidentalis, 259 Cercis_gigantea, 260 Cercis_canadensis, 261 Cercidium_floridum, 262 Ceratonia_siliqua, 263 Centrolobium, 264 Cascaronia_astragalina, 265 Carmichaelia_williamsii, 266 Caragana_arborescens, 267 Campylotropis_macrocarpa, 268 Calpurnia_aurea, 269 Calpocalyx_heitzii, 270 Calliandra_surinamensis, 271 Calliandra_californica, 272 Callerya_reticulata, 273 Callerya_atropurpurea, 274 Calia_secundiflora, 275 Calia_arizonica, 276 Caesalpinia_andamanica, 277 Brya_ebenus, 278 Brownea_sp., 279 Brongniartia_alamosana, 280 Brachystegia_spiciformis, 281 Brachypterum_robusta, 282 Bowdichia_virgiloides_2, 283 Bowdichia_virgiloides_1, 284 Bossiaea_cordigera, 285 Bolusanthus_speciosus, 286 Bobgunnia_madagascariensis, 287 Berlinia_congolensis, 288 Bauhinia_tomentosa, 289 Baptisia_australis, 290 Baphia_massaiensis, 291 Baphia_madagascariensis, 292 Austrosteenisia_blackii, 293 Ateleia_herbertsmithii, 294 Astragalus_nothoxys, 295 Astragalus_lonchocarpus, 296 Astragalus_canadensis, 297 Astragalus_americanus, 298 Arcoa_gonavensis, 299 Arachis_pintoi, 300 Arachis_major, 301 Apoplanesia_paniculata, 302 Apios_americana, 303 Aotus_ericoides, 304 Anthyllis_vulneraria, 305 Angylocalyx_sp., 306 Andira_galeottiana, 307 Anarthrophyllum_desideratum, 308 Amphicarpaea_bracteata, 309 Amorpha_fruticosa, 310 Ammodendron_argenteum, 311 Amicia_glandulosa, 312 Amherstia_nobilis, 313 Amburana_cearensis, 314 Amblygonocarpus_andongens, 315 Alhagi_maurorum, 316 Albizia_julibrissin, 317 Aeschynomene_rudis, 318 Aeschynomene_purpusii, 319 Aeschynomene_pfundii, 320 Aeschynomene_indica, 321 Aeschynomene_americana, 322 Adesmia_volckmanii, 323 Adesmia_lanata, 324 Adenanthera_pavonina, 325 Acosmium_panamense, 326 Acacia_willardiana, 327 Acacia_melanoxylon, 328 Acacia_hindsii, 329 Acacia_greggii, 330 Abrus_precatorius; TREE Fig._6 = [&R] (15,((74,(((288,(259,258,260)),((241,72),((171,30),((278,((125,287),280),229),312)))),((((((200,(276,178)),(254,(53,52))),(((104,((261,107),239)),217),(((((((((((203,204),250,(166,316),54,327),(148,176)),198),(271,270)),326),329),328,(108,136)),(221,(71,218)),(156,128),(70,69)),(((324,29),314),((2,269),68),(90,205))),(103,102)))),((262,(179,(188,187))),298)),(((((((((((303,193),284,(164,181)),223),169),((((((((((201,(((((((9,(7,8)),(((99,97),98),42)),(162,211)),((145,207),44)),6),242),(((183,(67,(112,(66,55)))),308),61))),(220,267)),302),86),((195,(((88,(((73,134,129),((109,222),281)),155)),(31,133)),((135,(96,95)),196))),330)),292),225),3),(232,(167,168))),(((((153,((154,113),304)),238),((48,51),(50,49))),((((((236,(237,235)),(191,100)),((78,80),79),124,43),(57,56)),((186,184,((76,77),75)),185)),(158,175))),(((((((37,((243,265),36)),240),(((295,294),(296,297)),(111,110))),(266,((123,174),315))),(((((((((160,159),161),87),(11,12,((14,(13,10)),157))),((((26,23),22),25),24)),((((19,20),(21,(138,137))),((142,(139,140)),141)),(121,122))),(247,(248,249))),194),106)),((5,4),272)),(182,273))))),(290,291)),((((322,323),(((311,1),81),((256,(257,255)),(126,127)))),(((((319,163),(320,317)),321),((318,146),(227,226)),(((216,214),215),((120,119),(118,117)),116,(93,(91,92)))),((((((((299,300),(40,41)),((252,251),253)),197),(264,(189,190))),(((277,234),180),((263,((((165,27),144),(64,63)),59)),84))),85),((209,208),58)))),(((301,(202,199)),(309,105)),((143,224),65))),(170,306)),((115,114),(((((283,282),325),(212,213)),((((279,172),230),177),83)),((((310,(47,46)),((289,28),89),147),285),(((307,((228,(192,45)),((151,149),150))),233),268))))),((173,18),((152,(16,17)),32)),(274,275)),((((245,246),39),94),244)),(((313,206,(((132,130),131),(210,62))),305),((293,231),((33,(35,34)),286))))),((101,219),82)))),60),38); END;