#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on July 12, 2025; 9:12 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Arbizu berrocal C.I., Ruess H., Senalik D., Simon P.W., & Spooner D.M. 2014. A phylogenomic study of Daucus. American Journal of Botany, 101(10): 1666-1685. 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Daucus_capillifolius_A30198 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Daucus_capillifolius_A30202 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Daucus_capillifolius_A30207 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Daucus_carota_subsp._carota_652393 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Daucus_carota_subsp._gummifer_478883 TAGTTCTTCACACAGCTTC-CTTCAGCAAGCTC-------TATATATATAACATATTATGATGAAAAGTTAGA-------------------ACTACTGAGATTGTTAC-----ACC--AAACTCAT--ACTCAAGGATACACATAATATAATTTATTTAATTTTCAAATAAAATAACCAAGGTTAAAATTGCCTTTTATCCTTTGAACAACATAATCTGCTCGGACACTGCTGTGCGGTAGCAGACCTTTAACCCACTCTCCTCTCACCAAGGCATGAAGCCGTTGGTGCTCAGTGATGGCGTCAATACACTCCTGTAATATTGGTATTGAAGAATTCTGCTGTGGTGACTGTTGGAAATTGCCTATTGGCAGCTTAGCTGCAAATG-AAGAAA---ATTTTAATAAC----------ATATAACAAGGCTCA-AGCTCAACTTGAACCATTTAATCTTTGAAGTCCT----------------------------------------------------------GACTTTT-TACTTAT-AAT--GAAACT--------------------------------------------------------------------TTAAGATGGATGCTTGGAGTAAGT---GG-------GTGGGAACTAAATA-CTAATGCATGGACAAC----------------------------------AAATG-ACGTAGATCAGA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AGTATGAAGGTTA---ACCT-GATCAAATGT------------------------------------------------AAGATCCTACTAATT----CTTTCAGTATGC----ATGG-TGCAAG-AAGATATGAGAATACTTACGCATCGAAGCATCAAGAGCTTGAACAAGAGCAGCACGAAGTTGACATTGCACCACCGACATGCCTCACTCTCCTAAAGTAGATAAATTCAAT--AGAACTTTCTAA-----------------------------------------------AGTGCAGGAACATAGATCCACC-A--AAAATTGACTACATAGA-------GAAAGAAGT---ATACCATGCAGGCTCAGACTGCTCTAGATCACATAAAAGTCGAACCTCGGAAGGTGAAGTACCT-ACATGTCATCCATACAGCGAACGAAAAGCTAATTAATAAGCTTCTACTA--------TTAACATATAATATCACACAG--------AAACAAAAAGAGAAAG-TAAAAA-GTGTGACTAACTTCGTGAACTGTATGAAATTTATTCCC--------------------------------------------------------TAAGAC-------------------------------------------ACCATACAAAAATATCAAGACAAGATGGAAACAAGAA-TTACGACAGAAG-AGTCATGAAAGAGAGAAA-ATGAT---------TATAAG--AAA-GGGT-ACCGTAAATCCACTATTCTTCGGATAA-GAG---AAAAAAGAATAGAAATCTGCCCTAAATCCTG--ATGG--TGATTAC--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ATATT-TATATGGC-------TGGTCCTCATAACATAAAATTAC-----------AAACGGAGTAGCA--------TCAGAACATACCAAGGTTGGGGCCACTTTTGAGGCACAATTCATGGATCTTCAAACTCTTTCTGTGAACACCACAAAGACCTTGAATTCATGAGGGAAATCGCGGAGAATCGGAAAAGTAATCCACCGGTTATTCGGATCACGGCGATTGTCCCGGAGAATTATGCTATGGAGTCGAGACTTATGACGGAGAATTTGTGTCAATTTGCTCGGGAGCTGAATATTGGATTCGAAATTGATTTCATTTCGGTGCGGACGTTCGAATTTTTGTCGTTCAAGTCCGTCAAATTCGCGGAAGGTGAGAAGATTGCTGTGCTGTTATCTCCGACGATCTTCCGTCGAATCGGCGCCGGTTTCGTGACGGATCTGCGGCGAATTTCGCCGCACGTGGTGGTGCACGTCGATTTC---GAAGGCTCGATAGCGTCTTCGTTTCGACAGGCCGTGATTGAAGGCCTGGAATTCTACTCCACCGTGTTTGAGTCACTGGAAGCCGCGAATGTCGGCGTCTGCGGCGGCGACTGGATCAGAAAGATAGAGATGTTCGTGATGCTTCCGAAGATAATCTCAGCTGTGGAGGCGGCAGGCCGCCGTGAGACGCCATGGAGGGAGGCGTTCGCCGGCGCCGGATTTAGGGCAGTAGGGTTGAGTCAGTTTGCTGATTTTCAAGCGGAGTGTTTACTCAGGAGGGTCCCTGGTCTCCTGTTGCAGAGTTGATAATGCTGTTTAAAGCAGTGGCAGCAAAGCAACCCAGACCCCCGGCTAGTGCAGCATAAGCTGAACCGATACTTCTCATCGCATCGGGGGCCTCCTGGTAGAGAAATTCCAGTAGTCCCACAATACAAAATACTTCAGCTAGTCCAATGAGGCAGTACTGAATCAACAGCCAGTATGCACTCAAGTCAGGCATAGGGCTAAGAAAACTAGCCTCAAATCCGTGTTCTATTGCATAATTCCTTCTGAATCTCTCAAACACTGCAGCCCACGCCACAGACAATATTGAAAGTCCCAAACCAATTCCTACCCTCTGTAGCTGGGAAGCACCATGAGGATTTCCCGTTATGCGCTTGGACAGAGGCACAAATACGGTGTAATAAAGAGATAGCAATAGAAATATGCTTAGGCCAGGGAATACTGGCATGCATGTGACAGGGAGTTTCAAATGCCCCATATAGGTATTTAATGTATAAGCTTGTTGCACTGATAGAGTCAAAAACTCAGTCAAGATTAGGCTCAGCATGATAGTGCAGGCCGGAATGGGAAGAAGCTTTATTAGAATCTTCACTTCCTCAACCTGTGATCTCTCTTCTCGCTCTCCGTCGAAACGCGAAATTCAGGTCT-------CTCATA------------TACTCAATTTTAGTCTCTGTGATTGAA-TTTTGTATTCTTTTTGC-TTGTGTAGTGATCTC------------TCTATGTCTACGTGTACTTGTTTGCTTTTCC-GGTTATTCGGACTTTTGCTTGTGA-TTGTGATTTGTGTAACGTG-TTCGAATTTTGAGGTTCAGTTCGGATCCTCTTCAGAG-AAATGAAAAGGA------GAAGTTTAT-------GATAC----------TGAAAGTTATAATAGCAAATTGTGAAGTTTCGAAATTAGAGCTTGAATTATGTATTGGATCATAGTGTCAGTGTTTCACGA----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ACTACA-TTTA--------CGGAATTTT------TCCTAAATTTAATTACT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGTTTGAATTTGTAGTTTGTTT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Daucus_carota_subsp._sativus_279777 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Daucus_guttatus2_652331 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Daucus_involucratus_652350 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Daucus_littoralis_295857 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Daucus_littoralis_341902 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Daucus_muricatus_A29090 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Daucus_sahariensis_A29098 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Daucus_syrticus_A29107 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Daucus_syrticus_A29108 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Daucus_syrticus_A29110 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Torilis_leptophylla_A25750 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Turgenia_latifolia_649433 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Daucus_carota_subsp._carota_478881, 86 Daucus_carota_subsp._carota_478884, 87 Daucus_carota_subsp._carota_652341, 88 Daucus_carota_subsp._carota_652393, 89 Daucus_carota_subsp._carota_A27397, 90 Daucus_carota_subsp._carota_A30251, 91 Daucus_carota_subsp._carota_A30262, 92 Daucus_syrticus_A29107, 93 Daucus_syrticus_A29108, 94 Daucus_syrticus_A29109, 95 Daucus_syrticus_A29110, 96 Turgenia_latifolia_649433, 97 Torilis_leptophylla_A25750, 98 Ammi_visnaga_A30185, 99 Torilis_leptophylla_A31619, 100 Torilis_nodosa_A31622, 101 Torilis_arvensis_A31623, 102 Pseudorlaya_pumila_A29088, 103 Daucus_tenuisectus_A31616, 104 Daucus_tenuisectus_A31617, 105 Torilis_nodosa_A31606, 106 Torilis_nodosa_A31607, 107 Daucus_carota_subsp._carota_A31570; TREE Tree6 = [&R] 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