#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on July 26, 2021; 20:02 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Giussani L., Cota-sanchez J., Zuloaga F., & Kellogg E. 2001. A molecular phylogeny of the grass subfamily Panicoideae (Poaceae) shows multiple origins of C4 photosynthesis. American Journal of Botany, 88(11): 1993–2012. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S832] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=107; TAXLABELS Acroceras_zizanioides Altoparadisium_chapadense Andropogon_hallii Anthaentiopsis_rojasiana Apluda_mutica Arthropogon_lanceolatus Arthropogon_villosus Arundinella_hirta Axonopus_anceps Axonopus_fissifolius Borthriochloa_odorata Capillipedium_parviflorum Cenchrus_ciliaris Chaetium_bromoides Chasmanthium_latifolium Chasmanthium_laxum Chionachne_koenigii Chrysopogon_fulvus Cleistachne_sorghoides Coelorachis_selloana Coix_aquatica Cymbopogon_flexuosus Danthoniopsis_petiolata Dathoniopsis_dinteri Dichantelium_koolauense Dichanthium_aristatum Digitaria_ciliaris Digitaria_radicosa Digitaria_setigera Echinochloa_colona Echinochloa_frumentacea Echinolaena_inflexa Elionurus_muticus Eriochloa_punctata Heteropogon_contortus Homolepis_glutinosa Homolepis_isocalycina Hymenachne_donacifolia Hyparrhenia_hirta Ichnanthus_pallens Ischaemum_afrum Lasciasis_sorghoides Leptocoryphium_lanatum Melinis_repens Mesosetum_chaseae Microstegium_nudum Miscanthus_japonicus Ophiochloa_hydrolithica Oplismenus_hirtellus Otachyrium_versicolor Panicum_aquaticum Panicum_bulbosum Panicum_elephantipes Panicum_euprepes Panicum_fauriei Panicum_laxumL Panicum_millegrana Panicum_nephelophilum Panicum_obtusum Panicum_ovuliferum Panicum_pedersenii Panicum_prionitis Panicum_repens Panicum_rudgei Panicum_sabulorum Panicum_stolonifera Panicum_virgatum Paspalidium_geminatum Paspalum_arundinellum Paspalum_conjugatum Paspalum_conspersum Paspalum_haumanii Paspalum_malacophyllum Paspalum_paniculatum Paspalum_remotum Paspalum_vaginatum Paspalum_wettsteinii Pennisetum_alopecuroides Pennisetum_setaceum Phacelurus_digitatus Plagiantha_tenella Pseudechinolaena_polystachya Sacciolepis_indica Schizachyrium_scoparium Setaria_lachnea Setaria_macrostachya Setaria_palmifolia Setaria_parviflora Setaria_sphacelata Setaria_verticillata Setaria_viridis Sorgum_bicolor Stenchisma_hians Stenotaphrum_secundatum Streptostachys_asperifolia Streptostachys_ramosa Tatianix_arnacites Thrasya_glaziovii Thrasya_petrosa Thysanolaena_maxima Tripsacum_dactyloides Urochloa_acuminata Urochloa_maxima Urochloa_mutica Urochloa_plantaginea Zea_mays Zeugites_pittieri ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M268] TITLE Figure_1; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=2084; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Acroceras_zizanioides 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Arthropogon_villosus 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Arundinella_hirta 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Borthriochloa_odorata 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Capillipedium_parviflorum 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Cenchrus_ciliaris 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Chaetium_bromoides 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Chasmanthium_latifolium 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Chasmanthium_laxum 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Chionachne_koenigii 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Coix_aquatica 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Danthoniopsis_petiolata 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Dathoniopsis_dinteri 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Dichantelium_koolauense 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Dichanthium_aristatum 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Digitaria_ciliaris 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Echinochloa_frumentacea 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Echinolaena_inflexa 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Elionurus_muticus 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Eriochloa_punctata 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Hymenachne_donacifolia 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Hyparrhenia_hirta 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Miscanthus_japonicus --ATGTCAATGGGATTTGGACTTTTTCTTATTCCCACAGCAACAAAAAATCTTCGTCGCATATGGGCTTTTCCTAGTATTTTACTCTTAAGTATAGCTATGGTATTCTCACTTCACCTGTCTATTCAACAAATAAATGGAAGTTCTATCTATCAATATCTATGGTCTTGGACCATCAATAATGATTTTTCCTTAGAATTTGGATACTTGGTCGACCCCCTTACGTCTATTATGTTAATACTAATTACTACTGTAGGAATCTTAGTTCTTATTTATAGTGACGATTATATGTCTCACGATGAAGGATATTTGAGATTTTTTGTTTATATAAGTTTTTTTAATACTTCCATGTTGGGATTGGTTACTAGTTCCAATTTGATACAAATTTATTTTTTTTGGGAACTTGTCGGAATGTGTTCCTATTTATTGATAGGCTTTTGGTTTACGCGGCCAATTGCAGCGAGTGCTTGTCAAAAAGCTTTTGTAACTAATCGTGTAGGGGATTTTGGTCTGTTATTAGGAATTTTAGGTTTTTTTTGGATAACGGGTAGTTTGGAGTTTCGGGATTTGTTCAAAATAGCTAATAACTGGATTCCTAATAATGGGATTAATTCCTTACTTACTACTTTGTGTGCTTTTTTATTATTTCTTGGTGCAGTTGCAAAATCTGCACAATTTCCTCTTCACGTATGGTTACCTGATGCTATGGAAGGACCCACTCCCATTTCGGCTCTTATACACGCAGCAACTATGGTTGCTGCGGGGATTTTTCTTCTAGCTAGACTTCTTCCTCTTTTCATATCCCTACCCTTGATAATGAGTTTCATTTCTTTAGTAGGTACAATAACACTCTTCTTAGGAGCCACTTTAGCTCTTGCTC------AGAGAGATATTAAAAGAAGCTTAGCCTATTCTACAATGTCTCAATTGGGT-ATATGATGTTAGCTCTAGGTATAGGTTCTTATCAAGCTGCTTTATTCCATTTGATCACTCATGCTTATTCGAAAGCTTTATTGTTCTTAGGATCCGGATCCGTTATTCATTCAATGGAACCTCTTGTTGGATATTCACCAGATAAAAGTCAGAATATGGTTCTTATGGGTGGTTTAAGAAAATACGTTCCAATTACAAGAACTACTTTTTTATGTGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCACCTCTTGCTTGCTTCTGGTCCAAAGATGAAATACTTAGTAATAGTTGGTTGTATTCACCCTTTTTTGGAATAATAGCCTCTTTTACTGCAGGATTAACTGCATTTTATATGTTTCGGATATATTTACTTACTTTTGATGGGTATTTGCGTGTTCATTTTCAAAATTACAGTAGTACTAAAGAAGGTTCGTTGTATTCAATATCCTTATGGGGAAAAAGTATATCCAAAGGAGTCAATAGGGATTTTCTTTTATCAACAAT---GAAGAGTGGAGTTTCTTTTTTTTCACAAAATATACC------CAAAATTCCTGCTA------ATACAAGAAATAAGATAGGATCCTTTAGTACTCCC------TTTGGGGCTAAAAAAACTTTTGTCTATCCTCATGAAACGGGAAATACTATGCTATTTCCTCTTCTTATATTACTACTTTTTACTTTGTTCATTGGATCCATAGGAATCCCTTTTGATAATGGAGTAAAAGATAATAGAATATTGGAGTTAACCATATTATCAAAGTGGCTAACTCCTTCAATAAACTTGTTCCAGGAAAATTCAAATTCTTCCATAAATTCATATGAATTTCTCACTAATGCAATTTT-TCTGTAAGTTTAGCAATTTTTGGTCTATTCATAGCATATATCTTTTATGGATCTGCTTATTCTTTTTTTCAGAATTTGAATTTTCAAAATTCCCTTGT------AAAAAAGAATCCAAAAAAGAGCTTTTTGGA------TGAAGTAAAAAAAAAGATATACAGCTGGTCATATAATCGTGGTTATATAGATTTTTTCTATACTAGGGTTTTTATCCTAGGTATAAGAAGATTAGCTGAACTAACGCATTTTTTTGATAAAGGTGTCATTGATGGAATTATCAATGGAGTA Ophiochloa_hydrolithica 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Otachyrium_versicolor 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Panicum_aquaticum 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Panicum_bulbosum 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Panicum_fauriei 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Panicum_millegrana 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Panicum_nephelophilum 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Panicum_pedersenii 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Panicum_prionitis 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Paspalum_conspersum 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Paspalum_malacophyllum 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Pennisetum_alopecuroides 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Pennisetum_setaceum 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Phacelurus_digitatus 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Plagiantha_tenella 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Pseudechinolaena_polystachya 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Sacciolepis_indica 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Schizachyrium_scoparium 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Setaria_lachnea 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Setaria_macrostachya 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Setaria_palmifolia 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Setaria_sphacelata 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Setaria_verticillata 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Streptostachys_asperifolia 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Urochloa_maxima --ATGTCAATGGGATTTGGACTTTTTCTTATTCCGACAGCAACAAAAAATCTTCGTCGCATATGGGCTTTTCCTAGTATTTTACTCTTAAGTATAGCTCTGGTATTCTCAGTTCACCTGTCTATTCAACAAATAGATGGAAGTTCCATCTATCAATATCTATGGTCTTGGACCATCAATAATGATTTTTCCTTAGAATTTGGATACTTGATCGACCCTCTTACGTCTATTATGTTAATACTAATTACTACTGTACGAATTTTGGTTCTTATTTATAGTGACGATTATATGTCTCACGATGAAGGATATTTGAGATTTTTTGTTTATATAAGTTTTTTTAATACTGCCATGTTAGGATTGGTTACTAGTTCCAATTTGATACAAATTTATTTTTTTTGGGAACTTGTCGGAATGTGTTCCTATTTATTGATAGGCTTTTGGTTTACACGACCAATTGCAGCGAATGCTTGCCAAAAAGCTTTTGTAACTAATCGTGTAGGGGATTTTGGTCTGTTATTAGGAATTTTAGGTTTTTTTGGGATAACAGGTAGTTTAGAGTTTCGGGATTTGTTCAAAATAGCTAATAACTGGATTCCTAATAATGGGATTAATTCCTTACTTACTACTTTGTGTGCTTTTTTATTATTCCTTGGTGCAGTTGCAAAATCTGCACAATTCCCTCTTCACGTATGGTTACCCGATGCTATGGAAGGACCCACTCCCATTTCGGCTCTTATACACGCAGCAACTATGGTTGCTGCGGGGATTTTTCTTCTAGCTCGACTTCTTCCTCTTTTCATATCCCTACCTTTGATAATGAGTTTTATTTCTTTAGTAGGTACAATAACACTCTTCTTAGGAGCCACTTTAGCTCTTGCTC------AGAAAGATATTAAAAAAAGCTTAGCCTATTCTACAATGTCTCAATTGGGT-ATATGATGTTAGATCTAGGTATAGGTTCTTATGAAGCTGCTTTATTCCATTTGATCACTCATGCTTATTCGAAAGCTTTATTGTTCTTAGGATCTGGATCCATTATTCATTCAATGGAACCTCTTGTTGGATATTCACCAGATAAAAGTCAGAATATGGTTCTTATGGGTGGTTTAAGAAAATACATTCCAATTACAAGAGGTACTTTTTTATGTGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCACCTCTTGCTTGCTTCTGGTCCAAAGATGAAATTCTTAGTAATAGTTGGTTGTATTCACCCTTTTTTGGAATAATAGCCTCTTTTACTGCATGATTAACAGCATTTTATATGTTTCGGATATCTTTACTTACTTTTGATGGGTATTTGCGTGTTCATTTTCAAAATTACAGCAGTACTAAAGAAGGTTCGTTGTATTCAATATCCTTATGGGGAAAAGGCATATCCAAAGGAGTCAATAGGGATTTTGTTTTATCAACAAT---GAAGGGTGGAGTTTCTTTTTTTTCACAAAATATACC------CAAAATCCCTGATA------ATACAAGAAAAAAGATAGGATCCTTTAGTACTCCC------TTTGGGGCTAAAAACACTTTTGTCTATCCTCATGAAACGGGAAATACTATGTTATTTCCTCTTCTTATATTACTGCTTTTTACTTTGTTCATTGGATCCATAGGAATCCATTTTGATAATGGAATAAAGGGTAATGGAACATCGGAGTTAACCATATTATCAAAGTGGCTAACTCCTTCAATAAACTTTTTCCAGGAAAGTTCTAATTCTTCCATAAATTCATATGAATTTCTCATTAATGCAATTTCTTCCGTAAGTTTAGCAATTCTTGGTCTATTCATAGCATATATCTTCTATGGATCTACTTATTCTTTTTTTCAGAATTTAAATTTTCAAAATTCCCTTGT------AAAAGGAAACCCCAAAAAGAACTTTTTTGA------TGAAGTAAAAGAAAATATATACAGCTGGTCATATAATCGCGGTTATATAGATGTTTTCTATGCTAGGGTTTTTATCTTTGGTATAAGAAGATTAGCGGAACTAACGAATTTTTTCGATAAGAGTGTCATTGATGGAATTACCAATGGAGTG 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Urochloa_plantaginea --ATGTCAATGGGATTTGGACTTTTTCTTATTCCGACAGCAACAAAAAATCTTCGTCGCATATGGGCTTTTCCTAGTATTTTACTCTTAAGTATAGCTCTGGTATTCTCAGTTCACCTGTCTATTCAACAAATAAATGGAAGTTCTATCTATCAATATCTATGGTCTTGGACCATCAATAACGATTTTTCCTTAGAATTTGGATACTTGATCGACCCCCTTACGTCTATTATGTTAATACTAATTACTACTGTAGGAATCTTGGTTCTTATTTATAGTGACGATTATATGTCTCACGATGAAGGATATTTGAGATTTTTTGTTTATATAAGTTTTTTTAATACTGCCATGTTGGGATTGGTTACTAGTTCCAATTTGATACAAATTTATTTTTTTTGGGAACTTGTCGGAATGTGTTCCTATTTATTGATAGGCTTTTGGTTTACACGACCAATTGCAGCGAGTGCTTGCCAAAAAGCTTTTGTAACTAAT?GTGTAGGGGATTTTGGTCTGTTATTAGGAATTTTAGGTTTTTTTTGGATAACAGGTAGTTTAGAGTTTCGGGATTTGTTCAAAATAGCTAATAACTGGATTCCTAATAATGGGATTAATTCCTTATTTACTACTTTGTGTGCTTTTTTATTATTTCTTGGTGCAGTTGCAAAATCTGCACAATTCCCTCTTCACGTATGGTTACCCGATGCTATGGAAGGACCCACTCCCATTTCGGCTCTTATACACGCAGCAACTATGGTTGCTGCGGGGATTTTTCTTCTAGCTCGACTTCTTCCTCTTTTCATATCCCTACCTTTGATAATGAGTTTTATTTCTTTAGTAGGTACAATAACACTCTTCTTAGGAGCCACTTTAGCTCTTGCTC------AGAGAGATATTAAAA?AAGCTTA?CCTATTCTACAATGTCTCAATTGGGTTATATGATGTTAGCTCTAGGTATAGGTTCTTATGAAGCTGCTTTATTCCATTTGATCACTCATGCTTATTCGAAAGCTTTATTGTTCTTAGGATCTGGATCCATTATTCATTCAATGGAACCTCTTGTTGGATATTCACCAGATAAAAGTCAGAATATGGTTCTTATGGGTGGTTTAAGAAAATACGTTCCAATTACAAGAGGTACTTTTTTATGTGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCACCTCTTGC?TGCTTCTGGTCCAAAGATGAAATTCTTA?TAATA?TTGGTTGTATTCACCCTTTTTTGGAATAGTAGCCTCTTTTACTGCAGGATTAACTGCATTTTATATGTTTCGGATATATTTACTTACTTTTGATGGGTATTTGCGTGTTCATTTTCAAAATTACAGCAGTACTAAAGAAGGTTCGTTGTATTCAATATCCTTATGGGGAAAAGGCATATCCAAAGGAGTCAATAGGGATTTTGTTTTATCAACAAT---GAAGGGTGGAGTTTCTTTTTTTTCACAAAATATACC------CCAAATTCCTGATA------ATACAAGAAAAAAGATAGGATCCTTTAGTACTCCC------TTTGGGGCTAAAAACACTTTTGTCTATCCTCATGAAACGGGAAATACTATGCTATTTCCTCTTCTTATATTACTGCTTTTTACTTTGTTCATTGGATCCATAGGAATCCATTTTGATAATGGAATAAAGGGTAATGGAATATCGGAGTTAACCATATTATCAAAGTGGCTAACTCCTTCAATAAACTTTTTCCAGGAAAGTTCTAATTCTTCCATAAATTCATATGAATTTCTCATTAATGCAATTTCTTCCGTAAGTTTAGCAATTCTTGGTCTATTCATAGCATATATCTTCTATGGATCCGCTTATTCCTTTTTTCAGAATTTAAATTTTCTAAATTCCCTTGT------AAAAGGGAACCCAAAAAAGAACTTTTTGGA------TGAAGTAAAAGAAAATATATACAGCTGGTCATATAATCGCGGTTATATAGATGTTTTCTATACTAGGGTTTTTATCTTGGGTATAAGAAGATTAGCTGAACTAACAAATTTTTTCGATAAGGGTTTCATTGATGGAATTACCAATGGAGTA Zea_mays --ATGTCAATGGGATTTGGACTTTTTCTTATTCCTACAGCAACAAAAAATCTTCGTCGTATATGGGCTTTTCCTAGTATTTTACTCTTAAGTATAGCTATGGTATTCTCACTTCACCTGTCTATTCAACAAATAAATGGAAGTTCTATCTATCAATATCTATGGTCTTGGACCATCAATAATGATTTTTCCTTAGAATTTGGATACTTGGTCGACCCCCTTACGTCTATTATGTTAATACTAATTACTACTGTAGGAATCTTAGTTCTTATTTATAGTGACGATTATATGTCTCACGATGAAGGATATTTGAGATTTTTTGTTTATATAAGTTTTTTTAATACTTCCATGTTAGGATTGGTTACTAGTTCCAATTTGATACAAATTTATTTTTTTTGGGAACTTGTCGGAATGTGTTCCTATTTATTGATAGGCTTTTGGTTTACGCGGCCAATTGCAGCGAGTGCTTGTCAAAAAGCTTTTGTAACTAATCGTGTAGGGGATTTTGGTCTGTTATTAGGAATTTTAGGTTTTTTTTGGATAACGGGTAGTTTGGAGTTTCGGGATTTGTTCAAAATAGCTAATAACTGGATTCCTAATAATGGGATTAATTCCTTACTTACTACTTTGTGTGCTTTTTTATTATTCCTTGGTGCAGTTGCAAAATCTGCACAATTTCCTCTTCACGTATGGTTACCTGATGCTATGGAAGGACCCACTCCTATTTCGGCTCTTATACACGCAGC---TATGGTTGCTGCGGGGATTTTTCTTCTAGCTAGACTTCTTCCTCTTTTCATATCCCTACCCTTGATAATGAGTTTCATTTCTTTAATAGGTACAATAACACTCTTCTTAGGAGCCACTTTAGCTCTTGCTC------AGAGAGATATTAAAAGAAGCTTAGCCTATTCTACAATGTCTCAATTGGGTTATATGATGTTAGCTCTAGGTATAGGTTCTTATCAAGCTGCTTTATTCCATTTGATCACTCATGCTTATTCGAAAGCTTTATTGTTCTTAGGATCCGGATCCGTTATTCATTCAATGGAACCTCTTGTTGGATATTCACCAGATAAAAGTCAGAATATGGTTCTTATGGGTGGTTTAAGAAAATACGTTCCAATTACAAGAACTACTTTTTTATGTGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCACCTCTTGCTTGCTTCTGGTCCAAAGATGAAATCCTTAGTAATAGTTGGTTGTATTCACCCTTTTTTGGAATAATAGCCTCTTTTACTGCAGGATTAACTGCATTTTATATGTTTCGGATATATTTACTTACTTTTGATGGGTATTTGCGTGTTCATTTTCAAAATTACAGTAGTACTAAAGAAGGTTCGTTGTATTCAATATCCTTATGGGGAAAAAGTATATCCAAAGGAGTCAATAGGGATTTTGTTTTATCAACAAT---GAAGAGTGGAGTTTCTTTTTTTTCACAAAATATACC------AAAAATTCCTGCTA------ATACAAGAAATAAGATAGGATCCTTTAGTACTCCC------TTTGGGGCTAAAAATACTTTTGTCTATCCTCATGAAACGGGAAATACTATGCTATTTCCTCTTCTTATATTACTACTTTTTACTTTGTTCATTGGATCCATAGGAATCCATTTTGATAATGGAGTAAAGGATAATGGAATATTGGAGTTAACCATATTATCAAAGTGGCTAACTCCTTCAATAAACTTGTTCCAGGAAAATTCTAATTCTTCCATAAATTCATATGAATTTCTCACTAATGCAATTTCTTCTGTAAGTTTAGCAATTTTTGGTCTATTCATAGCATATATCTTTTATGGATCTGCTTATTCTTTTTTTCAGAATTTGAATTTTCAAAATTCCCTTGT------AAAAAAGAATCCAAAAAAGAGCTTTTTGGA------TGAAGTAAAAAAAAAGATATACAGCTGGTCATATAATCGTGGTTATATAGATTTTTTCTATACTAGGGTTTTTATCCTAGGTATAAGAAGATTAGCCGAACTAACGCATTTTTTTGATAAAGGTGTCATTGATGGAATTACCAATGGAGTA Zeugites_pittieri --ATGTCAATGGGATTTGGACTTTTTCTTATTCCGACAGCAACAAAAAATCTTCGTCGCATATGGGCTTTTCCTAGTGTTTTACTCTTAAGTATAGCTATGGTATTCTCAGTTCACCTGTCTATTCAACAAATAAATGGAAGTTCTATCTATCAATATCTATGGTCTTGGACCATCAATAATGATTTTTCCTTAGAATTTGGATACTTGATCGACCCGCTTACTTCTATTATGTTAATACTAATTACTACTGTAGGAATCTTGGTTCTTATTTATAGTGACGATTATATGTCTCACGATGAAGGATATTTGAGATTTTTTGTTTATATAAGTTTTTTTAATACTTCCATGTTGGGATTGGTTACTAGTTCCAATTTGATACAAATTTATTTTTTTTGGGAACTTGTCGGAATGTGTTCCTATTTATTGATAGGCTTTTGGTTTACACGGCCAATTGCAGCGAGTGCTTGTCAAAAAGCTTTTGTAACTAATCGTGTAGGGGATTTTGGTCTGTTATTAGGAATTTTAGGTTTTTTTTGGATAACAGGTAGTTTAGAGTTTCGGGATTTGTTCAAAATAGCTAATAACTGGATTCCTAATACTGGTATTAATTCCTTACTTACTACTTTGTTTGCTTTTTTATTATTCCTTGGTGCAGTTGCAAAATCTGCACAATTCCCTCTTCACGTATGGTTACCCGATGCTATGGAAGGACCCACTCCCATTTCGGCTCTTATACACGCA---ACTATGGTTGCTGCGGGTATTTTTCTTGTAGCTCGACTTCTTCCTCTTTTCATATCTCTACCTTTGATAATGAGCTTCATTTCTTTAGTAGGTACAGTAACACTCTTCTTAGGAGCCACTTTAGCTCTTGCTC------AGAGAGATATTAAAAGAAGCTTAGCCTATTCTACAATGTCTCAATTGGGTTATATGATGTTAGCTCTAGGTATAGGTTCTTATCAAGCTGCTTTATTCCATTTGATCACTCATGCTTATTCGAAAGCTTTATTGTTCTTGGGATCCGGGTCCATTATTCATTCGATGGAACCTCTTGTTGGATATTCGCCAGATAAAAGTCAGAATATGGTTCTTATGGGTGGTTTAAGAAAATACGTTCCAATTACAAGAACTACTTTTTTATGCGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCACCTCTTGCTTGCTTCTGGTCCAAAGATGAAATCCTTAGTAATAGTTGGTTGTATTCACCCTTTTTTGGAATAATAGCCTCTTTTACTGCAGGATTAACCGCATTTTATATGTTTCGGATATATTTACTTACTTTTGATGGGTATTTGCGTGTTCATTTTCAAAATTACAGTAGTACTAAAGAGAGTTCGTTGTATTCAATATCCTTATGGGGAAAAAGCATACCCAAAGGAGTCAATAGGGATTTTGTGTTATCCACAAC---GAAGAGTGGAGTTTCCTTTTTTTCACAAAATATACC------AAAAATTCCTGGTA------ATACAAGAAATAAGACGGGATCCTTTAGTACTCCC------TTTGGGGCTAAAAAAACTTTTGTCTATCCTCATGAAACGGGAAATACTATGCTATTTCCTCTTCTTGTATTACTTATTTTGACTCTGCTCATTGGATTCATAGGAATCCATTTTGATAATAGAGTAAAGGATAATGGAATATCGGAGTTAACCATATTATCAAAGTGGCTAACTCCTTCAATAAACTTTTTCCAGGAAAGTTCTAATTCTTCCATAAATTCATATGAATTTCTCACTAATGCAATTTCTTCTGTAAGTTTAGCTATTTTTGGTCTATTCATAGCATATATCTTCTATGGATCCGCTTATTCTTTTTTTCAGAATTTGAATTTTAAAAATTCCCTTTT------ACAAGGGAATCAAAAAAAGTTCTTTTTGGA------TGAAGTAAAAAAAAATATATACAGTTGGTCATATAATCGTGGTTATATAGATGTTTTCTATACTCGGGTCTTTATCCTGGGTATAAGACGATTAACCGAACTAACGAATTTTTTCGATAAAGGTGTCATTGATGGAATTACCAATGGAGTA ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = Figure_1) = N: 1-2084; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = Figure_1) = N: 1-2084; END; BEGIN TREES; TITLE Tb6138; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Thysanolaena_maxima, 2 Danthoniopsis_petiolata, 3 Dathoniopsis_dinteri, 4 Arundinella_hirta, 5 Zeugites_pittieri, 6 Chasmanthium_latifolium, 7 Chasmanthium_laxum, 8 Zea_mays, 9 Tripsacum_dactyloides, 10 Sorgum_bicolor, 11 Schizachyrium_scoparium, 12 Phacelurus_digitatus, 13 Miscanthus_japonicus, 14 Microstegium_nudum, 15 Ischaemum_afrum, 16 Hyparrhenia_hirta, 17 Heteropogon_contortus, 18 Elionurus_muticus, 19 Dichanthium_aristatum, 20 Cymbopogon_flexuosus, 21 Coix_aquatica, 22 Coelorachis_selloana, 23 Cleistachne_sorghoides, 24 Chrysopogon_fulvus, 25 Chionachne_koenigii, 26 Capillipedium_parviflorum, 27 Borthriochloa_odorata, 28 Andropogon_hallii, 29 Apluda_mutica, 30 Urochloa_plantaginea, 31 Urochloa_acuminata, 32 Urochloa_mutica, 33 Thrasya_petrosa, 34 Thrasya_glaziovii, 35 Tatianix_arnacites, 36 Streptostachys_asperifolia, 37 Streptostachys_ramosa, 38 Stenchisma_hians, 39 Stenotaphrum_secundatum, 40 Setaria_lachnea, 41 Setaria_parviflora, 42 Setaria_sphacelata, 43 Setaria_palmifolia, 44 Setaria_viridis, 45 Setaria_verticillata, 46 Setaria_macrostachya, 47 Sacciolepis_indica, 48 Pseudechinolaena_polystachya, 49 Melinis_repens, 50 Plagiantha_tenella, 51 Pennisetum_setaceum, 52 Pennisetum_alopecuroides, 53 Paspalum_malacophyllum, 54 Paspalum_wettsteinii, 55 Paspalum_conjugatum, 56 Paspalum_remotum, 57 Paspalum_paniculatum, 58 Paspalum_conspersum, 59 Paspalum_vaginatum, 60 Paspalum_haumanii, 61 Paspalum_arundinellum, 62 Paspalidium_geminatum, 63 Panicum_rudgei, 64 Panicum_millegrana, 65 Panicum_obtusum, 66 Panicum_aquaticum, 67 Panicum_euprepes, 68 Panicum_stolonifera, 69 Panicum_laxumL, 70 Panicum_sabulorum, 71 Panicum_virgatum, 72 Panicum_ovuliferum, 73 Panicum_prionitis, 74 Panicum_repens, 75 Panicum_fauriei, 76 Urochloa_maxima, 77 Panicum_bulbosum, 78 Panicum_elephantipes, 79 Panicum_pedersenii, 80 Panicum_nephelophilum, 81 Oplismenus_hirtellus, 82 Otachyrium_versicolor, 83 Ophiochloa_hydrolithica, 84 Mesosetum_chaseae, 85 Leptocoryphium_lanatum, 86 Lasciasis_sorghoides, 87 Ichnanthus_pallens, 88 Homolepis_glutinosa, 89 Homolepis_isocalycina, 90 Hymenachne_donacifolia, 91 Eriochloa_punctata, 92 Echinolaena_inflexa, 93 Echinochloa_frumentacea, 94 Echinochloa_colona, 95 Digitaria_ciliaris, 96 Digitaria_setigera, 97 Digitaria_radicosa, 98 Dichantelium_koolauense, 99 Chaetium_bromoides, 100 Cenchrus_ciliaris, 101 Axonopus_fissifolius, 102 Axonopus_anceps, 103 Arthropogon_villosus, 104 Arthropogon_lanceolatus, 105 Anthaentiopsis_rojasiana, 106 Altoparadisium_chapadense, 107 Acroceras_zizanioides; TREE Fig._2A = [&R] ((7,6),(((((107,((86,48),81)),((94,93),72))forest_shade_clade,(((((((100,51),52),((77,44,40),(62,39)),((46,42),((45,41),43)))Setaria_bristle_clade,((((99,91),(76,32)),30),49,31)Urochloa_clade),((80,75),(79,66),78,74,71,63)Panicum_subg._Panicum)'Panicum/Urochloa/Setaria clade',(98,70)Panicum_subg._Dichanthelium_sect._Dichanthelium),(64,47))),(97,96,95))'Paniceae x=9',((((106,103),(104,73,67),(89,88),(84,35),37)Ambiguous_clade,(((105,(65,(((61,54),60),59,58,57,56,55,53,(34,33)))),((102,101,83),36),(92,68),87),((90,((82,(69,38)),50))'Steinchisma/Hymenachne clade',85)))'Paniceae x=10',((((29,(((28,16,11),((27,19),26),20,17)core_Andropogoneae,21),24,((23,10),14,13),22,12),15),25,(18,9,8)),4)Andropogoneae))Panicoideae,(5,((3,2),1))); END;