#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on July 25, 2021; 17:57 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Lavin M., Eshbaugh E., Hu J., Mathews S., & Sharrock R. 1998. Monophyletic subgroups of the tribe Millettieae (Leguminosae) as revealed by phytochrome nucleotide sequence data. American Journal of Botany, 85: 412-433. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S885] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=49; TAXLABELS Austrosteenisia_blackii Bolusanthus_speciosus Butea_monosperma Callerya_atropurpurea Callerya_australis Callerya_megasperma Callerya_reticulata Caragana_arborescens Carmichaelia_sp Chadsia_versicolor Clianthus_formosus Coursetia_madrensis Craibia_brevicaudata Cyclolobium_nutans Dahlstedtia_pinnata Dalbergia_sp Dalbergiella_nyassae Derris_elliptica Fordia_splendidissima Glycine_max Hebestigma_cubense Hybosema_robustum Lathyrus_odoratus Lennea_melanocarpa Lonchocarpus_eriocarinalis Lonchocarpus_phaseolifolius Lonchocarpus_spectabilis Millettia_dura Millettia_grandis Millettia_richardiana Millettia_thonningii Mundulea_sericea Myrospermum_sousanum Ostryocarpus_stuhlmannii Phaseolus_vulgaris Piscidia_piscipula Pisum_sativum Platycyamus_regnellii Poecilanthe_falcata Poitea_carinalis Pongamia_pinnata Pongamiopsis_amygdalina Sesbania_cochichinensis Sesbania_emerus Sesbania_vesicaria Sophora_affinis Tephrosia_villosa Tipuana_tipu Wisteria_floribunda ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M350] TITLE Millettieae_phytochrome_genes; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=1668; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Butea_monosperma ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AACAAGGTCCGTATGATAGTTGATTGTCATGCAAAACACGTGAAGGTTCTTCAAGATGAAAAACTCACATTTGATTTGACTTTGTGTGGTTCCACCTTAAGGGCTCCTCATAGTTGTCACTTGCAATACATGTCCAACATGGATTCAATTGCTTCCCTGGTTATGGCAGTTGTAGTCAATGACAATGAAGAAGATGGGGAC---CCTGATGCTGTTCAGCCACAAAAGAGAAAGAGACTTTGGGGTTTGGTAGTTTGCCACAACACTACTCCCAGGTTTGTTCCCTTTCCTCTAAGGTATGCTTGTGAATTTCTGGCTCAAGTATTTGCCATCCATGTGAACAAAGAAATAGAGTTAGAATATCAGATAATTGAGAAGAATATCCTGCGCACCCAGACACTCTTGTGTGATATGCTGATGCGAGATGCACCCCTAGGAATTGTGTCACAGAGCCCT??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TTGTTTATGAAGACCAAGGTCCGCATGATAGTTGATTGTCGTGCAAAGCATGTGAAGGTGCTTCAAGATAAAAAAATTCCATTTGATTTAACTTTGTGTGGATCAACCTTGAGGGCTGCTCATAGTTGCCACTTGCAATACATGGAGAACATGAATTCTAGTGCTTCCTTGGTTATGGCAGTTGTGGTCAATGACAATGATGAACATGGGGATAGCTCTGATGCTGTTCCGCCACAAAAGAGAAAGAGACTATGGGGTTTAGTAGTTTGCCGTCACACTACGCCCAGGTTTATTCCCTTCCCTCTTAGGTATGCTTGTGAATTCCTGGCTCAAGTATTTGCCATCCATGTGAACAAAGAACTAGAGTTAGAGTATCAGATTGTTGAGAAGAACATCCTGCAAACTCAAACACTCTTGTGTGACATGCTGATGCGAGATGCACCCCTGGGTATTGTATCACAAAGTCCT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TCTCGCTTCTTGTTCAAGCAAAACCGGGTCAGGATGATTTGTGATTGCCATGCAAAGCCGGTTAAGGTCATTCAGAGTGAAGAATTAAGGCAATCTCTTTGCTTGGTGAACTCCACCCTTAGGCTACCACATGGTTGTCACACGCAGTACATGGCTAACATGGGCTCAATTGCCTCTCTGGTGATGGCAATTATAGTTAATGGAAATGATACAACGAGGCTTTGGGGTTTGCTAGTTTGTCATCACACTTCCCCACGCTATGTGTCTTTCCCGGTTCGTTATGCTTGTGAATTCCTAATGCAGGCTTTTGGACTGCAGCTTTACATGGAGATTCAATTGGCATCACAAATGGAAGAGAAGAGAATTCTTAAAACACAAACCTTGCTGTGTGACATGCTCCTTCGAGATGCCCCGTTTGGCATTGTGACTCAATCCCCA Callerya_atropurpurea ??????????????????????????????????????????????????????????????CTATCCAGCCACAGATATTCCCCAGGCTGCACGCTTTTTATTTATGAAGAACAAGGTCCGTATGATAGTTGATTGTCATGCAAAACATGTGAAGGTTCTTCAAGATGAAAAACTCCCATTTGATTTGACTTTGTGTGGTTCAACCTTAAGGGCTCCCCATAGTTGCCATTTGCAGTACATGGCAAACATGGATTCCATTGCTTCCCTGGTTATGGCAGTTGTAGTCAATGACAGTGAAGAAGATGGGGATAGCTCTGAGGCAGTTCAGCCACAAAAGAGAAAGAGACTCTGGGGTTTGGTAGTTTGCCATAACACTACACCCAGGTTTGTTCCCTTTCCTCTAAGGTATGCTTGCGAATTTCTGGCTCAAGTATTTGCCATCCATGTGAACAAAGAAATAGAATTAGAATACCAGATTCTTGAGAAGAATATCCTGCGCACCCAGACACTCTTGTGTGATATGCTGATGCGAGATGCACCCCTAGGTATTGTATCACAGAGCCCTGATCAAGGTGAAGTGATTGCTGAGGTCACAAAGCCAGGCCTAGAGCCATATCTG???GGTTTGCACTATCCAGCCACTGATATTCCCCAGGCGACACGCTTTTTATTTATGAGGAACAAGGTCCGCATGATAGTTGATTGTAGTGCAAAGCATGTGAAGGTGCATCAAGACAAAAATATTCCATTTGAGGGAACTTTGTGTGGATCAACCTTGAGGGCTCCTCATAGCTGCCATTTGCAATACATGGAGAACATGAATGCAAGTGCTTCCCTGGTTATGGCAGTTGTGGTCAATGATGACGAAGAAGATGAGGACAGCGCCGGTGATGTTGAGCCGCAAAAGAGAAAGAGACTCTGGGGTTTAGTTGTTTGCCATCACATTACTCCCAGGTTTGTTCCCTTCCCTCTTAGGTATGCTTGTGAATTTCTGGCTCAGGTATTTGCCATCCATGTGAACAAAGAAATAGAGTTAGAATATCAGATTATTGAGAAGGAA?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Callerya_australis ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AACAAGGTCCGCATGATAGTTGATTGTCGTGCAAAGCATGTGAAGGTGCTTCAAGAGCAAAAAATTCCATTTGATTTAACTTTTTGTGGATCGACCTTAAGGGCTCCTCATAGTTGCCATTTGCAATACATGGAGAACATGAATGCAAGTGCTTCCCTGGTTCTGGCAGTTGTGGACAATGACAATGATGAATATGAGGATAGCTCTGATGATGTTGCTGGTGAAAAGAGAAAGCGACTGTGGGGTTTAGTTGTTTGCCATCACATTAGTCCCAGGTTTGTTCCCTTCCCTCTAAGGTATGCTTGTGAATTCCTGGCTCAAGTATTTGCCATCCATGTGAACAAAGAAATAGAATTAGAATATCAGATTCTTGAGAAGAATATCCTGCGCACCCAGACACTCTTGTGTGATATGCTGTTGCGAGATGCACCCTTAGGTATTGTATCACAGAGCCCT??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Callerya_megasperma ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGTCATGCAAAACATGTGAAGGTTCTTCAAGATGAAAAACTCCCATTTGACTTGACTTTGTGTGGTTCAACCTTAAGGGCTCCCCACAGTTGCCATTCGCAATACATGGCAAACATGGATTCAATTGCTTCCCTGGTTATGGCAGTTGTAGTCAATGACAGTGATGAAGATGGGGATAGCTCTGATGCAGTTCATCCGCAAAAGAGAAAGAGACTCTGGGGTTTGGTAGTTTGCCATAACACTACTCCCAGGTTTGTTCCCTTTCCTCTAAGGTATGCTTGTGAATTTCTGGCTCAAGTATTTGCCATCCATGTGAACAAAGAAATAGAATTAGAATATCAGATTCTTGAGAAGAATATCCTGCGCACCCAGACACTCTTGTGTGATATGCTGTTGCGAGATGCACCCTTAGGTATTGTATCACAGAGCCCT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CCCAGGCTACACGCTTTTTATTTATGAAGAACAAGGTCCGCATGATAGTTGATTGTCGTGCAAAGCATGTGAAGGTGCTTCAAGACAAAAAATTTCCATTTGATTTAACTTTTTGTGGTACAACCTTAAGGGCTCCTCATAGTTGCCACTTGCAATACATGGAGAACATGAATGCAATTGCTTCCCTGGTTCTGGCAGTTGTGGTCAATGACAATGATGGATATGAGGATAGCTCTGATGATGTTCAGCCGCAAAAGAGAAAGAGACTGTGGGGTTTAGTTGTTTGCCATCACATTACTCCCAGGTTTGTTCCCTTCCCTCTTAGGTATGCTTGTGAATTTCTGGCTCAAGTGTTTGCCATCCATGTGAGCAAAGAAATAGAGTTAGAATATCAGATTATTGAGAAGAACATCCTGCGCACCCAAACACTCTTGTGTGATATGCTGATGCGAGATGCACCCCTAGGAATTGTATCACAGAGCCCT??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Caragana_arborescens ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CAGGCTGCACGCTTTTTATTTATGAAGGAACAAGATCCGTATATAGTTGATTGTCATGCAAAACATGTGAAGGTTCTTCAAGATGAAAAACTCCCATTTGATCTGACTTTGTGTGGTTCAACCTTAAGGGCTCCCCATAGTTGCCATTTGCAGTACATGGCAAACATGAATTCAATTGCTTCCCTGGTTATGGCAGTTGTTGTCAATGACAGTGATGAAGATGAGGATAGCTCTGATGCAGTTCACCCACAAAAGAGAAAGAGACTTTGGGGTTTGGTAGTTTGTCATAACACTACTCCCAGGTTTGTT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CAGGCTACACTCTTTTTGTTTATGAAGAACAAGGTCCATATGATGGTTGATCGTCGTGCAAAGCATGTGAAGGTGCTTCAGGATCAAAAAATTCCATTTGATTTAACTTTGTGTGGATCAACCTTAAGGGCTCCTCATAGTTGCCATTTGCAATACATGGAGAACATGAATACAAGTGCTTCCCTGGTTATGGCAGTTGTGGTCAATGACAGCAATGAAGATGAGGATAGTTCTGATGATGTTCAGCTGCAGAAGAGAAAGAGACTATGGGGTTTAGTTGTTTGCCATCACATTACTCCCAGGTTTGTT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Clianthus_formosus ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ACACGTTCGCGCTTTTTATTTATGAAGAACAAGGTTCGAATGATAGTTGATTGTCATGCAAAACATGTGAAGGTTCTTCAAGATGAAAAACTCCCATTTGATTTGACTTTGTGTGGTTCAACCTTAAGGGCTCCACATAGTTGCCATTTGCAGTACATGGCAAACATGAATTCAATTGCTTCCCTGGTGATGGCAGTTGTAGTCAATGATAGTGATGAAGATGGGGATAGCTCTGATGCAGTTCAACCACAAAAGAAAAAGAGACTTTGGGGTTTGGTAGTTTGTCATAACACTTCTCCCAGGTTTGTT??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Craibia_brevicaudata GATCATGGGGAGGTGATTGCTGAGATAACAAAGCCAGGCCTTGAGCAATATCTGGGTTTGCACTATCCAGCCACTGATATTCCTCAGGCTGCACGCTTTTTATTTATGAACAACAAGGTCCGTATGATAGTTGATTGTCATGCAAAGCATGTGAAGGTTCTTCAAGATGAAAAACTCCTGTTTGATTTGACTTTGTGTGGTTCCACGTTAAGGGCTCCTCATAGTTGCCACTTGCAATACATGGCGAACATGGATTCAATTGCTTCCCTGGTTATGGCAGTTGTAGTCAATGACAATGAAGAAGATGGGGATAGCTCTGATGCTGTTCAGCCACAAAAGAGAAAGAGACTCTGGGGTTTGGTAGTTTGCCATAACACTACTCCCAGGTTTGTTCCCTTTCCTCTAAGGTATGCTTGTGAATTTCTGGCTCAAGTATTTGCCATCCATGTGAACAAAGAAATAGAGTTAGAATATCAGATTATTGAGAACAATATCCTGCGCACCCAGACTCTCTTGTGTGATATGCTGATGAGAGATGCACCCCTAGGAATTGTATCACAGAGCCCT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CCCCAAGCTACACGCTTTTTATTTATGAAGAACAAGGTCCGTATGATAGTTGATTCTCGTGCAAAGCATGTTAAGGTGCTTCAAGACCAAAAAATTCCATTTGATTTGACTTTGTGTGGATCTACCTTAAGGGCTCCTCATAGTTGCCATTTGCAATACATGGAGAACATGAATTCAAGTGCTTCCCTGGTTATGGCAGTTGTGGTCAATGACAATGATGAAGATGGGGATAGCTCTGATGCTGTTCAGCCACAAAAGAGAAAGAGACTCTGGGGTTTAGTAGTTTGCCATCACACTACTCCCAGGTTTGTTCCTTTTCCTCTTAGGTATGCTTGTGAATTCCTGGCTCAAGTATTTGCCATCCATGTGAACAAAGAGCTAGAGTTAGAATATCAAATTGTTGAGAAGAATATCCTGCGCACTCAAACTCTCTTGTGTGATATGCTGATGCGAGATGCACCCCTAGGTATTGTATCACAGAGCCCT??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Dahlstedtia_pinnata GATCATGGGGAGGTGATTGCTGAGATAACAAAGCCAGGCCTTGAGCCATATCTGGGTTTGCACTATCCAGCCACTGATATTCCCCAGGCTGCACGGTTTTTATTTATGAAGAACAAGGTCCGCATGATAGTTGATTGTCATGCAAAACACGTGAAAGTTCTTCAAGATGAAAAAACCCCATTTGATTTGACTTTGTGTGGTTCGACCTTAAGGGCTCCCCATAGTTGCCATTTGCAATACATGGCAAACATGGATTCAATTGCTTCTCTGGTTATGGCAGTTGTAGTTAATGACAACGAAGAAGATGGGGATAGCTCTGATGCTGTTCAGCCGCAAAAGAGAAAGAGACTATGGGGTTTGGTAGTTTGCCATAACACTACTCCCAGGTTTGTTCCCTTTCCTCTAAGGTATGCTTGTGAATTTCTGGCTCAAGTATTTGCAATCCATGTGAACAAAGAAATAGAGTTAGAATACCAGATTATTGAGAAGAATATCCTGCGCACCCAGACACTCTTGTGTGATATGCTGATGCGAGATGCACCCCTAGGAATTGTATCACAGAGCCCT??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TTTGTGTGGATCAACCTTAAGGGCTCCTCATAGTTGCCATTTGCAATACATGGAGAACATGAATTGTAGTGCTTCCTTGGTTATGGCAGTTGTGGTCAATGACAATGATGAAGATGGAGATAGT---GATGCTGTTCAGCCACAGAAGAGAAAAAGACTCTGGGGTTTAGTAGTTTGCCATAACACTACTCCCAGGTTTGTTCCTTTTCCTCTTAGGTATGCCTGTGAATTCCTTGCTCAAGTATTTGCCATCCATGTGAACAAAGAACTAGAGTTAGAATATCAGATTGTTGAGAAGAATATAATGCGAACTCAAACACTCTTGTGTGATATGCTGATGCGAGATGCGCCACTAGGCATTGTAACACAGAGACCT??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Dalbergiella_nyassae GATCATGGGGAGGTGATTGCTGAGATAACAAAGCCAGGACTTGAGCCATATCTGGGTTTGCACTATCCAGCCACTGATATTCCCCAGGCTGCACGCTTTTTATTTATGAAGAACAAGGTCCGTATGATAGTTGATTGTCATGCCAAACACGTGAAGGTTCTTCAAGATGAAAAACTCCCACTTGATTTGACTTTGTGTGGTTCAACCTTAAGGGCTCCTCATAGTTGCCACTTGCAATACATGGCGAACATGGATTCCATTGCTTCCCTCGTTATGGCAGTTGTAGTCAATGACAACGAAGAAGATGGGGATAGCTCTGATGCTGTTCAGCCACAAAAGAGAAAGAGACTCTGGGGTTTGGTAGTTTGCCATAACACTACTCCCAGGTTTGTTCCCTTTCCTCTAAGGTATGCTTGTGAATTTCTGGCTCAAGTATTTGCCATCCATGTGAACAAAGAAATAGAGTTAGAATATCAGATAATTGAGAAGAATATCCTGCGCACCCAGACACTCTTGTGTGATATGCTGATGCGAGATGCACCCCTAGGAATTGTATCCCAGAGCCCTGATCATGGGGAAGTGGTTGCTGAGGTCAAAAAGCCAGGCCTAGAGCCATATCTG???GGTTTGCACTACCCAGCCACTGATATTCCCCAGGCTACACGCTTTTCATTTATGAAGAACAAGGTCCGCATGATAGTTGATTGTCATGCAAAGCATGTGAAGGTGCTTCAAGACAAAAAAATTCCATTTGATTTGACTTTGTGTGGATCAACCTTAAGGGCTCCTCATAGTTGCCATTTGCAATACATGGAGAACATGAATTCTAGTGCTTCCTTGGTTATGGCAGTCGTGGTCAATGACAATGATGAAGATGGGGATAGCTCTGATGCTATTCAGCCACAAAAGAGAAAGAGACTTTGGGGTTTAGTAGTTTGCCATCACACTACTCCCAGGTTTGTTCCTTTCCCTCTTAGGTATGCTTGTGAATTCCTGGCTCAAGTATTTGCCATCCATGTGAACAAAGAGCTAGAGTTAGAATATCAGATTGTTGAGAAGAATATCCTGCGCACTCAAACACTCTTGTGCGATATGCTGATGAGAGATGCACCCCTGGGTATTGTATCACAGAGCCCTGAGCATGGTGAGGTTGTATCTGAGATTAGAAGGTCAGATTTGGAGCCTTACTTG???GGTTTGCATTATCCTGCCACTGATATCCCTCAAGCTTCTCGATTATTGTTCAAGCAAAACCGGGTCAGGATGATTTGTGATTGCGATGCAAAGCCAGTTAAGGTCATTCAGAGTGAAGAATTAAGGCAACCTCTTTGCTTGGTGAACTCAACCCTTAGGTCACCACATGGTTGTCACACACAGTACATGGCTAACATGGGCTCAATTGCCTCTCTGGTGATGGCAGTTATAATTAATGGAAATGATACAACAAGGCTTTGGGGTTTGCTGGTTTGTCATCACACTTCACCCCGTTATGTGCCTTTCCCAGTCTGCTATGCTTGTGAGTTCCTAATGCAGGCTTTTGGACTGCAGCTTTACATGGAGATTCAGTTGGCATCGCAAATGGCAGAGAAGAGAATTCTTAAAACACAAACCTTGCTGTGTGACATGCTCCTGCGTGATGCGCCATTTGGCATTGTGAATCAATCCCCA Derris_elliptica GATCACGGGGAGGTGATTGCTGAGATAACAAAGCCAGGCCTTGAGCCATATCTGGGTTTGCACTATCCAGCCACTGATATTCCCCAGGCTGCACGCTTTTTATTTATGAAGAACAAGGTCCGCATGATAGTTGATTGTCATGCAAAACACATGAAGGTTCTTCAAGATGAAAAAATCCCATTTGATTTGACTTTGTGTGGTTCGACCTTAAGGGCTCCCCATAGTTGCCATTTGCAATACATGGCAAACATGGATTCAATTGCTTCTCTGGTTATGGCAGTTGTAGTTAATGACAACGAAGAAGATGGGGATAGCTCTGATGCTGTTCAGCCGCAAAAGAGAAAGAGACTATGGGGTTTGGTAGTTTGCCATAACACTACTCCCAGGTTTGTTCCCTTTCCTCTAAGGTATGCTTGTGAATTTCTGGCTCAAGTATTTGCAATCCATGTGAACAAAGAAATAGAATTAGAATATCAGATTATTGAGAAGAATATCCTGCGCACTCAGACACTCTTGTGTGATATGCTGATGCGAGATGCACCGCTAGGAATTGTATCACAGAGCCCTGATCATGGAGAAGTGATTGCTGAGGTCAAAAGGCCTGGCCTAGAGCCTTATCTG???GGTTTGCACTATCCAGCCACTGATATTCCTCAGGCTACGCGCTTTTTATTTATGAAGAACAAGGTTCGTATGATAGTTGATTGTCGTGCAAAGCATGTGAAGGTTCTTCAAGACAAAAAGGTTCCATTTGATTTAACTTTGTGTGGATCAACCTTAAGGGCTCCTCATAGTTGCCATTTGCAATACATGGAGAACATGAATTGTAGTGCTTCCTTGGTTATGGCAGTTGTGGTCAATGACAATGATGAAGATGGAGATAGT---GATGCTGTTCAGCCACAGAAGAGAAAAAGACTGTGGGGTTTAGTAGTTTGCCATAACACTACTCCCAGGTTTGTTCCTTTTCCTCTTAGGTATGCCTGTGAATTCCTTGCTCAA???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GATCATGGTGAGATTGTATCTGAGATTAGAAGGTCGGATTTGGAGCCATATTTG???GGTTTGCATTATCCTGCCACAGATATCCCTCAAGCTTCTCGCTTCTTGTTCAAGCAAAACCGTGTCAGGATGATTTGTGATTGCCATGCAAAGCCGGTTAAGGTCATTCAGAGTGAGGAGTTAAGGCAACCTCTTTGCTTGGTGAACTCAACCCTTAGGTCACCACATGTTTGTCACACACAGTATATGGCTAACATGGGCTCAATTGCCTCTCTGGTTATGGCAATTATAGTCAACGGAAATGATACAACAAGACTTTGGGGTTTGCTAGTTTGTCATCACACTTCGCGC---TATGTGCCTTTCCCAGTTCGCTATGCTTGTGAGTTCCTAATGCAGGCTTTTGGAGTGCAGCTTTACATGGAGATTCAGATGGCATCACAGATGGCAGAGAAGAGAATGCTTAAAACACAAACC????????????????????????????????????????????????????????? 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Lathyrus_odoratus ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CAGGCTGCGCGGTTTCTATTTATGAAGAACAAGGTCCGTATGATAGTTGATTGTCATGCAAAACATGTGAAGGTTCTTCAAGACGAAAAACTCCCATTTGATTTGACTCTGTGCGGTTCGACCTTAAGAGCTCCACATAGTTGCCATTTGCAGTACATGGCTAACATGGATTCAATTGCTTCATTGGTTATGGCAGTGGTCGTCAATGACAGCGATGAAGATGGAGATAGCCGTGACGCAGTTCTACCACAAAAGAAAAAGAGACTTTGGGGTTTGGTAGTTTGTCATAACACTACTCCGAGGTTTGTT??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Millettia_dura 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Millettia_thonningii 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Mundulea_sericea GATCACGGGGAGGTGATTGCGGAGATAACAAAGCCAGGCCTTGAGCCGTATCTGGGTTTGCATTATCCTGCCACTGATATTCCCCAGGCTTCACGCTTCTTATTTATGAAGAACAAGGTCCGTATGATAGTTGATTGTCATGCAAAACATGTGAAGGTTCTTCAAGATGAAAAACTGCCATTCGATTTGACATTGTGTGGTTCAACCTTAAGGGCTCCTCATAGTTGCCATTTGCAATACATGGCAAACATGGATTCAATTGCTTCTCTGGTTATGGCAGTTGTTGTCAATGACAACGAAGAAGATGGGGATAGCTCTGATGCTGTTCAGCCTCAAAAGAGGAAGAGACTATGGGGTCTGGTAGTTTGCCATAACACTAGTCCAAGGTTTGTTCCCTTTCCACTGAGGTATGCCTGTGAATTTCTCGCTCAAGTATTTGCCATCCATGTGAACAAAGAAATTGAGTTAGAAAATCAGATTATTGAGAAGAATATCCTGCGCACCCAGACACTCTTGTGTGATATGCTGATGCGAGATGCACCACTAGGAATTGTATCACAGAGCCCAGATCACGGGGAGGTGATTGCGGAGATAACAAAGCCAGGCCTAGAGCCTTATCTG???GGCTTGCACTATCCGGCCACCGATGTTCCTCAGGCTACGCGCTTTTTATTCATGAAGAACAAGGTTCGTATGATAGTTGATTGTCGCGCAAAGCATGTGAAGGTGCTTCAAGACAGAAAGGTTCCATTTGATTTAACTCTGTGTGGATCAACCTTAAGGGCTCCTCATGGTTGCCATGTGCAATACATGGCAAACATGAATTGTAGTGCTTCTCTGGTCATGGCAGTTGTGCTGAATGACAATGATGAAGATGGAGGAGACAGTGATGCTGTTCAGCCACAAAAGAGAAGAAGACTCTGGGGTTTAGTGGTTTGCCATAACACTACTCCAAGGTTTGTTCCTTTT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GATCATGGGGAGGTTGTATCCGAGATTAGGAGGTCGGATTTGGAGCCATATTTG???GGTTTGCATTATCCTGCCACAGATATTCCTCAAGCCTCTCGCTTCTTGTCCAAGCAAAATCGCGTCAGGATGATTTGTGATTGCCATGCAAAGCCAGTTAAGGTCATTCAAAGTGAGGAGTTAAGGCAACCTCTTTGCTTGGTGAACTCAACCCTTAGGTCACCACATGTTTGCCACACACAGTATATGGCTAATATGGATTCAATTGCCTCTCTGGTGATGGCAATTATAGTCAATGGAAATGATACAACAAGGCTTTGGGGTTTGCTAGTTTGCCATCACACTTCACCGCGCTATGTGCCCTTCCCAGTTCGCTATGCCTGTGAGTTCCTAATGCAGGCATTTCCATTGCAGCTTTACATGGAGATTCAGTTGG?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Myrospermum_sousanum GATCATGGGGAGGTGGTCGCTGAGATCACAAAGTCAGGCCTAGAGCCATATCTGGGTTTGCACTATCCAGCCACTGATATTCCCCAGGCTGCACGTTTTTTATTTATGAAGAACAAGGTCCGCATGATAGTTGATTGTCATGCAAAACATGTGAAGGTTCTTCAAGATGAAAAACTCCCATTTGATTTAACTCTGTGTGGTTCAACCTTAAGGGCTCCTCATAGCTGCCATTTGCAATACATGGCGAACATGGATTCAATTGCTTCCCTGGTTCTGGCAGTTGTGGTCAATGACAGTGATGAAGATGGGGATAGCTCTGATGCTGTTCAACCTCAAAAGAGAAAGAGACTATGGGGTTTAGTAGTTTGCCATAACACTACTCCTAGGTTTGTTCCCTTTCCTCTAAGGTATGCTTGTGAATTTCTGGCCCAGGTATTTGCCATCCATGTGAACAAAGAATTTGAGCTAGAATATCAGATTATTGAGAAGAATATCCTGCGCACCCAGACACTCTTGTGTGATATGCTGATGCGAGATGCACCCCTAGGCATTGTATCACAGAGCCCT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CAAGCTGCTCGCTTCTTGTTCAAGCAAAACCGGGTCAGGATGATTTGTGATTGCTATGCAAAGCCTGTTAAGGTCATTCAGAGTGAAGAATTAAGGAGACCTCTTTGCTTGGTCAACTCAACCCTTAGGTCTCCACATGGTTGTCACACACAGTACATGGCTAACATGGGCTCAATTGCTTCTCTGGTAATGGCAGTTACAGTCAATGGAAATGATACAACTAGGCTTTGGGGTTTGCTAGTTTGTCATCACACTTCACCACGCTATGTG?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Ostryocarpus_stuhlmannii ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CAGGCTGCACGCTTTTTATTTATGAAGAACAAGGTCCGTATTATAGTTGATTGTCATGCAAAGCATGTGAAGGTTCTTCAAGATGAAAAACTCCCGCTTGATTTGACTTTGTGTGGTTCCACCTTAAGGGCTCCTCATAGTTGCCACTTGCAATACATGGCGAACATGGATTCAATTGCTTCCCTGTTTATGGCAGTTGTAGTCAATGACAATGAAGAAGATGGGGACAGCTCTGATGCTGTTCAGCCACAAAAGAGAAAGAGACTGTGGGGTTTGGTAGTTTGCCATAACACTACTCCCAGGTTTGTT??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GATCATGGAGAAGTGATTGCTGAGGTCAAAAAGCCTGGCCTAGAGCCTTATCTG???GGTTTGCACTATCCAGCCACTGATATTCCTCAGGCTACGCGCTTTTTATTTATGAAGAACAAGGTTCGTATGATAGTTGATTGTCGCGCAAAGCATGTGAATGTTCTTCAAGACAAAAAGGTTCCATTTGATTTAACTTTGTGTGGATCAACCTTAAGGGCTCCTCATAGTTGCCATTTGCAATACATGGAGAACATGAATTGTAGTGCTTCCTTGGTTATGGCAGTTGTGGTCAATGACAATGATGAAGATGGAGATAGT---GATGCTGTTCAGCCACAGAAGAGAAAAAGACTCTGGGGTTTAGTAGTTTGCCATAACACTACTCCCAGGTTTGTTCCTTTTCCACTTAGGTATGCCTGTGAATTCCTTGCTCAAGTATTTGCCATCCATGTGAACAAAGAACTAGAGTTAGAATATCAGATTGTTGAGAAGAATATCCTGCGGACTCAAACACTCTTGTGTGATATGCTGATGCGAGATGCGCCACTTGGCATTGTAACACAGAGGCCT???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CAAGCTTGTCGCTTCTTGTTCAAGCAAAACCGGGTCAGGATGATTTGTGATTGCCATGCAAAGCCGGTTAAGGTCATTCAGAGTGAGGAGTTAAGGCAACCTCTTTGCTTGGTGAACTCAACCCTTAGGTCACCACATGTTTGTCACACACAGTATATGGCTAACATGGGCTCAATTGCCTCTCTGGTTATGGCAATTATAGTCAATGGAAATGATACAACAAGACTTTGGGGTTTGCTAGTTTGTCATCACACTTCACCGCGCTATGCACCTTTCCCAGTTCGCTATGCTTGTGAGTTCCTAATGCAGGCTTTTGGATTGCAGCTTTACATGGAGATTCAGTTGGCATCACAGATGGCAGAGAAGAGAATGCTTAAAACACAAACCTTGCTGTGTGACATGCTCCTGCGTGATGCGCCTCTTGGTATTGTGACTCAATCCCCA Phaseolus_vulgaris ??????????????????????????????????????????????????????GGTTTGCATTATCCAGCCACTGATATTCCCCAAGCTTCACGCTTTTTATTTATGAAGAACAAGGTCCGTATGATAGTTGATTGTTACGCAAAACACGTGAAGGTTCTTCAAGATGAAAAACTCCCATTTGATTTGACTTTGTGTGGTTCAACCTTGAGGGCTCCTCATAGTTGTCATGCTCAATACATGGCAAACATGGATTCAATTGCTTCCCTGGTCATGGCAGTTGTAGTCAATGACAACGAAGAAGATGGGGAT---ACTGATGCTGTTCAACCACAAAAGAGGAAGAGACTTTGGGGTTTGGTAGTTTGCCATAACACTACTCCCAGGTTTGTTCCCTTTCCTCTTAGGTATGCTTGTGAATTTCTGGCTCAAGTATTTGCCATCCATGTGAACAAAGAAATAGAGTTAGAATACCAGATTATTGAGAAGAATATCCTGCGCACACAGACACTCTTGTGTGATATGCTGATGCGAGATGCACCCCTTGGAATTGTATCACAGAGCCCT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Platycyamus_regnellii 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Poecilanthe_falcata 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Poitea_carinalis 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Sesbania_emerus ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CAGGCTGCACGCTTTTTGTTTATGAAGAACAAGGTCCGTATGATAGTTGATTGTCATGCAAAACATGTGAAGGTTCTTCAAGATGAAAAGCTTCCATTTGATTTGACTTTGTGTGGCTCAACCTTAAGGGCTCCTCATAGTTGCCATTTGCAATACATGGCGAACATGGATTCAATTGCTTCCCTGGTTATGGCAGTTGTAGTCAATGACAGTGATGAAGATGGGGACAGCTCTGATGCAGTTCAGCCACAAAAGAGAAAGAGACTCTGGGGTTTGGTAGTTTGCCATAACACGACTCCCAGATTTGTT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CAGGCTACACGCTTTTTATTTATGAAGAACAAGGTCCGTATAATAGTTGATTGTAGTGCAAAGCATGTAAAGGTGATTCAAGACAAAAATATTCCATTTGATTTAACTTTGTGTGGATCAACCTTAAGGGCTCCTCATAGTTGCCATTTGCAATACATGGAGAACATGAAAGCAAGTGCTTCCCTGGTTATGGCAGTTGTGGTCAATGACAGCAATGAAGACGGTGATAGCTCTGATGCTGTTCAACCACAAAAGAGAAAGAGACTCTGGGGTTTGGTAGTTTGCCATAACACGACTCCCAGGTTTGTT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Tephrosia_villosa 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Tipuana_tipu 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Wisteria_floribunda ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CAGGCTGCACGCTTTTTATTTATGAAGGAACAAGGTGCGTATATAGTTGATTGTCATGCAAAACATGTGAAGGTTCTTCAAGATGAAAAACTCCCATTTGACTTGACTTTGTGCGGTTCAACCTTAAGGGCTCCCCACAGTTGCCATTTGCAATACATGGCAAACATGGATTCAATTGCTTCCTTGGTTATGGCAGTTGTAGTCAATGACAGTGATGAAGATGGAGATAGCCCTGATGCAGTTCATCCGCAAAAAAGAAAGAGACTCTGGGGTTTGGTAGTTTGCCATAACACTACTCCCAGGTTTGTT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CAGGCTACACGCTTTTTATTTATGAGGAACAAGGTCCGCATGATAGTTGATTGTCGTGCAAAGCATGTGAAGGTGCTTCAAGACAAAAAAATTCCATTTGATTTAACTTTTTGTGGATCAACCTTAAGGGCTCCTCATAGTTGCCATTTGCAATACATGGAGAACATGAATGCAAGTGCTTCCCTGGTTCTGGCAGTTGTGGTCAATGACAATGATGAAGATGAGGATAGCTCTAATGATGTTCAGCCGCAAAAGAGAAAGAGACTGTGGGGTTTAGTTGTTTGCCATCACATTACTCCCAGGTTTGTT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CAAGCTTCTCGGTTTTTGTTCAAGCAAAACCGGGTGAGGATGATTTGTGATTGCCATGCAAAGCCAGTTAAGGTCATTCAGAGTGAAGAGTTAAGGCAGCCTCTTTGCTTGGTCAACTCAACCCTCAGGTCACCACATGATTGTCACACACATTACATGGCTAACATGGGCTCAATTGCCTCTCTGGTGATGGCAGTTATAGTCAATGCAAATGATGCACCTAGGCTTTGGGGTTTGCTAGTTTGTCATCACACTTCACCGCGCTATGTG?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? ; END; BEGIN TREES; TITLE Tb6246; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Craibia_brevicaudata, 2 Pongamia_pinnata, 3 Butea_monosperma, 4 Millettia_thonningii, 5 Tipuana_tipu, 6 Sesbania_cochichinensis, 7 Sesbania_vesicaria, 8 Sesbania_emerus, 9 Poitea_carinalis, 10 Lennea_melanocarpa, 11 Lathyrus_odoratus, 12 Hybosema_robustum, 13 Hebestigma_cubense, 14 Clianthus_formosus, 15 Callerya_australis, 16 Dalbergia_sp, 17 Lonchocarpus_eriocarinalis, 18 Caragana_arborescens, 19 Wisteria_floribunda, 20 Lonchocarpus_phaseolifolius, 21 Ostryocarpus_stuhlmannii, 22 Carmichaelia_sp, 23 Chadsia_versicolor, 24 Bolusanthus_speciosus, 25 Pongamiopsis_amygdalina, 26 Callerya_reticulata, 27 Callerya_megasperma, 28 Callerya_atropurpurea, 29 Tephrosia_villosa, 30 Fordia_splendidissima, 31 Poecilanthe_falcata, 32 Dalbergiella_nyassae, 33 Austrosteenisia_blackii, 34 Dahlstedtia_pinnata, 35 Millettia_richardiana, 36 Lonchocarpus_spectabilis, 37 Platycyamus_regnellii, 38 Piscidia_piscipula, 39 Mundulea_sericea, 40 Millettia_grandis, 41 Coursetia_madrensis, 42 Phaseolus_vulgaris, 43 Glycine_max, 44 Millettia_dura, 45 Sophora_affinis, 46 Myrospermum_sousanum, 47 Derris_elliptica, 48 Cyclolobium_nutans, 49 Pisum_sativum; TREE Fig._4 = [&R] ((((((((49,11),14),28,(((27,15),19),18)),26),(41,22,13,(12,9),10,8,7,6))Hologalegina,((((((((((47,44,36,34,(25,21),20,17,4,2),35),38)'Derris-Lonchocarpus clade',((39,23),29)Tephrosia_clade),40),(32,3)),((43,42),33)),37),1),30)),((48,45),31),24,(16,5)),46); END;