#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on July 25, 2021; 19:05 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Hu J., Lavin M., Wojciechowski M., & Sanderson M. 2000. Phylogenetic systematics of the tribe Millettieae (Leguminosae) base on chloroplast trnK/matK sequences and its implications for evolutionary patterns in Papilionoideae. American Journal of Botany, 87(3): 418-430. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S890] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=62; TAXLABELS Abrus_precatorius Acosmium_panamensis Adesmia_volkmannii Aeschynomene_fasicularis Andira_galeottiana Astragalus_lonchocarpus Austrosteenisia_blackii Baphia_massiaensis Bolusanthus_speciosus Brachypterum_robusta Brongniartia_alamosana Callerya_atropurpurea Callerya_reticulata Capassa_violacea Caragana_arborescens Cladrastis_lutea Cyamopsis_senegalensis Cyclolobium_nutans Dalbergia_congestiflora Dalbergiella_nyasae Derris_laxiflora Fordia_splendidissima Galactia_striata Glycine_max Glycyrrhiza_lepidota Harpalyce_arborescens Indigofera_suffruticosa Lonchocarpus_lanceolatus Lotus_purshianus Machaerium_sp Melilotus_alba Millettia_dura Millettia_grandis Millettia_leptobotrya Millettia_thonningii Mundulea_sericea Myrospermum_frutescens Neodunnia_richardiana Ophrestia_radicosa Ormosia_formosana Ornithopus_compressus Ostryocarpus_stuhlmannii Paraderris_elliptica Phaseolus_coccineus Philenoptera_eriocalyx Philenoptera_laxiflora Piscidia_piscipula Pisum_sativum Platycyamus_regnellii Poecilanthe_parvifolia Pongamiopsis_amygdalina Psoralea_cinerea Pterocarpus_indicus Robinia_pseudoacacia Sophora_secundiflora Swainsona_pterostylis Swartzia_simplex Tephrosia_heckmanniana Vataireopsis_surinamensis Vigna_umbellata Wisteria_frutescens Wisteria_sinensis ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M98] TITLE 'trnK/matK'; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=3277; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Astragalus_lonchocarpus 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Baphia_massiaensis 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Cyamopsis_senegalensis 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Cyclolobium_nutans 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Dalbergiella_nyasae 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Derris_laxiflora 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Fordia_splendidissima 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Indigofera_suffruticosa 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Lonchocarpus_lanceolatus 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Lotus_purshianus 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Millettia_dura 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Millettia_grandis 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Millettia_leptobotrya 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Millettia_thonningii 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Myrospermum_frutescens 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Ostryocarpus_stuhlmannii 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Phaseolus_coccineus 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Philenoptera_laxiflora 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Piscidia_piscipula 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Pisum_sativum 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Platycyamus_regnellii 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Pterocarpus_indicus 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Tephrosia_heckmanniana 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Vataireopsis_surinamensis 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Vigna_umbellata 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Wisteria_frutescens ??????????????????????????????????????????GCT-CCATT-TTTTACACATTTCTATGAACTAATTGGTTCATCCATACCATCGGTAGGGTTTGTAAGACCACGAGTGATCCAGAAAGGAATGAATGGAAAAAGCAGCATGTCGTATCAA-----TGGCGAATT------------CTAAAAA-------TATTTCATT--CGTATT--------GGACCCGGCCTAAA-TTTTTGTTTG--AATTCTTGG----CTCGGAACAAAGGAA---TTCAGTTGGGTTGAATTAATA-AAGGGATAGAGCTTGGCTGCTCCAA-TTATA---GGGAAACAAAAAGCAACGAGCTTTCATTTTTA----------------ATTTGAATGATTACCCCATCTAA-----TTCTATGTTAAAAA-GAGATTAGTGCTTGCTGTGGAAAAAGTTTTTCCCACGAA-----CGGATT-ATGGA----TTTTTGTTATGAGTCCTAACTAT-TAGCTATTTTCCATT---ATG------------TTATGGGGTAGCGA-TAAATGTGT----AGAAGAAAGAGTATATTGATAAA-----GATATTTTTTTTT----------------------CCAAAA-TCAAAAGAGCGATTGG---GCAAAAAAA------------------------TAAAGGATTTCTAACTAGCTTGTTGTCCTAGAACAA-----------------------TTAGATGGAACAA----GCGAGGAGAGATAGTCCATTGATAAGTTTT-ACTTGTTTTC------TAGGTATCTATTCATA---------TTCGTTTTTT-------------ATTT--------GAATTCGAATACTAATATATA----------------------------------------------------------------------ATAGAGTACCCTG------TGATGACTGTATCGCACTATGTATC-ATTTGATAATCCAATGAATCTCTGATCC----TTTGACCAAA-----TAGAATTTCT------------AAAATGAAGGAATATCAAGTATATTTAGAACGA---GATAGATCTCGCCAACAGGACTTCCTATACCCACTTATTTTTCGGGAGTATATTTATGGACTTGCTTATAGTCATGATTTTAAT------AGATCCATTTTTGTGGAAAATGTAGGT---TATGACAAT---AAATCTAGTTTACTAATTGTAAAACGTTTAATTACTCGAATGTATCAACAGAATCATTTGATCATTTCCGCTAATGATTCTAACAAAAAT------CCATTTTTGGGGTATAATAAGAATTTTTATTCTCAAATAATATCAGACGGTTTTGCCGTCGTTGTGGAAATTCCATTTTTCCTACAATTAAGC------TCTTCCTTAGAGGAGGCAGAA---ATCGTAAAATCTTATCATAATTTGCGATCAATTCATTCCATTTTTCCCTTTTTGGAGGATAAATTTACATATTTAAATTATGTGTCAGATATACGAATACCCTATCCTATCCATCTGGAAATCTTAGTTCAAATCCTTCGATACTGGGTGAAAGATGCCTCCTTTTTTCATTTATTACGGTTTTTTCTTTATCATTTT------TCTAATAGGAATAGT------------CTTATTACTCCA---------AAAAAATCGATTTCTACCTTTTCA------AAAAGTAATCCAAGATTATTCTTGTTCCTCTATAATTTTTATGTATGTGAATATGAATCTATCTTCCGTTTTCTACGTAACCAATCCTCTCATTTACGATTAAAATCTTTTAGCGTTTTTTTTGAGCGAATCTTTTTTTATGCAAAAAGAGAACATCTTGTAAAAGTTTTTCCTAAGGATTTTTCGTCTACCTTAACATTCTTCAAG------GATCCTTTCATTCATTATGTTAGATATCAAGGAAAATCCATTCTGGCTTCAAAGAATGCGCCTCTTTTGATGAATAAATGGAAACACTATTTTATCCATTTATGGCAATGTTTTTTTGATGTTTGGTCTCAACCAGGAACGATCCATATAAACCAATTA---TCCGAACATTCA---------TTTCACTTTTTA------GGCTATTTTTCAAATGTGCGGCTAAATCGTTCAGTGGTACGGAGTCAAATGCTGCAAAATACATTTCTAATCGAAATTGTTATCAAAAAGCTTGATATAATAGTTCCAATTATTCCTCTAATTAGATCATTGGCTAAAGCGAAATTTTGTAATGTATTAGGGCATCCCCTTAGTAAGTCGGTCTGGGCCGATTCATCCGATTTTGATATTATTGACCGATTTTTGCGAATATGCAGAAATCTTTCTCATTATTACAATGGATCCTCAAAAAAAAAAAATTTGTATCGAATAAAATATATACTTCGGCTTTCTTGTATTAAAACTTTGGCTTGTAAACACAAAAGTACTGTACGCGCTTTTTTGAAAAAATCTGGTTCAGAAGAATTATTGGAAGAATTCTTT---ACAGAGGAAGAAGAGATTCTTTCTTTGATTTTT------CCAAGAACTTCTTCTACTTTGCAGAGATTACATAGAAATCGGATTTGGTATTTGGATATTCTT---TTCAGCAAC------GAT------TTGGTCAAT---CATGAATGA-----------------------TTGGTTATGTTATGAGACTTTGTAAATGA-----------------------------------------GTAAATGGAAA-TTATCCTT-------AAATGAAGATAAGAAAA--------------------TTCATTCATTTCT----------ATTAGTATTCTAT---------------------------ATCTATAGGA-----TTATGAAA------------TGTTCATGTA---TGTAATAAG-----AGTGG-AGT------TTCAAGA-------------TTCCTCAATTGAG-----TATTTAA-----------CTTTCTT-----ATAGTCTTGT---TCTGGGAAAGT----AACTC-----AGGTTTAGATGTA----TACATAGGGAAAGCCGTGTGCAATGAAAAATGCAAGCACGGCTTGGGGAGGGATTTTTTCTTGTTTTATTTTTT-AAATTTGATTAAACATGATGA????????????????????????????????????? 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END; BEGIN TREES; TITLE Tb6254; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Pisum_sativum, 2 Melilotus_alba, 3 Caragana_arborescens, 4 Astragalus_lonchocarpus, 5 Swainsona_pterostylis, 6 Callerya_atropurpurea, 7 Callerya_reticulata, 8 Wisteria_sinensis, 9 Wisteria_frutescens, 10 Glycyrrhiza_lepidota, 11 Lotus_purshianus, 12 Robinia_pseudoacacia, 13 Ornithopus_compressus, 14 Neodunnia_richardiana, 15 Millettia_leptobotrya, 16 Millettia_grandis, 17 Millettia_thonningii, 18 Millettia_dura, 19 Philenoptera_laxiflora, 20 Philenoptera_eriocalyx, 21 Capassa_violacea, 22 Fordia_splendidissima, 23 Lonchocarpus_lanceolatus, 24 Brachypterum_robusta, 25 Derris_laxiflora, 26 Paraderris_elliptica, 27 Mundulea_sericea, 28 Tephrosia_heckmanniana, 29 Pongamiopsis_amygdalina, 30 Piscidia_piscipula, 31 Platycyamus_regnellii, 32 Ostryocarpus_stuhlmannii, 33 Austrosteenisia_blackii, 34 Dalbergiella_nyasae, 35 Abrus_precatorius, 36 Galactia_striata, 37 Ophrestia_radicosa, 38 Phaseolus_coccineus, 39 Vigna_umbellata, 40 Glycine_max, 41 Psoralea_cinerea, 42 Cyamopsis_senegalensis, 43 Indigofera_suffruticosa, 44 Dalbergia_congestiflora, 45 Aeschynomene_fasicularis, 46 Cladrastis_lutea, 47 Sophora_secundiflora, 48 Machaerium_sp, 49 Pterocarpus_indicus, 50 Adesmia_volkmannii, 51 Harpalyce_arborescens, 52 Brongniartia_alamosana, 53 Poecilanthe_parvifolia, 54 Cyclolobium_nutans, 55 Bolusanthus_speciosus, 56 Acosmium_panamensis, 57 Baphia_massiaensis, 58 Ormosia_formosana, 59 Andira_galeottiana, 60 Vataireopsis_surinamensis, 61 Myrospermum_frutescens, 62 Swartzia_simplex; TREE 'Fig. 1, 2' = [&R] (62,(61,(((60,59),(58,((56,(((54,52),51),53)),55)),(57,(50,(49,((48,45),44)))),47,(((43,42),(((((((41,(40,37)),(39,38)),31),((36,(((30,(((29,14),17),(((26,25),(24,22)),(23,18)))),(28,27))core_Millettieae_Clade_A,(((21,(20,19)),16),15))core_Millettieae),35)),33),34),32)),(((13,11),12),(10,((9,8),7),6,(((5,4),3),(2,1)))IRLC)Hologalegina))'Millettieae trnK/matK 50-Kb inversion',46))); END;