#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on September 18, 2025; 22:08 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Hansen A., Gilbert L., Simpson B., Downie S., Cervi A., & Jansen R.K. 2006. Phylogenetic Relationships and Chromosome Number Evolution in Passiflora. Systematic Botany, 31(1): 138-150. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S10863] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=61; TAXLABELS Adenia_sp. Dilkea_sp. Passiflora_actinia Passiflora_acuminata Passiflora_affinis Passiflora_alata Passiflora_ampullacea Passiflora_andina Passiflora_antioquiensis Passiflora_aurantia Passiflora_auriculata Passiflora_biflora Passiflora_campanulata Passiflora_candida Passiflora_candollei Passiflora_ciliata Passiflora_cirrhiflora Passiflora_coccinea Passiflora_crenata Passiflora_cumbalensis Passiflora_deidamioides Passiflora_edulis_Inter Passiflora_garckei Passiflora_glandulosa Passiflora_guatemalensis Passiflora_herbertiana Passiflora_holosericea Passiflora_kawensis Passiflora_lancetillensis Passiflora_laurifolia Passiflora_ligularis Passiflora_magnifica Passiflora_maliformis Passiflora_manicata Passiflora_menispermifolia Passiflora_microstipula Passiflora_microstipula100 Passiflora_microstipula100a Passiflora_miersii Passiflora_multiflora Passiflora_murucuja Passiflora_nitida Passiflora_oblongata Passiflora_palmeri Passiflora_parritae Passiflora_perfoliata Passiflora_pittieri Passiflora_platyloba Passiflora_racemosa Passiflora_reflexiflora Passiflora_seemannii Passiflora_serratodigitata Passiflora_speciosa Passiflora_trialata Passiflora_trifoliata Passiflora_trisecta Passiflora_vespertilio Passiflora_villosa Passiflora_vitifolia Tetrapathea_tetrandra Tetrastylis_ovalis ; END; BEGIN TREES; TITLE 'D: cpDNA, gaps excluded, indels scored'; LINK TAXA = Taxa; TREE Fig._D = [&R] (((((((((((((((((((Passiflora_alata,Passiflora_trialata),Passiflora_edulis_Inter),(Passiflora_trifoliata,Passiflora_trisecta)),(Passiflora_nitida,Passiflora_microstipula100,Passiflora_microstipula)),Passiflora_reflexiflora),Passiflora_racemosa),Passiflora_speciosa),(((Passiflora_andina,Passiflora_antioquiensis),Passiflora_ampullacea,Passiflora_parritae),(Passiflora_cumbalensis,Passiflora_manicata))),((((Passiflora_magnifica,Passiflora_ligularis),Passiflora_serratodigitata),Passiflora_platyloba),(Passiflora_seemannii,Passiflora_maliformis))),(Passiflora_laurifolia,(Passiflora_crenata,Passiflora_acuminata),(Passiflora_palmeri,Passiflora_ciliata))),Passiflora_coccinea),Passiflora_campanulata),((((Passiflora_garckei,Passiflora_menispermifolia),Passiflora_miersii),(Passiflora_glandulosa,Passiflora_actinia)),Passiflora_villosa)),Passiflora_vitifolia),((Passiflora_pittieri,Passiflora_kawensis),Passiflora_candida)),((Passiflora_microstipula100a,Passiflora_lancetillensis),(((((Passiflora_holosericea,Passiflora_auriculata),((Passiflora_perfoliata,(Passiflora_candollei,Passiflora_vespertilio),Passiflora_oblongata,Passiflora_biflora,Passiflora_murucuja),Passiflora_affinis)),Passiflora_multiflora),(Passiflora_herbertiana,Passiflora_aurantia)),Passiflora_guatemalensis))),(Dilkea_sp.,Tetrapathea_tetrandra)),((Tetrastylis_ovalis,Passiflora_deidamioides),Passiflora_cirrhiflora)),Adenia_sp.); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr21527] END;