#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on September 18, 2025; 17:18 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Plume O., Straub S.C., Tel-zur N., Cisneros A., Schneider B., & Doyle J. 2013. Testing a Hypothesis of Intergeneric Allopolyploidy in Vine Cacti (Cactaceae: Hylocereeae). Systematic Botany, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S13843] BEGIN TAXA; TITLE Hylocereae_ITSC1_Taxa_for_Analyses; DIMENSIONS NTAX=243; TAXLABELS Aporberocereus_innesii_208AINN1 Aporberocereus_innesii_208AINN2 Aporberocereus_innesii_208a Aporberocereus_innesii_208b1 Aporberocereus_innesii_208b2 Aporberocereus_innesii_208c1 Aporberocereus_innesii_208c2 Aporberocereus_innesii_208c5 Aporberocereus_innesii_208c8 Aporberocereus_innesii_208d2 Aporberocereus_innesii_208e Aporberocereus_innesii_208f2 Aporberocereus_innesii_208g1 Aporberocereus_innesii_208h Hylocereus_bronxensis_178_Hylocereus_guatemalensis_6_Hylocereus_ocamponis_14_HOCA1_ Hylocereus_bronxensis_178HBRO1 Hylocereus_bronxensis_178HBRO2 Hylocereus_bronxensis_178a2 Hylocereus_bronxensis_178d1 Hylocereus_bronxensis_178e2g2 Hylocereus_costaricensis_3 Hylocereus_costaricensis_35_Hylocereus_monacanthus__9_78_Hylocereus_undatus_28_HMON1_ Hylocereus_costaricensis_35_Hylocereus_monacanthus_10_19_HMON3_ Hylocereus_costaricensis_35c5 Hylocereus_costaricensis_35c6 Hylocereus_costaricensis_35d7 Hylocereus_costaricensis_35e Hylocereus_costaricensis_35f7 Hylocereus_costaricensis_35hF Hylocereus_costaricensis_4a Hylocereus_costaricensis_4c Hylocereus_costaricensis_4d Hylocereus_costaricensis_4f Hylocereus_costaricensis_4g Hylocereus_costaricensis_4h Hylocereus_costaricensis_4hVV Hylocereus_escuintlensis_179HESC1 Hylocereus_esquintlensis_179HESC2 Hylocereus_esquintlensis_179a2 Hylocereus_esquintlensis_179b2 Hylocereus_esquintlensis_179c Hylocereus_esquintlensis_179h2 Hylocereus_guatemalensis_6het1a Hylocereus_megalanthus_133_134_138_143r_144_146_152_HMEG1_ Hylocereus_megalanthus_133_134_143r_152_159_HMEG2_ Hylocereus_megalanthus_133a11 Hylocereus_megalanthus_133a12 Hylocereus_megalanthus_133d12 Hylocereus_megalanthus_133e12 Hylocereus_megalanthus_133f12 Hylocereus_megalanthus_133g11 Hylocereus_megalanthus_134_138_143r_152_HMEG5_ Hylocereus_megalanthus_134_138_152_HMEG4_ Hylocereus_megalanthus_134_138_HMEG6_ Hylocereus_megalanthus_134_143r_152_HMEG3_ Hylocereus_megalanthus_134_143r_HMEG7_ Hylocereus_megalanthus_134a3 Hylocereus_megalanthus_134b Hylocereus_megalanthus_134b4 Hylocereus_megalanthus_134c2 Hylocereus_megalanthus_134c3 Hylocereus_megalanthus_134d2 Hylocereus_megalanthus_134d4 Hylocereus_megalanthus_134e4 Hylocereus_megalanthus_134f Hylocereus_megalanthus_134g4h3 Hylocereus_megalanthus_134h2 Hylocereus_megalanthus_138e2 Hylocereus_megalanthus_143r_144_HMEG8_ Hylocereus_megalanthus_143r_144_HMEG9_ Hylocereus_megalanthus_143r_152_HMEG10_ Hylocereus_megalanthus_143rc2 Hylocereus_megalanthus_143rc7 Hylocereus_megalanthus_143rc8 Hylocereus_megalanthus_143rf Hylocereus_megalanthus_143rf7 Hylocereus_megalanthus_143rg Hylocereus_megalanthus_143rh7 Hylocereus_megalanthus_144b1 Hylocereus_megalanthus_144b2 Hylocereus_megalanthus_144c1c2 Hylocereus_megalanthus_144d1 Hylocereus_megalanthus_144d2 Hylocereus_megalanthus_144e1 Hylocereus_megalanthus_144f1 Hylocereus_megalanthus_146D7 Hylocereus_megalanthus_152a4 Hylocereus_megalanthus_152b10 Hylocereus_megalanthus_152c4a Hylocereus_megalanthus_152c4b Hylocereus_megalanthus_152d10 Hylocereus_megalanthus_152d9 Hylocereus_megalanthus_152e10 Hylocereus_megalanthus_152g6 Hylocereus_monacanthus_10het1c Hylocereus_monacanthus_112het1a Hylocereus_monacanthus_112het1g Hylocereus_monacanthus_11c Hylocereus_monacanthus_11d Hylocereus_monacanthus_12G3H3 Hylocereus_monacanthus_12H1 Hylocereus_monacanthus_12ds4 Hylocereus_monacanthus_13_78_Hylocereus_undatus_28_HMON2_ Hylocereus_monacanthus_19a7 Hylocereus_monacanthus_19a9 Hylocereus_monacanthus_19b9 Hylocereus_monacanthus_19c7 Hylocereus_monacanthus_19f7 Hylocereus_monacanthus_19g7 Hylocereus_monacanthus_19g8 Hylocereus_monacanthus_78a Hylocereus_monacanthus_78c Hylocereus_monacanthus_78e Hylocereus_monacanthus_78f Hylocereus_monacanthus_78g Hylocereus_monacanthus_7het1t Hylocereus_monacanthus_93_Hylocereus_ocamponis_8_HOCA2_ Hylocereus_monacanthus_93_Hylocereus_sp_1_15_Hylocereus_undatus_22_HSP1_ Hylocereus_monacanthus_9f Hylocereus_ocamponis_8b Hylocereus_ocamponis_8c Hylocereus_ocamponis_8e Hylocereus_ocamponis_8f Hylocereus_ocamponis_8g Hylocereus_sp_1_15_Hylocereus_undatus_22_HSP2_ Hylocereus_sp_108E Hylocereus_sp_108hA Hylocereus_sp_108hN Hylocereus_sp_15b Hylocereus_sp_15e Hylocereus_sp_1f Hylocereus_sp_1h Hylocereus_triangularis_18 Hylocereus_undatus_20b2 Hylocereus_undatus_20d2 Hylocereus_undatus_20e2 Hylocereus_undatus_20f Hylocereus_undatus_20h Hylocereus_undatus_21c42 Hylocereus_undatus_21x2 Hylocereus_undatus_25_40_117_HUND1_ Hylocereus_undatus_26a2 Hylocereus_undatus_26b Hylocereus_undatus_26b2 Hylocereus_undatus_26c Hylocereus_undatus_26c2 Hylocereus_undatus_26c3 Hylocereus_undatus_26d2 Hylocereus_undatus_26e Hylocereus_undatus_26f Hylocereus_undatus_26g Hylocereus_undatus_26h3 Hylocereus_undatus_26hL Hylocereus_undatus_27_42_43_HUND2_ Hylocereus_undatus_33_62_HUND4_ Hylocereus_undatus_36_88_91_HUND5_ Hylocereus_undatus_38b Hylocereus_undatus_38c2 Hylocereus_undatus_38e Hylocereus_undatus_40d Hylocereus_undatus_40e Hylocereus_undatus_40f Hylocereus_undatus_40g Hylocereus_undatus_40h Hylocereus_undatus_42_Hylocereus_sp_108_HUND3_ Hylocereus_undatus_42d Hylocereus_undatus_42e Hylocereus_undatus_42g Hylocereus_undatus_44_Hylocereus_monacanthus_7_HUND6_ Hylocereus_undatus_44a Hylocereus_undatus_44d Hylocereus_undatus_44f Hylocereus_undatus_44g Hylocereus_undatus_44h Hylocereus_undatus_91het1a Hylocereus_undatus_HZAB1 Pachycereus_pringlei_CC4ha Pachycereus_pringlei_CC4hb Selenicereus_atropilosus_206SATR1 Selenicereus_atropilosus_206SATR2 Selenicereus_atropilosus_206c11 Selenicereus_atropilosus_206c15 Selenicereus_atropilosus_206c3 Selenicereus_atropilosus_206c9 Selenicereus_grandiflorus_subsp_donckelaari_207SGDON1 Selenicereus_grandiflorus_subsp_donckelaari_207SGDON2 Selenicereus_grandiflorus_subsp_donckelaari_207SGDON3 Selenicereus_grandiflorus_subsp_donckelaari_207a Selenicereus_grandiflorus_subsp_donckelaari_207f2 Selenicereus_grandiflorus_subsp_donckelaari_207h Selenicereus_grandiflorus_subsp_donckelaari_207h2 Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_195c10 Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_195c12 Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_195c13 Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_195c19 Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_195c23 Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_195c4 Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_195c6 Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_195ds13 Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_198_Selenicereus_pteranthus_203_SGRA1_ Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_198SGRA2 Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_198c13 Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_198c16 Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_198c17 Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_198c18 Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_198c19 Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_198c2 Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_198c20 Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_198c4 Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_198c5 Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_198c7 Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_198c8 Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_198c9 Selenicereus_hamatus_204 Selenicereus_inermis_209SINE1 Selenicereus_inermis_209SINE2 Selenicereus_inermis_209d Selenicereus_inermis_209e Selenicereus_inermis_209h Selenicereus_inermis_214SINE3 Selenicereus_inermis_214SINE4 Selenicereus_pteranthus_200SPTE1 Selenicereus_pteranthus_200SPTE2 Selenicereus_pteranthus_200a Selenicereus_pteranthus_200b Selenicereus_pteranthus_200d Selenicereus_pteranthus_200e Selenicereus_pteranthus_200g Selenicereus_sp_210_SSP1 Selenicereus_sp_210_SSP2 Selenicereus_sp_210a2 Selenicereus_sp_210b Selenicereus_sp_210f Selenicereus_sp_210h Selenicereus_spinulosus_211r_SSPI1 Selenicereus_spinulosus_211rc12 Selenicereus_spinulosus_211rf12 Selenicereus_spinulosus_211rg11 Selenicereus_vagans_213rc12 Selenicereus_vagans_213rc20 Selenicereus_vagans_213rc5 Stenocereus_griseus_CC2ha Stenocereus_griseus_CC2hb ; END; BEGIN TREES; TITLE ITSC1_Parsimony_Strict_Consensus; LINK TAXA = Hylocereae_ITSC1_Taxa_for_Analyses; TREE ITSC1_Parsimony = [&R] (Stenocereus_griseus_CC2ha,(Stenocereus_griseus_CC2hb,((Pachycereus_pringlei_CC4ha,Pachycereus_pringlei_CC4hb),(Aporberocereus_innesii_208e,Aporberocereus_innesii_208h,Aporberocereus_innesii_208b2,Aporberocereus_innesii_208a,Aporberocereus_innesii_208c5,Aporberocereus_innesii_208AINN2,(Selenicereus_atropilosus_206c15,Selenicereus_atropilosus_206c11,Selenicereus_atropilosus_206c3,Selenicereus_atropilosus_206SATR1,(Selenicereus_atropilosus_206c9,Selenicereus_atropilosus_206SATR2)),(Aporberocereus_innesii_208c1,Aporberocereus_innesii_208f2,Aporberocereus_innesii_208g1,Aporberocereus_innesii_208c8,Aporberocereus_innesii_208b1,Aporberocereus_innesii_208AINN1),(Aporberocereus_innesii_208c2,Aporberocereus_innesii_208d2),((((Selenicereus_sp_210a2,Selenicereus_spinulosus_211rf12,Selenicereus_spinulosus_211rc12,Selenicereus_spinulosus_211r_SSPI1,Selenicereus_spinulosus_211rg11,Selenicereus_sp_210h,Selenicereus_sp_210_SSP1,Selenicereus_sp_210b,Selenicereus_sp_210_SSP2,Selenicereus_sp_210f,Selenicereus_vagans_213rc12,Selenicereus_vagans_213rc20,Selenicereus_vagans_213rc5),(Selenicereus_pteranthus_200g,(Selenicereus_hamatus_204,Selenicereus_pteranthus_200SPTE1))),(((Selenicereus_inermis_214SINE4,Selenicereus_inermis_214SINE3),(Selenicereus_inermis_209SINE2,(Selenicereus_inermis_209e,(Selenicereus_inermis_209h,Selenicereus_inermis_209SINE1,Selenicereus_inermis_209d)))),(((Selenicereus_grandiflorus_subsp_donckelaari_207f2,Selenicereus_grandiflorus_subsp_donckelaari_207a,Selenicereus_grandiflorus_subsp_donckelaari_207SGDON1,Selenicereus_grandiflorus_subsp_donckelaari_207h),(Selenicereus_grandiflorus_subsp_donckelaari_207SGDON3,(Selenicereus_grandiflorus_subsp_donckelaari_207h2,Selenicereus_grandiflorus_subsp_donckelaari_207SGDON2))),(Selenicereus_pteranthus_200b,Selenicereus_pteranthus_200SPTE2,Selenicereus_pteranthus_200a,Selenicereus_pteranthus_200d,Selenicereus_pteranthus_200e,(Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_198c4,Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_198c18,Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_198c16,Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_198c17,Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_198c20,Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_198c7,Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_198SGRA2,(Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_195c10,Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_195c12,Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_195c13,Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_195c19,Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_195c6,Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_195c23,Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_195c4,Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_195ds13),(Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_198c8,Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_198c5,(Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_198c9,Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_198c13,Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_198c19,Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_198c2,Selenicereus_grandiflorus_subsp_grandiflorus_198_Selenicereus_pteranthus_203_SGRA1_))))))),(((Hylocereus_costaricensis_4a,Hylocereus_costaricensis_4d,Hylocereus_costaricensis_4g,(Hylocereus_monacanthus_112het1a,Hylocereus_monacanthus_112het1g),(Hylocereus_costaricensis_4hVV,Hylocereus_costaricensis_4h)),((Hylocereus_triangularis_18,(((Hylocereus_undatus_21x2,Hylocereus_undatus_21c42),(Hylocereus_undatus_40g,Hylocereus_undatus_40d)),(Hylocereus_monacanthus_11d,Hylocereus_sp_1h,Hylocereus_sp_1f,Hylocereus_monacanthus_93_Hylocereus_sp_1_15_Hylocereus_undatus_22_HSP1_,(Hylocereus_esquintlensis_179a2,((Hylocereus_escuintlensis_179HESC1,(Hylocereus_esquintlensis_179c,Hylocereus_esquintlensis_179HESC2)),(Hylocereus_monacanthus_11c,(Hylocereus_costaricensis_4f,Hylocereus_costaricensis_4c,Hylocereus_costaricensis_3,Hylocereus_monacanthus_9f)),(Hylocereus_costaricensis_35c5,Hylocereus_monacanthus_78g,Hylocereus_costaricensis_35c6,Hylocereus_costaricensis_35_Hylocereus_monacanthus__9_78_Hylocereus_undatus_28_HMON1_,(Hylocereus_monacanthus_78c,(Hylocereus_monacanthus_78f,Hylocereus_monacanthus_78e,Hylocereus_monacanthus_78a,Hylocereus_monacanthus_13_78_Hylocereus_undatus_28_HMON2_)),(Hylocereus_costaricensis_35d7,Hylocereus_costaricensis_35f7)),(Hylocereus_monacanthus_19g7,Hylocereus_monacanthus_19a9,Hylocereus_monacanthus_19g8,Hylocereus_monacanthus_19c7,Hylocereus_monacanthus_19a7,Hylocereus_monacanthus_19f7,Hylocereus_monacanthus_19b9,Hylocereus_monacanthus_10het1c,Hylocereus_costaricensis_35_Hylocereus_monacanthus_10_19_HMON3_,(Hylocereus_costaricensis_35e,Hylocereus_costaricensis_35hF)))),(Hylocereus_monacanthus_12H1,Hylocereus_monacanthus_12G3H3,Hylocereus_monacanthus_12ds4),(Hylocereus_esquintlensis_179h2,Hylocereus_esquintlensis_179b2),(Hylocereus_sp_15b,Hylocereus_sp_15e,Hylocereus_sp_1_15_Hylocereus_undatus_22_HSP2_))),((Hylocereus_undatus_26b2,(Hylocereus_undatus_26b,(Hylocereus_undatus_26h3,(Hylocereus_undatus_40e,(Hylocereus_undatus_20f,Hylocereus_undatus_20b2,Hylocereus_undatus_33_62_HUND4_,Hylocereus_undatus_40f,Hylocereus_undatus_40h,Hylocereus_undatus_25_40_117_HUND1_,Hylocereus_undatus_38c2,Hylocereus_undatus_HZAB1,(Hylocereus_undatus_26c,Hylocereus_undatus_26c2,Hylocereus_undatus_26c3,Hylocereus_undatus_26g,Hylocereus_undatus_26e,(Hylocereus_undatus_26d2,Hylocereus_undatus_26a2)))))),(Hylocereus_undatus_26hL,Hylocereus_undatus_26f)),(Hylocereus_undatus_42d,Hylocereus_undatus_44f,Hylocereus_undatus_44g,Hylocereus_undatus_44h,Hylocereus_undatus_44a,Hylocereus_monacanthus_7het1t,Hylocereus_undatus_42_Hylocereus_sp_108_HUND3_,Hylocereus_undatus_44_Hylocereus_monacanthus_7_HUND6_,(Hylocereus_sp_108hN,Hylocereus_undatus_44d,(Hylocereus_sp_108hA,Hylocereus_sp_108E),(Hylocereus_undatus_20h,Hylocereus_undatus_20d2,Hylocereus_undatus_20e2)),(Hylocereus_undatus_38e,Hylocereus_undatus_38b,Hylocereus_undatus_91het1a,Hylocereus_undatus_36_88_91_HUND5_,(Hylocereus_undatus_42e,Hylocereus_undatus_42g,Hylocereus_undatus_27_42_43_HUND2_))))),(Hylocereus_megalanthus_143rc2,Hylocereus_megalanthus_133e12,Hylocereus_megalanthus_143rg,Hylocereus_megalanthus_152c4a,Hylocereus_megalanthus_152a4,Hylocereus_megalanthus_134a3,Hylocereus_megalanthus_143rf7,Hylocereus_megalanthus_133d12,Hylocereus_megalanthus_134b,Hylocereus_megalanthus_134d2,Hylocereus_megalanthus_138e2,Hylocereus_megalanthus_144d2,Hylocereus_megalanthus_133a12,Hylocereus_megalanthus_133a11,Hylocereus_megalanthus_144e1,Hylocereus_megalanthus_143rc7,Hylocereus_megalanthus_152g6,Hylocereus_megalanthus_133f12,Hylocereus_megalanthus_134c2,Hylocereus_megalanthus_143r_152_HMEG10_,Hylocereus_megalanthus_143r_144_HMEG8_,Hylocereus_megalanthus_134e4,Hylocereus_megalanthus_152d9,Hylocereus_megalanthus_133_134_143r_152_159_HMEG2_,Hylocereus_megalanthus_152c4b,Hylocereus_megalanthus_144b1,Hylocereus_megalanthus_152b10,Hylocereus_megalanthus_133g11,Hylocereus_megalanthus_134f,Hylocereus_megalanthus_143rh7,Hylocereus_megalanthus_143r_144_HMEG9_,Hylocereus_megalanthus_144f1,Hylocereus_megalanthus_144d1,Hylocereus_megalanthus_134_138_HMEG6_,Hylocereus_megalanthus_134c3,Hylocereus_megalanthus_134b4,Hylocereus_megalanthus_134d4,Hylocereus_megalanthus_152d10,Hylocereus_megalanthus_146D7,Hylocereus_megalanthus_134g4h3,Hylocereus_megalanthus_144b2,Hylocereus_megalanthus_143rc8,Hylocereus_megalanthus_134_138_152_HMEG4_,Hylocereus_megalanthus_134h2,Hylocereus_megalanthus_133_134_138_143r_144_146_152_HMEG1_,Hylocereus_megalanthus_134_143r_HMEG7_,Hylocereus_megalanthus_143rf,Hylocereus_megalanthus_134_143r_152_HMEG3_,Hylocereus_megalanthus_144c1c2,Hylocereus_megalanthus_152e10,Hylocereus_megalanthus_134_138_143r_152_HMEG5_))),((Hylocereus_bronxensis_178a2,Hylocereus_bronxensis_178e2g2,Hylocereus_bronxensis_178d1,Hylocereus_guatemalensis_6het1a,Hylocereus_bronxensis_178HBRO2,Hylocereus_bronxensis_178HBRO1,Hylocereus_bronxensis_178_Hylocereus_guatemalensis_6_Hylocereus_ocamponis_14_HOCA1_),((Hylocereus_ocamponis_8f,Hylocereus_monacanthus_93_Hylocereus_ocamponis_8_HOCA2_),(Hylocereus_ocamponis_8b,Hylocereus_ocamponis_8c,(Hylocereus_ocamponis_8e,Hylocereus_ocamponis_8g)))))))))); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr60634] END;