#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on September 18, 2025; 23:51 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Triplett J.K., & Clark L. 2014. Hybridization defines major patterns of diversity in the temperate bamboos (Poaceae: Bambusoideae: Arundinarieae). Systematic Botany, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S16116] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=202; TAXLABELS Arundinaria_appalachiana_99 Arundinaria_funghomii_10 Arundinaria_gigantea_197 Arundinaria_gigantea_291 Arundinaria_tecta_173 Hibanobambusa_tranquillans_072 Hibanobambusa_tranquillans_205 Phyllostachys_aurea_120 Phyllostachys_bambusoides_121 Phyllostachys_edulis_KMBG04 Phyllostachys_heteroclada_119 Phyllostachys_nigra_KMBG07 Pleioblastus_aff_amarus_124 Pleioblastus_aff_argenteostriatus_353_INT_nez1 Pleioblastus_aff_argenteostriatus_359 Pleioblastus_aff_argenteostriatus_378 Pleioblastus_aff_chino_373_INT_med Pleioblastus_aff_chino_402_INT_med Pleioblastus_aff_chino_412_INT_med Pleioblastus_aff_chino_villosus_398_INT_med Pleioblastus_aff_kongosanensis_364_INT Pleioblastus_aff_kongosanensis_367_INT_nez1 Pleioblastus_aff_kongosanensis_370_INT_nez1 Pleioblastus_aff_simonii_323_int Pleioblastus_aff_simonii_382_INT Pleioblastus_aff_simonii_383_INT_nez1 Pleioblastus_aff_variegatus_361 Pleioblastus_aff_variegatus_375_INT_nez1 Pleioblastus_aff_variegatus_385_INT_nez1 Pleioblastus_aff_variegatus_386_INT_med Pleioblastus_aff_variegatus_387 Pleioblastus_aff_variegatus_Fukuda_INT_nez1 Pleioblastus_aff_viridistriatus_414 Pleioblastus_amarus_Z07082 Pleioblastus_argenteostriatus_204 Pleioblastus_argenteostriatus_31 Pleioblastus_argenteostriatus_glaber_66_INT_nez1 Pleioblastus_chino_11 Pleioblastus_chino_14 Pleioblastus_chino_297 Pleioblastus_chino_301 Pleioblastus_chino_302 Pleioblastus_chino_304_INT_nez2 Pleioblastus_chino_305 Pleioblastus_chino_307 Pleioblastus_chino_309_INT_nez2 Pleioblastus_chino_310 Pleioblastus_chino_313_INT_nez2 Pleioblastus_chino_315 Pleioblastus_chino_316 Pleioblastus_chino_73 Pleioblastus_chino_Gracilis_49_nez1x2 Pleioblastus_chino_Kimmei_40 Pleioblastus_chino_Murakamianus_32 Pleioblastus_chino_Variegatus_129 Pleioblastus_chino_Variegatus_236 Pleioblastus_chino_vaginatus_415_INT_nez2 Pleioblastus_chino_vaginatus_419_INT_nez2 Pleioblastus_chino_vaginatus_420 Pleioblastus_gauntlettii_145 Pleioblastus_gozadakensis_337 Pleioblastus_gozadakensis_338 Pleioblastus_gozadakensis_342 Pleioblastus_gozadakensis_343 Pleioblastus_gozadakensis_344 Pleioblastus_gramineus_329 Pleioblastus_gramineus_348 Pleioblastus_gramineus_35 Pleioblastus_gramineus_36 Pleioblastus_gramineus_58 Pleioblastus_gramineus_59 Pleioblastus_hindsii_229 Pleioblastus_hindsii_331 Pleioblastus_hindsii_335 Pleioblastus_hindsii_339 Pleioblastus_hindsii_341 Pleioblastus_hindsii_346 Pleioblastus_hindsii_39 Pleioblastus_hindsii_408 Pleioblastus_hindsii_411 Pleioblastus_hindsii_65 Pleioblastus_humilis_158 Pleioblastus_humilis_219 Pleioblastus_humilis_41 Pleioblastus_intermedius_Z06188 Pleioblastus_juxianensis_117 Pleioblastus_juxianensis_43 Pleioblastus_kongosanensis_366 Pleioblastus_kongosanensis_68 Pleioblastus_kongosanensis_74 Pleioblastus_kongosanensis_Aureostriatus_46 Pleioblastus_linearis_328 Pleioblastus_linearis_349 Pleioblastus_linearis_350 Pleioblastus_linearis_351 Pleioblastus_linearis_352 Pleioblastus_linearis_Nana_157 Pleioblastus_maculatus_252 Pleioblastus_maculatus_287 Pleioblastus_nagashima_123 Pleioblastus_nagashima_54 Pleioblastus_nagashima_62 Pleioblastus_nagashima_75 Pleioblastus_putative_hybrid_143_med_x_ryu Pleioblastus_putative_hybrid_318_nez1_x_med Pleioblastus_putative_hybrid_360_nez2_x_med Pleioblastus_putative_hybrid_362_INT Pleioblastus_putative_hybrid_388_nez2_x_med Pleioblastus_putative_hybrid_397_nez2_x_med Pleioblastus_putative_hybrid_404_INT Pleioblastus_putative_hybrid_405_nez2_x_med Pleioblastus_putative_hybrid_60_med_x_ryu Pleioblastus_pygmaeus_127 Pleioblastus_pygmaeus_17 Pleioblastus_pygmaeus_28 Pleioblastus_pygmaeus_45 Pleioblastus_pygmaeus_Distichus_12 Pleioblastus_shibuyanus_tsuboi_30 Pleioblastus_shibuyanus_tsuboi_61 Pleioblastus_simonii_232 Pleioblastus_simonii_293 Pleioblastus_simonii_296 Pleioblastus_simonii_299 Pleioblastus_simonii_358 Pleioblastus_simonii_377 Pleioblastus_simonii_379 Pleioblastus_simonii_389 Pleioblastus_simonii_399 Pleioblastus_simonii_400 Pleioblastus_simonii_401 Pleioblastus_simonii_409 Pleioblastus_simonii_42 Pleioblastus_simonii_9 Pleioblastus_simonii_Het_53 Pleioblastus_solidus_Z06190 Pleioblastus_variegatus_Fortunei_63 Pleioblastus_viridistriatus_29 Pleioblastus_viridistriatus_Chrysophyllus_154 Pseudosasa_amabilis_139 Pseudosasa_cantorii_114 Pseudosasa_cantorii_153 Pseudosasa_hindsii_Z06078 Pseudosasa_hindsii_Z07013 Pseudosasa_japonica_122 Pseudosasa_japonica_303 Pseudosasa_japonica_319 Pseudosasa_japonica_320 Pseudosasa_japonica_369 Pseudosasa_japonica_371 Pseudosasa_japonica_392 Pseudosasa_japonica_403 Pseudosasa_japonica_Pleioblastoides_52 Pseudosasa_longiligula_152 Pseudosasa_owatarii_33 Pseudosasa_owatarii_48 Pseudosasa_usawae_206 Pseudosasa_viridula_282 Sasa_kurilensis_223 Sasa_nipponica_306 Sasa_nipponica_308 Sasa_oshidensis_161 Sasa_palmata_113 Sasa_palmata_228 Sasa_senanensis_146 Sasa_shimidzuana_416 Sasa_tsukubensis_317 Sasa_veitchii_126 Sasa_veitchii_hirsuta_365 Sasaella_aff_masamuneana_244 Sasaella_aff_ramosa_140 Sasaella_aff_ramosa_314 Sasaella_bitchuensis_128 Sasaella_bitchuensis_133 Sasaella_masamuneana_289 Sasaella_masamuneana_76 Sasaella_ramosa_118 Sasaella_ramosa_130 Sasaella_ramosa_288 Sasaella_ramosa_34 Sasaella_sawadae_417 Sasaella_sawadae_418 Sasaella_sawadae_71 Sasamorpha_borealis_294 Sasamorpha_borealis_298 Sasamorpha_borealis_300 Sasamorpha_borealis_311 Sasamorpha_borealis_312 Sasamorpha_borealis_407 Sasamorpha_borealis_LGC1327 Semiarundinaria_aff_maruyamana_393 Semiarundinaria_fastuosa_138 Semiarundinaria_fortis_136 Semiarundinaria_kagamiana_79 Semiarundinaria_makinoi_135 Semiarundinaria_makinoi_160 Semiarundinaria_maruyamana_125 Semiarundinaria_maruyamana_203 Semiarundinaria_okuboi_163 Semiarundinaria_yashadake_137 Unknown_115 Unknown_51 Unknown_78 ; END; BEGIN TREES; TITLE Arundinarieae_AFLP_202; LINK TAXA = Taxa; TREE 'AFLP_202_Taxa' = [&R] (((((Arundinaria_appalachiana_99,Arundinaria_tecta_173),(Arundinaria_gigantea_197,Arundinaria_gigantea_291)),((((((Sasamorpha_borealis_311,(Sasamorpha_borealis_298,Sasamorpha_borealis_LGC1327)),((Sasamorpha_borealis_312,Sasamorpha_borealis_300),Sasamorpha_borealis_294)),Sasamorpha_borealis_407),Sasa_oshidensis_161),Sasa_tsukubensis_317),(((Sasa_nipponica_306,((Sasa_shimidzuana_416,(Sasa_veitchii_hirsuta_365,Sasa_veitchii_126)),Sasa_nipponica_308)),(Hibanobambusa_tranquillans_072,Hibanobambusa_tranquillans_205)),((Sasa_palmata_113,Sasa_palmata_228),(Sasa_kurilensis_223,Sasa_senanensis_146))))),(((Pseudosasa_japonica_122,((((Pseudosasa_japonica_403,Pseudosasa_japonica_319),Pseudosasa_japonica_320),Pseudosasa_japonica_371),(Pseudosasa_japonica_392,Pseudosasa_japonica_303))),Pseudosasa_japonica_369),Pseudosasa_japonica_Pleioblastoides_52)),((((((((((((((((((Pleioblastus_gauntlettii_145,((Pleioblastus_chino_Variegatus_236,Pleioblastus_chino_11),Pleioblastus_chino_Variegatus_129)),Pleioblastus_chino_73),Pleioblastus_chino_297),Pleioblastus_chino_313_INT_nez2),Pleioblastus_chino_vaginatus_419_INT_nez2),(((Pleioblastus_chino_302,Pleioblastus_chino_vaginatus_420),((((Pleioblastus_chino_310,Pleioblastus_chino_305),Pleioblastus_chino_301),Pleioblastus_chino_Kimmei_40),((Pleioblastus_chino_316,Pleioblastus_chino_14),(Pleioblastus_chino_315,Pleioblastus_chino_307)))),((Pleioblastus_shibuyanus_tsuboi_30,Pleioblastus_shibuyanus_tsuboi_61),Pleioblastus_chino_304_INT_nez2))),Pleioblastus_chino_309_INT_nez2),(Pleioblastus_chino_vaginatus_415_INT_nez2,Pleioblastus_chino_Gracilis_49_nez1x2)),((((((((((Pseudosasa_owatarii_48,Pseudosasa_owatarii_33),Pleioblastus_pygmaeus_Distichus_12),Pleioblastus_kongosanensis_366),(((Pleioblastus_viridistriatus_29,Pleioblastus_viridistriatus_Chrysophyllus_154),Pleioblastus_aff_variegatus_361),Pleioblastus_aff_variegatus_Fukuda_INT_nez1)),(((Pleioblastus_aff_kongosanensis_370_INT_nez1,Pleioblastus_aff_kongosanensis_367_INT_nez1),Pleioblastus_aff_kongosanensis_364_INT),Pleioblastus_kongosanensis_68)),((Pleioblastus_kongosanensis_Aureostriatus_46,Pleioblastus_kongosanensis_74),((Pleioblastus_aff_viridistriatus_414,((((Pleioblastus_pygmaeus_28,Pleioblastus_pygmaeus_45),Pleioblastus_variegatus_Fortunei_63),(((Pleioblastus_humilis_219,Pleioblastus_pygmaeus_127),Pleioblastus_humilis_158),(Pleioblastus_humilis_41,Pleioblastus_pygmaeus_17))),(Pleioblastus_nagashima_62,((Pleioblastus_nagashima_54,Pleioblastus_nagashima_75),Pleioblastus_nagashima_123)))),((Pleioblastus_argenteostriatus_glaber_66_INT_nez1,Pleioblastus_aff_argenteostriatus_353_INT_nez1),((Pleioblastus_argenteostriatus_204,Pleioblastus_argenteostriatus_31),Pleioblastus_aff_argenteostriatus_359))))),(Pleioblastus_chino_Murakamianus_32,Pleioblastus_aff_argenteostriatus_378)),Pleioblastus_aff_variegatus_386_INT_med),(Pleioblastus_aff_variegatus_375_INT_nez1,Pleioblastus_aff_variegatus_387)),Pleioblastus_aff_variegatus_385_INT_nez1)),Pleioblastus_aff_chino_373_INT_med),(Pleioblastus_aff_chino_402_INT_med,(Pleioblastus_aff_chino_villosus_398_INT_med,Pleioblastus_aff_chino_412_INT_med))),(Pleioblastus_putative_hybrid_404_INT,(((((((((((((((Pleioblastus_simonii_399,((Pleioblastus_simonii_401,Pleioblastus_simonii_379),(Pleioblastus_simonii_409,Pleioblastus_simonii_377))),Pleioblastus_simonii_293),(Pleioblastus_simonii_296,Pleioblastus_simonii_Het_53)),(Pleioblastus_simonii_232,Pleioblastus_simonii_389)),Pleioblastus_simonii_42),(Pleioblastus_simonii_400,Pleioblastus_simonii_358)),Pleioblastus_simonii_299),Pleioblastus_simonii_9),(Pleioblastus_aff_simonii_382_INT,Pleioblastus_aff_simonii_323_int)),Pleioblastus_aff_simonii_383_INT_nez1),Pleioblastus_putative_hybrid_318_nez1_x_med),Pleioblastus_putative_hybrid_405_nez2_x_med),Pleioblastus_putative_hybrid_388_nez2_x_med),Pleioblastus_putative_hybrid_360_nez2_x_med),Pleioblastus_putative_hybrid_397_nez2_x_med))),((((Sasaella_aff_ramosa_314,((Sasaella_ramosa_288,(Sasaella_ramosa_118,Sasaella_ramosa_34)),Sasaella_ramosa_130)),((Sasaella_sawadae_417,Sasaella_sawadae_71),Sasaella_sawadae_418)),(Sasaella_aff_ramosa_140,((Sasaella_aff_masamuneana_244,(Sasaella_bitchuensis_133,Sasaella_bitchuensis_128)),(Sasaella_masamuneana_76,Sasaella_masamuneana_289)))),((Semiarundinaria_fastuosa_138,(Semiarundinaria_aff_maruyamana_393,(((Semiarundinaria_kagamiana_79,((((Phyllostachys_aurea_120,Phyllostachys_bambusoides_121),(Phyllostachys_nigra_KMBG07,Phyllostachys_edulis_KMBG04)),Phyllostachys_heteroclada_119),(Pseudosasa_cantorii_153,Pseudosasa_cantorii_114))),(Semiarundinaria_maruyamana_203,Semiarundinaria_maruyamana_125)),((Semiarundinaria_fortis_136,Semiarundinaria_okuboi_163),Semiarundinaria_yashadake_137)))),(Semiarundinaria_makinoi_135,Semiarundinaria_makinoi_160)))),Pleioblastus_putative_hybrid_362_INT),(Unknown_78,(Unknown_51,Unknown_115))),Pleioblastus_putative_hybrid_60_med_x_ryu),((Pseudosasa_viridula_282,(Pseudosasa_usawae_206,((Pleioblastus_intermedius_Z06188,(Pseudosasa_hindsii_Z06078,Pseudosasa_hindsii_Z07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[! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr76474] END;