#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 19, 2024; 0:29 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Bentlage B. 2010. Evolution of box jellyfish (Cnidaria: Cubozoa), a group of highly toxic invertebrates. Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 277(1680): 493-501. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S13778] [ The following blocks are input data for analysis step 10634 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep10634; DIMENSIONS NTAX=35; TAXLABELS Aglauropsis_aeora Alatina_mordens_Queensland_AUS Antipathes_galapagensis Atolla_vanhoeffeni Carukia_barnesi_Queensland_AUS Carybdea_arborifera_Hawaii Carybdea_branchi_South_Africa Carybdea_brevipedalia_Japan Carybdea_brevipedalia_Japan2 Carybdea_marsupialis_Auctorum_LabCulture_Hamburg Carybdea_rastonii_Auctorum_New_South_Wales_AUS Carybdea_rastonii_South_Australia Carybdea_xaymacana_Auctorum_Caribbean_Panama Carybdea_xaymacana_Caribbean_Panama Chironex_fleckeri_Northern_Territory_AUS Chironex_fleckeri_QLD_AUS2 Chironex_fleckeri_Qld_AUS Chironex_yamaguchii_Japan Chiropsalmus_quadrumanus_Brazil Chiropsalmus_quadrumanus_Brazil2 Chiropsalmus_quadrumanus_NC_USA Chiropsella_bronzie_Queensland_AUS Copula_sivickisi_Japan Craterolophus_convolvulus Fabienna_sphaerica Gerongia_rifkinae_Northern_Territory_AUS Haliclystus_sanjuanensis Malo_kingi_Queensland_AUS Montastraea_franksi Morbakka_virulenta_Japan Phacellophora_camtschatica_B Tamoya_cf._haplonema_Netherlands_Antilles Tamoya_haplonema_Auctorum_North_Carolina_USA Tripedalia_cystophora_Indonesia cf._Chironex_sp._Palau ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M15636] TITLE Fig_S1_SSU_and_LSU_with_outgroups; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep10634; DIMENSIONS NCHAR=4956; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Aglauropsis_aeora 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Antipathes_galapagensis 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Carukia_barnesi_Queensland_AUS 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Carybdea_rastonii_South_Australia 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Chironex_yamaguchii_Japan 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Chiropsalmus_quadrumanus_Brazil 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Chiropsalmus_quadrumanus_NC_USA 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Craterolophus_convolvulus 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Fabienna_sphaerica 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Haliclystus_sanjuanensis 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Malo_kingi_Queensland_AUS 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Montastraea_franksi 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Morbakka_virulenta_Japan 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Phacellophora_camtschatica_B 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Tamoya_cf._haplonema_Netherlands_Antilles 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Tamoya_haplonema_Auctorum_North_Carolina_USA 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Tripedalia_cystophora_Indonesia 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cf._Chironex_sp._Palau 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; END; [ The following blocks are output data for analysis step 10634 ] BEGIN TREES; TITLE 'S1 UPGMA cluster analysis (Distance: Distances from Character Matrix)'; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep10634; TREE Fig._S1 = [&R] (((Antipathes_galapagensis,Montastraea_franksi),((Craterolophus_convolvulus,Haliclystus_sanjuanensis),((Fabienna_sphaerica,Aglauropsis_aeora),(Atolla_vanhoeffeni,Phacellophora_camtschatica_B)))),((Carybdea_marsupialis_Auctorum_LabCulture_Hamburg,Alatina_mordens_Queensland_AUS),(((Chiropsalmus_quadrumanus_NC_USA,(Chiropsalmus_quadrumanus_Brazil,Chiropsalmus_quadrumanus_Brazil2)),(Chiropsella_bronzie_Queensland_AUS,((cf._Chironex_sp._Palau,Chironex_yamaguchii_Japan),(Chironex_fleckeri_Northern_Territory_AUS,(Chironex_fleckeri_Qld_AUS,Chironex_fleckeri_QLD_AUS2))))),((Carukia_barnesi_Queensland_AUS,(Morbakka_virulenta_Japan,(Gerongia_rifkinae_Northern_Territory_AUS,Malo_kingi_Queensland_AUS))),(Carybdea_xaymacana_Caribbean_Panama,(Carybdea_xaymacana_Auctorum_Caribbean_Panama,((Tripedalia_cystophora_Indonesia,Copula_sivickisi_Japan),((Tamoya_cf._haplonema_Netherlands_Antilles,Tamoya_haplonema_Auctorum_North_Carolina_USA),(Carybdea_branchi_South_Africa,((Carybdea_rastonii_South_Australia,Carybdea_rastonii_Auctorum_New_South_Wales_AUS),(Carybdea_arborifera_Hawaii,(Carybdea_brevipedalia_Japan,Carybdea_brevipedalia_Japan2)))))))))))); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr60258] END;