#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on November 14, 2025; 4:28 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Guschanski K., Krause J., Sawyer S., Valente L.M., Bailey S., Finstermeier K., Sabin R., Gilissen E., Sonet G., Nagy Z.T., Lenglet G., Mayer F., & Savolainen V. 2013. Next-Generation Museomics Disentangles One of the Largest Primate Radiations. Systematic Biology, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S13808] [ The following blocks are input data for analysis step 10686 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep10686; DIMENSIONS NTAX=110; TAXLABELS Allenopithecus_nigroviridis_N_CG Cercocebus_chrysogaster_DPZ Cercocebus_torquatus_RB Cercopithecus_ascanius_ascanius_R_CD Cercopithecus_ascanius_katangae_R_CD Cercopithecus_ascanius_katangae2_R_CD Cercopithecus_ascanius_schmidti_B_CD Cercopithecus_ascanius_schmidti_N_KE Cercopithecus_ascanius_schmidti_R_CD Cercopithecus_ascanius_whitesidei_R_CD Cercopithecus_campbelli_R_LR Cercopithecus_cephus_cephodes_N Cercopithecus_cephus_cephus_R_CD Cercopithecus_cephus_cephus_RB_AO Cercopithecus_cephus_ngottoensis_R_CF Cercopithecus_cephus_ngottoensis2_R_CF Cercopithecus_cephus_ssp_B_CM Cercopithecus_diana_B_CI Cercopithecus_diana_B_LR Cercopithecus_dryas_R_CD Cercopithecus_erythrogaster_pococki_N_NG Cercopithecus_erythrotis_camerunensis_B_CM Cercopithecus_erythrotis_camerunensis_N_CM Cercopithecus_erythrotis_erythrotis__N_Bioko Cercopithecus_erythrotis_erythrotis_R_Bioko Cercopithecus_hamlyni_DPZ Cercopithecus_lhoesti_B_CD Cercopithecus_mitis_albogularis_N_Zanzibar Cercopithecus_mitis_albotorquatus_N_KE Cercopithecus_mitis_boutourlinii_B_ET Cercopithecus_mitis_doggetti_B_KE Cercopithecus_mitis_doggetti_N_UG Cercopithecus_mitis_doggetti_R_CD Cercopithecus_mitis_erythrarchus_N_MZ Cercopithecus_mitis_francescae_N_MW Cercopithecus_mitis_heymansi_R_CD Cercopithecus_mitis_kandti_N_UG Cercopithecus_mitis_kandti_R_CD Cercopithecus_mitis_kolbi_N_KE Cercopithecus_mitis_labiatus_N_ZA Cercopithecus_mitis_mitis_N_AO Cercopithecus_mitis_moloneyi_N_MW Cercopithecus_mitis_moloneyi_N_ZM Cercopithecus_mitis_moloneyi_R_TZ Cercopithecus_mitis_monoides_B_TZ Cercopithecus_mitis_monoides_DPZ Cercopithecus_mitis_opisthostictus_N_ZM Cercopithecus_mitis_opisthostictus_RB_CD Cercopithecus_mitis_stuhlmanni_N_SD Cercopithecus_mona_N_GH Cercopithecus_mona_N_ST Cercopithecus_neglectus_B_ET Cercopithecus_neglectus_N_UG 'Cercopithecus nictitans martini B CD*' 'Cercopithecus nictitans martini B CM*' Cercopithecus_nictitans_martini_N_CM Cercopithecus_nictitans_nictitans_R_GQ Cercopithecus_petaurista_buettikoferi_B_LR Cercopithecus_petaurista_buettikoferi_N_SL Cercopithecus_petaurista_petaurista_B_TG Cercopithecus_petaurista_petaurista_R_CI Cercopithecus_pogonias_denti_R_CD Cercopithecus_pogonias_elegans_R_CD Cercopithecus_pogonias_elegans2_R_CD Cercopithecus_pogonias_grayi_N_CG Cercopithecus_pogonias_grayi_N_CM Cercopithecus_pogonias_nigripes_N_GQ Cercopithecus_pogonias_pogonias_N_NG Cercopithecus_pogonias_pyrogaster_R_CD Cercopithecus_pogonias_schwarzianus_R_CD Cercopithecus_pogonias_wolfi_R_CD Cercopithecus_preussi_insularis_N_Bioko Cercopithecus_preussi_insularis2_N_Bioko Cercopithecus_preussi_preussi_N_CM Cercopithecus_roloway_R_GH Cercopithecus_solatus_N_GA Cercopithecus_solatus_R_GA Chlorocebus_aethiops_N_ET Chlorocebus_aethiops_N_SD Chlorocebus_aethiops_gb Chlorocebus_cynosuros_B_AO Chlorocebus_cynosuros_N_ZM Chlorocebus_pygerythrus_N_ZA Chlorocebus_pygerythrus_gb_TZ Chlorocebus_pygerythrus_gb_ZA Chlorocebus_sabaeus_B_MR Chlorocebus_sabaeus_N_SL Chlorocebus_sabaeus_gb Chlorocebus_sabaeus_gb_SN 'Chlorocebus tantalus B TG*' Chlorocebus_tantalus_N_CM Chlorocebus_tantalus_gb_CF Colobus_guereza Erythrocebus_patas_DPZ Erythrocebus_patas_N_GH Erythrocebus_patas_N_SD 'Lophocebus albigena B*' Macaca_fascicularis_Gb Macaca_mulatta Macaca_sylvanus Macaca_thibetana Mandrillus_leucophaeus_B_CM Miopithecus_ogouensis_B_CM Miopithecus_ogouensis_N_GA Miopithecus_ogouensis_R_CM Miopithecus_talapoin_N_AO Papio_hamadryas_gb Procolobus_badius_gb Theropithecus_gelada Theropithecus_gelada_B_ET ; END; BEGIN CHARACTERS; [! 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Colobus_guereza 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'Lophocebus albigena B*' 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Macaca_fascicularis_Gb 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Macaca_mulatta TAAGGACTGCAAACACCTACTCTGCATCAATTGAACGCAAATCAACCACTTTAATTAAGCTAAGCCCTTTGGTAAGTAGTTTAAATAAAATAAATGATTTCGACTCATTAGATTATGATAACCATACTAACCAACTAGATCAATGGGACTCGAACCCACAAAAACTTAGTTAACAGCTAAGCACCCTAACCGACTGGCTTTGACCCAAAGGTATTAGAAAAGTCATTTCGTAGCTTTGTCAAAGCTAAATCATAGGCCA-AACCCTATATATCTTAGAAGCCCCGGCAGAAACTCTAAGACTGCTCCTTTGAACTTGCAATTCAACATGAAAATCACCTCGGGGCTAGGACTGTAGGTATCGAACCTACCCCTGAGAATCCAAACTTCTCCGTGCTACCCTACACACTCTATCCTTGCTTTCACATGGACTCCAACCATGACTAATGGTACGAAAAACCATCGTTGTATTTCAACTATAAAAGCACTCTTTTAGTATAACAAGTACAATTGACTTCCAATCAATCAGTTTTGAC-AACATTCAAAAAAGAGTAGTAGATATAGTTTAACTAAAACATTAGATTGTGAATCTAACCACAGAGACTTACCACCTCTTATTTACCCTAGAAATATGTCTGACAAAAGAGTTACTTTGATGGAGTAAATAATAGAGGCCCCAATCCTCTTGTTTGTTAAGATGGCAGAGCCCGGTAATTGCATAAAACTTAAAACTTTGTAACCAGAGGTTCAATTCCTCTTCTTAACAACTTTTAAAGGATAACAGCTATCCATTGACCTTAGGAGTCAAAAA-CATTGGTGCAACTCCAAATAAAGTAAGGTCAGCTAAACAAGCTATCGGGCCCATACCCCGAAAATGTTGGTCACATCCTTCCCGTACTAGATGGGTTTGCACACCCCATAAACATCAGAAAGAAAGTACCTAACTCCACCACCAACACCCAAAGCTGGCATTCTAATTTAAACTACTTTCTGCGAAAAAGGAGGGAGTCGAACCCCCTAAAACTGGTTTCAAGCCAATCTTATAGCCCCTATAACTTTTTCGAGAAAACTCACAAGGATTGCTAACCCATGTACCCGTACCTAAAATTACGGTTTTCTCAGCCCTCGTAGTATAAATTAG-TACACTGGCCTTGTAAACCAGAAATG-AACA--CTC-TTCCTAGGGCAAGAAATTTAGGTTAAACA-AGACCAAGAGCCTTCAAAGCCCTTAGTAAGTAAAAA--CACTTAATTTCTGTGGTAAAAGGGGGACTAAACCCCCGTCTTTAGGTTTACAGCCTAATACTTACTCAGCCATTTTACCAAGGCATAGCTTAATAT-AAAGCACCTGGCCTACACCCAGAAAATCTCAATACCACTTGATTGCCTTGAAAACTCACTGTATAGCTATCTTAGCATTAACCTTTTAAGTTAAAGACGGGGG-----ACACACCC-CCTA Macaca_sylvanus 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Macaca_thibetana 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Mandrillus_leucophaeus_B_CM 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Miopithecus_ogouensis_B_CM 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Miopithecus_ogouensis_N_GA 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'Chlorocebus tantalus B TG*' 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Macaca_thibetana 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Chlorocebus_sabaeus_gb 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'Lophocebus albigena B*' 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Chlorocebus_aethiops_gb 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Theropithecus_gelada 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'Cercopithecus nictitans martini B CD*' 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'Cercopithecus nictitans martini B CM*' 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Cercopithecus_pogonias_wolfi_R_CD 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Chlorocebus_tantalus_N_CM 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Erythrocebus_patas_N_GH 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Macaca_mulatta 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