#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on December 15, 2025; 23:43 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Tang C.Q., Obertegger U., Fontaneto D., & Barraclough T. 2014. Sexual species are separated by larger genetic gaps than asexual species in rotifers. Evolution, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S14643] [ The following blocks are input data for analysis step 12046 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep12046; DIMENSIONS NTAX=23; TAXLABELS Keratella_cochlearis_138KC1Tovel15m Keratella_cochlearis_138KC7Tovel15m Keratella_cochlearis_14KC1Cresp Keratella_cochlearis_15KC1Antho Keratella_cochlearis_3KC1Terlag Keratella_cochlearis_3KC2Terlag Keratella_cochlearis_3KC4Terlag Keratella_cochlearis_3KC5Terlag Keratella_cochlearis_3KC6Terlag Keratella_cochlearis_54KC1Serra Keratella_cochlearis_55KC10Voels Keratella_cochlearis_55KC3Voels Keratella_cochlearis_55KC4Voels Keratella_cochlearis_55KC5Voels Keratella_cochlearis_55KC7Voels Keratella_cochlearis_5KC8Lavaro Keratella_cochlearis_7KC1Levico Keratella_cochlearis_7KC2Levico Keratella_cochlearis_7KC5Levico Keratella_cochlearis_7KC6Levico Keratella_cochlearis_7KC8Levico Keratella_cochlearis_9KC3Raierm Keratella_cochlearis_9KC5Raierm ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M18422] TITLE Keratella_cochlearis_haplotype_alignment; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep12046; DIMENSIONS NCHAR=661; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Keratella_cochlearis_138KC1Tovel15m TACTCTATATTTTATTTTTGGTATTTGGGCTGGTTTTATTGGTTTAAGTATAAGTCTTTTAATTCGCTTGGAGTTAGGTGTTGTTGGGCCTTTCTTGTCTGATGAGCATCTTTATAACGTTATTGTTACTGCTCACGCTTTTATCATAATCTTCTTTATGGTTATGCCTATTTCCATAGGTGGTTTTGGTAATTGGTTAATTCCTCTCATACTAGGTGTAGCTGACATGGCTTTCCCTCGCATAAATAATCTTTCTTTCTGACTTTTAGTCCCTTCCTTTACTTTCCTTCTACTTTCTTCTATCCTTGATTCAGGAGCTGGAACAGGGTGGACTGTCTATCCTCCTCTTTCTGATTCTAAGTATCATTCTGGTATCTCAGTTGATCTGGCTATTTTTAGTCTTCATCTAGCAGGTATTTCTTCTATTCTCGGTAGGATTAATTTTCTTACAACAATCATTTGTTCTCGTACTACTAAGGTTATTTCTCTTGATCGTATGCCTCTTATGCTTTGAGCAATTTCTGTTACGGCTATTCTTTTGATCACCAGATTGCCAGTCTTAGCAGGTGCCATTAC??T?CTTTTAACTGATCGAAATCTAAATACTTCTTTCTTTGA??????????????????????????????????????????? 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