#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on August 26, 2026; 23:09 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Rahman M.Z., Uematsu S., Suga H., & Kageyama K. 2014. Two varieties, Phytophthora nagaii var. nagaii and P. nagaii var. fragariaefolia, of a new Phytophthora species causing serious diseases of rose and strawberry, respectively, in Japan. Journal of General Plant Pathology, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S14497] [ The following blocks are input data for analysis step 12497 ] BEGIN TAXA; TITLE TaxaForAnalysisStep12497; DIMENSIONS NTAX=40; TAXLABELS Phytophthora_alni Phytophthora_cajani Phytophthora_cambivora Phytophthora_cinnamomi Phytophthora_cinnamomi_var_robinae Phytophthora_cryptogea Phytophthora_europaea Phytophthora_fragariae Phytophthora_melonis Phytophthora_nagaii_var_fragariaefoilia_CH05MT11 Phytophthora_nagaii_var_fragariaefolia_CH05MT31 Phytophthora_nagaii_var_fragariaefolia_CH05MT40 Phytophthora_nagaii_var_fragariaefolia_CH05NSU11 Phytophthora_nagaii_var_fragariaefolia_CH05NSU21 Phytophthora_nagaii_var_fragariaefolia_CH05NSU31 Phytophthora_nagaii_var_fragariaefolia_HSP501 Phytophthora_nagaii_var_fragariaefolia_HSP502 Phytophthora_nagaii_var_fragariaefolia_HSP503 Phytophthora_nagaii_var_fragariaefolia_HSP504 Phytophthora_nagaii_var_fragariaefolia_HSP505 Phytophthora_nagaii_var_fragariaefolia_HSP506 Phytophthora_nagaii_var_nagaii_CH00MKR1 Phytophthora_nagaii_var_nagaii_CH00MKR2 Phytophthora_nagaii_var_nagaii_CH02PHR1 Phytophthora_nagaii_var_nagaii_CH04PHR11 Phytophthora_nagaii_var_nagaii_CH04PHR12 Phytophthora_nagaii_var_nagaii_CH94PHR1 Phytophthora_nagaii_var_nagaii_CH95PHR10 Phytophthora_nagaii_var_nagaii_CH95PHR16 Phytophthora_nagaii_var_nagaii_CH95PHR17 Phytophthora_nagaii_var_nagaii_CH97PHR1 Phytophthora_nagaii_var_nagaii_P_A Phytophthora_nagaii_var_nagaii_P_B Phytophthora_parvispora Phytophthora_pistaciae Phytophthora_rubi Phytophthora_sojae Phytophthora_taxon_niederhauserii Phytophthora_uliginosa Phytophthora_vignae ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M19331] TITLE Phytophthora_nagaii_COX1; LINK TAXA = TaxaForAnalysisStep12497; DIMENSIONS NCHAR=672; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Phytophthora_alni 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